3H1VX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
446
structure length
446
Chain Sequence
MVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The design and optimization of a series of 2-(pyridin-2-yl)-1H-benzimidazole compounds as allosteric glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 172
structure length 446
sequence length 446
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h1vX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3h1vX01
1G99A 3BF1A 4PKGA 2D4WA 4B1VA 3HZ6A 3VGMA 3AARA 3O1WA 3ULEB 3SMPA 3VF4A 1ZXOA 2E2OA 2GELA 3CQXA 4DCHA 4FWMA 4M7XA 1RDWX 3C7NA 4B1UB 4EIAA 3ZEUA 4K41A 4BR9A 4EAHD 1NGGA 5LJVA 3VETA 1KAYA 2YI1A 3H3OB 4FPBA 3U4LA 5E84A 3H46O 3FR0A 3WEEA 3O6WA 3SMSA 3BF3A 3M6GA 1S3XA 2QWPA 1NGEA 4BGBA 4BG9A 3QICA 4XEIA 1NGBA 4FWNA 2P9IB 5LY3A 2V7ZA 4CBUA 3CETA 5AZJA 3AY9A 3DXMA 1ATSA 4CD1A 5AQTA 1R59O 2FF6A 1QQNA 4JD2A 5EX5A 3ZX3A 3WXJA 1ZC6A 2P9UA 4EHUA 5AFUH 4CZJA 5AFUA 2D1KA 3DXKB 1DGKN 5AQVA 3A5MC 4FWLA 4IJNA 2P9LA 4JAXA 3W0LA 3VERA 2E2PA 1BA0A 3A5OC 3MN5A 4B9QA 5BPMA 4DQ8A 3CQYA 2ASMA 2A40A 4B1XB 2E2NA 2E88A 1BG3A 4AM7A 4RTFD 1NGAA 1GLCG 3ID8A 1GLAG 3AAPA 1YXQA 5F2RA 5JICA 4FWOA 3O8MA 5KPZA 3MN7A 2W40A 3HI0A 3IDHA 2ASPA 3QDKA 3UE5A 2QW9A 3AAQA 3FZHA 2FF3B 3VGLA 4CZHA 4BRCA 4FWKA 1TUYA 2VYPA 4BRIA 3G25A 4K43A 4PKIA 1NGHA 2EWSA 2ZGZA 3KZBA 4QS8A 5AQIA 3VEVA 4AM6A 4PKHA 2GWJA 3O08A 4H0OA 5EVZA 1K8KA 2YJFA 2QWOA 4BRHA 4DB3A 3O5BA 3HBTA 1U2VA 4YDUC 2FSJA 5JMVA 3SJHA 4BQLA 2UYTA 1HLUA 1HX1A 3I8BA 4CD3A 5E26A 5AQSA 4JHDB 4CZMA 2AA4A 1NGFA 2IVPA 3VEZA 5BRHA 1BA1A 2P9SA 3EKSA 3WXLA 4ISFA 5BREA 4RWTA 1NLVA 1E4GT 4BR5A 2YCHA 4MO4A 1XUPO 1Y64A 1JCEA 4GY2B 4IZ9A 4B1ZA 2NRHA 1V4TA 3CJ7A 3D2EA 2OANA 2F9TA 5AQMA 3UKUB 1SAZA 5AZIB 5AQUA 3FE1A 2F9WA 3QMLA 5AQRA 3LDPA 3CJCA 3I33A 4IWVA 1JCFA 4QS9A 1GLBG 1WUAA 3SK3A 2ITMA 2IVOA 3BEXA 3H45C 1ZBSA 5KQDA 3GBTA 4A62A 2CGKA 1NGIA 1QZ5A 3H1QA 5KQ8A 3DWLA 3UB5A 4BRAA 4BRGA 5AQGA 1BO5O 3HM8A 1ATRA 4YDUA 2VWBA 4CZIA 3B8AX 4H5VA 4CZLA 1KAXA 1EQYA 3WUHA 3JS6A 5JLFA 2HF3A 4B1WB 3QFUA 1BOTO 3WXIA 5JLHA 2P9IA 4FO0A 2P9NA 1KAZA 3CIPA 3LDQA 2Q0RA 3MK6A 1QHAA 4MLEA 5CE3A 3OHRA 2GTDA 3LDOA 3ZETA 5BN9A 4ISEA 3W3DA 5BPLA 3DXKA 3KHYA 2I7PA 5ADXH 5ADXA 3LL3A 2HMPA 1WOQA 4JNEA 1U6ZA 3J8AA 2E20A 3UKRB 1HKGA 2HF4A 4IJAA 1MWKA 4NO7A 5EOYA 2E1ZA 4FWSA 1DEJA 5BRDA 4H5TA 4BVOA 4H0TB 3EN9A 3A5NC 3BP8A 2QWMA 3GDQA 3L6QA 3VENA 3VF2A 4LC9B 3VEOA 2W41A 1ESVA 2QWRA 2KHOA 5AZJB 1GLJO 2QWQA 4FL9A 4C23A 3FGUA 2VCPA 4BRKA 2WUSA 4WYBA 1C0GA 2Q36A 3GOIA 4JN4A 4F9OA 4BVPA 2YHWA 3VEYA 1X9JA 3WXKA 5AR0A 3MDQA 1MA9B 3KVGA 3CJ1A 4HTLA 3IMXA 5ELZA 4IO8A 5AQFA 3FFKB 1NGCA 4XH4A 3CHWA 1IJJA 4MO5A 4IXCA 4NB4A 3R6MA 1YUWA 5EXWA 4BRNA 2A3ZA 4BR0A 1GLLO 2IVNA 4CJ7A 4Z94A 3RSEB 4BRFA 1X3NA 5AQOA 2DPNA 4JHDA 3CJAA 2NZTA 3VEXA 3R8EA 5AQQA 5AQNA 3VOVA 3ATUA 5AQLA 3VESA 2A5XA 2PAVA 4H5WA 2QWNA 5AQJA 2FSKA 2FSNA 4WQ4C 3SLCA 3ATVA 3MN6A 3A0IX 3VF6A 5AQHA 4H5NA 2A41A 5AQWA 1NBWA 2J4RA 3UKUA 5AZIA 3TU5A 4BR7A 1E4FT 3P4IA 4BC2A 1NWKA 1GLFO 3CJ9A 5AQKA 4E1JA 2Q0UA 3U9ZA 3LM2A 3MMVA 1QQMA 4I6MB 2CH6A 1TYQB 4BRQA 4BC4A 3D2FB 4BR2A 1V4SA 2AP1A 2V7YA 2CGLA 3FZKA 5F0XA 3ULEA 3FLCO 1H1VA 3ZX2A 4CZKA 4BROA 2P9PB 2P9KB 3U8XA 1IG8A 5FPMA 3DAWA 1J6ZA 1HPMA 1T6DA 3EO3A 1C0FA 5F1XA 4WQ5C 4CI6A 4EHTA 3A8YA 2FLOA 4WQ4A 4H0PA 2ZF5O 5FPNA 4MLHA 2QXLA 3F9MA 1KXPA 4BC5A 1QZ6A 1Z05A 3O4WA 1Q18A 2D0PA 4EFHA 3L4IA 2V51B 1YAGA 2E8AA 3H3NO 3C7NB 3GG4A 3S41A 3UKRA 3ZEUB 4CBXA 4K25A 4BG8A 1NGJA 2Q1NA 3IFRA 1T6CA 5BPNA 3WEEB 4PL8A 5KPTA 1HJOA 4XH1A 3VEWA 4WQ5A 1NGDA 2P9NB 2V52B 2Q31A 3QBWA 3D7EO 1XC3A 2PBDA 1BDGA 3WQUA 4BRPA 2D0OA 4BRLA 3ZETB 2NLXA 2GUPA 3DXMB 3EKUA 4FOEA 3EL2A 4H0XB 4O5FA 5KPRA 2GEMA 4JD2B 5LJWA 3CI5A 1JCGA 4BRMA 1T44A 2P9UB 1BWFO 4HWIA 2H3GX 4CZFA 4BREA 4BGAA 4O8KA 1CZAN 3WQTA 1YVNA 2I7NA 3CERA 3IUCA 5AQXA 2QM1A 1ATNA 4ISGA 3ENHA 5AQZA 3ZX0A 2P9LB 1RFQA 1RGIA 3FZLA 3QFPA 1HUXA 5FPEA 4QS7A 3RSEA 1HKCA 1NMDA 2BTFA 4XH5A 5BR9A 1OKJA 2HOEA 4GNIA 1SQKA 3HTVA 4L3QA 3ENOA 4M63C 2A42A 4FWQA 4FWRA 3VPZA 4CZEA 2IIRA 3DJCA 3FZMA 1LCUA 4BRDA 1X3MA 5B8HA 1DKGD 1BUPA 1QQOA 3H6EA 1BU6O 2BUPA 3HSCA 3EZWA 2ASOA 4M7YA 3MN9A 4PL7A 1MWMA 4H5RA 3VGKA 3U9DA 5AQYA 1Z6RA 4K42A 2YHXA 3C0BA 3QBXA 3BUZB 1GLEG 3GL1A 3MCPA 3WT0A 1LOTB 2E1YA 4I6MA 1P8ZA 4KBOA 4DHYA 1TYQA 3D2FA 3LDNA 4A2BA 1SZ2A 4BR4A 1TUUA 2CH5A 3M1FA 2CGJA 2P9PA 2A6AA 4FSVA 1MDUB 2P9KA 5EY4A 1K8KB 4B1YB 1XQSC 4FWPA 4J8FA 4A61A 3JXUA 3M3ZA 5FPDA 1NM1A 4BQZA 5BRFA 1GLDG 4H0VB 1U2VB 1HKBA 4FPAA 4FOIA 5AQPA 4CBWA 2QWLA 3LM9A 4A2AA 4H0YB 3O1BA 3QB0A 3FZFA 4BC3A 2P9SB 1S22A 3L0QA 3CJBA 2YJEA 5BN8A 2GWKA 3A5LC 3H1VX 2ZWHA 1D4XA 2FXUA 5I9EB 3O80A 2Q97A 3D2EB 3R9PA 4RCHA 4Y0WA 3LDLA 4H03B 5TKYA 4CZGA 2YHYA 3TPQA 2ZGYA 2E2QA 2Q2RA 3GE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D4WA 1LV5A 3HZ6A 3HL8A 4IEEA 3ULEB 3HSTB 1WSJA 4NCAA 4KH5A 4M7XA 1N8RO 3ZEUA 3MECA 4PHTX 3VETA 1KAYA 4BDYA 3OW2M 3U4LA 4FYDA 3RR8A 3FR0A 1WBDA 1QSLA 4FJLA 3O6WA 3SMSA 4J2EA 3L2QA 4Q0BA 1VHXA 3DYAA 2WTUA 2GUIA 4PA1A 5LY3A 5J2PA 4CBUA 4DQPA 1BCMA 3AY9A 1RT3A 3DXMA 3KD5E 1QS4A 3PIPL 1R59O 2FF6A 4RW6A 1EX4A 3T7ZA 3Q7BA 3DLKA 2D1KA 5AQVA 4JI3K 2XY7A 4A57A 1ZBFA 1A5XA 3TAEA 4LF5K 1C6VA 3T3FA 3DI6A 4DV0K 2E2PA 1GOCA 2XY5A 4B9QA 3CQYA 3DRPA 4G1QA 5TKWA 3PO4A 4LFBK 2E88A 4DSLA 4B9LA 4AM7A 1KD1O 1NGAA 4DUZK 4DU4A 2ETJA 3OYLA 2F8SA 4OPJA 3RMDA 1YXQA 3ZT2A 4HCBA 3TAPA 3T1AA 2W40A 2Z1GA 3HI0A 3OTOK 1TKTA 2QW9A 1YTUA 4QOZB 2QEXN 4CK1A 1TUYA 4OGEA 4DF8A 4DTOA 4B9TA 3AA4A 2EWSA 2ZGZA 5EVZA 3QIOA 1BIZA 3G71N 3AVMA 4IOAL 3I8BA 4JHDB 4CJFA 5BRHA 4Z4EA 4C8OA 3ITHA 2P9SA 1OVQA 4YOWA 3WXLA 2HBMA 3M5RA 3O9TA 3VTHA 4ISFA 4DF4A 3NF6A 2FBXA 3P83D 4CJRA 1B92A 1J54A 4IZ9A 2NRHA 3D2EA 4V19S 3PLAA 5AQMA 3QETA 5AQUA 4IOCL 3FE1A 2F9WA 4YOTA 1RDCA 1WUAA 1A5VA 4DFJA 3BEXA 3THWA 3L2UA 2ZD1A 4LD0A 2CGKA 3OYJA 2UUBK 1NGIA 5JVGL 3DWLA 2HBLA 1IBKK 1RCHA 5AQGA 1ATRA 2BANA 1XC9A 4I2QA 1T05A 4H5VA 4CZLA 1KAXA 4DSEA 3K9KA 3PUFA 2OTLN 1JL1A 4YORA 3DRRA 3WXIA 3THXA 5JLHA 3SCXA 1YJNN 3VMFB 2ZJPL 2P9IA 1R0AA 3CQ8A 1JLGA 2B4JA 3MK6A 4AHUA 2VGNA 1FKPA 1LW2A 3OHRA 4IEIA 4ISEA 4CJVA 3K5LA 1WBBA 3KHYA 5BR8K 5ADXH 4JNEA 1U6ZA 4IFEA 3J8AA 1YJWN 3UKRB 1VQKN 2OPQA 1EO1A 2YX6A 4JK8A 2NRWA 4PUOA 3ZLJA 2HF4A 2O4GA 1MWKA 2O8CA 5EOYA 2E1ZA 3AA2A 3EE9A 3LANA 4H0TB 4DU3A 1VSJA 1OH8A 2QWMA 3AVGA 1BCOA 2X6NA 4DR5K 3MEGA 2QWRA 2KHOA 4M41A 1GLJO 4FL9A 2NRXA 5CY4A 1ZBHA 2PY5A 1RDDA 2RPIA 3TTCA 1NG9A 3GOIA 3OY9A 2UXCK 4ILJA 1K8AO 1X9JA 1RTIA 1XMQK 3PSFA 4GW6A 3CC4N 5FRNA 1QVGM 2HHTA 1RTHA 1REVA 3OYFA 4IO8A 5AQFA 1NGCA 4NB4A 4E1NA 3O3HA 5EXWA 4BRNA 3NVMA 4L8RB 2D0BA 1ZYQA 4JEPA 4CCHA 1S9GA 4BR0A 3OBWA 4CJ7A 4FM1A 4NCBA 3CCUN 3SAGA 4HTUA 5AQOA 3HPOA 1E3MA 3VEXA 1C1CA 3R8EA 3DOKA 2A5XA 2PAVA 2FSKA 2FSNA 1Q82O 4DQIA 3RMBA 3MEDA 4IG3A 4JKCA 3A0IX 2VWKA 5AQHA 2R7YA 4M42A 3UKUA 1NBWA 3TTFA 1GLFO 3CJ9A 2D5RA 1BI4B 1QQMA 1TGOA 2O8EA 1VQMN 4ICLA 4BC4A 4BR2A 3HT3A 1VRUA 4BROA 3CFOA 2P9KB 3QEWA 2UXDK 1NKBA 1VQPN 4B8AB 3DAWA 3SJJA 1HPMA 3DLGA 1NJWA 2PZSA 5GIPA 4CEBA 3EO3A 4YNQA 4CI6A 5J2MA 3VQAA 4WQ4A 2ZF5O 1HNZK 3F9MA 3CPEA 1KXPA 4BC5A 1TKXA 3IKMA 4A5AA 1Z05A 4IO9L 1I39A 2XO7A 1KSPA 3DLEA 1LW0A 4PY5A 4N76A 2XY6A 1XWLA 4NXNK 3L4QA 4RW7A 2YNFA 3DOLA 2UU9K 4E7IA 4O44A 1RT5A 4BWMA 3S41A 4CBXA 3JYTA 3HO1A 1NGJA 3IFRA 4CJUA 4PL8A 4JV5K 4CEAA 5KPTA 2ATQA 4CW7B 4WQ5A 3QO9A 4HUEA 3NGZA 3QBWA 1O1WA 1XC3A 4JKFA 1BDGA 2F4VK 4BRPA 1D5AA 4BRLA 3LALA 4X62K 4DFPA 2NLXA 3EKUA 4FOEA 1X9MA 3EL2A 3HK2A 2GEMA 3E9PA 1TAQA 3THVA 2HHUA 3D0PA 1Y97A 4CZFA 2H3GX 3HXMA 2I5JA 4U67L 1JLCA 4BGAA 2QKKA 1CZAN 4DS4A 1YVNA 2HVHA 1BL3A 3ZSXA 2QM1A 4ISGA 3ENHA 5AQZA 4FJ9A 2O8CB 1RGIA 5AJ3K 4IDHA 4DTMA 4KFBA 1G15A 5FPEA 4YOUA 2E5LK 1HKCA 3ALYA 4CF2A 1K6YA 3HTVA 1QSSA 3TAQA 4B8CA 4DU1A 1X3MA 4JKBA 2HBJA 4JI6K 3SBGA 1QQOA 3KK7A 2F8TA 1IV0A 4M7YA 3HRGA 4AHRA 1BQMA 3U9DA 1M90O 4DG1A 4M45A 1W97L 3J7ZO 3PX6A 3KIOA 2PYLA 3TAMA 4CJTA 3RRHA 3MCPA 1VK0A 1P8ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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