3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanococcus maripaludis s2
publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
molecule keywords Conserved archaeal protein
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
3LDLA 1HUXA 2QWMA 4BG9A 1QQNA 4BQZA 2ASOA 4QS8A 2ZF5O 2YI1A 4BRFA 2GTDA 3O1WA 1D4XA 1TUYA 5AQKA 2FXUA 4H5RA 3SMPA 2E2QA 4ISFA 1BWFO 4IO8A 4BR0A 2FLOA 3D2FA 3GBTA 4JHDB 3U9DA 4H0TB 4B1ZA 4IJNA 4CBXA 5B8HA 1HKGA 4PKHA 2QWNA 1V4SA 4JHDA 1NGCA 5AQRA 2QWLA 4FWQA 4BRNA 2A3ZA 3M3ZA 3MDQA 1KAXA 2NRHA 5AQPA 5E84A 4MLEA 2P9UA 1YUWA 4B1VA 1JCEA 3CI5A 5KPTA 2GUPA 1T6CA 2Q31A 1ATNA 3B8AX 2QWOA 4IJAA 3OHRA 3KVGA 1HJOA 1HKCA 2E8AA 3U8XA 1MA9B 3O8MA 4WQ5A 1BA1A 4LC9B 3C7NB 1CZAN 4FWRA 5AQMA 3CIPA 1NGEA 4BR9A 3ENHA 4ISGA 4FWLA 3VEOA 3HSCA 4WQ4A 2H3GX 4XH4A 4HWIA 3FFKB 4MO5A 2IVOA 5KQDA 1T6DA 3KZBA 2ASPA 4IXCA 2P9IB 5BN9A 5F2RA 3W0LA 4BC2A 1NGJA 2QM1A 5FPEA 5KPZA 5ELZA 1J6ZA 1Q18A 4H5NA 1NGGA 4BQLA 3IUCA 1JCFA 2NZTA 3BUZB 4K41A 2W41A 3O08A 3ATUA 5JMVA 2FSNA 2CH6A 4ISEA 1S22A 1NGIA 5AFUH 3D2EB 1GLFO 3H3OB 1G99A 5FPNA 3FZFA 4HTLA 1R59O 1SAZA 5AQWA 3VETA 3D2EA 2ZWHA 4FPBA 3WXIA 5AQUA 4H5VA 4Z94A 3H45C 4CZHA 4BC4A 1X3MA 2GWKA 4H0XB 3U4LA 1NBWA 2YCHA 1C0FA 4EFHA 1HLUA 1U6ZA 3CJCA 3FZKA 4H0OA 3ZX3A 4CBWA 5AQFA 2VYPA 3VEZA 4B1XB 1XUPO 2Q0RA 3VF6A 3AAQA 2CGKA 3HI0A 3SJHA 4FWKA 1YVNA 4L3QA 4BR7A 4CZFA 1V4TA 2P9SA 2V7YA 4I6MA 5LJVA 3VF2A 1JCGA 4FWPA 4B9QA 2IVPA 4A62A 3CJBA 1OKJA 2QWPA 3EKSA 5AQXA 5AZJB 2HOEA 3O80A 1HPMA 1Z6RA 4KBOA 5AZJA 3U9ZA 5E26A 4FSVA 1TYQB 5AQQA 2Q1NA 2FF6A 4QS7A 3VGMA 2E2PA 1T44A 2P9KB 2A40A 5EX5A 1RDWX 4GNIA 4DB3A 3QMLA 2F9TA 2IIRA 4DHYA 5FPDA 4BROA 3AY9A 3MN7A 2P9KA 3VEYA 1NGAA 5EXWA 3DXMB 3A0IX 3F9MA 4XH5A 2UYTA 2ZGZA 1BOTO 3CJ9A 3QBXA 2ITMA 3IFRA 1RFQA 4GY2B 4BRLA 3BEXA 1NGFA 1KXPA 3JXUA 3BF3A 3WUHA 1ZC6A 2HMPA 1S3XA 3TPQA 4BRGA 5BPNA 4H0YB 3MK6A 3QICA 1BUPA 3CHWA 3VGLA 4BC5A 3EKUA 3R9PA 1BDGA 4BRIA 3W3DA 4FOEA 4CZIA 5AZIB 4FPAA 1C0GA 3ENOA 3O4WA 3ZX0A 3C7NA 3WXJA 5KQ8A 4BGBA 4CZLA 4F9OA 1X9JA 4H0VB 4MLHA 3CJ1A 3GL1A 2A5XA 1NWKA 5JLFA 3O6WA 5LY3A 2YHYA 4XH1A 3WXLA 1XQSC 5TKYA 4BRQA 4RWTA 2NLXA 3EZWA 3WQUA 1GLAG 3WXKA 4EHTA 2P9IA 5AQJA 5AQGA 1GLJO 2I7NA 3R8EA 3WQTA 1ZXOA 3H1QA 1QQMA 3H6EA 3C0BA 2I7PA 1WUAA 4DQ8A 1TUUA 1NGHA 4JD2B 4H0PA 1HX1A 5AQNA 5EVZA 4EAHD 1E4FT 4YDUA 3LDPA 4O8KA 3LDOA 4JD2A 3M1FA 3ULEB 3H3NO 3LM9A 4PKGA 3FGUA 3VF4A 5JICA 3RSEB 3S41A 1SQKA 2E2OA 2OANA 3GDQA 3ULEA 3EL2A 3A5LC 3R6MA 3RSEA 3EN9A 4BRDA 3WEEB 3UE5A 4WQ5C 4RTFD 3G25A 2FF3B 5EY4A 1QQOA 5EOYA 2E88A 3BF1A 3ATVA 2AA4A 4BRPA 2PBDA 4NO7A 4WQ4C 4AM6A 2CGJA 3LDNA 3VEVA 4BC3A 4JN4A 3UKUB 1NM1A 1SZ2A 4CD1A 3MN6A 4NB4A 2YHXA 2VWBA 3AAPA 3UKUA 2A41A 3FZMA 1P8ZA 2W40A 3L4IA 3VESA 3GE1A 5AQSA 2A6AA 2GELA 2HF3A 3QDKA 1K8KB 5FPMA 4AM7A 3HBTA 2QW9A 3D7EO 1TYQA 1HKBA 3J8AA 3SLCA 3CQYA 5AQIA 1ATSA 1ESVA 2BTFA 2HF4A 4A2AA 3VEXA 4BREA 4BVPA 1GLCG 2P9LB 2QWRA 1GLBG 3A5MC 1QZ5A 5BPMA 4JAXA 3JS6A 4FWSA 4YDUC 4EIAA 4CI6A 2P9LA 3ZETB 2D1KA 1ZBSA 2PAVA 4FL9A 5AQYA 2P9NB 3CJAA 3FR0A 4IWVA 2D0OA 3DXMA 4H03B 3MN5A 4CBUA 3AARA 5AR0A 2AP1A 2YJFA 4J8FA 3QBWA 4MO4A 4B1YB 2P9NA 3VERA 1XC3A 3O5BA 4K25A 3QB0A 5BRFA 2Q36A 2FSJA 4JNEA 4A2BA 4CZMA 2E2NA 3TU5A 5F0XA 1DGKN 2D4WA 3LDQA 5BRHA 5AQTA 4FOIA 3VENA 1MWMA 3UB5A 3D2FB 4IZ9A 2CH5A 4M7XA 5CE3A 2ASMA 4CZKA 5BREA 4BR4A 4CD3A 4FWOA 2CGLA 2FSKA 1U2VB 4PL7A 1NGBA 3A5NC 2P9UB 2ZGYA 5BN8A 5AZIA 4CZJA 4BRCA 1LOTB 4M7YA 3WT0A 1U2VA 2E1ZA 4QS9A 3CJ7A 3DXKB 4DCHA 3VOVA 4PL8A 3FE1A 1X3NA 3FZHA 1MWKA 1Y64A 4BVOA 3DXKA 1DEJA 2Q97A 1BG3A 1LCUA 2V52B 3SK3A 2A42A 1RGIA 1QHAA 3BP8A 2YHWA 3I8BA 3A8YA 3IMXA 3LM2A 3HM8A 3DJCA 4FWMA 3DAWA 3A5OC 3VGKA 3H46O 3UKRB 3VEWA 3FZLA 2E1YA 1IG8A 5KPRA 3SMSA 4PKIA 3UKRA 4BGAA 3O1BA 1YXQA 1KAYA 4C23A 4BRKA 4CZGA 3FLCO 3MN9A 1H1VA 4CZEA 3QFPA 3GOIA 5ADXH 1YAGA 4B1WB 4FO0A 1QZ6A 2V7ZA 4WYBA 2EWSA 2QXLA 2WUSA 4K43A 1BA0A 2GEMA 4Y0WA 5F1XA 1GLLO 3MMVA 4BR5A 3ID8A 1WOQA 3IDHA 3EO3A 1BU6O 1KAZA 3QFUA 1NGDA 3H1VX 4BR2A 5ADXA 2Q0UA 1EQYA 3I33A 1NLVA 3CQXA 5AQLA 3WEEA 3ZX2A 3DWLA 3CERA 2GWJA 4BRAA 4CJ7A 4B1UB 5AQOA 3ZEUB 1GLEG 3KHYA 4EHUA 4M63C 5JLHA 1E4GT 3LL3A 1DKGD 5AFUA 3GG4A 1BO5O 1ATRA 5AQVA 1IJJA 1Z05A 2KHOA 5I9EB 3ZEUA 4O5FA 3P4IA 4H5TA 5AQZA 3HTVA 3L6QA 2P9SB 5AQHA 4A61A 4I6MB 2BUPA 4K42A 2P9PB 1GLDG 2J4RA 4BRMA 2V51B 2IVNA 5BPLA 1NMDA 2DPNA 1K8KA 4XEIA 3HZ6A 4BG8A 2P9PA 3VPZA 3L0QA 3MCPA 2D0PA 2Q2RA 4RCHA 2QWQA 4BRHA 1MDUB 5BRDA 2VCPA 2F9WA 3CETA 2E20A 2YJEA 3M6GA 4E1JA 4FWNA 5BR9A 3ZETA 4H5WA 5LJWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LDLA 4O44A 3ZT4A 1HQEA 1QQNA 4BE0A 4BQZA 1IH7A 5JVGL 4QS8A 2KW4A 2YI1A 3AGRA 4R79A 5SWMA 2HHWA 1D4XA 1Q9XA 2E2QA 4CJPA 4BR0A 3V4IA 3RWUA 4E7HA 1VSMA 4B1ZA 4DV3K 2HSTA 1RTHA 3TTDA 4FJXA 4ELTA 3NFAA 5DM7L 2QWLA 4Z4EA 5LMNK 4BRNA 3N4QA 2NRHA 5AQPA 5IWAK 4CFBA 3T1AA 1YUWA 2NRZA 4I9LA 4B1VA 4J2AA 3RMCA 3BY5A 2QWOA 2YNFA 3TAQA 3OHRA 3JAMO 4U7BA 2E6LA 3OYJA 1FW6A 2OYQA 4FWRA 4KTZA 3V9ZA 4E89A 4I2QA 1NGEA 3VQBA 1VQ6N 4ZTFA 4BR9A 4IOXA 4FWLA 1IG9A 1IBLK 4CJVA 5GAGP 1K6YA 4MO5A 3RR8A 4IXCA 2D0CA 4BWMA 5F2RA 3W0LA 1NGJA 2QM1A 5ELZA 1J6ZA 1SS6A 5MLCQ 4KO0A 3QEVA 1G15A 4MDBA 1NGGA 4G1QA 1XHXA 1FKOA 1XMOK 4BQLA 3THVA 3SAHA 1VQMN 2HNZA 5JMVA 4DR4K 1S22A 1GLFO 4JK7A 1G99A 1NK0A 1UWBA 4CHZA 1S6PA 3VETA 4B8AB 3I55N 3EZ5A 2ZJPL 4JI6K 4CZHA 4AILC 2GWKA 2OA8A 5HL7L 1WSHA 1NBWA 4HTUA 2YCHA 4CGHA 1U6ZA 1NMNA 3FZKA 3AO4A 3VQ7A 3CC4N 2HHQA 3O9UA 1XUPO 2Q0RA 1C1BA 3O4NA 4O4GA 3NCIA 2GV9A 1VQNN 3ITHA 3SBGA 3DLKA 2P9SA 2V7YA 1FXXA 4O0JA 5DMRA 5LJVA 3NF7A 1XI1A 1ZBUA 4M3ZA 4XIUA 1JCGA 4FWPA 1XNRK 3C94A 1YI2N 3S3MA 4N41A 4DTUA 5J2PA 1Z6RA 1NOZA 3F73A 4CJ4A 5AZJA 3U9ZA 4CFDA 1IKWA 4FSVA 4W5OA 3LWMA 4QS7A 3VGMA 2LSNA 1N36K 1KLNA 2GX9A 5CHIA 3THXB 4IOCL 4KHYA 4GNIA 3QMLA 2F9TA 4DHYA 4BROA 1XHZA 5CR4A 2W6KA 1BI4A 3SYZA 3NVKA 4JI4K 3L2RA 1YTUA 3WNEA 4KAZA 4XH5A 1VQ8N 3CJ9A 3BEXA 1CZBA 4PY5A 2HMPA 2ZE2A 4BRGA 2OTJN 1M90O 3HP6A 4H0YB 2GBZA 1BIZA 1RT4A 2Z1HA 1LW2A 3ENBA 2OPSA 1KD1O 1K9MO 3EKUA 2HBLA 1BDGA 3OYIA 1VQKN 4Z4FA 3JYTA 4CJLA 4CGFA 4FM2A 4GVEA 5AZIB 3OYLA 2HNYA 3WXJA 5KQ8A 5C25A 4CZLA 4DTXA 4F9OA 1YHQN 4CVNE 3G6EN 4ILGB 2ATQA 1EP4A 1QHTA 3L3UA 5TKYA 4RWTA 2NLXA 3EZWA 5GAHP 1BL3A 1KSPA 4KH4A 1GLJO 2I7NA 3R8EA 3H1QA 4BE1A 2UXDK 1RDUA 3C0BA 4DQ8A 4GMJB 3LPTA 4CJ5A 4H0PA 5AQNA 4IO9L 2AJQA 1BQNA 2PY5A 5GIOA 3ULDA 4JD2A 5HRSA 3M1FA 1VSEA 4AHTA 3LANA 1KFSA 1SKWA 3FGUA 2YX6A 4NCBA 4CIGA 3GDQA 3EN9A 1RT2A 4BRDA 3WEEB 3UE5A 1X9WA 4RTFD 1S5JA 3G25A 4GW6A 1KVBA 3CCVN 4AH9A 5EOYA 3SNNA 1RBSA 4BRPA 4NO7A 1DT9A 3NMUA 4OLAA 2O8BB 2HW3A 3ZSXA 2FBVA 4GVMA 2VWBA 5FRMA 3UKUA 2IC3A 3CCJN 2W40A 3QLHA 2A6AA 2GELA 2HF3A 4FJIA 1U49A 4FJJA 1RT5A 4GKJK 2G8HA 1TYQA 1HKBA 3E66A 4M3TA 2BTFA 4YOWA 3SCXA 3MWPA 2O8EA 3ZT0A 1GLCG 2FBYA 1GLBG 3A5MC 4H4MA 1QZ5A 4BE2A 1Q82O 1WSJA 4EIAA 2WBNA 1KTQA 3ZETB 5AQYA 4LFBK 4IWVA 2D0OA 1QVFM 4JK8A 4LH4A 4KTQA 3S3NA 3VERA 3O5BA 4KB1A 2FSJA 2HMIA 5F0XA 2D4WA 5BRHA 4DTRA 4M41A 2F4VK 4UY8O 4IFEA 1LWCA 1E3MA 1FKPA 1WSGA 3KLGA 4FWOA 3E1YA 3OJUA 1KCFA 3TTFA 2FSKA 2WTUA 4B3TK 1NGBA 1S9EA 4AHSA 4CZJA 4DQQA 3SUPA 1LOTB 4DV6K 4M7YA 3CJ7A 3DXKB 1N8RO 1VQ7N 2B6AA 5GIPA 1MWKA 4DSLA 2D5RA 1TL1A 2V52B 3BZCA 2B4JA 1WAJA 3ZSYA 3SQ4A 3T69A 3I8BA 3LM2A 1TKDA 3DJCA 4FXDA 1NKEA 3UKRB 3VEWA 4JEPA 4N47A 3FZLA 4E3SA 1IG8A 1VQLN 2O4GA 2FBTA 3HO1A 3T1YK 3GOIA 1VQON 2IGIA 4WYBA 2EWSA 1HPZA 4LSNA 2QXLA 2WUSA 4K43A 5KGXA 4Z4HA 1BA0A 2GEMA 1U04A 1Q9YA 1IO2A 4FLUA 4CGDA 4IEIA 2HVHA 4CIFA 3L2VA 4LF5K 1RBUA 4L8RB 3EO3A 4BDZA 1KAZA 3QFUA 4BR2A 2Q0UA 3U6FA 2GUIA 1RNHA 4E7KA 3PO4A 2G8UA 1P90A 1BCMA 3QEPA 1Q81O 1RCHA 4AF1A 4EHUA 4M63C 2RPIA 5JLHA 4MFBA 3VQCA 4M45A 1EO1A 4NCAA 3ZEUA 3THWB 4H5TA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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