3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
1K73O 1M1KO 1KQSM 1ILYA 1VQ7N 1QVGM 5DM7L 3CCMN 1VQ9N 1JJ2M 3CCEN 4UY8O 3G4SN 4WFAL 1NJIO 3CC4N 1VQ4N 1YIJN 5GAHP 2ZJRL 3G71N 2QA4N 1VQPN 3CD6N 3CCSN 1M90O 3CCJN 1VQON 4IOAL 1VQ6N 1YJWN 5MLCQ 1Q82O 3DLLL 4WCEL 5JVHL 1VQ5N 1K9MO 3CMEN 4WF9L 1KC8O 1QVFM 3I55N 1YHQN 3I56N 3CCRN 3CC2N 5DM6L 1Q86O 3J7ZO 5GAGP 1KD1O 1VQKN 4WFNL 1W2BM 3CCLN 1VQLN 4IO9L 5GAEP 1VQNN 1VQMN 3G6EN 5JVGL 3CCQN 5H1SQ 2ZJPL 5HL7L 3PIOL 1YITN 4WFBL 4U67L 2OTJN 1YJ9N 3CMAN 2ZJQL 3CCUN 1N8RO 3OW2M 3CC7N 1OVYA 3CXCM 3CPWM 2QEXN 3PIPL 1VQ8N 5GADP 1YJNN 3CF5L 4IOCL 1YI2N 3CCVN 2OTLN 1Q7YO 1S72N 1K8AO 1Q81O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JD2B 5CY4A 4CESA 4DQSA 2JLEA 4B1VA 4BY9C 1FK9A 1X1PA 2NUBA 2IOCA 5LL6Z 3VQPA 2P9NA 4DKWA 1ILYA 2OYQA 1Q9XA 3O9QA 5CE3A 4FXDA 4M7YA 3NAEA 2P51A 3U9DA 3OYCA 3VQ9A 5E84A 2YI1A 3ZSXA 1XMOK 5BRHA 4LFAK 3PLAA 5C24A 4DR4K 3ZT2A 5AR0A 1T3VA 4YFUA 2NLXA 1W0HA 4O44A 3SLCA 4JS4A 4CHOA 4KHWA 3CCJN 2PYLA 1NK8A 4X62K 5C15A 1YAGA 1HX1A 3JXUA 3HP9A 4AHVA 3HPGA 1QE1A 4AM7A 4DQPA 3HSCA 1K9MO 4JLHA 4BRAA 3SYZA 3DXKA 2OCEA 5AQUA 4JEPA 1KC8O 4F4KA 3QETA 1W9HA 4KH4A 2KHOA 1VSEA 3VQAA 1NK9A 1KD1O 4JRQA 1WSFA 3CYMA 3GBTA 4MLEA 3B8AX 2A6AA 2BDPA 3NFAA 2HHQA 4FCYA 1D5AA 1VQMN 4DU3A 4IFYA 3EKSA 5ADXH 4FWLA 1NGFA 1RBRA 4GKKK 2ZJPL 2FF6A 1Q18A 3VF4A 2D0PA 4U67L 3A5MC 4YOYA 3CMAN 5E41A 3V9SA 1N32K 4B9MA 4M41A 1D4XA 3CXCM 1IKYA 1IO2A 2QXFA 2WOMA 2KW4A 4JKGA 4E7IA 3F9KA 2HHXA 2BE2A 2PFUA 3OYIA 3H3NO 1OVQA 5KQ8A 3CF5L 1S1TA 2V7YA 2Y1IA 3I33A 3IMXA 3DLEA 2JWKA 4BROA 3LM9A 4CK3A 3L2RA 1VQ7N 1TKTA 4Z4GA 2RHKA 1ZXOA 3EKUA 2G8VA 3D6RA 1HMVA 4GMJB 1OH6A 2FLOA 5AZIB 4XIUA 1TK8A 4JN4A 2GELA 3SV4A 3NF8A 1OKJA 4LC9B 3GL1A 2YHAA 1E4GT 2QI2A 4GV6A 4PKGA 1VQ4N 1NK5A 4CVNE 4RTFD 3TAQA 4L8RB 4FK0A 4M42A 3B6PA 3KWGA 4E1JA 1BL3A 4GVEA 4EHTA 3TTFA 5M1OA 3VGKA 3EN9A 4NYFA 3SBGA 1NJXA 3I55N 4CCHA 4BGAA 3IS9A 2XY8A 4CGIA 5GAGP 4JK9A 1GOBA 3LZJA 4FWMA 1WBBA 3VEZA 2GV9A 4NCGA 3EZ5A 5C12A 3ALYA 3CCQN 3RRGA 4DSIA 4H5RA 3UKRB 3THYA 2O8BA 1NKEA 5B8HA 3LDOA 4KHSA 4Z0UA 3O80A 1YTAA 3CQYA 5I3UA 1YITN 2E1YA 3LALA 4NXNK 4HUEA 4KTZA 4FJMA 3OYLA 1NMDA 3ZSRA 3K5MA 4E0DA 4C8NA 4Y1CA 3O3HA 2PYJA 1DGKN 1GLBG 1RNHA 1ITGA 2YJEA 1G15A 3SPYA 1Y64A 2NRXA 3CETA 4DUZK 2HBMA 3DLKA 3K5LA 3VTHA 1RBUA 1ASVA 2YHBA 4H5NA 3LP0A 3VQQA 2OZMA 3KKRA 1UOCA 5AFUH 4GY2B 3A5LC 1TKDA 2P1JA 1U2VA 3QEWA 1HYSA 2KFZA 4ILHA 4OO1J 3BEXA 4B8AB 1S3XA 5AQQA 5F0XA 3L2WA 3VESA 3HRGA 4B9SA 2F8TA 3UE5A 3O5BA 4BDYA 2BTFA 3K5OA 4FOEA 2VWJA 2HHSA 1HYVA 3GOIA 1W7AA 3O9UA 1WLJA 4Z4EA 2P9KA 3KK1A 3LPTA 4LSNA 3C7NA 1DTQA 1HNWK 3AAPA 3VQ8A 2HVIA 3C0BA 4ZHRA 2QA4N 1JLAA 4KV8A 3RSEB 4ZTJA 1TUUA 1YF5L 1TYQA 3HXMA 3CPEA 3K5NA 3RVCA 3WXKA 4E7HA 4FJJA 1IJJA 4NCAA 4FM2A 1EETA 4UQGA 1FJGK 2NRHA 1BO5O 4Z94A 3EZWA 1CLQA 4I2PA 3DLGA 4YDUC 3D2FB 4HVJA 1XI1A 4KI4A 3ZEUA 4DV6K 3SJHA 5JMVA 2RPIA 2A3ZA 3OYGA 1VSKA 3L3UA 1ZBUA 1IKVA 1JKHA 1SL2A 3NDKA 2NZTA 4EAHD 3KTQA 1RDUA 3V1RA 2HBLA 1J5OA 3WQUA 2WBNA 3SK3A 5HRNA 1EWRA 2CH5A 1T7PA 4PWDA 1EO1A 5GINA 1L3UA 4LFCK 4CHNA 4U7BA 4MO5A 4G1QA 4HTUA 1GLAG 4CJTA 3CPWM 1LCUA 3BGRA 3AARA 4CZKA 4DQIA 4IOCL 1RBVA 4RW6A 5FROA 1X9MA 2XRIA 4BRHA 3QEVA 4YDUA 4FLZA 4CE9A 2BGGA 2XO7A 1QQNA 4CF1A 4CIGA 3AVGA 1RTDA 1RTIA 3A8YA 1EP4A 3HBTA 2VYPA 4N76A 4HWIA 3ZX0A 1QTMA 3DLBA 4JKBA 1P90A 4RWTA 2YJFA 3HPOA 4WQ5C 3VQ6A 1TV6A 2RKIA 5FPDA 1OH8A 1D8YA 3SUPA 4KTWA 3ID8A 3CFRA 3H08A 3DAWA 4KTQA 3VGMA 2OPPA 2LSNA 4BREA 3TARA 5AQXA 4OLAA 5MLCQ 1KTQA 2ZGZA 3FZHA 2I7PA 3SZ2A 4NXMK 4CEZA 4Q0BA 5FPMA 2QWNA 4DV7K 1JXEA 5HROA 3HM9A 3J80O 4NO7A 5DM6L 3MEEA 3PSIA 4IXCA 2E6MA 1HKCA 3GG4A 4WFNL 1S1VA 1Z05A 4CZEA 3SAGA 1RFQA 4EFHA 3DRPA 1UA1A 3SQ2A 4YOUA 3KZBA 1I39A 4CZMA 4XEIA 4W5TA 3UKUB 2Q97A 1QQMA 2Q0RA 2E2NA 5BPLA 1N33K 3PIOL 4JKFA 3TANA 3OYHA 3RMCA 1YTUA 4JYAK 2QK9A 4B9LA 1EWQA 5T7BA 3MK6A 3CJAA 2HMIA 3OYJA 4OPAA 4CJFA 4WQ5A 3NF9A 4FWQA 3V1OA 3TABA 2YHYA 3HYFA 4BC5A 4AHTA 4O8UA 3FLCO 1REVA 2HMPA 1FXXA 3QO9A 2OTLN 4GVMA 4LF6K 3OY9A 1NK0A 3AVIA 2NNWA 1S9EA 1K6YA 4Z4IA 4R79A 4DHYA 3AA4A 2IVPA 4DR3K 3O1WA 4BE0A 1XNQK 4DV3K 3QBWA 3PX0A 4DS4A 4OPKA 4CF9A 4H0YB 5DM7L 3L2VA 3CQ8A 1N36K 3EY1A 1GOAA 1JLQA 4MDBA 2D0BA 5TKYA 5AQPA 2FBVA 4DG1A 1NGJA 1E3MA 2O4GA 3AA2A 4B3MK 1NGCA 2FXUA 3BDPA 3TSQA 4C23A 1U47A 1VK0A 5AQVA 1DT9A 5AZIA 1GLLO 1M90O 3AV9A 4JI4K 1WSEA 4OPJA 4AHUA 4DQRA 5AQGA 4BR9A 3SBTA 1SL1A 3J7AP 3VEYA 4BE1A 1C1AA 4KHYA 4G9ZA 4IOAL 1YJWN 4CJQA 3V81A 3M5RA 3SMPA 3KLHA 3O9TA 1HYZA 1X3NA 4M3WA 3Q7CA 3KLGA 3OVNA 4B1XB 1NGEA 2VCPA 4BVPA 3FFIA 4O4GA 3KKSA 3V9UA 4M3RA 5GIPA 4C1NK 1VSDA 4XH5A 3U9ZA 4DF8A 4B1YB 4DSFA 4EHUA 4PY5A 3S3OA 3MN9A 1BU6O 5GIOA 5H1SQ 3O1BA 3C65A 4C1NI 1NLVA 4LH5A 1LWCA 2E2OA 4EP4A 4B3TK 1EXQA 2G8KA 1ZBIA 3D45A 4KBOA 4JKDA 5AQIA 1NGIA 2HHHK 1ZBSA 3CI5A 3VF6A 3P83D 1BOTO 3PSFA 2P9LB 4BRLA 3FGUA 4M3UA 3OS1A 3AY9A 3O9SA 1WSJA 1BA0A 1VHXA 2QWLA 1CZAN 2QWOA 2VWKA 3O9RA 1Y97A 4DR2K 3DXMB 5J2NA 5IT9O 4WQ4C 4IWVA 5TKWA 2KQ2A 1N34K 5C25A 1X9WA 4F2RA 1C0UA 4I9QA 4FJ9A 4OKJA 5AQNA 1HJOA 4C8LA 4H0PA 3NMUA 3VQ7A 3KLEA 1BGXT 3G10A 2A41A 3AVFA 3JSMA 5AQJA 3QNNA 3ZYYX 2WC9A 5AZJB 1IBKK 4BGBA 5J2PA 2GTDA 4CJ5A 4W5QA 4HUFA 4MLHA 1ATRA 1D9DA 3VMFB 4O5BA 1SUQA 1Z26A 3KIOA 4I2QA 3CC4N 4CGDA 4CHQA 4CHYA 2FSNA 4BVOA 1LWFA 2VG7A 4M3ZA 3IDHA 2Y1JA 2YHWA 4IFVA 1NWKA 2KZMA 1EKEA 5HOOA 2CH6A 1NGAA 2UXDK 2I7NA 3E9OA 3RWUA 1VSIA 4JI5K 3KHYA 3O3GA 4WQ4A 3M8RA 4YOVA 3NH0A 3MXIA 3AVHA 4Y1DA 4KB1A 3K9KA 3DRRA 2XY6A 1Q86O 3EE9A 1ESVA 3DM2A 4RW7A 1J9AA 4O8KA 1WOQA 4H8KA 3U6FA 5BN8A 1T44A 1FKOA 3HSTB 2HSTA 3SAFA 1VQLN 3WXLA 4DFMA 1RT2A 3ASMA 3CM6A 1MWKA 4CZLA 5JVGL 3D2FA 4GNIA 2E1ZA 2KLAA 4IFEA 4HCBA 5AQTA 3EYZA 4FLWA 3OTOK 1RDWX 4IOXA 4C8OA 2YV0X 1SV5A 2A1SA 3TAPA 4KHUA 3E1YA 4CJUA 4JKEA 1MWMA 3A5OC 1ZYQA 3PO5A 3QMLA 2VG5A 3DRSA 1S1UA 4MQ3A 4J2AA 3ZCMA 3TWHA 3H45C 4IDKA 1QZ6A 4E1NA 5M1PA 4M45A 2G8WA 3UIQA 2W6LA 4M3XA 4BRCA 1WB9A 1TAUA 3DOLA 4IBNA 1SKSA 3VENA 1LW2A 1QSYA 3T1HK 2XY7A 2BUPA 3HP6A 3NVKA 2QM1A 1GLCG 1Q7YO 4FW1A 4FZZA 4JK8A 4BC3A 4CHZA 5AQZA 2E2QA 1BUPA 3T1AA 3SUQA 2KTQA 4CJVA 5FDLA 1KQSM 5AFUA 4CJ7A 1T03A 4DFPA 2DY4A 4XH4A 1BDGA 4FVMA 4FJ7A 3IKMA 4KO0A 4NCBA 2D0AA 5CHIA 3L0QA 2H3GX 3LDQA 3NGZA 3V6DA 3L2QA 1XWLA 4B3SK 2ITMA 1HNXK 4ICLA 4J2BA 3KJVA 2V7ZA 1CXQA 3C6TA 4FPAA 3AAQA 4A59A 3HVTA 1YXQA 1TK0A 3ZSQA 4DLGA 3IRXA 1IBLK 3OHRA 3KVGA 3MEGA 4K8ZA 3HTVA 4A57A 5KPTA 2GUIA 4Q5VA 4ILJA 1KAYA 4WF9L 3P4IA 5KRSA 1RDAA 4H4OA 1QZ5A 3SV3A 1RT6A 1H1VA 1T6CA 2E20A 4E1MA 1YUWA 2UXBK 3MCAB 1W97L 1JL1A 4BR2A 4DR6K 1VQNN 5FRNA 4FJLA 3ULEB 3C6AA 1NKCA 3PY8A 3S3NA 4Y0WA 1HQUA 4HTLA 3CJ7A 3AVNA 1X3MA 2HW3A 3M8SA 1V4TA 3QIPA 1D9FA 4DLEA 1IV0A 1LW0A 3CG7A 3CCUN 3UKUA 4JI8K 2VG6A 1S22A 2IIRA 4AHCA 3OYFA 2ZM6K 1BCMA 3KWIA 4LF5K 3DYAA 4LF8K 3TSPA 4E89A 5I9EB 2B5JA 1JXBA 1ZBLA 4H0TB 2YKMA 2IVOA 3SQ1A 3OBYA 3A2FA 1KLNA 2D0CA 2BH1A 4MFBA 4A61A 3M8QA 4GKJK 4CIFA 4E7LA 4JNEA 1J6ZA 4B08A 3BZCA 3HO1A 3K59A 5SZTA 4FJXA 2HNYA 2X6NA 1S6PA 2ASMA 1VQ9N 3H6EA 1R59O 4V19S 4CZHA 2G8HA 4OKEA 2YX6A 4HHTA 5KQDA 3NGIA 5AQOA 1JCEA 1KXPA 5JS1A 4C8KA 2WUSA 3QICA 1WAJA 3L4QA 3TR8A 3LL3A 4ISEA 3VEOA 3NF7A 5EU7A 4PL8A 4F3OA 1K8KB 3H46O 2E5LK 3C6UA 3AO4A 1C6VA 5BREA 4M63C 3J7ZO 2Q3SA 4GV9A 1IH7A 4RG8A 4CHPA 3D2EB 4PHTX 1W2BM 1QHAA 5AQKA 1L3TA 1HJRA 2J4RA 2E6LA 1A5WA 1N5YA 2KFNA 3QIOA 1EX4A 4CEOA 4F2SA 1WSGA 3O4QA 3BP8A 4DSKA 4E7JA 3PX6A 3J7YP 2QWMA 5FPNA 4CD3A 2P9NB 1KSPA 4I9LA 4DCHA 3LWMA 4WFBL 1A5VA 1DKGD 1U45A 3LP2A 3P5JA 3VPZA 1OH5A 1EQYA 4N41A 2NRZA 4CJ4A 5FRMA 4FWKA 4YOTA 2QEXN 4B1UB 4B9UA 2X78A 2QXLA 3VQ4A 2PBDA 4RW8A 2GWKA 4DV4K 2Q0UA 4BRDA 1WNSA 3AVKA 3DXKB 3L3VA 4QOZB 3HPHA 4JHDA 3ATVA 4FJKA 4IJAA 4W5OA 2QTDA 2OPQA 3OYNA 3MEDA 4UY8O 3V9WA 2DTUA 3Q7BA 3B6OA 3AVLA 3MECA 4NLBA 1ASWA 1F21A 4IG3A 4DTSA 2CGLA 5AZJA 5JICA 3MN5A 1MDUB 3A5NC 3V9ZA 5KPRA 3WT0A 4N56A 4PUOA 3OYEA 1NG9A 4JD2A 4H03B 1LWEA 2ATQA 2QKKA 4KPYA 4K43A 1LV5A 4BRFA 1RT3A 3QINA 3ZT4A 3WXIA 1RT1A 4DTJA 1QSSA 1YHQN 4DUYK 2ASPA 1VRUA 1IG9A 4FK2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4JD2 B;  5CY4 A;  4CES A;  4DQS A;  2JLE A;  4B1V A;  4BY9 C;  1FK9 A;  1X1P A;  2NUB A;  2IOC A;  5LL6 Z;  3VQP A;  2P9N A;  4DKW A;  1ILY A;  2OYQ A;  1Q9X A;  3O9Q A;  5CE3 A;  4FXD A;  4M7Y A;  3NAE A;  2P51 A;  3U9D A;  3OYC A;  3VQ9 A;  5E84 A;  2YI1 A;  3ZSX A;  1XMO K;  5BRH A;  4LFA K;  3PLA A;  5C24 A;  4DR4 K;  3ZT2 A;  5AR0 A;  1T3V A;  4YFU A;  2NLX A;  1W0H A;  4O44 A;  3SLC A;  4JS4 A;  4CHO A;  4KHW A;  3CCJ N;  2PYL A;  1NK8 A;  4X62 K;  5C15 A;  1YAG A;  1HX1 A;  3JXU A;  3HP9 A;  4AHV A;  3HPG A;  1QE1 A;  4AM7 A;  4DQP A;  3HSC A;  1K9M O;  4JLH A;  4BRA A;  3SYZ A;  3DXK A;  2OCE A;  5AQU A;  4JEP A;  1KC8 O;  4F4K A;  3QET A;  1W9H A;  4KH4 A;  2KHO A;  1VSE A;  3VQA A;  1NK9 A;  1KD1 O;  4JRQ A;  1WSF A;  3CYM A;  3GBT A;  4MLE A;  3B8A X;  2A6A A;  2BDP A;  3NFA A;  2HHQ A;  4FCY A;  1D5A A;  1VQM N;  4DU3 A;  4IFY A;  3EKS A;  5ADX H;  4FWL A;  1NGF A;  1RBR A;  4GKK K;  2ZJP L;  2FF6 A;  1Q18 A;  3VF4 A;  2D0P A;  4U67 L;  3A5M C;  4YOY A;  3CMA N;  5E41 A;  3V9S A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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