3IDHA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glucokinase
total genus 168
structure length 453
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3idhA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3idhA01
3QDKA 3FE1A 4AM6A 5I9EB 5AQQA 4IJNA 1QQOA 3RSEB 5AQVA 4PKHA 4Z94A 4JN4A 3UKUA 3U9DA 5AQHA 3VERA 2GELA 5LJVA 2F9WA 1DGKN 1T6DA 4PL7A 1EQYA 2PBDA 2YCHA 2YJFA 3DXMB 2ZGYA 3O4WA 4QS9A 3FZFA 1BOTO 2W41A 3LDLA 3M3ZA 3WT0A 3ZX2A 4BROA 5BN8A 3L0QA 2CGKA 2V52B 1ATRA 2AA4A 5AQJA 4BQZA 3H6EA 3DAWA 3MDQA 4ISGA 1RFQA 3GDQA 4PKIA 3C7NA 4PKGA 1GLJO 5AQUA 5AQSA 4FWNA 1TUYA 3JS6A 2P9UA 4FL9A 4BRDA 4CI6A 3U4LA 3O5BA 4HWIA 3HBTA 3ATVA 3CETA 3VGLA 1JCGA 3BUZB 1SQKA 2P9PA 2A41A 2ASPA 5BPLA 3H1VX 4JNEA 3VF4A 5ELZA 3ZX0A 4FWMA 5AQZA 3SMSA 2CGJA 4BRCA 2FSKA 4JHDA 3U8XA 2Q31A 4BR4A 2ZWHA 2E2OA 2QWPA 4H5VA 2D4WA 3A5LC 4Y0WA 4A2AA 2IVPA 3LDOA 2P9LA 3LDPA 3VOVA 4H5TA 5B8HA 4WQ4A 3VETA 4B1YB 2QM1A 4CD1A 4E1JA 3CQYA 1V4SA 4FOIA 4A2BA 2E2NA 2E8AA 2WUSA 3QB0A 1KAXA 2BUPA 1YAGA 3H46O 5E26A 5AFUA 3WXLA 4DQ8A 1NGDA 3ENOA 3HI0A 4CBUA 4BREA 4WYBA 2YHXA 1HKBA 3BF3A 2FF6A 2ITMA 3DXMA 2QXLA 4XH1A 2CH6A 2PAVA 4BQLA 3UKRB 4EIAA 4WQ4C 3LL3A 5FPEA 4ISEA 3DXKA 1X3NA 2AP1A 4XH5A 4I6MB 4F9OA 1GLDG 4BRNA 2V51B 1MA9B 3IUCA 4BRMA 3C0BA 2YJEA 4CZGA 3ATUA 1R59O 1KAYA 1NGEA 3BP8A 3QBWA 3ZETB 1P8ZA 1LCUA 3KVGA 1NGAA 5AZIB 3DWLA 5EXWA 1ZBSA 5AQTA 5AQYA 4EAHD 1QHAA 1LOTB 2IVOA 3HTVA 4H5RA 3GE1A 5KPZA 4O5FA 2E2QA 3H3NO 1BU6O 2GWKA 3MN7A 4FO0A 5F2RA 4K41A 1NGBA 4XH4A 5BREA 3EL2A 1HPMA 4RCHA 5EOYA 5BRHA 3LM9A 1GLLO 1ESVA 4BC3A 3AY9A 3CIPA 4DHYA 1MDUB 4B1ZA 2Q97A 1NGGA 1HLUA 1YUWA 5FPDA 3VF6A 3HZ6A 3A5NC 4K25A 2YI1A 3EO3A 3CI5A 1X3MA 3CJ1A 3TPQA 4IZ9A 2GWJA 4BGBA 4BRPA 3GOIA 4H0OA 5F1XA 2P9IB 3MN5A 2E88A 4BVOA 4H0PA 4FPAA 1GLFO 1QQNA 1XUPO 4BRIA 4RTFD 2HOEA 5AQXA 5KPTA 2HF4A 3O1WA 3L6QA 5BN9A 4JD2A 3L4IA 1HJOA 2P9SB 3UKRA 1XC3A 4YDUA 1WUAA 4CD3A 3FFKB 3EKUA 4BRKA 4K42A 4BC4A 1BO5O 1Z05A 3SMPA 1BA0A 2A40A 3EN9A 5AQOA 1TYQB 4CZIA 4MLHA 4BG8A 2GTDA 3CERA 3SLCA 3VGKA 4RWTA 4BGAA 5AQGA 2E20A 5TKYA 5AQFA 4FWSA 5FPNA 3FZLA 1HKGA 3VENA 1DEJA 1U2VB 2FXUA 5AZJB 3O80A 3G25A 2NZTA 1OKJA 4KBOA 3HSCA 4YDUC 4CZMA 1GLAG 4MO4A 4CZFA 3MN9A 2P9KB 1E4GT 2HMPA 3ZEUB 4BRFA 5JLFA 1QQMA 3H45C 3IDHA 1V4TA 3O6WA 1SZ2A 2I7NA 2FF3B 5AQMA 2NLXA 3O8MA 4B1UB 3VEVA 2CGLA 5ADXH 4NO7A 3A0IX 3M1FA 2GUPA 4B1VA 3RSEA 3LDQA 5KQ8A 5JICA 1KAZA 1D4XA 3GG4A 3QICA 4AM7A 4CBXA 1X9JA 3MK6A 2D1KA 3GL1A 3VEWA 3WQTA 1MWMA 4FWRA 4LC9B 2DPNA 4ISFA 3I8BA 4IO8A 3ZX3A 3VEYA 4L3QA 5BRDA 5AR0A 4C23A 2UYTA 1GLCG 2P9IA 4BRAA 3O08A 3VEXA 1ZXOA 5BR9A 4BVPA 3W3DA 1T44A 3QMLA 3VESA 3WXIA 4CBWA 2E1YA 3DJCA 4H5NA 2P9SA 1S3XA 1T6CA 3CJ9A 3CJAA 4MO5A 2VCPA 4IWVA 1XQSC 4H0TB 5EVZA 2ASMA 4CZEA 4CJ7A 2ASOA 3C7NB 5BPNA 3EZWA 3UE5A 1ATNA 1IJJA 1J6ZA 3A8YA 1HKCA 2P9UB 4NB4A 4IXCA 3UB5A 4FWPA 2QWNA 3FZHA 4BRQA 2FLOA 5AQRA 5FPMA 4BC2A 3D7EO 3ULEB 2A5XA 5AQWA 2QWLA 1KXPA 2P9PB 1RGIA 2Q0RA 4BR5A 3VEZA 2P9NB 3R6MA 1U2VA 2Q2RA 3QBXA 2E1ZA 3AAQA 4H0YB 3FGUA 4O8KA 3CJCA 2P9KA 1BA1A 3ZEUA 4H0XB 4B9QA 2IVNA 2ZGZA 4BRLA 4CZHA 3R8EA 1BWFO 5F0XA 3VEOA 1NGFA 4WQ5A 4BRGA 4B1WB 3KZBA 4H5WA 3D2FB 4DCHA 5KQDA 4FWKA 3M6GA 5JLHA 3WEEB 2QWQA 3HM8A 3KHYA 2H3GX 4PL8A 5BPMA 5EX5A 3TU5A 2Q1NA 4BRHA 1GLEG 5LY3A 4FSVA 3EKSA 1TUUA 5EY4A 2VWBA 2YHWA 3D2EB 2QW9A 5AQIA 4EHTA 3GBTA 3LDNA 1E4FT 4WQ5C 3IMXA 4I6MA 3A5OC 4M63C 1G99A 3JXUA 3S41A 3WXKA 1WOQA 2Q0UA 2QWRA 1NGIA 4B1XB 5CE3A 3DXKB 1RDWX 4FWQA 3J8AA 3ENHA 2I7PA 4FOEA 2BTFA 5AQPA 3ZETA 1BUPA 1U6ZA 5AZIA 2QWMA 3ID8A 2J4RA 3VF2A 4XEIA 2HF3A 1GLBG 1NGJA 3FZMA 4QS7A 3R9PA 3ULEA 1NLVA 2F9TA 5ADXA 3W0LA 3H3OB 2P9NA 4QS8A 3SK3A 3WUHA 3O1BA 1BG3A 2IIRA 3CQXA 5JMVA 1CZAN 5AQLA 4EFHA 2NRHA 1K8KB 2KHOA 3VGMA 5KPRA 4MLEA 1DKGD 4GY2B 3CHWA 2A42A 4M7YA 1JCEA 2ZF5O 2D0PA 1QZ6A 4BR9A 3MCPA 4BR0A 4CZKA 1NWKA 3FLCO 2CH5A 3D2FA 4BR2A 3CJBA 1SAZA 4FWLA 1YVNA 2V7ZA 4K43A 3WEEA 1QZ5A 3IFRA 5E84A 1Z6RA 3AAPA 3UKUB 2A3ZA 1NGHA 1IG8A 1JCFA 3U9ZA 4CZJA 3QFPA 2FSNA 2Q36A 4BC5A 2FSJA 4HTLA 2YHYA 4BG9A 3D2EA 3BF1A 4FWOA 1S22A 1MWKA 3SJHA 3WXJA 5AFUH 3A5MC 4JD2B 5LJWA 5AQKA 1NGCA 2VYPA 3MN6A 4H0VB 4FPBA 3FZKA 1NM1A 3H1QA 3BEXA 1BDGA 1ATSA 1HUXA 4BR7A 4H03B 1TYQA 3OHRA 5BRFA 1HX1A 1NBWA 4DB3A 4GNIA 3QFUA 2QWOA 4IJAA 5AZJA 3AARA 4JHDB 1C0FA 1C0GA 1Q18A 2GEMA 4A61A 2EWSA 4JAXA 4M7XA 1H1VA 3LM2A 2V7YA 2A6AA 2W40A 3B8AX 5AQNA 3MMVA 4EHUA 1Y64A 4A62A 3VPZA 2P9LB 4J8FA 3I33A 1NMDA 3CJ7A 1K8KA 1YXQA 3WQUA 2OANA 3FR0A 3F9MA 2D0OA 2E2PA 3P4IA 4CZLA 1ZC6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKEA 1C0UA 3V6DA 2HHHK 3RSEB 2YX6A 4PKHA 1TL1A 1E3MA 4WFAL 1NOZA 3AVIA 2GELA 1NK0A 2XO7A 4GVMA 2PBDA 4JS5A 3DXMB 4QS9A 1HR0K 3D0PA 3LDLA 3H08A 2NNWA 2V52B 4W5TA 3IS9A 4PQUA 2EHGA 1ATRA 5DM7L 4JKFA 4FLYA 2IOCA 4X66K 1N5YA 4ISGA 1RT2A 4HCCA 3ITHA 5AQUA 4F3TA 5AQSA 4GV3A 4FL9A 4BRDA 4R5PA 1JLGA 2O8EB 3ATVA 5C0YA 4DKWA 3AVFA 5J1EA 3DI6A 4DTRA 3BUZB 2A1SA 3H1VX 4JNEA 4E89A 3SMSA 4QOZB 2KTQA 2Q3SA 3LP2A 3D6RA 3SZ2A 1KVCA 1QVGM 4C8OA 2ZWHA 5J2NA 4KRFA 2E2OA 4E7KA 4DLGA 4Y0WA 5TKWA 3OS1A 2HVHA 3RMAA 3E9OA 4OKEA 3ENBA 4W5QA 3E66A 4CEBA 2GX9A 3VTHA 3O9RA 2D5RA 3VOVA 4JV5K 2QM1A 3O9UA 4DFJA 3CQYA 3WNEA 3ZT2A 1V4SA 4CJ4A 2E2NA 2WUSA 3DLGA 3QB0A 5E26A 4DQ8A 3HI0A 4CBUA 4BREA 2YHXA 4AHTA 3BF3A 1FJGK 2ITMA 3DXMA 1T05A 3K57A 4BQLA 3NVKA 1L3TA 4O55A 1KCFA 2WBNA 4CIEA 4FCYA 3V1RA 1CXUA 4I6MB 4F9OA 4DUYK 4DQIA 4EZ6A 4CIFA 1GLDG 1RT6A 4FJ5A 4IKFA 1MA9B 5CY4A 3QINA 5J2MA 3PLAA 1TKTA 3LP1A 1KAYA 3ZETB 4DV7K 4LH4A 3DWLA 1F21A 4NCBA 1QQCA 2IVOA 3AO2A 5J2PA 1DLOA 2HHWA 4DU3A 4G9ZA 4DV4K 4DS4A 1X9MA 4OPAA 3BDPA 2UXDK 4K41A 3MCAB 1HPMA 5BRHA 4J2DA 4DHYA 3AY9A 4JRQA 2G8KA 1HLUA 3VF6A 3IKMA 3SV4A 3KD1E 3A5NC 3HM9A 3V9UA 1T7PA 2YI1A 4TSXA 3CI5A 1B92A 2GWJA 3UIQA 3J81O 3RWUA 3F5TA 4DWIA 4H0OA 2P9IB 4CJLA 2DFFA 3WNHA 4F2SA 4H0PA 1YHQN 4FPAA 1HMVA 1YITN 3WNFA 3HSTB 3L6QA 3CFOA 1M90O 1VQLN 1KSPA 3ZT4A 4YDUA 3S3OA 3HOTA 1C1BA 2UUAK 3PSIA 4OX9K 4DR4K 2A40A 3EN9A 3AVGA 3QEWA 3CC2N 4FJNA 1TYQB 3OBWA 1Z25A 3SLCA 3VGKA 4ZTFA 4BGAA 5TKYA 3QLHA 4FWSA 5FPNA 4N41A 2EX3A 3QEIA 1N6QA 1RBSA 1U2VB 3O80A 3MXIA 1OKJA 1NK9A 3AVNA 1GLAG 2P9KB 1WN7A 4IOAL 3IDHA 2P5OA 1U48A 2FF3B 2NLXA 3O8MA 1RBUA 3JYTA 4B08A 4CF9A 3LANA 2HHSA 1EETA 5DM6L 4AHUA 1O1WA 4CJFA 5CHIA 5KQ8A 4KO0A 5JICA 2R7YA 4KTQA 1QHTA 3QICA 4KH6A 3GG4A 4CBXA 1X9JA 3MK6A 3NH1A 2UXBK 1QTMA 4YOYA 1IKXA 1HJRA 3O4QA 3SQ1A 2XRIA 4FWRA 2YKNA 4ISFA 4BDYA 3AA5X 4L3QA 5BRDA 4C23A 2UYTA 3CCRN 2P9IA 1JLFA 4C1NI 3OVNA 4CJ5A 1NJZA 3O08A 3VEXA 4CGGA 3THWB 1T44A 3WXIA 2I5JA 3KLHA 1SL0A 1T6CA 4JKHA 1JJ2M 2VCPA 2HNZA 3T1YK 5T7BA 4AQYK 3C7NB 1U47A 2JGUA 1IJJA 3A8YA 4NB4A 4FWPA 3CD6N 4CVNE 2QK9A 3FZHA 1S1XA 3TANA 1VSHA 3OTOK 4Z4IA 2KZZA 5AQWA 4ILHA 2QWLA 4JKAA 2QKBA 2P9PB 3D45A 3OYEA 5HRPA 5I3UA 1ITGA 1U2VA 3HL8A 2E1ZA 4O8KA 1TKZA 2P9KA 1L3SA 4XIUA 1C1AA 2IVNA 3RR7A 4CZHA 1A5VA 2RPIA 3C6UA 4GMJB 4HHTA 3V9XA 1R0AA 2P5GA 3NMUA 3M6GA 3SUQA 2HBJA 4F8RA 2Y1IA 2QWQA 3HM8A 4YORA 5CYMA 3KLGA 3K5OA 4FK0A 5BPMA 3OYKA 5EX5A 1YTAA 2Q1NA 4JKGB 2E5LK 2NRVA 5HROA 2O8FB 1NK8A 3PIOL 4DU1A 2VWKA 4BE1A 3EKSA 3OS0A 2YHWA 1LAVA 1BI4A 3THWA 2X6NA 1JLBA 1BCMA 4M63C 5GIPA 3L2UA 4DTPA 4DTNA 3G10A 3S41A 4B3MK 4B1XB 3DXKB 1RDWX 3VN5A 3ENHA 4FOEA 3TWHA 4DQQA 1IG9A 3M8SA 4LF7K 3AVCA 2Y1JA 3VF2A 4XEIA 1S9EA 4A5BA 3NHGA 3WNGA 2RN2A 3VA0A 2F9TA 3AO3A 3AVKA 1QSLA 4O0JA 3MECA 3KWGA 3P39A 1BG3A 4JI4K 2IIRA 1FW6A 1OH5A 4HUGA 1TK0A 2KHOA 4MLEA 1Y97A 3CHWA 2A42A 1VQON 2RE2A 4FJMA 1QZ6A 4BR9A 3RRHA 1VQKN 1XWLA 3A2FA 3LP0A 5FROA 4DQRA 4K43A 4GV9A 4NLCA 4CF1A 5E84A 2KFNA 3AAPA 3HYFA 1NGHA 1T8EA 3PO5A 3TSPA 2O8FA 3BZCA 4B9VA 4CZJA 3QFPA 3VMFB 1YVUA 3NH2A 3EY1A 2FSJA 2JLEA 3CPWM 4HTLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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