3IMXA

Crystal structure of human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
451
structure length
447
Chain Sequence
GPGSMVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Investigation of functionally liver selective glucokinase activators for the treatment of type 2 diabetes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 167
structure length 447
sequence length 451
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3imxA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3imxA01
2A40A 1SQKA 3LDQA 4H0OA 1YAGA 4J8FA 4K43A 2Q31A 3FZLA 4BRFA 1HJOA 2D0PA 2GUPA 5KPZA 2P9UA 3UKRB 4IXCA 2HMPA 4JN4A 4PKGA 5AQIA 1RGIA 3VF4A 1S22A 5AQXA 1GLEG 4BRCA 3ULEB 3VERA 1YUWA 2A3ZA 3WXLA 3O5BA 3FGUA 3FR0A 4CZFA 3MN7A 1J6ZA 3WQTA 4PKHA 2E20A 2W40A 3H6EA 3LM2A 2P9SA 1MWMA 2FSNA 2YI1A 4M7YA 4ISGA 2QW9A 1NGHA 5AZIB 5LY3A 3VETA 3M6GA 3AY9A 3CJBA 4H5NA 3WT0A 3CHWA 4BRHA 3UKUA 4BC4A 4FPAA 1QZ6A 3QICA 3I33A 4QS7A 3KHYA 1QHAA 3CJAA 1HLUA 2I7PA 3ATVA 2P9PA 3GBTA 3D2EB 2J4RA 1NBWA 2HF4A 5B8HA 4JD2A 4CZMA 3CJ1A 2Q97A 3DXKB 4BRLA 3H45C 3EL2A 5JLHA 3VOVA 4BC2A 3QBWA 5KQ8A 4CBXA 2HOEA 5JICA 2E2NA 4FWLA 3JS6A 5ADXA 1KXPA 3EKSA 3HI0A 1LCUA 4DQ8A 2WUSA 3LDOA 5AQQA 3C7NB 1X9JA 4WQ5A 2GWJA 2A6AA 2EWSA 2QWQA 5AQSA 5AZJB 3U9DA 4IWVA 2PBDA 2FF6A 2CH5A 3H3NO 4K42A 1SZ2A 3CJ7A 3SJHA 3BF3A 1GLDG 5JMVA 1NGCA 2QWRA 4H03B 3QB0A 4BR7A 3D2EA 2GTDA 4EFHA 5AQKA 1U2VA 5AQJA 1Z05A 1BOTO 4BRMA 4Z94A 5KPRA 2DPNA 1C0GA 4MLHA 1Z6RA 4JAXA 3O8MA 3WEEA 3O4WA 4FWNA 2H3GX 3A5OC 3R9PA 2VCPA 3CJ9A 1V4TA 1MWKA 3MDQA 2P9UB 4BRKA 1TUYA 3BEXA 5BPLA 3GE1A 2HF3A 1MDUB 4BC5A 4EHUA 4H5WA 1E4FT 3MN6A 3IUCA 5EXWA 1BDGA 4H0VB 4MO5A 5E26A 4BVPA 4I6MA 4HWIA 3AAQA 1NGEA 1KAYA 3DWLA 4LC9B 4CZLA 2YJEA 3KZBA 5AQWA 2P9SB 4JHDA 1NLVA 2V52B 4EIAA 3O08A 5BREA 2YJFA 3UKUB 3LDNA 4BQLA 3VEZA 2E1ZA 1WOQA 1NGDA 2P9PB 2E88A 1GLCG 1E4GT 1KAZA 1XC3A 4JD2B 2ASOA 1C0FA 2AA4A 1NGJA 3WUHA 5BR9A 3O1WA 3FZKA 5BRFA 3ZX0A 4XEIA 4CZEA 4YDUC 2F9WA 5BRHA 2QXLA 4HTLA 4FOEA 1HUXA 5AQGA 3W0LA 2P9NA 3L4IA 3L6QA 4O8KA 3G25A 3WXKA 3B8AX 3UE5A 2GWKA 5AQMA 1HKGA 3GDQA 2ZWHA 3MN5A 2FF3B 3P4IA 4QS8A 5CE3A 4H0PA 3J8AA 3CQXA 4EAHD 3LDPA 2QWMA 3SMPA 4O5FA 2ASPA 3OHRA 3CETA 1NGFA 1SAZA 4FWQA 3TPQA 4FPBA 4H5RA 2QWPA 2PAVA 4NB4A 3IFRA 1U2VB 2YHYA 3RSEA 3F9MA 1DGKN 1HKBA 3HSCA 3QBXA 3TU5A 4XH5A 3VESA 5ADXH 2Q36A 3L0QA 4FSVA 3WEEB 5AQRA 4BGAA 5LJWA 2BTFA 1JCGA 4B1WB 1U6ZA 4B1XB 1G99A 3QFUA 3R6MA 2V51B 5AQOA 3VENA 3VEOA 3HTVA 4CI6A 4JNEA 3MK6A 4CZKA 1S3XA 3SLCA 4A2AA 1BA1A 4KBOA 1KAXA 2P9IA 4I6MB 1JCEA 4M7XA 1ZC6A 1ATRA 2FLOA 1ATSA 1Q18A 3AARA 3EKUA 3M3ZA 3R8EA 4EHTA 4BRGA 3GOIA 4FWRA 5AQZA 4JHDB 5AQTA 4IZ9A 3MMVA 1NGIA 1HX1A 2CH6A 3ZEUA 3A5MC 2GELA 4FWOA 4L3QA 2E2OA 1XUPO 4E1JA 5JLFA 2QWLA 5KPTA 3CERA 1X3NA 5EY4A 4Y0WA 4A2BA 2CGKA 4K41A 4CBWA 2YHWA 2OANA 4FWPA 2NLXA 3QFPA 4H5TA 4CBUA 1BU6O 3HZ6A 1ZXOA 2V7ZA 3BUZB 3ZETA 1NWKA 3BF1A 3D2FA 4BROA 5AFUA 3VEXA 3WXIA 1OKJA 2P9NB 2YHXA 5KQDA 2ZGZA 1X3MA 3BP8A 4FWSA 1GLAG 2NZTA 3I8BA 3UB5A 3VGKA 4PL8A 2QM1A 5ELZA 1K8KB 4CZGA 4BRDA 4YDUA 2IIRA 1Y64A 1QZ5A 4NO7A 3ZX2A 4RWTA 2CGLA 3ENOA 3ENHA 3IDHA 1CZAN 1QQMA 5TKYA 2Q2RA 1BO5O 4A61A 1HPMA 2FSJA 5EOYA 3VF6A 3M1FA 2IVPA 3HBTA 4FOIA 2KHOA 4BRPA 2F9TA 4B9QA 1H1VA 3HM8A 4AM7A 4BRIA 4BRAA 4DB3A 4FO0A 3CQYA 4IJNA 4MLEA 2V7YA 1YXQA 5BPNA 5BRDA 5FPMA 2I7NA 2ZF5O 4WQ4C 3QDKA 3RSEB 2QWOA 1BG3A 2ZGYA 3EZWA 2ITMA 4BR2A 3FE1A 3IMXA 4CZJA 2QWNA 3VGMA 2A42A 2P9KA 3S41A 5AQVA 4PKIA 5I9EB 4BRQA 3DJCA 4DHYA 4F9OA 2BUPA 1K8KA 1T44A 3O1BA 1QQNA 2E8AA 4BR0A 2A5XA 2D4WA 4A62A 4FWKA 3DXMA 4RTFD 3VPZA 4FWMA 1JCFA 2P9IB 3EN9A 3LDLA 1EQYA 2P9LA 1T6CA 1NGGA 3ATUA 1RFQA 5EVZA 5AQUA 3WXJA 1T6DA 5FPEA 3A5NC 3ZEUB 1R59O 1TYQA 4FL9A 5BN9A 1DKGD 3H1QA 4BGBA 4C23A 5AQYA 3ID8A 2CGJA 3FFKB 5FPDA 2UYTA 3W3DA 4B1ZA 3D7EO 3JXUA 4BG9A 1WUAA 1GLLO 3FLCO 3LM9A 4BG8A 4B1YB 2W41A 2D0OA 5LJVA 5E84A 3GL1A 2ASMA 3H1VX 3VEVA 3LL3A 1NMDA 3ZETB 3A5LC 3O6WA 3GG4A 2Q0UA 3D2FB 3H46O 4K25A 5F0XA 1BUPA 3VEYA 3WQUA 4WYBA 3CI5A 4BREA 4DCHA 5F1XA 5AQLA 4ISFA 1P8ZA 1IJJA 2Q0RA 5AQHA 4B1VA 3UKRA 1HKCA 1NM1A 4BVOA 1GLJO 4H0TB 3ULEA 5BPMA 4GY2B 1YVNA 5FPNA 4GNIA 1QQOA 1BA0A 1ESVA 1NGBA 3H3OB 4B1UB 3U8XA 3CJCA 4BR9A 2IVOA 2E1YA 5AZIA 3FZMA 1GLFO 5AQNA 5BN8A 1XQSC 4MO4A 1GLBG 2VWBA 3U9ZA 5AFUH 3O80A 3CIPA 3VEWA 1ZBSA 4IO8A 3SK3A 1RDWX 2Q1NA 5F2RA 4QS9A 4BR4A 4CZHA 2NRHA 4CJ7A 3FZHA 4BC3A 2E2QA 2GEMA 2P9KB 3MCPA 4WQ4A 4ISEA 3DXKA 1BWFO 4BR5A 3A8YA 3U4LA 2E2PA 4WQ5C 2FXUA 5AR0A 3VF2A 3DXMB 2IVNA 5AQFA 2P9LB 3ZX3A 5EX5A 1DEJA 3EO3A 4IJAA 3C0BA 3C7NA 1IG8A 1ATNA 4H0YB 4XH4A 1D4XA 1NGAA 2VYPA 4XH1A 5AZJA 4PL7A 1TYQB 3MN9A 4H0XB 4RCHA 5AQPA 3QMLA 3DAWA 4AM6A 4BRNA 1LOTB 1TUUA 2FSKA 3AAPA 4BQZA 4M63C 2A41A 2YCHA 4H5VA 2AP1A 1MA9B 3A0IX 2D1KA 4CZIA 3VGLA 4CD1A 3FZFA 3KVGA 3SMSA 4CD3A 1V4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NGZA 4ZHRA 5DM7L 2ATQA 1YAGA 4K43A 1VSKA 1JLQA 4DG1A 5SWMA 4BE1A 4B9NA 2ZD1A 1JKHA 4IXCA 4PKGA 4G1QA 3OYFA 1TGOA 3VF4A 5AQXA 1GLEG 2LSNA 3ULEB 4M3XA 3WXLA 3O5BA 1BISA 3OW2M 4ID5A 4CIEA 4N41A 2E20A 5JVGL 2FSNA 4M7YA 4A5AA 4ISGA 1C1AA 3OBWA 1KQSM 4N47A 3SCXA 3CJBA 4GV9A 1NJXA 3PX4A 4BC4A 4FPAA 3L8BA 5CR4A 2NUBA 4TSXA 3QICA 3WNEA 4FK2A 4HCCA 3KHYA 3AA4A 4L8RB 3CJAA 1HLUA 2P9PA 1SUQA 1NK8A 3L2WA 4KFBA 1NBWA 2HF4A 4KH5A 4CF2A 4JKDA 4LH5A 2Q97A 3DXKB 3LWMA 3H45C 3VOVA 3ZSQA 4CJLA 4CBXA 3K57A 2E2NA 5D3GA 3JS6A 5GAGP 2EHGA 4FZZA 4RW4A 1X9JA 2HNZA 1N5YA 5J2NA 4KREA 3C94A 4KHNA 4KRFA 2QWQA 3CMEN 2HHXA 1GOAA 3QESA 2FF6A 1SV5A 4JKGB 4FLXA 4Z4IA 2EX3A 4K42A 3ASMA 4NXMK 1JXBA 3SJHA 5HRPA 1GLDG 3MCAB 4BE0A 3VTHA 2QWRA 1RT3A 3S3OA 4B9SA 1RT2A 3NF9A 3OA9A 4BR7A 3CPWM 1U2VA 5CZ2A 5LMNK 4I2PA 1BOTO 4Z94A 2DPNA 4NXNK 4E0DA 4JAXA 5CHIA 3HT3A 2WFBA 3O8MA 1HYZA 3O4WA 4FWNA 5C42A 1YTAA 3LPUA 4IOXA 4PA1A 4OJRA 1TUYA 3V1QA 4I2QA 5BPLA 2GBZA 1EP4A 1BIZA 3HM9A 1J5OA 3OYCA 2YNGA 1NJWA 3SUOA 3C6AA 3MEDA 4DU3A 3AO4A 4HWIA 1RNHA 3QEVA 3DWLA 1EETA 3V4IA 3RMAA 2HB5A 2G8HA 3SQ0A 3J7ZO 2V52B 3KD5E 4ILGB 3AVJA 4DFKA 1EX4A 3LDNA 2UXBK 3L2QA 1WOQA 3SJJA 4CW7B 4DWIA 4DTPA 1YI2N 4NYFA 2W6KA 1KAZA 2YHAA 4CERA 4CF9A 4C8LA 2AA4A 3G6EN 2WONA 3DOKA 2WBNA 5KI6A 5KGWA 2QXLA 4HTLA 4FOEA 2P9NA 4FJKA 3L4IA 3L6QA 2Q3SA 4O8KA 4CCHA 4CGDA 3WXKA 5IT9O 3B8AX 2GWKA 4K0KK 1HKGA 2NRWA 4CJRA 2HNDA 2OPSA 1RTDA 2ZWHA 3MN5A 4M41A 1TAQA 5CE3A 3J8AA 1TVRA 1ZYQA 3D0PA 4HUFA 3TANA 3LDPA 1NMNA 2YKMA 4O5FA 3JAMO 4JI2K 2ZJQL 3PIOL 4JI5K 1KLMA 3TPQA 3NF7A 4B08A 2PAVA 3IFRA 4M3YA 3NHGA 1WSGA 3C6TA 3RRGA 3RSEA 5C15A 4BDZA 1XWLA 1DGKN 4FLVA 3VQQA 5ADXH 3L0QA 4FSVA 4F2RA 3WEEB 1EO1A 1ZBIA 4AH9A 3I0SA 4CK2A 3IKMA 1QTMA 3T1AA 4B1XB 1YHQN 3QFUA 3CCMN 3VENA 2DFHA 1LW2A 3RWUA 1LAVA 4CZKA 4JKFA 1S3XA 2X78A 3SLCA 2HHTA 1VSHA 1KAXA 3QETA 2P9IA 4I6MB 1JCEA 4M7XA 4FK0A 1ZC6A 2FLOA 4EHTA 1Q18A 4DFMA 4CIGA 2YKNA 3O9TA 4I9QA 5AQZA 3DYAA 1NGIA 1HX1A 4AHTA 2KLAA 3TI0A 4DU4A 1L5UA 3NE6A 3CERA 1X3NA 3AVIA 5EY4A 4Y0WA 4A2BA 3CCLN 2Z1GA 4K41A 3QNOA 3NF8A 3MECA 4FJLA 4FWPA 2NLXA 4B3TK 2NRRA 4H5TA 3OYDA 3HZ6A 3BUZB 1NWKA 3BF1A 4WE1A 3K5LA 3VEXA 4AHRA 1OKJA 4DTNA 2YHXA 4M3UA 3I8BA 3VGKA 4DSJA 1K8KB 4YDUA 4J2EA 1Y64A 4NO7A 2HHWA 3ZX2A 4RWTA 1LW0A 1NOZA 3ENOA 1N34K 4W5NA 1CZAN 4KKOA 3DLBA 3TAPA 3ITHA 3N4PA 4I9LA 5FLXO 2O4GA 1H1VA 4DB3A 1SL2A 2KW4A 1LWCA 4IJNA 2V7YA 2FBYA 1YXQA 4DQPA 4WCEL 3QNNA 1FXXA 4CFAA 4X65K 3I0RA 1Q82O 3VN5A 3VQEA 1ASUA 2HNYA 3S41A 1S1XA 4PKIA 4JRPA 1OVQA 5I9EB 3HXMA 4KH6A 1K8KA 5MLCQ 1QQNA 1XHXA 4A62A 1C1CA 3AVCA 4JKHA 1BCMA 4RTFD 2XY5A 4FWMA 3LDLA 1T6CA 1NGGA 3RVCA 1RFQA 3WNGA 1T6DA 4IBNA 1BGXT 4LF7K 3C6HA 3K0SA 3SQ4A 3KIOA 1WAFA 4FW1A 1TYQA 4QCLA 5AQYA 2UYTA 3MXMA 3D7EO 4DR3K 3E9OA 1WUAA 4CJ4A 1GOBA 1GLLO 3TAMA 4K8ZA 5LJVA 4W5TA 2D0AA 2ASMA 3LP2A 3A5LC 3O6WA 2FC0A 1NNEA 3O4NA 1C1BA 5F0XA 5C10A 4JLHA 3WQUA 3CI5A 1QE1A 4CE9A 5F1XA 3K5NA 3R1XA 1WN7A 1S5JA 2Q0RA 4OPAA 3BY5A 1DLOA 1HKCA 3NVMA 4A59A 3LZIA 3RMDA 4LF9K 4YOTA 4DV6K 1YF5L 4M42A 1Z26A 1JJ2M 3CMAN 4J2AA 5BPMA 5FPNA 1L3UA 3SZ2A 1TV6A 3ZSOA 1ESVA 1NG9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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