3CCUN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482c
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccuN00
1Q7YO 1VQKN 1VQ8N 4U67L 1VQLN 5GADP 3CCSN 2ZJRL 5GAGP 1OVYA 2QEXN 3PIOL 3G71N 1Q86O 3I55N 1Q82O 1NJIO 1YIJN 3CCRN 1YI2N 1KC8O 3CF5L 3CCMN 1YJ9N 4WFBL 3CCJN 1KQSM 1VQ6N 1VQNN 5MLCQ 1Q81O 3CCUN 5GAEP 4IOAL 3G6EN 1JJ2M 1K9MO 3G4SN 3I56N 1VQ4N 3CCLN 5JVGL 3DLLL 4WCEL 5H1SQ 1VQ5N 1ILYA 5DM6L 3CC2N 1QVGM 1VQON 1YJNN 3CCEN 1K73O 3CMEN 3CCQN 5HL7L 3CC7N 3PIPL 5JVHL 4WFNL 1QVFM 1W2BM 4UY8O 3CPWM 1YITN 1VQ7N 3CC4N 3CMAN 1YHQN 1M90O 5DM7L 4IO9L 4WFAL 1K8AO 1VQPN 1S72N 3CD6N 1VQMN 2OTLN 2QA4N 2ZJPL 3J7ZO 1N8RO 5GAHP 1KD1O 1M1KO 1VQ9N 2OTJN 4WF9L 3CCVN 3CXCM 3OW2M 2ZJQL 1YJWN 4IOCL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BDGA 5C24A 4CEOA 1BWFO 3U8XA 5BR9A 3VQAA 2J4RA 5GADP 5JS2A 4FL9A 1U49A 4DU4A 4CF8A 3LDNA 2P9KB 2V51B 3LP0A 3RRHA 3QEWA 3L3UA 3NF9A 4C1NI 4LD0A 3VMFB 3D0PA 5TKWA 3WNGA 4QS7A 5J1EA 2HHQA 4F8RA 4KI4A 3U4LA 1BIZA 1XC9A 1NGJA 4JKAA 4JKCA 1KAXA 2ITMA 4E89A 2P9KA 3AVGA 1X9JA 1Z26A 3ULEB 1NGFA 3L4IA 2D0CA 1D8YA 4HCCA 1TKTA 3C7NB 5JVGL 3J80O 3BGRA 4BRGA 4CJ3A 2D0AA 3A2FA 3AVNA 4RW9A 1NM1A 1NMNA 2VGMA 1EX4A 1GLJO 4KB0A 4KV8A 4FJLA 2HHUA 5CR4A 4ISGA 3ULEA 4AILC 1TL3A 1TKZA 3C7NA 4YOWA 1NBWA 4EIAA 3SK3A 5DK5A 3SV3A 3CPWM 1RT5A 2ZE2A 4WQ5C 4BRFA 2BH1A 4DV3K 3HPOA 3VEZA 4EHUA 1TK0A 3OBWA 3DAWA 3HZ6A 4XH1A 1VQPN 4HWIA 2IDOA 3M6GA 4H5TA 4BE0A 3DRSA 4WQ4A 2F8TA 4CIEA 4NYFA 1LAVA 3CJ9A 3CJBA 4DU3A 2IS3A 4N47A 4EZ6A 2HMIA 2FLOA 3KK2A 4CK2A 1S1XA 4DV7K 2QXFA 4X65K 1EXQA 3OYBA 4IKFA 1KCFA 5HRRA 4DV0K 3P38A 5FPMA 3OY9A 4LF9K 3PLAA 3ZT3A 5BPMA 4FVUA 4ISFA 4JKBA 3SQ2A 3ALYA 3KLIA 2P9PB 3O1WA 2ZF5O 3L6QA 3CCSN 4V19S 4DTSA 4A5BA 1IKYA 5SZTA 3HI0A 2OANA 4DSJA 1S1WA 3O3HA 4E1NA 1YXQA 3HBTA 1IBMK 3DLKA 2QWMA 1NG9A 2P9PA 4EP4A 1BQNA 3CCJN 1FW6A 2IAJA 2HBMA 3FZHA 4IG3A 4CF1A 3EE9A 1T6CA 2HHVA 4ELVA 1BU6O 3VF4A 2WBNA 4PHTX 4H4MA 3DLBA 2P9SB 3AVHA 3NF8A 3P39A 2E8AA 1SL0A 5CZ1A 5AQIA 1E3MA 1RDWX 2I7NA 3CCLN 4BC2A 3LDPA 2W6KA 3CCQN 2P9SA 3HYFA 3O4QA 2WC9A 3RSEB 4DR5K 1DTQA 4H0YB 4X66K 2XY5A 4FJ9A 3CMAN 2QW9A 4BWJA 3ISNC 4HUEA 3HPGA 2X78A 1W7AA 3BF3A 1XNQK 1GLDG 1X9MA 3CPEA 1QSLA 3MN6A 1HKGA 3OS1A 4A61A 2OTLN 4O4GA 3D6RA 2HF3A 1VSEA 1CZ9A 3DI6A 1Z6RA 5AQUA 3SQ0A 3ZSVA 2AJQA 1JLQA 3VQPA 4DSFA 1XHZA 4A5AA 1NWKA 4DR6K 1T05A 4FWQA 1B9DA 4ELTA 1JCGA 3P1GA 3AVBA 3ZSWA 2Y1JA 4XH4A 1C0MA 2Q0UA 3CYMA 3K0SA 2RF2A 3DLHA 2EWSA 3OYNA 2Y1IA 2G8UA 1X3NA 5LY3A 3K59A 3HK2A 4GV6A 3THWB 2GWJA 5M1FA 3G71N 2KZMA 5AFUH 5FPNA 3SLCA 5JMVA 4M3RA 2V7YA 4KREA 4ILGB 4DFPA 3OTOK 3T1YK 4XH5A 3THWA 2Q3SA 3GL1A 4CF9A 4PL7A 1S6PA 2CGLA 4Z4IA 4O55A 2A3ZA 4FLXA 5C15A 2A41A 2UUAK 2VQEK 4OJRA 1KRPA 4DKWA 4IOAL 3MXIA 5KGWA 1HYVA 1K9MO 2ZD1A 2O4IA 3ZCMA 3NVMA 4JS5A 4FWNA 3PSIA 3IUCA 1U47A 3DXKB 4RCHA 1N36K 5FRMA 4DR4K 2E1ZA 3HOTA 3K5NA 3CQXA 1WSIA 5AQQA 5H1SQ 2KZZA 5AQSA 2UXCK 1VQON 4O8UA 4OLAA 5EU7A 1JLEA 4CZEA 2F7TA 3PIPL 4NCAA 5KRTA 3DXKA 4W5NA 1HNZK 5M1NA 5BREA 4CZJA 1WSJA 4FJGA 1IV0A 4KO0A 3TAGA 1OH7A 4DQIA 3OYGA 4CFDA 3OYKA 1HQEA 4DSKA 5EXWA 4DLEA 3MEGA 4WQ5A 1XUPO 2NRZA 5AQRA 1L3TA 4CHYA 4EP5A 4O5BA 1DT9A 1TGOA 1LCUA 5HROA 4FYDA 4DQPA 4DU1A 3MECA 3CD6N 1EWRA 3AA3A 2QA4N 1BCMA 4M3XA 2G8FA 4K41A 1QSSA 1WSGA 1VQ9N 4A2AA 1HR0K 3O1BA 3SV4A 1R59O 3IS9A 4FLVA 5KQ8A 3LZJA 4DF4A 1MA9B 4FM2A 4BR9A 3O9UA 4IJNA 4CGDA 2HHSA 3O4WA 4C8NA 4BRHA 1MU2A 4CFCA 1C1AA 1KAZA 3QERA 2G8WA 3AY9A 1C1CA 4KTWA 2Z1JA 1VHXA 4C8MA 3G0ZA 1DTTA 1SS6A 1YT3A 3HTVA 5M1QA 3OYJA 2DTUA 3WT0A 2NRHA 3CCMN 4WYBA 3MXMA 5AQOA 1S6QA 2Q2RA 2PFUA 2LSNA 1JL2A 3L0QA 4MDAA 3L2VA 4GNIA 5CYMA 4B9QA 4L3QA 3CJAA 4CGHA 4I2QA 3HPHA 3NE6A 1QSYA 3B8AX 3T19A 3U6FA 1IH7A 4DTPA 1YAGA 3V9XA 4JN4A 3LANA 4GW6A 2E2NA 1IKXA 1KFSA 3ZSQA 2VYPA 1IBLK 5IWAK 3VOVA 4DTJA 4XEIA 4B9UA 4X62K 5FPEA 4YDUA 1HYZA 3B6OA 2YHBA 1ATNA 4CJLA 4OKEA 1HX1A 3PSFA 2D5RA 2YNHA 4BC5A 3LPTA 3HM9A 3S3OA 3NDKA 3C6HA 1L5UA 4BG8A 1W2BM 5A2QO 4J2EA 1GLBG 3CJ1A 2XHBA 4BR7A 1YHQN 5D3GA 5AQVA 5C2DA 4JI4K 3C6TA 1RTJA 3TR8A 4CZLA 3T3FA 4W5TA 4BDYA 3VEYA 2YV0X 1NOYA 3H45C 2VWJA 4Z0UA 4HTUA 3TTDA 2D0PA 1OH6A 4JK7A 3QICA 1V4TA 3QEPA 4DV1K 2KQ2A 5HRSA 4BDPA 1GLEG 2RPIA 1HQUA 5F2RA 4FJNA 3ZETB 4B1VA 3KK3A 3LM2A 4WF9L 4BVOA 1O13A 3H6EA 4BACA 4Q0BA 2ASMA 3V1RA 1JLBA 3QBXA 2Z1HA 4KHYA 4C8OA 2IOCA 2D1KA 4EAHD 3M3ZA 1VSDA 1N5YA 3ZETA 3LWMA 4CHQA 3IG1A 1A5VA 3DXMB 5CE3A 3O3GA 1L3UA 3UIQA 3FLCO 1TL1A 3PV8A 3ZSYA 2P9UB 1YI2N 2VQFK 4DV5K 3CJ7A 3ZLJA 1RNHA 3EN9A 1W0HA 4CEDA 5JICA 3DXMA 4CHNA 4B9MA 4H0TB 4LSNA 2PY5A 1C0UA 2CH5A 5AQGA 4DFKA 2X6NA 3QLHA 2W40A 2P9UA 4CI6A 3BF1A 1B92A 2VG5A 4JLHA 4JKFA 4DUYK 4M63C 4YOYA 5LL6Z 2B6AA 3IKMA 4CGGA 4FLWA 5LMNK 4DR7K 5HBMA 3KJVA 5LMUK 1NLVA 2RN2A 4DF8A 3WXLA 4K8ZA 1JXBA 1KAYA 1O1WA 1XMOK 5J2QA 2QKBA 2BTFA 3MDQA 3GBTA 4FWMA 4AHVA 1T3VA 1T8EA 5HOOA 3SBTA 3SCXA 1QHAA 5JVHL 4CJQA 4R5PA 1WN7A 3FFKB 3V1OA 3D2FB 5BN9A 4HUGA 4H03B 4C23A 3VF2A 3NFAA 3DWLA 1BUPA 1NK7A 4WFAL 4ICLA 3D2FA 4BREA 1RGIA 2XY7A 1EO1A 4ELUA 3P83D 1ZYQA 3VQEA 4B1XB 3M8PA 1ZBFA 5C10A 4CEEA 3EEQA 3BZKA 3SZ2A 4B3RK 3ZT0A 1U2VA 1SQKA 1CXUA 1XHXA 4CZFA 2HF4A 4HCBA 4IFEA 4FK0A 3D45A 1B9FA 1IKWA 3SAFA 1VQ8N 3WXJA 3LAKA 2QWPA 4DV6K 4OO1J 1P90A 4IJAA 4NCGA 3D7EO 4O44A 2DFFA 1RTHA 3E9OA 1NJIO 3SQ4A 1KC8O 3QINA 3VEOA 4CJUA 1NK8A 4B9NA 2OA8A 1EKEA 4CEFA 1IO2A 2BE2A 3NF7A 1N34K 3RR8A 2X74A 4CF0A 3QMLA 1IG9A 1I3AA 2HSTA 3ID6A 3I56N 4B1WB 3IDHA 3B6PA 1NK9A 2YX6A 1KVCA 3G25A 3TAMA 1BIUA 3DLLL 3LALA 5FROA 4I6MA 4YHHK 2YNGA 2VG6A 3J7AP 3VEXA 4OKJA 1NGHA 3ENOA 3J7YP 3L3VA 2I5JA 3AGRA 5ELZA 4DTNA 2NRXA 3TSUA 1QQMA 2NZTA 1JLFA 3TAFA 3LDSA 3HSTB 1LOTB 4RTFD 4UY8O 1LAWA 4JRQA 4H5VA 4M41A 2WOMA 2BGGA 4FWLA 3ATUA 1RBVA 4ID5A 1MDUB 1RTDA 1ATRA 3KLHA 3OYDA 4CZKA 4KHQA 4FLUA 4IOXA 1S72N 4CJPA 1ATSA 2KW4A 2FF3B 4AQYK 2PAVA 3L4QA 1QS4A 1KD1O 4KHNA 1EWQA 2YI1A 2AA4A 2E5LK 4KB1A 1S1TA 2E20A 2KLAA 4Y1DA 2WTUA 4E3SA 3EY1A 1D5AA 1E4FT 3V9ZA 2A1RA 4U7BA 2QWOA 3PX6A 4YOXA 2JGUA 3FZLA 3VQ7A 3WQTA 5BN8A 1HJOA 3ID8A 1NK5A 3FZKA 4OPJA 2HHHK 1MWKA 4B9LA 3QB0A 3TTFA 4CEBA 3JAMO 3MXJA 1OKJA 5ADXA 4M3ZA 3GG4A 4AHTA 5LJWA 2FBTA 1Q86O 4DFMA 3THYB 3P31A 2QKKA 4MFBA 1WSEA 4HHTA 5I42A 3OBYA 1GOCA 1VSFA 4FZZA 4LFAK 5MLCQ 3CIPA 4FLTA 1SL2A 2F4VK 1HMVA 5JLHA 3THYA 3THVA 3VQ6A 3AVCA 3HXMA 3VQ4A 2A1SA 1VRTA 4FJKA 5BPNA 2E2OA 3WXMB 3L2RA 3AVIA 5EY4A 3C6AA 3A5MC 4JI5K 4J2DA 3I33A 4B1UB 3HRGA 1DLOA 3OVNA 1RT3A 1RFQA 3PO5A 1LWFA 1YJNN 2RKIA 5AFUA 3TTCA 4LF6K 1ASWA 3ULDA 3F9MA 4H4OA 2W6LA 3GOIA 4CBXA 3LWLA 1FJGK 3JXUA 3O5BA 1JL1A 3VTIA 2DFEA 4CIGA 1T44A 4FXDA 3T7ZA 4CJTA 1RDAA 4CK3A 4CECA 4BY9C 3CG7A 4JK8A 1JXEA 3BUZB 3EKSA 4QS9A 4DCHA 3J7ZO 2YKMA 4KH5A 3AVMA 3LZIA 4F3OA 3ZX3A 4CGFA 4RW7A 1KSPA 4B3SK 3HJFA 2D0BA 2ZQBA 2OPRA 4BR0A 3VQDA 2XY6A 1SV5A 1TK8A 2ZJQL 1KTQA 4CK1A 5E26A 5BRFA 3TPQA 1KVAA 1HUXA 5ADXH 4JI1K 3KLFA 1FXXA 1VQKN 2KKZA 3ENBA 4JS4A 2IC3A 4GY2B 3A5OC 1NK4A 1JKHA 3WNHA 1X3MA 3WNFA 4LH5A 3WEEB 1OVYA 2IVOA 1OVQA 3NGZA 3K58A 2WFBA 1S9EA 4UQGA 4F2SA 3CF5L 4CW7B 4Y0WA 1BA0A 1RBTA 3EYZA 3RMBA 4H8KA 4O5FA 4I9QA 1TUYA 4MO4A 4DR2K 3WEEA 1RTIA 3TI0A 4N76A 4FWSA 3AAQA 4H5WA 1Q81O 4JAXA 3R1XA 3U3GA 5AQHA 3AVLA 2YKNA 2HHXA 3RMDA 3O3FA 2QWRA 1N33K 3QEIA 4K8XA 2P9IB 3VQ9A 4XIUA 1W97L 3ZEUB 3LL3A 1K8KB 4BGAA 3GE1A 2HHTA 2Q31A 3VQ8A 4EFHA 3ZX0A 3MCAB 4CZIA 2G8VA 4I7FA 4BVPA 4CFAA 2P9IA 3ZEUA 5AZJB 1K8KA 3S9HA 4DQQA 3HVRA 1BOTO 4MLEA 4DQ8A 3SUPA 3FGUA 3C65A 4ZTJA 3FZMA 3MWPA 3TARA 5KPZA 4NLBA 1C0TA 2JWKA 5AZJA 4KTZA 1NGBA 3QEVA 1XWLA 2RE2A 2GEMA 2DY4A 1J9AA 1S1UA 3JYTA 1YTUA 4CJFA 3E9PA 1WOQA 5HP1A 4CZMA 3TSPA 4CF2A 3NAEA 3DOKA 1N8RO 2AP1A 4K42A 3A5LC 1NGAA 4DSIA 1SKSA 3AARA 3DRRA 4KHWA 4E1JA 5HRPA 4B9VA 1ZXOA 4HVJA 5KTQA 1U45A 2QXLA 3KVGA 1XQSC 4PL8A 4YOVA 1NJYA 4OLBA 2YCHA 5M1KA 3SUOA 3QEXA 2G8HA 2PYJA 1GLFO 4FJMA 4J8FA 4DTMA 1GOAA 2QTDA 2BUPA 1Y97A 4JV5K 3AA4A 4GV9A 4KPYA 3F5TA 5GAGP 4Q5VA 4Z94A 1NOZA 4JHDA 4J2BA 3C94A 3KWIA 5KQDA 1WBBA 2P5OA 5AQPA 3AV9A 5E41A 3TAEA 4JK9A 1NK6A 4AF1A 2I7PA 3V1QA 1VQNN 4LSLA 4L8RB 1RCHA 4OVLA 5C42A 3GDQA 1EETA 5I9EB 3SBGA 4ILJA 4FK4A 1REVA 4CEAA 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 1Q7Y O;  1VQK N;  1VQ8 N;  4U67 L;  1VQL N;  5GAD P;  3CCS N;  2ZJR L;  5GAG P;  1OVY A;  2QEX N;  3PIO L;  3G71 N;  1Q86 O;  3I55 N;  1Q82 O;  1NJI O;  1YIJ N;  3CCR N;  1YI2 N;  1KC8 O;  3CF5 L;  3CCM N;  1YJ9 N;  4WFB L;  3CCJ N;  1KQS M;  1VQ6 N;  1VQN N;  5MLC Q;  1Q81 O;  3CCU N;  5GAE P;  4IOA L;  3G6E N;  1JJ2 M;  1K9M O;  3G4S N;  3I56 N;  1VQ4 N;  3CCL N;  5JVG L;  3DLL L;  4WCE L;  5H1S Q;  1VQ5 N;  1ILY A;  5DM6 L;  3CC2 N;  1QVG M;  1VQO N;  1YJN N;  3CCE N;  1K73 O;  3CME N;  3CCQ N;  5HL7 L;  3CC7 N;  3PIP L;  5JVH L;  4WFN L;  1QVF M;  1W2B M;  4UY8 O;  3CPW M;  1YIT N;  1VQ7 N;  3CC4 N;  3CMA N;  1YHQ N;  1M90 O;  5DM7 L;  4IO9 L;  4WFA L;  1K8A O;  1VQP N;  1S72 N;  3CD6 N;  1VQM N;  2OTL N;  2QA4 N;  2ZJP L;  3J7Z O;  1N8R O;  5GAH P;  1KD1 O;  1M1K O;  1VQ9 N;  2OTJ N;  4WF9 L;  3CCV N;  3CXC M;  3OW2 M;  2ZJQ L;  1YJW N;  4IOC L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BDG A;  5C24 A;  4CEO A;  1BWF O;  3U8X A;  5BR9 A;  3VQA A;  2J4R A;  5GAD P;  5JS2 A;  4FL9 A;  1U49 A;  4DU4 A;  4CF8 A;  3LDN A;  2P9K B;  2V51 B;  3LP0 A;  3RRH A;  3QEW A;  3L3U A;  3NF9 A;  4C1N I;  4LD0 A;  3VMF B;  3D0P A;  5TKW A;  3WNG A;  4QS7 A;  5J1E A;  2HHQ A;  4F8R A;  4KI4 A;  3U4L A;  1BIZ A;  1XC9 A;  1NGJ A;  4JKA A;  4JKC A;  1KAX A;  2ITM A;  4E89 A;  2P9K A;  3AVG A;  1X9J A;  1Z26 A;  3ULE B;  1NGF A;  3L4I A;  2D0C A;  1D8Y A;  4HCC A;  1TKT A;  3C7N B;  5JVG L;  3J80 O;  3BGR A;  4BRG A;  4CJ3 A;  2D0A A;  3A2F A;  3AVN A;  4RW9 A;  1NM1 A;  1NMN A;  2VGM A;  1EX4 A;  1GLJ O;  4KB0 A;  4KV8 A;  4FJL A;  2HHU A;  5CR4 A;  4ISG A;  3ULE A;  4AIL C;  1TL3 A;  1TKZ A;  3C7N A;  4YOW A;  1NBW A;  4EIA A;  3SK3 A;  5DK5 A;  3SV3 A;  3CPW M;  1RT5 A;  2ZE2 A;  4WQ5 C;  4BRF A;  2BH1 A;  4DV3 K;  3HPO A;  3VEZ A;  4EHU A;  1TK0 A;  3OBW A;  3DAW A;  3HZ6 A;  4XH1 A;  1VQP N;  4HWI A;  2IDO A;  3M6G A;  4H5T A;  4BE0 A;  3DRS A;  4WQ4 A;  2F8T A;  4CIE A;  4NYF A;  1LAV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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