3DJCA

Crystal structure of pantothenate kinase from legionella pneumophila
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
LILCIDVGNSHIYGGVFDGDEIKLRFRHTSKVSTSDELGIFLKSVLRENNCSPETIRKIAICSVVPQVDYSLRSACVKYFSIDPFLLQAGVKTGLNIKYRNPVEVGADRIANAIAATHSFPNQNIIVIDFGTATTFCAISHKKAYLGGAILPGLRLSADALSKNTAKLPSVEIIKTESVVGRSTIESIQSGVYYGVLGACKELIQRIHHEAFNGDQILILATGGFASLFDKQGLYDHLVPDLVLQGIRLAAMMNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Pantothenate Kinase from Legionella Pneumophila
rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
molecule tags Transferase
source organism Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. philadelphia 1
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2008-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3djcA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3djcA01
4HTLA 2V7ZA 3G25A 4BRQA 2Q0RA 5AQNA 2UYTA 4JD2B 3H46O 4J8FA 2E2NA 1G99A 4O5FA 5KPRA 3R9PA 3WEEB 3D2FB 2BTFA 3WT0A 3VEZA 1U6ZA 1NGEA 3H6EA 2OANA 4BQLA 1DEJA 3A5LC 2BUPA 2W41A 3ZETB 1TUUA 5LJWA 1J6ZA 4NO7A 4FWMA 1YAGA 3GL1A 3GOIA 5AQJA 2ZWHA 3DXKA 3VGMA 3QFUA 3DJCA 3H3NO 3QBWA 1GLEG 1T44A 4B1XB 3QICA 1X3MA 2A41A 4BC4A 2VYPA 1V4TA 1GLBG 2PAVA 5KQDA 4BR2A 1Q18A 4O8KA 3A8YA 3C7NA 2H3GX 1LOTB 4BRKA 3D7EO 3DXMA 1ZBSA 4BVOA 2E88A 3HSCA 2Q31A 2PBDA 3O8MA 3W0LA 3WXKA 3CJBA 3VEYA 1BU6O 1IG8A 2P9KB 4XH4A 1GLFO 3H45C 3UE5A 4WYBA 3ZEUA 3ULEB 1NWKA 3L0QA 3HZ6A 3H3OB 3QBXA 4JN4A 5BPMA 4RWTA 5AQOA 3EKUA 2ZGYA 2IIRA 4BG9A 1BA0A 3SMSA 1YXQA 1QZ5A 4BC3A 4BVPA 3F9MA 3RSEA 5E26A 3A0IX 2P9PA 4CZLA 1Y64A 3LM9A 1U2VA 3VGLA 1HX1A 2ZF5O 1SZ2A 5BPLA 3AAQA 3ATUA 4PL8A 3ZX2A 3EZWA 3ZX3A 3FFKB 2IVPA 2HF4A 2QM1A 4WQ4C 2P9IA 2ASMA 4K42A 4BR5A 4WQ4A 1P8ZA 4CBUA 3D2EA 2YJEA 4FO0A 3H1QA 3LL3A 2YHYA 4MO5A 3O1WA 4H5NA 4B1UB 5EY4A 4H0TB 1RGIA 2GTDA 3FLCO 4I6MA 3EN9A 2Q1NA 2P9SA 4CD1A 2QWMA 4WQ5C 1KAYA 4H5WA 3O4WA 3S41A 4WQ5A 3CHWA 5AQLA 4FPBA 5AZJA 4GY2B 4FWRA 3SK3A 4BRPA 1XUPO 3O80A 4FWQA 3LDOA 4PKIA 3CJ7A 1ESVA 4BREA 2A5XA 2I7NA 1QQMA 2E1YA 3CQXA 4BRHA 1X3NA 4QS8A 4BR7A 5FPMA 5AQHA 3TU5A 1T6DA 3HI0A 5EXWA 2HF3A 3A5OC 5AQTA 1NGJA 2F9TA 4XEIA 3ENOA 2FSNA 1D4XA 4CBXA 2NRHA 2J4RA 3I8BA 4BRMA 2A40A 2V52B 5AQIA 1NLVA 4BQZA 5KPTA 1T6CA 1HUXA 1YUWA 3VOVA 2FSKA 2F9WA 1V4SA 3CJCA 1Z05A 3DXKB 3UB5A 5ADXA 2AA4A 4RTFD 1C0FA 3JXUA 3CQYA 4EAHD 1WUAA 4BRNA 3MN6A 2E2QA 5AQMA 2NLXA 4YDUC 4FWPA 5ADXH 1ZXOA 4H5VA 4IO8A 4YDUA 1S3XA 3L6QA 3C7NB 4ISFA 5E84A 5I9EB 3LDLA 4PL7A 4JHDA 3O08A 3DXMB 2I7PA 5AZIB 4CZKA 5TKYA 4CI6A 5BR9A 3MMVA 1NGCA 2Q2RA 5EVZA 3ZEUB 4JNEA 1K8KB 1NGBA 4L3QA 1YVNA 5B8HA 2CGLA 3UKRA 2FF6A 4H0VB 5AQXA 1NGHA 4F9OA 2FF3B 5AQZA 4A62A 3VESA 4FWKA 2HOEA 2P9LA 2E1ZA 1E4FT 1XC3A 2E8AA 3VEVA 2QWLA 2Q36A 3DWLA 4EIAA 2DPNA 4JD2A 3ENHA 3OHRA 1U2VB 3D2FA 1KAZA 1SQKA 3H1VX 4XH1A 1GLDG 3FGUA 3W3DA 4IJNA 4QS9A 3B8AX 3FZKA 2P9UB 4BR4A 4BRDA 5JLFA 4M7YA 2AP1A 1DKGD 3TPQA 1ATNA 2CGKA 3D2EB 3VERA 5BPNA 1TYQA 1RFQA 4BROA 3QMLA 3LDPA 4FOIA 1BOTO 4IXCA 5JMVA 4H0YB 4C23A 4I6MB 3QDKA 4A2AA 2QWPA 3UKUB 4PKHA 3HTVA 2V7YA 2E20A 2P9SB 4MO4A 4EHTA 2D0PA 4MLHA 5AQUA 5BN9A 5AQSA 1S22A 5AZJB 4DB3A 1H1VA 1BDGA 4FWNA 4A61A 4DCHA 4FSVA 4BR0A 3FR0A 2V51B 1BWFO 4A2BA 1ATSA 3MN7A 3U8XA 2QWOA 2E2PA 3ZX0A 2YHWA 2ZGZA 4QS7A 1OKJA 4M7XA 4FL9A 4CZFA 3IFRA 4IJAA 1EQYA 2ASOA 3VPZA 5AFUA 3BEXA 1ATRA 2CH6A 5AQYA 2E2OA 4AM7A 4FWOA 2HMPA 3FZMA 1JCEA 4EHUA 4BC2A 3CJ1A 3CETA 3EKSA 3HBTA 5AFUH 5JICA 1NGIA 1MA9B 2A6AA 1NGDA 3CIPA 4B1WB 4CZJA 5FPEA 4FOEA 3EL2A 2A3ZA 2YCHA 2YHXA 4BGAA 3GDQA 4KBOA 3KHYA 5FPDA 4ISGA 4CZGA 5KQ8A 1BA1A 1LCUA 4CZIA 1HKCA 3MDQA 1IJJA 3MCPA 5AQFA 4H0PA 3VGKA 4B1YB 3VF6A 3U9ZA 3LDQA 2QWQA 3IMXA 3L4IA 5AQRA 5AQGA 4IZ9A 2FXUA 1TUYA 2IVNA 4JHDB 1KXPA 4K41A 3VEXA 1Z6RA 3C0BA 4JAXA 2D4WA 4GNIA 4Y0WA 1NBWA 1GLLO 2W40A 3A5NC 4CBWA 3UKRB 3CJ9A 1DGKN 5F0XA 2EWSA 1MDUB 2YI1A 4BGBA 4BRIA 3LDNA 2FLOA 4DHYA 5AQKA 5AR0A 3SJHA 1QZ6A 5LJVA 4CD3A 1HKGA 3VF4A 5F1XA 3DAWA 3J8AA 1BUPA 4H0OA 4HWIA 2IVOA 3WXLA 2QW9A 3O1BA 2A42A 2KHOA 4AM6A 3U4LA 2P9NA 3R6MA 2NZTA 3U9DA 3WUHA 1KAXA 4K43A 3RSEB 1TYQB 2P9PB 1ZC6A 2ASPA 3VENA 1HKBA 3EO3A 5FPNA 4RCHA 3ATVA 2D1KA 3SLCA 1QQNA 3CI5A 3BF1A 2D0OA 1RDWX 2QXLA 3WEEA 5BRDA 4CZHA 3IDHA 3GG4A 2VWBA 5CE3A 2QWRA 2GWJA 2P9IB 3ZETA 2CH5A 1CZAN 4NB4A 4B1VA 1NGGA 1E4GT 3WQUA 1GLJO 3AY9A 5F2RA 5AZIA 1NM1A 1HJOA 4BRGA 4BR9A 4BRAA 2Q0UA 1R59O 4H03B 1MWMA 5BN8A 1C0GA 2FSJA 4MLEA 3FE1A 1K8KA 3O5BA 4LC9B 3MK6A 3ID8A 3M1FA 3LM2A 3KZBA 3WQTA 4BRLA 5AQVA 3KVGA 3MN9A 5JLHA 4EFHA 1GLCG 4FWSA 3AARA 1XQSC 2VCPA 3VETA 5EX5A 1JCFA 4IWVA 4B9QA 4CJ7A 1QHAA 3QB0A 2P9KA 3HM8A 4ISEA 4Z94A 3FZLA 1JCGA 5AQWA 3GE1A 3P4IA 3ULEA 2P9UA 1BG3A 4CZMA 2WUSA 4BRFA 2GEMA 3BP8A 2GWKA 2YJFA 4CZEA 5AQPA 5EOYA 1X9JA 3CERA 1NGAA 3M3ZA 1BO5O 3VEWA 4BC5A 3UKUA 3AAPA 3SMPA 1SAZA 5BREA 3I33A 4H5RA 3JS6A 3GBTA 1QQOA 2QWNA 5BRFA 3BF3A 3FZFA 4E1JA 1NMDA 1HLUA 1WOQA 5ELZA 4FWLA 4BG8A 3R8EA 3CJAA 4FPAA 1HPMA 3WXJA 3WXIA 3QFPA 3M6GA 5AQQA 2ITMA 4BRCA 1MWKA 5BRHA 5LY3A 3MN5A 3O6WA 3FZHA 4H0XB 2GUPA 5KPZA 2Q97A 3IUCA 4PKGA 2GELA 1NGFA 3VEOA 4M63C 4XH5A 3VF2A 2CGJA 3BUZB 2P9NB 4B1ZA 4DQ8A 1GLAG 2P9LB 4K25A 3A5MC 4H5TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KV8A 3OYEA 3NGIA 1F21A 4CF9A 2E2NA 1G99A 3KWIA 2HHVA 1TGOA 5MLCQ 1U6ZA 2OANA 4AQYK 3C6TA 3TSUA 1DEJA 2W41A 1HNZK 4DG1A 5LJWA 1J6ZA 4NO7A 4RW8A 1X1PA 1IV0A 1KFDA 3VGMA 3QFUA 4PQUA 2VGNA 2G8WA 3QBWA 1GLEG 1T44A 4B1XB 4CFDA 4E7LA 3CFPA 4DTUA 2A41A 1BGXT 4LF9K 4W5TA 1V4TA 1RDAA 4LFBK 1J5EK 3CFRA 4CERA 4CJ5A 4DTPA 3AGKA 3D7EO 3DXMA 3HSCA 4V19S 3O8MA 2A1RA 4KHUA 3VEYA 1ZYQA 4RW4A 1GLFO 3VTIA 4WYBA 4CHYA 1GOBA 3THVA 1NWKA 3HZ6A 3QBXA 4JN4A 4N5SA 3KJVA 4CF0A 2ZGYA 3AV9A 4BVPA 3CQ8A 3OVNA 2P9PA 4LH5A 4DQRA 4CZLA 1U2VA 3VGLA 1Q81O 4JI2K 3AAQA 1N36K 4CE9A 4IEEA 1Q8IA 3ZX3A 3FFKB 5CR4A 2QM1A 4KPYA 2P9IA 1VQ5N 3WXMB 3MEGA 4JKFA 3J7YP 3CMEN 3D2EA 3C6UA 3H1QA 4MO5A 3O1WA 1HNIA 4DV7K 4DTXA 3AGRA 4B1UB 2RPIA 5EY4A 1RGIA 1G15A 4I6MA 4CK1A 4DSKA 3R1XA 2RKIA 3PSFA 4YOVA 4HUGA 4JYAK 4QAGA 2R7YA 1WSFA 5HOOA 4JRPA 3S41A 1IBKK 4CJ4A 3CHWA 4JKCA 5AQLA 5AZJA 4GY2B 3OYCA 4CGIA 3G10A 1M1KO 3PIOL 4FWQA 4Z4HA 3LPTA 3PSIA 4JK9A 1ESVA 4KTWA 1BI4A 4B3RK 1K6YA 1YF5L 1LV5A 1S6PA 1VQ8N 5EXWA 2F9TA 2HNDA 4XEIA 1EETA 2FSNA 3SUPA 4A5BA 1W97L 1L3TA 4BRMA 2A40A 3F9KA 4G9ZA 5AQIA 1NLVA 5KPTA 1T6CA 1YUWA 3RVCA 3VOVA 1BCMA 2F9WA 3L4QA 4KHNA 1CZBA 1Z05A 3UB5A 5ADXA 3VA0A 3M8QA 3OYFA 1C0FA 3JXUA 1UAXA 4YDUC 1ZXOA 1TAQA 4B9LA 4H5VA 1R0AA 4X62K 4YDUA 3L6QA 3C7NB 3LDLA 3V9XA 1O1WA 2Z1IA 4GMJB 4OX9K 5BR8K 4OKKA 4GW6A 4CGJA 3MMVA 1NGCA 4E89A 5EVZA 4Z4IA 1RT1A 4YOYA 4F9OA 3AO1A 5AQZA 3AVHA 4FWKA 4DV0K 4W5RA 2OPQA 1E4FT 3VQAA 3SUOA 4OKJA 2Q36A 3UIQA 4YNQA 2DPNA 3OHRA 1HPZA 2VG5A 1L5UA 4X66K 3H1VX 3K9JA 3FGUA 3W3DA 3B8AX 3FZKA 2XY7A 4BR4A 3L3VA 2QKBA 3TTDA 1TV6A 2G8HA 3TPQA 1ATNA 4M3WA 4CJEA 1T03A 4ELVA 4FLWA 4CGGA 2W6KA 4IXCA 4H0YB 4YOXA 1IKWA 3QDKA 2QWPA 3HTVA 2O8FA 3ZSYA 5H1SQ 4EHTA 4M3RA 4CEOA 2D0PA 4MLHA 5BN9A 4H8KA 1S22A 1BDGA 3C6HA 1RTDA 3AVFA 4PHTX 1XC9A 3TAMA 3WNGA 3TABA 3ZCMA 1JLAA 3AO2A 3IAYA 4PY5A 2E2PA 2E6MA 4QS7A 1JLGA 4M7XA 4YOUA 4DFMA 2ASOA 4KKOA 4AM7A 4FWOA 2HMPA 4BE0A 3FZMA 1WSHA 1JCEA 5IT9O 3V81A 4EHUA 4DUZK 3SI6A 3CJ1A 3EKSA 5JICA 1RT3A 1MA9B 3O9RA 1C1CA 1NGDA 3CIPA 1VQ6N 2ATQA 4CZJA 4JI3K 3EL2A 1XHXA 2YCHA 3GDQA 2KTQA 3KHYA 1NJXA 1BA1A 2YNIA 1RBVA 1OH5A 2P5GA 2Z1HA 1IJJA 3MCPA 1NG9A 4H0PA 3VGKA 3U9ZA 4JKHA 3AVBA 2OPSA 3HPHA 2IVNA 2HNYA 1KXPA 4WCEL 1VRTA 3CFOA 1Z6RA 2GX9A 5C12A 2UUBK 4JAXA 4CJRA 3CC4N 4GNIA 3SAGA 1HYSA 1GLLO 4DR7K 3KLEA 3V9UA 1S1WA 4JKBA 3NHGA 2FBVA 2YI1A 1MDUB 3L2QA 4CFBA 1UWBA 4I9LA 4C8NA 4DV2K 4Y1DA 4DLGA 3HT3A 4DQIA 3KTQA 3DAWA 2PY5A 1YJNN 4DQSA 4JKGA 1FW6A 2A42A 2KHOA 1LWFA 2FBYA 4CK2A 4DTSA 4CIEA 1JLEA 3AVMA 3R6MA 3U9DA 1HNXK 4IDHA 4N56A 2ASPA 2G8VA 1VSDA 3NF9A 4RCHA 3CI5A 3WEEA 1RDWX 2QXLA 1W0HA 1LAWA 3IDHA 3TTFA 5CE3A 3DRSA 2GWJA 4CGDA 2CH5A 2VG6A 3PY8A 2NRVA 4M3UA 2JLEA 1NK5A 4B1VA 3KD5E 1GLJO 1JL2A 4OLAA 5AZIA 2KLAA 4H03B 3U3YA 1BQNA 3AA4A 2YHBA 3DOKA 3MXMA 3O5BA 3P5JA 3OS2A 4LC9B 2NRWA 3MK6A 1NKBA 2W42A 1J54A 2E4LA 4C1NK 3KZBA 4BRLA 3VQPA 3DMJA 3KVGA 1WBDA 4IEIA 4EFHA 4DFJA 1GLCG 4FWSA 2HBKA 4RW9A 3SV3A 3RMCA 3RR7A 4W5NA 5EX5A 1JCFA 2OTJN 1Q7YO 1XI1A 4J2AA 3HM8A 3FZLA 2ZM6K 1SKSA 1K8AO 2P9UA 1BG3A 5J1EA 1IG9A 1I3AA 1JL1A 4QCLA 1C0TA 1BHLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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