3CCSN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Ribosome
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccsN00
5JVGL 2OTLN 3CCRN 4IO9L 1VQ4N 3CC2N 3PIOL 3CF5L 4WFBL 1OVYA 1Q7YO 1VQ7N 1VQ8N 3OW2M 3CCLN 4IOCL 5MLCQ 3G4SN 5H1SQ 1VQMN 3I56N 2QEXN 4WF9L 1KD1O 3CCEN 1VQKN 5GAGP 3CC7N 1NJIO 3CMEN 3PIPL 3CCMN 3G6EN 3DLLL 4WCEL 4IOAL 3CCSN 1Q82O 1M1KO 3CCJN 1VQPN 1QVGM 1YJ9N 5HL7L 5GAHP 3CC4N 1YHQN 2OTJN 1YIJN 2ZJRL 1K73O 1VQ6N 1M90O 1Q81O 3CXCM 5DM6L 1N8RO 3CCUN 5GADP 1S72N 3CMAN 3J7ZO 3G71N 4WFAL 1KQSM 4U67L 1VQ5N 1YI2N 1VQNN 1JJ2M 4UY8O 2ZJPL 1YITN 1VQLN 1K8AO 3CCVN 1VQ9N 5DM7L 1W2BM 1VQON 3CD6N 5JVHL 2ZJQL 1YJWN 2QA4N 3CCQN 5GAEP 1KC8O 1ILYA 3CPWM 1YJNN 4WFNL 3I55N 1QVFM 1Q86O 1K9MO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H4OA 3CM5A 4CECA 2GV9A 1CZBA 3IFRA 3PIOL 3O3GA 1TGOA 4KH4A 4CZEA 2FC0A 4XH4A 2E2PA 2IIRA 4PHTX 1NJYA 2KFZA 2IGIA 4E19A 4IFEA 1CZAN 3F9MA 3WNFA 4MQ3A 4KH5A 3EKUA 2HB5A 3DMJA 4CFDA 4YOVA 1NMDA 2P9SA 1D4XA 1EWQA 3ZLJA 3PIPL 4DS4A 1WBDA 3DLLL 2HNZA 1VSKA 3AO2A 3PSFA 4CJ4A 3Q7CA 2WOMA 4X62K 4PQUA 1X9JA 1QVGM 4FOEA 1J54A 3ASMA 4YORA 1O13A 3I8BA 4O5BA 3V9XA 4G9ZA 3T1YK 4JHDB 1EKEA 4A2AA 1OH8A 2W6LA 3NH0A 2E8AA 5CYMA 1N5YA 4B3SK 2E4LA 4FWMA 4IWVA 1HNZK 2FF6A 3VERA 3DOLA 3L3VA 4BR0A 3WNHA 3M5RA 4WQ5A 1IKYA 3AAPA 4B1VA 4JKEA 3HK2A 2A6AA 4FJLA 2ZD1A 5BN9A 3IDHA 1XI1A 4B9SA 4OPAA 3NGYA 4Y0WA 3DLGA 1NGDA 1TL3A 2PY5A 4LF4K 5CZ2A 5TKYA 1BHLA 2Z1GA 2ASOA 3SAFA 3QNOA 3GL1A 1NNEA 3LWLA 1XHXA 2NRVA 3CFRA 3DOKA 2O8CB 3AAQA 3LM2A 2UXDK 4YOUA 3MXIA 1YUWA 5AQOA 3EEQA 4PUOA 3ZSZA 4X66K 2YHWA 4ISEA 4QS9A 3A2FA 3AO5A 5M1OA 2QWRA 3ZSXA 4CERA 5AQSA 1TKDA 4E89A 2YV0X 1TV6A 4BWJA 2KFNA 1IKWA 2VYPA 3RMBA 3ZX3A 1LOTB 5EY4A 1VSIA 2F9TA 2EWSA 2FSJA 2W41A 4ISGA 4O0IA 3HO1A 4BC2A 1QZ5A 1TUUA 3SJHA 3ZX2A 4ELUA 4KHPK 4GV6A 4DV1K 3GG4A 1RBSA 4WF9L 3WT0A 5E41A 4PKIA 5C10A 4DTSA 5C2DA 3UB5A 1JL1A 4CHPA 4I2QA 5AQKA 4CJVA 4DTOA 3VQBA 2KQ2A 2Q97A 4MO4A 1NGEA 3RSEA 3VEZA 4CE9A 4O4GA 5AQRA 3D45A 1TL1A 3OYKA 4LF6K 3L2UA 3ATVA 4FZZA 3A5OC 3IKMA 4E7HA 4BGBA 2BUPA 4DUZK 3TU5A 4DMNA 1W97L 5FPDA 4KHWA 4N47A 3WNGA 4CZJA 1GOCA 1T3VA 4DTMA 1T05A 1U49A 5AQLA 4LF8K 1BQMA 2OANA 3MCAB 4WFAL 4ZTFA 3AO1A 4HCBA 3DAWA 3DRRA 2VG6A 4BRPA 2XY8A 1DTQA 3KHYA 4H5TA 1IH7A 1Q18A 4FWSA 2P51A 2RN2A 2P9PA 1VSDA 3TR8A 1HKGA 1WAFA 5HP1A 3V6DA 3DXMA 4KKOA 4QS8A 5F2RA 4CHZA 4DTUA 5FPNA 2P9KA 3CD6N 3VEVA 4CEEA 4GV9A 1UA1A 1VSJA 3PX0A 1S5JA 4DR3K 4LF9K 1DTTA 2E6LA 1QSLA 4R79A 4H5NA 2D5RA 1K9MO 2OTLN 3VGMA 1IJJA 1S9GA 1ASWA 5KQ8A 4BACA 4Z0UA 4M3TA 5AR0A 2J4RA 3O9SA 1VQ7N 4M7YA 3D2FB 1VQ8N 5ADXA 4GW6A 3G4SN 2RF2A 1MA9B 2QWQA 3AVAA 3LAMA 3FZMA 3TAFA 3A5LC 1RT2A 3QLHA 4H0TB 3VEWA 1HJOA 3M8SA 1NU0A 3O9RA 4Z4IA 4RW4A 1Q82O 5F1XA 3MN6A 1W9HA 1KCFA 1T44A 4RW6A 3OYLA 1J9AA 2YJFA 3OTOK 3P83D 4CJLA 4JRQA 1RTIA 3PUFA 4FCYA 4B1XB 3MEDA 4C1NI 1G99A 1WSGA 2O8DB 5ELZA 4C1NK 4J8FA 4BVPA 2ETJA 4DQSA 4FLTA 2QI2A 5AQGA 3F73A 4JI7K 4LC9B 4W5QA 4PL8A 1JLGA 2DFFA 1LAWA 3LP1A 5FROA 3WQUA 1JLFA 2JGUA 4U67L 4CJ5A 4KHQA 4F8RA 3H6EA 5AFUA 1JJ2M 2Q1NA 4M42A 4DFMA 2E20A 4K41A 3R3LA 3TAQA 2A3ZA 1BA1A 3THXA 5CYQA 3A5NC 5AQJA 4AH9A 2WUSA 4IBNA 4B8AB 4F9OA 1NJXA 3V1OA 4CZIA 2DTUA 1XQSC 4F3OA 2ZE2A 1REVA 3O5BA 4AHSA 5TKWA 1OVQA 5AZIB 2O8BA 4O44A 4U7BA 4DV4K 1HYZA 3E9LA 3KK1A 3SK3A 4AQYK 2V7YA 3I0RA 4QCLA 2NRWA 2HHTA 5J2QA 4FJXA 3TAGA 4Z4FA 3LL3A 3KLFA 4C8OA 1V4SA 5FPMA 1RDAA 1U4BA 4FVUA 1C0FA 3ZEUA 3TAPA 4B9UA 3K5OA 1C0UA 4O8KA 3A8YA 1NK8A 1V4TA 1ZBSA 4H8KA 1LCUA 5C2FA 3AVKA 5M1FA 3U9DA 1D9DA 4B9TA 2P9IA 3ALYA 5JS2A 2GTDA 2HBJA 5B8HA 3DXKB 3D2EA 3SQ0A 4KAZA 4FJ5A 5HLFA 2QWMA 2HW3A 3ENHA 4GKKK 4MLHA 2DPNA 1MWMA 4M3RA 3AVBA 1TKXA 1YHQN 5AJ3K 3EZ5A 1JLBA 4A5AA 3LAKA 4BDYA 4M7XA 1GLEG 1C0MA 3QDKA 4CVNE 3H3NO 3CJCA 2P1JA 1DT9A 2Q2RA 1NK6A 3KWIA 3VQEA 4F2SA 4B1ZA 1TKTA 3IUCA 1VSHA 3BF1A 3O4NA 2D4WA 3N4PA 4ICLA 3CCUN 4K25A 4DLGA 1FJGK 5J2MA 4YOXA 1XNRK 3UIQA 2QWNA 4WQ4C 5AQPA 4NCAA 1XMOK 4AF1A 1RTDA 2P9SB 1WNSA 4HTLA 4FPBA 3K58A 1YI2N 5C12A 2Z1JA 4DR2K 5AQMA 4A61A 2O4GA 1NK7A 3V9WA 5KTQA 2NRXA 1ESVA 1HRHA 2JWLA 1RDDA 4CFBA 1KRPA 3VQ6A 2GEMA 4Q5VA 3CJ1A 4BQLA 3VA0A 5EU7A 3SPYA 3M6GA 1BI4A 4ID5A 2HMIA 4EHTA 3F9KA 2QK9A 4YOYA 4YNQA 3QEPA 2Q31A 3KD5E 1BDGA 4F4KA 2DY4A 4GMJB 1QZ6A 3MDQA 3FFIA 3CETA 2HHQA 4TSXA 2HHSA 5C0YA 2Z1HA 4YOTA 4Z4HA 2QWPA 3VEXA 4DR4K 4BRFA 3HSCA 1YT3A 1Z6RA 1RDWX 4CHNA 1S1VA 1QQNA 4LSNA 3SI6A 3DRSA 4IOCL 4ILJA 1FXXA 3ZT2A 3WXIA 3AGKA 5DK5A 2F7TA 5BPLA 4BR2A 1KD1O 2I7NA 3O4WA 3OBYA 3CJBA 3VMFB 1VHXA 1NGGA 3FR0A 3G6EN 3LPUA 1RBTA 4H03B 3E66A 4ILGB 3NF6A 2QWOA 1T7PA 3HZ6A 4B9VA 3ZETA 4CJQA 1RDBA 5T7BA 4A2BA 4JKCA 3N4QA 4CGHA 2ZQBA 4NLCA 2GWJA 4NXMK 3L2RA 1FK9A 2P9UA 4B8CA 3VGLA 4X64K 3PX4A 4DQQA 4CCHA 4IG3A 2G8IA 4CBUA 3LDSA 1S1TA 1IG8A 1QSYA 5GIOA 4M3YA 2YKMA 1NKEA 1GLFO 3M3ZA 2WBNA 1JLCA 3NF8A 3RR8A 3SNNA 3VN5A 1GLCG 4DU1A 2AJQA 2FSKA 4BRMA 1KLMA 1C0GA 5LMUK 3A5MC 4AM7A 5JLHA 2Z1IA 3FFKB 4AHVA 4DQRA 3K59A 1VSMA 4ELTA 4FSVA 1K8AO 4CF0A 3OYAA 3OVNA 1WLJA 3RSEB 3ULEA 3CQYA 2E2OA 4CZKA 2XHBA 4OKKA 4E1JA 2CGJA 3MXJA 4DV2K 4FJ8A 1O1WA 4YHHK 2NUBA 1D8YA 3QIOA 4JKFA 2NLXA 4CBXA 3TWHA 3K0SA 3MECA 4DSEA 3SUNA 3SZ2A 1TK5A 1W0HA 4JNEA 2ASPA 2KHOA 2PBDA 3FZLA 3QMLA 3B8AX 1Q86O 5KI6A 2F96A 3T1HK 5E84A 1LWCA 4W5TA 1OVYA 4W5RA 3HJFA 3C6AA 5F0XA 4LH5A 3AVLA 3D6RA 3R9PA 1U45A 3OW2M 3DLBA 1QQMA 5FPEA 2XRIA 1QSSA 1NGIA 1YAGA 4J2AA 1ZBIA 3KJVA 2DFEA 2P9PB 5A2QO 2GUIA 3OYFA 4DU4A 3QNNA 2H3GX 4AHTA 4DQ8A 4BVOA 4DF4A 3OYMA 1VRTA 5HRSA 1NK5A 1NGAA 1S22A 2HF3A 5GAGP 1ZC6A 4FJJA 3UKRA 5HBMA 1LW2A 5C24A 3DXMB 3BDPA 4L3QA 2ZF5O 1BCMA 3OJSA 3VPZA 2P9KB 4JLHA 4I9LA 1HR0K 3TSQA 2CH6A 5M1NA 3NF9A 3PY8A 2RKIA 4LH4A 1KXPA 3AA5X 4JI5K 4FLUA 3QB0A 1JCGA 1BL3A 1RT5A 2GWKA 4O0JA 2KW4A 1TK0A 2OTJN 3O1BA 1QHTA 3H08A 4KB1A 1KSPA 2HHHK 3HI0A 1X9SA 1IKXA 4LD0A 4CJUA 4JS5A 4CEBA 3B6OA 3WQTA 4Z4GA 1OKJA 3JXUA 2OZSA 2E1ZA 4E7IA 4DV3K 2NRZA 3NH2A 4XEIA 4XH1A 5GADP 3SYZA 4FJKA 3BEXA 4JI3K 2D1KA 1NGCA 1N36K 4AM6A 2O8FA 3ENBA 4HHTA 4OGCA 3MWTA 1CXUA 4H0VB 4B9MA 5AQZA 4YDUC 3HRGA 3AVJA 4I6MA 2BDPA 1HX1A 1RFQA 1XC3A 3L0QA 2OZMA 4FJNA 4KHUA 2E6MA 4MLEA 3T3FA 3HSTB 4BE1A 2WTUA 1G15A 3ZT0A 3T1AA 3U6FA 4I7FA 2CGKA 4OLAA 3HL8A 3O9QA 3R1XA 3MN5A 3HVTA 4OVLA 4CJ7A 3MN9A 2IS3A 3S9HA 1FKPA 3C6HA 2ZJQL 4GV3A 4FJMA 1FKOA 2QKBA 4K0KK 1EWRA 2X6NA 3MN7A 5FRNA 1K8KA 3QIPA 3LP2A 3TAMA 1XMQK 1KC8O 4CZMA 2D0PA 4ELVA 5BR9A 1YJNN 4I2PA 3EYZA 3MX2A 3W0LA 4CF8A 1R59O 4DCHA 4DG1A 4JN4A 1I94K 2B4JA 2NNWA 3ZSRA 4BRKA 3I8DA 1NK4A 1BG3A 4CESA 1IKVA 3WNEA 3OYJA 3S3MA 1ZYQA 3K5LA 3THXB 1L5UA 3NF7A 3OYBA 3V9ZA 4Z4EA 5CR4A 2EHGA 3CFPA 3TI0A 4DKWA 2WONA 3C95A 4H0OA 2HHVA 2O8BB 1U04A 2VWKA 2YHXA 3S41A 3PV8A 4DFPA 4B3MK 4B3OA 5GAHP 1C1BA 2CGLA 1SKSA 3CFOA 1A5VA 4Z4CA 2HMPA 4FXDA 3VQDA 2G8UA 3RRHA 4OX9K 3U3YA 1TKZA 3QESA 3MAQA 4J2DA 3HYFA 4BG8A 3FGUA 3OYHA 3CXCM 2P9NB 4CHYA 1EQYA 3ZEUB 4OPJA 3V9UA 3WUHA 2XY7A 3O08A 1EP4A 1ASVA 1L3UA 1JXBA 4WE1A 5BRHA 5J2NA 3VQAA 3FZFA 4E7LA 2P9IB 3ZT1A 1YVNA 3KK7A 1D9FA 3D2EB 1Q9XA 3ZSOA 2OCEA 3EE8A 3VQ9A 3AVNA 3SV4A 4KV8A 2JLEA 3GDQA 4BRLA 4IOXA 3SBTA 4FO0A 1IBKK 1Y97A 5I9EB 3ISNC 2IVNA 1GLBG 3CQ8A 2Y1IA 5CHIA 2HNYA 3HM8A 3CG7A 4CJPA 2HBMA 3OJUA 3TANA 4CFAA 4OLBA 2YNIA 4WFNL 3E1YA 1Q9YA 2G8VA 4GY2B 1LWEA 5BR8K 3VOVA 2HBKA 4F2RA 5EX5A 3LM9A 2V52B 5FDLA 3SUOA 3AVCA 1Q8IA 3THWA 2UUCK 2QEXN 3KLIA 3CCEN 3CC7N 3CMEN 4YFUA 3VETA 4EIAA 4CI6A 4DSKA 3F5TA 1OH6A 1BI4B 4DV5K 3HXMA 3ZSWA 1XWLA 4FM1A 2Y1JA 3IS9A 3Q7BA 4MFBA 3QINA 4DFKA 2UU9K 4FJHA 3JAMO 1HPZA 4DUYK 3O8MA 1JLAA 2YHBA 4R5PA 5K14A 4FW1A 1CLQA 2FBYA 3ZSQA 1OH5A 2F8SA 1W7AA 1NMNA 1WBBA 3ZYYX 2KZZA 4H5VA 2I7PA 5CY4A 3VENA 5E26A 2VWJA 1SL0A 3BF3A 4HUGA 2IVPA 2A5XA 1TYQA 3MEGA 1YITN 2GX9A 3NGIA 2WC9A 2HVIA 3QBWA 4M3WA 2IDOA 3ZETB 2ZWHA 1T03A 3AO3A 3KLHA 4BRAA 4DS5A 1J5EK 4BGAA 4CJWA 3QFUA 3CIPA 3VF6A 2P9UB 3A0IX 3D7EO 4RCHA 4EHUA 1YTUA 1SS6A 1C0TA 5GINA 1I39A 2XO7A 4IO9L 3OA9A 2QTDA 2BE2A 3GBTA 4QOZB 4KFBA 4JRPA 1DGKN 1T6DA 1SZ2A 1RNHA 5HROA 2UXCK 3CCLN 1BCOA 4CK1A 1KAYA 3IRXA 3CPEA 1E4GT 3ULEB 4OKJA 1B9DA 4L8RB 3SMSA 1CXQA 3OYEA 1HMVA 4CZFA 1E3MA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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