3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
3CPWM 1K73O 3CCVN 1N8RO 1W2BM 1K9MO 1KQSM 1YI2N 3I55N 3OW2M 1VQPN 1YJNN 1Q82O 1KD1O 3CMAN 2QEXN 4WFAL 4IOCL 1VQ7N 4WCEL 1YJWN 3CC7N 3CMEN 1VQNN 3CCEN 1JJ2M 3CCRN 2ZJRL 3J7ZO 1M1KO 1Q7YO 4U67L 5JVHL 2OTLN 1VQ5N 4WFNL 3PIOL 1QVFM 1NJIO 1QVGM 3G6EN 3I56N 2ZJQL 1ILYA 4IOAL 5DM6L 1VQKN 3G4SN 1VQ8N 5MLCQ 5GADP 3CCQN 1YJ9N 3PIPL 1VQ4N 1M90O 2OTJN 1Q81O 3CCLN 4UY8O 5GAEP 4WF9L 3G71N 3CCSN 3CCUN 4WFBL 1YHQN 5GAGP 1K8AO 5HL7L 1YITN 2ZJPL 5JVGL 1VQMN 3CCJN 3CXCM 3CCMN 1VQ9N 1YIJN 3CC4N 4IO9L 1S72N 1KC8O 1VQON 1Q86O 3CD6N 1VQ6N 5GAHP 3CF5L 3DLLL 1OVYA 1VQLN 5DM7L 3CC2N 5H1SQ 2QA4N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C2DA 1VSLA 3E9PA 1GLJO 3QNNA 3DLKA 1RBUA 2QKKA 5AQTA 4K0KK 5AQJA 4JYAK 3KK7A 4LY7A 4FPAA 4PWDA 4B1UB 5KGXA 4WQ5C 4F8RA 3CMEN 4B1YB 4CZLA 4E1JA 2P51A 1JL1A 1SAZA 3R6MA 3RR8A 3AVMA 3AV9A 4E7LA 5CE3A 1TKTA 1HYSA 4BRQA 5I42A 4OO1J 3U4LA 4DFMA 1T6DA 4X62K 1E4GT 4B1VA 4CEDA 1EWQA 2XY7A 5EXWA 3P1GA 5BR9A 3H3OB 1VK0A 3EL2A 5GIOA 4JRPA 3HTVA 1DLOA 4HUGA 4DTSA 4CJ3A 3THYA 2LSNA 3O3GA 3J7YP 3C95A 3SJJA 1KTQA 4MO4A 3LDLA 3LM9A 3QB0A 3GL1A 1NM1A 3ZX3A 1BUPA 5AQKA 4WQ4A 2QW9A 4RWTA 4EHUA 1C1AA 4CJVA 2ASPA 1RILA 2QWOA 4BE1A 3AVFA 5JVGL 3UKUB 3KD5E 4CW7B 4H0XB 4DLGA 3M8SA 1GLCG 3L8BA 1XUPO 4JS5A 1Q86O 1JLFA 4B9TA 4KTZA 3TSPA 3ASMA 2NLXA 4C8NA 1Y64A 4QOZB 2P9SB 1JLQA 1L3TA 3ZSQA 2ASMA 2FF3B 1Q9YA 3C7NB 3TAFA 3J81O 4WYBA 3EO3A 4CFAA 4A5BA 4DQSA 1KFSA 3MK6A 3FZFA 4L8RB 4DU4A 4QCLA 3CJCA 3VEOA 1NJYA 4BRIA 3KJVA 3ZX0A 5F2RA 2IAJA 4DF4A 2Y1JA 3S9HA 1I94K 2RHKA 5AQQA 3JAMO 4LH5A 3L2WA 4C1NI 1Q7YO 1TUYA 3ENBA 3ITHA 5LJVA 3NE6A 2QKBA 5AFUA 3CM5A 3I0RA 1L3VA 1C0FA 2VYPA 2G8IA 3UB5A 4GV9A 5FPNA 4CEBA 5AQGA 3RWUA 4Z4EA 3R8EA 4Y1DA 4WE1A 1HKCA 3TAGA 3VQBA 1LAVA 3F73A 3F5TA 3I56N 3Q7BA 2F8TA 5GIPA 1VSFA 4NB4A 4BRMA 1SV5A 3MXMA 3SMPA 3WXLA 2P9PA 4CJLA 4E7JA 1K6YA 1TAUA 4CGJA 4R5PA 2E4LA 4BDYA 3NVMA 2NRRA 4CJSA 1VSMA 3QNOA 3DLBA 2ASOA 4X64K 3S3OA 3AA4A 2FBVA 4FWOA 2HHXA 3A8YA 1YTAA 4WQ5A 3TABA 4Z4HA 3CQYA 4FWKA 1D9DA 3HRGA 2HVHA 2GTDA 2E6LA 1MWMA 1NKCA 1HNZK 3L4IA 4H5VA 4JKEA 2P9LB 4B9QA 5M1NA 4JV5K 4M3UA 5HL7L 1YITN 4KO0A 4KB1A 2OANA 3OYFA 3L2VA 4DV1K 3OYJA 1X9JA 2UUAK 2HMIA 4MLHA 4O8UA 1VQON 3VGKA 4ELTA 5KQ8A 1VSKA 2O8CA 2PZSA 3RMAA 1K8KA 3F9KA 3SBGA 3IG1A 4TSXA 4H03B 3HVTA 3DLHA 1MDUB 2B5JA 2OPQA 5HRSA 1BISA 2F96A 1GLEG 2X74A 3LDQA 5C10A 3MN6A 2VG7A 3CMAN 4WFAL 1QZ6A 3E9LA 1W0HA 2P1JA 3THYB 3V6DA 4DHYA 4F3OA 4NCBA 5J1EA 4FLWA 3WQUA 3D7EO 1U04A 1BQMA 5AQHA 2DFEA 4XH1A 4W5QA 4FVMA 3QIPA 1EXQA 2HHSA 2A1SA 1D5AA 3PSIA 4FJ7A 2G8WA 1RBRA 3VGMA 2D0BA 5ADXA 4E1NA 3MN9A 4HVJA 2UUBK 1HNIA 5M1PA 4MDBA 3LAMA 1NJIO 4O55A 3QDKA 2Z1IA 3TTDA 1HRHA 3N4QA 4KI4A 4QAGA 4AM7A 3MX2A 3K2PA 3G4SN 4FO0A 4FXDA 1VQ8N 1BQNA 3RTVA 3LDPA 3OYIA 4HUFA 4BREA 4B3OA 1TKXA 1XHXA 3L3UA 1N5YA 1BG3A 4ZHRA 4FJLA 1A5VA 4QS9A 4XH5A 3AVBA 4FYDA 4FJMA 1J5EK 4CF2A 2QWPA 4AHUA 4FJIA 3H46O 2HMPA 4DQQA 5FPEA 3TARA 4KV8A 2ZM6K 3OBWA 3K59A 2F8SA 1RDAA 2VGMA 3P4IA 4PY5A 4NCAA 1NJZA 3QEPA 3CCSN 3L2RA 4DG1A 3VF4A 1SZ2A 3OYBA 2E1ZA 4M7XA 1YT3A 3F9MA 1VQMN 4Q0BA 3CXCM 4GVEA 4CE9A 2D0PA 2O8DB 2CGJA 4CZKA 3J80O 3VA0A 4KRFA 2JWLA 2O4GA 1KVAA 4FWMA 5M1KA 2IVNA 3OVNA 1HMVA 3PO5A 3NBPA 3EYZA 3AVNA 4FCYA 4DTJA 1CLQA 2NZTA 3AARA 3MEEA 5AQVA 2I7NA 3ENOA 3O5BA 2OPRA 3VTIA 1FXXA 2P9PB 2HNZA 4O0IA 1VSIA 5EU7A 2P5GA 3SYZA 4G1QA 2E1YA 4FZZA 3HOTA 5AZIA 4BWMA 4CD3A 3KTQA 1NJXA 3H45C 4O44A 5EOYA 1Z25A 5IT9O 1J5OA 5T7BA 2FSJA 4LFBK 4FLZA 2KZMA 2ZWHA 1J9AA 2IVOA 2X6NA 3UE5A 2YHWA 3VOVA 3L2QA 1A5WA 4EZ9A 3M3ZA 4E1MA 1RDDA 1B92A 1HYVA 4V19S 3K5MA 2RN2A 2OZMA 2O8EB 4NYNA 2VWJA 3PIPL 1XWLA 2O8CB 4JS4A 4BRDA 4BY9C 3MN7A 3A5LC 1K8KB 1WBBA 4FJ8A 3MCPA 4MFBA 5BPMA 1DGKN 5GAEP 4B8AB 2G8FA 4H5NA 4ISFA 3C94A 4IFEA 5HRNA 4DTPA 4CK3A 1HUXA 4BRAA 4JI1K 3KK3A 1T03A 4KHUA 3EE8A 1N32K 1KFDA 2FBYA 3CC4N 1KLMA 3AAQA 1CXQA 2AA4A 2QK9A 3BDPA 1RTIA 4FPBA 4GY2B 1IBLK 3ID6A 3VQ8A 3ALYA 4YOXA 4CBXA 4H0TB 2ZGYA 2HHHK 5BN8A 5TKYA 1SUQA 3ZT3A 4EIAA 1IKWA 3MEGA 1WN7A 3T1HK 4A2AA 1RFQA 2XY8A 3I55N 5B8HA 3OW2M 2NRWA 5M1OA 3SUNA 4HUEA 1Q82O 5F1XA 4CF0A 5J2PA 1B9DA 4JKGB 4IDHA 4CJUA 1H1VA 2V7YA 1B9FA 3A5NC 1VQ7N 4DV3K 4Z94A 4DQIA 2E2PA 4BRGA 2AJQA 1RBSA 5KGWA 4ELVA 1KVCA 4JD2A 1C6VA 2Y1IA 5C24A 1IG8A 3VQ5A 3U3GA 5CYMA 3P38A 3V1OA 3E1YA 4DR6K 1KAZA 4CJQA 4FLYA 4LC9B 3SZ2A 1XQSC 1NGCA 3AVJA 2NNWA 3AGRA 4JKDA 4EZ6A 2WOMA 2W42A 3G6EN 3C65A 3OYEA 3AA2A 3BEXA 3OYMA 5KRSA 4BRFA 1NGIA 3JSMA 3VPZA 3C6TA 1NKBA 3ULDA 4BRPA 1JLBA 4CZFA 3VQ9A 1W97L 3AVLA 1C1BA 4JLHA 3ZT1A 3TSQA 3D45A 2GX9A 3RMBA 2ZF5O 1SL0A 2OTJN 1P8ZA 4JKBA 3QEIA 4JHDA 1N33K 5D3GA 3P39A 2WONA 4PKHA 2RKIA 3BY5A 3VF6A 4M7YA 3VQ6A 2F7TA 4JAXA 1NGFA 1RT7A 5CZ1A 1S9EA 1EWRA 4KHNA 4NO7A 3ATUA 4L3QA 2IS3A 1ZBFA 2O8FA 2E88A 1T44A 3NH0A 3M1FA 2ZJPL 3QESA 5GINA 5CYQA 1C1CA 2IVPA 1ASUA 2O4IA 5AZIB 3SI6A 5GAHP 3K57A 5KRTA 5LMNK 3WNFA 3A2FA 1FKPA 4H5WA 4BG8A 4OKKA 2RPIA 4HCBA 2O8BB 4I2QA 4KI6A 2BTFA 3CCVN 4LF7K 2XY5A 2ZD1A 4B1XB 4G9ZA 4I7FA 1RT5A 5KPZA 2YI1A 4MQ3A 4J2BA 1CZAN 4B9LA 1HKGA 1Q9XA 1TGOA 1BI4B 2A42A 4ELUA 3QFPA 2HNDA 2ZJRL 4FK0A 3NGIA 1S1WA 3O3FA 4N47A 1EKEA 4DV0K 3SAHA 4ILJA 3O8MA 4OPKA 1OH7A 5E84A 3SUQA 1SKRA 2GELA 4M3RA 4KHSA 4LFAK 1VSHA 2WC9A 4B08A 4H0OA 2DTUA 1RNHA 1KVBA 4CJRA 2ATQA 3AY9A 1BU6O 4IOAL 3AVAA 4Q5VA 1BA1A 4CFDA 2VG5A 5C2FA 4DV5K 5GADP 3ZT2A 4DR3K 1FKOA 3AO4A 1TKZA 4I6MA 1OH6A 2OCEA 4PQUA 4CECA 4CHOA 3HYFA 4CIEA 4OLBA 3WT0A 3O4NA 2GUIA 4CGFA 3ATVA 4BG9A 3MDQA 5EVZA 3ZSRA 1YHQN 1YTUA 4JI6K 3BZKA 1KAXA 4OKJA 2YNFA 3OYDA 3O3HA 4N76A 3O80A 3BGRA 4M45A 1QSSA 1SKWA 4FOIA 3OS2A 4B3MK 1YIJN 3LDSA 4EAHD 4M3ZA 4JD2B 1J53A 4C23A 4E7HA 3QICA 3CFRA 3NDKA 1HQEA 3FZHA 1TL3A 2F4VK 4F3TA 3I33A 3RRHA 3H6EA 4AHSA 3KLFA 1Z05A 3SQ0A 3TR8A 1D4XA 3IUCA 3PSFA 4B9VA 4BRKA 5FLXO 2E6MA 1W2BM 4FLXA 3T1YK 3LP3A 5JS2A 5AQLA 4CEEA 3HXMA 1VQPN 4DQ8A 3SCXA 4CEOA 4I9QA 4NCGA 2QWLA 3THVA 4KREA 4GMJB 2KLAA 1IG9A 4M42A 4M41A 1YVNA 2GWJA 2QWRA 3FR0A 2YX6A 1IKYA 1HYZA 1WSFA 3VEYA 4A5AA 1D8YA 1L3SA 2OA8A 1XMOK 2YCHA 1OH8A 1NGGA 3NF9A 4FJHA 3L2UA 4AILC 3RMCA 2GWKA 3HL8A 4IJNA 3AO3A 1QVFM 3EN9A 2QWQA 1ATSA 4CF1A 4NXNK 2O8FB 2Q1NA 4J2EA 1VAZA 4BRNA 3LAKA 3CJAA 1NWKA 1QSLA 1BIZA 4B3SK 1WSIA 1RBVA 2YHBA 4KB0A 4QS8A 5SZTA 3KLGA 3DAWA 3JS6A 1G99A 1NOZA 5KPTA 1JXEA 3AVGA 1LOTB 3VQ7A 3CFOA 4M3WA 3I8DA 4DTNA 3KLIA 3NVKA 3C0BA 4M3TA 3MX5A 1BDGA 1RCHA 3WXKA 1S1XA 1I3AA 4CIFA 3OYKA 1YAGA 3NAEA 5HROA 4DSIA 1QQMA 2HVIA 3LL3A 1JLCA 4IDKA 5HRPA 3PO4A 1U48A 1XNRK 4DS4A 4CZMA 2ITGA 3DYAA 4JK9A 1F21A 5J2MA 1R0AA 3D2FA 4N41A 3LM2A 4DR7K 3FFIA 2UU9K 5BRDA 2QWMA 4OPJA 4QS7A 1VQ6N 3R1XA 4DR5K 4AHVA 3BUZB 3HPGA 3UKRA 4IG3A 4B3TK 5H1SQ 4LF5K 3KLEA 5BREA 2R7YA 3T7ZA 4Z0UA 1TAQA 1BA0A 1QQNA 3TU5A 1X3MA 4BR7A 3KKRA 1IJJA 3B6OA 1YJWN 3CCEN 5AQYA 2D4WA 3AVHA 2A1RA 3AO2A 1L5UA 3ULEA 3SBTA 4I6MB 1R59O 4BC2A 1NNEA 5EX5A 4Z4CA 3U9DA 4KHPK 1NGEA 2XRIA 4LFCK 3HSCA 3O4QA 1YUWA 1FK9A 4BC3A 2FBXA 3HP9A 3PIOL 2Q2RA 3VQDA 2VQEK 3A0IX 3K9JA 1ZBUA 2KW4A 2CGLA 3RMDA 1QVGM 3TAMA 2KHOA 1JLAA 4DQPA 3ZLJA 1GOAA 1IKXA 3CM6A 4A62A 1Q8IA 1RDCA 3KWGA 3ZETA 1E3MA 5C15A 4A59A 5TKWA 5HLFA 5IWAK 3IRXA 4KH6A 4CGDA 4FM2A 5FRNA 3KWIA 2FLOA 1YJ9N 5I9EB 2FC0A 2YJEA 3VQQA 3WNEA 4AHTA 1M90O 4BRLA 4KTWA 5BPLA 1RGIA 4CERA 4GV6A 5LMUK 1NK7A 3K5NA 1I39A 4B9SA 4OPHA 5FDLA 1NGAA 2Q0RA 2A5XA 4AM6A 1S6QA 3AVIA 3FZKA 5CZ2A 3O6WA 3HJFA 4YOUA 3DLEA 4IKFA 1IO2A 2E5LK 1HJRA 1KXPA 4FWLA 1U6ZA 4PL7A 5JS1A 3GOIA 3ZEUA 4YOWA 4IO9L 4BE2A 1QS4A 3C6HA 1YXQA 2D1KA 5E41A 1VHXA 4BGBA 4DV2K 3E01A 3EZWA 4YNQA 4BR4A 2V7ZA 1SQKA 3TPQA 3CC2N 4JKHA 3EKSA 2QA4N 2XY6A 5M1QA 1ZXOA 4LF9K 4CCHA 3V9WA 3CPWM 4LF4K 1TK5A 1TK0A 3HI0A 5AQMA 2HBLA 4RW7A 5KQDA 4LF6K 2HNYA 1OH5A 3E9OA 1KLNA 1KSPA 3NGZA 4LSLA 4W5NA 3PX6A 1QTMA 3TAEA 5AJ3K 4CEQA 4FVUA 2UXDK 5AQNA 3ZSYA 5C0YA 4PL8A 3J7ZO 1T3VA 4JNEA 3MCAB 2E2OA 4CGGA 5AR0A 4BR9A 5JVHL 3OJSA 2OTLN 3MWTA 2GV9A 3OYAA 4EHTA 1CXUA 4FM1A 4N56A 4YOTA 2XHBA 3VQEA 5BN9A 4DF8A 1NGHA 1T8EA 3CJ1A 2IIRA 1RT4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CPW M;  1K73 O;  3CCV N;  1N8R O;  1W2B M;  1K9M O;  1KQS M;  1YI2 N;  3I55 N;  3OW2 M;  1VQP N;  1YJN N;  1Q82 O;  1KD1 O;  3CMA N;  2QEX N;  4WFA L;  4IOC L;  1VQ7 N;  4WCE L;  1YJW N;  3CC7 N;  3CME N;  1VQN N;  3CCE N;  1JJ2 M;  3CCR N;  2ZJR L;  3J7Z O;  1M1K O;  1Q7Y O;  4U67 L;  5JVH L;  2OTL N;  1VQ5 N;  4WFN L;  3PIO L;  1QVF M;  1NJI O;  1QVG M;  3G6E N;  3I56 N;  2ZJQ L;  1ILY A;  4IOA L;  5DM6 L;  1VQK N;  3G4S N;  1VQ8 N;  5MLC Q;  5GAD P;  3CCQ N;  1YJ9 N;  3PIP L;  1VQ4 N;  1M90 O;  2OTJ N;  1Q81 O;  3CCL N;  4UY8 O;  5GAE P;  4WF9 L;  3G71 N;  3CCS N;  3CCU N;  4WFB L;  1YHQ N;  5GAG P;  1K8A O;  5HL7 L;  1YIT N;  2ZJP L;  5JVG L;  1VQM N;  3CCJ N;  3CXC M;  3CCM N;  1VQ9 N;  1YIJ N;  3CC4 N;  4IO9 L;  1S72 N;  1KC8 O;  1VQO N;  1Q86 O;  3CD6 N;  1VQ6 N;  5GAH P;  3CF5 L;  3DLL L;  1OVY A;  1VQL N;  5DM7 L;  3CC2 N;  5H1S Q;  2QA4 N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 5C2D A;  1VSL A;  3E9P A;  1GLJ O;  3QNN A;  3DLK A;  1RBU A;  2QKK A;  5AQT A;  4K0K K;  5AQJ A;  4JYA K;  3KK7 A;  4LY7 A;  4FPA A;  4PWD A;  4B1U B;  5KGX A;  4WQ5 C;  4F8R A;  3CME N;  4B1Y B;  4CZL A;  4E1J A;  2P51 A;  1JL1 A;  1SAZ A;  3R6M A;  3RR8 A;  3AVM A;  3AV9 A;  4E7L A;  5CE3 A;  1TKT A;  1HYS A;  4BRQ A;  5I42 A;  4OO1 J;  3U4L A;  4DFM A;  1T6D A;  4X62 K;  1E4G T;  4B1V A;  4CED A;  1EWQ A;  2XY7 A;  5EXW A;  3P1G A;  5BR9 A;  3H3O B;  1VK0 A;  3EL2 A;  5GIO A;  4JRP A;  3HTV A;  1DLO A;  4HUG A;  4DTS A;  4CJ3 A;  3THY A;  2LSN A;  3O3G A;  3J7Y P;  3C95 A;  3SJJ A;  1KTQ A;  4MO4 A;  3LDL A;  3LM9 A;  3QB0 A;  3GL1 A;  1NM1 A;  3ZX3 A;  1BUP A;  5AQK A;  4WQ4 A;  2QW9 A;  4RWT A;  4EHU A;  1C1A A;  4CJV A;  2ASP A;  1RIL A;  2QWO A;  4BE1 A;  3AVF A;  5JVG L;  3UKU B;  3KD5 E;  4CW7 B;  4H0X B;  4DLG A;  3M8S A;  1GLC G;  3L8B A;  1XUP O;  4JS5 A;  1Q86 O;  1JLF A;  4B9T A;  4KTZ A;  3TSP A;  3ASM A;  2NLX A;  4C8N A;  1Y64 A;  4QOZ B;  2P9S B;  1JLQ A;  1L3T A;  3ZSQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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