3G10 | Genus

Total Genus 85

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	85
sequence length	252
structure length	252
Chain Sequence	SPIRDVWSTNLQQEMNLIMSLIERYPVVSMDTEFPGVVARPLGVFKSSDDYHYQTLRANVDSLKIIQIGLALSDEEGNAPVEACTWQFNFTFNLQDDMYAPESIELLTKSGIDFKKHQEVGIEPADFAELLIGSGLVLQEEVTWITFHSGYDFAYLLKAMTQIPLPAEYEEFYKILCIYFPKNYDIKYIMKSVLNNSKGLQDIADDLQIHRIGPQHQAGSDALLTARIFFEIRSRYFDGSIDSRMLNQLYGL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__422306427564144__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__422306427564144__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3G10/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__422306427564144__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"422306427564144","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3G10/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__422306427564144__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5cfeef24906694d364cc79a9/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5cfeef24906694d364cc79a9/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5cfeef24906694d364cc79a9/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5cfeef24906694d364cc79a9/pdb.gz): 61 ms

reading 252 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

252 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 23 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:251});backbone only;select *;

platformSpeed = 8

cartoonsFancy = true

sheetSmoothing = 1.0

traceAlpha = true

loadScript /static/js/j2s/core/corescriptcmd.z.js

specularPower = 9

ambientPercent = 20

antialiasDisplay = true

Script completed

Jmol script terminated

loadScript /static/js/j2s/J/g3d/HermiteRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/renderbio/BioMeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/render/MeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/shape/Mesh.js

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase, gene regulation
source organism	Schizosaccharomyces pombe
publication title	The activity and selectivity of fission yeast Pop2p are affected by a high affinity for Zn2+ and Mn2+ in the active site pubmed doi rcsb
molecule keywords	CCR4-Not complex subunit Caf1
total genus	85
structure length	252
sequence length	252
ec nomenclature	ec 3.1.13.4: Poly(A)-specific ribonuclease.
pdb deposition date	2009-01-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04857	CAF1	CAF1 family ribonuclease

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H	3g10A00

2Q3SA 3HP9A 3WNEA 3V9SA 3AVLA 3OYMA 4CCHA 1S5JA 3AVGA 4CHOA 1D9FA 1KSPA 3L8BA 1FXXA 4N5SA 5HLFA 4ICLA 1CXUA 1REVA 1JLFA 1YTAA 3JSMA 1TGOA 4ID1A 2F96A 3P1GA 4CJQA 4KB0A 4Q0BA 3MXJA 3KLFA 4HUGA 4E19A 2KFZA 1BIUA 1KLMA 4KHQA 2KW4A 5KRSA 4J2DA 3RMAA 1LWFA 1BI4B 1KFSA 3TAQA 4CJFA 3DLKA 4FJ9A 2KZZA 1RDDA 1J5OA 4FJIA 4DSFA 1VSKA 3BGRA 3S9HA 4PUOA 2GV9A 1B92A 2YNGA 3CFOA 4RW9A 3P5JA 4E1MA 5KRTA 4O0IA 4IG3A 1QSSA 1S1TA 1RBVA 3G0ZA 3DYAA 4M3RA 3OS1A 3OYIA 4C8KA 4DSJA 1BGXT 1RT1A 1WLJA 1RTIA 3VN5A 1VSHA 1WSJA 3OS0A 1LW2A 4F4KA 1XHXA 3O4QA 4M3YA 4HUEA 3DLEA 4Y1DA 1LWCA 3FFIA 4CJRA 3SQ1A 1SL1A 4B9UA 2E4LA 4HTUA 4I9QA 4OLBA 3QERA 2VG6A 4DTSA 5SZTA 2YKMA 4CEZA 2JGUA 4W5RA 2FBXA 4DWIA 2B6AA 4GW6A 1C0TA 2D0BA 4DQRA 4CGDA 3IAYA 1QSYA 3QNOA 4B9NA 1VSMA 1NJYA 2RKIA 4BWJA 3WNHA 1L3SA 3OJSA 1W0HA 4FM1A 4DLGA 2OA8A 1VK0A 1HQEA 1GOCA 3HSTB 3EY1A 3SCXA 1NOYA 2G8UA 4PQUA 1T8EA 4I2PA 4FLZA 1VSFA 2FBVA 4IDKA 5DK5A 4GVMA 4FZXC 1XHZA 2Z1IA 5KGXA 1NK5A 1ZBUA 4ELTA 1BHLA 4DFJA 2YHAA 1UWBA 3DOLA 3NH0A 4N41A 4CFDA 4CHNA 4EP4A 3SQ2A 3M8QA 4NYNA 1Q9XA 4C8OA 1NJXA 1TL3A 3AA4A 4ZTJA 4DQQA 1D5AA 4OGCA 4CGFA 1XI1A 1U45A 1ZYQA 4CEOA 4GMJB 4FLVA 3DMJA 4HHTA 3AVAA 1NK7A 4AHRA 4C8NA 4CJ4A 3KLEA 3AVIA 3MAQA 3V81A 2VWJA 3TI0A 4ELUA 2HHWA 3VA0A 3QINA 5KI6A 4FYDA 2FBYA 1XC9A 5DMRA 4EZ9A 2X78A 3OJUA 2B4JA 2G8KA 3AO3A 4F8RA 3VQ6A 3VQPA 4PA1A 4HCBA 1WAJA 4OKEA 3IS9A 3U3GA 3THVA 1RBUA 4UQGA 2B5JA 5CZ1A 4I9LA 4XIUA 4E89A 4M3TA 1ITGA 2IGIA 3K58A 4CK1A 1I3AA 3IG1A 3LAKA 3AO5A 3V9ZA 1VSEA 3LALA 3TWHA 3QEIA 3HXMA 1UA0A 1UA1A 1T03A 1ZBHA 4AHVA 3K59A 2QK9A 1TKXA 1T7PA 5KGWA 4E7IA 1BQMA 2VWKA 3C95A 3DLRA 1WSEA 1EP4A 3K5OA 4CJPA 3RMCA 2HHTA 4CEAA 5JS2A 1U4BA 2XRIA 4DQSA 5FDLA 4E7JA 4N47A 1DTQA 1RT3A 1Z25A 3NF9A 5E41A 1NKEA 3T19A 2DFFA 1Q8IA 5HRSA 4CIEA 3QEXA 3TAPA 3NE6A 4CIFA 3TANA 2KTQA 1RDCA 3K57A 3OYLA 5CY4A 3BDPA 3L3VA 2X6NA 4CEBA 3ZCMA 1EKEA 3QIPA 4CJTA 1JXBA 4B9TA 1RTJA 3DRRA 4F2RA 2GBZA 1WSHA 3LP3A 1BL3A 2YNHA 3OVNA 4CJSA 3KLHA 3B6OA 3V9UA 3OYGA 3K2PA 3D45A 3L2QA 4DFMA 3DM2A 4E3SA 1ASVA 3DRPA 4CHPA 3OYHA 3AO4A 2PYLA 1TL1A 4AHSA 4HCCA 3CFRA 3LPTA 3KLGA 3ZSVA 3ITHA 1TK0A 3QNNA 1SKRA 2HVHA 4PWDA 1RT6A 2OPSA 4O44A 2E6LA 2I5JA 3ZT4A 3G10A 3AVCA 3KKSA 3IRXA 3ZT3A 4CF0A 3T3FA 3SUQA 2PYJA 3H08A 4DTUA 4CK2A 2OZMA 2QKBA 3L3UA 4CE9A 4KHUA 4B3OA 4LH5A 1L3TA 2G8FA 1S1VA 1TAQA 3U3YA 1VSJA 1YTUA 2D0AA 3QIOA 4FLYA 1X9MA 3NDKA 3ZSXA 2W42A 4ID5A 4FM0A 3PV8A 3LP1A 2BDPA 4QCLA 3AVFA 4KO0A 3WNFA 3QEVA 2F8SA 4RW7A 3SUOA 4FJ7A 1BIZA 5C25A 3K5NA 3RR8A 1BISA 2YNFA 1HYVA 2IOCA 4ZHRA 1IKVA 1S9EA 3ASMA 3ZT2A 3OYEA 3K5MA 4DU4A 3RMBA 4FXDA 4LSLA 3HPOA 1SL2A 1QQCA 3AVBA 1TK5A 3HO1A 4J2BA 2LSNA 3MXIA 3HM9A 1BCMA 4DQIA 4OPJA 1RTHA 4AHUA 2OPRA 4FJ8A 4IFVA 4NYFA 2NUBA 1RBRA 3VQ8A 2XHBA 4DFKA 1A5WA 2XY7A 4O0JA 3ZSQA 3NGIA 5K14A 4DTMA 1WSIA 1VRUA 3PO5A 4TSXA 1UOCA 3NFAA 4DF8A 1RT7A 4IBNA 4L8RB 4KI6A 2YV0X 1NKCA 1Q9YA 2RN2A 5CYQA 4M41A 4FJLA 3HPHA 3SV3A 3VQ5A 3SYZA 4OLAA 3L2UA 3C94A 3AVHA 5I3UA 1Z26A 4CFBA 4JLHA 3SJJA 1U48A 3AVNA 1TV6A 4W5QA 4CHQA 3TAFA 3HJFA 2X6SA 4ELVA 4FJMA 4C8LA 4CJLA 1NK4A 4J2EA 2P1JA 4W5TA 1RILA 1S1XA 3WNGA 3S3OA 1GOAA 3CFPA 1HPZA 3SQ0A 2PY5A 1RNHA 3TAMA 4DG1A 5JS1A 3AA3A 2FBTA 3C6UA 3RRGA 2Z1HA 2OYQA 5J2QA 4CF1A 3S3MA 1FK9A 1LV5A 2IC3A 3AA2A 4CEDA 3NF7A 4KFBA 3DI6A 3U6FA 4DSLA 1F21A 1RT2A 3OY9A 3V6DA 3PX6A 1I39A 3ALYA 1U04A 3QO9A 2O4GA 4OKJA 3VQAA 3NH1A 4AHTA 4BACA 4AILC 4FJHA 4F3OA 1TKDA 2RPIA 3VQDA 1L5UA 1QHTA 4OKKA 2P5OA 3F9KA 5J2MA 1RBSA 1IKXA 3RTVA 4M3ZA 2FC0A 1QE1A 3AO2A 2G8VA 1KTQA 3KIOA 1RTDA 1YVUA 2P51A 2RF2A 5C24A 1CZBA 4CFAA 3NH2A 3D0PA 4Z4IA 3QEWA 4KREA 3OYKA 4MQ3A 3RMDA 3ZT1A 2EHGA 2XY8A 4W5OA 5FRNA 1S1WA 2IDOA 1HQUA 2IAJA 4AHCA 2XY6A 3SNNA 3LANA 2G8IA 2HB5A 3VQBA 3V9XA 1X1PA 3HVTA 1ZBLA 4BWMA 3M8RA 1D9DA 2HVIA 3V4IA 1YT3A 4RG8A 1SL0A 5FROA 2OPQA 3RRHA 2HHXA 3NCIA 3B6PA 4IKFA 1IO2A 1RBTA 4Z4CA 3O3GA 3L2RA 4Z4GA 1FKPA 1S9GA 3SPZA 4Z4HA 3P83D 1JLAA 2DY4A 5C42A 4E7LA 1C1AA 1RT5A 4Y1CA 4KHWA 5D3GA 3KK3A 3RR7A 2HW3A 2BGGA 4G1QA 1RDBA 1RDAA 1ASUA 4Q5VA 5CYMA 4E0DA 4CF2A 2DFEA 2R7YA 3CG7A 1U49A 4DTOA 1ZBIA 4YFUA 2BE2A 4FJKA 4E7KA 3NAEA 3SV4A 3TAEA 1U47A 3E01A 1EX4A 1WN7A 4B9SA 1T05A 2X74A 2Z1GA 4O4GA 1CXQA 1GOBA 2GUIA 3DRSA 4BDZA 4W5NA 4NCGA 3I0RA 4CF9A 4FJJA 1RCHA 3F73A 1TVRA 3KD5E 1VRTA 3HP6A 1DTTA 1WAFA 1C1CA 1S6PA 1W9HA 4FJGA 5FRMA 1J54A 4BE2A 4K8ZA 1JLBA 3A2FA 3NF6A 3KLIA 4DSEA 3CM5A 3KK2A 2Y1IA 1SKSA 1L3VA 1QTMA 5SWMA 3ZSOA 3O3HA 3LP2A 5HBMA 3L2VA 1ASWA 3S3NA 3TARA 1NKBA 1K6YA 3AVJA 4DU1A 1JKHA 4DTNA 3UIQA 3HPGA 4CEFA 2QKKA 4BE0A 4KHNA 3CYMA 3ZSZA 1WSGA 3OYBA 4DF4A 1NJZA 1FKOA 4CJEA 1HJRA 4B9LA 2EX3A 4JS4A 4DLEA 4B9MA 2AJQA 1J9AA 1SV5A 2KFNA 3L2WA 1LAWA 4FLTA 1A5VA 2HHUA 4FLUA 4E1NA 4K8XA 4JRQA 4FK2A 3JYTA 1WSFA 2OZSA 3PX4A 5HP1A 4KTWA 1JL2A 1IH7A 3QETA 3ULDA 2ZD1A 3HYFA 1B9DA 4FLWA 1G15A 3LAMA 1TK8A 4Z0UA 4DTJA 3DLHA 4CESA 3CM6A 4FJNA 2WONA 3VQCA 1HYZA 4KKOA 1S6QA 4M3UA 1HYSA 3OYNA 4CHZA 4DTPA 4DFPA 5HRRA 4O55A 4CGGA 3SZ2A 3MEDA 1HNVA 2HHQA 4CIGA 4YNQA 4ZTFA 3KJVA 2YHBA 3HT3A 3KK1A 1NOZA 2YNIA 4IFYA 5HRPA 5J1EA 4FW2A 4FM2A 4CECA 4DMNA 1TKTA 2JLEA 3LDSA 3MXMA 3HK2A 2G8HA 3ZSWA 3ZT0A 3K5LA 4C8MA 1WNSA 3QLHA 4FZZA 4Z4EA 1HMVA 3NGYA 3ZSYA 4CK3A 1DLOA 2QXFA 1JLCA 3VQ7A 3NBPA 1SUQA 2A1RA 4KTQA 4NCBA 4E7HA 1BQNA 2HNZA 4BDYA 4CHYA 4BDPA 1D8YA 4KAZA 3OYFA 4I7FA 2XO7A 4QOZB 4WE1A 4CJVA 1KVBA 3T1AA 4JRPA 2PZSA 1J53A 4FZYA 4JS5A 1BCOA 4M45A 3VQEA 4KRFA 3I8DA 1X9SA 5HRNA 4CJWA 2IS3A 2DTUA 3VA3A 1XWLA 1B9FA 2E6MA 4EP5A 4N76A 2HHSA 3HL8A 4OGEA 5CZ2A 1EETA 3EZ5A 4I2QA 4OPKA 1Y97A 3ISNC 1SKWA 4LD0A 4H8KA 3V1OA 4FJXA 1C0MA 3LZJA 2BANA 2HNYA 2XY5A 1R0AA 2ETJA 4FJ5A 1KRPA 3SUPA 2WOMA 3MEEA 1NK0A 3KD1E 1MU2A 1C1BA 4RW6A 4AH9A 2HNDA 2F8TA 4CJ3A 3LPUA 2ITGA 4CGIA 1IKWA 4CEQA 2P5GA 4KHYA 1HNIA 4B08A 4CF8A 2ZQBA 4DTRA 1LW0A 1NJWA 4CEEA 3AA5X 2HHVA 1X9WA 4Z4FA 4DU3A 5HROA 1RT4A 4LH4A 3HVRA 3LP0A 3NF8A 4HVJA 2Y1JA 5T7BA 4PY5A 1UAXA 4EZ6A 1VSDA 4N56A 1VSIA 3TABA 4F3TA 2VG7A 4FW1A 2ZE2A 3AO1A 1JLGA 1C0UA 3KKRA 1CLQA 4F2SA 3DOKA 4CGHA 4DSKA 2KQ2A 4QAGA 2OPPA 3EYZA 4FLXA 1N6QA 3OS2A 3DLBA 2DFHA 4LY7A 4CJKA 4BE1A 4FVMA 1LWEA 4KI4A 4DTXA 4LSNA 4B9VA 1TAUA 5KTQA 1NK6A 3O4NA 4FK4A 1NK8A 1BI4A 4RW4A 1KVAA 3ZSRA 3NGZA 2D5RA 4DS4A 1A5XA 1IKYA 2ATQA 4KHSA 1JL1A 3AVKA 1JLEA 5EU7A 1L3UA 3PX0A 3O3FA 3OYAA 4DSIA 3MEGA 4KB1A 4DS5A 1KFDA 4CERA 4CFCA 4HUFA 2G8WA 3AV9A 3SPYA 4OJRA 3LZIA 1QSLA 3PO4A 4DQPA 4FCYA 3SUNA 1LAVA 2O4IA 2YKNA 3PUFA 1CZ9A 3QEPA 4KTZA 3PY8A 4MFBA 4RW8A 4CJ5A 3TAGA 5I42A 1IG9A 1ZBFA 3TR8A 4M3WA 4B8AB 3OYDA 3NHGA 1KVCA 1N5YA 4M3XA 3V1QA 1KLNA 1VSLA 4KV8A 4O5BA 3VQQA 3OYCA 3VQ4A 4KPYA 3DLGA 3I0SA 4R5PA 4J2AA 1KCFA 3MECA 4M42A 4OVLA 3CQ8A 3AVMA 2Z1JA 4H4MA 4CGJA 5J2PA 2D0CA 3LWLA 3QESA 4H4OA 1EXQA 1QS4A 4IG0A 2KZMA 5J2NA 1JLQA 2VG5A 3RWUA 4NCAA 3M8SA 4B8CA 4CJUA 3SI6A 3LWMA 1TKZA 3VQ9A 1O1WA 3V1RA 3V9WA 3C6TA 4FK0A 3KTQA 2A1SA 1HRHA 3SQ4A 1NK9A 1S1UA 1C6VA 3OYJA 2HMIA 3M8PA 1JXEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2E1ZA 3EKUA 4V19S 2Q3SA 3HP9A 5FPDA 2UXDK 3OYMA 4CCHA 1S5JA 1WBDA 1HNZK 4BRIA 3DJCA 1FXXA 4N5SA 5HLFA 1MDUB 5IWAK 1G99A 2F96A 3MN9A 4Q0BA 3FLCO 4H0TB 2UXCK 3RSEA 3MXJA 3CI5A 1I94K 4YOXA 4FJ9A 2KZZA 3DLKA 4H5RA 3WXMB 3BGRA 3S9HA 4PUOA 4O5FA 1B92A 4O0IA 3JS6A 2HSTA 1S1TA 2P9SB 3AGKA 4C8KA 4M3RA 1BGXT 4KHPK 1QZ6A 4F4KA 3DLEA 5GAEP 3SQ1A 4OLBA 3AARA 4I9QA 4JK7A 1K8KA 4JI3K 4HTLA 2D0BA 2F9TA 2YHWA 4JI2K 2F9WA 4B9NA 2ASOA 2RKIA 1L3SA 3WNHA 4DR6K 1VK0A 3O8MA 3SCXA 5C2DA 1EQYA 4JK8A 4JKDA 3K9KA 5DM7L 1XHZA 4WFNL 2RE2A 3WEEB 5M1FA 4ELTA 1BHLA 4DFJA 3Q7BA 3NH0A 1UWBA 1Z05A 4N41A 3SAHA 3SQ2A 3M8QA 4NYNA 1Q9XA 1TL3A 3AA4A 2HBMA 4CEOA 4GMJB 3DMJA 5EY4A 3V81A 2D0OA 4ELUA 4F9OA 2HHWA 3VA0A 4FYDA 4BVOA 2G8KA 5AQIA 1QZ5A 4PA1A 2O8FB 3IS9A 1KC8O 3E9LA 1RBUA 3O4WA 5AQUA 3K58A 1I3AA 3AO5A 3BY5A 3BZCA 1VSEA 1ZBHA 3FFKB 1TKXA 1T7PA 1BQMA 3K5OA 5LMNK 5JS2A 3L4QA 4CBUA 4E7JA 4N47A 5B8HA 1HX1A 5E41A 3T19A 2DFFA 4BRGA 4ILHA 4I6MA 4CIEA 2E2NA 1RDCA 5C12A 3K57A 4BRPA 3OYLA 5AQGA 5CY4A 3BDPA 1BO5O 3L3VA 4CEBA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1KFD A;  4CER A;  4CFC A;  4HUF A;  2G8W A;  3AV9 A;  3SPY A;  4OJR A;  3LZI A;  1QSL A;  3PO4 A;  4DQP A;  4FCY A;  3SUN A;  1LAV A;  2O4I A;  2YKN A;  3PUF A;  1CZ9 A;  3QEP A;  4KTZ A;  3PY8 A;  4MFB A;  4RW8 A;  4CJ5 A;  3TAG A;  5I42 A;  1IG9 A;  1ZBF A;  3TR8 A;  4M3W A;  4B8A B;  3OYD A;  3NHG A;  1KVC A;  1N5Y A;  4M3X A;  3V1Q A;  1KLN A;  1VSL A;  4KV8 A;  4O5B A;  3VQQ A;  3OYC A;  3VQ4 A;  4KPY A;  3DLG A;  3I0S A;  4R5P A;  4J2A A;  1KCF A;  3MEC A;  4M42 A;  4OVL A;  3CQ8 A;  3AVM A;  2Z1J A;  4H4M A;  4CGJ A;  5J2P A;  2D0C A;  3LWL A;  3QES A;  4H4O A;  1EXQ A;  1QS4 A;  4IG0 A;  2KZM A;  5J2N A;  1JLQ A;  2VG5 A;  3RWU A;  4NCA A;  3M8S A;  4B8C A;  4CJU A;  3SI6 A;  3LWM A;  1TKZ A;  3VQ9 A;  1O1W A;  3V1R A;  3V9W A;  3C6T A;  4FK0 A;  3KTQ A;  2A1S A;  1HRH A;  3SQ4 A;  1NK9 A;  1S1U A;  1C6V A;  3OYJ A;  2HMI A;  3M8P A;  1JXE A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E1Z A;  3EKU A;  4V19 S;  2Q3S A;  3HP9 A;  5FPD A;  2UXD K;  3OYM A;  4CCH A;  1S5J A;  1WBD A;  1HNZ K;  4BRI A;  3DJC A;  1FXX A;  4N5S A;  5HLF A;  1MDU B;  5IWA K;  1G99 A;  2F96 A;  3MN9 A;  4Q0B A;  3FLC O;  4H0T B;  2UXC K;  3RSE A;  3MXJ A;  3CI5 A;  1I94 K;  4YOX A;  4FJ9 A;  2KZZ A;  3DLK A;  4H5R A;  3WXM B;  3BGR A;  3S9H A;  4PUO A;  4O5F A;  1B92 A;  4O0I A;  3JS6 A;  2HST A;  1S1T A;  2P9S B;  3AGK A;  4C8K A;  4M3R A;  1BGX T;  4KHP K;  1QZ6 A;  4F4K A;  3DLE A;  5GAE P;  3SQ1 A;  4OLB A;  3AAR A;  4I9Q A;  4JK7 A;  1K8K A;  4JI3 K;  4HTL A;  2D0B A;  2F9T A;  2YHW A;  4JI2 K;  2F9W A;  4B9N A;  2ASO A;  2RKI A;  1L3S A;  3WNH A;  4DR6 K;  1VK0 A;  3O8M A;  3SCX A;  5C2D A;  1EQY A;  4JK8 A;  4JKD A;  3K9K A;  5DM7 L;  1XHZ A;  4WFN L;  2RE2 A;  3WEE B;  5M1F A;  4ELT A;  1BHL A;  4DFJ A;  3Q7B A;  3NH0 A;  1UWB A;  1Z05 A;  4N41 A;  3SAH A;  3SQ2 A;  3M8Q A;  4NYN A;  1Q9X A;  1TL3 A;  3AA4 A;  2HBM A;  4CEO A;  4GMJ B;  3DMJ A;  5EY4 A;  3V81 A;  2D0O A;  4ELU A;  4F9O A; 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3G10A

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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