3ID6A

Crystal structure of sulfolobus solfataricus nop5 (1-262) and fibrillarin complex
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
VKIYLIEHVIGAVAYDENGNIVDYITNPRDLGKITEELLNNEKGIPFSATVELLKKVNPQEVVVENEAEVPKLQALGYRVSYEPYSKVSRIFRESLPKVAIDIKFASNEEDYYNFLHELSLEYTRRKLRSAAQKRDLLAIQAVRAMDDIDKTINLFSERLREWYSIHFPELDKLIEDHEEYATIVSRFGDRGFLTIDSLKELGFNEQRINRILDAAKKSIGADISEDDLSAMRMIANTILDLYNIRRNLNNYLEGVMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural organization of box C/D RNA-guided RNA methyltransferase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pre mRNA splicing protein
molecule tags Transferase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 97
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.220 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3id6A01
3PLAA 5GINA 3ID6A 5GIOA 2NNWA 3T7ZA 3NMUA 5GIPA 3NVKA 3NVMA 4BY9C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I9LA 5AJ3K 3R9PA 2Z1IA 3C7NA 4IOAL 2QWMA 4DR5K 3VPZA 3CCLN 2DTUA 2ASPA 4BC5A 2ASOA 2Y1JA 3ZT1A 2P9IA 4HVJA 5KQDA 4CK1A 4E19A 4DSLA 3LP2A 4GV3A 3HVRA 1N33K 2OZMA 3KVGA 1RT3A 4BR7A 2HMIA 3LDLA 5AQYA 5J1EA 2F4VK 1LWFA 5BPNA 3VQ4A 2QWPA 2XY5A 3K58A 5FPEA 4BDYA 2HHUA 3CCEN 4B3SK 1VQ7N 2QXFA 5AQJA 1XHXA 3OYBA 4ICLA 4PKHA 3RRHA 3ZETA 1NK8A 2HW3A 4C8LA 5K14A 2O8FA 4NLBA 2A5XA 3OS2A 3QNNA 4IBNA 2FF3B 1P90A 5C0YA 3FE1A 3OTOK 2P5OA 4ZTJA 1JCEA 1NNEA 4JRQA 1KAXA 4YNQA 1W7AA 3WXJA 3PIPL 3AVFA 4BRAA 4CZHA 2KZZA 2OPQA 4CFCA 1KAZA 3VF2A 2Z1GA 4JI5K 4CJLA 5LJVA 5D3GA 3O1BA 3THYB 3VEVA 1ASVA 3SQ0A 1KVAA 1HR0K 1YAGA 1LWCA 3CCVN 1Z6RA 2YNHA 3P83D 3R1XA 1X9SA 4HWIA 2Q0UA 2RKIA 1JLQA 1O1WA 2P9KB 1S9GA 1SKRA 1VQMN 4LC9B 1MWMA 3C0BA 4KHWA 1XI1A 2E1YA 4RW6A 3VEWA 3CCRN 2G8VA 1N32K 4OX9K 2BGGA 4FWRA 4RW4A 2KLAA 1RCHA 5BN8A 3THVA 1MU2A 5AZJB 5CZ2A 3CCMN 4F2SA 2Q3SA 4BRHA 4NO7A 3PX4A 3CETA 3EZWA 1ZBUA 3SPYA 5AQHA 5B8HA 3HPHA 1S1XA 3O4WA 3K0SA 3PSIA 3JAMO 1YI2N 3VMFB 5AQSA 3KZBA 3QIPA 3TPQA 3MK6A 3AVJA 3BP8A 4EFHA 4JI4K 3KKSA 4V19S 3CQ8A 1YTUA 3T1AA 1ITGA 1RT5A 5GIOA 4CFDA 4JK7A 4O0IA 5FLXO 3TAGA 1BDGA 3ULEA 4NB4A 3DLBA 1WN7A 4DV5K 5CY4A 4KRFA 5KGXA 4ZHRA 4FW1A 3V9ZA 1FJGK 2GBZA 4FLVA 4QOZB 3BEXA 3EL2A 4DTRA 1T8EA 1CZBA 4FJ7A 2UYTA 3H08A 2O8DB 1VQ8N 4DR3K 4CD1A 3V1OA 2XO7A 4JI0K 1A5XA 3JYTA 4G9ZA 4KH5A 3IG1A 4BRGA 1GLEG 4IEEA 2OYQA 4DLEA 3LPUA 3O3GA 3V4IA 2PYLA 3M6GA 4CIFA 1NK7A 5BN9A 2P9SB 4KAZA 1ZYQA 4ELTA 3M8SA 4MO4A 4IJAA 3VTHA 3M3ZA 1WLJA 2HSTA 3NVKA 4B9VA 3FFIA 1VHXA 1SKSA 2ZE2A 2YKMA 4YY3K 4FJGA 1JJ2M 3ZT0A 4CF0A 2DFFA 1YIJN 1RBUA 4CJEA 3DI6A 4BR2A 3QICA 5AQUA 4DB3A 3KK3A 3S3OA 4DF8A 4U7BA 2HBJA 4BR5A 3LWLA 4PKGA 4I7FA 2VQFK 4HTLA 3ZT4A 3M8QA 5JVHL 5AZIB 4H03B 1Q86O 2D0CA 4KO0A 1SV5A 3ZSOA 4FK4A 4GV9A 3VF4A 4H0XB 1YJNN 4IWVA 2A6AA 1XNRK 4FXDA 1T44A 1HMVA 2F8TA 3AO4A 4DR7K 2HMPA 4B9TA 4K8XA 3NFAA 4OGCA 4DSKA 5M1PA 4M41A 1KFSA 4J2BA 3T69A 4IFVA 4DV7K 3HSCA 4BQLA 2VG7A 3CPWM 2D1KA 3HL8A 3IRXA 4KV8A 3CPEA 4FCYA 3TAQA 3S3NA 2ZJRL 4M3TA 4CJ5A 5FROA 3KK1A 3C6AA 1A5VA 3EZ5A 1FK9A 1QS4A 4CFBA 2E20A 4YOVA 3OYFA 1VSJA 4MO5A 4DV0K 1LW2A 3BF1A 4H0PA 4OKKA 1Q8IA 4IO8A 1RTJA 3CERA 3H1QA 4BRKA 2ZQBA 2RE2A 5KRSA 5EXWA 2KW4A 3BGRA 4Q0BA 4BVOA 4FW2A 4I2PA 3F9KA 1S1VA 3H1VX 2CGJA 3L3VA 2HF4A 3UKRB 3E9PA 4JI2K 5GAEP 3E9LA 4DR2K 2BDPA 4CGGA 4WQ5A 2IVOA 1YTAA 4IO9L 1N34K 2CH6A 5AFUA 4DMNA 4WFAL 1DT9A 1NOZA 2ZJQL 2LSNA 3IMXA 5AQNA 3FZKA 3MXMA 1L3VA 4KHYA 5EY4A 4CHZA 4E7HA 2Q1NA 1TV6A 3NHGA 4CE9A 5AFUH 3GE1A 3G6EN 1NKCA 2VG6A 3L8BA 1IBLK 4CZJA 1HNIA 3K5OA 3M8RA 3R8EA 4LFAK 2OPSA 3HM9A 2E1ZA 3OBWA 4O44A 1QQOA 5JLHA 1WSGA 3RMBA 2HNDA 1BHLA 3VGKA 3KJVA 1SL0A 5TKYA 4DSFA 4BWJA 4DTUA 4ILJA 3HVTA 4FJ8A 1WAFA 3WNFA 4B3MK 3H6EA 3TTDA 4FJNA 4E7LA 1D9DA 4H0VB 1C6VA 1I3AA 4CGFA 3WQTA 4BREA 2E2QA 4FLYA 1BCMA 1RT1A 3EYZA 3HT3A 4JS5A 3S41A 1HPMA 1TVRA 4I6MB 1FKPA 4FK2A 2P9UB 3BY5A 5ELZA 4LFBK 4A59A 3C65A 1K9MO 5KPRA 3RSEB 4OPHA 2QM1A 3U9ZA 4A61A 2QK9A 4BRDA 3E1YA 2HHSA 4CFAA 1BA0A 1U2VA 4JKHA 4FJ9A 4WF9L 3O3HA 2QWRA 3H3OB 2ZD1A 1VSFA 1NK4A 5C2DA 5HP1A 2FBYA 4CVNE 1Q7YO 3HP6A 2JGUA 3O08A 3AY9A 1DGKN 1T7PA 3ID6A 4FVUA 5F0XA 3CIPA 1N36K 1KVBA 1OH7A 2QEXN 3PV8A 4ZTFA 5HRNA 3DXMB 4Z4CA 1UAXA 3TAPA 1O13A 1I39A 1WB9A 4N41A 4JRPA 4C8NA 2OA8A 4DSEA 3HPOA 1YVNA 3ZEUA 2G8WA 2PZSA 4GV6A 3TANA 2X78A 2ZJPL 4IFEA 1VQLN 1HNVA 4CJPA 2YHXA 4CK2A 3T3FA 3K5LA 3DOLA 1IH7A 3DLKA 1J54A 4KB0A 2PFUA 3GBTA 3SMPA 1HRHA 3TU5A 2OTLN 3QEVA 4LF7K 1S72N 1TK0A 1LAWA 4EP4A 2W6KA 3V1QA 4Z4EA 4J2DA 1Q9XA 4CJ3A 1LAVA 4K41A 5BR8K 3QESA 1M1KO 4BY9C 2YNFA 4FZZA 2GWJA 2RPIA 2A1SA 4KI6A 3PUFA 1VSKA 4FJIA 3DJCA 4DU4A 2JWKA 3ATUA 1K6YA 4FK0A 4JHDA 3R3LA 2F9WA 4QS8A 1JLBA 1QZ5A 1XMOK 5MLCQ 3L3UA 5AQZA 4N76A 1S9EA 2HF3A 3LP0A 4BG9A 4UY8O 2YI1A 2O8BA 2P9LB 1WUAA 4OPKA 4JI8K 4YFUA 5J2QA 1CXQA 3E66A 4BVPA 5AQOA 5KQ8A 4JK8A 3RTVA 2GWKA 3CCJN 1L5UA 2NLXA 2D0AA 5GAGP 4AHTA 4JKAA 1HKBA 4Q5VA 1Q18A 2IS3A 3QB0A 1VSMA 3HPGA 3LDNA 2V7YA 1EXQA 2CH5A 4CCHA 3E01A 4CZMA 5FRMA 4A57A 1K8KA 3TABA 4DG1A 2KQ2A 3K59A 4CZGA 1P8ZA 1N8RO 2QI2A 3OJUA 2HVHA 3OS1A 4C23A 4CEFA 4FJXA 4E3SA 1D5AA 2Q97A 4CHQA 3B8AX 3HI0A 3CQXA 2CGLA 4FJKA 3O4NA 3T1YK 3LALA 4F3OA 2E8AA 4E1JA 3MEEA 2G8FA 5BR9A 4CBXA 5J2MA 4NCBA 1RTHA 2HNYA 2AA4A 5CZ1A 5JS2A 4BC2A 2ATQA 4CBUA 3HBTA 3VQ8A 3A2FA 4OVLA 4H4MA 4F4KA 4CJRA 4KBOA 3C6HA 2P9NB 2A3ZA 1NK5A 2YX6A 4WQ4A 4DSJA 1NK0A 5C42A 4ISGA 1Q82O 1RDUA 1VRUA 1A5WA 2AJQA 3AVNA 3QINA 3LDQA 4BR9A 5KPTA 1M90O 4FJLA 1U4BA 4DSIA 4ILHA 3VQ5A 1ILYA 4OPAA 5AQPA 3DOKA 1XMQK 2Q31A 1U47A 4C8KA 2Q2RA 3D45A 4B8AB 4RG8A 1IG9A 3CG7A 4JKGB 2O4GA 3CCUN 1ATRA 1VQ4N 2F7TA 1NM1A 5GAHP 4FM1A 3LDPA 3I0SA 3HYFA 4BACA 3M5RA 2UXCK 2ZGYA 3CHWA 1TKZA 4EIAA 3PY8A 3OW2M 2P51A 1C1BA 4DTMA 4TSXA 1QHTA 5HLFA 4FPAA 3ZSRA 3AO2A 4DCHA 3SK3A 1U49A 4C1NK 3DWLA 3CMEN 1QHAA 3PIOL 4IZ9A 1C1AA 4UQGA 4FWKA 4KREA 5AQTA 5I42A 4EAHD 4Y0WA 5AQMA 1L3SA 4KHSA 5E26A 1TK5A 2VGNA 2YKNA 1RBSA 2GTDA 4JEPA 2ZWHA 3HTVA 4JV5K 4MLEA 4O5BA 3LZJA 1BQMA 3MCAB 1ESVA 3U4LA 4GMJB 4DQ8A 3SJHA 2GX9A 4E7IA 3J7YP 1NGGA 2FLOA 4IXCA 4B9SA 3CFPA 1C1CA 2IVNA 3L2RA 1U48A 3FZHA 2BUPA 4CJFA 4WYBA 1TKDA 1N5YA 4LY7A 3VN5A 1DLOA 1HX1A 2G8IA 1HLUA 1KD1O 3DXKB 2O8EA 4FWSA 5CR4A 3HZ6A 4O0JA 4BROA 3NAEA 3SUNA 1W9HA 2PBDA 3EE8A 3K9KA 3MN6A 3OJSA 3ALYA 3MN5A 4CERA 2E2PA 4M63C 3OYCA 1RDDA 3L2VA 3HJFA 1IO2A 3O5BA 4GW6A 4BRNA 1Y64A 1BGXT 2B5JA 2VGMA 1WBBA 3MXJA 3KLHA 3AAQA 2UUCK 1C0TA 3CC4N 3P4IA 4CGJA 1DTQA 1MA9B 4DHYA 3U3YA 2V51B 2J4RA 4NLCA 4CF1A 4KTZA 1C0MA 4BRQA 4A2BA 5DM7L 3VEYA 1TAQA 1SAZA 1D4XA 1J6ZA 2P9PB 3PO4A 4EZ6A 5BRFA 3NGYA 3EY1A 3THXB 2H3GX 2GUIA 3FGUA 3A5NC 3LL3A 1BL3A 1X3NA 3THWB 1WBDA 5E41A 1NJXA 4DV2K 3V9XA 1NGDA 2E6LA 1S3XA 2NRRA 1RTDA 4WE1A 1RT2A 3A0IX 1BQNA 4DV3K 3C6TA 3RRGA 4AM7A 3VQBA 3OYKA 1WNSA 2OPPA 4CJWA 5C15A 3AAPA 2G8KA 4C8OA 4PHTX 2HHXA 1KC8O 1YT3A 2D5RA 3RMDA 3BF3A 5EX5A 4Z4GA 3FR0A 1HUXA 1SQKA 4FOEA 5BRHA 1RBRA 3V81A 2E5LK 3UE5A 5GADP 2O4IA 1WSFA 3UKUB 3IUCA 2HVIA 4YHHK 1B9FA 3AVHA 1ZBIA 3QETA 4DQIA 1JXEA 2R7YA 3D2FA 1D8YA 4BE2A 4CHYA 1IBKK 1S6PA 2D4WA 3AO3A 1TKXA 2HHWA 4EHTA 2HHTA 4DLGA 2NNWA 2W6LA 4FSVA 3D0PA 4RCHA 3CJ1A 2E2OA 2QW9A 3KD5E 1L3UA 2IVPA 4FLXA 3SUPA 4HHTA 2F96A 4DF4A 3SQ2A 5AQVA 3F2KA 4X66K 3TAEA 3ZSWA 3OYEA 4IKFA 4O4GA 1QVFM 4DS4A 4DFMA 1B9DA 3ID8A 4FYDA 1QQCA 4LF9K 1XNQK 4YORA 4BC3A 1NU0A 3H45C 5JMVA 4DFPA 3AA2A 3I0RA 1DKGD 1C0FA 1TYQB 3VQDA 3PLAA 3L4QA 3LP3A 4JK9A 3WXLA 1BI4B 4H5TA 1TGOA 2IDOA 2P9LA 1JLEA 3AVLA 1S1UA 3OA9A 4FM2A 1F21A 4RW7A 2WTUA 3CJ7A 3O4QA 1HNXK 4FJMA 4M3RA 3A5LC 3U6FA 4ID1A 4E7KA 4AHUA 1T05A 3O9TA 3AA3A 3PO5A 4NYNA 3C7NB 4X62K 4DTPA 1MDUB 3L4IA 2O8CA 1I94K 1NK6A 4DU1A 2P9IB 4YOXA 2P1JA 2OANA 1VSEA 4CJ7A 4K0KK 3EE9A 5KI6A 2ZF5O 4FJHA 4WFBL 1KRPA 5AQFA 1U04A 1NGFA 1WAJA 1NBWA 1HKCA 3KLGA 3G25A 2ITMA 1NJYA 4CF9A 3O1WA 4FLUA 2D0OA 3U9DA 5CHIA 3BZKA 3OYAA 3IS9A 3TSUA 3D2EA 1RT7A 4DR6K 1HYSA 4PWDA 1GOBA 1KQSM 3VQ9A 4NXNK 1RDBA 3ZETB 3N4QA 1HKGA 3KD1E 4JAXA 2O8FB 3AVBA 2NRVA 3CMAN 3CD6N 5CE3A 5C24A 3ATVA 3D6RA 2P9NA 1OKJA 2JWLA 3H46O 2QTDA 3WNEA 4B08A 4DR4K 1VQ5N 4LSLA 3EKUA 3T7ZA 1E3MA 3VQ6A 3P39A 1S1TA 4WFNL 3RR7A 3I56N 1WSIA 3W3DA 3Q7BA 1RNHA 3LDSA 1QQNA 1CZ9A 2ETJA 2OZSA 5LY3A 4AH9A 3R6MA 3P5JA 4CGDA 2Z1HA 5M1NA 1RILA 3MMVA 3O80A 1R0AA 3I8DA 3I55N 5EOYA 3H3NO 1BIUA 1TL3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3PLA A;  5GIN A;  3ID6 A;  5GIO A;  2NNW A;  3T7Z A;  3NMU A;  5GIP A;  3NVK A;  3NVM A;  4BY9 C; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4I9L A;  5AJ3 K;  3R9P A;  2Z1I A;  3C7N A;  4IOA L;  2QWM A;  4DR5 K;  3VPZ A;  3CCL N;  2DTU A;  2ASP A;  4BC5 A;  2ASO A;  2Y1J A;  3ZT1 A;  2P9I A;  4HVJ A;  5KQD A;  4CK1 A;  4E19 A;  4DSL A;  3LP2 A;  4GV3 A;  3HVR A;  1N33 K;  2OZM A;  3KVG A;  1RT3 A;  4BR7 A;  2HMI A;  3LDL A;  5AQY A;  5J1E A;  2F4V K;  1LWF A;  5BPN A;  3VQ4 A;  2QWP A;  2XY5 A;  3K58 A;  5FPE A;  4BDY A;  2HHU A;  3CCE N;  4B3S K;  1VQ7 N;  2QXF A;  5AQJ A;  1XHX A;  3OYB A;  4ICL A;  4PKH A;  3RRH A;  3ZET A;  1NK8 A;  2HW3 A;  4C8L A;  5K14 A;  2O8F A;  4NLB A;  2A5X A;  3OS2 A;  3QNN A;  4IBN A;  2FF3 B;  1P90 A;  5C0Y A;  3FE1 A;  3OTO K;  2P5O A;  4ZTJ A;  1JCE A;  1NNE A;  4JRQ A;  1KAX A;  4YNQ A;  1W7A A;  3WXJ A;  3PIP L;  3AVF A;  4BRA A;  4CZH A;  2KZZ A;  2OPQ A;  4CFC A;  1KAZ A;  3VF2 A;  2Z1G A;  4JI5 K;  4CJL A;  5LJV A;  5D3G A;  3O1B A;  3THY B;  3VEV A;  1ASV A;  3SQ0 A;  1KVA A;  1HR0 K;  1YAG A;  1LWC A;  3CCV N;  1Z6R A;  2YNH A;  3P83 D;  3R1X A;  1X9S A;  4HWI A;  2Q0U A;  2RKI A;  1JLQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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