3ID8A

Ternary complex of human pancreatic glucokinase crystallized with activator, glucose and amp-pnp
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
453
structure length
450
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 169
structure length 450
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3id8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3id8A01
5AQQA 2BTFA 5B8HA 4BQZA 2OANA 2FF6A 4H0TB 5AQKA 4QS7A 3ULEA 1KAYA 4CZLA 3GDQA 3ZEUB 3CQYA 2GWJA 2VWBA 2ZGZA 3HZ6A 5BPLA 4WYBA 4BRMA 1K8KB 3VEVA 1MWMA 1X9JA 2Q97A 2PBDA 1R59O 2P9LA 2A41A 2QWLA 5AQSA 4B1ZA 3J8AA 5F2RA 4XH1A 3UKUB 1TUYA 5FPEA 2E8AA 1BA0A 5BPMA 5AQRA 4K42A 4EIAA 3VF4A 3FLCO 4WQ5C 2HF4A 1YUWA 3VGKA 1Q18A 3ZETB 4L3QA 3H6EA 3R8EA 5FPNA 2CGKA 2E1ZA 5AZJB 5AQPA 1NGFA 2QXLA 1U2VB 4BR2A 1V4TA 1BOTO 2ZF5O 5AQJA 3SMPA 4BC4A 3FGUA 4H03B 2I7NA 3HBTA 5AQUA 1NLVA 2AA4A 3LL3A 2YHYA 1JCFA 3AY9A 1OKJA 4K41A 1DEJA 3MN9A 4IJAA 3O1WA 1NGBA 3ATVA 5AQNA 2NZTA 3CJ9A 3EN9A 3DXKB 5EVZA 4B9QA 3FFKB 3WXLA 2QWNA 3A0IX 4BVPA 5F0XA 3L0QA 2P9UB 3VF6A 1Y64A 4CD3A 3QDKA 2E2QA 4YDUC 3S41A 1CZAN 3MMVA 5AQHA 3WQUA 3VGMA 4BRCA 4DHYA 3C7NB 2P9IA 3IMXA 3B8AX 5AQLA 4FWSA 4PKIA 3CJCA 1C0GA 3VENA 5AZIA 4CZHA 2P9KA 4CZKA 4BRKA 5AQFA 4BG8A 4GY2B 1X3NA 5ELZA 2V51B 3AAQA 2A40A 1NGJA 3UB5A 3C0BA 3O1BA 2P9NA 4H5NA 4BRFA 4DQ8A 2PAVA 3H3OB 1T44A 4CZJA 3FR0A 3LDNA 4B1UB 1T6CA 4FWPA 1QQMA 3IDHA 4CJ7A 1HUXA 3LDQA 1IG8A 3VEXA 1ATSA 1BU6O 2DPNA 3FZHA 4H0PA 3BF3A 2FLOA 1WOQA 4BRQA 4BRPA 1YAGA 1XUPO 3VEZA 5AQTA 4H5VA 3FE1A 4HTLA 3MDQA 2QWQA 1RDWX 5BN8A 2P9LB 4XEIA 1LOTB 3H1QA 1P8ZA 3VESA 3CJ7A 4FWLA 2E2PA 4FOEA 2YHWA 3VPZA 2YJEA 3O08A 2ZGYA 4JHDA 1JCGA 4HWIA 4BC5A 1HKGA 3ATUA 5CE3A 5JLHA 1J6ZA 1GLCG 3U9ZA 2GTDA 2E2OA 2QW9A 4H0XB 3U8XA 2E20A 3UKRA 3MK6A 3EL2A 4FWQA 5TKYA 1TUUA 4PKGA 2KHOA 4IWVA 4I6MA 4MLEA 1GLBG 3WEEA 3GG4A 4BRDA 2QWPA 3U4LA 4CI6A 2HOEA 5BRDA 2A5XA 2E2NA 2A3ZA 4FPAA 4CZMA 2FXUA 3VETA 3FZFA 3ENHA 2ZWHA 4QS9A 1E4GT 3EKSA 3VERA 5LJVA 4B1WB 1KAXA 4LC9B 4EHUA 1ZXOA 4BRAA 2Q31A 2ASMA 4FWKA 1Z6RA 4CZFA 1U6ZA 2CH5A 1QZ5A 3A5OC 4RCHA 4E1JA 3RSEA 3QFUA 4M63C 5LY3A 1ZC6A 1EQYA 3CIPA 4FPBA 3VEYA 1ZBSA 5BRFA 1V4SA 3R6MA 4H5WA 4J8FA 4K43A 4EHTA 3AAPA 1GLLO 1D4XA 2D0OA 5E26A 2CGJA 4CBWA 5EY4A 4C23A 3CERA 2GUPA 2QWRA 5E84A 3P4IA 5AQMA 2P9KB 4BG9A 4O8KA 2P9SA 3MN7A 3D2FA 4M7XA 3JXUA 3HTVA 5KPTA 4K25A 3GE1A 4H0OA 4BQLA 5JLFA 1K8KA 4H0YB 3MCPA 4IJNA 4XH4A 1BG3A 1C0FA 4A2AA 3H3NO 3U9DA 2E88A 4MLHA 4BVOA 2BUPA 1BA1A 2YJFA 4BR4A 3UKUA 1SQKA 5AQWA 4JNEA 3IFRA 3F9MA 5EXWA 5EOYA 4BGBA 1NWKA 4PKHA 5FPMA 3EZWA 2P9PA 3L4IA 3M1FA 1LCUA 5BREA 1KAZA 2H3GX 5AQYA 3L6QA 3QICA 2CGLA 3A5LC 4CZEA 3VEWA 3LDPA 4ISFA 5JICA 1HX1A 2F9WA 5AQZA 5AZJA 3O80A 1ESVA 1U2VA 1BDGA 2CH6A 3DXMA 2Q36A 3O6WA 4PL7A 4XH5A 3DJCA 4B1XB 4NO7A 1GLEG 3WXKA 3A8YA 3ULEB 1Z05A 3UKRB 3ID8A 3QMLA 1NGEA 3M6GA 3WXJA 4CD1A 5AQVA 4A62A 1T6DA 2A42A 5F1XA 4I6MB 3GOIA 3WEEB 3CETA 3FZLA 4BGAA 3QBWA 3D7EO 5AQIA 2VYPA 4JD2A 3AARA 2P9UA 3CJ1A 3TU5A 1YXQA 1NGDA 3BP8A 1SAZA 4DCHA 2WUSA 4Y0WA 1YVNA 1G99A 2Q0UA 3KVGA 3HI0A 3QB0A 3WUHA 3WXIA 4DB3A 3UE5A 1GLJO 2FF3B 3C7NA 3BF1A 4BR0A 1HKBA 3O4WA 4PL8A 3RSEB 2ITMA 1HJOA 5JMVA 1DKGD 1BWFO 3VGLA 3HSCA 3I33A 3LDLA 4FWRA 2W40A 3ENOA 3CJAA 4A2BA 2Q2RA 2Q1NA 4RWTA 3VF2A 4IO8A 3D2EA 3D2FB 1NGCA 1DGKN 1HKCA 2VCPA 3CQXA 3I8BA 3MN5A 4CBUA 4JN4A 4BRLA 1XC3A 3LM2A 3FZMA 1HLUA 4ISGA 2V7ZA 2V7YA 4H5RA 3TPQA 1MDUB 3KHYA 3HM8A 1TYQA 1XQSC 1BO5O 2ASOA 4GNIA 5AFUH 2ASPA 4FWMA 1NGGA 3JS6A 2YI1A 5LJWA 3W0LA 2QWMA 2F9TA 2P9IB 4CZIA 4BRGA 4EAHD 4BC3A 1H1VA 4MO4A 3H45C 4BR7A 3H1VX 4NB4A 1RFQA 4F9OA 4B1VA 4BR9A 5AZIB 2P9PB 1IJJA 4B1YB 4WQ4A 3LM9A 2NRHA 5ADXH 2HMPA 3EKUA 3BUZB 2D4WA 3DAWA 4BRHA 2P9NB 3QFPA 3ZEUA 3CI5A 1QZ6A 1SZ2A 5AR0A 3DXMB 1NBWA 2FSNA 3FZKA 2AP1A 1NM1A 2IVNA 3H46O 3O5BA 3ZX3A 4RTFD 3KZBA 3ZX2A 2FSJA 3W3DA 3SJHA 1GLFO 1NGIA 2YHXA 3DWLA 3QBXA 2V52B 4Z94A 1MA9B 4BC2A 5EX5A 1S3XA 1JCEA 4AM6A 3GBTA 4H5TA 4JD2B 2Q0RA 3IUCA 2GWKA 2W41A 3OHRA 3A5NC 3R9PA 3ZETA 1ATNA 4M7YA 5BPNA 1ATRA 4BRIA 4WQ5A 4JHDB 3WQTA 1QQNA 4IZ9A 4BR5A 2IIRA 5AFUA 4BRNA 2GEMA 2EWSA 4FO0A 3MN6A 4AM7A 5AQXA 2IVOA 2HF3A 1NGHA 2FSKA 4MO5A 1GLDG 2YCHA 4ISEA 5FPDA 1QHAA 5AQOA 4BREA 1QQOA 4KBOA 2UYTA 1E4FT 1NMDA 3DXKA 5BRHA 3VOVA 2E1YA 3CJBA 5ADXA 3BEXA 4FSVA 4JAXA 1GLAG 1HPMA 3M3ZA 2QWOA 5I9EB 3D2EB 3VEOA 1WUAA 2I7PA 3O8MA 3LDOA 4O5FA 4FOIA 1MWKA 3A5MC 4YDUA 2IVPA 1BUPA 1RGIA 2D1KA 3SK3A 1X3MA 4BROA 2QM1A 3GL1A 2NLXA 1KXPA 5KPZA 1TYQB 4IXCA 3SLCA 4CZGA 4EFHA 3CHWA 5KPRA 4FL9A 3G25A 3WT0A 4A61A 4FWOA 2J4RA 5KQ8A 3EO3A 5BR9A 5KQDA 4WQ4C 5AQGA 4FWNA 2D0PA 3SMSA 4QS8A 1S22A 2GELA 3ZX0A 4CBXA 5BN9A 1NGAA 4H0VB 2P9SB 2A6AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ULEA 1KAYA 4CZLA 5BR8K 3OYLA 3OW2M 3CQYA 3HZ6A 3VQDA 1RILA 4BRMA 3DLLL 3AVCA 1U47A 3LP2A 2Q97A 1N33K 5AQSA 2HHQA 3AA5X 1X9MA 1TUYA 3CD6N 5I42A 1VSEA 3KLHA 4Q5VA 1NK4A 2UUAK 3VN5A 1C0MA 4AHUA 1B9FA 3J7YP 2ZJRL 4K42A 5FRNA 4EIAA 1EP4A 5J2NA 4DV5K 3VGKA 3ZT0A 1Q18A 1S9GA 4BY9C 1QSYA 3DLRA 2GV9A 1CLQA 4HCCA 1U2VB 3SAHA 3LP3A 3SMPA 3FGUA 4H03B 2I7NA 4CEFA 4FJJA 4NYFA 1JL2A 1NLVA 4CJ5A 1KFDA 4WFBL 3KLFA 2P1JA 1XWLA 1FJGK 3G6EN 5C12A 2PYJA 1IKXA 5AQNA 1QSLA 1HNWK 4W5OA 3CJ9A 1SUQA 4J2AA 5KTQA 3OJUA 1S1XA 3A0IX 3LANA 3MX2A 3EY1A 1HPZA 5KRTA 3VF6A 4I2QA 1P90A 4CD3A 3PY8A 2X6SA 4IBNA 4FK2A 3CF5L 3MMVA 4KI6A 1VQON 2YV0X 4H8KA 4DHYA 4CEDA 3IMXA 3CCLN 3B8AX 5KGXA 4FVMA 5AQLA 1N32K 3LAKA 3VENA 5AZIA 4BRKA 4YOYA 4GY2B 2HHUA 2G8WA 1JLAA 3F9KA 3C0BA 3T3FA 1T44A 1JLEA 4IO9L 3FR0A 3LDNA 4CEEA 1T6CA 1VHXA 1SL0A 5DM7L 3RMDA 2NUBA 3VEXA 1YTUA 2DPNA 4IKFA 4CF8A 2Y1JA 4LF6K 5M1FA 4JK8A 4DU1A 2NRTA 1FK9A 2KFNA 4O0IA 3MDQA 1RDWX 3THVA 3H1QA 1W9HA 2QKBA 4M3WA 4HCBA 5C2DA 5LMNK 5CE3A 2VG6A 1J6ZA 4NXNK 2E2OA 3EL2A 3V81A 5TKYA 3AVJA 4PQUA 4PKGA 1CZ9A 2KHOA 1S6PA 4V19S 4I6MA 4B3MK 4BRDA 1BCOA 3U4LA 4E7HA 5BRDA 4O5BA 2O8FA 3DLEA 4LF7K 3FZFA 1T3VA 1VAZA 1L3VA 1S1UA 4QS9A 3EKSA 4IOCL 4CIEA 1FXXA 4LY7A 1VQ9N 5LJVA 3PIPL 3KD5E 1KAXA 2RE2A 1U45A 1RTIA 1ZXOA 4BRAA 1YIJN 4F2RA 2DFEA 4FJMA 4BE1A 4RCHA 2HNZA 3QFUA 3ALYA 3CIPA 3QERA 1ZBSA 4DTRA 4H5WA 4C8LA 1C1BA 5E26A 2CGJA 1EKEA 4CBWA 3VQ7A 3CCRN 3E01A 2GUPA 3TTFA 3MXIA 1Q82O 2O8CB 4PWDA 3D2FA 4UQGA 3K9KA 3PX0A 1RCHA 4K25A 3BY5A 3AVIA 5JLFA 3O9TA 1K8KA 3OBYA 4KFBA 1WAFA 4A57A 2WONA 5SWMA 3QIPA 1BG3A 1JKHA 4A2AA 4NCGA 2PYLA 5A2QO 3L2QA 3CFPA 2BUPA 5AQWA 4IDKA 4JNEA 5C25A 5LL6Z 4BGBA 3CC2N 3O3GA 4PKHA 3K0SA 4DTSA 5FPMA 3CYMA 4YOUA 4ICLA 2O4GA 3L6QA 3QICA 3A5LC 1D9DA 4W5RA 4LH4A 1ESVA 1BDGA 2CH6A 3O6WA 4OKKA 4YOTA 1L3TA 3CXCM 3RTVA 1YITN 1IKYA 5KRSA 2VGMA 3VQCA 3B6OA 1MU2A 3CCEN 3RVCA 3NMUA 4M3ZA 4DR5K 4I6MB 3GOIA 4KHYA 1ILYA 3SAGA 2E5LK 3DRSA 5CZ1A 3QBWA 3OYMA 4JLHA 2WOMA 3K59A 4Y1CA 3TU5A 3L3UA 2XO7A 2ZJQL 1NK8A 1NK6A 1O1WA 1YXQA 4RW4A 3OJSA 1SAZA 4IOXA 5C2FA 1G99A 1REVA 3AVKA 3TAQA 3QB0A 3WXIA 4CJRA 4FJIA 1GLJO 4HUEA 2HBMA 3BF1A 2ATQA 3O4WA 1NK7A 1HJOA 1RNHA 2ZD1A 3AVLA 1DKGD 1BWFO 1L3UA 4WF9L 4AILC 3DYAA 2BE2A 4DMNA 3I33A 4B3OA 1TKXA 4C8OA 4JS4A 2QTDA 3HXMA 3NGZA 1KRPA 4A2BA 2Q1NA 4FLVA 1TKTA 4B9LA 4DFPA 4FW2A 2WTUA 1HQUA 4M3UA 2X6NA 3D2FB 3VQPA 3M8PA 2VCPA 3I8BA 3THXA 1VSKA 4BRLA 1XC3A 1QQCA 3LM2A 3ENBA 4AHSA 3RMBA 3EE9A 5HOOA 5KGWA 3EYZA 1N8RO 1U4BA 4C8KA 2LSNA 4FWMA 5HLFA 3NVMA 4DV1K 3JS6A 4DSFA 3DLHA 4CZIA 1RDBA 4EAHD 4BC3A 4MO4A 3K2PA 4F9OA 3L2VA 4LF8K 1IJJA 3KWIA 2NRHA 3AV9A 1NJYA 3QEIA 5I3UA 2EHGA 1BHLA 2UU9K 4BRHA 3OYIA 2D5RA 5IT9O 4HUFA 1GOBA 1KQSM 1SZ2A 2Q3SA 4GMJB 4I9LA 5AR0A 2FSNA 2VWJA 1NM1A 2IC3A 2IVNA 4KAZA 4DG1A 4RTFD 4YORA 4YOWA 3KZBA 5HRRA 4JKHA 2YHXA 4Z4IA 3DWLA 3O3HA 2G8KA 3QBXA 1SL1A 4FJKA 2Q0RA 3MWTA 2W41A 3OHRA 4EP4A 1OH7A 3ZETA 4B9MA 1ATNA 5BPNA 1S1TA 3PUFA 4WQ5A 3TWHA 3I55N 2E6LA 5CY4A 1HRHA 4BRNA 1GOCA 3P83D 5H1SQ 3KJVA 1NGHA 1GLDG 4LH5A 5CZ2A 3AO1A 4F4KA 1BIZA 4ISEA 4NYNA 1QHAA 2JWKA 4A5AA 1EXQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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