3F2KA

Structure of the transposase domain of human histone-lysine n-methyltransferase setmar
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
222
structure length
197
Chain Sequence
HELTENQKNRRFEVSSSLILRNHNEPFLDRIVTCDEKWILYDNRHPKKVMVTIWWSAAGLIHYSFLNPGETITSEKYAQEIDEMNQKLQRLQLRKGPILLHDNARPHVAQPTLQKLNELGYEVLPHPPYSPDLLPTNYHVFKHLNNFLQGKRFHNQQDAENAFQEFVESQSTDFYATGINQLISRWQKCVDCNGSYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The Crystal Structure of Transposase Domain of Human Histone-lysine N-methyltransferase SETMAR.
rcsb
molecule keywords Histone-lysine N-methyltransferase SETMAR
total genus 67
structure length 197
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.1.1.43: Histone-lysine N-methyltransferase.
pdb deposition date 2008-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01359 Transposase_1 Transposase (partial DDE domain)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.470 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3f2kA00
5CR4A 4U7BA 3K9KA 4MDBA 5HOOA 3K9JA 3HOTA 3F2KA 3HOSA 2F7TA 4R79A 4MDAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A5WA 1NK9A 3B6OA 1JXEA 2QWOA 3EYZA 4DQIA 2IVOA 4E0DA 1HNXK 4JKCA 4WE1A 1Z26A 3NH2A 4CCHA 4AHUA 4B3OA 2P9UA 3KLHA 1V4SA 2YJFA 4CFBA 3CC7N 5GAGP 4HTLA 3VQ8A 2W6LA 4CEAA 3RVCA 4DSKA 1F21A 3V6DA 3M8RA 5CY4A 4O0JA 2VYPA 4JI4K 4JKAA 5HOOA 5GIPA 2P9UB 3SLCA 3FZHA 1IG8A 1VSHA 4JKBA 4B1YB 2OTLN 4CD3A 4Y0WA 4MLHA 3MK6A 4BRNA 4RW8A 3CFRA 3EKSA 1SZ2A 3H6EA 1HX1A 4J2DA 3ULDA 3OYMA 3JS6A 4CHNA 1W7AA 2Q1NA 2WC9A 3HPGA 3MN9A 1WLJA 3H3OB 4AHVA 5JVGL 3HM9A 3AVNA 4Y1CA 4KTZA 1LWCA 3DRPA 4BRLA 3WT0A 3IMXA 3FFKB 1NKEA 4FJXA 4FJ9A 3QEXA 4E3SA 3NGYA 4OJRA 4CFDA 3MWPA 1VQ5N 2Q36A 3CQXA 3LP0A 3KD1E 3SQ0A 3D7EO 4F8RA 2QWPA 5KPTA 5HLFA 4FOEA 3WXLA 5FPDA 5CE3A 2VCPA 1HLUA 4JN4A 3ZX2A 2Q31A 4IOCL 4CJLA 1KSPA 4ISEA 4FM1A 1KLMA 3GL1A 3PIPL 3VEOA 2UUCK 2YJEA 1G99A 3H1VX 3VQAA 3VN5A 3ZETA 1QQNA 3MAQA 3SK3A 1I94K 1RDCA 4FWLA 3LWMA 5J2MA 1BHLA 2RN2A 1J53A 4ELVA 1IO2A 1NGFA 5A2QO 3G71N 2HNZA 2HHVA 5DM6L 1WSIA 3AO2A 4CZGA 1HJOA 5M1KA 1IBMK 3B8AX 3UKRA 3LDOA 5BPMA 1WSHA 4GMJB 5HL7L 3ZYYX 1NKCA 5AQNA 2FSNA 2ZJQL 1GLFO 1VSFA 3ID6A 4RG8A 2PBDA 3DM2A 3E1YA 5AJ3K 2IAJA 1SL0A 4B08A 1VQNN 4WFNL 4DCHA 3MXJA 4NB4A 4O8UA 3AO3A 4EP5A 1J54A 4JK9A 3VGKA 2QTDA 4MLEA 1W2BM 1VK0A 3AA3A 4CBUA 4LFAK 1RDUA 1HJRA 3AO1A 1NBWA 4LH4A 1SQKA 4CD1A 5BR8K 3KTQA 1UA1A 2HHHK 2LSNA 1JLBA 2V51B 4BR7A 4X62K 1D9FA 4FZZA 4DV6K 3VENA 3RMBA 3IAYA 3HSTB 1L3SA 1BIUA 3ZSWA 3CI5A 2I7NA 1YAGA 2P9SA 2ZJPL 3PUFA 3O4QA 5AZIA 4FYDA 3OS0A 4Y1DA 4LF8K 3HK2A 3I0SA 5F0XA 5M1NA 4LSNA 3JSMA 1XMQK 3LP3A 4F3TA 1REVA 3QMLA 2P9SB 3ZT3A 2GWJA 1EETA 1JCEA 3VA0A 3C7NB 1BO5O 3N4PA 2RHKA 4AILC 2ATQA 3O9RA 5AZIB 2O8EB 3DLKA 3LZJA 3PIOL 1N33K 3O9UA 3DLHA 4F2SA 5AQXA 3K2PA 3OTOK 3L0QA 3WNGA 2NRRA 4H4OA 5DK5A 2O8CB 3R6MA 3EE9A 4JK7A 4Q0BA 4AHTA 4F2RA 2NRXA 3VEXA 4IO8A 4IOAL 3W3DA 1NJZA 4FJKA 4CK1A 2Q3SA 4OGEA 1QVGM 3TTCA 1YITN 4CHYA 1HNVA 1HNZK 3OY9A 3EL2A 3BDPA 4LF6K 2OPSA 3L4QA 5E41A 3QIPA 4CJWA 4H8KA 2WTUA 4IO9L 1CZBA 3O3FA 2HHTA 2Q2RA 4JI2K 5C15A 2HHWA 2HF3A 4BR2A 3AVHA 3EKUA 4HUFA 2PY5A 2KW4A 2Y1IA 2A3ZA 2HBKA 3SAHA 3VQBA 4FSVA 3D2FA 3OYHA 3CPWM 3BZCA 2VQEK 1WB9A 5LMUK 4FWRA 4H0XB 3PO5A 5BN9A 1KQSM 1ATSA 3O80A 5JVHL 5KRTA 1FW6A 4DTJA 3U3YA 1NK4A 3FZKA 3CCQN 4LF9K 2YNFA 5JICA 2DTUA 3PX0A 3QFPA 1RBRA 1JJ2M 1JLFA 4B8AB 3OYEA 3DMJA 4DUZK 5JLFA 3H1QA 2IGIA 1VSMA 2ZWHA 2F7TA 3V4IA 2B4JA 1OH6A 3K5LA 1OH5A 3CG7A 3M8SA 2WOMA 4KHYA 4RW9A 5AQMA 3RMCA 2AP1A 1ZXOA 1XWLA 2XY5A 1JLGA 2E2QA 4CZMA 3BF1A 4IDHA 2FC0A 4CESA 3IDHA 2AJQA 1C0TA 1IV0A 3HI0A 3OYBA 4F3OA 2Q0RA 1J5OA 4BGBA 2RF2A 2FF6A 1E4GT 4H4MA 4IXCA 1LAVA 4FLYA 4YY3K 4CJ3A 4BR5A 2GWKA 4X65K 2Q97A 1WOQA 3O3HA 5EOYA 4GW6A 2NRZA 3A5NC 4FPBA 2KZZA 2ZM6K 1ZBSA 4NCBA 3CC4N 1ITGA 4B9UA 4Z4GA 3NVKA 1X9MA 4BRCA 2YNIA 3AVJA 1I3AA 3AVLA 3C6TA 4Z94A 5BRFA 4CJVA 2A1RA 4DLGA 1LW0A 2IDOA 3H46O 5AQSA 5CZ1A 3KLEA 1UOCA 1NLVA 3DAWA 2DFEA 1XC9A 2HBJA 4BG9A 1RFQA 4OPHA 4CW7B 4B8CA 4FJJA 5ADXH 1VSLA 2NRWA 3R8EA 1QTMA 1QQOA 1Q81O 2DY4A 4EHTA 2BH1A 1TL1A 3V9ZA 4BRMA 1WSFA 5FRNA 5C12A 4RW7A 3WXIA 3UKUA 1NGJA 1NK7A 3SUQA 3E9PA 4BC5A 4DSEA 3F5TA 3VA3A 4B3RK 2WBNA 1BUPA 4DFKA 3UB5A 4CF1A 3IS9A 4AM6A 4H5WA 4DF4A 2HNDA 4U7BA 2X6NA 4CZKA 1DKGD 3HP9A 4YORA 3TTDA 3MCAB 4M3RA 3T1AA 3TSPA 5KPZA 2W40A 2P5OA 1A5XA 4C8MA 4CEQA 1SL1A 5I3UA 2JLEA 2GTDA 3U6FA 3VQ5A 1TV6A 3V9UA 1BCOA 2YI1A 4KI4A 2AA4A 5AQPA 3VESA 5ADXA 2QEXN 2GEMA 4A5BA 1QS4A 1IKXA 5AQWA 1WAFA 3TAQA 3CETA 3SMSA 4CHPA 4G9ZA 1KVBA 4B3SK 3VOVA 4KREA 1WNSA 4HVJA 4I6MA 2F96A 1HKCA 3N4QA 5GAHP 3WUHA 2ZE2A 5CR4A 4JKGB 4EIAA 5BREA 4HUEA 4FWMA 1E3MA 4OKJA 4M3YA 4NXMK 1JL2A 3SPZA 2W6KA 3V9WA 2NUBA 3F73A 4I6MB 1E4FT 3TAMA 1N6QA 4GNIA 4E7HA 4OGCA 5HROA 5K14A 4GKKK 1X3NA 4BQLA 4FW1A 4QOZB 2F8SA 4CJKA 3VEYA 3AARA 3U4LA 3TAFA 2P9KB 1FXXA 5KI6A 2OYQA 1TUUA 2VG5A 1YHQN 1DTTA 2BE2A 4AF1A 3CQ8A 3AAQA 3SQ2A 3MCPA 4RCHA 3CJ1A 4MDBA 3RMDA 3O9QA 3M5RA 4BRDA 1RT5A 4B1ZA 3NHGA 4DTUA 2PZSA 2A6AA 2E6MA 4CEEA 3PLAA 3R3LA 4H03B 5AFUH 4CJRA 4KHWA 1T8EA 3OVNA 5C25A 4DKWA 1ASWA 1RT3A 3MX5A 3SMPA 1J9AA 1DTQA 4KO0A 3K0SA 2PFUA 3M3ZA 2A41A 2YNHA 4FWPA 3I0RA 4MFBA 1S6PA 4FK0A 1NWKA 5AZJA 1RT6A 3C94A 1BL3A 3DRSA 4JEPA 2Y1JA 4BREA 2WONA 2VG7A 4DMNA 2PAVA 3VQDA 3AVBA 3T1YK 4DU4A 1LOTB 1K8KA 1L3UA 2I7PA 1RILA 3OBWA 3VQ9A 4BGAA 2HW3A 4A2AA 1EKEA 4FJHA 3JXUA 4KRFA 1T03A 2CH5A 5AZJB 4FJ5A 3WEEA 4BQZA 3L2VA 5HRPA 3HM8A 3J7YP 3BGRA 4M7XA 1RT7A 2Z1IA 1KAXA 1K8KB 3G25A 3SI6A 4W5TA 1U47A 4PL7A 4R5PA 1NGIA 3WEEB 3KK7A 3RR7A 1BI4A 4XH4A 3SV3A 5FLXO 3P38A 4K43A 4DB3A 5CZ2A 1IH7A 3F9MA 4QAGA 4CZIA 1NJIO 4XEIA 4E1NA 1Q9XA 3Q7CA 3UIQA 4JI8K 1S1VA 1UA0A 2YHBA 3MEEA 3ZSZA 1JLEA 2D5RA 1DEJA 4B3MK 3E9OA 4IFEA 4PKHA 1YJNN 2Q0UA 2FLOA 3SUNA 4M42A 3KK1A 3JYTA 2NLXA 1Q86O 1ZC6A 3OYNA 4AHSA 3L3UA 3NH1A 2F9TA 3FZLA 4BRIA 4M3WA 4HTUA 4JAXA 1JCFA 1S22A 1S72N 1RGIA 3AGRA 1VQMN 3O3GA 2YKMA 2RPIA 4CJ7A 3CCRN 4Z4CA 1Q82O 2X74A 4KHSA 2KFZA 4ISFA 2X6SA 4IEEA 5SWMA 3QNNA 5AQUA 4UY8O 4DS4A 4NCAA 4DTMA 4DHYA 5TKWA 4EFHA 1T3VA 4BR0A 4KH4A 1TYQB 4YOTA 4JKHA 3V1QA 4WF9L 1X1PA 3CJ7A 2F4VK 1YXQA 3TWHA 5I42A 1HNWK 1ILYA 4DSIA 2YHAA 3L2QA 2GELA 2G8IA 1TAUA 4BWJA 1BOTO 3THXA 4O0IA 3EN9A 3OBYA 3PO4A 3P31A 1C6VA 3HRGA 4CIEA 3HO1A 1MDUB 1FKOA 2YHWA 3AO5A 1FK9A 4KPYA 5BRHA 3CMEN 3AA4A 4W5OA 4KFBA 3NFAA 1X9SA 1SKSA 3THXB 1Q9YA 4FXDA 3VF2A 2YCHA 1UWBA 2BUPA 4M3XA 5GINA 3VQEA 1N8RO 1W97L 1Q8IA 1VRTA 4J8FA 5J2NA 5BRDA 3LAKA 4O5FA 1XHXA 2HOEA 4IFYA 4DTXA 1C0FA 4KKOA 1S5JA 4BDYA 4OPKA 3C6UA 3ZCMA 4DR7K 3D0PA 2UXBK 2Z1JA 1GOCA 3ENOA 3R1XA 1EO1A 4JK8A 1UAXA 2P9NA 3HVRA 3P1GA 1QQCA 2KLAA 3OW2M 3ZEUB 2OPPA 4GVEA 1KTQA 2E8AA 3RWUA 3TTFA 2YHYA 4CF9A 1NK6A 3NDKA 4KBOA 4FM0A 3TI0A 4M63C 5FPNA 2OZSA 4RW6A 2P9NB 1IG9A 4BVOA 1NGEA 2KHOA 3LDLA 5AQOA 3D6RA 3QFUA 4DTSA 4KHNA 5HRRA 3SJHA 1WSGA 3EY1A 3E9LA 3LDQA 2OPRA 3NMUA 2E88A 3CCJN 1ZBFA 4B9TA 1YTUA 1WN7A 5C10A 3RMAA 5SZTA 3ENHA 2KFNA 1S1WA 3DLRA 4OPJA 3OYGA 3NH0A 4FM2A 4H5TA 1BIZA 2E2PA 3RR8A 2YHXA 1CZAN 4AQYK 5FROA 4RTFD 3A5MC 1R0AA 4YOXA 2ZJRL 4FJ8A 3NVMA 1SL2A 2FSKA 3SQ4A 5FRMA 4JV5K 3EZ5A 5M1FA 3GE1A 4C8KA 1KXPA 3DJCA 1EXQA 3VEZA 3SZ2A 4FLTA 1QSSA 3AGKA 2ASPA 4FJ7A 3H3NO 1EP4A 4NXNK 2QM1A 4MO5A 1IBLK 2O4IA 3TR8A 1RTIA 3T19A 4B1XB 2E1YA 1XHZA 1BG3A 4HCCA 3Q7BA 4X66K 4E1JA 4H0PA 3C7NA 3MX2A 5GAEP 4E7IA 3EZWA 1VQLN 2O8EA 5AQTA 5IWAK 4HUGA 1SS6A 1HYZA 1TKZA 2UXDK 4FK4A 4WCEL 1GLAG 1KVCA 1VSEA 3AVAA 3OYJA 1TUYA 4FVMA 1XC3A 2O8CA 1NGHA 5AQGA 5EXWA 1TGOA 2IOCA 3HXMA 3CHWA 4E7JA 1TVRA 4O55A 4PKGA 3MMVA 4EAHD 5DM7L 4CJ5A 5J2PA 1RBUA 4FO0A 4ISGA 4CZHA 4Z0UA 4NYFA 2HB5A 1J5EK 3DXMA 4I2QA 1KAYA 4DV7K 1YJWN 5HBMA 2OTJN 1K6YA 3ZX0A 1NK8A 4DUYK 2VWJA 1Z25A 1TKXA 2P9PA 2HBMA 2A1SA 5KRSA 3IKMA 4MO4A 4Z4IA 3DXMB 5MLCQ 3PY8A 1EX4A 5CYMA 1OVYA 5CHIA 4IJNA 1RT4A 4EZ6A 3DLGA 2KZMA 4LFBK 1YTAA 3SUOA 1NK5A 2P9PB 1JCGA 3P83D 4JNEA 3L2UA 4DTNA 2XO7A 4NCGA 4DR4K 3DLLL 4B9QA 5JMVA 4CERA 1JLQA 4CJ4A 1RTDA 4E19A 5DMRA 3WXMB 3FZFA 3LDPA 1GLBG 3LAMA 4MDAA 3CF5L 3G4SN 2QXFA 2KTQA 4C1NI 3HZ6A 2O8DB 3H08A 1KCFA 1YVNA 3HYFA 2FBYA 5LL6Z 3SJJA 2D4WA 3WXKA 1LW2A 3NCIA 1IKYA 1BQNA 2HSTA 3CJ9A 4O4GA 4N76A 4JI6K 4PY5A 1JLCA 3VQ6A 4CHQA 4FL9A 4ID1A 3OYCA 4H0VB 2QA4N 4K8ZA 4WFAL 4BC2A 1MWKA 3M8QA 1DLOA 2HMIA 3VF4A 4CHOA 3IUCA 1S1TA 4CGFA 1D8YA 1MWMA 1WSJA 3OHRA 4M41A 3TU5A 3OS2A 2P9LB 4ZTFA 3G10A 3NF6A 2VQFK 2VGMA 3TAEA 3P39A 1HKBA 4CJTA 3OYDA 3RTVA 1VHXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5CR4 A;  4U7B A;  3K9K A;  4MDB A;  5HOO A;  3K9J A;  3HOT A;  3F2K A;  3HOS A;  2F7T A;  4R79 A;  4MDA A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1A5W A;  1NK9 A;  3B6O A;  1JXE A;  2QWO A;  3EYZ A;  4DQI A;  2IVO A;  4E0D A;  1HNX K;  4JKC A;  4WE1 A;  1Z26 A;  3NH2 A;  4CCH A;  4AHU A;  4B3O A;  2P9U A;  3KLH A;  1V4S A;  2YJF A;  4CFB A;  3CC7 N;  5GAG P;  4HTL A;  3VQ8 A;  2W6L A;  4CEA A;  3RVC A;  4DSK A;  1F21 A;  3V6D A;  3M8R A;  5CY4 A;  4O0J A;  2VYP A;  4JI4 K;  4JKA A;  5HOO A;  5GIP A;  2P9U B;  3SLC A;  3FZH A;  1IG8 A;  1VSH A;  4JKB A;  4B1Y B;  2OTL N;  4CD3 A;  4Y0W A;  4MLH A;  3MK6 A;  4BRN A;  4RW8 A;  3CFR A;  3EKS A;  1SZ2 A;  3H6E A;  1HX1 A;  4J2D A;  3ULD A;  3OYM A;  3JS6 A;  4CHN A;  1W7A A;  2Q1N A;  2WC9 A;  3HPG A;  3MN9 A;  1WLJ A;  3H3O B;  4AHV A;  5JVG L;  3HM9 A;  3AVN A;  4Y1C A;  4KTZ A;  1LWC A;  3DRP A;  4BRL A;  3WT0 A;  3IMX A;  3FFK B;  1NKE A;  4FJX A;  4FJ9 A;  3QEX A;  4E3S A;  3NGY A;  4OJR A;  4CFD A;  3MWP A;  1VQ5 N;  2Q36 A;  3CQX A;  3LP0 A;  3KD1 E;  3SQ0 A;  3D7E O;  4F8R A;  2QWP A;  5KPT A;  5HLF A;  4FOE A;  3WXL A;  5FPD A;  5CE3 A;  2VCP A;  1HLU A;  4JN4 A;  3ZX2 A;  2Q31 A; 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 3OYF A;  1VQ4 N;  1LAW A;  1KVA A;  4BE1 A;  3VER A;  4BR4 A;  3U3G A;  4FLV A;  3L4I A;  4FJI A;  2VWB A;  4FLU A;  1SUQ A;  3CCV N;  1NJX A;  4N5S A;  2PYL A;  4IWV A;  3V9X A;  4LF5 K;  4G1Q A;  1ESV A;  4FOI A;  4K8X A;  3AVM A;  1VRU A;  3F9K A;  3NGI A;  1TK5 A;  1XUP O;  1X9J A;  3LP1 A;  3MWT A;  2JWK A;  1JLA A;  5H1S Q;  3DOK A;  5J2Q A;  3MEG A;  3I33 A;  4OO1 J;  1T6C A;  5T7B A;  1SKR A;  4C8O A;  3KWI A;  3QES A;  2QXL A;  1S1U A;  3G0Z A;  5E84 A;  4AM7 A;  2D0B A;  4E1M A;  2UU9 K;  2E5L K;  2G8H A;  4CGG A;  4KTQ A;  3NF7 A;  5AFU A;  4NLC A;  3HSC A;  2O8B A;  4BAC A;  1BU6 O;  2RKI A;  2OAN A;  1BQM A;  4BC3 A;  2BGG A;  4IFV A;  3PX4 A;  3LAL A;  3CFO A;  4JKF A;  3PSF A;  3QET A;  4B3T K;  4E89 A;  3CXC M;  2UUB K;  4H5R A;  5AQI A;  4CZF A;  3M8P A;  1N36 K;  4XH5 A;  1XNR K;  3QEP A;  3T1H K;  1BI4 B;  1G15 A;  2V52 B;  2D0O A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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