3GOIA

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 171
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3goiA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3goiA01
2Q36A 3BF1A 3UKUB 2IVOA 1MA9B 1GLBG 4H0XB 2E2NA 5AQPA 3TPQA 2P9KA 3ZEUA 4B1UB 3QBWA 3IDHA 5KPZA 1NWKA 3C0BA 1HKGA 5AQVA 3U8XA 2Q31A 1Z05A 1QQOA 2A3ZA 4RCHA 4I6MB 4BR9A 1IJJA 4FWOA 3DXKB 3RSEB 5F0XA 1G99A 4JD2B 2ASPA 4FOIA 2P9PA 4H0YB 1C0FA 3AY9A 4MLEA 5AQYA 3FGUA 4BREA 5AFUA 3SLCA 3ULEA 3I33A 2QXLA 3MK6A 4DCHA 3W3DA 1EQYA 5EY4A 1HLUA 2QWPA 4BG9A 2GUPA 3LDOA 2D1KA 3GE1A 1JCEA 5AQRA 1NGCA 2QW9A 3HBTA 5AQMA 3UKUA 3ZX2A 5BREA 1QHAA 2CGLA 1Y64A 4M7XA 1P8ZA 1YXQA 3BEXA 1BA0A 3F9MA 4BGAA 5LJWA 4H0OA 3SJHA 4FPBA 1U6ZA 3U9ZA 1XC3A 4ISGA 2Q1NA 3VF4A 4I6MA 4BR2A 4ISFA 4K43A 2WUSA 3DXKA 3FR0A 3RSEA 2AP1A 2IVPA 1JCGA 4BGBA 2P9SA 4M7YA 3HZ6A 1LCUA 2EWSA 4BRIA 3FZKA 3L4IA 4WQ4A 2DPNA 3EKSA 4BC5A 5LJVA 4AM6A 1CZAN 1DEJA 5FPDA 1NM1A 1T6CA 2W40A 3CQXA 3B8AX 1HKBA 4CZEA 4O8KA 1BDGA 5AQXA 2QWNA 3A8YA 3QMLA 4DB3A 1NBWA 3G25A 4H5VA 2GTDA 3FFKB 1DKGD 3H3OB 3CJBA 4BR7A 4FWLA 4M63C 4F9OA 3JXUA 4MO5A 1SZ2A 3WXIA 2E2OA 2E8AA 4WQ5A 2A5XA 2P9KB 5AQQA 4B1ZA 3QFUA 5BR9A 4QS8A 4BC4A 3LDPA 1JCFA 3HI0A 1WOQA 2KHOA 1KAXA 1YVNA 3LM2A 4ISEA 3QBXA 2E20A 1QQNA 4H0PA 1TUUA 4CZMA 2VWBA 1BA1A 2GEMA 1V4SA 4J8FA 5AQZA 2FSNA 2ITMA 4B1VA 4IXCA 3L0QA 4CZJA 1NLVA 2FF6A 2PAVA 3M1FA 4BQLA 2QWLA 3VEYA 1ATNA 3IFRA 3H6EA 3AAPA 3DXMA 3IUCA 4A61A 5BN9A 1C0GA 2VYPA 3CJAA 1S22A 2V7YA 1RFQA 4BR4A 3O8MA 2YHXA 3A5LC 2E1YA 1NGGA 3TU5A 5ADXH 3GOIA 4KBOA 1BWFO 4H03B 5AQUA 3A5NC 2AA4A 3D2EB 4NO7A 5E26A 4BRGA 1KAYA 4BG8A 4CBUA 5AR0A 5BPMA 2NLXA 1Q18A 4K42A 4A2BA 1E4FT 2P9SB 2Q0UA 4MLHA 1S3XA 2UYTA 2Q2RA 3QFPA 3VPZA 5AQKA 1IG8A 3FZFA 3O1BA 5AZIA 3ATVA 1WUAA 5F1XA 2YJEA 2ZF5O 3MCPA 4XH5A 1SQKA 1ZBSA 1D4XA 3U9DA 3ATUA 3W0LA 4HTLA 4BRCA 4EAHD 2NRHA 2FXUA 3CI5A 3H1VX 1NGDA 2I7NA 3LDNA 1ATSA 2IIRA 1HX1A 3EL2A 5AQNA 5JLFA 3SMPA 2ASMA 3MN9A 2QWRA 5JMVA 1SAZA 5EXWA 3WXJA 4JNEA 2CH6A 1GLLO 5CE3A 3O80A 3O5BA 3D2EA 1RDWX 3VOVA 2P9LA 4FWNA 3ENOA 5AQJA 5AQTA 1NGJA 4MO4A 3VESA 3ZX3A 5FPMA 1YUWA 4H5RA 5AQOA 4H0VB 5BPNA 5AQGA 2ZGZA 1YAGA 5I9EB 3HM8A 2I7PA 5ELZA 4PKIA 2D4WA 4DHYA 1ZC6A 1GLDG 5EX5A 3BUZB 2W41A 3C7NA 3LL3A 3S41A 1K8KA 1J6ZA 2D0OA 2CGJA 4PL7A 3GDQA 4B1YB 3LDLA 4WQ4C 3MN5A 3DXMB 3FZMA 4QS9A 5KPTA 3CERA 4H5WA 4FWPA 2P9UB 1TYQA 3CETA 1T6DA 4XH4A 1MDUB 3P4IA 1GLJO 2YHYA 2QWOA 5BPLA 4BRPA 3VGMA 2E2PA 2YHWA 3DJCA 1NGHA 5AQWA 4YDUA 3GBTA 4E1JA 4BRDA 4BR5A 4CJ7A 1NGFA 4WQ5C 1NGIA 2ZGYA 2CH5A 4EHTA 3H45C 3WXLA 4GNIA 2NZTA 2PBDA 3A0IX 1NGEA 4IZ9A 5AZIB 4B1XB 1R59O 4B1WB 2BUPA 3ZETA 3WQTA 4BC2A 1HUXA 3EN9A 3KVGA 1HKCA 5ADXA 1DGKN 4RWTA 4NB4A 5AZJA 3HTVA 4CZKA 3AARA 5BRDA 2HF4A 4AM7A 1XQSC 3VEZA 5B8HA 3LM9A 3MMVA 3ZX0A 4JHDB 2P9UA 3O6WA 1BG3A 3CIPA 2FLOA 4EFHA 5F2RA 4Z94A 4K41A 5AQFA 3H1QA 3VEOA 1ATRA 2P9LB 4BQZA 1HJOA 3I8BA 3JS6A 3BP8A 5KQ8A 4FOEA 5FPNA 4H5TA 2P9IB 2E88A 2ASOA 2E2QA 2OANA 2V52B 4IWVA 4DQ8A 4JAXA 1QZ5A 4XEIA 2GWJA 3WUHA 4FPAA 4WYBA 3FE1A 3VF6A 4A62A 3GG4A 4BVPA 1U2VB 2F9WA 2QWMA 3QB0A 2V51B 1NGBA 2E1ZA 3UB5A 4CI6A 1ZXOA 1H1VA 1NMDA 4H0TB 4LC9B 4EIAA 4PKHA 3O4WA 3QICA 4O5FA 3C7NB 2H3GX 1K8KB 3ID8A 2J4RA 4EHUA 1E4GT 3VEWA 4JHDA 3AAQA 3R8EA 1BOTO 1X3MA 3D2FB 3GL1A 3VERA 5EOYA 3CHWA 2GELA 1MWMA 2ZWHA 1X3NA 1TYQB 4FWMA 4XH1A 4K25A 1Z6RA 5KPRA 4CZLA 4CZIA 3SK3A 4CD1A 2HF3A 3O1WA 4BVOA 3A5MC 1HPMA 1V4TA 3IMXA 5EVZA 3EZWA 4CBXA 5BRHA 4CZFA 1NGAA 2FSJA 4RTFD 5FPEA 2P9IA 4L3QA 1T44A 4BRNA 4CD3A 5AQLA 2YJFA 4BRFA 1LOTB 3DAWA 3UKRB 4FSVA 4FWSA 5AFUH 2YI1A 3EO3A 4FO0A 1BUPA 4GY2B 2FSKA 1U2VA 2A40A 3M3ZA 2V7ZA 3ZETB 4H5NA 3CJ7A 3OHRA 3D7EO 3WXKA 5AZJB 1RGIA 4BR0A 4IJNA 4JD2A 3HSCA 3KHYA 2GWKA 2A6AA 3CQYA 4FL9A 3CJ1A 2P9NB 3D2FA 4BC3A 3VGKA 4IJAA 3WT0A 3M6GA 1QQMA 4CZHA 2D0PA 1KXPA 3FLCO 3VF2A 4CBWA 3EKUA 3QDKA 3WEEB 1X9JA 3CJ9A 1KAZA 4BRKA 4CZGA 3O08A 1XUPO 3L6QA 3FZHA 2VCPA 4BRMA 4BRLA 3U4LA 5BN8A 3MN6A 1BU6O 4FWQA 3UKRA 2IVNA 2Q0RA 3R6MA 3VEVA 1GLAG 4PL8A 4BROA 2FF3B 3VEXA 2F9TA 5AQHA 3R9PA 3ZEUB 3MDQA 3UE5A 2HOEA 4HWIA 2QWQA 3BF3A 2CGKA 3WQUA 1GLFO 4YDUC 3CJCA 3FZLA 2A41A 2HMPA 4FWKA 2Q97A 4QS7A 3VETA 3A5OC 4IO8A 1GLEG 3ENHA 2P9NA 1GLCG 4PKGA 5LY3A 1OKJA 5E84A 5AQSA 3H46O 2P9PB 3SMSA 4B9QA 1ESVA 3DWLA 4FWRA 5TKYA 4BRHA 2A42A 2QM1A 4C23A 3H3NO 2BTFA 4A2AA 1QZ6A 3VENA 3MN7A 3WEEA 3LDQA 3ULEB 4BRAA 5KQDA 4Y0WA 1MWKA 3VGLA 4JN4A 3J8AA 5JICA 4BRQA 1TUYA 5JLHA 5BRFA 3KZBA 2YCHA 5AQIA 1BO5O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F5TA 3UKUB 2F7TA 4FLXA 3TAGA 5AQPA 3O3GA 1NJYA 2KTQA 3MXIA 4LH5A 1NJWA 3AO4A 4IFEA 3CCLN 3NGIA 1HKGA 4R5PA 3V9SA 4JI8K 4LFAK 3TWHA 2Q31A 2BE2A 4RCHA 1FKPA 4BR9A 2RHKA 4O4GA 1G99A 2ASPA 4FOIA 5FRMA 1TKZA 2QKKA 1Q9YA 3C6UA 4J2AA 3P31A 3KLIA 2HNDA 3OJUA 1RTDA 3SLCA 1JKHA 4HUEA 2PY5A 3CFOA 5I3UA 2QXLA 4A59A 3W3DA 4E19A 3V6DA 1RT1A 2QWPA 1OH7A 3AA5X 3IG1A 3HBTA 4DV3K 4ELTA 3UKUA 3ZT2A 4AILC 2CGLA 3KK3A 1IKYA 2JLEA 3BEXA 3F9MA 4CGJA 1XNRK 1WSHA 4Q0BA 3AO2A 1XC9A 4ISGA 4Z0UA 2Q1NA 3VF4A 4K43A 3RMCA 4BGBA 4FJ9A 4FK4A 5GINA 2DPNA 3EKSA 3CQ8A 4BC5A 1DEJA 4BDPA 5FPDA 1NM1A 4U7BA 3WNFA 4B9VA 3L2QA 1Q86O 2W40A 1C0TA 3G0ZA 4O8KA 3A8YA 3T19A 2GTDA 5KGXA 4BR7A 1K73O 4CHQA 4FWLA 4IG0A 4I9LA 2JGUA 3V9WA 1WBDA 2O8CB 2ZJQL 3WXIA 4CK2A 1LWFA 2YNIA 2P9KB 5AQQA 3EZ5A 5JS1A 4QS8A 2KW4A 5A2QO 1KLMA 2LSNA 1JLQA 4F2RA 4WF9L 3KLEA 3SUOA 1YVNA 1JLGA 3QBXA 2E20A 4H0PA 4Z4EA 1TUUA 3QEXA 1JLFA 1BA1A 2YNHA 3U3YA 1NMNA 2FSNA 3L0QA 3KWGA 3MAQA 1D5AA 2ZE2A 3T1AA 3H6EA 3S9HA 4LD0A 3DRSA 1C0GA 3EYZA 4JKGA 4GMJB 2O8CA 1EXQA 3A5LC 5I42A 4DV1K 5T7BA 1NGGA 3GOIA 4DWIA 2QTDA 2Z1IA 3G6EN 2VQFK 2OPQA 4CF0A 3VA0A 3PLAA 4IKFA 4FJXA 3D2EB 4BRGA 4R79A 4CBUA 3NH0A 4CGIA 4K42A 2P9SB 3AO1A 2Q0UA 1C0UA 2Q2RA 5GIOA 1TK0A 3FZFA 2NRVA 3UIQA 3ZSWA 2YJEA 2ZF5O 2BDPA 3O9UA 3MCPA 4XH5A 3K9KA 3L2WA 3U9DA 3HPOA 1LV5A 4DQPA 4EAHD 3B6PA 3NF8A 1NU0A 3OYCA 5HP1A 2FXUA 3HVRA 3CI5A 2I7NA 3F73A 2YKMA 3QEVA 3LAMA 3SMPA 3OYEA 1IBKK 5GIPA 3D2EA 3LZJA 4FWNA 4W5NA 2YV0X 4PHTX 3LANA 4MO4A 4DG1A 1TKTA 4H5RA 4CJRA 4B9SA 1RTIA 1OVYA 2ZGZA 5I9EB 3FFIA 4OX9K 3DLEA 4B3RK 3ULDA 1JLEA 4FK2A 1S1TA 5EX5A 2W41A 1WN7A 3S41A 1LAVA 4YOUA 4M45A 3OTOK 5DMRA 4PL7A 3QINA 1K8AO 4WQ4C 3MN5A 3P5JA 3PX6A 4H5WA 4CEDA 2FC0A 4JKCA 3CM6A 2G8HA 5C0YA 4DR1K 1MDUB 2YHYA 2QWOA 1TAUA 3VGMA 1S1VA 3PUFA 4YDUA 3VQPA 1YJNN 1ZBFA 2NRXA 4E1JA 1DLOA 2GV9A 4FK0A 3SQ4A 3V4IA 1NGIA 2CH5A 4FJ7A 3SPYA 4EHTA 4AHSA 4CGHA 1R59O 4KPYA 1IBLK 4JKHA 3I8DA 4LF6K 4ILGB 3VQ4A 4C8OA 5AZJA 3HTVA 3AARA 2HF4A 4AM7A 1YJWN 3HL8A 2OA8A 4ID1A 3ZX0A 1WSFA 4JHDB 1XMOK 3O6WA 1TV6A 3AVGA 1VQLN 2VG7A 1DTTA 1NOYA 2E4LA 5FLXO 4EFHA 1TGOA 5F2RA 2WBNA 4Z94A 3S3NA 1T7PA 5AQFA 2B5JA 3AVMA 3H1QA 3RMDA 3MXMA 5CYMA 4OKEA 1YT3A 3VEOA 2XHBA 4AHUA 4BQZA 3CF5L 4DTUA 1B9DA 4IOXA 4FOEA 2P9IB 4FVMA 4DR2K 2V52B 4IWVA 4DQ8A 3PX0A 3THVA 4FJ5A 1BHLA 3WUHA 3TABA 5J2NA 1YITN 4O5BA 1TK8A 3GG4A 3TSPA 4F4KA 4BVPA 1U2VB 1EWQA 4B9UA 2HB5A 5HRRA 2GX9A 4CI6A 2IC3A 5KI6A 4H0TB 4FLTA 3QICA 3C7NB 1N33K 1K8KB 3WNEA 2EHGA 2P5OA 4YOXA 3VEWA 1RDAA 4JHDA 3AAQA 3MCAB 2PZSA 4KHSA 4M3YA 3D2FB 4BE2A 4JLHA 3HPGA 4C8LA 4FWMA 3ZSOA 5IT9O 2VG6A 2NUBA 3T1HK 1ZBHA 4CD1A 4GV6A 2HF3A 4DQQA 2IAJA 4KHWA 1V4TA 3SJJA 4CBXA 2X6NA 4CZFA 1VSHA 4AF1A 2P9IA 1D9DA 1RT7A 4WFAL 4HCBA 5AQLA 4N5SA 1LOTB 3DAWA 3UKRB 2XY6A 1BUPA 1U2VA 2AJQA 1JXEA 2A40A 4DMNA 3J81O 3THYB 3QIPA 3BDPA 4ZHRA 3NH1A 4IJNA 2O8DB 3CJ1A 3D2FA 2XY7A 1U47A 4IJAA 3IKMA 4DR7K 4KREA 4N41A 3DYAA 4DV2K 3DLGA 4JYAK 4WE1A 1KVAA 3EKUA 3QDKA 4CZGA 4IG3A 3O08A 2R7YA 4KHUA 1XUPO 4CIEA 4J2EA 4BRMA 1VSKA 3U4LA 4JS4A 4CHPA 4E7IA 3OYJA 1EKEA 4DR6K 1CZ9A 4JI3K 1NJXA 3UKRA 4CJVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3D7E O;  2DFF A;  5C24 A;  2GWK A;  3CQY A;  2B4J A;  3MWT A;  4FW1 A;  1NG9 A;  2UUB K;  1A5V A;  1UOC A;  4DU3 A;  2KKZ A;  5JS2 A;  3TAF A;  3WT0 A;  1X9W A;  3TR8 A;  3M6G A;  2D0B A;  1F21 A;  4A5B A;  1P90 A;  3SQ1 A;  1KXP A;  2VGN A;  5IWA K;  3FLC O;  3VF2 A;  5KTQ A;  3WEE B;  4CES A;  3NFA A;  4A5A A;  2QEX N;  4KH5 A;  3P83 D;  4BE0 A;  5E41 A;  3MN6 A;  4JKB A;  2KQ2 A;  3CFR A;  5M1N A;  3VEV A;  5C12 A;  3LAL A;  4BRO A;  3VEX A;  4FLY A;  2HOE A;  2HHT A;  2QWQ A;  1BI4 B;  3AVN A;  3IAY A;  3FZL A;  4QS7 A;  2VGM A;  2WTU A;  3OYA A;  5LY3 A;  1OKJ A;  3SMS A;  4B9Q A;  3D0P A;  1ESV A;  1N5Y A;  3L3V A;  2A42 A;  2QM1 A;  3BY5 A;  4CFD A;  3H3N O;  4A2A A;  4CHY A;  1QZ6 A;  3VEN A;  3WEE A;  4NCA A;  1L3S A;  5KQD A;  4Y0W A;  1MWK A;  4K8Z A;  3J8A A;  4I7F A;  3KKR A;  4B8A B;  3SQ2 A;  1T03 A;  1EX4 A;  3I0R A;  5BRF A;  3HVT A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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