3CCRN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation a2488c. density for anisomycin is visible but not included in the model.
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccrN00
1JJ2M 2QA4N 1M1KO 1YITN 3CCRN 1K73O 3CF5L 1YI2N 3CPWM 2OTJN 1N8RO 1VQPN 5JVHL 5HL7L 3CCVN 5GAHP 3PIPL 1QVGM 3J7ZO 2ZJRL 1K8AO 1Q86O 3G6EN 1K9MO 1W2BM 1VQMN 1VQKN 1YHQN 5JVGL 3CMAN 3CCMN 1VQ9N 3DLLL 5DM6L 3CCSN 3CCLN 1ILYA 3PIOL 5GADP 3CCQN 1KC8O 1VQLN 3CXCM 1OVYA 1Q82O 1Q81O 3OW2M 2OTLN 4U67L 3I56N 3I55N 1NJIO 1VQNN 5GAEP 3CMEN 1Q7YO 2ZJQL 3CCEN 4WFAL 4UY8O 1S72N 5MLCQ 4WF9L 1QVFM 1YIJN 4IOAL 5H1SQ 4IO9L 1VQ7N 2QEXN 3CC4N 4WFNL 3CC2N 3CC7N 1M90O 3CCUN 1VQ4N 5DM7L 1YJNN 1VQON 3CD6N 1KD1O 1VQ8N 3CCJN 1YJ9N 5GAGP 4WFBL 4WCEL 4IOCL 3G71N 1YJWN 1VQ6N 1KQSM 3G4SN 2ZJPL 1VQ5N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I9LA 2QA4N 3ZT1A 3GE1A 2P9LB 3SBGA 5EVZA 1UOCA 1TKZA 1U47A 2PZSA 1KLNA 1Y64A 4FZXC 3THWA 4B9TA 1IKYA 4OLAA 3VGMA 2OANA 1E4GT 2RPIA 1VAZA 3DAWA 3P39A 1RNHA 5HOOA 1X9WA 4HUEA 3NF8A 1CZ9A 4FPBA 1MU2A 3IDHA 2I5JA 1VSEA 2P9KB 4ELVA 3TU5A 4X65K 4FW2A 3P1GA 4CZIA 3MN9A 5ADXH 4FM2A 4FJLA 5GADP 4MO5A 2E6MA 1HQEA 1KAYA 4DV6K 1HNXK 4GY2B 3ASMA 1HLUA 1Q8IA 1BQNA 1IG8A 4JHDA 3SAFA 2O4GA 4L3QA 2RE2A 4CEAA 3WXKA 3Q7CA 3JSMA 4DV0K 4A5BA 1EP4A 1QTMA 3VQDA 3VGKA 3D0PA 4KHWA 3KZBA 5CZ1A 2ATQA 4KAZA 4EIAA 4W5NA 1C1BA 5EXWA 3LP1A 4PA1A 3ENOA 1QVFM 1ASVA 2CGJA 3O1BA 3F73A 3DMJA 4DV3K 4IO9L 2JGUA 4E89A 1HYVA 3M3ZA 1IBLK 4FK0A 3RVCA 4M3YA 1DTQA 4JKFA 2KFNA 4CEQA 5C2DA 3TSPA 4DTJA 3LAMA 4O0IA 3ZETA 4CJLA 4JYAK 4TSXA 5EX5A 4CBUA 5KPZA 4DR7K 4NLBA 3AVFA 1XHXA 4CERA 2P5GA 4FJKA 3QICA 5EOYA 2Q36A 4WFBL 4GV6A 4X64K 4FLZA 1VHXA 4CFAA 1TVRA 3ISNC 4QS8A 3D7EO 3QINA 3VF2A 2P9PA 1U48A 4FVMA 2WUSA 4W5OA 4JRPA 1KSPA 3NF7A 4O8UA 3HSTB 3VQ8A 5C42A 4JI0K 3CJAA 3QMLA 1B92A 1KVAA 1GLCG 2PFUA 1K73O 1L5UA 5I42A 4F3TA 3ZSOA 4K42A 3HL8A 4KV8A 2O8DA 1JXBA 2ZGZA 2P9SA 3DLBA 4JKBA 1RBSA 3ID8A 1SKSA 1IJJA 3VEOA 1K9MO 3IMXA 3U9ZA 3VN5A 3KTQA 1KVCA 1EKEA 4IG0A 5LJVA 1ASWA 1DKGD 3ZSXA 4H0VB 3ZX0A 2X6SA 1RDDA 5JLHA 4C8LA 3KK3A 3K57A 4I7FA 5AQRA 4GW6A 1KC8O 5AZIB 3ZSYA 3LDQA 2HNZA 3AGKA 4CGJA 2JWKA 2QKKA 1QQNA 2P9LA 4FLVA 3NVKA 3OW2M 3OYBA 4B9LA 4O5BA 2HNDA 4M41A 4OKKA 4B08A 3V6DA 1GLEG 5T7BA 4C8NA 4YY3K 1V4SA 5LJWA 4CF2A 3VEWA 3E66A 4FM0A 4CFBA 3DJCA 4B1UB 3UKUB 2HOEA 1EO1A 4DR4K 3RWUA 3V9ZA 3U4LA 1WLJA 2P9KA 2E4LA 2GBZA 3W3DA 3O5BA 4M3WA 4FLWA 4DTSA 4JI7K 3CC4N 4NXNK 2F4VK 4IXCA 3KKSA 1N34K 4YOVA 4LC9B 3V1RA 5C2FA 3M8QA 3TSUA 3TTCA 2YV0X 4CZGA 5BRFA 2P9IB 2UUBK 2EX3A 1D5AA 2HHWA 2KHOA 3ZX3A 1W0HA 2V7ZA 3VQEA 2ITGA 3C6HA 4EHUA 3ZYYX 4EZ9A 3HT3A 4F3OA 1TKXA 2VWBA 4LFAK 1NGBA 4IJNA 2O4IA 3NVMA 3NF6A 4CZEA 4JNEA 3WUHA 4DCHA 2B5JA 2IAJA 3CHWA 1N8RO 1ASUA 1RT6A 1GLLO 1YF5L 5FPMA 2OPQA 1C0MA 2X74A 3VESA 1E3MA 1HYSA 4BR2A 3IAYA 3EZWA 4JEPA 3GBTA 4ILJA 3CMAN 1LWEA 1BO5O 1YTUA 1ILYA 1NK9A 5LY3A 4K41A 4QAGA 2E2PA 2KKZA 1LWCA 4NCBA 2FF6A 4B3OA 2GEMA 1Q82O 2VGMA 1YVUA 1BCMA 2UYTA 4DSLA 4BRIA 1CXQA 2BANA 5AQXA 1X9JA 4FJ9A 3D2EB 1IKXA 3SZ2A 5KGWA 3ZSQA 5KPTA 1KXPA 4HHTA 4JD2B 1HQUA 4AHRA 3F9KA 2D0BA 4OLBA 4BVPA 3MN6A 1VSDA 4B1ZA 4W5TA 2IS3A 1NWKA 1WSHA 3V9WA 2IDOA 1U2VB 2QEXN 1TYQB 4BRPA 3CG7A 5AZIA 1NMDA 1SL0A 4DHYA 3CCUN 4NCGA 2KFZA 4DF4A 3J80O 2BUPA 5AQHA 1T3VA 2IVPA 4Z4EA 1U4BA 2HB5A 4A2AA 4DFJA 4X62K 1ATSA 5F1XA 5TKWA 4DLGA 3FE1A 4NYFA 3SNNA 4RW7A 5IWAK 2RHKA 3LP3A 4WCEL 3TSQA 4AHVA 1FJGK 4H8KA 3WNGA 1VK0A 5BN9A 1RT7A 1VQ5N 3TAMA 3UKUA 4JKGB 4PKHA 4QCLA 4JK9A 2AP1A 4C8OA 3VGLA 4DR1K 3THXA 1SQKA 3VENA 3KJVA 4EFHA 3L4QA 1YI2N 2NUBA 4O4GA 2E1YA 3AA2A 2W41A 2UUAK 3CCVN 4Z94A 5CY4A 4LF6K 4CGDA 4XIUA 1Q86O 2W6LA 1EWRA 2P9IA 3RMCA 2B4JA 2P9NB 1WSGA 4E1MA 3VQQA 2KQ2A 3BZCA 4DSJA 2WFBA 4ILGB 4B8AB 3HTVA 3ULEB 4JI2K 3T1HK 3SUNA 4OGCA 1VQLN 3F2KA 2KZZA 2RF2A 3SI6A 2EHGA 2GTDA 3E01A 5SWMA 1KTQA 2JWLA 4CIEA 4AHTA 4DF8A 5BRDA 1JLGA 3BEXA 1XI1A 1HUXA 4FLTA 1QS4A 4XEIA 4Z4HA 5LMUK 1JL1A 3LP0A 4BR0A 1HNWK 3O9TA 2ZM6K 3QNOA 3S9HA 2HW3A 1LW0A 3OY9A 1EQYA 3IKMA 2FSKA 3LWMA 3H6EA 2E8AA 1TK8A 3HK2A 1ZBFA 4FCYA 3ZSVA 5J2QA 4BC5A 1LWFA 1X9SA 3MMVA 4K43A 3FZLA 3ZSWA 4FSVA 5AQFA 4Z4CA 2X78A 1MDUB 3D2EA 3VMFB 4CGHA 4KHUA 5M1NA 1RT3A 2NRZA 4JD2A 2QTDA 4DV7K 1T6CA 3K2PA 1QSSA 4LF9K 1NK0A 3D6RA 4C8MA 3G25A 1JLQA 1DT9A 4BRCA 3O9SA 4OGEA 4JK8A 1G15A 1WSEA 4KBOA 1TGOA 3H1QA 1NNEA 5J2NA 1WN7A 1ZBUA 1U2VA 4JKAA 1JKHA 1RDCA 3SQ2A 4EZ6A 1TYQA 1TKTA 4CHOA 4DS5A 1I3AA 1UAXA 3DLEA 3HYFA 3NH1A 4BRFA 3O3GA 2WBNA 3RMDA 2F7TA 4BGAA 4K0KK 1JCGA 3AO3A 5JVGL 1VSIA 4JLHA 5HRSA 1X9MA 2FLOA 4CZJA 1BIZA 2VCPA 2D0AA 3M8SA 3Q7BA 4BRNA 4HTLA 2UUCK 4JI6K 2Y1JA 2Z1JA 3RRGA 3P4IA 4CJ7A 2Q3SA 4JKGA 4E3SA 3F5TA 5DK5A 4KPYA 4OX9K 3G10A 2JLEA 4FLXA 5FLXO 1T03A 1K6YA 3QEVA 1TAUA 3VQ9A 1QSYA 3UKRB 1CLQA 5JICA 3MXJA 3FZKA 3KLGA 3AVBA 4DU3A 4KI4A 1KFSA 3MN5A 5CZ2A 3VA3A 2Q1NA 4E19A 3PO4A 4C23A 3L2WA 2E2NA 1WAJA 3QBXA 4CF9A 2YNHA 1S1VA 4ID5A 2P9NA 4K8XA 3D2FB 3I0RA 1G99A 3AVAA 4FWMA 4NO7A 3BZKA 3O8MA 1VQ7N 3ULEA 2PBDA 4JK7A 3L8BA 4JI5K 4HCCA 1TL1A 1D4XA 4WYBA 3TTDA 5AZJB 5CYMA 4CZFA 3C6UA 3K59A 5F0XA 3KWIA 4YNQA 1VQ8N 3V1OA 4CBWA 2G8WA 1KVBA 4RW4A 3G71N 1YJWN 4H0YB 4B3SK 1SL1A 4RW8A 4JV5K 5KGXA 1NMNA 2E2QA 1IBMK 4CZLA 4DTUA 2YI1A 4N76A 3CCRN 1NJZA 3QO9A 4DTMA 1DGKN 4CJFA 3RMAA 1S5JA 5C10A 1HRHA 5HL7L 1SL2A 3MAQA 3L2UA 4KO0A 4GV9A 1RT4A 3ZT2A 2FBYA 4FZYA 4CEDA 4RW9A 2F8TA 2HBMA 4JN4A 4YOWA 3JAMO 2E5LK 4E7HA 3CPEA 1Q9XA 5J2MA 3WXLA 1NJXA 3AARA 1JLEA 4H5WA 5BR8K 1GOBA 4FJIA 4OKEA 1ZC6A 1N33K 4BG9A 2FBTA 3SPZA 4BRGA 2RN2A 3I0SA 2OZMA 4CJRA 3HVTA 3MEGA 2ASPA 3SJJA 5AQPA 2YKNA 3CQXA 3T3FA 2QW9A 4K25A 2VYPA 1HPMA 4Y0WA 1CZAN 4BC2A 2IIRA 2DFFA 3O9RA 3MCAB 2OPPA 1EX4A 2E1ZA 3VEZA 3WNHA 3TPQA 4CIGA 4M42A 4KTZA 2FBXA 3OYEA 3PSIA 3VQ4A 5C12A 3HVRA 3MXMA 3AVMA 3LWLA 1T8EA 2D5RA 3H1VX 3SQ1A 1FXXA 4BR5A 3CC7N 3UIQA 3OHRA 2E2OA 3MX2A 4FWNA 2AA4A 1RCHA 1UA0A 4KB1A 1NGIA 4RWTA 4A59A 3KK2A 4PWDA 1H1VA 3OS0A 1A5XA 3NE6A 4Z4IA 1A5WA 2I7NA 3IRXA 3LM2A 5E26A 3OJSA 2NNWA 5KTQA 3HM9A 3OA9A 4A2BA 4ELUA 4BR9A 2YNGA 1C1AA 4B1XB 4BRLA 3OYCA 3QNNA 3G4SN 2YHYA 3QIPA 2F9TA 1U45A 3CQYA 4CFDA 4HTUA 2Z1HA 4CGIA 2QWLA 4BREA 4F8RA 5FRMA 3CJ1A 3H45C 5BRHA 3HOSA 3SUQA 2A1SA 3DRPA 3D2FA 1HJOA 3OYDA 4QOZB 2GWJA 2O8BB 1SKWA 4E7JA 3A8YA 1I94K 3P5JA 3O08A 5ELZA 4BC3A 4RTFD 1KCFA 3L3VA 3J7ZO 4MO4A 2KZMA 3HP9A 2BE2A 3OYIA 3QESA 5AZJA 1SZ2A 1RTHA 4H0XB 1YAGA 4UQGA 3R8EA 3A5NC 2YNIA 3JYTA 2XHBA 3N4PA 2PAVA 4CBXA 3O3HA 2W6KA 4LY7A 2GELA 3TARA 4AHUA 1BG3A 4DUZK 3BUZB 3PIOL 3FFKB 3MX5A 3CJ7A 2NLXA 4DQSA 1TK0A 1YTAA 1TL3A 1MWKA 1RBTA 1ESVA 4LFBK 1O1WA 1B9DA 1C6VA 3LANA 2HHTA 4YOTA 4MDBA 5AQTA 3U6FA 1JL2A 3OS2A 3C6TA 4E7IA 3CCEN 1QZ5A 1ZXOA 4ZTJA 1NG9A 1HR0K 4O0JA 2NRVA 5J1EA 4JI3K 2HVHA 4G1QA 3J81O 1Q18A 3CM5A 4N56A 1S1WA 5I9EB 4R5PA 4KH6A 5KPRA 4M3ZA 4J2BA 3CC2N 2A42A 5HLFA 3VQPA 5JMVA 4CHPA 4CI6A 4DWIA 2AJQA 3GG4A 3VF6A 4ELTA 3DI6A 3QLHA 4OJRA 2YCHA 5AQQA 4FJGA 1VSMA 1S3XA 4IO8A 4IKFA 3AO2A 3VF4A 1U49A 3AA4A 4YHHK 4A61A 3IG1A 5LMNK 4CHZA 3MEEA 1RTDA 1VQ6N 1NGFA 3AGRA 5AQMA 4Q5VA 3L6QA 1J6ZA 2D0CA 3WXMB 4A5AA 2P1JA 4HVJA 3I8BA 3S3OA 1OH6A 4IZ9A 3SUPA 1NBWA 3QIOA 1RDAA 2DFHA 1X3NA 2OTJN 5JVHL 1FK9A 2HBKA 2QM1A 3IFRA 1C0GA 3LDLA 1HNVA 4NLCA 2O8EB 4CF0A 4FW1A 3QETA 1RTJA 5EY4A 5DMRA 2VQEK 3V1QA 3QEWA 4DR3K 3QEIA 1XC9A 1QHAA 3FR0A 4CZHA 1HX1A 5HRRA 1L3UA 3CETA 1HMVA 2XY8A 3LAKA 4FWSA 4ZTFA 2YHWA 4XH5A 3QDKA 1XNRK 5E41A 4PKIA 4R79A 2CGKA 3OYGA 2HVIA 5AQSA 2RKIA 1GOCA 2NRTA 1K8KB 4DLEA 1VQNN 5FPEA 4M3XA 4IEIA 2HHHK 2F9WA 4F2RA 4LD0A 1JLAA 5C15A 2QWQA 5AQKA 3ULDA 4LF5K 2QK9A 4IBNA 4ISEA 1Z25A 1XMQK 1LAWA 1ZYQA 1J54A 3QB0A 1Z6RA 3OYFA 4NXMK 3J8AA 2QWMA 3SQ0A 4CVNE 3LZIA 4FPAA 1IKWA 4CD1A 3VPZA 4Z0UA 2IC3A 2QWNA 3M1FA 1WAFA 4DQIA 2YHBA 4CEBA 4DV2K 4BR4A 3O3FA 4KH5A 3OVNA 3L2VA 3H3OB 4BE0A 4PL8A 1OH8A 1W9HA 1QQCA 1SAZA 3TTFA 4BDYA 2VG5A 4GNIA 4YOXA 4AH9A 1BU6O 3PSFA 4FO0A 5CHIA 3SLCA 5TKYA 3S3NA 2GX9A 2PY5A 3AA5X 1S9EA 2R7YA 3DYAA 1KFDA 4CECA 3PV8A 3E1YA 3LPUA 4BE2A 3MWTA 4KTWA 4FYDA 3IS9A 3HO1A 4KTQA 1JLFA 1NJWA 2ZF5O 4IJAA 3T1AA 1QVGM 2NZTA 3WT0A 1RFQA 5AQVA 3G6EN 4PY5A 3L2RA 4B9VA 1BA1A 3ENBA 4OKJA 1S1XA 2Q0RA 3SMPA 3CCMN 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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