3HZ6A

Crystal structure of xylulokinase from chromobacterium violaceum
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
500
structure length
497
Chain Sequence
SLAFYIATFDIGTTEVKAALADRDGGLHFQRSIALETYGDGNGPVEQDAGDWYDAVQRIASSWWQSGVDARRVSAIVLSGQMQNFLPLDQDHEPLHRAVLYSDKRPLKEAEEINARHGADNLWSALENPMTAASILPKLVFWRASFPQAFGRLRHVVLGAKDYVVLRLTGRHATDRTNASTTGLYRPKDDAWHVELLADYGFSLDLMPRLLEPGEQVGGVSALAARQTGFVSGTPVLCGLGDAGAATLGVGVLDDEDAYLHLGTTGWLARLTQTDPVGDMPVGTIFRLAGIIAGKTLQVAPVLNAGNILQWALTLVGHRPGEDCAEYFHMAAAEVQGVTVPDGLLFVPYLHAERCPVELPAPRGALLGVTGATTRAQILLAVLEGAALSLRWCAELLGMEKVGLLKVVGGGARSEAWLRMIADNLNVSLLVKPDAHLHPLRGLAALAAVELEWSHSIQDFLREADLRSNILHPQPCDEGRRRRKFERFKQCVETLGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Chromobacterium violaceum
publication title Crystal structure of xylulokinase from Chromobacterium violaceum
rcsb
molecule keywords Xylulokinase
total genus 162
structure length 497
sequence length 500
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2009-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hz6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hz6A01
3LL3A 2YCHA 4HWIA 4BRHA 3CJBA 3CQYA 1NGEA 1YUWA 4FWKA 3WQTA 2OANA 2CH6A 1C0FA 4H5WA 3VEXA 4BC3A 4AM7A 5AQIA 3A5OC 5AR0A 5JICA 3WT0A 1C0GA 2FLOA 2H3GX 3FFKB 1U2VB 3IMXA 1JCGA 4FWLA 3WEEB 1Z05A 4EHTA 2QWRA 4FWPA 5ADXA 1BWFO 2E88A 1E4FT 4CZLA 4BR7A 3FZLA 4H03B 2AP1A 2GELA 2NLXA 3LM2A 1YVNA 2V7YA 4CZGA 1NBWA 3CJ9A 2P9SB 4DB3A 3WXKA 1RGIA 3GG4A 5AFUH 4CBUA 3EKSA 4B1YB 3JS6A 4QS9A 4M7XA 3ZETA 4YDUA 3MN6A 2D1KA 4K43A 3BF1A 4H5VA 2E20A 4EFHA 2VCPA 1HPMA 2YHWA 2IVPA 3VENA 3FR0A 4XEIA 1WUAA 1V4TA 1KXPA 4H5TA 4BRDA 4JD2B 2GUPA 5BN8A 1TUYA 1LCUA 3AAPA 5KQ8A 5BRDA 1HKBA 4BQZA 4K41A 4XH4A 1DEJA 4Z94A 3KVGA 4JHDB 1EQYA 3I8BA 3U4LA 1T44A 4QS7A 1KAYA 5TKYA 4E1JA 3VETA 3VGKA 3P4IA 2Q1NA 5EVZA 1ATSA 1Z6RA 3L6QA 4AM6A 5AQHA 3GDQA 5EXWA 1XUPO 2P9NA 3RSEA 3IUCA 4M63C 4NO7A 3DXKB 3UKRB 4EAHD 3QMLA 2BTFA 1BG3A 2CH5A 4BC2A 2W40A 2W41A 4EHUA 2HMPA 4BGBA 4MO5A 1S3XA 5LY3A 1BOTO 3DXMB 3A5MC 2CGLA 5AQVA 3VEYA 1R59O 3BEXA 4CZIA 3R6MA 2HOEA 5EX5A 3GBTA 3DJCA 1GLDG 1NGAA 5AQMA 4IXCA 4B1ZA 2E2NA 5EOYA 1E4GT 3ZEUB 3H3OB 2NZTA 4CD3A 2P9IB 4H0VB 1HKGA 3IFRA 3FZMA 2F9WA 2V52B 1GLFO 3QFPA 3SMSA 4JNEA 4IZ9A 3LDOA 1HUXA 3CETA 4BRNA 3H3NO 2QWQA 3VGMA 4JAXA 1QQMA 5BPNA 2A3ZA 3M1FA 3SJHA 4M7YA 1ATNA 1V4SA 3D7EO 4H0OA 2ZGYA 1BDGA 4ISGA 5KPZA 4C23A 4BRAA 4BG9A 1NGJA 4BRLA 4B1XB 3IDHA 1YXQA 1GLLO 1G99A 3D2FB 3MCPA 4B1UB 3CJCA 2HF4A 1QZ6A 3AARA 4A2BA 4K42A 4BRKA 2P9NB 2YHXA 2QXLA 4WQ5A 3RSEB 3WUHA 4JN4A 4H0YB 4F9OA 5JMVA 5AQJA 1NGCA 2F9TA 1NGIA 2E2QA 1ZXOA 3EZWA 1ZBSA 3AAQA 5AQTA 1WOQA 3ATUA 4XH1A 2QWMA 3SK3A 2CGJA 2PAVA 1KAXA 2Q0RA 3U8XA 3HTVA 1K8KB 4BROA 5FPDA 4FWNA 4H5NA 3O5BA 4BR9A 2P9LA 2Q2RA 1ZC6A 2YJEA 3VEOA 3HBTA 2P9PA 3CI5A 3CHWA 5AQPA 3H1QA 5AQGA 4FWSA 4B1VA 4FPAA 3GL1A 3CJAA 1QHAA 1T6DA 3C7NA 4GNIA 2D0PA 2QWPA 3VF6A 1MDUB 2QWLA 5E26A 3ULEA 4K25A 5ELZA 4DQ8A 3M3ZA 5AQUA 2FF6A 1Q18A 1GLAG 5FPMA 4MO4A 4PL8A 2P9UA 2AA4A 3LDQA 5AQWA 1MWKA 2A40A 1KAZA 3L4IA 3VOVA 2VYPA 4BREA 1H1VA 4WYBA 4BR2A 3J8AA 1TYQA 5AQNA 3EL2A 1DGKN 1P8ZA 1NMDA 5B8HA 4CD1A 3BF3A 3U9ZA 3H1VX 3EKUA 1BA1A 1GLBG 3ZX2A 4KBOA 3HZ6A 2Q36A 3SLCA 2ZWHA 3FZHA 3LM9A 4H5RA 2UYTA 4BRPA 5BN9A 5KQDA 2A5XA 4BRCA 3FZFA 1HX1A 1T6CA 4WQ5C 3CJ1A 3EN9A 1DKGD 5AZJA 2D4WA 4H0XB 2P9PB 1HKCA 4BRMA 4DCHA 2Q0UA 4IJNA 5AQOA 3R9PA 1BU6O 5E84A 3FZKA 3L0QA 3BP8A 4WQ4A 3AY9A 3LDPA 3WXJA 4IJAA 3ZX3A 4H0PA 4CZEA 3C0BA 3QDKA 1OKJA 5JLFA 5ADXH 4BR4A 3ULEB 3G25A 3ZETB 4Y0WA 3WQUA 4CBWA 1NLVA 4BC4A 1ESVA 3VF4A 4MLEA 2V51B 2CGKA 3FGUA 3QB0A 5AFUA 5LJWA 2YI1A 2GWKA 3UKUA 4RWTA 1SAZA 3MK6A 4FPBA 4BRGA 2EWSA 5AQZA 5F0XA 2DPNA 2BUPA 3B8AX 2P9SA 2KHOA 1TYQB 3CIPA 4YDUC 3KHYA 3A5NC 3ID8A 3MN5A 4MLHA 2QWOA 5BPMA 4BR0A 5AQFA 5FPEA 5JLHA 2E1YA 3CQXA 2FSKA 5BREA 1QQNA 3UE5A 1X3NA 3BUZB 3HI0A 2E8AA 3W0LA 5I9EB 3CERA 4A2AA 1BUPA 2QWNA 3A8YA 5KPRA 4O5FA 5BR9A 3F9MA 2GTDA 1IJJA 4FO0A 4RTFD 4PKIA 3H45C 3H46O 1MWMA 4NB4A 3OHRA 5AZJB 5BRFA 5KPTA 2ZF5O 2A6AA 3FE1A 2E1ZA 3EO3A 5EY4A 1RDWX 1Y64A 1NGGA 4FOEA 3VERA 4ISEA 4I6MA 4B1WB 5BRHA 2HF3A 2A42A 3MDQA 3DXKA 1YAGA 4A61A 4IO8A 3QFUA 3UKRA 4CZKA 4PKGA 1BO5O 4BG8A 4FSVA 3VEZA 2Q31A 4RCHA 3FLCO 5LJVA 2QM1A 3UKUB 1XQSC 4QS8A 2I7NA 3DXMA 4CZJA 4FWRA 4WQ4C 3TPQA 4FOIA 2ZGZA 4BRIA 3WXIA 2ITMA 4CBXA 2ASPA 4A62A 1JCFA 3ENOA 3GE1A 4CJ7A 3ZEUA 4BC5A 1NGDA 2QW9A 1SQKA 3LDNA 4BGAA 1S22A 4CI6A 2P9IA 3O80A 4FL9A 3UB5A 5AQSA 1QZ5A 3R8EA 1J6ZA 1LOTB 2Q97A 3WXLA 4CZMA 1ATRA 3A0IX 1GLEG 4BRQA 2V7ZA 2P9KA 1HLUA 3VPZA 4CZFA 1NGBA 1GLCG 5F1XA 3JXUA 3D2EA 5AQXA 5CE3A 2FXUA 3QBWA 5F2RA 1HJOA 1NGFA 3I33A 3VF2A 2FF3B 5AZIA 3VESA 5AQKA 2J4RA 3O8MA 3D2FA 3VEWA 1QQOA 3HSCA 4CZHA 4GY2B 2E2OA 3VEVA 2P9LB 3O6WA 1D4XA 3LDLA 5AQLA 2E2PA 2FSNA 2IIRA 2NRHA 3H6EA 4LC9B 3DAWA 2IVNA 4BVPA 4IWVA 4I6MB 4FWMA 3KZBA 5FPNA 5AQRA 1IG8A 3MN7A 4J8FA 3C7NB 4B9QA 4DHYA 5BPLA 4HTLA 3GOIA 3U9DA 3ENHA 4BRFA 4FWQA 3DWLA 1U2VA 3S41A 3WEEA 4O8KA 3MN9A 1K8KA 3O08A 4FWOA 3CJ7A 1NM1A 5AQQA 3A5LC 2GEMA 1XC3A 2P9UB 1RFQA 2I7PA 2D0OA 3MMVA 3ZX0A 2GWJA 1SZ2A 2WUSA 3W3DA 2ASMA 4L3QA 1NGHA 1X3MA 3VGLA 3O4WA 1NWKA 1MA9B 4PKHA 5AQYA 1GLJO 3M6GA 4BQLA 2VWBA 2FSJA 2YJFA 2P9KB 1TUUA 4PL7A 4EIAA 1JCEA 4BR5A 3D2EB 1CZAN 2PBDA 3TU5A 1U6ZA 3HM8A 3O1WA 2YHYA 2ASOA 3QBXA 3QICA 3O1BA 4BVOA 3ATVA 4JD2A 4XH5A 3SMPA 5AZIB 1X9JA 4ISFA 4H0TB 4JHDA 2A41A 1BA0A 2IVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TAEA 3BY5A 3LL3A 1NGEA 3QEIA 4AHTA 1YUWA 3E01A 3T3FA 4FWKA 1VSJA 2CH6A 4OJRA 3AVGA 4BC3A 4AM7A 2XHBA 3WNEA 4O8UA 3CM6A 5JICA 5SZTA 3SZ2A 1RDAA 1XHXA 3FFKB 4FLUA 4DV7K 2P5OA 5HRPA 3TARA 1JCGA 1OH5A 1VQ9N 3VTHA 4FWPA 3TTCA 3KKRA 1BWFO 4KREA 1VSKA 4CZLA 4BR7A 3FZLA 4H03B 2NLXA 4CEFA 1J5OA 4OGEA 3CJ9A 1TKTA 1VSIA 1YT3A 3SCXA 4J2BA 5LL6Z 4CF9A 1QE1A 4FJIA 4Z4IA 2YX6A 1SKRA 3EKSA 1RBUA 1RDBA 4YDUA 3OY9A 4H5VA 4JEPA 1NMNA 4EFHA 2P5GA 3HYFA 4DV4K 4W5RA 1KCFA 4JD2B 2GUPA 5BN8A 3CCEN 4N5SA 1KFDA 4BQZA 3OYLA 2GUIA 3KVGA 3RMDA 1WSHA 3U4LA 1KAYA 1NK0A 1HJRA 3VGKA 4DKWA 3KLHA 4DV6K 4ICLA 4KI4A 4RW6A 4B3RK 1Z6RA 5EXWA 3GDQA 1QVGM 1LWFA 1RDUA 2QEXN 4NO7A 2YNGA 3HRGA 1FXXA 5T7BA 4IBNA 5TKWA 2OCEA 1LW0A 4FJNA 1X9MA 2CH5A 2HMPA 1YIJN 1VHXA 4CJ5A 4CK1A 1BOTO 2CGLA 4WCEL 3PO4A 3BEXA 4CZIA 3LANA 2HOEA 1NGAA 3ZEUB 1C1CA 1RBVA 1WSGA 3LWLA 3FZMA 2F8TA 2V52B 4AHRA 3SMSA 3L4QA 3RRGA 4TSXA 2NRVA 1QQMA 3UIQA 2A3ZA 3VN5A 3M1FA 4IG0A 4DTMA 3SJHA 4M7YA 4HUFA 5FRNA 1ASWA 3OYCA 3THXA 1V4SA 3OYEA 4H0OA 2ZGYA 4B9TA 1BDGA 3SNNA 1WB9A 5KPZA 1RNHA 3C6HA 4C23A 4BRAA 4BG9A 4CJUA 2JWLA 2DFHA 1CZBA 1S9GA 4M3YA 1G99A 3CMAN 1D9FA 4CGDA 4B3TK 1JL2A 2GX9A 3CJCA 1HYSA 1QZ6A 2KTQA 4CJQA 1N32K 4BRKA 3U6FA 3MX5A 1S1WA 3SUQA 3SUNA 1A5XA 2F9TA 1NGIA 2GBZA 1LWEA 1VQ7N 1ZXOA 1EP4A 5GIOA 2PYJA 4NXNK 1QQCA 2FBXA 3SK3A 1VQ4N 2PAVA 3U8XA 3AO5A 3CPWM 4BROA 1U48A 1I39A 4BR9A 3THVA 2P9LA 1QSSA 3VEOA 2P9PA 3AO4A 4JLHA 3CHWA 5CZ2A 4FPAA 3GL1A 2G8IA 3SQ1A 1VSLA 1VQLN 3LZIA 1HNVA 4I2PA 3PY8A 4IDHA 5IWAK 5ELZA 3E9LA 4JKBA 5FDLA 4ELUA 4CJRA 3AVAA 3PLAA 1XMOK 3THXB 1JLQA 4LSNA 3TABA 4CGHA 4HVJA 2O4IA 2P9UA 4CHYA 4WFAL 4M3UA 5AQWA 3RR8A 1VQON 4E89A 1KAZA 4FJGA 4KO0A 1ZBUA 4BE2A 1C0MA 3DLEA 1Q9XA 4CD1A 2O8EB 4N47A 3PSFA 4Z4GA 1C6VA 3V9XA 3EKUA 3LAMA 3ZX2A 4KBOA 2Q36A 2ZWHA 3LM9A 3ISNC 3DLBA 5BN9A 3PIOL 1NOYA 4CK3A 1HR0K 3FZFA 1T6CA 1IKXA 4CCHA 3SBTA 4H0XB 4KV8A 2UUCK 2P9PB 4IEIA 4JKDA 1Q82O 3R9PA 4CEBA 3AGKA 4U67L 1Z25A 2HVHA 4DU4A 2KFNA 3AY9A 1U4BA 4JI6K 3TANA 1HQEA 3C0BA 3CCRN 4DQSA 4OKJA 3HPOA 4DQQA 4JKEA 2E4LA 3V1RA 2WC9A 3G25A 5J1EA 3KD1E 3ZETB 3KK7A 3WQUA 4DV0K 4YORA 4JK7A 2HHTA 4MLEA 1BIUA 2V51B 3FGUA 3NDKA 3P39A 2GWKA 1SAZA 1VSMA 1R0AA 3THYA 1N34K 4M41A 4FLVA 2BUPA 3B8AX 2VG7A 3CIPA 3M5RA 4LH4A 5FROA 1NOZA 3BZCA 3HPGA 5FPEA 1XNQK 2FBVA 3AA2A 3CQXA 1RT6A 5LMNK 3CM5A 1RILA 4DV2K 4CJSA 1QVFM 1QQNA 5I9EB 4IKFA 1BUPA 5KPRA 4LSLA 1HQUA 3LP0A 4RG8A 1S9EA 1IJJA 3VQBA 4FO0A 4RTFD 1NJIO 3H45C 1MWMA 3OHRA 2UU9K 1KLNA 3T69A 3F73A 2OYQA 3AO1A 1A5WA 4BWJA 4EP5A 1GOBA 3HOSA 1Y64A 3V9SA 2QXFA 4GKKK 3AO3A 1BIZA 3PX6A 2HF3A 5DM7L 2A42A 4A61A 3DXKA 1YAGA 4IO8A 3QFUA 3UKRA 1LWCA 4CZKA 4DLEA 3MXMA 4ILJA 2X6SA 4FCYA 4E3SA 1YTUA 1SL2A 1ZBHA 1S5JA 2HVIA 1XQSC 1VRTA 1JLGA 2RN2A 3THYB 2RF2A 1C0UA 4BRIA 2YNFA 3WXIA 2ITMA 2ASPA 2KW4A 1W0HA 3GE1A 2QW9A 1SQKA 1S22A 2P9IA 3L8BA 1OVQA 4I9LA 1LOTB 2Q97A 1ATRA 1GLEG 1VK0A 3P1GA 4BRQA 2P9KA 2ZQBA 3VPZA 4KH6A 4JS5A 5F1XA 3JXUA 2YNIA 5MLCQ 4B9MA 2QKBA 1IKWA 3HL8A 2Y1IA 1NGFA 3I33A 3VF2A 5CYQA 4CIFA 4CK2A 3D2FA 3VEWA 4CZHA 1FK9A 1IV0A 5HRRA 1X9SA 4B3SK 3H6EA 4AQYK 2HHQA 3DLRA 4PA1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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