3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
1M90O 3OW2M 3CCSN 2QA4N 4IOAL 3CCEN 3CF5L 1ILYA 1Q81O 3PIPL 1W2BM 2OTLN 1Q7YO 3CMEN 3CXCM 1VQ9N 1YITN 4IOCL 4WFNL 3CC4N 1K8AO 1NJIO 2QEXN 5GAEP 1KD1O 1K73O 1S72N 4UY8O 5H1SQ 1YJ9N 5DM6L 1YHQN 3CMAN 1K9MO 2OTJN 3CC2N 5GADP 5MLCQ 3CCRN 4IO9L 3CCLN 1YJWN 1VQKN 5GAHP 1KQSM 1YIJN 1VQON 1YI2N 1OVYA 1VQNN 3J7ZO 5DM7L 5GAGP 2ZJPL 3I56N 4WF9L 1VQLN 4WFBL 1Q82O 1VQ5N 1JJ2M 3CCMN 1VQ6N 3G4SN 3DLLL 1YJNN 5JVGL 3CC7N 4U67L 3PIOL 1M1KO 4WFAL 2ZJRL 3CCUN 1VQ4N 2ZJQL 3G6EN 1Q86O 1QVGM 4WCEL 3CCQN 3G71N 1N8RO 5JVHL 1KC8O 3CD6N 3CCVN 1VQ7N 5HL7L 3CPWM 1VQPN 1VQMN 1QVFM 1VQ8N 3CCJN 3I55N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YF5L 1S1UA 1QTMA 4JI6K 1HQEA 5FPMA 4FM1A 1Q9YA 3FZFA 4H5VA 4JD2A 4IO8A 3VETA 2E6LA 1J6ZA 5JMVA 1A5WA 1TK0A 3DLBA 4KHPK 4IJNA 3S9HA 4BQLA 2QWOA 3TTDA 4NO7A 1JXEA 2Q0RA 4JKBA 1WLJA 1Q7YO 2VWBA 1I39A 4Z4FA 1C1AA 2E1YA 3AVGA 2YI1A 3WUHA 2QEXN 2D1KA 5FRMA 2O8CA 4BC5A 3V4IA 4CECA 5BRDA 2W42A 1IKXA 3C65A 4DQPA 4JK8A 4H0XB 3VENA 2QI2A 4BDZA 2OTJN 3QNNA 4PWDA 3RTVA 3CC2N 3PO5A 1LW2A 1LWCA 1NJZA 3HBTA 3O1BA 5AQOA 5MLCQ 2P1JA 3NGYA 1BL3A 4I9LA 4DR7K 3EZ5A 4JHDB 4DQRA 4HHTA 2HSTA 4BRKA 3KLFA 2PFUA 2HHQA 2P9NB 1HNVA 4NCGA 3HYFA 1TK5A 3SCXA 3VQ7A 2KFZA 4ISFA 1VSMA 4BGBA 4H5NA 3M8RA 4DTRA 4KV8A 2WONA 4BRNA 2HMPA 1UA1A 4LF7K 4DV7K 5C15A 4CJQA 1RT4A 5M1OA 3ZT3A 1T05A 1EP4A 1C1BA 4CJEA 2UXCK 4W5RA 5BPMA 3VPZA 4DTMA 2GBZA 4CF2A 4B1VA 5J2PA 4HWIA 1YAGA 4FJJA 1HRHA 3V9XA 3ITHA 4CHOA 4PA1A 1N8RO 3PX4A 1T6DA 4BWJA 2GWJA 1BQMA 3OJUA 2G8WA 4RW6A 5AQMA 5AZJB 1NM1A 4E0DA 3JYTA 2P9UA 5HROA 1SAZA 3KKRA 3JS6A 5C12A 4BRHA 3MMVA 2HHUA 3V9UA 1RDAA 1T44A 4QS8A 4FK2A 2VG6A 3O9QA 3WNGA 1ITGA 1TKTA 2E2QA 3FLCO 4EP5A 1BIZA 4JN4A 2VWKA 1HPMA 2P5OA 2D0PA 4CZMA 2OTLN 1NGGA 3AVNA 3DLEA 3D2FA 3K5OA 1TKZA 2YNIA 4RW7A 1YITN 2IAJA 3S3NA 3RRGA 2D0OA 1Z26A 2I5JA 2P9SB 5EX5A 2YHXA 4BREA 1KD1O 3QMLA 4FO0A 4IXCA 3RMAA 4EHUA 4CEAA 3SQ1A 2NRRA 4OGEA 1CLQA 1HKGA 4CF0A 3GOIA 4CZEA 4NCBA 4DG1A 5IT9O 2HHVA 3MX2A 1NK8A 4M3UA 2E8AA 1VSEA 4CFBA 1BI4A 1EO1A 3ASMA 4CE9A 1YI2N 3AVKA 2ZGYA 1QQMA 4BR2A 5HRRA 2Z1HA 3DXMA 4Y1CA 4DFKA 4FZYA 1KXPA 1YUWA 4QS7A 1MDUB 2HBJA 1VQLN 3CETA 2QWRA 1TGOA 3DYAA 2PAVA 1EETA 4KFBA 3O1WA 1XNQK 3DXKA 3DLLL 1ASUA 3ATVA 1NNEA 1RTJA 3LP3A 3LALA 1T03A 4CD1A 1EKEA 2E5LK 2A3ZA 1UOCA 4IEEA 4FWRA 4E89A 3MCAB 3PO4A 2JWKA 1GLAG 1EX4A 4EFHA 2A41A 4BE0A 2KTQA 2X6SA 3EE9A 2A1SA 1KC8O 3MN6A 2LSNA 3M5RA 2KW4A 3VF2A 1QZ5A 1KFSA 4DHYA 4J8FA 3L8BA 1TYQB 3R3LA 3NGZA 2HW3A 2B5JA 2DY4A 3MN5A 3O6WA 4E1MA 5M1KA 3CQ8A 4A59A 2O8EA 5BREA 2VGMA 2E1ZA 3WQUA 2QA4N 1C0GA 2OPRA 4OX9K 4KPYA 4DTOA 1X9MA 3ISNC 1JL1A 3PX6A 3CFOA 3P1GA 1Q81O 1D5AA 4O5FA 2F7TA 1LAWA 3ZEUA 1KAZA 4X65K 4FWMA 4FWKA 3LPTA 4OJRA 4WFNL 3U9DA 3CERA 5IWAK 3K2PA 1BOTO 3MN9A 1NJIO 4LH4A 1JLQA 1XC3A 4CF9A 4K8XA 2CGLA 4H0YB 2VG7A 1P90A 5E26A 4BRCA 4G9ZA 4J2DA 1YJ9N 4BC4A 2DTUA 5HRNA 1UAXA 4AH9A 3QIOA 3MEDA 3V9WA 4JI0K 3OYBA 4CJ7A 5J2MA 2FBVA 1JLCA 1XMQK 1K8KB 3WEEB 4DQIA 3LP1A 3VQEA 2HNDA 4BY9C 4F3OA 1DTTA 3NVMA 4H0PA 2FLOA 5EY4A 3J7AP 4KO0A 4CEEA 4WF9L 4J2EA 4OLBA 5I9EB 3AY9A 2HVHA 3HI0A 3OYEA 3TAQA 2YHYA 4RW8A 3G4SN 4PHTX 4CGIA 4KB0A 2HNYA 3HSTB 3WXKA 2HHWA 2Q0UA 3DRRA 2Q1NA 2WBNA 2ITMA 3QEWA 2ZE2A 3DLGA 3ZSWA 1E4GT 4CGHA 4FWOA 5ADXA 2ZJQL 4DR2K 3VQ8A 3KVGA 3KTQA 5J2QA 2GEMA 1QSLA 4Q0BA 2F9TA 1LCUA 2H3GX 5KRSA 3AVIA 3ZT2A 1U6ZA 2NZTA 3SI6A 1RBSA 3SBTA 3F5TA 5HL7L 5A2QO 3SJJA 3RMCA 3MEGA 3V9ZA 1XNRK 4JRPA 1RGIA 1BWFO 2B6AA 2FSKA 3SJHA 4OKEA 4JEPA 4EP4A 1NGHA 4E7KA 3P31A 4FLWA 1CZBA 1QSSA 4B3SK 3CCEN 4FPBA 1T7PA 1TL3A 3SNNA 3QEIA 4BRDA 5FROA 3THWB 4H5TA 1VSLA 1OVQA 3MDQA 3ZX2A 4E1NA 4CCHA 2UU9K 2AP1A 3IMXA 3QFPA 3CJCA 2IVPA 1BCOA 3D2EB 3ZYYX 2NRVA 3LWLA 2HHXA 5KGXA 3C6UA 3LZIA 3QEVA 1QQOA 1YVUA 1BHLA 5DM6L 5CZ1A 4JHDA 4AQYK 1B92A 2P9NA 3EE8A 3CCRN 1JLBA 3HJFA 1VSJA 1YIJN 3GE1A 4PY5A 5D3GA 1IV0A 1MWKA 3NDKA 4FLZA 4K42A 4CESA 4Z4GA 2UXBK 4AHRA 4FW2A 3K5NA 5GAGP 3RMDA 5BPNA 4M7XA 3C6TA 3RR7A 3N4QA 1BIUA 1VQ5N 1SQKA 2XY7A 4KTZA 5FRNA 4WQ5C 2F8SA 4BRQA 4IDKA 5AQKA 3ZCMA 3PIOL 2CH5A 4WFAL 5CYQA 4QCLA 1VRUA 4YDUC 2NRWA 2W40A 3VOVA 1RCHA 2F9WA 4DU4A 1Y97A 1XHZA 3V1QA 5JS1A 1D8YA 4DTPA 3BUZB 4OKKA 4FLXA 3O80A 3LDSA 1X1PA 5AZJA 4O8UA 2P5GA 3DM2A 4RW9A 3MECA 3VA0A 3EKUA 3AVFA 3CCJN 3ZSVA 3RWUA 3DI6A 1H1VA 4M3RA 3MCPA 4ELVA 4JYAK 1NMNA 2IC3A 5KTQA 3BF3A 3THXB 1XQSC 2OPQA 4DQQA 2V7ZA 3OYAA 1WAFA 2O8BA 4DV0K 3C0BA 4Z4HA 3CF5L 1N5YA 4DSJA 3UKRB 3AGKA 1VAZA 1SL1A 1IKVA 1EWRA 2YV0X 2NRXA 4BRMA 1SKWA 3CJ7A 2P9SA 2YKMA 3C6HA 3VQBA 2F8TA 1LWFA 3L3UA 4ZHRA 2O8DB 4PL7A 4CHNA 3O4QA 1WSIA 4DF8A 2ZGZA 4F8RA 3G25A 1U45A 2XRIA 2HHTA 2G8KA 2QM1A 1OKJA 3M3ZA 1S72N 1ASVA 3HPHA 3HOSA 5AQLA 2PBDA 1Q9XA 3CMAN 4PQUA 5TKYA 1RTDA 3VQQA 4CFDA 5AQFA 4H5WA 1I3AA 5GAHP 3L2VA 3AA3A 3V9SA 2QWPA 2KKZA 2P51A 4KH6A 3FZMA 3LAKA 1IG9A 4Z0UA 1N6QA 3HTVA 3OYDA 1RFQA 3C6AA 3ENHA 4WYBA 4DCHA 4R79A 3J8AA 3OTOK 4AILC 1WBBA 4BR9A 1NJYA 3AGRA 3OYMA 4IKFA 4E7JA 3SLCA 3VTIA 2EWSA 4B1YB 4C8KA 4HCCA 3O4NA 1NGDA 5AQRA 3PSIA 2BANA 3WNFA 3G6EN 1IBKK 3I0SA 3VN5A 3CCQN 2FBYA 2Q97A 2NNWA 4J2AA 1KVAA 3TAGA 2DPNA 1TYQA 2NRZA 1WSFA 4BACA 3CD6N 3UKUB 3BP8A 3DRSA 3KWGA 3M8QA 4B1ZA 3OS1A 3NGIA 2QXLA 4GV3A 1KSPA 5C2FA 3CFPA 4DTSA 3CJAA 1QE1A 5C2DA 3SUNA 5HBMA 4KHSA 1WOQA 2UUCK 3A8YA 5AQPA 4EHTA 3GL1A 4E7IA 1HUXA 3VTHA 1VSFA 2ASPA 4WQ4C 4Q5VA 3NF6A 4BVOA 4LC9B 3WXLA 4DKWA 3K59A 4ILJA 4KREA 1WAJA 3J80O 4FLYA 4JI5K 3O9SA 1NJWA 1CXQA 1JLEA 3EEQA 3KD1E 3SMSA 5GAEP 4CBXA 1Q8IA 1BO5O 5KQDA 4DV3K 2VWJA 3SBGA 4ILHA 1QQNA 2G8HA 3LP2A 5GIPA 5AQJA 4FJLA 4K8ZA 4O44A 4NCAA 3EKSA 1K8KA 2KLAA 4FJ7A 5BRHA 4Y0WA 3SUPA 2DFEA 1SKSA 3DAWA 1KQSM 2IGIA 3DOLA 3O9RA 3VEXA 3HP6A 3IUCA 4OPJA 3H1VX 4CGDA 4QS9A 2IOCA 3KIOA 5AQWA 3OVNA 1ZC6A 1WSHA 1JJ2M 1HJOA 3MEEA 4A62A 3LDOA 1L3VA 4U67L 1Z25A 4AHSA 3C7NA 2E88A 2ASOA 1VQ4N 3O08A 4DR6K 1Q86O 1B9DA 1FXXA 4A57A 5AZIA 1C0FA 1ZBFA 3HZ6A 4OLAA 3OYNA 3AVBA 3BZCA 3E1YA 5LMNK 4F9OA 3QEXA 4BG8A 4NXMK 1RDWX 3E9LA 1HKBA 3UB5A 1VQ8N 4MO4A 5AFUH 3D0PA 4O0JA 1M90O 4F3TA 2PYLA 4M42A 1L3SA 3AAQA 3RVCA 2GWKA 3QBXA 3THWA 2W6KA 4GMJB 4EZ9A 2NUBA 1GLEG 4CJFA 1NK6A 4DV2K 4BGAA 4CZFA 5E41A 5CR4A 3UIQA 4BE2A 1X9SA 3D2EA 3FZKA 3CI5A 4JKAA 5HLFA 4Z4IA 5I3UA 3CMEN 1YT3A 2BGGA 2QTDA 3KK7A 2KZZA 1RDCA 3OYFA 1D9FA 3U4LA 1ZBLA 1R59O 5JLFA 4ID5A 1RT7A 1KTQA 1T3VA 3SUOA 5KRTA 1CZ9A 1NK9A 1ZBHA 4BRFA 4DU1A 3ZSYA 3OYIA 3M8PA 1DEJA 1VK0A 3FE1A 4B9UA 5K14A 4HTUA 3U3YA 4FWSA 4CZKA 1NU0A 3L2RA 4ISGA 5DM7L 1X3NA 4FOEA 3IG1A 4CERA 1DLOA 4B8AB 2HB5A 4DTXA 3QERA 1IG8A 4DFJA 3SQ0A 4DV4K 2FBXA 1VQ6N 4F2RA 3NH0A 3QIPA 1EQYA 2OYQA 2KZMA 4M3WA 4CJ3A 2ZJRL 2ZQBA 4B9TA 4H4MA 1CXUA 1WB9A 3ATUA 4FZXC 3SQ2A 2P9IA 3H45C 3VF4A 3QFUA 4FLVA 2ZWHA 4A2BA 2W41A 4K41A 3TSQA 3M8SA 4M3XA 3F73A 2EHGA 2DFFA 1NGCA 4FYDA 2HVIA 4YOTA 1BCMA 4DLGA 4GKJK 1CZAN 3THXA 3WT0A 2OPSA 4FJHA 1RTHA 4ZTJA 4N76A 2E2PA 2JGUA 1WSJA 1TKDA 2P9LB 1DGKN 3IFRA 1SL2A 3UKRA 1HLUA 4OVLA 3ZT1A 1KVCA 4I6MB 1OH8A 1J5EK 4C8MA 4HUEA 4OO1J 4IG0A 3HPGA 1RT2A 4H5RA 3TU5A 3AO2A 2O8DA 3D6RA 4NYNA 1U47A 3A5LC 2XHBA 4RG8A 3NH2A 1RTIA 1JCGA 4I7FA 4BR7A 5J2NA 3O3HA 3CJ1A 3LDQA 4KHWA 4EZ6A 2X78A 4BRPA 1NG9A 1K8AO 4CBUA 3HO1A 4H8KA 4AHTA 3VQPA 1GOBA 3IRXA 2BTFA 2D0CA 4YOXA 2QWMA 4CHYA 3BGRA 1XUPO 2HMIA 4DV6K 3F9KA 2PYJA 4CEZA 2G8IA 4FJIA 4DQ8A 3M6GA 4LFAK 4CBWA 3HT3A 3JSMA 2ETJA 1REVA 4CK2A 3KLEA 1VQON 1W0HA 1HYSA 2YJFA 2Z1JA 3KK2A 3TARA 3OJSA 1VQNN 5AQZA 4A5AA 5B8HA 2NLXA 1GOAA 4RWTA 1SZ2A 1GLCG 4CEOA 1G15A 4BDPA 3PX0A 2BDPA 1DKGD 1U4BA 4PKHA 1KLNA 4FPAA 5JVGL 3VQ4A 4LF8K 4LD0A 4JS5A 2HNZA 3O3FA 5LY3A 3HSCA 5CE3A 3DOKA 4KH5A 4FJ5A 2VCPA 3DLRA 4MDBA 2VGNA 4JKCA 1SKRA 3ENOA 1NOZA 1QVGM 2Q2RA 4O4GA 1HYVA 5DK5A 4FK0A 4MLHA 5HOOA 3UKUA 1KLMA 1OH5A 1JKHA 2E2NA 3THVA 4H0VB 4B08A 2HF3A 1P8ZA 4BWMA 3S3MA 4MLEA 4KB1A 2OZSA 1HX1A 1U2VB 3WQTA 4CJLA 1NGBA 4YOVA 1VQPN 2F4VK 2YKNA 1IKWA 4BRAA 1D4XA 5CHIA 3AVHA 3OYLA 2PZSA 4F2SA 1TAUA 1NGFA 2NRTA 4JI1K 3VERA 3I0RA 4HCBA 4HVJA 2Z1IA 3PV8A 3HVRA 5AJ3K 1NK4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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