3H3NO

Glycerol kinase h232r with glycerol
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
501
structure length
501
Chain Sequence
AEKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYRFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKFKAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Enterococcus casseliflavus
publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glycerol kinase
total genus 185
structure length 501
sequence length 501
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2009-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h3nO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h3nO01
4CZHA 3LDLA 2V52B 5BPMA 2NZTA 3CJ7A 3UB5A 2P9KA 4FPAA 4H0VB 4BREA 2Q2RA 2YHYA 3ZEUA 4H03B 4FPBA 5TKYA 1BOTO 3ENOA 1NLVA 3O5BA 3FZLA 4BRNA 3MN5A 4H0TB 4BRDA 5LJWA 1XUPO 2FLOA 4CD3A 3BF1A 5B8HA 2Q0RA 3WUHA 1ATSA 3UKUA 4JD2A 4YDUA 5AQTA 4BRGA 3L4IA 1TYQA 1NGAA 1TUYA 4ISEA 4PL8A 4ISFA 4B1ZA 5FPEA 5AZIA 4MO5A 3A5OC 2A6AA 3FZHA 4FWPA 4F9OA 4K41A 2CGLA 3A8YA 3KVGA 1C0GA 4BC2A 5JICA 2UYTA 3CETA 1QZ5A 2P9UB 5AQXA 5EX5A 3GE1A 3C7NB 1BUPA 1Z6RA 3A0IX 3D2FA 1WOQA 3AY9A 3AAPA 3CIPA 3VESA 4A61A 1DGKN 4EFHA 1GLAG 3ATUA 3CJCA 3DXMA 3CJAA 2P9LB 4BROA 2P9PA 2GTDA 3D2EB 4BRFA 2AA4A 4BGAA 1X3MA 3VEYA 4IXCA 4AM6A 2E2PA 3VF6A 4XH1A 2Q1NA 4FSVA 3LDQA 3QBWA 5BRDA 5AQSA 4B1WB 2FSJA 4WQ4A 4CZKA 2GELA 5JMVA 4BRMA 1Q18A 1X3NA 3VEOA 1NGBA 1TUUA 2A40A 1IG8A 2GEMA 3M3ZA 3QBXA 5AQRA 3SMPA 3SMSA 2A42A 5AFUA 4FWKA 4DHYA 2CGJA 2QWOA 3VGKA 3WEEB 1U6ZA 3D7EO 2GWKA 5BPNA 5BN9A 4EHUA 1X9JA 2F9WA 3CERA 2QWQA 4H5RA 3WQTA 4QS9A 3FZKA 3H6EA 4FOEA 1QHAA 2P9UA 5E84A 2QW9A 5AFUH 3QB0A 3C7NA 3O4WA 2F9TA 2Q31A 2Q97A 2ZGZA 2VWBA 3OHRA 4CBWA 3VENA 2YJFA 1HX1A 3VERA 1HKCA 4CZMA 3WQUA 4BRQA 4HWIA 4M7XA 1NMDA 2E1YA 3A5MC 2D0OA 2P9NB 2ZGYA 2DPNA 3WT0A 1MA9B 2P9LA 4FWNA 2FXUA 3J8AA 2P9PB 4BGBA 3FE1A 5AR0A 1KAXA 3D2EA 3ULEB 5F2RA 1SQKA 1NBWA 1ATRA 4O8KA 3U8XA 4BRHA 4I6MB 4FL9A 3VF4A 2E8AA 5EXWA 5AQZA 3UKRB 3VPZA 1V4TA 5EVZA 4BR5A 4A2BA 5F0XA 3EZWA 3KHYA 5AQFA 3O08A 4Z94A 5BRFA 3O80A 4RCHA 2HF4A 3M1FA 2HMPA 3VEZA 2Q36A 2E20A 2BTFA 1QQMA 1NGEA 4DB3A 5AQYA 5AQMA 3M6GA 3UE5A 4H5VA 4PKHA 5FPNA 2E2OA 2Q0UA 3S41A 4H0PA 3WEEA 4BVOA 4BC5A 3VEWA 4BR7A 4NB4A 1E4GT 5AQGA 2IVNA 2YI1A 2ASMA 3ZX2A 3VEVA 3SLCA 3MDQA 1BO5O 3ZX0A 2VCPA 4BRKA 2FF3B 4FWRA 5E26A 3TPQA 5ADXA 3GG4A 1K8KB 3P4IA 2E2NA 4IJNA 2YHXA 2P9IB 3MK6A 4H0YB 3SK3A 5AQHA 2P9SB 1HPMA 4YDUC 2D0PA 4GNIA 5BRHA 1DEJA 4K25A 2P9NA 1WUAA 2PBDA 4JHDB 4IZ9A 1SAZA 3DAWA 4H0OA 3O6WA 5FPMA 1NGFA 3QDKA 1S22A 1KAZA 3ULEA 3ZX3A 4EIAA 3HZ6A 4JAXA 4MLHA 5FPDA 1S3XA 4BQLA 3SJHA 1NM1A 4I6MA 3W0LA 2E1ZA 3CJ9A 3MN9A 4RWTA 3UKRA 2YJEA 3TU5A 2GWJA 3HI0A 2HOEA 2KHOA 5AQUA 1Y64A 1T6CA 1T44A 2ZWHA 1SZ2A 4DCHA 2CGKA 1QQOA 1BWFO 5CE3A 4L3QA 5KQ8A 4H5WA 3VEXA 5AQJA 3FFKB 3VOVA 4EHTA 1GLFO 5AQOA 2ASPA 3O1WA 4BRIA 1DKGD 1MWMA 4WQ4C 1NGGA 3KZBA 5EOYA 3F9MA 1IJJA 3EL2A 1K8KA 1NGHA 2AP1A 3U9DA 5AQNA 3U4LA 3ENHA 4JN4A 2P9IA 3EKUA 4FWLA 4WQ5A 1CZAN 3DWLA 1GLLO 1JCGA 1GLEG 4XH4A 1GLCG 2P9SA 3LM2A 1ZBSA 4CZGA 2IVOA 2NRHA 4IO8A 2W41A 1YAGA 4M7YA 4JHDA 1GLBG 3O1BA 3R6MA 5JLFA 1ESVA 1LOTB 1QZ6A 3L6QA 1BDGA 2QWMA 1BG3A 3JS6A 4BR0A 5AQLA 1YXQA 2D1KA 2HF3A 4A62A 4IJAA 4CZJA 2QXLA 4BR4A 3ZETB 4LC9B 3HM8A 4CZIA 3CQYA 3GL1A 4BRLA 3JXUA 4RTFD 5F1XA 5EY4A 3WXKA 2YHWA 3VF2A 3A5NC 3GBTA 2YCHA 4J8FA 4JNEA 3H1VX 1RFQA 3GDQA 1E4FT 3MMVA 3CI5A 1GLJO 2A5XA 4PKIA 4FO0A 3WXIA 3VETA 3IDHA 3HSCA 4H0XB 1NGIA 2V7YA 4AM7A 1P8ZA 2QWLA 5AQIA 4B1YB 5BR9A 3IMXA 3QMLA 5AQPA 3AAQA 2V51B 1OKJA 4M63C 5LY3A 3MCPA 4E1JA 2IIRA 2NLXA 1NGDA 1LCUA 1EQYA 4ISGA 1YVNA 5AQQA 4CZLA 1U2VB 3HBTA 4B1XB 2ZF5O 5KQDA 4PL7A 4QS7A 2I7PA 3R9PA 3MN7A 2V7ZA 4BRCA 4BG8A 1BA1A 4XH5A 3FGUA 5AQKA 3H1QA 4O5FA 3RSEB 4BRAA 4Y0WA 5AZJB 4B1VA 2E88A 3FR0A 1D4XA 4CJ7A 3LL3A 5ADXH 1MDUB 5BPLA 1GLDG 4C23A 4EAHD 3H3OB 1QQNA 1ATNA 4H5NA 3LDOA 2ASOA 3O8MA 1KXPA 4FOIA 4IWVA 2GUPA 4K43A 5KPZA 1V4SA 3QFUA 4FWOA 1KAYA 2FSKA 4FWMA 4K42A 2A3ZA 3ZETA 4A2AA 5KPRA 1J6ZA 2EWSA 2OANA 3EO3A 2VYPA 4XEIA 3DXKB 3L0QA 2CH6A 4CBXA 2PAVA 3CHWA 3VGLA 3AARA 3FZFA 3GOIA 1HUXA 4BVPA 1JCEA 5AQVA 3BEXA 1Z05A 2P9KB 3B8AX 3IFRA 4B1UB 5KPTA 1NGJA 2CH5A 3H3NO 4BC4A 1HJOA 1BU6O 3I33A 1T6DA 3ZEUB 3W3DA 1JCFA 4B9QA 4H5TA 3R8EA 4MLEA 4CBUA 3LDNA 4FWSA 4BR9A 4BC3A 3ATVA 3I8BA 4CZEA 5JLHA 1YUWA 1H1VA 4HTLA 1U2VA 4WYBA 4BRPA 3LDPA 4PKGA 1ZXOA 2E2QA 2W40A 3EN9A 3U9ZA 3UKUB 4JD2B 3EKSA 3BUZB 1XC3A 3RSEA 3LM9A 4FWQA 2QWRA 1TYQB 2IVPA 5AZJA 3CQXA 5BN8A 5AZIB 3CJ1A 1MWKA 5AQWA 4BG9A 4BQZA 1NWKA 3WXJA 2FF6A 2WUSA 3FZMA 3QICA 1G99A 4BR2A 3BF3A 5LJVA 5BREA 1RGIA 3H45C 4GY2B 3CJBA 3WXLA 5I9EB 1HKGA 3HTVA 1XQSC 2ITMA 2I7NA 3ID8A 4KBOA 3D2FB 2H3GX 2FSNA 4NO7A 5ELZA 3BP8A 4CD1A 1HKBA 3A5LC 4CZFA 4WQ5C 1C0FA 2A41A 4QS8A 1BA0A 1HLUA 2J4RA 1NGCA 3DXKA 2D4WA 3G25A 3DXMB 1ZC6A 1RDWX 1R59O 4MO4A 3VGMA 4CI6A 3IUCA 2QWNA 3C0BA 3H46O 2QM1A 2QWPA 3QFPA 3MN6A 2BUPA 4DQ8A 3DJCA 3FLCO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQMN 2V52B 3ZT2A 4BE2A 3CJ7A 4FPAA 2QTDA 4F4KA 1I39A 4DTMA 1U47A 2XY6A 4JI0K 1T8EA 3OYCA 1VRUA 4EZ6A 3O5BA 3FZLA 2HVHA 3KK2A 4H0TB 4CEZA 4BRDA 4FJXA 3HRGA 1IBMK 2FLOA 3LWLA 4IOAL 4KHYA 3SUQA 4JEPA 4YDUA 2G8IA 3NF8A 1TUYA 2Z1JA 4ISEA 4PL8A 3OW2M 4MO5A 3V1RA 4NLCA 3THXA 4JKAA 1C0GA 3BZKA 3CETA 3ITHA 4KTQA 3MXMA 1BUPA 1HNIA 1KFSA 2O8CB 3D2FA 4KFBA 1QSSA 1JLFA 4DTNA 5IT9O 4JK8A 1DGKN 3BGRA 5KGXA 3OJSA 3ATUA 4CGFA 3L3UA 3V81A 4OGEA 3CJCA 1FK9A 3S9HA 4M3ZA 3SQ4A 4ZHRA 4BRFA 2AA4A 1M90O 4OPJA 3MXIA 2F4VK 5LL6Z 3VEYA 1U04A 2Q3SA 2NUBA 4DQIA 4XH1A 3MAQA 3QBWA 5KI6A 4V19S 4E19A 4CJQA 3CCMN 3H08A 2FSJA 4WQ4A 3OBWA 3OS0A 4OKJA 1DT9A 1Q18A 1X3NA 3J7YP 1QTMA 3WNFA 1NGBA 3HVRA 1TUUA 4LSLA 1GOBA 4U67L 1S1WA 4CHPA 3SMSA 3DOLA 5AFUA 2CGJA 4Z4CA 3DOKA 3VGKA 3D7EO 5BPNA 4EHUA 2F9WA 1CZ9A 2G8HA 3E66A 3HYFA 4QS9A 4RW9A 4FOEA 2P9UA 5AFUH 1TKDA 3RMDA 4FYDA 3O4WA 4B3RK 2E4LA 4HUEA 1X1PA 3VQDA 3KLGA 4BDPA 3K9KA 3VERA 2FC0A 2B4JA 3LP1A 3VQQA 4LSNA 4RW8A 1NK7A 3DMJA 2NNWA 4FK0A 3WT0A 4FWNA 1WSIA 2O8DA 3D2EA 3ULEB 4CEEA 3FFIA 4DTJA 3AA3A 1JL2A 1NBWA 3CMAN 4ILGB 4FJ7A 1HNXK 2JLEA 4DTUA 3OYEA 3AA4A 4B3SK 3VF4A 3Q7CA 4F2SA 5AQZA 3MXJA 3VPZA 5EVZA 3NF6A 1LAVA 4LH4A 5AQFA 4CJVA 1XI1A 3O08A 5BRFA 1WAFA 2W6KA 4RCHA 1NOYA 3E01A 4W5OA 2VGMA 3NE6A 4H5VA 1JXEA 3S41A 4H0PA 3VEWA 2NRZA 4NB4A 2HHUA 2WC9A 1LV5A 3I56N 2YI1A 3CC4N 2ASMA 4KI6A 1S9EA 3MDQA 4B8CA 3V9XA 5E26A 1I94K 1TAUA 3K5MA 3AGKA 2NRWA 3MK6A 3CFRA 3KD1E 3ZLJA 5AQHA 2OTLN 4X66K 4GNIA 3NVMA 1VRTA 2VQFK 1SAZA 4I2PA 3B6OA 4CGJA 5SWMA 1Q9YA 3ZX3A 3HZ6A 1VQKN 5M1PA 1KVBA 4CFAA 2A1SA 5JS1A 3P5JA 3IKMA 4BQLA 3SJHA 3TARA 4I6MA 1HMVA 2YV0X 3CJ9A 1YTAA 1IBKK 1C1AA 1JLCA 4RWTA 3TU5A 2UU9K 2DFHA 2GWJA 2GUIA 2UXBK 1C0UA 4N56A 3OVNA 1Y64A 1JXBA 1RTIA 3A2FA 5FROA 5KRSA 3WNEA 2W6LA 5CE3A 3AVCA 3U3GA 4DV1K 5AQOA 2ASPA 3EZ5A 3T1YK 4BRIA 1S1TA 1NGGA 2XO7A 4M42A 4FW1A 3MX5A 2VG7A 4FM0A 2B5JA 3EL2A 4CK3A 3U4LA 5C0YA 4DSLA 3ENHA 3PIOL 2P9IA 4BWJA 4U7BA 1GLLO 2F8SA 1GLEG 5M1KA 2P9SA 1CXQA 2NRHA 3KKRA 5FRNA 3CPWM 4B9NA 4IKFA 3O1BA 4DU3A 2E5LK 3MEGA 3HOTA 3HK2A 1SS6A 1BDGA 2QWMA 3JS6A 1YXQA 2QA4N 3ZSXA 4FJ5A 3QESA 4OPKA 1TK0A 1KVAA 4LY7A 2O4GA 3C6UA 4DMNA 3DLGA 2XHBA 3WXKA 3VTIA 1YJWN 4GVEA 2YHWA 3H1VX 4I9QA 1RFQA 1E4FT 4J2EA 3CI5A 4DR6K 1M1KO 2XY5A 1GLJO 3ZT3A 3RR8A 3E9PA 3WXIA 1T05A 4FLZA 1XMOK 3AO2A 4H0XB 4QCLA 4JKBA 5BR9A 3CPEA 3LP0A 3QMLA 2V51B 3DRPA 4M63C 3OTOK 4HUGA 4E1JA 2DY4A 3CCRN 4M3RA 3M8PA 1EQYA 4ISGA 1YVNA 5AQQA 4CZLA 1N36K 4O4GA 3BZCA 4QS7A 4CEBA 2I7PA 4E7KA 4FM2A 3MN7A 2V7ZA 3RSEB 4O5FA 1TL3A 1BIZA 4CJ7A 4LH5A 3JAMO 2YX6A 3E9OA 4MQ3A 4C23A 4PWDA 4AHRA 1RT7A 3O3GA 2G8VA 4AILC 4OPAA 1KXPA 4FOIA 2BANA 2GUPA 4K43A 1JLBA 3M8QA 1KAYA 1LW0A 2FSKA 2QI2A 4FWMA 4A2AA 4AH9A 2OANA 3SBTA 3LP3A 2VYPA 2B6AA 3ZSRA 4ELUA 2OCEA 1VSJA 1NK5A 3DXKB 1ZBLA 4A57A 3CHWA 3VGLA 3AARA 4C1NK 3NH2A 4YOVA 4KHQA 4BVPA 2UUCK 4OJRA 1HNVA 1JCEA 3RRGA 2P9KB 3KK3A 2F96A 3H3NO 3OJUA 1OH7A 3PUFA 3I33A 4E7JA 3ZEUB 1Y97A 2HBJA 4CBUA 1NNEA 4OLBA 3N4PA 4BC3A 1R0AA 3CXCM 1VSMA 1H1VA 4FLWA 3RMAA 2BE2A 1U2VA 5M1OA 1B9FA 3LDPA 4PKGA 3N4QA 3EN9A 4FJ9A 3O9UA 1WSEA 4GKKK 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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