3CETA

Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein q6m145 at the resolution 1.8 a. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
300
Chain Sequence
MILGIDIGNTKITELHENGEFKVHHLVSHVALVTTAETKKEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNNMKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the pantheonate kinase-like protein Q6M145 at the resolution 1.8 A. Northeast Structural Genomics Consortium target MrR63.
rcsb
molecule keywords Conserved archaeal protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Methanococcus maripaludis s2
total genus 97
structure length 300
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cetA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3cetA02
4FPAA 5AQNA 4CZJA 1NBWA 4JD2B 4BRCA 2BUPA 3O08A 4JHDA 4BRQA 1GLLO 5AQMA 3VF6A 3HTVA 3CQXA 5F2RA 4H03B 1HPMA 2CH5A 4BRIA 4H0XB 3H3NO 3UKRA 3VGKA 3LDPA 3R9PA 1ATNA 4FWKA 1P8ZA 3MMVA 3QFUA 1YXQA 3GBTA 3BUZB 3VETA 3D2FA 3A5OC 2GWJA 1MA9B 2Q2RA 3LDQA 4JN4A 3DXMB 3L0QA 1E4FT 2YCHA 3ENOA 3WXKA 3R8EA 1G99A 5TKYA 4K42A 1BOTO 4AM7A 1LCUA 4BC2A 4H5TA 4JD2A 2ZF5O 4BC5A 3HZ6A 2CGLA 3SMSA 4EHUA 1NGDA 2A3ZA 4A2AA 1XQSC 4H5NA 4WQ5A 2VWBA 4FO0A 4CZKA 2FF3B 4Y0WA 1DGKN 1Z6RA 2P9SB 3DXMA 3FZLA 3VERA 2Q97A 4B9QA 3DWLA 5ELZA 1HJOA 1QZ6A 4CBXA 4O8KA 3O1WA 3FE1A 2ZGZA 3D2EB 3CJBA 2Q0RA 3J8AA 2E1ZA 3CHWA 2V52B 3CERA 2F9TA 2QXLA 2AA4A 5F1XA 1Q18A 4IJNA 5F0XA 1BG3A 2P9SA 3HBTA 5LY3A 2V7YA 1ATSA 5KPRA 4BVPA 2E2PA 4CZGA 1JCGA 2NLXA 2H3GX 5ADXH 2P9IB 3BP8A 5LJWA 5AZIB 3EKUA 1BA1A 3RSEB 1Y64A 2IVPA 3VEYA 3WUHA 3HI0A 3C7NB 1YUWA 3D2EA 3D7EO 4EAHD 5BPMA 3QMLA 4IZ9A 1KXPA 1BU6O 3O80A 2P9PB 3CJ7A 3A8YA 4BC3A 2YI1A 2YJEA 4FL9A 3H6EA 5FPDA 4J8FA 4IXCA 3O4WA 2A42A 1IG8A 3KVGA 3I8BA 4K43A 5AZJB 1XUPO 4K41A 1NGCA 2AP1A 2VCPA 4CZHA 5BRDA 1U6ZA 2P9IA 5AZIA 3RSEA 2ZWHA 1BA0A 4IWVA 4A61A 1BO5O 2DPNA 2E8AA 3C7NA 4JAXA 2A40A 2E2NA 3O1BA 1IJJA 2P9PA 3A5LC 3FZHA 5AQZA 5JLHA 3FGUA 3WT0A 4WYBA 2P9LB 3AY9A 3DJCA 4RTFD 5JICA 5AQQA 2E2OA 1X3NA 3VEWA 4L3QA 1YAGA 1MWKA 3WQUA 2ASMA 1TYQB 3QFPA 3BEXA 4K25A 3H1QA 5AZJA 4BR0A 1NGAA 5AQTA 5AQSA 5KPZA 4BROA 3MN6A 4GY2B 3DXKB 4DCHA 4F9OA 4BRHA 5EXWA 3QDKA 4H0VB 2E20A 4BRKA 2ZGYA 5AQHA 4B1WB 2GUPA 3EL2A 5AFUA 2FSNA 3VEXA 3HM8A 2P9LA 3CJAA 4CBUA 5I9EB 3KZBA 4FSVA 2E2QA 1QZ5A 4BGAA 2ITMA 3U9DA 3H46O 1TYQA 2YHWA 2HF3A 4BRLA 4DHYA 4H5RA 5AQXA 4CZEA 3DXKA 3GDQA 2PBDA 3ZETB 4NO7A 1HKCA 3QBXA 5LJVA 3LM9A 4H0TB 3FLCO 1GLEG 1GLCG 2WUSA 4XH5A 1MDUB 3TPQA 2VYPA 3MCPA 1D4XA 5CE3A 4MLHA 1NGBA 1XC3A 3IDHA 1C0FA 2F9WA 3U8XA 2IIRA 3ZX3A 1MWMA 1NMDA 3AAQA 4BRGA 1HX1A 4PKGA 3AARA 4M63C 1NGIA 4BRDA 4FPBA 4DQ8A 1U2VB 1JCFA 5KQ8A 1DKGD 4A2BA 4B1YB 1HKBA 4BRFA 3A0IX 3H1VX 3OHRA 2GTDA 3G25A 4ISEA 1QQOA 4CZLA 3ZETA 3TU5A 4PL7A 3SLCA 3FZFA 5JMVA 2EWSA 3QB0A 4RCHA 1JCEA 1X9JA 2CGJA 2QW9A 3AAPA 3UB5A 2I7PA 2YHYA 3VEOA 4BRAA 1TUYA 4BG8A 1GLAG 4M7XA 2QWMA 5BN9A 2UYTA 3VENA 4BQZA 3W0LA 1U2VA 3KHYA 5BRHA 3ZEUB 5AQRA 2FSJA 1C0GA 4BG9A 1NLVA 5BPNA 3CJCA 2OANA 3LDOA 1SZ2A 5FPMA 3EO3A 1KAZA 1K8KB 4DB3A 2A5XA 2FSKA 2V51B 2KHOA 3A5NC 4H5WA 2FXUA 4PKHA 4FWLA 4B1UB 3CJ1A 3GL1A 1NGEA 2ASPA 3FR0A 3ATVA 1S22A 3FZMA 3U4LA 4B1ZA 3F9MA 4I6MB 2P9UB 2HF4A 3ZEUA 2V7ZA 3I33A 3JS6A 4FWRA 4JNEA 4H0YB 1TUUA 4BR4A 1QQMA 3JXUA 4H0PA 1K8KA 5ADXA 2P9KB 3M6GA 5EY4A 4MO5A 1RDWX 2YHXA 3WXJA 4CD3A 5AQUA 1V4SA 1ATRA 2P9NB 2QWOA 3IFRA 4AM6A 4PL8A 4FWMA 3ID8A 3MN7A 5AR0A 5AQVA 4NB4A 3LDNA 3SK3A 4Z94A 3GE1A 1OKJA 1WUAA 3UKUB 1GLJO 5BN8A 1S3XA 4I6MA 3EN9A 5AQFA 4B1XB 4BRMA 1HLUA 2FF6A 2P9UA 4BQLA 2HOEA 4EFHA 3U9ZA 3VEZA 3VF4A 3FZKA 1BUPA 1NM1A 4FWPA 3VGMA 3CQYA 3VESA 4BC4A 1NGGA 4IJAA 5KPTA 2P9KA 4O5FA 1LOTB 2Q31A 2D4WA 1NGFA 1NWKA 5BPLA 4BR5A 4B1VA 1GLBG 1WOQA 2CGKA 2P9NA 2YJFA 1ESVA 1E4GT 4FOEA 5JLFA 4HWIA 4BVOA 4CZIA 4LC9B 4QS7A 3UKUA 3EZWA 3LDLA 4YDUC 1BDGA 2NZTA 1HUXA 4WQ4C 5KQDA 2QWPA 1SQKA 3A5MC 4EHTA 3C0BA 3L6QA 5AQPA 1GLFO 1RFQA 4XH4A 1YVNA 3WXLA 3LL3A 3EKSA 4EIAA 4BGBA 4CD1A 4CI6A 2Q36A 4XH1A 3QICA 3ZX2A 1ZBSA 5BR9A 3MDQA 4FWOA 4A62A 5AQIA 4QS8A 1HKGA 4CZMA 1H1VA 2Q0UA 3WXIA 3DAWA 2D1KA 3P4IA 4QS9A 2IVNA 2QWQA 3M3ZA 3VF2A 4BRPA 5EX5A 2E88A 1QHAA 3CI5A 3FFKB 4M7YA 1R59O 1V4TA 4FWNA 3VPZA 2QWNA 1RGIA 5EVZA 3UE5A 2GEMA 3SMPA 2PAVA 5AQLA 3O6WA 4ISFA 3GOIA 5FPNA 4XEIA 1T6CA 3ULEB 4MO4A 1X3MA 2W41A 1ZC6A 5AQGA 3H3OB 2GWKA 5AQYA 4BREA 4BR9A 1NGHA 5AQWA 3R6MA 4RWTA 1QQNA 3S41A 4CBWA 3SJHA 4C23A 2Q1NA 1KAYA 2J4RA 2A6AA 2QM1A 2I7NA 4FOIA 3ULEA 2ASOA 5E84A 4ISGA 4BRNA 3L4IA 2A41A 3H45C 3VOVA 2QWLA 3IUCA 4YDUA 4WQ4A 3IMXA 4E1JA 3MK6A 2HMPA 5AQOA 5E26A 3LM2A 4FWSA 3ATUA 1J6ZA 4CJ7A 2D0OA 1BWFO 3W3DA 1CZAN 5AQJA 1SAZA 4HTLA 4FWQA 4WQ5C 1T44A 5EOYA 3O5BA 2BTFA 3QBWA 2IVOA 4PKIA 5FPEA 3B8AX 4KBOA 3WQTA 3HSCA 5AQKA 2E1YA 3M1FA 5B8HA 3CETA 3WEEB 1DEJA 1ZXOA 4BR7A 4JHDB 4CZFA 1NGJA 5BREA 4IO8A 3ENHA 3O8MA 1GLDG 1T6DA 4MLEA 3VGLA 4H5VA 3MN5A 3UKRB 3GG4A 5AFUH 3CJ9A 3MN9A 2D0PA 4GNIA 2GELA 1KAXA 1EQYA 2W40A 3CIPA 3D2FB 2NRHA 4BR2A 3ZX0A 1Z05A 3BF1A 2FLOA 3BF3A 4H0OA 2CH6A 5BRFA 3VEVA 2QWRA 3WEEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI0K 4FPAA 3NF6A 1NBWA 2QI2A 4BRQA 5F2RA 4M3WA 1T05A 1VQ5N 4BACA 4CEAA 4CJ5A 4ZTJA 1P8ZA 1WAJA 1KQSM 3C6UA 3BUZB 1E3MA 4DUZK 3ZSOA 1M90O 3I8DA 3V1RA 2GV9A 3S9HA 4JN4A 3P38A 1GOBA 3ENOA 3CF5L 2G8FA 2KZZA 3QERA 2O8EB 1DTQA 4AM7A 3DRSA 2F4VK 4LF5K 2ZF5O 4BC5A 2CGLA 1B9DA 1GOAA 3HO1A 3R1XA 3U3GA 3K58A 5IWAK 3CFOA 3PSFA 1RT6A 1XMQK 1OVYA 1DGKN 3VQCA 1HJRA 1WLJA 1BIUA 2P9SB 2O8EA 1HRHA 1HJOA 3OYNA 4CBXA 3T1HK 4PQUA 3CM6A 3OBWA 3HL8A 1ASWA 4AQYK 3CCVN 3CERA 2AJQA 1S1VA 5KGWA 1HNXK 4AHRA 3NGZA 4BWMA 1BG3A 2P9SA 5LY3A 4YOUA 3NAEA 4EZ9A 3LP1A 4CZGA 3CCSN 4KHPK 3K5OA 2P9IB 4YOTA 1BA1A 3KK3A 3VEYA 3AA5X 3C7NB 3O9SA 5BPMA 1EXQA 4IZ9A 5M1FA 1K9MO 1HR0K 4DSFA 4CHQA 4W5TA 2P9PB 2BDPA 3A8YA 4BC3A 4CHNA 4CEOA 4FL9A 4CEEA 4ILHA 1EWQA 3SAGA 3C6AA 3O4WA 1VRTA 1EO1A 4FLUA 3CCLN 4M3TA 3I8BA 1CXUA 2HHSA 2AP1A 1U6ZA 2P9IA 2VWKA 4NLCA 4B9VA 3O9TA 3E01A 3C7NA 2DPNA 2E8AA 2HVHA 1VSKA 3D45A 1VQ6N 2P9PA 3A5LC 3AGRA 1WBDA 4WYBA 5J2QA 1QVFM 1RDBA 3V9XA 4NXMK 3AVAA 2O8FB 2E2OA 4YOWA 4L3QA 3WQUA 4LF8K 1N32K 3J81O 4Q5VA 2PFUA 3Q7CA 4BR0A 2VWJA 5AQTA 1G15A 4BROA 4KTZA 3MN6A 3DXKB 5EXWA 4H0VB 4DWIA 1EX4A 2E20A 3P83D 4B3SK 2ZGYA 3KD1E 3VEXA 3HM8A 2UUAK 1YF5L 2FBVA 5I9EB 3WNGA 5HBMA 2O8FA 1QZ5A 3OYFA 2ITMA 4CJWA 2HF3A 3KK7A 3WNEA 2D0BA 5AQXA 1C0TA 2UUBK 1OH7A 3DXKA 1BGXT 4DTJA 3LM9A 4B3OA 1D4XA 5CE3A 5DK5A 4MLHA 1NGBA 5CYMA 3U8XA 5E41A 3S3OA 1S6PA 3OYMA 1HX1A 4M63C 4BRDA 1LV5A 4B1YB 2G8KA 2GTDA 2F96A 3DOKA 4FJNA 1JXBA 4CZLA 3DYAA 1RBRA 4RCHA 4LD0A 1RILA 3AAPA 2I7PA 2YHYA 3AO1A 1TUYA 3HP6A 4BG8A 1GLAG 3T1AA 3J80O 1LW0A 3KLHA 2UYTA 1KSPA 4DV1K 3W0LA 4DR1K 4BDYA 2XHBA 4DU4A 5BPNA 2YNGA 3LDOA 2BANA 5EU7A 4DV6K 2A5XA 2FSKA 3DRRA 2V51B 4LY7A 2KHOA 2FXUA 3RVCA 1QS4A 4NYNA 1TK0A 3CJ1A 3ATVA 3FZMA 3EY1A 3SUOA 4FLWA 4B1ZA 3F9MA 4ZHRA 2VGNA 4Y1CA 4BR4A 1QQMA 4DTPA 3JXUA 5ADXA 2P9KB 4IDHA 4CGGA 1JLQA 3SBGA 3QEXA 1MU2A 4CD3A 1U49A 2P9NB 2QWOA 4LH5A 5C42A 4B3RK 4OPAA 5CR4A 3CMAN 3V9SA 2QXFA 2IC3A 5BN8A 5AQFA 4BRMA 3EN9A 4B1XB 1SKRA 4WFAL 3VF4A 1NM1A 2ZM6K 4FWPA 4TSXA 1Y97A 3Q7BA 3CQYA 1ILYA 4BC4A 2P9KA 3V9ZA 1K8AO 1RDUA 4CFCA 2UUCK 4B1VA 5JS1A 5MLCQ 4FLYA 3JSMA 4IFVA 1VK0A 2DTUA 4DU3A 2P9NA 5JVHL 3N4PA 1RT2A 4E1NA 2ZE2A 4QS7A 1D5AA 3O3HA 3LDLA 4QCLA 5KQDA 4EHTA 1C1BA 3C0BA 3VQQA 2E5LK 2Z1IA 2QEXN 4KHSA 4M45A 2NRRA 2G8UA 3EKSA 4BGBA 4HCCA 1SS6A 3QICA 4OLBA 2HBMA 3SQ1A 4A62A 3CCMN 3SV4A 5AQIA 3KTQA 1IBMK 3ID6A 2Q0UA 3WXIA 1WNSA 3DLRA 3M3ZA 4BRPA 2XRIA 3VF2A 1V4TA 4J2AA 1VQLN 4ELTA 4I7FA 4CJTA 4FLVA 3UE5A 4KHNA 3D6RA 4JKDA 1BQMA 4ILGB 3ISNC 5HRNA 5HROA 1RTIA 4JKGB 5AQGA 4CJRA 3H3OB 1NK5A 3MXIA 2F8SA 2GWKA 4W5QA 1YJ9N 4JK7A 4BREA 4NXNK 1NGHA 1RBUA 2IS3A 4E7JA 1Q7YO 1W97L 2OCEA 5C12A 1QQNA 1B92A 4CBWA 3CCEN 4E89A 1RT4A 2HHUA 4X66K 1YHQN 1TKXA 2WOMA 1OH5A 2Y1JA 1N34K 2NRXA 1IKVA 4JI5K 3VOVA 3CPWM 1ZBFA 4CJQA 4KI4A 3VQDA 4JKGA 3IUCA 4B08A 1QHTA 2ZJRL 2X78A 4OPJA 3ULDA 1FK9A 3LM2A 4CW7B 3WNFA 4G9ZA 2D0OA 1BWFO 4GVEA 5BR8K 3SJJA 2KTQA 4HTLA 4WQ5C 1T44A 1S1WA 3O5BA 2YV0X 2IVOA 4HCBA 3V1QA 3B8AX 4KBOA 1I94K 3J7AP 3OYCA 2PYLA 4C8OA 1DLOA 3CETA 4JKCA 4JHDB 3E9PA 1NGJA 2HBKA 3P1GA 3O8MA 4DS5A 3ZYYX 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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