3IMXA

Crystal structure of human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
451
structure length
447
Chain Sequence
GPGSMVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Investigation of functionally liver selective glucokinase activators for the treatment of type 2 diabetes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 167
structure length 447
sequence length 451
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3imxA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3imxA01
1ATRA 3CERA 4K41A 3O8MA 4CZKA 1HKCA 1IG8A 4MLEA 1BA0A 5BPMA 3QICA 5AQYA 5AQNA 1JCFA 4DHYA 1KAYA 2EWSA 5AZJA 3TU5A 2VWBA 1P8ZA 4PKIA 5B8HA 2AP1A 3AARA 3M6GA 4BRFA 5JLHA 2P9NA 2P9IA 2NZTA 2PAVA 4KBOA 2YHWA 1NGCA 1HJOA 1TYQB 2Q31A 3FE1A 1BOTO 5AQRA 2PBDA 3AAQA 4IJAA 5AQTA 2CGLA 3CI5A 2ITMA 3UB5A 3IDHA 3RSEB 1X3MA 4JHDA 5AQJA 3BF3A 1XC3A 4A62A 3ENHA 3LDLA 1JCEA 1NGEA 3D2EB 5AFUA 1GLFO 2KHOA 4BRQA 3H3OB 3BP8A 4CBXA 3P4IA 3VF2A 3JS6A 3BEXA 3CJCA 3GBTA 4H5TA 1HPMA 2FF3B 3CJ7A 3H46O 1NGGA 2FF6A 2BUPA 2AA4A 3C0BA 1NMDA 3DXKA 4M63C 3UKUA 3O4WA 2P9UB 2V7YA 4BR2A 1K8KA 5KPZA 3KZBA 1NGFA 5JICA 2D4WA 3SMPA 3DJCA 3C7NA 4J8FA 4H0PA 1NGJA 2E88A 3VERA 4H0VB 5ADXH 4RWTA 3H1QA 4H5NA 3ULEA 3MK6A 3VF4A 3MN9A 1E4FT 2QWNA 5F1XA 3H3NO 1Y64A 1YAGA 4BGAA 2I7PA 2P9LA 1V4SA 2QWRA 5LY3A 1GLCG 4H03B 1ZBSA 5BPLA 3WXIA 1ATSA 3FZKA 5BREA 3BUZB 5AZIB 4B1UB 4H0XB 2UYTA 4CJ7A 1ATNA 4JN4A 4BR9A 1BG3A 3VOVA 4FPAA 5F2RA 3U9DA 2HMPA 3ZETA 3MN5A 2A3ZA 4JAXA 3A5LC 2Q97A 3TPQA 1BU6O 4QS9A 1HKGA 1NM1A 4GY2B 5BN9A 3SJHA 3SMSA 1GLDG 4NB4A 5KQ8A 3R6MA 1NGAA 4BRGA 4XH5A 1QQNA 4K25A 3O5BA 4FWRA 2P9PB 5AQGA 2Q0RA 4H5RA 4QS7A 3G25A 3L4IA 1R59O 1Q18A 2P9NB 4I6MA 4BVOA 1MA9B 4DCHA 1Z6RA 4CI6A 4YDUA 4IO8A 4C23A 1T6DA 3DWLA 3HZ6A 3KVGA 4FPBA 3I8BA 4FOEA 4BGBA 2CH6A 1ESVA 1X3NA 4BC3A 3FLCO 4FWQA 2QWPA 1HUXA 3W0LA 2W41A 3L0QA 4E1JA 3B8AX 5CE3A 4BROA 2YHYA 3FZMA 3VETA 1RFQA 2YCHA 1LCUA 5AQFA 3GOIA 3HBTA 3IUCA 5BRDA 5E26A 3U4LA 1GLJO 3VEOA 1NGBA 2VCPA 3J8AA 5ELZA 1MWKA 2CH5A 3A5NC 4JD2B 3O1WA 4H5WA 2E1YA 5EX5A 5AQSA 5EXWA 3A5MC 4H5VA 4EHTA 3JXUA 4WQ5A 3GE1A 1RGIA 4BC2A 2J4RA 3VEZA 2YJEA 2QWQA 3FZHA 3O08A 3M3ZA 4ISFA 2QWLA 3UE5A 3EN9A 2P9LB 3M1FA 4FWKA 4M7YA 3HSCA 3WQUA 1SAZA 1WUAA 4EHUA 4BR7A 4FWLA 4BRPA 3EKSA 2GWKA 4BVPA 3WEEB 4BREA 4L3QA 1C0FA 4XH4A 3MN6A 3S41A 2A40A 4H0OA 3ZETB 3O80A 3OHRA 1HX1A 2ZGYA 3H1VX 1BDGA 3GG4A 3CETA 1BA1A 4BRNA 4A2BA 3MN7A 3F9MA 1BO5O 4MO5A 1HLUA 1S3XA 3DXMB 2P9KB 3D2FB 2CGKA 1NWKA 2YI1A 3VGMA 2P9SA 1H1VA 2Q36A 4BQLA 4A2AA 1MWMA 3LM9A 2I7NA 4FWOA 4FWSA 3ZX2A 4PKHA 4WYBA 1QZ5A 4QS8A 4EFHA 3LDOA 3A5OC 4O8KA 2NRHA 4FL9A 3LDQA 4WQ4A 2GELA 1T44A 3I33A 2Q2RA 3ZEUA 2F9WA 3A0IX 5AQMA 5ADXA 3ZX0A 1TYQA 3EKUA 1NLVA 4AM7A 1NGDA 3RSEA 3LL3A 2GUPA 1NBWA 2YHXA 3QMLA 1BWFO 3UKRB 5AQOA 3VF6A 3D2EA 1T6CA 2HOEA 2NLXA 5EY4A 4CZJA 3D7EO 1U6ZA 3GDQA 3QDKA 3VEVA 2ZF5O 4B1VA 1XUPO 1GLBG 5LJVA 5AQZA 3U9ZA 3WT0A 4PL8A 2P9UA 1ZXOA 3WUHA 5AQXA 5BR9A 2QWMA 2E2OA 3O6WA 5AZJB 4K42A 4CZIA 5JLFA 1TUUA 3R8EA 4B1XB 3WXKA 3IMXA 1LOTB 4BC5A 3FZLA 1QQMA 2P9IB 3FGUA 3CJ1A 2Q0UA 3CHWA 4IWVA 2E2NA 4ISGA 3CJAA 3LDPA 2IVPA 4FWMA 2ZGZA 4JHDB 4LC9B 3CQYA 1IJJA 1YVNA 3ATUA 3MDQA 4XH1A 1ZC6A 3VGKA 1C0GA 4CZFA 3CIPA 5AQLA 3VESA 2FSJA 3QBXA 5AZIA 2W40A 4DB3A 2A5XA 3ID8A 1DEJA 3ZX3A 1QHAA 3SK3A 5AQPA 5BRHA 3DXKB 1KAXA 3UKUB 2WUSA 3QFUA 4CZEA 5EVZA 3H45C 1K8KB 4BRLA 1EQYA 3BF1A 3WQTA 1SQKA 1MDUB 4BRIA 1HKBA 2IVNA 3C7NB 3HTVA 3HI0A 3VEWA 1V4TA 4B9QA 5LJWA 2V52B 4Z94A 1DKGD 4NO7A 5FPDA 4RCHA 3ULEB 2DPNA 2HF4A 2OANA 2QXLA 3SLCA 4B1WB 1OKJA 2FLOA 4H0TB 4CD1A 1E4GT 4BR5A 2P9SB 2QM1A 3QBWA 2P9PA 1QQOA 5AFUH 4CZHA 3HM8A 1YUWA 2ZWHA 5I9EB 3VEXA 3EO3A 2FSKA 2BTFA 2F9TA 3ZEUB 3IFRA 4FOIA 3VEYA 4BRDA 3L6QA 5AQWA 1GLEG 5AQHA 1U2VA 4H0YB 2ASPA 3FZFA 3EZWA 5FPMA 5BPNA 4YDUC 4BR4A 5FPNA 3WXLA 4M7XA 1QZ6A 2FSNA 4MO4A 4CZLA 4CD3A 1YXQA 4FWNA 3VPZA 2A41A 1NGHA 5AQQA 3MCPA 3MMVA 4B1YB 5AR0A 3WXJA 2ASOA 2E2PA 3VGLA 4B1ZA 4JD2A 3EL2A 4ISEA 1S22A 2GTDA 5JMVA 4XEIA 2E1ZA 4GNIA 3ENOA 3LM2A 5KQDA 5AQIA 4CZMA 4I6MB 2CGJA 4PL7A 3W3DA 4BQZA 3KHYA 4CZGA 2V51B 1D4XA 5AQVA 1NGIA 1Z05A 3U8XA 2FXUA 4CBUA 4BRMA 2E2QA 4FO0A 3FR0A 4A61A 4WQ5C 4F9OA 5KPTA 2VYPA 1GLAG 4HWIA 3CQXA 3O1BA 4BR0A 3WEEA 1RDWX 4RTFD 4K43A 5AQKA 4EIAA 1XQSC 1JCGA 1CZAN 3VENA 4BRCA 1GLLO 2IVOA 1KAZA 4O5FA 3H6EA 4DQ8A 4BG8A 1WOQA 2V7ZA 4Y0WA 4CBWA 3LDNA 2A6AA 2D0OA 5TKYA 4BRAA 3AAPA 4BRHA 2QWOA 3CJ9A 4IZ9A 4EAHD 3ATVA 2P9KA 3DXMA 3D2FA 2GWJA 2H3GX 2Q1NA 1X9JA 2ASMA 4BRKA 2HF3A 2YJFA 5EOYA 5AQUA 5KPRA 3QB0A 4MLHA 2QW9A 4FWPA 4AM6A 2GEMA 3FFKB 4JNEA 1SZ2A 5E84A 2D0PA 3QFPA 2E20A 4BC4A 1KXPA 4BG9A 1G99A 3A8YA 5FPEA 4IJNA 2A42A 1DGKN 3GL1A 5BRFA 4PKGA 2D1KA 4FSVA 4WQ4C 3UKRA 4IXCA 1J6ZA 3CJBA 1BUPA 1U2VB 3R9PA 5F0XA 4HTLA 3AY9A 2E8AA 2IIRA 1TUYA 3DAWA 5BN8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NBPA 3O8MA 1BISA 3S3NA 5BPMA 4E7KA 5AZJA 1RBVA 4KB0A 3K5LA 4C8NA 1ASVA 2A1SA 4JK9A 5C25A 1P8ZA 4DMNA 1NJYA 3IS9A 4BRFA 1TK8A 1N32K 2Q31A 1X9SA 1HNWK 2HBMA 4DTSA 2P51A 2RN2A 1XC3A 5JS2A 4FK0A 4JKFA 3LDLA 1NGEA 3R1XA 2IGIA 2KHOA 3VN5A 3JS6A 3CM6A 4CEQA 3RVCA 4H5TA 2FF3B 3O3FA 3LAMA 4O55A 2HHTA 2O8BB 3H46O 2BUPA 4M63C 3UKUA 2P9UB 4IFEA 3K9KA 1K8AO 5JICA 2ZM6K 4DTJA 1J54A 4H0PA 4FZXC 4DV6K 4DQSA 2RE2A 3HM9A 3MN9A 5F1XA 1UA0A 1Y64A 2QEXN 4BGAA 1YJNN 4IOAL 3NMUA 4FLTA 1GLCG 1YHQN 2YHAA 4H03B 4OKKA 3T69A 3L3VA 5BPLA 3FZKA 2ZD1A 2G8KA 4B1UB 4H0XB 3L4QA 2UYTA 4CJ7A 1KLNA 4FJXA 4BR9A 5KGXA 3OBWA 3ASMA 3U9DA 4JAXA 4X64K 4B8CA 1HKGA 1NM1A 4GY2B 5BN9A 3SJHA 4NB4A 3VQ9A 4QOZB 4CEAA 3R6MA 4XH5A 1QQNA 2PFUA 4FW1A 4ELUA 4M45A 4FWRA 2P9PB 4H5RA 4KREA 3ZT4A 4QS7A 3L4IA 1RBTA 1BCMA 4JKGA 3MXMA 1I94K 4UQGA 4I7FA 3AO4A 3DLGA 4C8MA 4CGGA 1X3NA 3DMJA 2X78A 1JLFA 4IKFA 1TL3A 5GADP 4B3SK 4KRFA 5FDLA 3WXMB 1VAZA 4E1JA 4CGDA 1EO1A 5CE3A 4BROA 3VETA 1LCUA 4KB1A 5CR4A 3IUCA 1FK9A 1VSEA 3DRPA 5HL7L 3TAGA 3VEOA 3BY5A 3QEPA 4HUGA 4Y1DA 4JKCA 4N5SA 3O1WA 1TK5A 1IKWA 3SV4A 1SL2A 4I9LA 5EXWA 4GW6A 3A5MC 4H5VA 3JXUA 4CJ3A 3J80O 4CHZA 1JXBA 1RGIA 2J4RA 3NH0A 3O08A 2Y1IA 2OTJN 3O3HA 1VSIA 2DFHA 1ILYA 2O8CA 1SAZA 2VWKA 4BR7A 4NCBA 4BRPA 1RTJA 3K9JA 4BVPA 4CEEA 3MN6A 1RT3A 2A40A 3O80A 3NF9A 2RKIA 5KRSA 4GKKK 3HT3A 1TGOA 1JLGA 3SQ4A 1S1WA 4KHNA 3DXMB 1WAJA 1KLMA 3HVRA 4LSNA 2P9SA 4ILGB 1NKEA 4BQLA 4A2AA 1MWMA 3DOLA 3HP6A 3ZCMA 4B8AB 1D9DA 4DSEA 3TTDA 4CJKA 4EFHA 2NRHA 4Q0BA 4WQ4A 4B9VA 4JKGB 2F9WA 1VQMN 5AQMA 3ZX0A 3VQCA 4DFMA 4WCEL 3NH2A 1S72N 3AVGA 3J7AP 3PSIA 3PUFA 3QMLA 3QIPA 5AQOA 4K8XA 1QE1A 3EYZA 3THXA 1T6CA 4YOXA 3CG7A 4KKOA 5EY4A 3D7EO 3VEVA 1N5YA 4JI0K 4B1VA 1EXQA 1GLBG 5LJVA 1YVUA 3P39A 4E7LA 5CZ2A 3OW2M 4KHUA 3WUHA 5AQXA 5J2PA 3PO4A 5FRMA 4K42A 3R8EA 4OPKA 4B1XB 3WXKA 3KK1A 4JKHA 3CJ1A 4EP4A 2Q0UA 4IWVA 4ISGA 4JKBA 4W5NA 2PZSA 3MCAB 1EP4A 4XH1A 4JI4K 4EP5A 1IBMK 4CJSA 5AQLA 3VESA 1HNVA 4DB3A 3VQAA 1QHAA 4AHCA 2VWJA 3DXKB 1NKBA 4CERA 3O9RA 1N34K 4YOVA 3WNHA 3H45C 3CFPA 2X6SA 4BRLA 3WQTA 4GKJK 1SQKA 4F3TA 4BRIA 2IVNA 3C7NB 5LJWA 3SYZA 3ZYYX 4YOYA 3SQ2A 4KH4A 1VQPN 1DKGD 1REVA 3LP2A 3SLCA 4B1WB 1VSMA 1TVRA 3SUOA 2QA4N 2P9SB 2QM1A 3ZSWA 3OYKA 4B9UA 1QQOA 5AFUH 4MDAA 4JEPA 1JL2A 2ZWHA 3VEXA 3OS2A 4ELTA 3EO3A 1YTUA 4FJNA 2B6AA 2BTFA 2FBXA 4YOWA 3NDKA 3VEYA 1KCFA 4Z4EA 1N33K 3WNEA 4Z4FA 1RT1A 4H0YB 4J2DA 3MAQA 2ASPA 4J2AA 3CCLN 3EZWA 5BPNA 5DM6L 3KK3A 1W2BM 1RDAA 1QZ6A 2ZJPL 4QCLA 3TTFA 1WBBA 1CZBA 1N8RO 3SJJA 2EHGA 4GV9A 1YT3A 5AQQA 4DV0K 1S6QA 1C0MA 3CCUN 5KRTA 4LD0A 2QK9A 3LM2A 3RMDA 2G8UA 4Z4GA 5AQIA 4I6MB 4BQZA 1YIJN 3L2UA 1D4XA 2NNWA 3U8XA 4E7JA 3KD5E 3NGZA 2HHSA 4Z0UA 3CCVN 4A61A 3FFIA 4U7BA 4FJMA 5KPTA 4CEBA 1QSLA 2UUBK 3O1BA 4BR0A 4CHQA 1RCHA 4RTFD 2O8EB 5M1OA 4LF8K 2HNDA 1VQON 1XQSC 2HHXA 1RILA 4OX9K 5J2MA 3VENA 1CZAN 1VQ7N 2YNFA 3CCRN 1KAZA 3H6EA 4FZZA 1WOQA 5I3UA 4GMJB 2O8FA 4CBWA 2A6AA 2D0OA 4BRAA 1YI2N 2QWOA 2VGNA 5KGWA 3CD6N 4Z4CA 3CC4N 1LWCA 4FXDA 3MX5A 3O9UA 3CXCM 1IKYA 1C6VA 3PIPL 3NHGA 3SQ0A 4K8ZA 1SZ2A 2D0PA 4CHOA 1ITGA 4BC4A 4BG9A 1G99A 3A8YA 3LP1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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