3ID6A

Crystal structure of sulfolobus solfataricus nop5 (1-262) and fibrillarin complex
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
VKIYLIEHVIGAVAYDENGNIVDYITNPRDLGKITEELLNNEKGIPFSATVELLKKVNPQEVVVENEAEVPKLQALGYRVSYEPYSKVSRIFRESLPKVAIDIKFASNEEDYYNFLHELSLEYTRRKLRSAAQKRDLLAIQAVRAMDDIDKTINLFSERLREWYSIHFPELDKLIEDHEEYATIVSRFGDRGFLTIDSLKELGFNEQRINRILDAAKKSIGADISEDDLSAMRMIANTILDLYNIRRNLNNYLEGVMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Sulfolobus solfataricus
publication title Structural organization of box C/D RNA-guided RNA methyltransferase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pre mRNA splicing protein
total genus 97
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.220 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3id6A01
3PLAA 4BY9C 3NVKA 3T7ZA 5GINA 5GIOA 3NMUA 2NNWA 3NVMA 5GIPA 3ID6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SKRA 1TK0A 2D0OA 4FW1A 3HJFA 1NK9A 4B3TK 4FJIA 4N56A 2IGIA 3V9WA 2P9LA 3OYIA 4BQLA 2J4RA 4FCYA 4DQSA 3JAMO 4R79A 5KPZA 3L2RA 2D5RA 1U4BA 2F7TA 2XHBA 4DSLA 4NYFA 3NF6A 1LWFA 5KQDA 4E3SA 2W6LA 1FJGK 3QERA 3CM5A 4DR6K 2HBMA 2KZZA 4F2SA 1P8ZA 4AHVA 1BIZA 4JAXA 4FJMA 4JKFA 4ILHA 1E3MA 4KTWA 4CF1A 1VAZA 2UU9K 3VQ9A 3MX2A 2YHWA 5LL6Z 2Q1NA 4FWOA 4B3RK 1JXEA 4JKGB 1LV5A 4QOZB 5ELZA 4F9OA 1QSSA 3SQ0A 4KH6A 1WAJA 1HNWK 1ITGA 4KV8A 2HBLA 1HMVA 2Y1JA 3AO2A 3EY1A 4FK0A 1ZBUA 3MN5A 2A6AA 2UXBK 1NGAA 1NLVA 2VWJA 4CEEA 4LY7A 3NGIA 4C8LA 3IKMA 4DTRA 4GKJK 4XH5A 1GLJO 3O4NA 1T6CA 4EIAA 3I56N 2P9LB 3D45A 1S6QA 4FOEA 4Y0WA 5FRNA 1TKTA 4A2AA 1RGIA 3O3FA 2QXFA 2A1RA 1MWKA 2HBKA 1D4XA 4GY2B 4CJFA 3VQQA 5AJ3K 3L8BA 2CGJA 3OHRA 2X6SA 3RVCA 3WXLA 1BI4A 3KD1E 4DSIA 4JI4K 3OJSA 1NK7A 4E7HA 1RCHA 3GBTA 2E8AA 3ZEUA 2O8BA 4K0KK 1IKYA 3AVJA 3EZWA 2XRIA 3TAPA 3SCXA 1TKXA 2VQEK 3DXKA 4I9QA 1YTUA 1S5JA 2BH1A 1DEJA 5AQZA 2QA4N 3AVGA 4FVUA 3CJ1A 2AP1A 1NGHA 1S22A 5AQJA 4CERA 1IG9A 4NB4A 1OH5A 3SQ1A 3AVCA 3TSQA 4F3TA 1QHTA 4FK4A 2BANA 4BRDA 1Q9YA 1NGBA 4KKOA 4PL7A 4H5TA 4B9MA 5JVGL 1NKBA 2WFBA 3OBWA 4DG1A 4JRPA 4CFDA 3P4IA 2W42A 3CCUN 2NZTA 3RSEB 1BGXT 4BC3A 1SZ2A 3OYMA 3J7ZO 4RTFD 4CD1A 3NDKA 1C1CA 4I6MA 4BC2A 4CJQA 2P9PB 4Y1DA 4PY5A 1FKPA 2PYLA 4IXCA 3H1VX 1KAYA 4N5SA 4KHWA 3ULEB 3CCVN 1C0GA 4G9ZA 3WXKA 3ZSOA 3T69A 2OPSA 3CJCA 5AQGA 2H3GX 3MN9A 1RTJA 4H4MA 1N36K 5LMUK 4K41A 3DLLL 3K2PA 1HKGA 5JVHL 3SUNA 3B6PA 3MDQA 3JS6A 3AVAA 2V52B 3PO4A 3LDPA 4DSEA 1U2VA 1X9SA 5CR4A 3J81O 1QS4A 4H0VB 4O8KA 3VPZA 4JKHA 1MWMA 4JKBA 3HO1A 4HTLA 3H3OB 2HVIA 5B8HA 3CXCM 4KB1A 4CBWA 3QO9A 1YJ9N 4RW7A 2ZGZA 3AVFA 4IO9L 3SQ4A 4I6MB 1YVNA 1EP4A 3PLAA 5M1NA 4FJXA 4RG8A 5FPEA 2VGNA 3C6HA 4FO0A 4WFBL 2P9KA 5AZJA 4FWPA 3CFOA 4U67L 2Q3SA 3MEDA 4EHUA 3KD5E 3C65A 5E26A 3L3UA 2V51B 1VQ7N 4JI7K 3OYLA 1VSDA 4Z94A 4FWLA 3ZSXA 4DCHA 4DV3K 1DGKN 3CCSN 1XNRK 1YVUA 1QZ6A 2PY5A 3F5TA 4FOIA 1SUQA 4LF5K 4A57A 4NCAA 5C15A 3R9PA 3D6RA 2PFUA 2O8EA 3CYMA 3PSFA 4RW6A 4CZFA 3KLGA 1VQLN 4WQ4A 2F4VK 1C6VA 4OPAA 3L2QA 4JI8K 1NGGA 1RT1A 4O44A 4J2AA 2NRTA 3TR8A 4FLUA 4CJ3A 3AY9A 2WC9A 2FSJA 1BDGA 3DAWA 4DFKA 4H0XB 2Q97A 5HOOA 2NRHA 1QE1A 4ZTJA 1BCMA 4DFJA 3CC2N 3KVGA 2P5GA 3CMAN 4BG8A 1YAGA 2P9KB 2HB5A 3GDQA 3L6QA 4B1UB 3HXMA 2RN2A 1RDAA 1LOTB 3FR0A 2YNFA 3MX5A 3VMFB 2G8UA 2PYJA 2YHBA 4CHPA 3UE5A 2E4LA 3O3HA 1RTDA 3ZSWA 4AHSA 4JI1K 1KVAA 4M3WA 5AQLA 2DFFA 5KGWA 2JWKA 2VQFK 1NMNA 1LW0A 2R7YA 5AQMA 5FPMA 4J8FA 3DLKA 1J6ZA 2VGMA 4RCHA 4DMNA 1LW2A 5FPNA 2O8EB 2A42A 3LANA 3RMAA 4FK2A 1C1BA 3CERA 1VQON 1EQYA 1D9FA 5FDLA 3PO5A 1UWBA 4DTUA 3QBXA 4FSVA 4IOAL 4PUOA 4DWIA 2IVPA 1S1UA 3WXMB 4B1XB 4FYDA 4QS9A 1NJWA 3QFPA 4WQ5A 1OKJA 4LC9B 4CFBA 3SUPA 4CD3A 4E1JA 3V1OA 4UY8O 5AQOA 2JWLA 3DXMB 1X9WA 4ZHRA 4KH4A 1YUWA 4CJ4A 1E4FT 5GIPA 3VQ4A 3Q7CA 3VETA 4KH5A 3ENHA 3SUOA 5AR0A 1YJWN 2VWBA 2ZF5O 2ATQA 3TAMA 3HZ6A 4A5AA 2X78A 3TWHA 2P5OA 3OVNA 4X62K 4FJ5A 3OYAA 3I33A 4MO4A 4MLEA 4DU4A 2WTUA 4PL8A 5A2QO 4CIFA 3TTDA 5HRPA 3QB0A 3KLFA 3CFPA 5D3GA 1WSHA 3CCQN 1Q7YO 1TGOA 4M3XA 4BR4A 3VEWA 1RT5A 5CE3A 3SMSA 3OYFA 1NK0A 3VGMA 3ENBA 3A0IX 4DS4A 4O0JA 2FSNA 3CETA 3GG4A 3SYZA 3KWIA 3THYB 3IRXA 3L2UA 3CD6N 2IS3A 2GWKA 5EXWA 1WOQA 1WNSA 1V4SA 2HW3A 4W5OA 3D2FB 1KVCA 3QEVA 3ZT0A 1C0TA 4CBUA 3CJAA 5K14A 2YHXA 4I2QA 4LFCK 3P1GA 1XMOK 4RW4A 1U48A 1XI1A 3HOTA 1FW6A 1RT4A 3PY8A 4BRFA 3ZSQA 3KKSA 1KRPA 4BC4A 3J8AA 4H0OA 1ZXOA 2G8HA 3C6AA 2OANA 5BN8A 4DSKA 2HHSA 3WNFA 4PA1A 3IS9A 4U7BA 3ULDA 4KHQA 3RR7A 1REVA 4DU3A 1T6DA 4GW6A 3LDOA 3DI6A 4PKHA 2I7NA 3ALYA 4AM7A 1XHXA 2NNWA 4DU1A 1TKDA 4EZ9A 4ILJA 4FVMA 2IOCA 4FM0A 3SK3A 4DUYK 4M3UA 1TVRA 1U49A 5HP1A 4H0TB 5SZTA 3CIPA 5KGXA 3RWUA 2HOEA 4OKJA 1ASWA 1H1VA 4FJGA 3TI0A 5HRRA 4XEIA 1Y64A 2JLEA 1GLCG 1ATSA 3TSUA 3IUCA 4H4OA 2D0BA 3MMVA 4KFBA 1D9DA 4MDBA 1C0UA 1YF5L 2Z1IA 4M3YA 3FZKA 4FLWA 1M1KO 3VESA 1ATRA 4ISEA 4CVNE 4I2PA 4BRQA 2YHYA 4JNEA 4F3OA 3ZCMA 4GVMA 1S1WA 1U04A 4BRLA 5EVZA 4H03B 2A5XA 2W6KA 4BG9A 3LDSA 1JLEA 4WE1A 4CIGA 1XC9A 2YHAA 5ADXH 1J54A 2D0AA 3C6TA 2AJQA 4EZ6A 1VQMN 3U3YA 4L8RB 2O8FB 4FM1A 4HTUA 1WSFA 4FJ8A 4KBOA 4B8AB 3WNHA 2DY4A 1KTQA 1BHLA 2O8DA 1G15A 3QEIA 1K9MO 3LAMA 5KI6A 4IFEA 3QDKA 5AQSA 3R3LA 3ZETB 4EHTA 2Q0UA 1VRUA 3K59A 4JI5K 3A5OC 3SJHA 3V9XA 4WQ4C 5J2PA 1BQMA 2GX9A 3H1QA 3E9OA 3NF9A 4FZXC 4CZJA 5F0XA 3SZ2A 4LF8K 4EFHA 1JXBA 3MCPA 1TL1A 1DT9A 5JICA 4GV6A 1GLFO 3H46O 1TUYA 1VQ6N 4B1WB 4FJLA 2ZE2A 3M8QA 4Y1CA 2IAJA 4JKGA 1I94K 2NUBA 4G1QA 2P9IB 5C2DA 3TSPA 3LPTA 4JEPA 1JLFA 2X6NA 3NCIA 2UUCK 3CJ7A 1Q82O 4TSXA 3HTVA 1Z6RA 4YOWA 3HM8A 4DSJA 3M8PA 4DV5K 3U4LA 4B1VA 1VSLA 3KWGA 1D5AA 4YOUA 2O8DB 3QESA 4GNIA 2WUSA 3ZX2A 1NBWA 5IT9O 3B6OA 1TYQB 4OX9K 3DLGA 2QI2A 3T7ZA 5J1EA 2QWRA 1LWCA 3AAPA 4DTXA 3THWA 1W0HA 1NNEA 4E7KA 2P1JA 3SPYA 5AFUH 2D4WA 4E89A 2IDOA 4YOVA 4K8XA 3LDLA 5AQRA 2F8SA 2B4JA 3KK1A 2YNIA 4JK7A 3QBWA 2HBJA 2ZWHA 1HNZK 3RR8A 2ASOA 4CHYA 2JGUA 1EWRA 4JI3K 5CHIA 4O55A 3HSTB 3AA2A 3J7YP 3S3NA 4C8NA 4WQ5C 2QWQA 4B9QA 4BRIA 3QIPA 4ID1A 1NK6A 4AHTA 4IEEA 4W5NA 4CI6A 4FWRA 5I9EB 1UA0A 4Z4HA 4DV4K 1KLMA 1W7AA 1KAZA 5HLFA 2KLAA 3CPEA 4H0YB 3PX6A 4JKEA 3JXUA 3TAFA 2HMPA 3F9MA 1ZBLA 4JRQA 1KVBA 1ZBFA 1YI2N 2FLOA 4NLBA 1JLGA 2GV9A 1CXQA 1RT3A 4M41A 3LP2A 3C95A 3PV8A 4W5RA 3TU5A 2QWMA 2XY5A 2OZSA 4JKAA 4EP4A 4B9VA 3CM6A 3CCMN 4FWQA 3QEWA 3THWB 4ISFA 5BREA 1OVYA 4J2BA 3RSEA 2HHWA 1L3VA 2UXCK 2Z1HA 4M3RA 5F2RA 2P9PA 4IOCL 4CZEA 5DM7L 1VK0A 4FW2A 4E19A 3THVA 3WEEA 3OBYA 2YJFA 3HBTA 3HK2A 2CGKA 1X3NA 3S41A 1I39A 4BR7A 3ULEA 4CEBA 2QTDA 1G99A 3M8SA 5IWAK 3BGRA 1CLQA 2VG6A 1K8KB 4FJ9A 5M1FA 3GOIA 2BGGA 1JCGA 1LAWA 1ASVA 3C6UA 1QQNA 4LD0A 4H5RA 1QSLA 4CJ7A 1BOTO 4DTOA 3UIQA 4MO5A 4PKGA 3M8RA 4I9LA 1ZYQA 3WXIA 4Z4CA 4WFNL 5CYMA 2AA4A 5I3UA 1HNIA 3VF4A 3AO3A 3NH2A 1JLAA 1QHAA 4V19S 1X9JA 3I8BA 3FGUA 1NJXA 3PSIA 2IVNA 4CFAA 2FBXA 3PX0A 2FXUA 2GUPA 3FFIA 1VSIA 1XWLA 3BP8A 1S1XA 4DR1K 4DQIA 4BY9C 4CJ5A 4LFBK 1RDCA 3WEEB 1RBVA 1O13A 4OGCA 2O8CB 1UOCA 1CZBA 2KKZA 3K9JA 3L2VA 3JSMA 3QICA 1JLBA 4DQPA 2KHOA 3K5OA 3LP0A 5FRMA 1VQ5N 3EZ5A 1RBUA 1EKEA 2NRRA 3N4QA 3KLHA 4CGHA 3MXIA 1SQKA 2XY8A 4KI4A 3U8XA 5BRDA 2WOMA 2ZD1A 1XMQK 3EEQA 1VQ8N 3W0LA 4CGJA 4DFPA 4C8OA 2ZQBA 3NFAA 4IZ9A 4E0DA 1JL1A 3HI0A 1NG9A 3OW2M 1NKEA 2YKMA 1RT2A 3O3GA 1A5XA 3MWTA 5KRTA 3SAHA 5BPLA 1EO1A 3VQPA 4OKEA 3D2EB 3LDQA 2NRVA 3A5MC 3TAGA 5M1OA 2QK9A 5FLXO 3AVIA 5EU7A 3SV4A 3DLHA 1VSMA 4AHRA 3ZT2A 1KFDA 2RPIA 3CF5L 1N8RO 4EP5A 5KRSA 1RDWX 3UKRA 4M42A 4DF8A 3R6MA 4CBXA 1JJ2M 1ZBHA 3QEPA 1F21A 4DV1K 1XUPO 1RTIA 5AQFA 5HBMA 2Z1GA 2P9NA 4CEFA 2HHVA 4LF6K 4YORA 2ZJRL 1JKHA 4DF4A 1HUXA 2P51A 3KK7A 3LALA 3LM9A 1ZBIA 3K5NA 4DTMA 3OS2A 1EXQA 3HP9A 1T7PA 3DYAA 2GEMA 4E1MA 3VEOA 4F2RA 4B1YB 3ITHA 4KHUA 4N76A 1C0FA 1MU2A 2NLXA 3M6GA 1N34K 1RNHA 2YI1A 3BZCA 3SMPA 3MEEA 3CI5A 1LCUA 4N47A 4JS5A 2GELA 4GKKK 4ELTA 4CGGA 1OH8A 5C12A 4BGAA 2ZGYA 4YOYA 2E5LK 4CK1A 4BRKA 5HROA 1C0MA 1QZ5A 3T19A 4BC5A 2HNDA 3AVLA 3DXMA 1Z26A 5AQQA 3HVTA 3UKRB 1BISA 3HL8A 4IBNA 3UKUB 3LPUA 4KI6A 4Z4FA 2P9NB 3C7NB 3LZIA 1B9DA 4HUFA 1QQCA 4FLTA 4BVPA 1JLQA 4M7YA 3ATVA 2VG7A 2YJEA 4UQGA 1GOBA 4GV9A 3O4WA 2UXDK 5BPNA 4DHYA 1SL0A 3TANA 2A40A 1J53A 3O5BA 3VTHA 3OYHA 3TABA 3IMXA 3HPOA 1GOCA 4B9SA 1IH7A 4BR0A 4CJRA 3RMBA 4E7IA 4IKFA 4FJKA 4FJJA 3O8MA 2Z1JA 3MK6A 3THYA 3VERA 4FZZA 2ETJA 3HOSA 1CXUA 4CJEA 3O9TA 4C8MA 3BF3A 3VGLA 5JLFA 1EX4A 3MXMA 3E9LA 4CJSA 3D2FA 3AA3A 2G8VA 4CZHA 2OCEA 4CFCA 2F9WA 3FZLA 2VCPA 1NGJA 2Y1IA 1SAZA 3SUQA 1YHQN 4BACA 1S72N 4DQRA 2G8WA 5J2QA 4DR7K 3SQ2A 3SBTA 3CQYA 1N5YA 3MCAB 5LY3A 2YCHA 1NU0A 4DTNA 5JLHA 2E1ZA 2CH5A 4HHTA 4IG0A 2HF3A 3V9UA 3QMLA 3OA9A 3I0RA 4BE2A 2LSNA 3E01A 1HNXK 3NVMA 3VQCA 5AQXA 2I7PA 2QWLA 4B8CA 4CEAA 3S9HA 1WSIA 5GIOA 3TARA 3BUZB 1IV0A 3ISNC 3VN5A 1IJJA 1TL3A 3VQBA 3T1AA 5E41A 1E4GT 3PIPL 4DTJA 4N41A 3HM9A 3QNNA 2DFHA 2E2OA 4AILC 1U45A 4IJAA 1FK9A 4PQUA 3K5LA 2V7ZA 1X9MA 3VEYA 2OPPA 4LFAK 3I8DA 1LWEA 5AZIB 3VF2A 3VQ5A 2O4IA 4MLHA 1TAUA 2Q36A 5AQVA 3AARA 3ZSYA 4J2EA 1QVGM 3VQ8A 4CJVA 5AQHA 3F9KA 2KFZA 3CG7A 1BIUA 4JK9A 3KTQA 4QAGA 2CGLA 2HF4A 3IFRA 3M5RA 5EOYA 2VYPA 4YFUA 3K58A 4H8KA 4B3OA 1S6PA 1VRTA 3OS1A 4DB3A 1NJZA 4A5BA 1TV6A 2QKBA 4BROA 3ZSVA 1HR0K 2DPNA 1IBLK 2O8FA 3T1YK 4LF7K 4ILGB 4E1NA 2Q31A 3PX4A 4NLCA 3A8YA 3AVHA 4C23A 4Z4GA 4DSFA 3KIOA 1W9HA 3ZSRA 3SJJA 3MEGA 3CCLN 1BL3A 5GAGP 4ELUA 1NGIA 3CFRA 5CZ1A 4BWMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3PLA A;  4BY9 C;  3NVK A;  3T7Z A;  5GIN A;  5GIO A;  3NMU A;  2NNW A;  3NVM A;  5GIP A;  3ID6 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1SKR A;  1TK0 A;  2D0O A;  4FW1 A;  3HJF A;  1NK9 A;  4B3T K;  4FJI A;  4N56 A;  2IGI A;  3V9W A;  2P9L A;  3OYI A;  4BQL A;  2J4R A;  4FCY A;  4DQS A;  3JAM O;  4R79 A;  5KPZ A;  3L2R A;  2D5R A;  1U4B A;  2F7T A;  2XHB A;  4DSL A;  4NYF A;  3NF6 A;  1LWF A;  5KQD A;  4E3S A;  2W6L A;  1FJG K;  3QER A;  3CM5 A;  4DR6 K;  2HBM A;  2KZZ A;  4F2S A;  1P8Z A;  4AHV A;  1BIZ A;  4JAX A;  4FJM A;  4JKF A;  4ILH A;  1E3M A;  4KTW A;  4CF1 A;  1VAZ A;  2UU9 K;  3VQ9 A;  3MX2 A;  2YHW A;  5LL6 Z;  2Q1N A;  4FWO A;  4B3R K;  1JXE A;  4JKG B;  1LV5 A;  4QOZ B;  5ELZ A;  4F9O A;  1QSS A;  3SQ0 A;  4KH6 A;  1WAJ A;  1HNW K;  1ITG A;  4KV8 A;  2HBL A;  1HMV A;  2Y1J A;  3AO2 A;  3EY1 A;  4FK0 A;  1ZBU A;  3MN5 A;  2A6A A;  2UXB K;  1NGA A;  1NLV A;  2VWJ A;  4CEE A;  4LY7 A;  3NGI A;  4C8L A;  3IKM A;  4DTR A;  4GKJ K;  4XH5 A;  1GLJ O;  3O4N A;  1T6C A;  4EIA A;  3I56 N;  2P9L B;  3D45 A;  1S6Q A;  4FOE A;  4Y0W A;  5FRN A;  1TKT A;  4A2A A;  1RGI A;  3O3F A;  2QXF A;  2A1R A;  1MWK A;  2HBK A;  1D4X A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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