3IDHA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 453
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3idhA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3idhA01
2FXUA 3CHWA 3U9DA 1XUPO 4H5WA 2BUPA 4BC5A 3HM8A 3FZKA 2P9UB 3TPQA 5EXWA 3FZHA 1SZ2A 3GDQA 1KAYA 2H3GX 4BVPA 3QFPA 5FPNA 3ZETA 3MK6A 2GELA 4IWVA 4RCHA 4JD2A 3FGUA 2P9SA 3VEOA 4PKIA 4XH5A 1GLLO 2AP1A 4A2AA 4CD3A 4CZGA 4BC4A 2FSKA 3D2FB 5JLHA 4AM6A 3DJCA 1QZ5A 4IJNA 4BGBA 2YHWA 1HX1A 2P9IB 2UYTA 1K8KB 2GUPA 3MN6A 1LCUA 4QS8A 2A5XA 2E1YA 3IFRA 2E88A 1JCEA 1HPMA 3WEEA 2ZF5O 5CE3A 3GL1A 5AQXA 2IIRA 5FPDA 5AQZA 5BN9A 2CH6A 2Q97A 1X3NA 1RFQA 2P9PA 3LDOA 3GG4A 3WUHA 1CZAN 5AQIA 3DXMB 2YHXA 3LDQA 3WQTA 1QQOA 4WQ5C 1NMDA 2ASMA 1BWFO 2P9KB 1BU6O 4HWIA 3I33A 3M6GA 5KPRA 4FOIA 3WQUA 4BREA 3SMSA 1NGJA 3ATUA 3L6QA 3QB0A 4NO7A 3FZFA 4BR0A 1D4XA 4CZKA 2W40A 3HZ6A 2CGJA 4FL9A 4JHDB 1Y64A 4CJ7A 3GE1A 5AQPA 4BRCA 3A5NC 4QS7A 4E1JA 2I7PA 1GLAG 3F9MA 4H0PA 3VESA 5BPNA 1T6DA 5JICA 1OKJA 5AR0A 2I7NA 1GLEG 4WQ4A 1HLUA 4H0VB 1X9JA 2A3ZA 5AQQA 4BRMA 1E4FT 2P9LA 2Q0RA 5ELZA 1BA1A 1WOQA 4BC2A 4H0TB 3FZLA 3DWLA 4EHTA 3DXKB 5AZIA 5AFUA 1YXQA 4FSVA 1NGHA 5KQDA 1QQNA 1GLDG 3QBXA 3WXJA 5ADXH 4M7XA 4BG8A 1J6ZA 5AQUA 1SQKA 4JNEA 1U2VA 4B1XB 2CGLA 2NZTA 1RDWX 3ZX2A 2A6AA 4BQLA 2QWOA 4O5FA 5AQWA 5LY3A 4GNIA 2D4WA 1U6ZA 3OHRA 4FO0A 5I9EB 2Q31A 4H5NA 3FFKB 3LDPA 4QS9A 1BOTO 4FWKA 4IO8A 5JLFA 5KPZA 4A62A 2DPNA 5BRDA 3O80A 5AQHA 3VPZA 3UKRA 4BRFA 2ITMA 1BG3A 3ENOA 3VF6A 2CGKA 4F9OA 3W0LA 3HBTA 4IZ9A 3AARA 3LDLA 4BROA 5BPLA 3H3NO 4A61A 4B9QA 3C7NA 3O1WA 2V7ZA 5EX5A 1ATSA 2P9NA 2A41A 1GLCG 1NGCA 2GWJA 1HKBA 3O4WA 4B1VA 2QWPA 3ZX0A 4I6MA 4BR2A 1ATNA 3KHYA 3RSEB 2FSJA 2HF4A 1NGBA 2VWBA 4KBOA 3B8AX 4FWMA 4K43A 1XC3A 3ULEA 3A5LC 3R6MA 1YAGA 3O08A 4H03B 2QWLA 3MN7A 2HMPA 1TUUA 1BO5O 1NM1A 2IVPA 3WXKA 4BR9A 3CQXA 3CERA 4CD1A 5LJVA 4CZFA 1Z05A 5AQSA 5AZJA 3VF2A 3L4IA 2E2PA 3VETA 3UKUA 3UB5A 2OANA 1MWMA 3EO3A 3EN9A 1DGKN 3IUCA 3LM9A 4IJAA 3CQYA 3ID8A 3LL3A 4BR7A 5AQLA 2E2QA 3VGLA 3VGKA 3W3DA 2Q1NA 3J8AA 3SMPA 4NB4A 1H1VA 2YI1A 3WXIA 5F0XA 1YVNA 3O8MA 3ZEUA 4BR5A 4K25A 4J8FA 1HJOA 2YJEA 1MWKA 4RTFD 4WQ5A 3CI5A 4B1UB 3M3ZA 2AA4A 1HUXA 4ISEA 3BP8A 5BN8A 2QWMA 1MA9B 3MCPA 3D7EO 4H0YB 5AQTA 3VEYA 1X3MA 3ZETB 2GWKA 3O5BA 4PKGA 1TYQA 3C0BA 3IDHA 3L0QA 3SK3A 4JD2B 4CZJA 2P9SB 5AQFA 3AAQA 3DAWA 2P9UA 4BGAA 4PL8A 2ASPA 1DEJA 2Q0UA 2NRHA 4YDUC 2BTFA 5KQ8A 2E2NA 4CZLA 1XQSC 1C0GA 1T44A 2QWRA 3BEXA 4BRKA 4BR4A 5AQNA 3MMVA 1Q18A 2QM1A 2V52B 2YCHA 3LM2A 3H46O 1Z6RA 4FPBA 2E8AA 3D2FA 3WEEB 4B1ZA 1P8ZA 1GLJO 2FLOA 4M63C 3CJCA 4BRQA 1ZBSA 4XH1A 3MN9A 2FF3B 2P9PB 5FPEA 1K8KA 1HKCA 3QMLA 3FE1A 2ZWHA 1GLFO 1KAXA 4BQZA 1ZC6A 1ZXOA 3QBWA 3UE5A 1S22A 2ZGYA 3CJ7A 2YJFA 1NWKA 3IMXA 3VENA 3M1FA 4AM7A 1SAZA 3BF3A 1V4SA 4L3QA 4B1WB 2D1KA 1T6CA 3WXLA 2D0OA 3U9ZA 5BR9A 4JAXA 3QICA 2P9KA 4BG9A 3EZWA 4M7YA 4H5TA 1NGFA 4DHYA 3FZMA 3H3OB 1RGIA 1R59O 1JCGA 4PL7A 3ATVA 3MN5A 3HSCA 4FWRA 3SLCA 5JMVA 1MDUB 5EOYA 3A5OC 1NGIA 4MLHA 4JHDA 2GEMA 3VF4A 2P9LB 5AFUH 1YUWA 4FWQA 2EWSA 4EHUA 4ISFA 4BRLA 4MLEA 3FLCO 5EVZA 1KXPA 1ESVA 4RWTA 5BRHA 4HTLA 4FWNA 5EY4A 4CBXA 2IVOA 5AZIB 3H6EA 2HF3A 2F9TA 2YHYA 2PAVA 5E84A 4EIAA 4DQ8A 4BRPA 1BUPA 3GBTA 3CJBA 3EKUA 2GTDA 2QWNA 3CJ1A 1E4GT 3HTVA 4BRGA 4CZHA 3DXKA 2PBDA 1QZ6A 1G99A 4PKHA 1U2VB 3G25A 4DB3A 3LDNA 1BDGA 4Z94A 5BRFA 5B8HA 2ZGZA 2V51B 3QFUA 4H0XB 1NBWA 2J4RA 3ENHA 1TUYA 3R8EA 2E1ZA 5AQKA 3H45C 3VEZA 2Q36A 4BRHA 1IG8A 5FPMA 1ATRA 4FPAA 5AQYA 1IJJA 2D0PA 3VOVA 5ADXA 3U4LA 2A42A 3UKRB 4WYBA 4K42A 3VEXA 3JXUA 5F1XA 4CZEA 1S3XA 5AQRA 3S41A 1WUAA 5LJWA 1NGGA 5AQOA 3D2EA 3A8YA 3C7NB 4FWSA 1GLBG 2IVNA 3JS6A 4GY2B 3TU5A 2Q2RA 3QDKA 3I8BA 3GOIA 3AY9A 2KHOA 4BC3A 2P9NB 4K41A 3ZX3A 3KZBA 4I6MB 2ASOA 3MDQA 5TKYA 4WQ4C 3VEVA 4CZMA 1NGEA 3KVGA 3VEWA 4EAHD 2NLXA 5F2RA 2E2OA 3EL2A 1LOTB 4BRAA 3ULEB 4Y0WA 4O8KA 5E26A 2VCPA 4H0OA 5AQJA 2A40A 4FOEA 4DCHA 1C0FA 3O1BA 4LC9B 3VERA 4BVOA 3RSEA 4MO4A 3A5MC 3CIPA 2HOEA 5AQMA 4YDUA 5AZJB 4JN4A 2VYPA 3A0IX 4FWPA 2P9IA 4EFHA 3UKUB 4XEIA 5BREA 5AQVA 2E20A 4B1YB 4H5RA 3BF1A 3H1QA 4H5VA 4A2BA 1NLVA 1NGDA 1NGAA 2F9WA 2V7YA 3EKSA 3AAPA 4C23A 3ZEUB 3O6WA 2FSNA 2CH5A 3CETA 5BPMA 3P4IA 3H1VX 3U8XA 3CJAA 4MO5A 1QHAA 2WUSA 3WT0A 3CJ9A 4FWLA 3DXMA 1JCFA 5AQGA 1EQYA 3FR0A 3R9PA 1KAZA 4IXCA 1QQMA 4CBWA 4CZIA 2QW9A 1DKGD 2FF6A 2QWQA 4ISGA 3VGMA 1HKGA 3SJHA 4BRNA 4CI6A 1BA0A 4BRIA 3BUZB 5KPTA 4FWOA 3HI0A 3D2EB 4CBUA 4XH4A 4BRDA 1TYQB 2W41A 2QXLA 1V4TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QXFA 4BC5A 3VQ6A 3V9UA 4DMNA 1SKSA 5EXWA 3FZHA 1SZ2A 3BZCA 3NGIA 3QETA 4BVPA 3AO5A 3TAGA 3L3UA 3C95A 4BACA 1WAJA 4IWVA 4RCHA 4FJ8A 3J7AP 4CJQA 4JD2A 1EETA 2UXCK 2P9SA 1C0UA 4CIFA 4M41A 1S1UA 1U47A 1CLQA 4JKGA 4IJNA 2YHWA 1LAWA 4CJ5A 4E7HA 2XRIA 1DTQA 1IH7A 2VG7A 1JCEA 4PHTX 1YVUA 1HPMA 3K9KA 1D8YA 2ZF5O 4JI0K 4ILHA 4YHHK 3WNGA 2IIRA 3T7ZA 3MEEA 5AQZA 1VQ7N 2CH6A 2RN2A 4ELVA 1A5XA 1CZAN 3LDSA 5E41A 3OYJA 4CJEA 1QQOA 1NMDA 3PIOL 1BWFO 1ZBUA 2P9KB 1BU6O 4HWIA 4FOIA 4ZTJA 4KH6A 3LPUA 3ZSOA 3VQCA 4DR6K 2O8FA 1NGJA 3KK2A 3QB0A 2RE2A 5KGXA 4EP4A 3FZFA 1WSIA 3GE1A 1N32K 4QS7A 4E1JA 1VQ5N 1S1VA 3QIPA 5SWMA 4H0PA 3SPZA 3VQBA 5BPNA 5FRNA 3ZYYX 4DFKA 4DQQA 3K2PA 4GVEA 1E4FT 3RVCA 2Q0RA 2UUAK 5C42A 4BC2A 3I0SA 4EHTA 3DXKB 1OH7A 1N34K 1RNHA 2A1SA 4CJLA 1L3TA 3ALYA 2VGMA 3P31A 3V9ZA 4BG8A 4OPKA 5AQUA 4BE2A 1VQ8N 4C8OA 1TAUA 4JNEA 4B1XB 2NZTA 4GKKK 2A6AA 3TAQA 1D9DA 4JLHA 3U6FA 3PX6A 4IOXA 4FWKA 1LAVA 1S1WA 2Y1IA 5BRDA 2PY5A 3FFIA 3OJUA 1RT1A 2ZQBA 3RR8A 3HVRA 4F9OA 2CGKA 3ZT3A 4JRPA 4CERA 3P83D 4JI4K 4WE1A 4B9QA 3TSPA 2V7ZA 1RTDA 3V1QA 2P9NA 1CZBA 4MDBA 5J2PA 3BDPA 4DU3A 3T1HK 3LAMA 1JL2A 4FJ5A 4CFCA 3ULEA 3A5LC 3R6MA 1I94K 4YOWA 5LMUK 2QWLA 3SI6A 4FLWA 3SJJA 4JRQA 1UAXA 2O8DB 2QTDA 4Z4CA 1NU0A 4E1NA 4CJVA 1IBKK 4CZFA 1JLCA 4HHTA 1VRTA 3L4IA 3HPGA 4HTUA 3VETA 3ZSWA 3UB5A 3EN9A 1DGKN 4IJAA 3CQYA 1VSLA 4EZ9A 3LL3A 4BR7A 4CW7B 1EWQA 1NK9A 3HP9A 5AQLA 3BGRA 3W3DA 3J8AA 2YNIA 1NKCA 3O8MA 3RMCA 4BR5A 4IFVA 3L2QA 4XIUA 1MWKA 3AVNA 4DSJA 4YOTA 2OPQA 1LWEA 3M3ZA 3BP8A 2NRZA 1WSFA 3DLEA 1MA9B 5C15A 2YKMA 3PIPL 3D7EO 4H0YB 5AQTA 3VEYA 1X3MA 4E89A 3RTVA 5C2DA 2FBYA 2ZE2A 4CZJA 4BY9C 4QAGA 3QEPA 3I8DA 4FVMA 2UXBK 1S6PA 5AQFA 4HCCA 3DAWA 1M1KO 4KRFA 4DQRA 3DI6A 1DEJA 1GOAA 5KQ8A 1T44A 2QWRA 3BEXA 4MDAA 3VQDA 1SKWA 1Q18A 1W2BM 3NF9A 4BE1A 4FLZA 4KI6A 4FJ9A 4CEDA 3HRGA 4IG0A 2BANA 2X74A 2FLOA 5DMRA 2DFHA 2P9PB 4DSFA 1X9WA 3LWLA 1N33K 4E7KA 1ZXOA 3QBWA 1RILA 3KK1A 3CJ7A 1W7AA 4RW9A 3F5TA 1REVA 1U45A 3ISNC 3BF3A 4FW2A 4L3QA 3TTDA 2FC0A 1RBTA 3U9ZA 5HRRA 4JAXA 3OY9A 3AVAA 2E5LK 4LF7K 3MAQA 3H3OB 4PL7A 4MFBA 3ATVA 4CF1A 2UXDK 1IKWA 4CJ4A 4FWRA 1NGIA 4J2AA 1LWFA 4B9LA 1QHTA 4M3XA 2EWSA 3T19A 4ISFA 4BRLA 1ILYA 3FLCO 5EVZA 1KXPA 1HQUA 5BRHA 4Z4GA 3IS9A 4FWNA 3ZSRA 4JI7K 4CESA 4KKOA 4DFPA 4CJRA 5GIPA 4OLAA 3OA9A 5E84A 4BRPA 3DMJA 1BUPA 3CJBA 1ZBIA 1QVGM 4CECA 4NLBA 4BRGA 4JYAK 1SUQA 1QZ6A 4PKHA 4FZYA 3LDNA 3D6RA 4PUOA 4Z94A 4KTZA 5BRFA 3RWUA 2ZGZA 4JS5A 3K57A 3QFUA 1HR0K 1FJGK 4H0XB 1NJYA 3TAMA 1TUYA 2HW3A 3NH2A 1L3VA 5M1QA 3VEZA 1QSSA 4F2RA 4AH9A 1IG8A 1GOBA 1I3AA 5AQYA 5KTQA 1TK0A 4I2PA 1IJJA 3F73A 3VOVA 3UKRB 3K0SA 3V1RA 1J9AA 4CJTA 4WYBA 3IRXA 4K42A 3VEXA 5F1XA 4CZEA 5A2QO 4FVUA 3O4NA 4BDZA 4AILC 4O0JA 2IVNA 3JS6A 3SQ0A 4ZHRA 3VMFB 4JI5K 3AY9A 2KHOA 3NE6A 4EZ6A 4YFUA 4ILJA 3ZX3A 4CZMA 3B6OA 1NGEA 4EAHD 4DUZK 3P38A 1L3SA 1LOTB 3O9UA 3ULDA 3CCUN 4DTJA 2G8KA 4B9UA 2A40A 4CEOA 3AVFA 2G8HA 3SUQA 3KIOA 4M45A 3O1BA 4JK7A 3J81O 1RBSA 3AVJA 3A5MC 2HOEA 2VYPA 3ZT2A 4FWPA 3KLFA 2P9IA 1Q9XA 4Q0BA 2O8EB 4O8UA 2E20A 3L2WA 3H1QA 1SL2A 1BCMA 4A2BA 4DV3K 2X6SA 1BQMA 4NCGA 4E3SA 3ZEUB 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5AZIA 4BWJA 3AVLA 1FKPA 4N41A 1HQEA 5KQDA 4U7BA 3J7YP 2KZZA 5DK5A 2KZMA 1WB9A 5HP1A 1QQNA 3QBXA 4YY3K 3KK3A 1RTHA 2W42A 4DQSA 1Q7YO 1J6ZA 2GV9A 4OX9K 2IGIA 1RT6A 3ZX2A 3WXMB 5AQWA 4OO1J 2YV0X 3THWB 4GNIA 5H1SQ 4X64K 3CFRA 2D4WA 3SUNA 2YNFA 3OHRA 4CGFA 3L8BA 2DPNA 3O80A 4DU4A 3VPZA 4B8CA 2ITMA 4Z0UA 3ENOA 3VF6A 2G8IA 3W0LA 1C1CA 4BROA 3H3NO 4I7FA 3OYMA 4A61A 3C7NA 2QEXN 4KHNA 2I5JA 4F2SA 1ATSA 2Z1JA 1NGCA 1IKXA 1HKBA 4B3OA 3CPWM 2W6LA 4BR2A 1ATNA 3E9OA 1ZBFA 3VA0A 4OLBA 4KBOA 4FJLA 4K43A 2D0CA 2ZJRL 2JWLA 2XHBA 2WONA 3O08A 3I0RA 3NF8A 1RDCA 3MXMA 3MN7A 4CJKA 5FROA 4O55A 2OZSA 4AHTA 4PY5A 3CERA 3AO1A 5LJVA 3SBGA 5AZJA 2HHQA 3VF2A 3DLGA 3O9RA 4IO9L 2E2PA 1OH6A 2OANA 4NYFA 1JXEA 1MWMA 3OW2M 1O1WA 3IUCA 3LM9A 3QNNA 3ID8A 3VGLA 1DLOA 2Q1NA 2YI1A 3WXIA 1YVNA 2E6LA 1TVRA 5GINA 4K25A 2O8BB 1HJOA 3TI0A 4AQYK 5C24A 4RTFD 4LD0A 4GV3A 4K8XA 3C6AA 4B08A 4ID5A 2AA4A 1Q81O 1HUXA 4ISEA 4TSXA 2QWMA 2HSTA 1X1PA 3SUPA 3O5BA 4PKGA 2HVHA 4OKKA 3L0QA 4JD2B 3TSQA 4JI1K 1VQLN 2P9SB 5KI6A 3BZKA 2LSNA 3AAQA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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