3EZWA

Crystal structure of a hyperactive escherichia coli glycerol kinase mutant gly230 --> asp obtained using microfluidic crystallization devices
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
KKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIDGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEHD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of a hyperactive Escherichia coli glycerol kinase mutant Gly230 --> Asp obtained using microfluidic crystallization devices.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glycerol kinase
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
total genus 196
structure length 498
sequence length 498
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ezwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ezwA01
1C0FA 4H5RA 1EQYA 2P9LA 4MLEA 5AQNA 3VGMA 5KQ8A 1QHAA 3QICA 4H03B 1H1VA 3U9ZA 3SLCA 4BQZA 4H5NA 3FLCO 2E2NA 2HMPA 3HI0A 4WQ4A 4M63C 2YHWA 4BRPA 1X9JA 5AQHA 2D4WA 3H3NO 3HZ6A 1NGJA 3IMXA 4QS7A 4DQ8A 2VYPA 5AZIA 3FE1A 3WXIA 2I7PA 4EHTA 1K8KA 2A3ZA 1KAXA 1NM1A 3LM9A 4CBXA 5AQKA 3P4IA 3MN9A 4BQLA 2YHYA 3CQXA 3U8XA 4H5TA 3SMPA 2P9KB 3HBTA 3B8AX 4HTLA 5AQPA 2ASMA 2E1ZA 4CZFA 1ZBSA 3O8MA 5AQJA 4CZMA 1C0GA 4BC4A 4M7XA 4IO8A 1D4XA 4BG9A 5F0XA 3DWLA 1NWKA 2NRHA 4MO5A 3WEEA 2YHXA 3J8AA 3H1VX 3O4WA 4PKIA 4H0YB 3VEVA 5AQGA 5LY3A 2P9UB 4IZ9A 2GELA 4WQ4C 4CZIA 1KAZA 2QWNA 2OANA 2QW9A 2ZWHA 4B9QA 5FPEA 1MWMA 5AQFA 2HOEA 2Q0UA 2AP1A 1RFQA 2A40A 1HUXA 1U2VB 5AQRA 3CJAA 3WT0A 1E4GT 1MDUB 1XC3A 3DXMB 5AR0A 3IUCA 1J6ZA 1GLEG 3KVGA 3UKRA 3H1QA 2VWBA 3RSEA 4HWIA 3AARA 1ATNA 3VENA 1Z6RA 4BC3A 4XH5A 1T6DA 3A5NC 3FGUA 4FWKA 4JHDA 1NGCA 4IWVA 4PL7A 3BF1A 4PL8A 4BR4A 4FWMA 5BRHA 4EIAA 4JD2A 3GOIA 4BG8A 4FWLA 4CZGA 2GEMA 3UB5A 2Q97A 1V4SA 4BGBA 3TU5A 4I6MB 2AA4A 5JICA 2HF4A 4B1UB 2E2PA 3ZETA 1KXPA 1S22A 3ENHA 5AQQA 1BWFO 1BA1A 3AY9A 1ATRA 2FSJA 1E4FT 3D2EB 5TKYA 5E84A 4BRCA 1ZXOA 2D0PA 4B1YB 4M7YA 3ATVA 3C7NA 1WOQA 2I7NA 1BA0A 1ATSA 1RDWX 1RGIA 1QQOA 4FOIA 2Q36A 2D1KA 2P9PB 1NLVA 3LM2A 3O6WA 4CZEA 4ISEA 3F9MA 3TPQA 3H46O 4L3QA 2Q1NA 3ZX3A 2P9LB 4B1WB 5AZJA 2CH5A 4GY2B 1ESVA 2GWKA 3I33A 1GLFO 5BPLA 5AQMA 4FO0A 2CH6A 1TUYA 5JLHA 5AQVA 4ISFA 1R59O 3AAPA 4XH4A 1YVNA 3GG4A 2P9IA 1U6ZA 1G99A 4FWQA 3GDQA 4B1XB 3WQUA 1XUPO 3CETA 2A42A 4QS8A 3EO3A 4BRNA 1Z05A 4AM6A 3L4IA 2FXUA 4FWNA 5ADXA 5BPNA 2WUSA 4BRHA 3LDLA 4PKHA 2KHOA 3UE5A 1NGGA 1V4TA 4BRIA 4WQ5C 3MCPA 1LOTB 1NGIA 3CERA 1NGEA 3ULEB 2ITMA 3VETA 5AFUH 3A5OC 3VESA 2PAVA 1X3MA 1BO5O 2QM1A 3MMVA 3WEEB 2BUPA 2IVNA 3R8EA 2QWRA 4CBWA 2QWQA 4IJAA 3FZLA 3VGKA 2V7YA 2A41A 4FPAA 4RTFD 5EY4A 5EXWA 4BRQA 4A2BA 5I9EB 3S41A 3IDHA 3A8YA 1HKBA 3DXKA 4O8KA 5AQSA 3FZHA 5KPZA 4Z94A 5BPMA 3BF3A 4CI6A 1BOTO 3CJ9A 3QB0A 2FSKA 3IFRA 4FWPA 5EX5A 2YJFA 5FPMA 3ZEUB 4H0TB 4A61A 2CGJA 5ELZA 4BRAA 1T44A 1GLAG 3EKUA 1YAGA 1SQKA 2FF6A 4BRLA 4B1VA 4E1JA 1T6CA 3GL1A 3VOVA 4JD2B 3O5BA 4H0XB 4BRKA 5AFUA 1Y64A 3VEYA 3ID8A 2QWPA 4H0VB 3O1WA 2F9WA 2ZGYA 4XH1A 3CI5A 3JXUA 4RWTA 1GLBG 5BRDA 5JLFA 3FZKA 3VPZA 3WQTA 2A5XA 5EOYA 3VF4A 1GLJO 5AQTA 4BR0A 2P9KA 1HPMA 3WXLA 3CHWA 1X3NA 2E2QA 3MN6A 3ZX0A 3SK3A 4H5VA 3C7NB 3HTVA 4C23A 3D2FA 2IVOA 3SMSA 1BG3A 3CJBA 1JCEA 2VCPA 3L6QA 5KQDA 4FWSA 1NGHA 2P9NA 3HSCA 3UKUA 1QQNA 2P9UA 3MK6A 4H0OA 5AQOA 4B1ZA 3MN5A 5AQYA 4BR7A 3JS6A 5AQWA 4GNIA 5JMVA 3WUHA 3GBTA 3SJHA 3HM8A 3U4LA 2QWLA 3VEWA 4QS9A 3DXMA 3VEXA 2P9IB 1BU6O 4WQ5A 1NBWA 2HF3A 4K25A 3VERA 2Q31A 4JNEA 3DJCA 4ISGA 4NO7A 4CJ7A 2D0OA 3CQYA 3KHYA 4BR9A 4A2AA 4MLHA 2V51B 3ZX2A 3EZWA 4CD3A 4FWOA 2ZF5O 4MO4A 3C0BA 1YUWA 3CJ1A 5AQUA 5AZIB 4A62A 3ENOA 1K8KB 4H5WA 2IVPA 3A0IX 5F2RA 4BVOA 3D2EA 1XQSC 1SAZA 4WYBA 2FF3B 3AAQA 3FZFA 4CD1A 4DB3A 3FR0A 2W40A 2P9SA 4CBUA 4XEIA 4BVPA 2GUPA 4BR2A 3QFPA 2YJEA 3H45C 3ATUA 3CJ7A 1IG8A 1DKGD 3QMLA 1TYQA 2J4RA 1QQMA 2YCHA 3BP8A 4LC9B 3W0LA 3LDQA 5E26A 4BRDA 3LDPA 3LL3A 2H3GX 4BC5A 4JN4A 1HJOA 3M1FA 1MWKA 2ASOA 4K42A 1LCUA 4CZHA 3O08A 4BROA 2NLXA 2Q0RA 3M3ZA 4EHUA 1ZC6A 2IIRA 3G25A 3WXKA 4K43A 3BEXA 1YXQA 3VF6A 3QBWA 2EWSA 2W41A 3UKRB 4EFHA 2FSNA 3RSEB 1HX1A 2NZTA 2E1YA 4JAXA 2PBDA 2FLOA 3LDNA 3L0QA 1Q18A 3H6EA 4YDUA 3A5MC 4JHDB 3CIPA 2CGKA 4BRMA 2ZGZA 2QWMA 4BC2A 1HKGA 5F1XA 2Q2RA 3ULEA 3D2FB 2V52B 2A6AA 3EKSA 3R6MA 2E2OA 3MDQA 4IXCA 4BGAA 4FL9A 1JCGA 4K41A 4BREA 3QFUA 2P9NB 1NGBA 3QBXA 5FPDA 3ZETB 3UKUB 1QZ5A 2E8AA 3W3DA 1DGKN 5LJWA 2QXLA 1GLDG 4DCHA 5BREA 3I8BA 2F9TA 3A5LC 5AQZA 4FWRA 3U9DA 1KAYA 3CJCA 4H0PA 3O1BA 4RCHA 1QZ6A 4FSVA 3R9PA 1GLLO 3M6GA 2GTDA 4KBOA 4IJNA 4YDUC 3ZEUA 5AQIA 1SZ2A 2V7ZA 4EAHD 4FOEA 2DPNA 4CZLA 5AZJB 2UYTA 1DEJA 5BRFA 2QWOA 3EL2A 5BN9A 4BRGA 3O80A 1U2VA 4DHYA 5BN8A 2ASPA 3VEZA 4F9OA 1TUUA 2YI1A 3FZMA 1BDGA 4BR5A 1CZAN 5KPRA 1BUPA 4BRFA 1NMDA 4Y0WA 3BUZB 4O5FA 5ADXH 3FFKB 3OHRA 2BTFA 3WXJA 1HLUA 1NGDA 3H3OB 4AM7A 2P9SB 1JCFA 5BR9A 1P8ZA 1MA9B 1NGAA 5KPTA 3QDKA 2E20A 4I6MA 4CZKA 5AQLA 4FPBA 1TYQB 3DAWA 5AQXA 5LJVA 1WUAA 2CGLA 3MN7A 4PKGA 1OKJA 5CE3A 5EVZA 3GE1A 3VEOA 3VF2A 1NGFA 3EN9A 3VGLA 2E88A 3LDOA 1IJJA 1HKCA 4NB4A 5B8HA 3DXKB 5FPNA 3D7EO 4CZJA 4J8FA 2P9PA 1GLCG 3KZBA 1S3XA 2GWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2JLEA 4H5RA 4CJSA 4WCEL 3HVRA 5KQ8A 4AHVA 3OS2A 4FZZA 4IFYA 4H5NA 3HI0A 1R0AA 2YHWA 2WONA 1X9JA 3DYAA 4U67L 4J2DA 4FJHA 1KFDA 1NGJA 4DV0K 4CJEA 4DQ8A 3SI6A 4EHTA 1NM1A 3AV9A 2HW3A 4PHTX 1Q82O 3HOTA 3P4IA 3CQXA 1JLEA 4CJUA 4HTLA 2ASMA 1FKPA 5AQJA 4CZMA 1VQ6N 1C0GA 3ZSWA 4M7XA 2KFZA 3SNNA 3EZ5A 3ULDA 1S6QA 3P38A 1WLJA 4N76A 1S1XA 2NRHA 3EYZA 2D0CA 4M41A 3CPEA 3Q7CA 3H1VX 4PKIA 3VEVA 5HRPA 2P9UB 3K0SA 1KAZA 4CJRA 3TARA 4FJJA 4FLXA 3LDSA 1KVCA 3AO5A 3CJAA 1XNRK 1LW2A 2GUIA 1KVBA 2XRIA 5HRRA 5D3GA 1IH7A 3HXMA 3H1QA 2ZM6K 3EE8A 4BC3A 2HHSA 3SJJA 4XH5A 1RTHA 4CJ4A 3FGUA 4FWKA 1KVAA 4CEBA 1NGCA 1ITGA 4IWVA 1WN7A 4NYFA 2F8SA 4PL8A 3QEVA 4FWLA 3MWPA 4I9LA 3LP1A 1ZBUA 2G8VA 2JGUA 3TU5A 3KLFA 4DU1A 5JICA 4FJ7A 4B1UB 4BWJA 1JKHA 1BA1A 2QTDA 3O9RA 2QK9A 4H4OA 3E9PA 3LP0A 1NK9A 3OBWA 1D8YA 3DRPA 1Q9YA 2D0PA 3MEGA 3OYGA 3HP6A 3T1YK 1WOQA 4B9MA 2QXFA 2I7NA 1ATSA 5J2QA 3IAYA 1QQOA 2P9PB 4BDZA 3LM2A 3F9MA 1TGOA 3NF7A 3CM5A 3ITHA 1HNWK 2Q1NA 4W5TA 4B1WB 3K5NA 5M1FA 3O3FA 2OZSA 2PFUA 2O8BA 3IRXA 5BPLA 1U47A 1EKEA 1YTUA 4ELTA 1TUYA 4KH6A 1OVYA 3EE9A 3TABA 3MWTA 1EP4A 4FWQA 3CETA 4Z4CA 3EO3A 4BRNA 2PZSA 1Z05A 1RDCA 5ADXA 3H08A 4N41A 2OCEA 1V4TA 2GX9A 2ETJA 3CD6N 3CERA 2ITMA 3VETA 1Q8IA 3A5OC 3K9KA 1X3MA 1FJGK 2VGMA 4BE0A 1HNVA 1YT3A 1IBMK 2WFBA 5LL6Z 3WEEB 4YOXA 1Y97A 2IVNA 4HCBA 1S1TA 5MLCQ 4NCGA 3L2VA 4IJAA 1VQ5N 4JI6K 2GBZA 5EY4A 3V1RA 5EXWA 3KTQA 4A2BA 4FLUA 3VA0A 4JKGA 3DXKA 5K14A 1TKDA 4Z94A 1T8EA 1VSMA 2O8EA 1BOTO 3QEIA 1TK8A 2YJFA 4QOZB 2CGJA 4BRAA 3EKUA 4OPAA 1J54A 4JI3K 3GL1A 1EX4A 4CIEA 3VOVA 4JD2B 3O5BA 4BRKA 3V9XA 4CFAA 3VEYA 3ID8A 4WE1A 3CC4N 1A5WA 2DFHA 3O1WA 2ZGYA 4RWTA 1GLBG 3ZSXA 3FZKA 3WQTA 2A5XA 4BDYA 4BR0A 2IGIA 4KTWA 1X3NA 2E2QA 4E7LA 3ZX0A 3C7NB 2HNZA 3E9LA 2XY8A 1BIZA 3D2FA 2IVOA 3SMSA 4HVJA 3V1OA 2IAJA 2QKBA 3NGIA 1K8AO 4CEQA 3KLEA 4E89A 3MK6A 3THWB 5AQOA 4B1ZA 4BR7A 1S72N 3RVCA 3AVIA 2F7TA 5AQWA 3WUHA 3RR8A 1WAJA 4IG0A 2QWLA 3E9OA 4FJ8A 3DXMA 3M8QA 2G8HA 5JVGL 4ILGB 4K25A 1N36K 4NCBA 5HROA 2KKZA 1VQPN 4JNEA 4DKWA 4DV2K 3G10A 4FZYA 4CJ7A 1FXXA 3KHYA 1ASUA 4JS4A 4KHUA 2P5GA 4MDBA 2E6MA 4A2AA 4MLHA 1DTTA 1TKXA 3AVJA 1YUWA 5AQUA 4ILHA 2B5JA 1IO2A 2X74A 1C1CA 1WSJA 3A0IX 3R3LA 4IFEA 3NCIA 1RT1A 2WBNA 3DI6A 4CD1A 1NKBA 1L3TA 2UXCK 2P9SA 4CBUA 4B08A 4LF5K 2YJEA 2OA8A 3OYIA 3QMLA 2J4RA 1ZBHA 2ZQBA 3LDQA 3DLHA 3L3VA 3KLIA 4LH5A 3T1HK 2PYLA 3ZSYA 1HJOA 3IKMA 3M1FA 2ASOA 3A2FA 3BY5A 3P83D 4BROA 1JL2A 2Q0RA 3M3ZA 1ZC6A 5FDLA 4A5BA 3VQPA 1YXQA 4EFHA 4AF1A 3TANA 5JS1A 2XY7A 2XO7A 1VQLN 2FLOA 4F3OA 2HBMA 1VQ4N 2D5RA 3AVHA 4K0KK 4YDUA 3CIPA 3BZKA 1GOCA 1HYZA 2CGKA 3AVMA 2ZGZA 2QWMA 4C8KA 5F1XA 5EU7A 3ULEA 4CGGA 3O4NA 2QEXN 4JKFA 1VSLA 2X6SA 2PY5A 4AHSA 4K41A 4OPJA 3QFUA 3CCRN 4DTMA 4DSLA 3VQDA 4B8AB 3CG7A 4GKKK 3W3DA 2QA4N 5LJWA 3CCMN 1F21A 1WSFA 3PIOL 3U9DA 1KAYA 3K5LA 1NOYA 3MXMA 3O1BA 3LALA 1QTMA 3JYTA 4HCCA 4O55A 3R9PA 4W5OA 4YDUC 4KRFA 5AQIA 2DPNA 4Z4IA 2F8TA 2UYTA 1DEJA 1S9GA 4GVEA 3EL2A 3AVFA 1N8RO 4CJVA 5J2NA 1SKRA 4DTRA 5CZ2A 2YI1A 4ILJA 3NH1A 3HP9A 4KHNA 3OTOK 1U45A 4C8MA 4CJPA 2YHBA 1G15A 4DR5K 3VQ9A 4BRFA 1NMDA 5M1NA 4OVLA 2DFEA 2PYJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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