3IDHA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH2 (27-45)TII3 (259-262)TI8 (261-264)AH12 (361-396)3H2 (238-240)TI1 (46-49)3H1 (50-52)S1 (58-63)TVIII1 (53-56)EMPTYS2 (72-79)S3 (83-93)TIV8 (441-444)TVIII3 (81-84)S4 (98-109)TI3 (94-97)AH3 (112-116)TI'1 (168-171)S9 (196-203)TIV1 (139-142)S5 (143-150)S7 (161-164)TIV2 (156-159)S6 (154-158)TII1 (173-176)TII2 (176-179)S8 (179-180)AH5 (181-192)AH6 (205-213)TVIII6 (399-402)TIV3 (213-216)TVIII4 (215-218)S11 (230-237)TI5 (214-217)S13 (402-409)TI6 (217-220)TIV4 (226-229)S10 (220-226)TII4 (283-286)S12 (250-254)3H3 (257-259)TI9 (264-267)3H4 (267-269)AH9 (295-312)TIV6 (281-284)AH8 (288-292)TII5 (326-329)3H6 (323-325)3H5 (316-318)AH11 (346-355)AH10 (332-340)AH13 (411-415)AH14 (418-430)TII6 (431-434)AH15 (444-456)S14 (434-440)AH1 (6-22)AH4 (119-137)TI4 (158-161)AH7 (272-280)TIV7 (285-288)TVIII5 (328-331)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 168
structure length 453
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3idhA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3idhA01
1WUAA 5KPTA 3CIPA 5AFUH 3MCPA 2GELA 4JHDB 4BC3A 2E8AA 2PAVA 4PKHA 2A3ZA 4XH4A 5AQNA 2UYTA 3H1VX 2QWMA 4H0XB 4GNIA 1U2VB 1DEJA 3UKRB 4H5TA 4CD1A 5JLFA 2VWBA 1EQYA 4H0TB 4FWQA 1BUPA 3GG4A 3KZBA 4LC9B 3O4WA 2NRHA 1NGFA 1YXQA 3QFPA 3U9DA 5AFUA 1MA9B 2GTDA 4FWNA 3SMPA 5B8HA 4EAHD 4M63C 2YHYA 1LCUA 1HKGA 4CZFA 5EY4A 1GLBG 4BRGA 4CD3A 1T6CA 1NGEA 3ATVA 2QWOA 3BF3A 4M7YA 4J8FA 5AZIA 4B1WB 2FF6A 4CJ7A 3O1BA 4CZMA 2ASPA 2P9PB 4F9OA 4BRKA 1YVNA 3ZETA 3H6EA 4WQ4A 2AP1A 2P9KA 3A5LC 5AQPA 1X9JA 4IXCA 4BGAA 5FPEA 4EHTA 3RSEA 4A61A 5EXWA 5FPMA 3WQTA 5AQMA 4BRDA 4AM6A 3WT0A 3LM9A 4H0VB 3DWLA 2E2QA 4MO4A 2P9SA 4CZEA 4XH1A 3MN5A 2W40A 1TYQA 2YI1A 3VEXA 4QS7A 3WXKA 2CGJA 1IJJA 3CI5A 4RTFD 1X3MA 3I8BA 3DXKB 5KQ8A 2AA4A 5AQLA 3JS6A 1C0FA 3VGKA 3CJAA 3QBXA 2HF4A 2CH6A 3WEEA 4IJAA 4NO7A 3VF4A 3IDHA 2V51B 4K41A 4JD2A 3QMLA 2EWSA 1V4SA 3IMXA 1BDGA 4ISGA 5I9EB 4BRFA 1QZ6A 5F2RA 3W3DA 2FXUA 4BROA 1K8KA 2FLOA 5AZJB 2QWRA 4WQ4C 3FZFA 5AQKA 2DPNA 2P9NA 3L4IA 2D4WA 2Q2RA 1E4GT 3C0BA 4BRPA 1S3XA 3IFRA 1KAZA 2QWQA 3ZX0A 3C7NB 2ITMA 4JNEA 2YHWA 3HSCA 3TPQA 2J4RA 2CH5A 2P9IB 5E84A 5BN9A 1SQKA 3HI0A 2QWPA 3AY9A 4DCHA 5KPRA 5EVZA 3ENOA 2A42A 1QZ5A 3MN9A 1JCFA 5JLHA 4QS9A 3B8AX 3EKUA 2BUPA 5AQFA 5JMVA 2D0OA 3O80A 1NGBA 4IWVA 5LJVA 1ATRA 4K25A 3LDLA 2P9UA 4L3QA 2YJEA 3AARA 3L6QA 1ATSA 3ZEUA 2YJFA 4GY2B 1H1VA 1LOTB 4K42A 3UKUB 1KAYA 4BG9A 4FWPA 2CGLA 3VETA 2A5XA 4CZKA 1MDUB 4Z94A 1G99A 5KPZA 4EFHA 3A5OC 3FE1A 5AR0A 5FPNA 3S41A 4I6MA 2F9TA 4HWIA 1R59O 1XUPO 2HOEA 3DXMB 4H5VA 4IZ9A 2V7YA 1GLAG 1E4FT 5F0XA 1XQSC 3AAPA 4FWLA 3A8YA 4BGBA 2GEMA 3EO3A 1NM1A 4BQZA 3O1WA 1TYQB 3D2FB 4JHDA 4MLHA 3R9PA 4YDUA 4RWTA 2A41A 1WOQA 1MWKA 5BPMA 4FWRA 1U2VA 3D2EB 3UKRA 1BWFO 3M1FA 3P4IA 3DJCA 3O5BA 1JCEA 4PKGA 3EZWA 4E1JA 4BRNA 1SZ2A 2FF3B 5AQUA 1MWMA 2FSJA 3EL2A 1RGIA 3WXJA 1NGIA 4BR7A 4ISFA 4FSVA 4BC5A 4KBOA 2F9WA 1J6ZA 1QQNA 1BA0A 1NGAA 2FSKA 5AQWA 3A5NC 1BG3A 1NGGA 5BPNA 1T6DA 1GLDG 3VENA 3U9ZA 3W0LA 3FGUA 4CZHA 2KHOA 4FWKA 4BR2A 1NBWA 3L0QA 3LDOA 4WQ5A 1GLLO 3LM2A 5E26A 5JICA 2P9PA 1NWKA 4M7XA 2P9LB 4CZIA 4EHUA 4BRCA 3ULEB 4JN4A 5BRDA 1TUUA 2A40A 3ATUA 2CGKA 1HKBA 3LDPA 4ISEA 5AQYA 4CZGA 4YDUC 2Q0UA 1CZAN 1HLUA 1BOTO 3LL3A 3WXIA 1QHAA 4CBWA 1P8ZA 1KXPA 3CETA 1YUWA 1NGHA 2YHXA 4XEIA 4PL7A 3LDNA 2I7PA 4CZLA 3HTVA 1OKJA 4WYBA 5BRHA 2E2NA 2FSNA 3O6WA 5ELZA 4MLEA 2H3GX 4FPAA 2HF3A 3FFKB 3CJ9A 2D1KA 4H03B 3BF1A 4CBXA 2IVOA 5ADXH 3MK6A 3O8MA 3QFUA 5EOYA 3FZLA 3VESA 2E2OA 4B1UB 4BRLA 3CJ1A 5F1XA 4O8KA 2GWJA 4CZJA 2ASMA 2ZGYA 1KAXA 3QICA 4C23A 5AQVA 3WXLA 1T44A 4BC4A 3ID8A 3KVGA 3H1QA 5BR9A 4FOIA 3FZKA 5AZJA 2VYPA 4JAXA 3LDQA 3CJBA 4MO5A 3GOIA 4H0PA 5ADXA 3QDKA 4CI6A 3WQUA 1HX1A 1RFQA 1BO5O 3FR0A 4BR4A 1GLCG 2QM1A 3CJ7A 5AQJA 5EX5A 5AZIB 3HZ6A 4BREA 2I7NA 1DKGD 4BC2A 3MN7A 1Q18A 3C7NA 5BN8A 3GE1A 3CHWA 3U8XA 5AQSA 1ATNA 2P9IA 1Z05A 3ZETB 1BA1A 2P9KB 1RDWX 4H0YB 1JCGA 3VERA 2QW9A 5AQGA 2Q0RA 4DHYA 3SJHA 3RSEB 3VF2A 1XC3A 4H5RA 2V7ZA 4BRHA 3JXUA 4B1VA 3M3ZA 3MDQA 3VEVA 3VPZA 3AAQA 2QWLA 4H5WA 3R6MA 5AQRA 2P9SB 3CJCA 2HMPA 1S22A 2ZF5O 3BP8A 4DQ8A 4H5NA 1NGJA 1NGDA 5AQXA 2IVPA 4BRAA 4BVOA 3H3NO 2E1ZA 3EN9A 4CBUA 5KQDA 2NLXA 2WUSA 2NZTA 3D7EO 4EIAA 5AQQA 1NMDA 4QS8A 3EKSA 4Y0WA 4FWMA 2BTFA 4BQLA 3UKUA 2Q36A 1DGKN 2E20A 3WEEB 3TU5A 3QBWA 4A2BA 3J8AA 4K43A 3CQXA 2ASOA 3HM8A 4JD2B 4BR9A 3UE5A 3CQYA 3MMVA 1HUXA 3WUHA 4FL9A 3FZHA 4B9QA 3ENHA 3VGMA 1Y64A 3VEOA 5TKYA 2QWNA 4BR0A 1K8KB 3H45C 3SLCA 5LY3A 3DXMA 3KHYA 4IO8A 3CERA 4BG8A 5FPDA 3GBTA 2PBDA 2P9NB 4HTLA 1X3NA 4A2AA 5AQZA 2GUPA 3HBTA 3D2FA 4H0OA 3BEXA 3QB0A 1GLJO 5BREA 2IVNA 1U6ZA 4BR5A 1GLFO 2V52B 1ESVA 4BVPA 3D2EA 3U4LA 4NB4A 3ZX3A 4B1XB 4DB3A 1SAZA 1QQMA 3SK3A 1Z6RA 2IIRA 2YCHA 2Q1NA 4A62A 5AQOA 1TUYA 2E1YA 4FO0A 5BRFA 3H3OB 2D0PA 3IUCA 4B1YB 2GWKA 5AQHA 3H46O 3ZX2A 2W41A 1IG8A 4XH5A 1BU6O 1C0GA 5AQTA 1ZBSA 2ZWHA 3R8EA 5AQIA 1HPMA 3VGLA 3SMSA 3G25A 4O5FA 2E88A 4BRQA 2A6AA 3DAWA 1V4TA 3VEZA 3DXKA 3I33A 3VEWA 3BUZB 2ZGZA 4PKIA 3GDQA 4B1ZA 2OANA 4PL8A 1NGCA 2P9UB 4BRMA 4FWOA 1HJOA 3VOVA 3ZEUB 2E2PA 3FLCO 2Q31A 3M6GA 4AM7A 1HKCA 2P9LA 1ZXOA 2Q97A 3ULEA 1NLVA 3A0IX 3A5MC 3VF6A 4WQ5C 2QXLA 3F9MA 5LJWA 1YAGA 4RCHA 5CE3A 4FOEA 2VCPA 5BPLA 3UB5A 4BRIA 4FWSA 3O08A 1ZC6A 3GL1A 4I6MB 4IJNA 1QQOA 3FZMA 1GLEG 3MN6A 4FPBA 3OHRA 3VEYA 1D4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OJSA 5KPTA 1J5OA 3CIPA 3D45A 4O8UA 2HBMA 3KJVA 2IAJA 4JHDB 2E8AA 1TL3A 4DF8A 4B3RK 2PAVA 2Y1JA 3HPHA 4OPAA 2G8KA 1ITGA 3CD6N 1DEJA 3WNFA 5SWMA 3O9SA 1T03A 1FK9A 2G8FA 3OS2A 4FZXC 3CG7A 1O13A 1RTHA 4X64K 4K0KK 4JI6K 3LP2A 5AFUA 1MA9B 4FWNA 1RNHA 4CZFA 3M5RA 4FJXA 2HNZA 4BRGA 4CF0A 1RCHA 2QWOA 3NHGA 4NCBA 3C6HA 3WNEA 4DV4K 4Q0BA 2FF6A 3OYDA 1ZBUA 4DUZK 1HRHA 2P9PB 1XI1A 1N34K 4F9OA 4AHUA 3ZETA 3CMAN 2AP1A 3A5LC 2ETJA 4BGAA 4DQIA 1RDBA 1CZBA 4KREA 2FBTA 5EXWA 4UY8O 3WQTA 4DTXA 4CJ5A 3N4QA 4H0VB 1N5YA 5IWAK 3DWLA 3PSFA 1D8YA 2E2QA 1K6YA 3TTFA 4AHVA 1HR0K 1K73O 3MN5A 3AO3A 4PY5A 4WF9L 2CGJA 1IJJA 1S9GA 4DLEA 1Q9XA 2ZM6K 3I8BA 1JLGA 1XWLA 3KK1A 1VQON 4K8XA 1C0FA 3VGKA 3CJAA 4IOCL 1EP4A 2FBXA 2VWJA 4M3WA 1YF5L 4CEAA 2HBKA 2O8EB 2PZSA 4WFBL 1U49A 3DYAA 3OYJA 3VA0A 3QEVA 4AF1A 2QK9A 2HHHK 1EETA 3LP1A 1RT6A 1MU2A 1ZBHA 2FXUA 1XHXA 2E5LK 4FJJA 1K8KA 3TARA 3BY5A 1SL0A 2QWRA 3RTVA 1XNQK 3FZFA 5AQKA 2P9NA 3TR8A 3I56N 3L4IA 1E4GT 3NDKA 4BE2A 3IFRA 3PX6A 2QWQA 3KLFA 4KHQA 3G10A 2ITMA 4JNEA 2RE2A 4CEBA 3J7YP 3O9UA 4O4GA 4LSNA 1VSIA 3HO1A 4CHQA 4CEEA 4LF7K 4KTQA 3PO4A 2KZMA 3K57A 3THWB 3KD1E 3L2WA 1S72N 4GKKK 4V19S 3OTOK 3ENOA 3HXMA 1ZBFA 5JLHA 3B8AX 3EKUA 2BUPA 5JMVA 3SBTA 4FLVA 2F7TA 3U3YA 3TANA 4ELUA 3MX5A 2RN2A 5CHIA 1VSHA 1C0MA 1HYSA 4K25A 3O3FA 2P9UA 3MXMA 1YI2N 4FVMA 4ICLA 1ATSA 2YJFA 4GY2B 4K42A 5M1PA 1BHLA 1VQ7N 2D5RA 4I2PA 3DOLA 1VK0A 3HYFA 4JV5K 1G99A 4JK8A 4JI3K 5KPZA 3B6OA 1WLJA 4CE9A 5TKWA 1WSGA 4Z4EA 1KLNA 4E1MA 5AJ3K 4I6MA 4OGCA 3VQ4A 1T3VA 3MEEA 3NGIA 2HMIA 4JKBA 1C1CA 4CJFA 3CCMN 1NK7A 1W0HA 1XQSC 4BY9C 1GOCA 1OH7A 4JHDA 3HOSA 4MLHA 2A41A 1WOQA 4DKWA 2OA8A 4WFAL 4Y1CA 3AA4A 4AILC 4F3TA 3P4IA 4C8MA 1VQPN 3KLGA 1CLQA 1B9DA 3PIPL 3KKSA 3EL2A 3WXJA 3ZT4A 3C94A 3K59A 5I3UA 4BC5A 5M1FA 4HTUA 1BA0A 1NGAA 1ZBLA 2DFHA 4E7KA 5AQWA 3A5NC 3AVKA 4I9QA 1BCMA 1NGGA 2Y1IA 3T1HK 3TABA 3V1OA 1OH8A 3O3GA 4CIFA 4JYAK 3SV4A 4CZHA 3HT3A 4O5BA 4CCHA 5M1QA 3L0QA 4CJVA 2ZJRL 3NE6A 5I42A 1LWFA 5JICA 2P9PA 1NWKA 4G1QA 3VQBA 4KHYA 4JN4A 2QA4N 5BRDA 1TUUA 3SBGA 1KRPA 3DRPA 4ISEA 5HROA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OJS A;  5KPT A;  1J5O A;  3CIP A;  3D45 A;  4O8U A;  2HBM A;  3KJV A;  2IAJ A;  4JHD B;  2E8A A;  1TL3 A;  4DF8 A;  4B3R K;  2PAV A;  2Y1J A;  3HPH A;  4OPA A;  2G8K A;  1ITG A;  3CD6 N;  1DEJ A;  3WNF A;  5SWM A;  3O9S A;  1T03 A;  1FK9 A;  2G8F A;  3OS2 A;  4FZX C;  3CG7 A;  1O13 A;  1RTH A;  4X64 K;  4K0K K;  4JI6 K;  3LP2 A;  5AFU A;  1MA9 B;  4FWN A;  1RNH A;  4CZF A;  3M5R A;  4FJX A;  2HNZ A;  4BRG A;  4CF0 A;  1RCH A;  2QWO A;  3NHG A;  4NCB A;  3C6H A;  3WNE A;  4DV4 K;  4Q0B A;  2FF6 A;  3OYD A;  1ZBU A;  4DUZ K;  1HRH A;  2P9P B;  1XI1 A;  1N34 K;  4F9O A;  4AHU A;  3ZET A;  3CMA N;  2AP1 A;  3A5L C;  2ETJ A;  4BGA A;  4DQI A;  1RDB A;  1CZB A;  4KRE A;  2FBT A;  5EXW A;  4UY8 O;  3WQT A;  4DTX A;  4CJ5 A;  3N4Q A;  4H0V B;  1N5Y A;  5IWA K;  3DWL A;  3PSF A;  1D8Y A;  2E2Q A;  1K6Y A;  3TTF A;  4AHV A;  1HR0 K;  1K73 O;  3MN5 A;  3AO3 A;  4PY5 A;  4WF9 L;  2CGJ A;  1IJJ A;  1S9G A;  4DLE A;  1Q9X A;  2ZM6 K;  3I8B A;  1JLG A;  1XWL A;  3KK1 A;  1VQO N;  4K8X A;  1C0F A;  3VGK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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