3CCJN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation c2534u
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 41
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccjN00
3PIOL 4IOCL 3CCMN 3CC4N 5HL7L 1YITN 1VQ4N 1VQNN 3PIPL 3CPWM 4IOAL 3CMAN 2ZJPL 1YHQN 3CCVN 4U67L 1VQ7N 5DM7L 1S72N 1VQ6N 1YIJN 1QVGM 3CMEN 3CC7N 3OW2M 3G71N 1VQPN 3G4SN 3J7ZO 2ZJQL 1QVFM 4IO9L 1VQ9N 3CCRN 1Q7YO 2ZJRL 1YJWN 5DM6L 2OTLN 1N8RO 1W2BM 1KQSM 3CD6N 1ILYA 4UY8O 1M90O 1K8AO 1KC8O 1Q86O 3G6EN 3CCLN 1YJ9N 1VQMN 5JVHL 1KD1O 5GAGP 3CCJN 3DLLL 3I56N 1Q81O 4WFAL 2OTJN 4WFNL 1JJ2M 1VQ8N 5GAEP 1YJNN 1K73O 1OVYA 5GADP 1VQKN 3CCSN 5GAHP 1M1KO 3CF5L 2QA4N 3CXCM 3CC2N 4WFBL 1K9MO 1VQ5N 3CCUN 2QEXN 1VQLN 5JVGL 1YI2N 3CCQN 1Q82O 1NJIO 3I55N 3CCEN 5MLCQ 4WF9L 5H1SQ 4WCEL 1VQON
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QAGA 4FJNA 1S1XA 4PQUA 4H5VA 4B1WB 3KIOA 4DFMA 1U45A 3L0QA 3E66A 3TR8A 3AVHA 3OS2A 5AQMA 3AVAA 1BU6O 2YHWA 3OBYA 1BQMA 1RDDA 3KKRA 1QHAA 3H1VX 4AH9A 4OO1J 3T7ZA 1XWLA 2HMPA 2OPPA 3AVJA 3THYA 2F4VK 1RBSA 3VN5A 4DSEA 5E26A 3ZSWA 4A57A 1N8RO 2ZM6K 4YY3K 3O9RA 4G1QA 4AILC 3C7NA 3P83D 3OA9A 1NK8A 2FBYA 1GOAA 2ZQBA 1RT6A 3L2RA 4FLZA 4WQ4C 4CGJA 1R0AA 1FXXA 1U2VB 4CJTA 1SL0A 4JLHA 5FPNA 5AZIA 4MLHA 3DXMA 4FJXA 5E41A 4IFYA 5AR0A 1NU0A 4BRMA 2E20A 3ZSOA 1LV5A 2XY7A 1D8YA 4Z4CA 3AO4A 3P31A 3FE1A 4E7LA 4PKGA 3ZT3A 3HT3A 4RW7A 1T44A 2VWJA 5LMUK 2P1JA 3O9UA 3W0LA 3DRRA 1N36K 1XMQK 1HX1A 4YOXA 2QWLA 5AQFA 3O08A 3HOTA 1V4SA 2O8EB 4BC3A 3A5LC 3AVBA 3T1AA 4DR2K 4Z4HA 4DV2K 1DKGD 4DFKA 3PX6A 1NK9A 1BA0A 3CPWM 4FJJA 4KTZA 3EYZA 2G8IA 3TAPA 1VQ7N 3SPYA 4B9UA 1NMNA 2V7ZA 1NGAA 4I7FA 2HBLA 5AQJA 4A2BA 3ZSQA 4BVPA 3A8YA 4MFBA 3EKUA 3TU5A 4KPYA 2HNDA 1IBMK 3WNHA 2UU9K 4DR7K 3OYIA 3LWLA 4TSXA 4EHTA 1DTQA 3PSFA 3WEEB 1E4GT 3ZSVA 1BI4A 3KWGA 1RTIA 1U04A 4CFDA 4N56A 1VQMN 2HF3A 4BE1A 4FZYA 4BQZA 2GTDA 1N34K 4QOZB 4KBOA 4CGIA 2XY6A 4FLXA 4CEEA 2OPSA 3LWMA 4E19A 5CE3A 1KVBA 2VYPA 4F8RA 3FZKA 1VAZA 2JLEA 3L3UA 4JKBA 4A2AA 4OGEA 1NLVA 2RN2A 4BR0A 4ZHRA 2AA4A 4Z4EA 4BRHA 1RT1A 3HSCA 3RSEB 5KPRA 5EXWA 3L2UA 4B3TK 3AY9A 3LALA 3KTQA 1Q8IA 1HKBA 2IS3A 2NLXA 2Q97A 3H08A 4B3SK 1K9MO 4EAHD 1O13A 2Y1IA 3VEYA 1XC9A 1UWBA 2G8KA 3EKSA 1JXEA 3MXIA 3SAHA 1JKHA 2UYTA 1BISA 4EP5A 4FJ7A 2IVNA 3KK3A 3C6TA 4WE1A 2HW3A 4CF9A 1C0UA 4O5FA 3CCQN 3PUFA 4CEZA 5AZJB 3KVGA 2HOEA 3ITHA 2QTDA 4E89A 1KSPA 3AGRA 4CHYA 2BTFA 1BWFO 1JLAA 3BP8A 4CEAA 5FLXO 4GV6A 1P8ZA 2QWRA 1VQON 1NK6A 3BF3A 4HUGA 2YHYA 4B3RK 3I8BA 1KLMA 2P9UB 3WXMB 2RF2A 4I2PA 4Z4FA 5AQHA 2WBNA 3SBGA 3EZWA 3ISNC 3FR0A 1RBTA 1TYQA 4JI2K 3UB5A 1HMVA 3RMCA 2P51A 4BRAA 3IAYA 4LH5A 3U3YA 2GBZA 2E6MA 2YI1A 4AHVA 4CBUA 3HO1A 2VWKA 3UKRA 4FLTA 2HHSA 1RTHA 5EOYA 3ULDA 4L8RB 2DY4A 4PWDA 1C6VA 1KC8O 3HPHA 3MXMA 2W42A 3CCLN 5AQNA 4CJSA 4FVMA 3C95A 1IV0A 4BC5A 2V7YA 4DTUA 4OKKA 5AQWA 5GIPA 1LW0A 3MEEA 4K43A 4PKIA 4PKHA 4BWJA 2HBJA 3HSTB 4FWPA 3CJ7A 4DTJA 5TKWA 3S9HA 1WSIA 3NFAA 2NUBA 5FRMA 4GKKK 4OLAA 1VQ8N 1U2VA 1NMDA 3LAMA 1GLCG 1CZBA 4JS4A 3K57A 3AVMA 3KKSA 3GL1A 1C0MA 3VEXA 4DQRA 1MWMA 2A40A 4JI7K 4DUYK 4LFCK 2D0PA 4FW2A 3NCIA 3HOSA 4DV0K 5J2NA 2E88A 3IRXA 4JK9A 3WXJA 4OPHA 2D5RA 2XRIA 4Q0BA 4DF4A 3UKUB 4E3SA 3O3GA 4C8OA 3VTIA 2P9PB 1YI2N 5C24A 3VQ9A 3AA5X 2A5XA 5ADXH 1NOYA 1EWQA 2VWBA 4PA1A 4DS4A 4FW1A 1A5VA 4DU3A 3WT0A 2NRHA 3P4IA 4FWLA 3VQBA 4CHZA 3ENBA 1QQMA 3ZX0A 3G25A 2O8EA 5AQQA 2GELA 3TABA 4A5BA 4K25A 4YOUA 4DU4A 1JLQA 1VSDA 2FSJA 3THXB 3UIQA 3VQ5A 4DSJA 2QXLA 4X66K 1YTUA 3CYMA 3OYGA 1VQ6N 3OYKA 3C0BA 2ZE2A 1RDUA 1ZXOA 4DV7K 2W40A 2QKKA 4HUEA 3CJCA 4BY9C 2I5JA 2F7TA 3ZETB 1IBLK 5J2QA 1RFQA 1G15A 4H5RA 3CCRN 2VG6A 1QZ5A 4IEEA 1OH5A 3PSIA 2ZJRL 4KI6A 3K2PA 3ULEB 5HROA 3VF2A 2X78A 4E7JA 4LSNA 4LF5K 3U3GA 4DV1K 1Y97A 1HKCA 4EFHA 1UOCA 4CHNA 4XH4A 5SZTA 4C8KA 4M3WA 3AO1A 1KLNA 3VQPA 5KI6A 3AVIA 1WB9A 3WEEA 1WNSA 2A6AA 4YOYA 4DQQA 1HKGA 1SL1A 5KQDA 1X3NA 4NYFA 3ID8A 4KO0A 3U9DA 3ZEUB 3OYNA 2NRZA 3VOVA 5KGWA 2ITMA 5BR9A 4O8KA 1KFSA 5AQRA 4CZIA 1EO1A 1OVYA 3EEQA 3OYFA 1GOBA 4J8FA 5I9EB 1S1UA 3CXCM 5BRDA 5CZ1A 4CFAA 2D0AA 5BPNA 3VGLA 4M3XA 3F73A 4BRNA 3RSEA 1XQSC 4FK0A 3VMFB 3TSPA 1Y64A 3J7AP 3QB0A 4CFBA 4JI5K 4KH5A 4DUZK 3MX5A 4CF2A 4QS9A 1QSYA 4M45A 3RR7A 2I7PA 1QQOA 2YKNA 3AVLA 1XNRK 2YNHA 5AZJA 2QM1A 4GVEA 1QE1A 3CETA 4XH5A 4DFJA 4CGFA 4CIGA 3MAQA 1ATSA 3R1XA 4B1UB 5AQIA 1ZBSA 3V1OA 4RWTA 3J80O 1YHQN 2E8AA 3LDQA 3OS0A 1SKRA 3F9MA 2P9UA 1XI1A 4JD2B 3QEIA 1VSIA 1S1VA 2A1SA 5HRSA 3DM2A 3N4QA 5HP1A 3LPTA 1N33K 4ELVA 4NXNK 5AQLA 3K5OA 4F3OA 1Q7YO 4DTNA 4JKDA 1YJWN 3O4NA 4AF1A 1NKEA 3THWB 2RHKA 1Q86O 1BO5O 2JGUA 1G99A 4CF1A 2ZD1A 5JVHL 3MXJA 2JWKA 5TKYA 4DR1K 1JXBA 3D2EB 4CERA 3SMPA 3CHWA 3EY1A 4ELTA 3B8AX 3RWUA 1RGIA 2PAVA 4H8KA 1HJOA 3L8BA 4F2SA 4CESA 5AQGA 2OCEA 4CHOA 2OZSA 4CF0A 4WFNL 2P9LA 2RKIA 1IKXA 3Q7BA 3E9PA 3K5NA 4CJWA 4NLBA 3M8PA 4DKWA 4HCBA 3LDOA 5ADXA 2FXUA 4B9MA 1L3VA 2EWSA 1EWRA 1BA1A 5ELZA 3AA2A 3A2FA 4JKCA 3ZX2A 4C23A 4BRCA 2V51B 1K6YA 5AQPA 5EX5A 4BACA 3NF8A 1W7AA 3K9KA 2NRWA 3MN6A 3AVFA 3SUNA 4FPAA 4BE2A 4CJ4A 3HP9A 3QERA 1U49A 4BRFA 1YUWA 1QQNA 3CJBA 3FLCO 3AVNA 3HBTA 3CCEN 2F96A 3DAWA 3C65A 2P9PA 4FWKA 4NCAA 4BRLA 4CJVA 1ATRA 3O80A 3AO2A 3IUCA 4CZMA 2HVIA 4FWQA 2Q0RA 3E01A 3BGRA 4BQLA 2X6NA 3VF4A 2IGIA 3R9PA 3DXKB 3WXKA 2NNWA 4C1NK 3JSMA 4CF8A 4YFUA 5B8HA 4DG1A 3HVRA 1BDGA 1W97L 1NG9A 5M1KA 4JS5A 1L3TA 1GLDG 1HNWK 3VQ6A 1NKBA 1TUYA 2YNFA 5J1EA 1LWCA 1W0HA 4X64K 4IO9L 4HWIA 4FWRA 3HP6A 3HL8A 4B8AB 3OYHA 4CJUA 2HNYA 3O9TA 3ZETA 4N41A 5I42A 4DSIA 4FCYA 3W3DA 1ILYA 1TYQB 1WUAA 4MDAA 4UY8O 4WYBA 1ASVA 2QWOA 3R8EA 3ULEA 3G6EN 4DR6K 2OPRA 2E2QA 1JL2A 4YDUC 4J2EA 3WXLA 3NGZA 2YV0X 3GBTA 5GAGP 3OYLA 3UKRB 2IAJA 2F9TA 3ZSYA 2ZF5O 1EXQA 2G8FA 4NCBA 1LW2A 5CZ2A 1BHLA 1X3MA 4FJLA 2Q36A 2OPQA 1JJ2M 4A62A 3VGMA 4H5NA 4CIEA 1WAJA 2I7NA 4FOEA 3ZEUA 2EX3A 1L3UA 3C6HA 3L3VA 1XUPO 3J7YP 1S1WA 3O9SA 2WC9A 2A1RA 4HTUA 3CJAA 1IG9A 4DR4K 4FJHA 2D4WA 4ILHA 1NGFA 2P9KB 3O6WA 4K8ZA 5M1FA 2XO7A 3MMVA 3OJSA 2OYQA 5BPMA 1CZ9A 5CY4A 1YT3A 1OH7A 4BRIA 1TVRA 3NBPA 3NF7A 4RTFD 3MN7A 2HHHK 4IEIA 5FRNA 4RW6A 4LH4A 2HHVA 4NB4A 2Q3SA 3N4PA 2ITGA 4CIFA 3CERA 4B9TA 1MWKA 1QS4A 4FWOA 1VRTA 4H0TB 4I9QA 4BR4A 4JI1K 2VG5A 3DLRA 4FJ8A 1KAYA 2YCHA 1GLEG 1NJWA 3I0SA 5C25A 5C0YA 2G8UA 3LAKA 3ZT1A 2G8VA 3D7EO 1GLJO 3EE8A 3O8MA 3DLHA 2P9IB 3J7ZO 2QWQA 4DSLA 3HI0A 4CEQA 3RRHA 1HUXA 4JD2A 2QXFA 2HHQA 2CH5A 1CLQA 4B1ZA 3NH1A 4PY5A 2OTLN 4G9ZA 4MO5A 5J2MA 3CQ8A 2E5LK 1NGHA 4KHPK 3KLFA 4MDBA 2FSNA 2HVHA 5HRNA 1TL3A 3E9OA 1MDUB 1WBBA 3THWA 2O8CB 3TAEA 4DTSA 2YJFA 3A5OC 3QBWA 3AVGA 4KFBA 3HM8A 1HYZA 2D1KA 1KXPA 3D2EA 4ISFA 3WNFA 4CEBA 4K41A 3TWHA 3FFIA 3RTVA 4FLWA 1LWFA 3TANA 4DCHA 4NXMK 4FPBA 3NH0A 4BR9A 4BG8A 4JYAK 5CR4A 2NZTA 1HQUA 3VEWA 1L3SA 3NGYA 4JHDB 1BGXT 4M3TA 1FK9A 2EHGA 4CK2A 4FXDA 4O0JA 4PL7A 3C6UA 4E7IA 1FW6A 1E3MA 1VSMA 3CCUN 1Z25A 1SQKA 4JK8A 3LM9A 3SZ2A 2F9WA 4BDPA 4CGGA 4MQ3A 2Q1NA 1YXQA 2DFFA 3SAGA 4MLEA 3NVMA 3VQ4A 4RW9A 4WF9L 4DR5K 4CZGA 5H1SQ 4CHPA 3KD5E 1RT5A 3H3OB 3IDHA 1T03A 3ZSRA 3NH2A 3CC4N 1D9DA 1VQNN 3U9ZA 1BUPA 3K58A 2Z1GA 4WQ4A 1T3VA 4FWMA 3CMAN 3PV8A 1IJJA 3NHGA 3KJVA 5AQSA 3DXKA 3O9QA 1RT3A 2FBTA 4LSLA 4CEOA 4Z0UA 1Q9XA 5C15A 4MO4A 1ITGA 5JLFA 3G71N 1MA9B 4FLUA 2ZJQL 1E4FT 1JCGA 1J53A 1NGEA 3WNEA 3VA3A 3V81A 5DM6L 1RCHA 1A5XA 1J5OA 5HBMA 1I94K 3ATUA 3HVTA 2KFNA 4IDKA 2IC3A 4IWVA 4B3MK 4YORA 1SZ2A 1SUQA 3F9KA 2UUBK 4DQ8A 3SUQA 2PZSA 3BF1A 3G10A 4ZTFA 3FZMA 2DFEA 4GY2B 4DQPA 4FJ5A 4C8MA 2LSNA 3ENOA 4N76A 3AARA 4N47A 4C1NI 4KB0A 4LFBK 4QCLA 1CXUA 3SJJA 4JK7A 3OYMA 3QMLA 2P9LB 4W5QA 3K5LA 1SAZA 4CCHA 1C1BA 1HNXK 3SYZA 1VQ5N 1VRUA 3BDPA 2Z1JA 4K42A 1KCFA 3TAFA 5FPMA 2FF6A 3MX2A 2P9KA 5KRTA 1WSEA 3VEVA 1TKTA 2E6LA 4PUOA 3I55N 4C8NA 4B9VA 4W5OA 3SBTA 2FC0A 5MLCQ 2NRXA 4FO0A 3LL3A 4H0VB 5AFUH 3M8QA 3Q7CA 1IBKK 4AHRA 3PO5A 5AQXA 1C1AA 1DEJA 3CFOA 1KFDA 3CCMN 4FVUA 2QW9A 3AA3A 1J54A 4BGAA 1DT9A 4R79A 5JS2A 4AM6A 4DQIA 4IOAL 1TAQA 3FZLA 2HMIA 3DOLA 1GLBG 4DB3A 1HYSA 4WQ5C 2UUAK 3QEPA 2XY8A 5AQKA 1VK0A 4GVMA 3L6QA 3ALYA 3D0PA 5C10A 4BG9A 3KZBA 3O1WA 2F8SA 1J5EK 4X65K 4C8LA 1NWKA 3L4QA 2IOCA 4FK4A 2E1YA 4CJKA 2BDPA 3KWIA 5IT9O 4LF4K 2P9IA 2AP1A 1S5JA 5BPLA 1TL1A 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1JCEA 1YTAA 2HB5A 3K59A 1HNVA 4FYDA 3TAQA 4JI3K 1K73O 3ZX3A 4NYNA 1M1KO 1XMOK 4DSFA 1WSGA 4M42A 3OHRA 3VQAA 2IDOA 2P9SA 3ENHA 4JAXA 4RW4A 3H1QA 4YOWA 3B6OA 3BY5A 5AFUA 2E2PA 4EHUA 4GV3A 1TK8A 1D5AA 1WOQA 3KLEA 4NCGA 2QEXN 1RBVA 2X6SA 4JI4K 3V9XA 1NGCA 3BEXA 2Y1JA 3QNNA 1Q82O 1WSHA 3CG7A 3EO3A 3V4IA 3F2KA 1RBRA 5EY4A 3T1HK 3SQ1A 5LJWA 3ATVA 1C1CA 3SPZA 1ZBUA 4YHHK 4W5NA 1TAUA 3EL2A 5KTQA 1J9AA 4DSKA 3LPUA 3MN9A 2YNIA 3DWLA 2DFHA 2E2NA 2A42A 1RNHA 4CJ3A 4Y1DA 2HHWA 3CQYA 2P9NB 3NVKA 1WSJA 3VEOA 1NK0A 4CGHA 3RMDA 4E7HA 1RILA 3SAFA 2WUSA 4DV5K 1V4TA 3VERA 2D0CA 3VQ8A 5KRSA 3G4SN 4YOTA 3P1GA 3O4QA 4BC4A 4CJFA 3A5NC 3D6RA 3OYCA 1S9GA 3H6EA 4JI6K 1R59O 2QI2A 3CQXA 4QS8A 1HNZK 2ZWHA 3V1QA 3VGKA 4ISGA 4DR3K 2J4RA 3QICA 3ZSXA 2VQEK 1ZBIA 3NF6A 3SI6A 5AQTA 2HBMA 2G8WA 4JI8K 4CHQA 4DTOA 1Q9YA 4FZZA 5AQOA 5M1NA 1OVQA 3HPOA 3V9ZA 2IVPA 5GADP 1HRHA 3C94A 1BOTO 3CCSN 1ESVA 3T3FA 5F2RA 4Z4GA 3OVNA 3V1RA 2DPNA 4E1JA 2E2OA 4CEDA 3CC2N 4WFBL 3PX0A 4FZXC 2E1ZA 5AQVA 4GW6A 1TKXA 3QIOA 1Z6RA 3P38A 4FK2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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