3CCSN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccsN00
1K8AO 2ZJPL 1Q86O 3G71N 3CCEN 5GAGP 3CCRN 3CXCM 3PIOL 2QA4N 1NJIO 1YHQN 1KC8O 4WFAL 5JVGL 1VQ4N 1N8RO 1VQ9N 1M90O 4WF9L 1YJNN 1KQSM 1VQNN 1VQPN 5GAHP 2ZJRL 3CCVN 5JVHL 3CCQN 3J7ZO 2OTJN 3CCLN 1Q81O 4U67L 4WFNL 5DM6L 5MLCQ 3PIPL 3CPWM 1ILYA 1OVYA 5DM7L 4IOAL 1VQ5N 5HL7L 2ZJQL 3CF5L 1YJ9N 1KD1O 1VQMN 1JJ2M 3CD6N 5GADP 1QVFM 3I55N 1W2BM 3CC2N 4IO9L 1YJWN 3OW2M 1QVGM 4WFBL 3I56N 1VQ7N 3CCUN 2QEXN 1VQON 1VQLN 1S72N 3G4SN 1M1KO 4UY8O 1K73O 1Q82O 3CCJN 3CCSN 1K9MO 3CMAN 1VQKN 3CMEN 1VQ8N 1VQ6N 3DLLL 3CC4N 3CCMN 4WCEL 1YI2N 1Q7YO 3G6EN 2OTLN 5GAEP 4IOCL 3CC7N 1YIJN 5H1SQ 1YITN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EP4A 4JI8K 4XH1A 3TAGA 2HNYA 2XY7A 3HP9A 4JRPA 4KPYA 3V4IA 1JLBA 3CG7A 1NJIO 1YHQN 3QNOA 3TAMA 4CHOA 3M5RA 4DUZK 1M90O 4H03B 1BISA 3EKUA 4C23A 4CGIA 2XO7A 4BRHA 4OPAA 4YDUA 1F21A 5AQYA 4MLHA 3HVRA 1NLVA 3THXA 1IKYA 3HRGA 4U67L 1EWRA 3AVNA 5M1OA 4TSXA 3WXLA 1C1CA 1Y64A 3IRXA 2WTUA 2I7PA 5JLHA 4Z4FA 2G8KA 2E20A 3QEIA 5HP1A 2YI1A 2A5XA 4KRFA 3HM8A 4NO7A 2Q2RA 2VYPA 4CEEA 2P5GA 2KLAA 4GVMA 1ASUA 3DRSA 3HPHA 4BGBA 4IO9L 2ZM6K 5EU7A 3F2KA 3L2UA 3D0PA 4JKDA 1MA9B 1UA0A 5DMRA 3VQ5A 4CJ7A 1HKBA 4CZMA 5J2QA 3TARA 3HJFA 2VG6A 2P9KA 1VQ7N 4JV5K 1T44A 5FPDA 1S1VA 5LL6Z 1HQEA 4BRIA 1S1UA 1VQLN 2IVNA 3G4SN 3B8AX 2V51B 1RT5A 3FZLA 3KWIA 3P4IA 3IS9A 3BZKA 4DQPA 1XMOK 4FM0A 4CHQA 3HK2A 5BREA 3OYNA 5KPZA 4AHCA 5HBMA 1Q9XA 3ZSRA 3K59A 4B1ZA 4E19A 2GEMA 4IFYA 4EFHA 4X62K 1EQYA 1YIJN 3BZCA 4CJRA 5BPNA 1K8AO 2GUIA 2P51A 2WC9A 2W42A 3SNNA 4CFDA 4N47A 1L5UA 1J9AA 4LFAK 1NK9A 1C1AA 4CI6A 5KI6A 1W7AA 2ZWHA 1IBKK 2HHWA 1CZAN 3E9LA 2X78A 3E66A 4DHYA 3NE6A 4LH4A 4C8NA 1UOCA 2ITMA 1JLEA 2EWSA 3IUCA 4B9VA 4FK2A 1GLBG 2OTJN 2AJQA 3O3GA 4W5QA 4M63C 4H0TB 5AQTA 5BR8K 1SL2A 4DR2K 2F7TA 3ZT4A 2ZF5O 5C0YA 1GOBA 5AQXA 1D4XA 3A0IX 3P1GA 2YNHA 4FJKA 3OYAA 4ELVA 4FCYA 4I9LA 4CF8A 3R8EA 2E8AA 1GLJO 5M1KA 2VQFK 3W3DA 1UAXA 3T1AA 3ZSVA 1BA1A 4JLHA 3VTIA 4DQQA 4CZHA 1JLCA 4CHNA 1RTIA 3DAWA 1JLQA 4B3OA 4KHNA 4FWQA 2HHQA 4CF9A 3OYHA 4HUEA 3L6QA 3C7NB 4IJAA 1WAFA 3CCUN 3LANA 1T6CA 3RMAA 2DPNA 3I8DA 4CFCA 2HBKA 3SBGA 4HVJA 2OPQA 3HT3A 1B92A 1QSLA 3CCSN 1RCHA 3UKUA 4IZ9A 3M8RA 3CIPA 2G8WA 4Z94A 4H5RA 3SAFA 4FSVA 1NJWA 4FXDA 1VSDA 2FBVA 3U9ZA 4RTFD 4KB0A 3G6EN 3VQ7A 4M7XA 3ZSQA 4FJ5A 3SAGA 2E2QA 5CYMA 4JD2B 2OCEA 1G99A 2Q36A 3L8BA 3NVMA 1U45A 4IEEA 4DR3K 2O8FB 4DSJA 3LAKA 3IMXA 2HMPA 4B3TK 3FZFA 3ZSXA 2QWRA 4CJKA 2E2PA 4Q0BA 1XC3A 1FKOA 4E7JA 5M1QA 4WYBA 4BRDA 1TAQA 1XHZA 1Q18A 3ZEUA 3OYFA 3VEOA 4FVUA 1KFDA 3KWGA 3TAEA 3LP0A 2NRXA 3NGYA 4E3SA 1BI4B 4C1NK 4FJHA 3VQ9A 4HTUA 1YT3A 2QWNA 1Q81O 3P83D 3LP2A 2RPIA 4DQIA 3PLAA 5GIPA 3BF3A 4G1QA 3ID6A 5MLCQ 3QETA 4PHTX 2ZGYA 4FO0A 3AGRA 4YOWA 4DKWA 2O8BB 4BR5A 1RBRA 1VHXA 5C12A 2FC0A 4BY9C 3V1QA 3R1XA 3KD1E 2ASOA 4GV9A 3MEGA 5GADP 4BQLA 3I55N 2KZZA 1ZBUA 3L4QA 4JAXA 4R5PA 4WE1A 3AVCA 3AO2A 2IOCA 2QKKA 1U2VA 1C0GA 2QXLA 3WXIA 2GV9A 4A2AA 4J2BA 1E4FT 3RMDA 3O8MA 3UKRA 4EIAA 1ZBFA 4CJSA 1S5JA 4M3UA 3J81O 1UWBA 5LJWA 5LMNK 1XUPO 1TKDA 4A59A 1NK0A 2D0CA 5SWMA 3KLIA 3DJCA 3KK3A 1KLNA 3VENA 3CCMN 1ATRA 1QZ5A 3NDKA 1Q7YO 3CFRA 1RTDA 2B6AA 5ADXH 2P9PA 3TANA 2ASMA 4CZLA 1S6PA 4JI7K 4JI4K 3TAFA 3VMFB 4CJUA 3ITHA 4OPJA 1KVBA 4JKGB 4FZYA 4NCGA 4W5TA 3NF7A 3O4NA 1EO1A 3ZT2A 1RDBA 3SV3A 3MXJA 1L3SA 4BE2A 5FRMA 2UXBK 1NGHA 3AVFA 2GELA 2W41A 2BGGA 4H0PA 1NK8A 1BCOA 4H5VA 2VQEK 2FBXA 3MX5A 2GWJA 3D2EA 4QS8A 4WFAL 1MWKA 1NGFA 3HTVA 5AQNA 2IAJA 3UB5A 1EWQA 2ETJA 1VSJA 3TWHA 3U9DA 3ZCMA 2Z1HA 1BIUA 3CYMA 3F9KA 3O08A 5SZTA 4PWDA 4MDBA 2H3GX 4B8AB 3V9UA 4PY5A 1WAJA 4ID5A 1HUXA 4BG9A 1XMQK 3WQTA 3MWTA 4J2DA 2W6KA 3MX2A 3PSFA 4NLCA 2VG7A 2F4VK 3EO3A 4WQ5C 2VWKA 3PX6A 3S3OA 1N5YA 5BN9A 1HLUA 1HYVA 1LCUA 2D4WA 2P9IB 2A3ZA 4Q5VA 1MWMA 4BDPA 5AZJA 2BDPA 4DV5K 1OH7A 3AA4A 3ENOA 1W0HA 3MAQA 3DLEA 3VA0A 1KRPA 1IH7A 3VF4A 3EKSA 3THYB 2F9TA 2QWOA 4N56A 3C65A 4DTPA 3RR7A 3J7AP 4JKEA 2YNFA 2X6SA 3MDQA 1YTAA 1Z26A 3BUZB 2CH6A 3KZBA 4IJNA 2HSTA 4A5BA 2E6MA 3TR8A 1BWFO 5AQMA 4IBNA 1VQ6N 4CGFA 4DU1A 4CK3A 4DQ8A 5KQ8A 1O1WA 2FBTA 4C8LA 1MU2A 2P9LA 4BRAA 1TKXA 5HRRA 2O8DB 5GAEP 5BRHA 3SV4A 2F8TA 1LV5A 1A5WA 3KK1A 3WXKA 2O8EB 4CJQA 2JWLA 1ASWA 3KK7A 3OYLA 3K58A 4KTZA 3CCEN 1K8KB 1QZ6A 3LM2A 2Q3SA 4M3XA 4RW8A 3QO9A 3IKMA 5JS1A 2YHBA 5JS2A 3RSEB 2KFNA 5KPTA 4GNIA 1NMNA 4CZGA 1WB9A 2XRIA 3JSMA 4DFKA 3AA3A 3HYFA 1U49A 3CJBA 4OKJA 4FLUA 1X9JA 4O0JA 1VRTA 2YV0X 3ZSOA 1KAZA 4JHDB 4BVPA 5C15A 3OYCA 3DOKA 2RN2A 2HBJA 3NCIA 3J8AA 3M6GA 3SUQA 4FJLA 4O4GA 4H5TA 3AAPA 1CXUA 2Q0UA 1U04A 3QBWA 1BG3A 1EP4A 4LF5K 3OS0A 4BRCA 3NH1A 3NBPA 2HF4A 2PAVA 1ZC6A 4CEZA 1HJOA 5HL7L 1D9DA 4GVEA 4I2PA 5AQJA 3ZX3A 1VQMN 2P9SA 1RFQA 1YJWN 2E5LK 3PUFA 3F5TA 5KPRA 2P9UA 2WOMA 2P9NA 3OW2M 1QVGM 1IG9A 3RTVA 4YOVA 3ZYYX 3CM6A 3WEEB 1XWLA 4BRFA 3TPQA 1TYQA 3GDQA 3QIOA 4K8XA 3TAPA 4KV8A 1N32K 4F3OA 4L3QA 1RBTA 1L3UA 1X3NA 5J1EA 4YNQA 5HRSA 2G8IA 4CJEA 3P38A 4BROA 2FBYA 3DLKA 2VCPA 2X74A 4EZ6A 4BACA 4CIGA 4WCEL 1VSFA 5KGWA 3L2VA 1YI2N 1D8YA 4FWPA 1SV5A 2RF2A 3SPYA 1C0FA 1GLCG 3PV8A 4DTNA 4H4MA 2QM1A 1T7PA 3CM5A 2PYJA 3LWMA 2IC3A 3QEWA 3CCRN 2NRHA 1BOTO 3PIOL 4JN4A 1C1BA 2G8UA 4IXCA 4B1WB 2OPPA 4OVLA 3EYZA 1HQUA 4FJNA 5EXWA 1JLAA 4M3YA 3MMVA 2D1KA 3VN5A 3THXB 3LALA 3H1VX 2NLXA 5JMVA 3AVJA 4DV4K 3L3UA 1RT2A 4JK7A 3VQ6A 3AO5A 1QQCA 4Z4EA 3J80O 4ISFA 4JI3K 3K0SA 2QTDA 2HBLA 5M1NA 4DLGA 4JK9A 4XIUA 4O55A 4OGCA 3DXKA 4JI6K 5KGXA 4W5NA 4CEOA 5AQKA 3P31A 4Z4CA 2P9KB 2X6NA 3CERA 3AO3A 3KLFA 4IG3A 5FLXO 5AQQA 3Q7CA 3D45A 5AQZA 4O5BA 4CHPA 4WFBL 2PYLA 3E1YA 4M42A 2F8SA 3V81A 1WLJA 3FZHA 4BE0A 4CF1A 1HYZA 5JLFA 1Q82O 5K14A 3H3OB 1HNZK 1CLQA 3KJVA 4QOZB 1Q8IA 1NGEA 4DR5K 2UYTA 3ULEA 2D0PA 1VQKN 4K43A 3KKSA 3LPUA 2AA4A 3UE5A 1QQNA 3KLHA 1SKSA 3LDOA 4DTRA 4DB3A 3LZJA 3VQDA 3D6RA 1YF5L 4B9LA 3LP3A 1J5OA 3AV9A 3CHWA 2HHXA 3O9QA 4BR2A 3QMLA 3SK3A 4BGAA 3QICA 1T8EA 3LDPA 3K57A 4HCBA 5KQDA 3SI6A 3SQ0A 1MDUB 4WQ4A 3DRPA 2FLOA 1B9FA 4H4OA 1J53A 1D9FA 1ZBSA 4Z4GA 2KW4A 3CXCM 1HJRA 4CZEA 3ZETA 1NOYA 4ELUA 1NWKA 5LY3A 2GWKA 2A1SA 4X65K 4FLXA 1Z05A 4HTLA 1TKTA 4WF9L 4I2QA 1VQNN 2EX3A 3C6HA 1R59O 2F9WA 4YOTA 2D0BA 4DFMA 2HVIA 3U8XA 4E7IA 1KTQA 1RT4A 2KZMA 2JLEA 4KI6A 2O4GA 4WFNL 3S41A 4DSFA 5CZ2A 3VA3A 3RRGA 3IDHA 2B5JA 3K2PA 1LWFA 4PL8A 1XC9A 4FK4A 2HW3A 4GV6A 3L2WA 2QI2A 1LW2A 1RBVA 4MQ3A 1BO5O 1KD1O 3EN9A 4FWMA 4E1MA 2IGIA 1DLOA 3MXIA 3V1RA 1X9MA 3CPEA 3LDSA 1A5VA 4A2BA 3OYGA 3H45C 1SZ2A 4Y1CA 4IWVA 1FKPA 3CJCA 4NXMK 4FWSA 3OS1A 4FW2A 5HROA 3O6WA 3NGZA 1IJJA 4JKHA 5FPEA 4DF8A 4BRMA 2WBNA 1GLEG 3N4PA 4BC2A 4UQGA 3WT0A 4B9SA 4XH4A 5C42A 1W9HA 4F4KA 1S1TA 1ITGA 1YAGA 4FYDA 5E84A 2W40A 2E4LA 3DXMA 1W97L 1NGJA 3R9PA 4Y0WA 3QEVA 4NXNK 3PO5A 3I33A 4IDKA 4DTJA 4DG1A 3KLEA 3ENHA 1Z6RA 1NGGA 3ZEUB 1NGDA 4I7FA 2V7ZA 4YOXA 5BRDA 1RBSA 1C0MA 3V9ZA 2J4RA 4FLVA 5FRNA 1WSJA 1NGIA 3M8QA 1IV0A 5KRSA 4CJVA 4QAGA 4N41A 3OYMA 3QEPA 1SS6A 4DFJA 1SAZA 3L0QA 1EETA 4C8MA 3K9JA 4KHPK 2KKZA 3KVGA 4DLEA 2FF3B 2D5RA 1X9SA 1JXBA 1L3VA 1K6YA 3NF9A 1SKWA 5J2PA 3H3NO 3V9SA 2UUBK 3C7NA 2E2OA 2YNGA 3CJ7A 2PZSA 3MCAB 4FPBA 4AHUA 4J2AA 1E3MA 3E9PA 4PUOA 4FWKA 4U7BA 3DI6A 3C6AA 2YKNA 3DLBA 4FJGA 3V9WA 5TKWA 2HHTA 4CJTA 4CBUA 4DF4A 3C95A 5AQIA 4A5AA 4J2EA 1X3MA 3BF1A 4IFEA 1HPMA 2CGJA 3H08A 4JKBA 3OJSA 3CCJN 4H5WA 3A8YA 5BPLA 4LSLA 1QSYA 5AFUA 4LC9B 4CF2A 1RT6A 3CMEN 4BRLA 1VQ8N 1RT3A 4JEPA 3TABA 4K42A 3SQ1A 4KI4A 3VOVA 4WQ5A 3BEXA 4OGEA 1JKHA 3S3MA 1TVRA 1HX1A 4OJRA 4FL9A 2Y1JA 4LY7A 3CJ9A 3HVTA 5CYQA 4I9QA 2P1JA 3A5NC 4CJ4A 2ZQBA 3M3ZA 1ZBIA 1VSLA 4CGJA 3AO4A 3O5BA 5AR0A 1NKBA 3GOIA 3SUPA 4KTQA 3MN7A 4CZIA 4O0IA 5CHIA 1JLGA 1S9GA 1BI4A 2VG5A 4O5FA 4IDHA 3O9RA 3AAQA 1KLMA 3ALYA 2ASPA 3LDLA 1G15A 5GAHP 4NYFA 2ZJRL 4IG0A 4DSLA 1GLAG 2O8BA 4LSNA 3CFOA 3TSPA 5AJ3K 2YCHA 3C0BA 4CGHA 2O8CB 3D2FA 3ID8A 4MLEA 1KVCA 2CGKA 4AF1A 3QIPA 5DM6L 4PQUA 4PKHA 1J6ZA 5AZIB 3WQUA 3I0RA 2V7YA 5B8HA 4FJJA 1ILYA 1KXPA 3QFUA 1KFSA 5IWAK 2Y1IA 3LDNA 1OVYA 1I39A 1ZBHA 1CZ9A 3CI5A 3VERA 4IKFA 3VGLA 1WNSA 1HNVA 4NB4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3C6U A;  4BRP A;  5GIO A;  2YJF A;  1D5A A;  4CEF A;  1VQP N;  1WSI A;  3THW B;  2NZT A;  4DUY K;  3MN9 A;  3QB0 A;  5HRP A;  3BP8 A;  3AVM A;  3SQ4 A;  4AM7 A;  2Z1I A;  4CBX A;  4IFV A;  3NF6 A;  5J2N A;  1P8Z A;  3SZ2 A;  4JHD A;  1RT1 A;  2A1R A;  3TSQ A;  4H5N A;  5AQG A;  3H6E A;  4FK0 A;  4QS7 A;  4BE1 A;  3OA9 A;  4E7L A;  4KH6 A;  1TK8 A;  1YJ9 N;  1TV6 A;  4CZK A;  4OO1 J;  1SQK A;  1GLL O;  3Q7B A;  3KHY A;  5EOY A;  4NCA A;  1VSM A;  2HMI A;  3MN5 A;  1LW0 A;  4AIL C;  1NK6 A;  1RIL A;  3HM9 A;  3QDK A;  3SMP A;  3WNF A;  3HST B;  3HI0 A;  4FWO A;  5AQP A;  2ZD1 A;  3IAY A;  4H0O A;  4YOR A;  4LH5 A;  4H8K A;  4CEC A;  1GLF O;  1NGB A;  4H0X B;  1JL2 A;  4FVM A;  3CC4 N;  4CJW A;  1JL1 A;  3PX0 A;  2IDO A;  3F73 A;  2A6A A;  3JXU A;  3JYT A;  3SPZ A;  4LF7 K;  3B6O A;  4DS5 A;  3ULE B;  3E01 A;  4X66 K;  1Y97 A;  2Q0R A;  3DMJ A;  1I3A A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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