3CCVN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2616a
Total Genus 47

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (11-15)EMPTYS4 (101-103)S1 (33-38)TI2 (39-42)3H1 (63-69)S2 (43-49)TI3 (51-54)AH3 (78-95)TVIII1 (57-60)AH4 (114-125)TII'1 (104-107)O1 (108-110)TII1 (110-113)3H2 (133-135)AH7 (169-180)AH5 (139-143)AH6 (145-152)TVIII2 (157-160)AH2 (20-28)S3 (56-59)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Ribosome
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccvN00
4WFBL 1Q81O 1N8RO 1VQ6N 1W2BM 3CC7N 4UY8O 3G4SN 1YJWN 3CCJN 3DLLL 3CCEN 1VQON 4IOCL 2ZJRL 1JJ2M 1YHQN 1VQNN 5H1SQ 5DM7L 2QEXN 1VQ5N 1OVYA 3J7ZO 4WCEL 3CF5L 1Q7YO 1K73O 1K9MO 1YITN 1VQMN 3PIOL 1VQ4N 3CC4N 1YIJN 2ZJQL 3CC2N 3G6EN 1K8AO 1VQLN 1Q86O 5GADP 3G71N 2OTJN 1VQ7N 4IOAL 3CMAN 4WFAL 2OTLN 1VQ9N 5GAGP 4WF9L 3PIPL 5HL7L 1YJ9N 3CPWM 3CCVN 3CCQN 1YI2N 3CXCM 3OW2M 1KC8O 1ILYA 3CCRN 4WFNL 3I55N 3CD6N 1S72N 1QVGM 5GAEP 1NJIO 1M1KO 1QVFM 3CCLN 1VQKN 4U67L 4IO9L 3CMEN 5GAHP 1KQSM 1VQ8N 5JVGL 5DM6L 2ZJPL 5MLCQ 2QA4N 5JVHL 1Q82O 1YJNN 3CCSN 1KD1O 1VQPN 3CCMN 1M90O 3CCUN 3I56N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TAGA 4I7FA 4QS9A 5E84A 4F3OA 3AVAA 1SKRA 1N8RO 4E0DA 4GVMA 1VSHA 1HYZA 4FWOA 1JLAA 4FM0A 2PAVA 4A61A 3DRSA 4DU3A 2OYQA 4L3QA 3OA9A 3M8QA 3WT0A 5BPMA 4AHCA 4IWVA 2YHAA 4DQQA 5C0YA 4E1MA 5ADXA 4M3ZA 2A1RA 3VQBA 1WSJA 3KLHA 1X1PA 4CF9A 3CF5L 4EZ9A 5FPMA 2CGJA 1IKXA 4JI4K 3S3MA 1VRTA 1NGGA 4YDUC 2UU9K 4OJRA 3CI5A 1CZ9A 2YJEA 3P1GA 4ISEA 2VWKA 1BDGA 3LM2A 4FWSA 3AA2A 4F3TA 4KAZA 1IV0A 4JRQA 1I94K 4BRCA 4EAHD 3HXMA 1IH7A 3LL3A 3OW2M 5GIOA 4CZMA 2D0PA 3ATVA 4FZYA 3VEZA 1NKEA 2QWMA 1GLDG 2VWBA 4IZ9A 1BGXT 1B9DA 3O9SA 5DM6L 2EHGA 2HHSA 3P39A 5JS1A 2P9UA 5C2FA 1KLMA 1YF5L 1GOBA 4H0VB 4DTPA 3VQDA 4HCCA 3THXA 1J6ZA 1UAXA 4RW9A 4ZTFA 3LAKA 4FWNA 3R8EA 1J5OA 4M3TA 2P9IA 1HMVA 2ASMA 3K5LA 3PUFA 4BQLA 3OYEA 4N41A 1K8KA 3KZBA 4CHOA 4CEQA 1IBMK 3TSUA 3H3OB 4BR4A 4N5SA 5J2PA 2PFUA 3NH2A 4OPAA 4ID5A 1EXQA 3AAPA 2UXDK 2RF2A 2VG6A 2QKBA 3RTVA 2HMIA 3J7AP 3ENOA 3IUCA 3NMUA 1JCGA 1ESVA 3BZKA 1OVYA 1KFSA 4KB1A 1L3TA 4PL7A 2ZM6K 3SAFA 4O5FA 5AQUA 5A2QO 4KO0A 3RRHA 4CGGA 3OYFA 4DR4K 4JHDB 4KB0A 2F7TA 4RCHA 2A6AA 1BHLA 3TSPA 4NLBA 2HOEA 4AHTA 5AZIA 3DOLA 4H5VA 2OTJN 4JKDA 3OS2A 4MDBA 3KK3A 2HF4A 4BE2A 3EE9A 2YKMA 5CY4A 4B3RK 4CJRA 2KQ2A 2NRWA 4BRPA 1ZBLA 4CFDA 4DG1A 4GMJB 2O4IA 2FC0A 4E19A 2YHXA 3NAEA 2W41A 3F73A 1CZBA 1JLFA 3VERA 1VSLA 4X66K 1NJIO 3D2FB 3OYIA 3A8YA 1HUXA 4FW2A 4OGEA 4CJFA 3AVCA 2P9LB 4C23A 2HHVA 2YI1A 2O8BB 4DV5K 1T3VA 1HX1A 2ZJPL 4WQ4C 4KREA 4LY7A 2D0BA 4A62A 3AVMA 4A5AA 5JVHL 3U6FA 5EY4A 5JLHA 3UB5A 1VK0A 4CZFA 4C8OA 3L0QA 3VESA 5AZJB 5M1QA 2NRXA 2NUBA 2BGGA 2QW9A 1IKYA 4KBOA 4NCAA 1BO5O 4WFBL 4DTXA 4BDZA 3QESA 3DJCA 4CHNA 3ZSWA 5M1KA 4LD0A 1YJWN 3AVLA 4DWIA 1C0GA 2FF3B 3RR7A 5BPNA 4FLTA 2BDPA 3I8BA 4FPAA 4ELUA 5ADXH 1XWLA 3KVGA 1VQNN 5FRNA 5H1SQ 2QEXN 4KH4A 3VQAA 4OO1J 3SCXA 4W5NA 1J53A 1T44A 2PYLA 3OBWA 2VQEK 3OYGA 3WXIA 3WEEB 3ENHA 1HKGA 2D1KA 3AO5A 1YITN 2XO7A 3PIOL 1TK5A 3C6AA 3KK7A 4AHVA 1GLLO 3H46O 2OPSA 3QEIA 5HROA 4OPJA 2VG5A 4JKGB 2KZZA 2X74A 3PSFA 1BA0A 4JI2K 3LWLA 1NMDA 1EWQA 2CH5A 4DTJA 3S3NA 3MK6A 1G99A 3EYZA 3L8BA 4CCHA 4BC5A 1NG9A 3ZCMA 1SV5A 4WF9L 2YNGA 5LMUK 4CGDA 1V4TA 3KK1A 4BE0A 3CCQN 4IFYA 1DKGD 3AA5X 3L2QA 4WFNL 1NBWA 1QQCA 2E4LA 5GAEP 1RDWX 2IVNA 4KHWA 4NCGA 3HO1A 4RTFD 3AO4A 4GY2B 3CMEN 4CJPA 2O8CB 1KVBA 1NGHA 2DFEA 3TI0A 2Q1NA 5SWMA 1VQ8N 4B9VA 1YTUA 4C8MA 4RW8A 1IBLK 1FJGK 2XY5A 4CI6A 4EZ6A 4YOTA 1C1BA 2ASOA 1N6QA 4DF4A 3GBTA 3TSQA 2AJQA 4DQPA 4DV1K 2IVOA 5BPLA 3NHGA 3RWUA 3THYB 5I3UA 4B3TK 2E6LA 3QMLA 3AVBA 1RCHA 2E6MA 4ILGB 3NGIA 1T03A 2HBLA 3HTVA 4E1NA 4DR2K 2A5XA 4H0XB 4E7IA 5AQWA 4E7HA 2P1JA 3CCJN 4HWIA 2GX9A 1ZBUA 4IOCL 1S3XA 1JJ2M 3KTQA 1ITGA 1X9MA 3SPZA 3BP8A 1J5EK 1TUUA 4B1UB 3U3GA 1JLQA 1WAJA 1L3VA 1N34K 4KHPK 1VQ5N 4AILC 4F2SA 1EETA 4CD1A 2OPQA 2O8DA 3VQ7A 3S3OA 2PYJA 1ASWA 2Y1IA 4BWJA 3I8DA 4A57A 2PBDA 4K8XA 3VQ6A 3CC4N 1W97L 2A42A 4O5BA 2IAJA 3THVA 4DFJA 3DYAA 4IFVA 5LMNK 4Z94A 1K8AO 4Z4FA 4BVPA 1WSIA 1C0FA 3ZSZA 3G71N 4MO4A 4G9ZA 1EP4A 3EKSA 2ZGYA 4DUYK 3NCIA 3A5MC 3FGUA 4DTSA 4DV7K 1NU0A 3C6HA 3QBWA 1C1AA 1QS4A 4CJSA 3CPWM 4KHNA 4CVNE 4X64K 1U04A 3P4IA 3N4QA 3AVJA 4ID1A 1D9FA 2D0CA 4H8KA 4C1NK 4RW6A 3DXKA 4AF1A 1IO2A 1O13A 1P90A 3F9KA 4FZXC 5HRPA 2HHUA 1WN7A 3R6MA 3U9ZA 3ALYA 2QI2A 3FZLA 3D2FA 4BRDA 4MLHA 1NGEA 5LL6Z 3QEWA 2P9LA 5K14A 4B3SK 4CFCA 4FLUA 3SLCA 4FLYA 3VOVA 2DFHA 3OYHA 2YJFA 3MAQA 4FWRA 1CLQA 4QS7A 4CJEA 4Q0BA 3LDSA 1MWMA 4BE1A 2ASPA 1NJXA 3NE6A 4ISGA 5AZJA 5BN9A 1WNSA 4Z4IA 2KTQA 3BGRA 3HM8A 3NFAA 2W40A 3L4QA 4WYBA 4IJAA 3DLHA 2Q97A 3AGRA 4UY8O 4NYNA 3HRGA 2PZSA 1RDAA 4CF2A 4B9NA 1ATSA 3OYAA 2KLAA 2VGNA 4HTLA 3VGLA 3UKRA 4PQUA 1HNWK 3OS1A 3ZETA 5JLFA 3VGMA 4K8ZA 4J2BA 2YNFA 4JK8A 4CJVA 2BUPA 2P9KA 1I39A 1NKCA 1RT1A 3LM9A 4LF4K 3DI6A 2YX6A 3K5OA 4YOWA 3KLGA 1O1WA 1RDUA 2OPRA 3CJAA 1BISA 2GUPA 1VQ4N 1S1VA 3CPEA 4DB3A 1S6PA 3HL8A 4KH6A 3H1VX 3FZFA 3HOTA 1Q86O 4RW7A 2D5RA 2RKIA 3CERA 3WXJA 2O4GA 3NF8A 4JKGA 1QSYA 4MLEA 2NRTA 2O8EB 3TTFA 3NF6A 1BCOA 3H6EA 2UXCK 3MN6A 3QDKA 1GLJO 3RRGA 2YHWA 4CEDA 3MWTA 3ZSOA 2YCHA 1U4BA 3ZSRA 4C8NA 3DOKA 2FBYA 3KK2A 4BY9C 4GW6A 2QM1A 2Z1GA 2OCEA 3NVMA 3QEVA 1NJZA 1LW2A 3VQ4A 4BRAA 4BRHA 1XUPO 3WNHA 1DTTA 1VSIA 1KQSM 1LWEA 4CERA 5FPNA 3SUPA 4FVMA 1QQMA 2KKZA 1ZC6A 2Q0RA 1KTQA 2O8CA 3RR8A 1S5JA 2IC3A 4CW7B 4CESA 1EKEA 3IRXA 3LDOA 4I6MA 5HLFA 2E88A 4FM1A 3VA3A 4KKOA 4J2DA 3EZWA 1KAYA 2P9PB 4Z4GA 3H3NO 4XIUA 1QHAA 3MCPA 3WXMB 3U8XA 1Q81O 1TUYA 1IKWA 3ZT2A 4GKKK 5AFUA 4FYDA 3HK2A 2WC9A 3LDNA 3HPGA 4A2AA 1N32K 1T8EA 4OGCA 3LDLA 4N56A 3MXJA 4H0TB 3CJ1A 2G8VA 4R79A 4LF6K 1L3SA 5CYMA 3G25A 5GINA 4I9LA 4OKJA 5AQXA 4EFHA 4GVEA 1BU6O 4DV2K 3KJVA 3THWB 5AQLA 2CGLA 1IG9A 4YY3K 1R0AA 2XHBA 1N5YA 1TKXA 4IDKA 3J7ZO 3PLAA 5BR8K 2NLXA 5F2RA 3OYNA 2JLEA 1J54A 5AQQA 1QSSA 1EO1A 4BC4A 1ZBFA 4CJ3A 4B3OA 1X3MA 1FW6A 4FPBA 5C12A 4TSXA 2P9SA 3MWPA 3CMAN 1NK5A 1L5UA 1TL1A 2W6LA 3V1QA 3VGKA 4DF8A 3ZSYA 1DTQA 3PIPL 3KLIA 1HQUA 3T1YK 5EXWA 3SMPA 3VMFB 2CH6A 5E26A 3K58A 1WSFA 5EX5A 1BOTO 1NK4A 1HPZA 5E41A 3OJSA 3LP1A 3K57A 3LAMA 4B1ZA 2HBKA 4JV5K 3SV3A 1IKVA 3IS9A 4ILJA 4JKBA 2OZMA 3FZKA 1RBRA 3VF4A 2F96A 3CCSN 5CE3A 1U47A 1JXEA 4IJNA 1UA0A 3VEYA 3L4IA 4FLXA 4A5BA 3VA0A 1TV6A 1QZ6A 3VQ9A 2P51A 3M1FA 2XY7A 3EKUA 3JSMA 3CQXA 5KGWA 3CQ8A 3ZSXA 3HZ6A 1MWKA 4JYAK 4LSNA 3UKUA 5T7BA 3T7ZA 1ZBIA 4DMNA 4Z4CA 5ELZA 3SQ4A 3VEVA 1W0HA 3F9MA 4BRFA 2YNIA 3TTCA 1HR0K 1ZXOA 4YOUA 1QSLA 2WBNA 2D0OA 3M3ZA 1NK8A 1X9SA 3GOIA 3AV9A 2B5JA 4CZHA 3TAFA 4YNQA 2OZSA 1GLBG 3SV4A 4BRMA 1K73O 1S1TA 4BRQA 2NRVA 4CECA 4CZIA 3LDQA 3CC2N 3AVIA 4AM6A 4X62K 3FE1A 2G8KA 4ZHRA 4FM2A 4DFPA 4Y1DA 1GLAG 1BL3A 3ZX0A 3NF9A 4PY5A 2OTLN 3ULEB 1S22A 4LFBK 2OPPA 1BI4B 3O4QA 3QBXA 3TPQA 1YI2N 3C95A 4XH1A 1NGAA 4JKEA 3O80A 4BWMA 3T69A 3AVGA 3WXLA 5J2QA 1TYQA 1XNRK 3CJ7A 1RDBA 4XH4A 4H5TA 4IG0A 5J1EA 1OH8A 3V9WA 1N36K 4AHUA 2FBVA 1GOAA 4FLWA 3TWHA 2O8FA 3KIOA 3HPHA 1RT7A 2A40A 1TVRA 1HJOA 3ZEUA 5FROA 4CZGA 3IKMA 3IAYA 4CHYA 4JRPA 4FJJA 1MA9B 1WOQA 4H0OA 4PWDA 2GELA 1NGBA 4DTRA 2Q36A 5C24A 4IO8A 3CM6A 5JS2A 3SNNA 3O9QA 1VSJA 4QOZB 4BQZA 2BANA 2WFBA 4ISFA 1P8ZA 1BCMA 4B9QA 5J2NA 5AFUH 3NGYA 4CEFA 1RFQA 3NVKA 3D7EO 4OVLA 1KAZA 2P9PA 1VQ6N 1HQEA 3O3HA 3BDPA 3ZSVA 2QTDA 5AQNA 2OA8A 3BF1A 5AQHA 4DUZK 3O8MA 3F5TA 4IBNA 3V1OA 1K6YA 3CJCA 3LWMA 1IJJA 4GV6A 4OX9K 3HJFA 3V9XA 4N76A 4LH4A 5I42A 2GTDA 4FOIA 3QO9A 5EVZA 5CZ1A 3QINA 2QWRA 4DTNA 1XQSC 1Q7YO 3DLEA 1GLEG 4B1XB 1K9MO 4N47A 3K0SA 4B1WB 4OKKA 5EOYA 5AQPA 1S9GA 3ZSQA 3SQ1A 1Q18A 3W3DA 4WE1A 3TAMA 4E1JA 2Q0UA 4B1VA 2P9NB 4H0YB 3SUOA 5HP1A 4DSEA 4JI6K 5KPRA 4CZLA 1X9JA 2E1ZA 3SAGA 1B9FA 3L3VA 3I0SA 2R7YA 3O5BA 2A1SA 1SQKA 1N33K 2VYPA 4BGAA 4CBWA 3HM9A 1WSEA 4JD2B 1YJ9N 5AQZA 2BE2A 4J2AA 3D2EB 3RMCA 4H4OA 1DEJA 4CHPA 5LJVA 2A3ZA 3ISNC 1EWRA 3SPYA 4KFBA 4WQ5A 4JK7A 3KWGA 4HUEA 1RNHA 4JLHA 4FWLA 4E3SA 2LSNA 3FFIA 3P83D 1KRPA 4FK2A 4BDYA 4H0PA 2HB5A 1ZBHA 2ETJA 3DWLA 2G8HA 5BRFA 4GV9A 4F8RA 4E7LA 3Q7CA 4RW4A 4QS8A 3QICA 4V19S 1RT6A 5KQ8A 5FLXO 3RVCA 3O1BA 4NLCA 2AP1A 4DTUA 1JLCA 1JL1A 3FZMA 1NGFA 2E2OA 3EY1A 1CXUA 3ZT1A 4A59A 1CXQA 1OKJA 2W6KA 3AA4A 4FLVA 3O6WA 4AHSA 3TARA 3CCEN 2GWKA 1VQON 4AH9A 3MDQA 3FZHA 3H1QA 3U3YA 1RDCA 5DM7L 1NNEA 3O4NA 2KHOA 3CHWA 1WLJA 3G10A 3O9RA 1QQOA 2HHXA 3MN9A 4EP4A 4W5OA 1LV5A 1RT4A 4QCLA 1NKBA 1NK9A 2V51B 4X65K 4M3RA 1NWKA 5AQOA 4FJ9A 2HF3A 3MX2A 3T3FA 3OBYA 4FWMA 4LF8K 1RBVA 5BN8A 4DSFA 2Z1HA 3S41A 4DR1K 1CZAN 5DMRA 5TKYA 3IG1A 2I7PA 4DFMA 4BRNA 3WNEA 2NRHA 1ASUA 4IXCA 4FK4A 2ZF5O 4CF0A 3MECA 4CGIA 3PO4A 3CD6N 1S72N 1LAVA 5IT9O 4K0KK 4M41A 3TTDA 4JHDA 4RWTA 2E8AA 2DPNA 4B9MA 2P5GA 4CJWA 3J8AA 4DHYA 3SJJA 4JKCA 3ENBA 3VPZA 2UUCK 2QA4N 5AQGA 4G1QA 3AA3A 1KFDA 5TKWA 1NK7A 4I9QA 4BG8A 4JI8K 1KD1O 3AGKA 5LY3A 4ICLA 4MQ3A 4CD3A 1SL1A 3W0LA 3OVNA 4NXNK 4BRLA 1HYVA 5KRSA 2ZGZA 2KW4A 3AVFA 5JMVA 4B1YB 3NGZA 3ULDA 4PA1A 4OPKA 2O8BA 3K2PA 3IFRA 3DRRA 3PSIA 4CF8A 5AR0A 5FRMA 5D3GA 5M1PA 2IS3A 4E7JA 1HNXK 1D9DA 4AHRA 3K5NA 1VHXA 5M1OA 3QIPA 2ZWHA 5FPEA 4CGFA 4DTOA 2GEMA 4W5TA 5AQJA 3WXKA 4FL9A 1NGDA 1T05A 1JKHA 3K5MA 1XMOK 5M1NA 3V1RA 5AQSA 4CJUA 1XHXA 4PL8A 4M3WA 2NRRA 2P9UB 1Z25A 5GADP 3OYBA 4FLZA 3VTHA 2E20A 1VQ7N 4NXMK 1HPMA 3B8AX 2F4VK 1TAQA 4YFUA 2P9NA 2HMPA 3R1XA 4O44A 1FKOA 2E1YA 3UIQA 5KQDA 1RILA 3K59A 4QAGA 4JI7K 4CIGA 1REVA 3MN5A 1SKSA 2FF6A 1SUQA 2QWNA 3MEDA 1K8KB 3MMVA 4BGBA 4CJ5A 3CCLN 3WEEA 4FJ5A 2HW3A 4KHQA 3KD1E 4CFBA 5AQRA 3OS0A 3DM2A 1ZYQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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