3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
molecule keywords Conserved archaeal protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanococcus maripaludis s2
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
4RCHA 2E2NA 5AR0A 5FPNA 3SK3A 4BG9A 4FWQA 1ATRA 4B9QA 4BR5A 4CJ7A 5BPMA 4BRCA 3FZMA 3VGMA 2D0PA 4BRHA 1ATNA 1LOTB 3AY9A 3VF6A 1QQMA 5AQUA 1KAXA 4B1YB 4BRGA 3A0IX 3VEWA 1RGIA 3WXLA 1HX1A 2ZF5O 4JAXA 2P9UA 2Q1NA 4WYBA 2V7ZA 4FPBA 1HPMA 2Q0RA 1TYQB 3DAWA 4A61A 4PKGA 3LM9A 3ULEA 3CQXA 3EZWA 3FE1A 3UKRB 2E2PA 3IFRA 1SZ2A 3D2FA 4FPAA 5EY4A 2FSJA 3AAQA 5ADXA 3JS6A 1GLDG 3GDQA 5FPEA 2E1ZA 5AFUA 5I9EB 2VCPA 4QS8A 1NGFA 4BREA 2YHYA 1ZBSA 3L0QA 1HKCA 5LJWA 3O08A 1WOQA 1DKGD 2W40A 3CJAA 4H5TA 2P9PB 3TPQA 3ZX3A 4B1ZA 4WQ4A 1T6CA 2IVNA 1DGKN 3CIPA 1ESVA 1YXQA 1QQOA 5AQLA 4BVPA 3CJ7A 5BRDA 3U4LA 1GLFO 4CZLA 3QBWA 4K42A 5E84A 3ZX2A 3FR0A 5KPRA 3QFPA 1QZ6A 4Y0WA 4BR0A 4H5RA 2Q0UA 3H46O 4XH5A 4YDUA 5BN9A 2FLOA 2J4RA 3B8AX 2AA4A 4CZFA 3DWLA 4CBWA 4EAHD 3BUZB 4WQ4C 1TUYA 4BR4A 2QWNA 4NB4A 2QWLA 1QZ5A 1MWMA 1BA1A 3CJ1A 4EIAA 1SAZA 5AQSA 1GLCG 1GLJO 1BOTO 5AQKA 3ZEUA 1TUUA 2P9SB 2A5XA 4DB3A 2AP1A 3BP8A 4B1VA 4CZMA 3HTVA 2I7PA 4I6MB 2FXUA 3H6EA 4YDUC 3U9ZA 1NLVA 1K8KB 3G25A 3VF2A 5JLFA 1U2VA 1V4SA 3A5LC 5AQYA 2P9KB 3BEXA 5E26A 1DEJA 5ELZA 1T6DA 3C7NA 2WUSA 4BGBA 5AZJA 3A5OC 4GY2B 3O1WA 4FL9A 1NGIA 3MN6A 4M63C 2YCHA 5EXWA 2E2OA 2A41A 1OKJA 2ASMA 2A3ZA 4CZKA 2NLXA 3FZHA 1NM1A 4K41A 5KQDA 5AQQA 2FF6A 3FFKB 4H0TB 2HF4A 2BUPA 2CGJA 3O4WA 3CQYA 3KVGA 3VGLA 3O1BA 3QDKA 1NGEA 4AM7A 2P9IA 4FO0A 2P9UB 2E88A 1BG3A 1NGCA 1ZC6A 2D1KA 1BA0A 5AQNA 3ZETA 2Q2RA 3QB0A 1BUPA 1BDGA 2E1YA 2GUPA 3D2FB 3LDOA 1Z05A 3VEZA 1C0FA 2ASOA 2ZWHA 4BC4A 3AAPA 4O8KA 3DXMA 3OHRA 4CZEA 2D4WA 3P4IA 1NWKA 1D4XA 4BC2A 2E20A 1GLLO 1E4FT 2YJFA 4M7XA 2CGLA 1Z6RA 3VERA 3A5MC 5BRFA 3WXIA 4BRDA 1R59O 3RSEA 1NGGA 4PL7A 4MO4A 5JICA 5ADXH 2H3GX 4A2AA 3M3ZA 2VYPA 2QW9A 3O5BA 4FSVA 5AFUH 3WEEA 1V4TA 4XH4A 1HKGA 2UYTA 5BPLA 4BVOA 5BR9A 1XC3A 2QWPA 1SQKA 3SJHA 1GLAG 3DXKB 3VEXA 4QS9A 4KBOA 3FLCO 3O6WA 4IJAA 4IWVA 1NBWA 4FWRA 4JNEA 4FWNA 3VESA 3ZEUB 3A5NC 3VF4A 2HOEA 2ZGZA 3SMPA 1HJOA 2FSNA 4BRAA 3EKSA 2D0OA 5TKYA 4B1WB 2W41A 1IG8A 1QQNA 4L3QA 3SLCA 3O8MA 1J6ZA 4O5FA 4FWSA 2IVPA 3H3NO 3C7NB 4Z94A 3IUCA 4H0YB 5AZJB 3CHWA 1YAGA 1HUXA 3GE1A 3BF1A 4IO8A 1JCGA 4NO7A 1WUAA 2GELA 3ATVA 3KHYA 4CZGA 4BR2A 4HTLA 4BRIA 2A42A 3GL1A 3M1FA 1GLEG 4CZHA 5AQVA 5AZIA 4JN4A 4LC9B 3QICA 5JMVA 5AQPA 2DPNA 3VEYA 3LDLA 4GNIA 1NGJA 3VPZA 2P9IB 2P9LA 5AQGA 3CJ9A 1X3NA 4JD2B 4RTFD 2YJEA 1BWFO 2CGKA 3H1QA 4XH1A 4IJNA 4MLEA 1S22A 2ZGYA 4H0OA 3LDNA 4CZJA 1IJJA 1XQSC 2V51B 3HZ6A 3HI0A 2E8AA 4BR9A 1HLUA 3LL3A 2FF3B 4CD1A 1GLBG 4BC3A 3M6GA 3MN9A 3DXMB 4DQ8A 1RDWX 3D2EA 4BQLA 1U6ZA 3FZLA 3MK6A 4H03B 4WQ5C 1EQYA 3U9DA 1ZXOA 4HWIA 1MA9B 1X3MA 5AQOA 5AQTA 2IVOA 3LM2A 1MDUB 3RSEB 3H1VX 4DHYA 2Q31A 2QXLA 3ULEB 4I6MA 4BRNA 1NGBA 5BPNA 1K8KA 2F9WA 4E1JA 3ZX0A 3WEEB 5AQJA 4K43A 2VWBA 1ATSA 3L6QA 4MLHA 3EL2A 4CD3A 4JHDA 5AQIA 3CJCA 1C0GA 2E2QA 3EN9A 3FZKA 5AQZA 5EOYA 1KAYA 1NMDA 5AQMA 4FWPA 4A62A 3VENA 2GEMA 5AQXA 3IMXA 3SMSA 4H0XB 3JXUA 4C23A 3WXJA 3H45C 4EHUA 3BF3A 3GOIA 1BO5O 2BTFA 4FWMA 2ASPA 5LJVA 1NGHA 5EVZA 1P8ZA 4PL8A 4MO5A 4FWKA 5B8HA 3AARA 2QWRA 3MDQA 3UKUA 4K25A 4BRFA 4BG8A 2P9NA 5AQWA 2A40A 4H5NA 2OANA 4BGAA 4CZIA 2V7YA 3QBXA 3HBTA 5BRHA 4IXCA 3IDHA 3L4IA 3ENHA 3EO3A 2QWMA 2GWKA 1T44A 4BRKA 1JCFA 3HSCA 4ISGA 3I8BA 5BN8A 3EKUA 4BR7A 3C0BA 4PKHA 3MCPA 4FOEA 4DCHA 1E4GT 4H5VA 5F1XA 3WUHA 5LY3A 4A2BA 5F0XA 1Y64A 2V52B 3FZFA 4FOIA 4EHTA 3R6MA 5AZIB 4CBUA 1U2VB 3J8AA 1MWKA 1YVNA 4FWOA 4IZ9A 4XEIA 2GWJA 1TYQA 4BQZA 5KPTA 2YHXA 3R9PA 4EFHA 3CERA 2P9LB 3UKRA 3CETA 3S41A 4B1UB 4BRQA 2FSKA 3DJCA 1CZAN 4RWTA 2QM1A 1LCUA 1NGAA 5KQ8A 2QWOA 3H3OB 3VGKA 3QMLA 2I7NA 4CBXA 2Q97A 4H0PA 3GG4A 1JCEA 3O80A 3DXKA 2P9PA 3FGUA 2CH6A 3ATUA 2HF3A 2YHWA 3D2EB 3UB5A 5EX5A 1H1VA 3VEVA 4H0VB 3WXKA 2PBDA 4F9OA 2KHOA 3VETA 3MMVA 5AQHA 4PKIA 2YI1A 4ISEA 5F2RA 3ZETB 5CE3A 2A6AA 1S3XA 1XUPO 2NRHA 4BRMA 5AQRA 2CH5A 3CJBA 3HM8A 3LDPA 4BRPA 4JHDB 5KPZA 2EWSA 1G99A 5BREA 3U8XA 5AQFA 3MN7A 1X9JA 2QWQA 3CI5A 2GTDA 4BC5A 2HMPA 1KAZA 1RFQA 4CI6A 4H5WA 1BU6O 3VEOA 2P9SA 4FWLA 4WQ5A 3W3DA 3LDQA 3A8YA 3GBTA 4B1XB 4BRLA 1NGDA 4ISFA 2NZTA 3QFUA 1HKBA 3R8EA 3TU5A 3WQUA 3WT0A 3D7EO 3MN5A 4QS7A 5FPDA 3W0LA 2P9KA 3ID8A 3ENOA 3KZBA 4BROA 1KXPA 3WQTA 5JLHA 2ITMA 4AM6A 3UKUB 3UE5A 2P9NB 1QHAA 2IIRA 5FPMA 3F9MA 2Q36A 1YUWA 4M7YA 4J8FA 3VOVA 2F9TA 1Q18A 4JD2A 3I33A 2PAVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHOA 4RW4A 5FPNA 1TKTA 4YFUA 5BPMA 1XI1A 3PIOL 3VGMA 4CHNA 5MLCQ 1NKEA 1LOTB 4B1YB 4DWIA 1FKOA 4FJMA 4JS5A 1C1BA 3VEWA 2XY6A 3WXLA 3AVCA 1SV5A 4JAXA 2Q1NA 5GAEP 1VQ5N 1NJZA 4DKWA 1TYQB 3DAWA 4A61A 1YJNN 3ULEA 4ZTJA 1SZ2A 3JAMO 5M1NA 5JVGL 4C1NI 2ZJRL 2UUCK 2E1ZA 5AFUA 4Q0BA 3SBGA 3I56N 1VQ4N 1ZBSA 4W5QA 4RG8A 1Q86O 2YKNA 1DKGD 4YOUA 1WSFA 3ZX3A 4IEEA 4B1ZA 2PFUA 2IVNA 4FZYA 1Q7YO 4JI3K 1ESVA 2O8EB 3CJ7A 1T3VA 3U4LA 3AGRA 3QBWA 1VSJA 4K42A 4CEEA 1JLGA 3T69A 1YJ9N 4Y0WA 4BE2A 2OCEA 4H5RA 4OPAA 3B8AX 2AA4A 2EHGA 4CBWA 3CM6A 4WFNL 4F2RA 2QXFA 1BA1A 4DFPA 3OBYA 5AQSA 3ZSYA 1QSSA 4OPHA 4JRQA 1IO2A 1WSGA 1BOTO 5AQKA 4CJEA 1Z25A 1XMOK 2XY7A 2VGNA 3E9PA 2JLEA 4CZMA 4I6MB 4DR6K 4B08A 4KHSA 3H6EA 3U9ZA 3VF2A 1K8KB 3QERA 3K5NA 3A5LC 1NG9A 2F4VK 1DEJA 3LWMA 5H1SQ 2UXBK 3MCAB 4BGBA 4GY2B 5CYQA 1NGIA 4M63C 4JI5K 5EXWA 3TSPA 4DQSA 2E2OA 4RW9A 1OKJA 1U47A 2ASMA 2KZMA 2NLXA 3HL8A 3HO1A 5AQQA 4CEFA 2XHBA 3TTDA 3TANA 2BGGA 3TTFA 3K59A 1QVGM 1I39A 3J81O 4F3OA 1NJWA 4DFMA 1NGEA 3KK2A 1L3SA 3VQPA 3HJFA 2P9UB 1U48A 3CC2N 4IBNA 2D1KA 1BA0A 4E7LA 1B9DA 3P38A 3ZT4A 1BDGA 3CCMN 3THWB 4E19A 5HLFA 2E1YA 2ZWHA 2VWKA 3WXMB 3ASMA 3HOTA 4DR2K 4DTRA 3JSMA 4CZEA 4LF9K 2D4WA 4BC2A 1NWKA 4DV0K 4FZXC 3VERA 4KB0A 5BRFA 1RT3A 3B6PA 1JKHA 3VQDA 4G1QA 2E4LA 1NJYA 4MO4A 4CF8A 4DTNA 2WFBA 5JS2A 3OYIA 5SWMA 3M3ZA 5CR4A 1HQEA 3SNNA 1YTAA 3AVFA 3R1XA 4BVOA 5BPLA 3NGIA 4CJKA 3MXIA 2QWPA 1SQKA 2KW4A 1UAXA 3O9QA 2G8FA 4UY8O 3DXKB 4W5TA 4JKEA 4IG3A 4QS9A 3FLCO 4IJAA 4NCBA 4FWRA 1YF5L 4JNEA 4FWNA 3CMEN 3OS1A 1NK6A 1RBRA 3KLFA 2HOEA 3D6RA 4JI2K 3DLEA 4FJ9A 1A5WA 1O1WA 5CZ2A 4CECA 1D9DA 5TKYA 3PX4A 3SLCA 4MFBA 4O5FA 3V9XA 2IVPA 2B5JA 5GADP 4HVJA 4ELVA 3C7NB 4Z94A 1FW6A 4CK2A 3THVA 3GE1A 3TAGA 3B6OA 1RBVA 1ZBUA 2GELA 3F5TA 4CZGA 4CHYA 3OS0A 3T19A 3ALYA 4HTLA 4BRIA 3EEQA 1TK5A 5AZIA 3QESA 3BZCA 3VEYA 2IC3A 3VTIA 2YHAA 4BDPA 1L3TA 2YX6A 3THYA 1NGJA 3G4SN 3VPZA 2VQEK 2P9LA 1S1VA 3T1YK 3SV3A 1X3NA 4JD2B 1XC9A 4RTFD 3SPZA 2YJEA 4IG0A 1VSHA 3M8PA 4IJNA 3V6DA 3MEDA 4FW2A 4Z4EA 3HZ6A 4DG1A 1D8YA 2FF3B 3CCRN 1KLNA 3LPTA 1RILA 4BDYA 1RDWX 2QK9A 4KHYA 3LPUA 4DTPA 4OLAA 4JEPA 4PY5A 3KLIA 4HWIA 1NOYA 5GAGP 4E7IA 2IVOA 1MDUB 3DLLL 3H1VX 1N34K 4NXMK 2OTLN 3CFRA 5BPNA 4E1JA 2JWKA 4UQGA 1TGOA 3WEEB 1L3UA 5AQJA 1NK7A 1QVFM 3LZIA 2VWBA 4O0IA 3AO4A 3DLGA 4KB1A 1BI4A 4CD3A 2YNHA 5KTQA 4JI7K 4X62K 5AQMA 2DY4A 4JI8K 1HYVA 3L2VA 3C94A 1KFSA 4GMJB 4JK9A 4N47A 3SQ1A 5LJVA 4PL8A 4MO5A 3CD6N 3OYBA 4GVMA 3VQ6A 1VK0A 3PY8A 2W6KA 2YV0X 2IDOA 1CLQA 4BG8A 4BY9C 5AQWA 3CYMA 4H5NA 4MQ3A 5C15A 1X9SA 1TKDA 3NCIA 1ZBFA 4B9TA 3QBXA 4K0KK 1P90A 1VRTA 5J1EA 4IXCA 1OVYA 1RT4A 3EO3A 2KQ2A 2GWKA 4CIFA 4LY7A 3I8BA 1S9EA 2ZQBA 4E89A 1NKCA 2I5JA 5HRRA 3V9SA 3AO5A 4FLUA 4E7JA 2OTJN 1DT9A 3FZFA 3S9HA 1WSJA 4B3TK 3R6MA 2HVIA 1YVNA 3HPOA 4M3UA 1WLJA 1LV5A 2G8VA 3P83D 2B6AA 2W42A 1IBKK 4Z4CA 3DJCA 3IS9A 4JYAK 1T8EA 3G6EN 3T1HK 4H0PA 1HYZA 4LFAK 1BGXT 4M3XA 3SJJA 1VSIA 3FGUA 3ATUA 5E41A 2EX3A 2BH1A 3D2EB 1NK5A 2P5GA 1NKBA 4KH6A 2O8DA 4A57A 3EE8A 4CJLA 4K8XA 4DSIA 3WNFA 1SUQA 5AQHA 1EKEA 4QAGA 3VQ9A 3VQBA 3WNEA 2YI1A 1VSFA 5F2RA 3ZETB 4JKCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4B1U B;  4IFV A;  2FSK A;  1RBS A;  3CCE N;  2QM1 A;  1LCU A;  4EP4 A;  3QML A;  1QHT A;  4CBX A;  2UU9 K;  1BIS A;  2P9P A;  2CH6 A;  2GBZ A;  4EZ6 A;  1RDA A;  4ILG B;  5EX5 A;  1WSE A;  1H1V A;  3IAY A;  3WXK A;  4H0V B;  3M8Q A;  1QSY A;  4PKI A;  1ZYQ A;  2KLA A;  4ISE A;  4V19 S;  2A6A A;  5T7B A;  3EZ5 A;  1S3X A;  4BRM A;  1SKS A;  1RT6 A;  3T1A A;  2IAJ A;  3AO2 A;  5AQR A;  4FJI A;  3PUF A;  4DR1 K;  4C8N A;  1JXE A;  1TVR A;  2EWS A;  1JLA A;  1G99 A;  4FW1 A;  4MDA A;  4AH9 A;  4OKJ A;  2HND A;  1KAZ A;  4IFY A;  4B3R K;  4H5W A;  2AJQ A;  1TAU A;  1UWB A;  1RTI A;  4BRL A;  1ASV A;  3R8E A;  2FBT A;  3NHG A;  1B92 A;  3AVJ A;  3WQU A;  3WT0 A;  3CCU N;  2VGM A;  4OLB A;  3W0L A;  3DLR A;  4IEI A;  3ZT3 A;  4BRO A;  3K5L A;  5JLH A;  1NK4 A;  4JLH A;  1QHA A;  3F9M A;  1NJI O;  2Q36 A;  1YUW A;  2O8B A;  4J8F A;  4CFC A;  3MN6 A;  2PAV A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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