3CCMN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2611u
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccmN00
5GAHP 5DM7L 1VQON 3G6EN 3G71N 1VQMN 1YI2N 3CC2N 5DM6L 3CC4N 1K9MO 1VQ7N 3CXCM 1YITN 1Q81O 1Q7YO 1VQ4N 3CMAN 3CC7N 3CF5L 1VQ9N 1K8AO 4UY8O 1YJNN 3CCUN 1S72N 1VQ8N 5JVHL 1Q82O 3CD6N 4IOAL 5HL7L 1VQKN 1QVFM 1KD1O 1OVYA 4IO9L 1YHQN 2QA4N 5JVGL 1QVGM 3CCLN 1VQ6N 3CCQN 3CCMN 1YIJN 1KC8O 5GAEP 3CCSN 3DLLL 5H1SQ 1N8RO 3PIOL 3I56N 3CCJN 3I55N 3CCEN 1M90O 2QEXN 1KQSM 1VQNN 1VQLN 1VQPN 1M1KO 4WF9L 1JJ2M 3CMEN 1ILYA 4U67L 4WFBL 1VQ5N 4WCEL 2ZJRL 5MLCQ 3CCVN 2ZJPL 3G4SN 3CPWM 3J7ZO 2OTJN 1NJIO 2ZJQL 1W2BM 3PIPL 3CCRN 1YJWN 4WFNL 5GADP 4WFAL 3OW2M 1K73O 1YJ9N 4IOCL 1Q86O 2OTLN 5GAGP
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KPTA 1VQON 4DWIA 1U4BA 2HF3A 4F9OA 4KHSA 4B08A 1KAZA 3CJ7A 2BGGA 1NGFA 4CJVA 1HJRA 4A59A 4FJNA 4NXMK 4EZ9A 4B3RK 1YVNA 1RT5A 4M3WA 3TU5A 3KD5E 1RFQA 3THYB 4Z4CA 1RDBA 4O5FA 4RW9A 3S3MA 5JLHA 3NF7A 4HUEA 1GOCA 3O4NA 5HRNA 2D0PA 3H08A 3HT3A 3F9MA 3RTVA 3CETA 4W5NA 3T7ZA 2RN2A 1YHQN 3OYCA 4NYFA 1DKGD 4JD2A 4MO4A 1VQ6N 4IKFA 2RKIA 3L8BA 2DY4A 3ISNC 4JN4A 4BWJA 4K25A 3J81O 1BI4A 1TL3A 1JCEA 3VQQA 3NH1A 3LL3A 2A41A 4C8OA 4JI8K 3CM5A 1JLCA 2VQFK 4LF5K 3K59A 1Q8IA 2W40A 5BR9A 3H3NO 4OKKA 4ILHA 1HNWK 4N56A 4H4MA 3PY8A 1ITGA 3TAMA 3RRHA 3QICA 1BA1A 2UU9K 4JK7A 3VA3A 1NK7A 4DR4K 3O4QA 1CZ9A 3AGRA 1SL0A 3AVGA 4IFVA 2RE2A 3TAPA 2O8CA 3T1YK 4KBOA 4FZYA 4CF1A 4FWPA 5D3GA 4H4OA 1GOAA 4DV7K 2YNIA 4FL9A 4Z4EA 3FZHA 3LP1A 1LCUA 5AQHA 2IGIA 1IKWA 3OW2M 3VGMA 2ASPA 5DM7L 1U48A 4Q0BA 5AQRA 3G71N 3CJBA 4CK2A 3C0BA 4KHQA 2VWBA 1V4SA 2E5LK 3BF1A 2BUPA 4E3SA 4BR0A 1T8EA 2P9NA 2HHQA 2P9PB 2ASMA 4DLEA 3L6QA 1UA0A 4NO7A 5C2FA 1QQNA 2QXLA 2HNZA 1BWFO 4H8KA 2FSJA 5FPDA 3R9PA 1VQ8N 4EAHD 1Q82O 4DFMA 5HOOA 4KTQA 4FM2A 3JXUA 1C1CA 1SAZA 3C65A 1VQKN 5EOYA 3CERA 1TK0A 2V52B 2HF4A 3PSIA 4NXNK 5LJWA 3SPYA 1NLVA 1WBBA 1RTDA 3CCQN 1KC8O 5AQFA 2JWKA 3T1AA 4DQIA 4CGFA 3CCSN 1CXQA 2P9IA 1C0TA 3IKMA 4H5WA 1D9FA 1LWEA 3P39A 4E1NA 4BRFA 1WNSA 3E9OA 3MN7A 4FPBA 1NGJA 1KSPA 4E7LA 4JKAA 1GLFO 3E9LA 3V4IA 3WXIA 1VSJA 3CM6A 3SMPA 4FPAA 4WQ5A 4J2EA 1ZBHA 3ZSQA 4CGJA 2I7PA 2P9KB 4XEIA 3L2RA 2YJFA 4RWTA 4M3YA 4GKKK 2HBLA 3EO3A 1VSDA 3THWB 4FJXA 1DGKN 1T3VA 2QXFA 4DU3A 3PO4A 3SLCA 3FFKB 3HBTA 4OO1J 3ALYA 1BHLA 3QFUA 1N36K 1S1TA 4FM1A 4B3MK 2VG7A 2OPPA 1GLAG 4YDUC 3AGKA 1QHAA 5I42A 3F5TA 1HUXA 1UWBA 4CJTA 3VA0A 3CG7A 3V1RA 5KPZA 3ZLJA 4CIEA 2OANA 3M8SA 3R3LA 4BWMA 1B92A 4IFYA 3VPZA 3G6EN 3ZEUB 2Z1JA 4BRIA 1VQMN 1YI2N 3VQBA 1YTUA 3HM8A 1W9HA 2AP1A 1BU6O 4O5BA 3BEXA 3AVMA 3NVMA 3HP9A 2OA8A 5SWMA 3ZSOA 3DLGA 3TABA 4OLBA 4FW2A 3DLRA 4IZ9A 5AQQA 1TK8A 1NGEA 1YJNN 3CCUN 1LOTB 4RCHA 4JK8A 2ASOA 4H0YB 2GWKA 4XH4A 1Y97A 2WONA 1KXPA 1LV5A 3M1FA 1OVYA 3FZLA 4F2SA 2KZMA 3EY1A 3ATUA 1N33K 5M1PA 2IAJA 4LF8K 2IDOA 4IXCA 4NLCA 3ENOA 2KTQA 2I5JA 5GAEP 4DQPA 3MXMA 4EHTA 4DHYA 3WXLA 1SZ2A 3C7NB 3OVNA 2NRZA 4K8XA 1VK0A 4JS4A 3CCJN 4GKJK 2A1SA 3ZT0A 3QINA 4B8AB 4BR2A 2HW3A 1WSIA 3FZKA 3OBWA 4FK4A 4W5RA 2VYPA 4HCBA 2VCPA 1VSFA 1Z26A 3A5LC 4DV1K 5KGWA 4IDHA 4WF9L 2G8UA 3E66A 2PZSA 4CJSA 4DFKA 3FR0A 2FF6A 4LSNA 4KB0A 2RF2A 1ATNA 4BVOA 1IBMK 5M1NA 3V6DA 4XH1A 4JKFA 3DJCA 5M1FA 5BPLA 1S1XA 4KI4A 4E7HA 1Z05A 3EE8A 5FPMA 1EWQA 5CZ2A 2A40A 3A2FA 3N4QA 3VEXA 2FXUA 4RW6A 1NOZA 2CH6A 4CFDA 1FK9A 3ULDA 3TAGA 4WFNL 4KI6A 2ITMA 4DKWA 3MMVA 4IEIA 4BR9A 1J6ZA 3LP2A 2W6LA 2CGLA 2WOMA 3TSPA 4CECA 4R79A 1C0MA 2GV9A 1NGAA 2BANA 4YOXA 5J2MA 3TSQA 4AM7A 4YOVA 2X74A 4L3QA 4LY7A 4ID1A 4FXDA 4QOZB 4AHRA 5GIOA 3O3GA 4N76A 3RMDA 1RBSA 4BG9A 4J8FA 3R8EA 2O8BA 3KJVA 1B9FA 3TARA 4K42A 4UY8O 5AQGA 2B4JA 4BC4A 2IOCA 4KHYA 1BQNA 1LWCA 3F2KA 3HSCA 5HL7L 5AFUH 1HYZA 3OYMA 4FJ8A 4WQ4A 1LWFA 2O4GA 5AZIB 1JL1A 1BISA 3OS1A 4HTLA 4DF8A 1RNHA 4A2AA 3AAQA 3AA4A 3VQPA 1XNRK 3VQ8A 3MECA 2WBNA 2YJEA 4HWIA 2CGKA 2F9TA 1XUPO 3NBPA 1EXQA 3MX5A 4K0KK 3DM2A 1RDAA 4IG3A 2WUSA 3PX4A 3SQ2A 3EE9A 3VESA 2JWLA 3V9XA 1T44A 1T03A 4BC5A 1N32K 1BO5O 3EN9A 1CXUA 5AQMA 3CJ9A 3VGKA 3IRXA 1XQSC 3OA9A 3QNNA 3MWTA 5CYMA 3FE1A 2KQ2A 3Q7BA 3LZJA 4RG8A 4PL8A 4CF9A 3KK3A 4KRFA 3RSEA 1BCOA 2NRVA 5KQ8A 2YHYA 1MDUB 2E2PA 5C15A 1XI1A 1Q9XA 4IJAA 1HX1A 3V9ZA 4OKEA 2E2NA 4OLAA 3CPEA 4IDKA 4M45A 4CZGA 4AM6A 2YNFA 3HPGA 1ASVA 4PHTX 3V81A 4O4GA 2ZJQL 5AQNA 3EZWA 4DV6K 3AO1A 4I6MA 4FWNA 1DEJA 2HHXA 5GADP 1I94K 4BR5A 1QSYA 1S5JA 4FWQA 1RBRA 4CJRA 4DTNA 2NRWA 5FPNA 4YNQA 4JHDA 3SJJA 1GLJO 4CJPA 4CJEA 2HVHA 3UKUA 1X9JA 3FLCO 1C6VA 1S22A 5M1QA 4CZIA 3SQ1A 2Q36A 1N6QA 3JYTA 3LALA 2OPSA 3AVCA 3K0SA 1NKEA 2PY5A 2Q97A 2FBVA 2D5RA 3HXMA 3KD1E 3CYMA 4CF2A 3IDHA 1VSKA 1SKSA 5AQXA 4NCBA 3VTHA 1J54A 1D4XA 3CHWA 4E7IA 1S6PA 4BRKA 2EWSA 1OH8A 1IG9A 3KK7A 3GOIA 3KTQA 2KFZA 2CH5A 3KIOA 3LDOA 5GIPA 5BR8K 3DXMB 3E1YA 2O8FB 4C8KA 3QESA 5HRRA 4JKCA 3DLLL 4B1WB 4EZ6A 4PUOA 1LW0A 3IS9A 4V19S 1N8RO 4CW7B 3PIOL 2QWMA 3TWHA 3TAQA 4JKGB 4HUFA 5AR0A 4AHCA 5AFUA 3C6TA 4H0TB 1KLNA 4FOIA 3ENHA 4QS9A 5LMUK 3NGZA 5EVZA 5C25A 3AVLA 4WFBL 4CJKA 1NOYA 4X62K 3CFRA 2ZJPL 3LDSA 1KRPA 4NLBA 2F4VK 2R7YA 3O9RA 4QS7A 3SCXA 5LL6Z 4OPHA 3CQYA 3MXJA 1HRHA 4A5AA 5IWAK 1QSSA 1U2VA 3VEOA 3CCRN 4CK3A 4JI6K 3G0ZA 4M7YA 1KCFA 4DR1K 3ID8A 4C1NK 4CGIA 4M63C 3L2WA 1IG8A 4EHUA 2ZE2A 3OYFA 4DU1A 3MAQA 3HOTA 1WLJA 3M6GA 4RTFD 2YNHA 5AJ3K 2FSNA 3JAMO 4GV6A 4OPJA 1GLCG 4DB3A 3NGIA 5C2DA 5AQYA 1YXQA 3CXCM 1OVQA 4Z4GA 1DTTA 1Q81O 3CC7N 3L0QA 4ID5A 1DLOA 1VQ9N 4DCHA 1QHTA 1ZYQA 3D7EO 1NM1A 4CJ7A 2A1RA 2GWJA 1RTHA 2P9PA 4BRMA 1U45A 4B9MA 4JAXA 5FRMA 5K14A 1FXXA 2QA4N 5JVGL 4CJFA 4DTRA 1J9AA 4BRCA 4EP5A 4CJWA 4CF0A 4JEPA 1ASUA 3SUPA 3OYNA 3MN9A 3ASMA 3HYFA 3KWIA 5FDLA 5H1SQ 3BUZB 4CK1A 4CGGA 1KVBA 5EX5A 5FLXO 3QEVA 3FGUA 3ITHA 3AO3A 3SJHA 5DMRA 3I56N 2HB5A 4WYBA 4BE0A 2XY7A 2WC9A 1CLQA 3WEEB 3MEEA 2Y1JA 3PX6A 5HRSA 1NKCA 1KQSM 3U9DA 3VEYA 4KH4A 1QE1A 2QWPA 3WNEA 3GBTA 1JJ2M 1RT6A 2XHBA 3CMEN 4QCLA 4FJIA 4MDBA 3MN5A 4FLXA 1X9SA 1E4FT 3G4SN 4LFCK 4KHPK 3LDLA 1S1WA 3NF6A 3LM9A 2UYTA 3ZSWA 4HVJA 4O8UA 1KAYA 2Q0RA 3QERA 4L8RB 1YF5L 2XY6A 5AQTA 4DV2K 3UE5A 4QAGA 3DOKA 3GE1A 5AQVA 1T05A 4O0IA 3G25A 3P38A 1FKOA 4DV4K 4CEQA 4B1VA 1MU2A 1IO2A 1NGIA 2KW4A 3L3VA 5AZJB 2FSKA 1HKBA 1NMDA 1P90A 2P9UB 4JKBA 4CZHA 1TYQB 1V4TA 4ELTA 5AQPA 3CC4N 4CFAA 3WNHA 2HHUA 1RGIA 3SK3A 1GLBG 2HBMA 3ZX3A 2OPQA 4NCGA 3O3FA 2D0CA 3ID6A 3K2PA 5CZ1A 3VERA 3CMAN 3MEGA 4CGHA 2E2OA 4FWOA 4FWSA 4R5PA 1P8ZA 4KO0A 1S1UA 4FWRA 1Z25A 2G8IA 3AVIA 1HKGA 2I7NA 4FWKA 5M1OA 1UAXA 2NUBA 3SUQA 1G15A 4C8LA 3S41A 4PY5A 3ZETA 2FBXA 3I0SA 4K43A 3IUCA 4OPAA 3HM9A 4DQRA 3L2QA 4IFEA 3QIPA 4MFBA 4HCCA 5EU7A 4PL7A 4JRQA 2AJQA 1TGOA 3P83D 4FZZA 1S9EA 4LSLA 1GLDG 3HRGA 2GTDA 5EXWA 4DSJA 3C7NA 3H46O 1ATRA 4FJ5A 2HHTA 4JI4K 2Q3SA 3K5OA 3NCIA 3H3OB 1VSEA 2B6AA 5C12A 5MLCQ 1BOTO 4Z4FA 4DTJA 3CI5A 3U9ZA 1XC9A 4FJLA 4KREA 4DTXA 1WN7A 4ELVA 1QQOA 4BE2A 3DRSA 3K57A 1B9DA 3CPWM 3RWUA 2OTJN 2ATQA 4A2BA 1NGBA 3CFPA 1YJWN 1SQKA 4AF1A 4PKGA 3RR7A 1R0AA 1YJ9N 3S3OA 4M7XA 1ASWA 1NK4A 4JD2B 3V1OA 1FJGK 1ESVA 3S3NA 4ILGB 5HLFA 4KPYA 5J2PA 3ZSRA 3KHYA 3GG4A 3J80O 1QSLA 3OYHA 4BVPA 3D2EA 3EL2A 2G8WA 5ELZA 1Q7YO 1WSJA 3CF5L 3HPHA 2Q2RA 5BN8A 4B9QA 4N47A 3NE6A 5JVHL 3DWLA 4BC2A 4CHQA 3O4WA 4PKIA 3VQ4A 1EWRA 4PWDA 1OH7A 1ZXOA 3D2FB 1RBUA 4MDAA 1KD1O 4AHTA 4O55A 3A5NC 3TTFA 3KLGA 3AAPA 4FSVA 4MQ3A 3SUNA 3NAEA 3JSMA 3A0IX 3QNOA 1R59O 4FOEA 1QZ6A 5AZIA 4FLZA 2YHWA 2PFUA 4E7KA 1X1PA 5E41A 3VF4A 4G1QA 3SQ4A 2ZF5O 1HKCA 5F0XA 1EETA 1KVAA 2RHKA 4LF7K 4B1ZA 1S6QA 4OPKA 2VWKA 1T6CA 4DV0K 3L4QA 3MXIA 3HTVA 1GOBA 2PAVA 4GVEA 3ZSVA 3THXB 4WCEL 1SL1A 2Z1IA 3AVHA 4DS5A 2QWLA 1SKRA 3M8QA 2BTFA 2V7ZA 4F2RA 3BGRA 4FLYA 1D9DA 3CQXA 3VOVA 3OTOK 3TAFA 4W5OA 4J2DA 4DSFA 1J5EK 3KVGA 4CFCA 2UUCK 3O1BA 5KGXA 1KAXA 1D5AA 4KH5A 1J53A 3OYIA 2J4RA 4F3OA 1JLQA 1ILYA 4I7FA 5GAHP 1L3TA 3O08A 4DV3K 5I9EB 4BROA 3H1QA 4CEDA 3SI6A 1KVCA 4FLTA 2HHHK 1VAZA 4DQQA 1S9GA 1X3NA 4BDYA 3OYKA 4BRAA 3BP8A 3M3ZA 3KLIA 2FBTA 3DXKB 3FZMA 1K8KB 4H5NA 4CEFA 1F21A 1KFDA 3QEXA 4CZEA 1TKTA 2VWJA 3K5NA 3ZCMA 1RT4A 1NJZA 5AQWA 4BDPA 1Y64A 2JGUA 4FJMA 4BRNA 1UOCA 2DFEA 3BF3A 3SAGA 2KZZA 4DLGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5GAH P;  5DM7 L;  1VQO N;  3G6E N;  3G71 N;  1VQM N;  1YI2 N;  3CC2 N;  5DM6 L;  3CC4 N;  1K9M O;  1VQ7 N;  3CXC M;  1YIT N;  1Q81 O;  1Q7Y O;  1VQ4 N;  3CMA N;  3CC7 N;  3CF5 L;  1VQ9 N;  1K8A O;  4UY8 O;  1YJN N;  3CCU N;  1S72 N;  1VQ8 N;  5JVH L;  1Q82 O;  3CD6 N;  4IOA L;  5HL7 L;  1VQK N;  1QVF M;  1KD1 O;  1OVY A;  4IO9 L;  1YHQ N;  2QA4 N;  5JVG L;  1QVG M;  3CCL N;  1VQ6 N;  3CCQ N;  3CCM N;  1YIJ N;  1KC8 O;  5GAE P;  3CCS N;  3DLL L;  5H1S Q;  1N8R O;  3PIO L;  3I56 N;  3CCJ N;  3I55 N;  3CCE N;  1M90 O;  2QEX N;  1KQS M;  1VQN N;  1VQL N;  1VQP N;  1M1K O;  4WF9 L;  1JJ2 M;  3CME N;  1ILY A;  4U67 L;  4WFB L;  1VQ5 N;  4WCE L;  2ZJR L;  5MLC Q;  3CCV N;  2ZJP L;  3G4S N;  3CPW M;  3J7Z O;  2OTJ N;  1NJI O;  2ZJQ L;  1W2B M;  3PIP L;  3CCR N;  1YJW N;  4WFN L;  5GAD P;  4WFA L;  3OW2 M;  1K73 O;  1YJ9 N;  4IOC L;  1Q86 O;  2OTL N;  5GAG P; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 5KPT A;  1VQO N;  4DWI A;  1U4B A;  2HF3 A;  4F9O A;  4KHS A;  4B08 A;  1KAZ A;  3CJ7 A;  2BGG A;  1NGF A;  4CJV A;  1HJR A;  4A59 A;  4FJN A;  4NXM K;  4EZ9 A;  4B3R K;  1YVN A;  1RT5 A;  4M3W A;  3TU5 A;  3KD5 E;  1RFQ A;  3THY B;  4Z4C A;  1RDB A;  4O5F A;  4RW9 A;  3S3M A;  5JLH A;  3NF7 A;  4HUE A;  1GOC A;  3O4N A;  5HRN A;  2D0P A;  3H08 A;  3HT3 A;  3F9M A;  3RTV A;  3CET A;  4W5N A;  3T7Z A;  2RN2 A;  1YHQ N;  3OYC A;  4NYF A;  1DKG D;  4JD2 A;  4MO4 A;  1VQ6 N;  4IKF A;  2RKI A;  3L8B A;  2DY4 A;  3ISN C;  4JN4 A;  4BWJ A;  4K25 A;  3J81 O;  1BI4 A;  1TL3 A;  1JCE A;  3VQQ A;  3NH1 A;  3LL3 A;  2A41 A;  4C8O A;  4JI8 K;  3CM5 A;  1JLC A;  2VQF K;  4LF5 K;  3K59 A;  1Q8I A;  2W40 A;  5BR9 A;  3H3N O;  4OKK A;  4ILH A;  1HNW K;  4N56 A;  4H4M A;  3PY8 A;  1ITG A;  3TAM A;  3RRH A;  3QIC A;  1BA1 A;  2UU9 K;  4JK7 A;  3VA3 A;  1NK7 A;  4DR4 K;  3O4Q A;  1CZ9 A;  3AGR A;  1SL0 A;  3AVG A;  4IFV A;  2RE2 A;  3TAP A;  2O8C A;  3T1Y K;  4KBO A;  4FZY A;  4CF1 A;  4FWP A;  5D3G A;  4H4O A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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