3IDHA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glucokinase
total genus 168
structure length 453
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3idhA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3idhA01
1X3MA 3MCPA 3SK3A 4BC3A 4WYBA 5CE3A 4ISFA 4H0YB 4JD2A 4J8FA 5BREA 4H5NA 1ZBSA 4BVOA 4WQ5C 2CGLA 4Z94A 3WXKA 3CJ9A 3BEXA 4B1VA 3VERA 2Q36A 3EL2A 3H6EA 2IVNA 1NGJA 1KAYA 3WQTA 2Q0UA 2QWMA 2GEMA 3UKUB 4XH1A 4PKHA 4H5WA 3SLCA 1BG3A 5I9EB 3AAPA 2HOEA 4CZIA 1MDUB 4GY2B 5BN9A 2A42A 5AQWA 1NGAA 2ZGZA 1T6CA 3VESA 2NLXA 1U6ZA 5KQDA 4PKGA 3GDQA 2GELA 4H5VA 4E1JA 2ITMA 3C0BA 3AARA 2QWNA 2QWRA 3GOIA 2CH5A 3ZX2A 4BVPA 4NB4A 1E4GT 4H5RA 1R59O 4CD3A 4EAHD 4LC9B 4KBOA 3CIPA 2E1ZA 5EXWA 1MWMA 5BRHA 3A5OC 2E2NA 4FOIA 5EY4A 4AM7A 4NO7A 4CD1A 1NGGA 3FZMA 3QBXA 4O5FA 4RCHA 3H46O 1NLVA 2ASOA 3ZEUA 2BTFA 1JCEA 3MN9A 5AQHA 2FF3B 3WEEB 3CJ1A 3IUCA 3WXLA 2YHWA 3EKSA 1GLJO 2BUPA 2NZTA 1HPMA 1C0FA 3EO3A 4AM6A 2W41A 2E2PA 3VOVA 4DHYA 1RFQA 1Z05A 2V52B 4QS8A 4K42A 1GLBG 5KPTA 3FZLA 2IVPA 3FZFA 1S22A 2A41A 2GWKA 1JCGA 4H0PA 3VEVA 4RWTA 3L6QA 4B9QA 2W40A 3A8YA 2P9LB 2E2QA 4FWMA 3VF6A 3W3DA 2VWBA 3LDQA 3M6GA 3UB5A 3C7NB 4QS9A 5AZIB 1BO5O 3LL3A 4H0XB 5AQTA 2P9SA 3CJ7A 1XC3A 3VF2A 4FPAA 2FSNA 3BP8A 3CI5A 3M1FA 3H3OB 4WQ4C 4IJNA 2P9IB 2A40A 4WQ5A 3OHRA 1SZ2A 4CBWA 3D7EO 3EN9A 1J6ZA 3U9DA 4H5TA 1HKBA 4JHDB 4JNEA 2IIRA 1LOTB 5FPDA 2P9PB 5LY3A 5BPMA 3HM8A 3U8XA 1TUUA 4BRDA 1TUYA 3GBTA 4CBXA 2P9UB 5AR0A 3DJCA 3O1BA 2D4WA 4BRIA 1BDGA 3FE1A 3ENHA 2P9LA 2YHYA 3R6MA 5AZIA 3DXKA 2V7YA 4BG9A 1MWKA 2E2OA 5BPLA 4FWLA 1GLLO 4CI6A 2PAVA 3DXMA 4BGAA 4XH4A 5AQGA 3RSEA 4JHDA 4B1ZA 5AQXA 2P9PA 1T44A 3TPQA 3IDHA 4BRAA 4XEIA 4CZJA 5ADXA 4FWRA 1P8ZA 3MN7A 2P9NA 3CQXA 4A2BA 3CERA 4BC4A 3D2FA 1ZC6A 2ASPA 3QFUA 1NMDA 5FPNA 1GLCG 4PL7A 4CZMA 1WOQA 2D1KA 2QWQA 2GUPA 3H3NO 3QICA 4FSVA 3ULEB 1TYQB 3ZX0A 5AQUA 4BG8A 3LDOA 1D4XA 4QS7A 5AQPA 3A0IX 2IVOA 3UE5A 1NGFA 3GL1A 1KAZA 4BR0A 1BA0A 3ATVA 1BUPA 2CH6A 2Q1NA 5BR9A 3LM9A 3W0LA 1HX1A 1Y64A 3ID8A 1HKGA 3UKUA 3CHWA 1XQSC 1MA9B 3GG4A 5AQQA 3BF1A 3QB0A 1EQYA 4BGBA 5ADXH 4YDUA 3R8EA 4CZEA 3CETA 4A2AA 3O08A 2D0OA 5E84A 5BN8A 4IJAA 1QQNA 4PKIA 2E1YA 3I33A 3WQUA 1C0GA 4BRKA 4WQ4A 5B8HA 2A3ZA 3WUHA 2A6AA 5BRDA 3ULEA 1TYQA 2ZGYA 2YJEA 3WXJA 4I6MB 3VENA 5EX5A 1NWKA 3GE1A 3H45C 4MO5A 4MLHA 1QQMA 1Z6RA 4O8KA 1S3XA 4H03B 1QHAA 2H3GX 3FR0A 3HBTA 3WT0A 1RGIA 1WUAA 1ATSA 3QMLA 1KXPA 4M7YA 1H1VA 1SAZA 2PBDA 5TKYA 4B1XB 3R9PA 2GTDA 3VF4A 3O80A 4CZLA 1ESVA 3U4LA 5EOYA 3WEEA 1QQOA 4FWKA 4BRLA 3FFKB 1JCFA 4YDUC 3JS6A 3LM2A 3EKUA 4BC2A 4CJ7A 4CBUA 3DWLA 4XH5A 3IFRA 5AQRA 2ZF5O 4FWOA 4M7XA 3QFPA 4FWSA 1IG8A 4FPBA 3FLCO 1X3NA 1KAXA 2Q31A 4BRNA 5BPNA 3S41A 3ZETB 1ATNA 4BRPA 4Y0WA 2J4RA 5AQMA 3MDQA 1LCUA 4FL9A 4A61A 4CZKA 5AFUA 3VEYA 2WUSA 3UKRB 3FZHA 3HSCA 3O1WA 5JICA 4BR5A 3VEOA 3LDLA 4BRHA 4DB3A 3SJHA 4DQ8A 1NM1A 3A5MC 4IXCA 3O6WA 1GLEG 2FSJA 3C7NA 4BR7A 1DKGD 4BQLA 3FGUA 4EHTA 1X9JA 2Q0RA 2HMPA 5AQFA 2P9IA 1ATRA 2QM1A 1GLAG 2YCHA 5AQNA 3VGLA 3BUZB 3IMXA 5AQLA 3H1QA 4BREA 2A5XA 3CJCA 5E26A 3KVGA 3HZ6A 2F9WA 2D0PA 2YI1A 4EHUA 4IZ9A 3HTVA 5AFUH 2P9UA 4GNIA 4BROA 3SMSA 5FPMA 3EZWA 2OANA 3HI0A 1HUXA 4BR9A 4CZGA 2AP1A 4H0TB 1K8KB 2VCPA 2I7NA 1YUWA 4DCHA 1V4TA 2QWPA 2DPNA 1BOTO 2UYTA 2E88A 1YAGA 4BC5A 2QXLA 2Q97A 4L3QA 1V4SA 3WXIA 3VPZA 4K41A 3O5BA 5EVZA 4JN4A 2QWOA 1RDWX 1GLFO 2E20A 3B8AX 3TU5A 3VEZA 1BWFO 5ELZA 3ZEUB 4B1WB 5KQ8A 1YXQA 4FOEA 5F1XA 5AZJB 3CQYA 4BR4A 3ATUA 3H1VX 4ISEA 4EFHA 4HWIA 2V51B 3LDNA 1K8KA 4C23A 1NGBA 4HTLA 3FZKA 4BRGA 2I7PA 1NGIA 4FWPA 1YVNA 5F0XA 5KPZA 2CGKA 3I8BA 5AQKA 4B1UB 1QZ5A 2FF6A 3L0QA 4CZHA 5F2RA 5AQJA 1DGKN 1XUPO 1IJJA 4PL8A 2KHOA 3KHYA 1QZ6A 2GWJA 2E8AA 2AA4A 3U9ZA 2P9KB 2F9TA 2NRHA 2VYPA 5AZJA 5AQVA 4BRQA 1U2VB 3O4WA 4IO8A 4A62A 4BRCA 1BA1A 3DAWA 4M63C 2P9SB 2HF4A 2YJFA 2YHXA 4BRMA 4EIAA 1GLDG 4IWVA 2ZWHA 3F9MA 3VEWA 1ZXOA 3ZX3A 4FWNA 1Q18A 3VEXA 1E4FT 2HF3A 4I6MA 2FLOA 4K43A 4MLEA 4RTFD 3AAQA 4JAXA 3CJBA 4ISGA 5AQIA 3MMVA 4K25A 3MN6A 2P9KA 5AQSA 3G25A 2CGJA 1U2VA 3A5NC 3J8AA 2QW9A 4H0VB 3DXKB 3O8MA 3ENOA 3VGMA 1NGCA 1G99A 1HJOA 1NGHA 4FWQA 3D2EB 3QBWA 3VGKA 1HKCA 3M3ZA 3P4IA 4BQZA 1HLUA 3CJAA 3L4IA 2FSKA 3DXMB 2V7ZA 4BRFA 4F9OA 2EWSA 4JD2B 3QDKA 5JLFA 3VETA 5KPRA 2FXUA 3RSEB 5FPEA 3KZBA 5LJWA 5JLHA 1NGDA 2ASMA 5LJVA 4MO4A 4CZFA 2QWLA 3A5LC 1BU6O 1NBWA 3ZETA 2Q2RA 3SMPA 3BF3A 1CZAN 3AY9A 3MK6A 1T6DA 4BR2A 5AQYA 2P9NB 5JMVA 5BRFA 5AQOA 5AQZA 3UKRA 3JXUA 1OKJA 3D2FB 4FO0A 3MN5A 4H0OA 1DEJA 1SQKA 3LDPA 3D2EA 1NGEA 4B1YB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1X3MA 3T69A 4YOUA 1TL3A 4H0YB 4ZTJA 4M3YA 1KD1O 4H5NA 4BVOA 4WQ5C 1KLNA 3WXKA 3CJ9A 4B1VA 3NDKA 3MXMA 1SUQA 3EL2A 4ICLA 4KB0A 1NJXA 4PKHA 4JKDA 4FVUA 1Q81O 1JXBA 3AAPA 2HHHK 4N76A 2HOEA 1NKEA 2A42A 3QNNA 5AQWA 1FK9A 3L4QA 2ZGZA 3CCRN 3CM5A 1T6CA 4UQGA 2VQFK 1W2BM 1DTTA 2HB5A 4F3TA 2GELA 4E1JA 3Q7CA 3AARA 2QWRA 4DMNA 1ZYQA 4DTUA 3GOIA 1VK0A 1WAJA 4W5RA 3ZYYX 1VSIA 5GADP 4CD3A 3TI0A 1NK0A 4KTWA 4LC9B 1MWMA 2E2NA 5EY4A 4LH4A 2OTLN 5KGXA 4CD1A 4O5FA 3VTHA 2ASOA 1IV0A 3MN9A 4E7HA 3SAFA 1RDCA 4DTSA 3CJ1A 4CEZA 3QEWA 1HPMA 4IOCL 1RT2A 4NYFA 4AM6A 3LP1A 3VOVA 4DHYA 4E7LA 4B3SK 4JI6K 4RG8A 3AA2A 4DQSA 3SNNA 4FJ7A 4GV9A 2X74A 5SWMA 2A41A 3NMUA 4JI4K 2GWKA 1LWFA 2XY8A 3D0PA 4HHTA 4CJSA 4PHTX 1EWQA 3CCSN 3L6QA 4FLXA 4B9QA 3O9TA 4BVPA 2JWLA 3RVCA 2KLAA 3C7NB 4MFBA 4LFCK 3F5TA 3WNEA 1BO5O 3LL3A 4H0XB 5M1NA 2Y1IA 2XHBA 2G8VA 5SZTA 4KV8A 4CHPA 3CI5A 1RILA 1SKWA 1W7AA 4IJNA 1LW0A 2A40A 1DLOA 1CZ9A 1W97L 4DU1A 1J6ZA 4H5TA 1Q9XA 3KTQA 3ALYA 2IIRA 1LOTB 4AHUA 1F21A 4KTZA 3I55N 2IDOA 1VQON 2P51A 1TUYA 4CBXA 1X9SA 4DV5K 4JS5A 3O3FA 3O1BA 3SAHA 3THWA 5IT9O 3HSTB 3ZT0A 3FE1A 2G8WA 3ENHA 1U04A 1L3TA 2HBJA 3R6MA 4I2PA 2HHWA 4BG9A 4BDPA 4DFPA 5BPLA 2PAVA 3V81A 2E4LA 4C1NI 3V4IA 4FJ8A 3RSEA 2NNWA 4Z4FA 1RBVA 1K9MO 1TVRA 1N34K 3IDHA 4BRAA 4CZJA 3DRSA 2F7TA 1Q82O 1XHZA 4CESA 4O0JA 5EU7A 2IC3A 3DYAA 4JI1K 4CHZA 4AHTA 1J9AA 1ZC6A 3OS2A 4GW6A 1IBKK 2HVIA 1TYQB 3U3GA 4BG8A 1SL2A 4QS7A 4CEEA 4FJHA 3AO3A 5HP1A 2Q1NA 3SV3A 5BR9A 3LM9A 3UKUA 1IKWA 4LSNA 3OBWA 3GG4A 4F2SA 2X6SA 1JXEA 1EQYA 4BGBA 3M8RA 4DSJA 4A2AA 5C2DA 4N41A 5CY4A 1QQNA 1IG9A 5T7BA 5J2PA 3CFRA 2HW3A 2A3ZA 3SJJA 2A6AA 3ULEA 5HRRA 1T03A 3WXJA 4JKGA 3CD6N 3H45C 4BE2A 1Z6RA 4N56A 3ZSZA 1QHAA 4JI7K 1WUAA 3QMLA 1H1VA 3MWTA 1XNRK 4NXMK 1N8RO 1SAZA 4DV7K 3R9PA 4KPYA 4DUZK 3O80A 3SAGA 4M3WA 1CZBA 4OPJA 3U4LA 4EP5A 4FYDA 4BRLA 3FFKB 4OO1J 5HBMA 1L3VA 1EO1A 5GIPA 3DWLA 1T8EA 4KI6A 3TTFA 2OCEA 1E3MA 3AO2A 4CGFA 1HQUA 3V1QA 2Q31A 3F9KA 3NFAA 4JI3K 4G1QA 3VQ6A 1ATNA 3L2VA 4AF1A 3OYNA 1LAVA 2RPIA 1L3UA 3VEYA 4FJIA 3UKRB 3FZHA 2YHAA 3HSCA 3VEOA 3G6EN 1HR0K 1QE1A 3KK1A 4DB3A 3SJHA 4DV3K 1Q8IA 1SL0A 5I3UA 3SQ4A 1GLEG 2FSJA 2KQ2A 4F8RA 1DKGD 2HHTA 1NU0A 4EHTA 1NJZA 1VSEA 4HUFA 3OTOK 4QOZB 1ATRA 2HSTA 1VAZA 5LL6Z 4DU4A 3IMXA 4HCBA 5AQLA 4E0DA 2GBZA 1JJ2M 3C94A 1ASVA 2F9WA 1YJ9N 1WSIA 4Z4CA 2YI1A 4YY3K 4E7KA 3THVA 4GNIA 1VSJA 3SMSA 3SUNA 3IG1A 3T1YK 4BR9A 4W5OA 1NJYA 4CZGA 1OVYA 1ILYA 4H0TB 2VCPA 4F4KA 4DCHA 4KHUA 3ZSQA 2DPNA 4DTMA 2HVHA 3ZT1A 3V9UA 2A1SA 2B6AA 4BC5A 2Q97A 1A5VA 1V4SA 3WXIA 2G8UA 4ILGB 4OX9K 5HRSA 5EVZA 5C25A 5KRTA 4NYNA 4DV0K 3P1GA 3UIQA 3V9WA 4FJGA 5FRNA 1BWFO 2HNZA 3MEEA 2KZZA 1G15A 1N32K 4FOEA 3Q7BA 3KLGA 5F1XA 4KH4A 5M1PA 4DR2K 3LDNA 3LALA 3PSFA 4C23A 4HTLA 4DSIA 1VQKN 2I7PA 2KKZA 4YOTA 5KPZA 4DTNA 2CGKA 3L0QA 1C1CA 1YHQN 5F2RA 4KRFA 1XUPO 4PL8A 2KHOA 4PWDA 3T7ZA 2AA4A 3AGRA 4B3OA 4CCHA 4IO8A 4IKFA 4H4MA 3K5LA 2YHXA 3PY8A 4BRMA 2A1RA 3LZIA 3QETA 3ZX3A 3HPGA 3VEXA 3NGZA 2FLOA 4GKKK 3PUFA 3NF9A 3G4SN 3HPHA 1S5JA 4JAXA 4B08A 1ZBFA 4DTOA 3VTIA 1NKCA 4R5PA 3CFPA 2HNYA 3G25A 4CF9A 3ASMA 3U3YA 1U2VA 3ID6A 3J8AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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