3HRGA

Crystal structure of bacteroides thetaiotaomicron bt_3980, protein with actin-like atpase fold and unknown function (np_812891.1) from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 at 1.85 a resolution
Total Genus 76

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GMIDFTKSKQYTLSIRLSTDGFSFSIYNPINDNSQSLFEKEVDTSLSLTANLKNVFHESDFLSYSYKRVNIMIASKRFTMIPLELFEEEQAELLFYHNHQKRENEIVMYNILKKNNVVIIFGIDKSTYTFLNEQYPEARFYSQSTPLIEYFSIKSRLGNSKKMYASVRKDAIDIYCFERGQLLLANSFECMQTEDRIYYLLYVWKQLEFNQERDELHLTGTLSDKETLMNELKKFILQVFIMNPANNIDMQALLTCE

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS3 (32-39)TVIII1 (65-68)S4 (67-70)S1 (11-17)TI1 (17-20)S11 (160-167)S2 (20-27)TI2 (28-31)AH1 (47-57)TI3 (42-45)S9 (122-123)TI4 (58-61)TI5 (59-62)AH3 (124-133)O1 (75-77)TIV2 (101-104)S8 (116-120)AH2 (90-96)S5 (77-81)3H2 (82-84)3H3 (87-89)S6 (104-105)TI7 (134-137)S7 (109-111)3H4 (112-114)3H6 (248-253)AH4 (142-154)S10 (138-139)TIV4 (209-212)S14 (215-219)S12 (170-177)S13 (180-188)AH5 (192-206)TIV5 (210-213)TVIII2 (235-238)TIV6 (221-224)TIV7 (223-226)3H5 (227-233)3H1 (4-9)TIV1 (27-30)TI8 (167-170)TIV3 (176-179)TIV9 (240-244)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
publication title Crystal structure of Bacteroides thetaiotaomicron BT_3980, protein with actin-like ATPase fold and unknown function (NP_812891.1) from BACTEROIDES THETAIOTAOMICRON VPI-5482 at 1.85 A resolution
rcsb
molecule keywords uncharacterized protein BT_3980 with actin-like ATPase fold
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12864 DUF3822 Protein of unknown function (DUF3822)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.250 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA01
3.30.420.260 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA02
3HRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NRWA 3T1HK 4KPYA 3A8YA 3TAFA 2XRIA 1FJGK 1EETA 3OTOK 1TVRA 1RBUA 1K73O 5AJ3K 5AZJB 4BRNA 2YNFA 4AHCA 3N4QA 3CCMN 4X64K 5KPTA 3I56N 3G10A 2HHVA 4JV5K 1X3NA 3NGYA 4B1ZA 4ICLA 1NGJA 1B92A 5GAEP 3VQCA 3ZETB 2HMIA 2KLAA 3TAMA 3ZSRA 4CI6A 1IKWA 5FPMA 1EP4A 2BE2A 4K41A 2E6LA 4A2AA 4FWPA 3THXB 2OZSA 2FSJA 3THWB 4E89A 3QEPA 5GIOA 2HB5A 4DTJA 1E4FT 3VMFB 2P5GA 1S22A 1NOYA 3L2WA 3JYTA 3GE1A 4CHOA 1MA9B 4PUOA 4DFMA 3QESA 1XMOK 4E19A 1HYZA 2GTDA 3AO1A 4WQ5A 3NE6A 3OJSA 2X74A 5J1EA 3UB5A 4CCHA 4B3RK 3DLRA 5AFUH 3QMLA 3HL8A 4KHYA 3M8RA 4I7FA 4Z4GA 3ENBA 1BISA 5LMUK 4JI4K 4BY9C 2V52B 1N8RO 2BTFA 1NJXA 3SUPA 3O80A 1HX1A 1Z25A 4NCBA 1RCHA 2QA4N 1GLBG 4CBUA 2NRHA 2W6KA 2WOMA 4WQ4A 3SPYA 1W0HA 3BZCA 4JKDA 3IKMA 4FWSA 3E66A 2IAJA 3CJ7A 4KHNA 2O4GA 4XH1A 3QNNA 2O8BB 3LM2A 1VQON 4K0KK 3T1YK 3I55N 4KB1A 2JWKA 3U9ZA 4EP4A 4W5RA 3ZSOA 3ZLJA 3V4IA 4EHTA 2D4WA 3TI0A 2VQEK 1NMNA 1TK8A 3UIQA 3G6EN 1BIUA 1IV0A 1BO5O 4F3OA 4H4OA 3PIPL 1N34K 4WE1A 3SJJA 3NF6A 1X9MA 3ZSYA 4FL9A 3NAEA 2VYPA 4KFBA 3WEEB 5AQJA 2Q36A 3MCAB 5JS1A 3PX4A 4JI5K 2V51B 4A62A 1JXEA 1L3SA 2A6AA 3VN5A 4DV3K 2JLEA 3OS2A 2AP1A 1YF5L 1LCUA 3BEXA 3LPUA 1CZAN 3AO4A 4CZEA 4BC4A 3D2FB 3ULDA 5MLCQ 4DTMA 3P83D 2UXDK 2YV0X 3M8PA 4AHVA 3LDOA 4ZTJA 2HSTA 3R8EA 1KLNA 4OPHA 3FZFA 4M3UA 1VQ9N 2VG6A 3BY5A 3CHWA 1VSKA 3IS9A 3VQ9A 3L2UA 3CF5L 4JKHA 4E1NA 4BRFA 4IZ9A 3IAYA 3CJ1A 4AHSA 3TANA 2G8HA 2UUBK 2IS3A 5KGXA 3WQTA 2E2OA 4JHDB 4BRPA 3HOTA 1GLCG 3AGKA 4MO5A 3S41A 1TKZA 2HVHA 5CYQA 3AVFA 4OJRA 5LJWA 5M1FA 4G1QA 4IEIA 2OTJN 3TTCA 4YFUA 3RMCA 3DI6A 1ATRA 3VGLA 5AQHA 3VEOA 3I8BA 2HHWA 5HRSA 3CQXA 1RDUA 1WNSA 2P9SB 2Z1HA 5KQDA 4JKCA 2P9IA 1EXQA 1OVYA 1D4XA 2WUSA 3TWHA 3KLFA 3KD5E 4ID5A 3SQ4A 4BWJA 4LSNA 4BG8A 2VGNA 2QWOA 3AARA 1W9HA 3H1QA 2ZGZA 4LFBK 4YORA 3J7ZO 4W5NA 4CEQA 1YI2N 3NVMA 3P31A 2HNYA 4LY7A 3OYJA 3L3UA 3CCRN 4GMJB 4O0JA 4NXNK 2YKMA 3C7NA 4O5FA 3M5RA 3CQ8A 3DJCA 4AHRA 5ELZA 2KKZA 5EXWA 3CXCM 4FYDA 4JK8A 1NGDA 1XWLA 3SV4A 3LAKA 3VENA 1Q18A 4G9ZA 4HUEA 4FJGA 2RE2A 5GADP 4I9QA 4BC2A 4DFKA 1TK5A 4A57A 3AA4A 1J6ZA 4DMNA 2KFNA 3C6UA 1IJJA 4QAGA 4LH5A 3V1QA 2D0AA 5BR9A 3OYFA 1NGGA 4PKIA 2GWKA 3LZJA 3ZT2A 2O8FB 4AQYK 2I5JA 4NYNA 4CF8A 4DR2K 4MO4A 1IBKK 5I42A 1QVFM 3HJFA 3OYCA 4FK2A 1W7AA 2HHSA 2DFFA 4NLCA 2VG7A 3MECA 3RRGA 4OGEA 1DKGD 1RDBA 3SAFA 2VWJA 4V19S 2YX6A 3VOVA 4FVUA 1UWBA 2GV9A 4BRLA 4KTWA 4IFEA 4X62K 3R1XA 1YIJN 4ILGB 1YHQN 4AHTA 2E8AA 1VSDA 3AVGA 3F9KA 1ATSA 1Q86O 5C2FA 4Q0BA 4NB4A 1B9FA 4FJHA 4Z4FA 4CIFA 4FJ9A 3CM6A 4N76A 2ETJA 2QK9A 1Q9YA 1KVCA 1J5OA 4ILHA 4JI0K 4LF6K 1TKTA 3BP8A 4BQZA 4FZZA 4KH4A 5C25A 2YHBA 2Z1IA 1WSJA 2OZMA 4HUFA 4NXMK 5BN8A 2P5OA 3QIPA 3V9XA 4CD3A 4OPAA 2LSNA 4IKFA 5AQFA 1U2VB 3KLGA 2IGIA 4BR2A 1HYSA 4NYFA 3ZX0A 4CJQA 4FLXA 4IOAL 3OA9A 4KH5A 3N4PA 1NM1A 1C6VA 2FBYA 3C6AA 1W2BM 1HUXA 5AQQA 2OA8A 2GUIA 4H5RA 4C1NI 4BDYA 1K8AO 4JYAK 3BGRA 1GLEG 4CZJA 4J2BA 1FK9A 1C0TA 2OTLN 1IKXA 1OH6A 4JI1K 1BQNA 3OYKA 2O8EB 3V1RA 3LALA 4H5VA 1Z05A 3KK1A 1MU2A 3EZ5A 4CK1A 3O3FA 4OPJA 3VQ7A 2ZJPL 4B8AB 1T03A 1A5VA 1NLVA 5KQ8A 3VQ6A 5AFUA 2D0CA 3KIOA 3OYAA 1OH8A 2OPQA 4OKKA 4B3SK 1F21A 2YHAA 3FFKB 1NK8A 4EFHA 5KRSA 1KXPA 1HNIA 5F1XA 1Z6RA 3KK7A 4HCCA 3GL1A 3NMUA 1VAZA 1KAZA 1Y64A 4ISGA 3ZEUA 3DXKA 5AQMA 3LZIA 3SCXA 1ZBUA 1NK7A 2ITGA 4BC5A 5AZIB 1OKJA 1X9JA 4CF9A 3OYEA 1P90A 3OYNA 1WSGA 1BL3A 1QHAA 4M45A 3O08A 3WT0A 3CQYA 2NRRA 4CF1A 3H45C 3THYB 4LFAK 3EZWA 2GELA 3VA0A 3CCSN 3CJCA 1BDGA 4Y1DA 2QXFA 4ELUA 4JN4A 3HRGA 1BOTO 1C0MA 2IVOA 3NF7A 2UXCK 1OH5A 1TYQA 4Z94A 1HPZA 1SZ2A 1QVGM 3ZSVA 3HYFA 2Q2RA 1VQLN 4LF7K 4BC3A 1KFSA 4CEEA 3OVNA 1Q82O 2B6AA 4DV6K 4YOVA 1DGKN 4CJTA 3AO5A 2QWLA 1J5EK 2UUAK 2Q3SA 2GUPA 3JAMO 4GV9A 3V9UA 2E1YA 4Y0WA 3SUNA 4E0DA 2V7YA 3CFPA 3ZT1A 4FLWA 1ASVA 1BA1A 3O9SA 3HM8A 3LANA 4FLTA 1IBLK 2HNZA 3OYMA 1TUYA 4OGCA 4B1XB 3TTDA 4OX9K 1JLFA 2WONA 4BVPA 4B9NA 4JRQA 1WB9A 3TTFA 3VETA 5KPRA 5HOOA 3SNNA 3BF3A 3HTVA 3FZHA 4FPAA 3SUQA 1OH7A 4EAHD 4DFJA 3C95A 3ALYA 3KLIA 4TSXA 3Q7CA 1VSEA 4BRKA 3NF9A 4FM0A 3S3MA 2QWMA 4W5QA 3J8AA 1RTHA 4FVMA 3RVCA 3J7YP 1XQSC 4CJPA 5J2MA 3CG7A 1NK9A 3NVKA 3TSUA 4MFBA 3RSEB 4CBWA 1SKSA 3VF4A 3DLHA 3ZT0A 2HMPA 3HO1A 4BRGA 3O4WA 3AAQA 1JLBA 1HJOA 3K0SA 4DSLA 1S1WA 2QTDA 1KVAA 4F2SA 3E9PA 4DTSA 3OBWA 2HHXA 1HQEA 1E4GT 3CCQN 1YJWN 2F4VK 1RDDA 2P9KB 4CF0A 1C1BA 2E6MA 4I6MA 4U67L 4BRQA 5BPNA 1VQ8N 3EYZA 1T6CA 1NU0A 3KD1E 4OKEA 3G25A 1YITN 4FJNA 3L2VA 4E7JA 1JLCA 3P39A 2P51A 3L2RA 2QEXN 5T7BA 4JAXA 1WSIA 3AVMA 1X1PA 1ESVA 3OYIA 3PLAA 3OYGA 4CJUA 2FC0A 1BCMA 3VF6A 1NOZA 3FFIA 4YDUC 3ZT4A 1YTAA 4CEDA 3ISNC 3O9UA 1KD1O 3ENOA 3THWA 4DQIA 1JCEA 2KFZA 4CF2A 3OYHA 3RTVA 3HPHA 3U4LA 2HBMA 4WFBL 3VQEA 4DFPA 2ZWHA 4JRPA 1K8KB 4DR6K 3SYZA 1T7PA 3K9KA 1BWFO 1I3AA 4M7YA 3CD6N 3HVTA 1YVNA 1ZXOA 1VQKN 2KQ2A 1BCOA 1S1TA 3HP6A 1CZ9A 2F7TA 3O3GA 2F8TA 3AVNA 2VCPA 5AQOA 1N36K 4CHPA 1X9SA 4B9VA 2CGJA 1YXQA 4H5NA 1NGFA 3AVHA 1MWMA 4DLGA 2WC9A 2IDOA 5BPMA 1FW6A 4YOYA 3K5LA 1O1WA 2VG5A 4CJKA 1VSFA 3TSQA 1BI4A 2O8CB 3VQDA 2I7PA 4F3TA 1DLOA 2QWQA 5M1OA 1Y97A 4LD0A 2NZTA 4BRAA 1VHXA 1QHTA 4CEAA 5A2QO 5AQIA 4LF9K 5BPLA 2FBTA 1SL2A 3OYBA 1VK0A 1Z26A 1NJYA 4JK7A 1VQMN 4IJAA 1WUAA 3JS6A 3E01A 3KKRA 4CFDA 4GY2B 1VSLA 4M7XA 4HCBA 1S1UA 1H1VA 2G8IA 4C1NK 2GEMA 3ITHA 4JEPA 1C0FA 4MDAA 1VQPN 2EX3A 3FZMA 2A1SA 4FOEA 5M1KA 1QTMA 4DUYK 3L8BA 4JK9A 3AA2A 3KWGA 3LM9A 2OPSA 4B9QA 5EOYA 2ZQBA 2YKNA 3UKUA 5SZTA 2KZZA 4Z0UA 3PSIA 1J9AA 1NBWA 2HBLA 3QFPA 2QWRA 2F96A 3M1FA 2G8UA 3PO4A 5DK5A 1NK5A 2VGMA 3AO2A 1YVUA 2NUBA 2P9LB 3B6PA 5J2QA 4DR4K 3DXMB 1QS4A 4CJRA 3BDPA 4WQ4C 4LF8K 4Y1CA 2GBZA 4CGGA 3CCJN 1QSSA 1D9DA 4GVEA 3NCIA 3EKUA 5CHIA 1D9FA 4H0OA 4A2BA 3MEDA 2D0BA 3CI5A 2D1KA 4E7IA 5AQUA 2P9NA 1S1XA 1X9WA 4CD1A 1EWQA 4OVLA 2ASMA 1DTTA 1KAXA 5C0YA 1Q8IA 4ISEA 3WNEA 3NGZA 5FPEA 1ZBLA 3E1YA 3O1BA 4B1WB 1KVBA 1WBBA 5HRRA 4FWMA 3SBGA 3SK3A 4B1VA 2QI2A 3QEXA 4DR7K 4CZGA 1WAFA 1NNEA 4B3OA 1YUWA 1C0UA 3HI0A 2Q0UA 3R6MA 4RG8A 2CGLA 1SV5A 3QINA 4WCEL 4XH4A 4BE0A 4KHSA 3AA3A 4CJ7A 3O3HA 4FJKA 5AQRA 1NGEA 2P9PA 1ZBSA 3MCPA 3CJ9A 3BUZB 3RR8A 2YJEA 2E2NA 4JKFA 2G8WA 4BQLA 3LWLA 3FGUA 1XC3A 1NK4A 4HVJA 1LW0A 4DU4A 4BREA 3CPWM 1KAYA 3V81A 4CGJA 4A61A 1KQSM 2NRXA 3B6OA 2WTUA 1T3VA 2RHKA 4CK3A 1T8EA 1GLDG 3K58A 3D2EA 2EHGA 3GOIA 3EE8A 4DQRA 1E3MA 4AF1A 4DSEA 1TL3A 4YOWA 1ZBIA 4OPKA 1TL1A 4DQ8A 3G4SN 2NRTA 3JXUA 4LF5K 2NRVA 3E9LA 1JLGA 1CZBA 3G71N 1HRHA 1TGOA 1T6DA 5ADXA 3IDHA 1LWEA 1JLEA 3L0QA 3OS0A 4O8UA 1NKBA 3MN7A 4UQGA 3SI6A 1JXBA 1HQUA 1NGBA 4CZIA 4DTOA 1IKVA 1Q7YO 3VQ8A 4CGFA 4DS4A 1ATNA 2IOCA 3ZSZA 1R0AA 3UE5A 1NKEA 5DM6L 5AQGA 4N56A 1MWKA 4KRFA 1U6ZA 4DTUA 3DWLA 3MMVA 3TU5A 4CJ3A 4JKAA 3W0LA 3LP3A 3UKRA 3CYMA 3AO3A 1VQ4N 3O4QA 3NGIA 3ZYYX 3O9TA 2O4IA 2P1JA 3MX5A 4DQSA 1T44A 1JL1A 1T05A 2P9UA 2HF4A 4IEEA 2PYLA 3MXIA 1M1KO 3WQUA 3GG4A 2PBDA 3DRPA 5AQLA 4R5PA 4DTNA 2P9IB 1RTDA 3L6QA 1IKYA 2ZE2A 3NH2A 3NH1A 4O8KA 5AR0A 3CCEN 4KH6A 4PL8A 4A5BA 3I0RA 1S9EA 3SQ0A 5KI6A 4B9MA 3CMAN 1MDUB 3RMDA 4ID1A 3R3LA 5AQTA 3ZSWA 3RRHA 1WAJA 3QFUA 4FW1A 2DFHA 1X3MA 4O44A 1K6YA 4YHHK 3C7NB 2YHXA 4BRMA 4FLVA 4DV1K 3HM9A 3WXIA 1CXQA 3KWIA 3IG1A 1XHXA 4H4MA 1QZ6A 1EWRA 1HNWK 2YHWA 4H0YB 5AQPA 3U6FA 3I0SA 3ZX2A 4FW2A 5DM7L 2QKBA 3LP1A 4FJ5A 3HZ6A 1RILA 1LWCA 1SL0A 4C8NA 5HRNA 5IWAK 3DLEA 3MAQA 1N6QA 4CJSA 4BDPA 4IG0A 1OVQA 3KJVA 4E7LA 4CEBA 2G8KA 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 3HRG A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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