3DJCA

Crystal structure of pantothenate kinase from legionella pneumophila
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
LILCIDVGNSHIYGGVFDGDEIKLRFRHTSKVSTSDELGIFLKSVLRENNCSPETIRKIAICSVVPQVDYSLRSACVKYFSIDPFLLQAGVKTGLNIKYRNPVEVGADRIANAIAATHSFPNQNIIVIDFGTATTFCAISHKKAYLGGAILPGLRLSADALSKNTAKLPSVEIIKTESVVGRSTIESIQSGVYYGVLGACKELIQRIHHEAFNGDQILILATGGFASLFDKQGLYDHLVPDLVLQGIRLAAMMNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Pantothenate Kinase from Legionella Pneumophila
rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2008-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3djcA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3djcA01
2E88A 5AQOA 5KQ8A 4B1ZA 1DEJA 4K41A 4BRLA 2IVOA 5JMVA 1QZ6A 4Y0WA 2E2PA 3CHWA 4IO8A 3IFRA 5F2RA 4CZFA 3FE1A 4WQ5A 1V4SA 1E4GT 3SMPA 4A2AA 2HF3A 1GLJO 3CJ7A 4H0OA 4JD2B 4CD3A 3QMLA 1U6ZA 3A8YA 2W40A 4CZIA 4WYBA 4PL7A 3WUHA 5ADXA 4BRKA 3HZ6A 2V7YA 4B1WB 3RSEB 3D2EB 3WQTA 2A42A 3ZETA 1GLDG 3IMXA 5AFUA 2E2NA 3M3ZA 2V52B 5AQUA 5AQGA 5BRDA 3ATUA 2FF6A 2Q0UA 1NGCA 2J4RA 2IIRA 4JHDB 4BRMA 3QB0A 3WXLA 3EKSA 4BG8A 3U9ZA 1U2VB 5AQMA 4BRPA 3VEWA 5JLFA 2WUSA 3VENA 4BRAA 3L4IA 4BREA 4RWTA 3CERA 4AM6A 2E20A 2ASOA 4H5NA 5BN9A 1BG3A 2GEMA 2IVPA 3DJCA 4BRFA 3AY9A 3W3DA 2P9PB 3QICA 2BTFA 1RDWX 3WXIA 1YAGA 4YDUA 3CJ9A 2FSKA 2P9LA 2F9TA 4BRNA 3ULEB 1WOQA 1XQSC 4BRDA 2CGJA 1NGIA 1HKCA 4CZLA 3H46O 3GOIA 4FWRA 2ITMA 3LM2A 4I6MB 2CGLA 1YXQA 4H0PA 3GE1A 2P9SA 1KAYA 5JLHA 3LDOA 3MCPA 4MO4A 3UKUA 3ID8A 3DXMB 2QWPA 4M63C 3VERA 2P9KB 4L3QA 2A5XA 4BROA 3CJBA 4BG9A 5AZIA 4K25A 1DKGD 5BREA 3QFPA 3VGLA 3UKRB 2YJFA 5BPNA 2Q0RA 2OANA 1BDGA 1BWFO 4DQ8A 1NM1A 2P9IA 3HSCA 3SLCA 2Q97A 4PL8A 1MA9B 2NLXA 3GL1A 2P9NA 4FL9A 1NLVA 5AQFA 3H1QA 4CI6A 1Q18A 4PKHA 5AQQA 4BQZA 4XEIA 5CE3A 1ATSA 5FPMA 3O6WA 1QQOA 2EWSA 3LDNA 1TYQA 4CJ7A 3M1FA 1P8ZA 5BRFA 3EO3A 2IVNA 3KHYA 3VOVA 4DB3A 1QZ5A 4J8FA 4FWNA 5KPZA 4EFHA 2E1ZA 3FLCO 4HWIA 2P9UA 3MN9A 2ZWHA 3R9PA 5AQLA 4FPBA 5KPRA 2ASMA 4E1JA 2D0PA 2ZF5O 3DXKA 3FZMA 3VEZA 3MMVA 3CI5A 4A2BA 1QQMA 4BRGA 1BU6O 4H0YB 1Y64A 1HPMA 5AQRA 5TKYA 2PAVA 4H03B 3FZKA 3BP8A 4FWSA 3AARA 2DPNA 4CBUA 1IJJA 4H5RA 1T44A 4BC3A 1OKJA 1GLLO 3H1VX 3W0LA 3CIPA 4ISGA 4RCHA 5AQYA 4BRHA 3FFKB 2QW9A 3H6EA 4DCHA 4NO7A 1JCEA 2BUPA 3F9MA 3C7NB 3ZEUB 3VGMA 4MO5A 1HLUA 1KXPA 3O8MA 3KVGA 1NGFA 5FPDA 3H45C 4CZHA 1C0FA 1XC3A 5LJWA 5AZJB 2CH6A 5AQJA 3DWLA 3U8XA 4FOIA 4XH5A 3QBXA 1NGGA 2ZGZA 3C0BA 4BR9A 4FWOA 1KAXA 4CZJA 3HBTA 2UYTA 3LDQA 3D2FB 1J6ZA 1BO5O 1EQYA 4FSVA 1V4TA 1BUPA 1X9JA 3BEXA 2H3GX 4CBWA 3VETA 4KBOA 5AQHA 1NGEA 5I9EB 1ESVA 2V51B 1GLEG 4AM7A 2A40A 4IXCA 1GLBG 3ENOA 4BR5A 4BR2A 3WXJA 5F0XA 4WQ4A 1WUAA 3HTVA 4JAXA 3L6QA 4BGAA 1Z6RA 3A5NC 3QDKA 4XH1A 5AR0A 3I33A 5EOYA 2E1YA 1K8KA 2F9WA 2AP1A 4IJAA 4JNEA 2YJEA 4F9OA 4ISEA 4M7YA 3I8BA 2Q1NA 2VCPA 1NGHA 1YUWA 4WQ5C 1GLAG 5AQKA 2KHOA 3ZETB 1BA1A 3VF4A 4H0XB 3ENHA 1SAZA 4BGBA 4PKIA 2YI1A 2QWRA 5LY3A 4FO0A 3JS6A 3TPQA 4B9QA 3FZFA 3WEEA 4CZMA 3CJAA 3MN5A 3GG4A 2A3ZA 2Q2RA 1GLCG 2GUPA 3D7EO 4BC4A 5AQPA 1S22A 1TUUA 2E2OA 4XH4A 3U4LA 2E8AA 4CZEA 4O8KA 1JCFA 3SK3A 4CD1A 4JD2A 5FPNA 3IUCA 4QS9A 5AFUH 4H0VB 3VPZA 2HF4A 4B1UB 1NGDA 4B1YB 2VYPA 5EVZA 4BRCA 4HTLA 3RSEA 3D2EA 2P9LB 3H3OB 2E2QA 2GWJA 3BF1A 2GELA 3M6GA 3MN6A 4IWVA 2ZGYA 3TU5A 3A5OC 1T6DA 3AAQA 4QS8A 4FWLA 2HOEA 1LOTB 4JHDA 3SJHA 2W41A 2P9SB 1R59O 1U2VA 5KPTA 3UKUB 4K43A 5E26A 2D1KA 3R8EA 3O4WA 5ELZA 1XUPO 2QWLA 1NWKA 2A6AA 4BRIA 1H1VA 1NGAA 4LC9B 3ATVA 3LDLA 5AZIB 1HUXA 5F1XA 2FF3B 3VGKA 5B8HA 3VESA 1BOTO 2D4WA 5LJVA 5AQVA 2QWMA 3O08A 3A5LC 1HJOA 3O80A 3CJCA 2P9IB 3WT0A 1JCGA 2P9PA 4GY2B 3ZX3A 2P9NB 4CZKA 2D0OA 2NRHA 4H5WA 3FZHA 5AQZA 3EKUA 3ZX0A 3OHRA 2NZTA 1Z05A 3QFUA 3FGUA 3ULEA 1BA0A 5BPLA 2GWKA 2Q31A 1TYQB 3ZX2A 5BN8A 4GNIA 1D4XA 4I6MA 1ZXOA 4CBXA 1RFQA 1ATNA 4IZ9A 2I7PA 1GLFO 1NBWA 4O5FA 3WQUA 4DHYA 3DXMA 2P9UB 2I7NA 1RGIA 4BR7A 4EIAA 2FSJA 2P9KA 3VEVA 3R6MA 2AA4A 4C23A 2Q36A 3FZLA 2CH5A 3KZBA 3GBTA 3DXKB 1YVNA 3J8AA 3UKRA 4B1VA 5AQTA 1HX1A 2QWQA 4K42A 3MK6A 4NB4A 1X3NA 1S3XA 4A62A 3DAWA 4QS7A 2GTDA 3U9DA 3VEYA 1DGKN 4FWMA 3EL2A 1TUYA 3EZWA 3VEOA 5BRHA 3SMSA 3S41A 3WXKA 1CZAN 5BPMA 2YHXA 5AQWA 3LDPA 3JXUA 4EHUA 2YCHA 1SZ2A 4BR4A 4EAHD 1E4FT 3LM9A 5EY4A 3L0QA 4BR0A 2FXUA 4MLHA 3H3NO 3UB5A 3MN7A 2FLOA 5FPEA 3FR0A 4MLEA 1HKGA 1X3MA 4BC5A 3HM8A 1ZBSA 3MDQA 4M7XA 1IG8A 1KAZA 2ASPA 4H5VA 1SQKA 4FWQA 2YHWA 3LL3A 2YHYA 1QQNA 4FPAA 1MWKA 2QM1A 4A61A 4FWPA 4PKGA 2FSNA 4BVPA 3VEXA 4FOEA 4ISFA 5ADXH 4JN4A 5EX5A 1HKBA 1NGJA 3P4IA 5JICA 3A0IX 5BR9A 2VWBA 3O5BA 4EHTA 3AAPA 4RTFD 5AQIA 3VF6A 3CQYA 3C7NA 1NMDA 3ZEUA 3O1BA 2CGKA 4CZGA 3QBWA 3G25A 5EXWA 1K8KB 1ZC6A 5AQXA 3O1WA 4FWKA 2QWNA 3VF2A 3B8AX 2V7ZA 4YDUC 4IJNA 5AZJA 4WQ4C 4H5TA 2HMPA 3EN9A 3IDHA 4BQLA 3CQXA 5AQNA 4BRQA 3BUZB 1C0GA 3HI0A 3A5MC 2QWOA 4BVOA 5AQSA 5KQDA 3CETA 3CJ1A 1MWMA 1ATRA 3D2FA 1G99A 3GDQA 5E84A 4Z94A 2PBDA 3UE5A 3BF3A 2A41A 4H0TB 4BC2A 2QXLA 3WEEB 4B1XB 1MDUB 1NGBA 1LCUA 1T6CA 1QHAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DRSA 1QZ6A 3IFRA 4J2EA 1X1PA 3FE1A 3CD6N 2OPPA 1E4GT 5C15A 3QNOA 4F2RA 5I3UA 4JD2B 1VK0A 5HRRA 2ZM6K 3DLHA 3QMLA 4GW6A 3SJJA 3EYZA 5DK5A 1XNQK 2W40A 1WAFA 4WYBA 5ADXA 4FYDA 3WQTA 4DV7K 3U3YA 3TWHA 4A57A 1QHTA 4MDAA 1SL2A 5BRDA 3ATUA 2FF6A 2Q0UA 1NGCA 4JI3K 1WN7A 4R79A 3U3GA 4BG8A 4B9SA 1U2VB 1U48A 2O8FB 3OBYA 1IV0A 3C65A 2ZE2A 3L2QA 4QCLA 5JLFA 3KK3A 1U49A 3VENA 4YOXA 4KO0A 3L4IA 1BIZA 2IDOA 3M8PA 4AHCA 3V9ZA 3CERA 2YV0X 2GEMA 1YF5L 3K59A 4K8ZA 5J1EA 2WFBA 3VA0A 5HL7L 3WXIA 3CJ9A 4PA1A 4E3SA 3P5JA 2VQEK 4EP4A 3LAMA 3SUQA 1U4BA 1TK8A 1T03A 3AO3A 1KLNA 1WOQA 1XQSC 1VQKN 1IG9A 1HKCA 3HSTB 3ZT4A 3LM2A 1I94K 3O3HA 2CGLA 2P5GA 5JLHA 4MO4A 4A59A 2O8BB 3OYJA 3ID8A 2ZJQL 5K14A 3VERA 3JSMA 1NOYA 4L3QA 1OH5A 4BROA 3NF7A 4JI1K 4K25A 4CK2A 4KV8A 3QFPA 5JVGL 3SCXA 4CHOA 3THXB 3VN5A 1NM1A 4JK8A 3HSCA 2Q97A 1MA9B 3GL1A 2P9NA 1N5YA 2EX3A 3TSQA 1Q18A 4PKHA 5CE3A 1ATSA 1C1BA 3PV8A 1FJGK 1IKYA 3AA5X 3KJVA 1QQOA 3CCUN 4CEZA 1IBKK 3LDNA 1TYQA 5BRFA 3M1FA 1P8ZA 1YVUA 4ILHA 3NGZA 4DV3K 2KTQA 1QZ5A 1JL1A 4J8FA 4NLBA 5KPZA 4HUFA 5HROA 4Z0UA 1ASVA 3LWLA 3DXKA 4DF8A 3MMVA 1Q81O 4W5RA 1ZBUA 1QQMA 3CCMN 3TAEA 4BRGA 4WF9L 2E4LA 1BU6O 1HPMA 3I0SA 5AQRA 4FLXA 4Q0BA 3P31A 3OYGA 3BP8A 4FWSA 3AARA 2ETJA 3SPZA 4GKKK 3KLFA 1IJJA 1T44A 4BC3A 3HP6A 3QEVA 4ISGA 4RCHA 4BRHA 2F8SA 2PYJA 2BUPA 1L3TA 4OX9K 3AVLA 3C7NB 3VGMA 3O3GA 1HLUA 2DFHA 2PFUA 1QVGM 3H45C 4CZHA 3HVRA 4GMJB 2HVIA 1C0FA 1SS6A 5AZJB 2CH6A 5AQJA 3VQBA 1JLFA 3E9PA 1RNHA 1R0AA 4DQRA 4BR9A 5A2QO 3HBTA 3EE8A 4M42A 1UWBA 3S3OA 3THWA 1J6ZA 1BO5O 3D45A 1S1WA 1V4TA 4CJPA 4CJSA 1X9JA 1BI4B 3Q7BA 3L8BA 4PQUA 1EWQA 4DTUA 3SQ1A 3LDSA 3CC2N 3ZSYA 3J7AP 3VA3A 4AM7A 2OA8A 4JYAK 1KFDA 3MCAB 3WXJA 1XMQK 5F0XA 4WQ4A 3BY5A 1WUAA 1Z6RA 3A5NC 4CESA 5AR0A 1TGOA 1VQMN 2E6MA 4DSKA 2NRWA 5AJ3K 1WNSA 2EHGA 4LY7A 1Q8IA 1YUWA 5EU7A 1NJYA 1VSKA 3OS2A 1W7AA 2HHHK 2HHTA 4O55A 4BGBA 1JJ2M 5CYQA 1QSSA 1S5JA 2VGMA 3WEEA 4CZMA 2XY5A 3CJAA 3MN5A 4DR2K 2YNFA 4H4OA 4LF9K 1GLCG 2RKIA 3D7EO 4HUGA 4W5OA 5H1SQ 4OLBA 2KQ2A 4W5TA 1TUUA 1IH7A 2E2OA 3U4LA 4O8KA 1JCFA 4ZTFA 3DMJA 4DUYK 4CD1A 4RW9A 4QS9A 2HF4A 4ELTA 1NGDA 2NRZA 1K6YA 4FZZA 5EVZA 4HTLA 4DR4K 2P9LB 1JXEA 3O3FA 3ZT1A 3MN6A 3M6GA 2ZGYA 2R7YA 4L8RB 3AAQA 3OBWA 4Z4GA 4LD0A 2D0BA 4FJLA 1GOAA 4JHDA 2O8CA 2W41A 2P9SB 1R59O 4LF8K 4FZYA 3R8EA 3VQAA 3O4WA 4JKFA 1XUPO 2QWLA 3G0ZA 4DR1K 1CZBA 4IDHA 1NGAA 1HNWK 3ATVA 3LDLA 1J54A 1HUXA 2G8KA 1FXXA 5HOOA 3CFOA 2FF3B 3VGKA 4DV5K 3SQ2A 2VQFK 4PY5A 2QWMA 2ATQA 3MWTA 1HJOA 4EZ9A 2ZD1A 3QEWA 1JCGA 2P51A 4DSIA 1S1UA 3S3MA 3QFUA 3ULEA 1KQSM 1RTIA 4IEIA 3ZX2A 4WE1A 3WNHA 2A1RA 3K0SA 4GNIA 4JS4A 1SUQA 4RW6A 4IZ9A 1D9DA 1GLFO 1NBWA 3DXMA 4EIAA 3ZT2A 2P9KA 3R6MA 3KZBA 2O8EA 3UKRA 4YOVA 2QWQA 3MK6A 4U67L 1VQ5N 5CZ2A 1WBBA 4FLYA 2FC0A 1NJIO 1IKXA 1VHXA 4GV3A 2GTDA 4NCBA 3QESA 1YJ9N 1RT6A 1EETA 3U6FA 1NK0A 3TTFA 2BANA 5AQWA 3K9KA 1YTAA 4EHUA 4EP5A 4M3TA 1SZ2A 3JAMO 1Y97A 1DTQA 2OZSA 4M3XA 4MLHA 3MN7A 2FLOA 3RWUA 3AVFA 4IG3A 2YX6A 3NF8A 2FBYA 3ZSOA 1YT3A 3DRPA 4B9UA 4I9QA 3LP2A 1IG8A 3MEEA 2UUAK 3LL3A 2YHYA 1QQNA 1I3AA 3SAHA 1BQNA 2QM1A 3LWMA 4A61A 1NK6A 2FSNA 4BVPA 4ISFA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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