3L4QA

Structural insights into phosphoinositide 3-kinase activation by the influenza a virus ns1 protein
Total Genus 31

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
SVPASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEWNDNTVRVSETLQRFA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS3 (115-120)S1 (87-91)AH1 (95-99)S2 (107-112)TVIII1 (104-107)TII'1 (112-115)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Viral protein/protein binding
source organism Influenza a virus
publication title Structural insights into phosphoinositide 3-kinase activation by the influenza A virus NS1 protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords Non-structural protein 1
total genus 31
structure length 120
sequence length 120
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.330 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l4qA00
3L4QA 3OA9A 3KWGA 4OPAA 3EE8A 2RHKA 3EE9A 3M5RA 3D6RA 3P39A 3O9SA 3O9RA 3O9UA 3P31A 3O9TA 3O9QA 3F5TA 2KKZA 4OPHA 2GX9A 3P38A 3RVCA 3KWIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1U2VA 4YOVA 5J2MA 2HBLA 2HHXA 3VN5A 3SK3A 4E1NA 2J4RA 3SBTA 1RT5A 2RHKA 2V7YA 3HYFA 4CEZA 4WQ4A 1HLUA 5JS1A 1YI2N 3HOSA 1ZBLA 3CF5L 1W7AA 3VQAA 1JL2A 4GY2B 4JK7A 1NMDA 5J1EA 1N34K 4KHUA 3K0SA 5AQKA 2QWMA 4CHZA 3UE5A 3HPHA 4CJWA 4JI3K 1SQKA 3CCUN 4JV5K 4B1WB 1T03A 1Y64A 3TPQA 2W42A 3ZT4A 4JRPA 3VQ6A 3O9SA 4CJ4A 4RW9A 4J8FA 4CF9A 5ELZA 1VRUA 3C7NB 1UOCA 2W6KA 4LC9B 1S1XA 5LY3A 4CZMA 2BDPA 4M3YA 1FKPA 1WN7A 2QM1A 3DOKA 4Z4FA 3KVGA 5GAHP 2IVOA 3RRGA 4IBNA 1KRPA 3OYFA 1ZXOA 4WQ5C 4I9QA 2KW4A 1UA0A 4O44A 3NMUA 2E1YA 3UKUA 3QERA 4UQGA 3AO5A 4ILJA 3NH2A 1BOTO 3QIPA 3ZSRA 1BCOA 2OPQA 1OH7A 1VQ9N 1LWCA 1Q18A 3BP8A 2O8DB 3LP1A 3OBWA 4BE1A 5LJVA 4OKEA 4CJEA 3AA3A 3T1AA 1QSYA 1I39A 2IC3A 2QEXN 3VQ4A 3QEVA 5E41A 3OS0A 4H4OA 1C6VA 3L2WA 3A5LC 4IJNA 3CJ7A 4F2RA 4I2PA 4K43A 5KGWA 4YHHK 4QOZB 5BPNA 4PQUA 2WUSA 1QSSA 1OVYA 4NXNK 3PLAA 4PY5A 3C65A 3AO4A 3VETA 1XHXA 4EHTA 1E4FT 3NVKA 1XQSC 2F9TA 3EZ5A 1TK5A 3MN6A 2BH1A 1L3UA 1GOAA 3L0QA 5GAGP 1NLVA 3B6OA 4DUYK 5AQJA 1OH5A 2QWNA 2XY6A 3DLKA 1DGKN 4B1VA 1EP4A 3VEYA 3SV3A 3T1YK 3QNOA 2F96A 3MWPA 4N47A 4EP5A 1VSFA 2PBDA 1JXBA 4PWDA 3HM8A 3NFAA 4PKHA 4LF7K 3WNEA 4CJPA 1ESVA 4ISGA 4WQ5A 4WE1A 3OYMA 4DQPA 5KRTA 2VYPA 1SV5A 4J2EA 3P1GA 2YHBA 3HT3A 4IEIA 3QFPA 2G8KA 3LWLA 1TYQA 2P9KB 3MECA 1J6ZA 3PX6A 1FJGK 5CY4A 4HCCA 3ITHA 5AQGA 5ADXA 4JS5A 2UXCK 3KK3A 3AAPA 2H3GX 4CJVA 1A5WA 1RT6A 4FPAA 3G25A 3O1WA 4CGJA 4FVUA 2V52B 1ILYA 2BGGA 1KC8O 4FWOA 4Z4CA 2HF4A 2D0OA 4KB0A 1I3AA 3IS9A 1U45A 4L3QA 4EIAA 3KHYA 5CR4A 1JLCA 2QA4N 3A5NC 4O8UA 2QXFA 4FWQA 3D2EA 5E84A 1V4SA 5C2FA 2CH5A 1GLDG 4ZTJA 3RWUA 4E7HA 3J80O 1JLAA 4Z4HA 1YJWN 2B4JA 1RTHA 2HB5A 4QCLA 1RTDA 1B92A 2E88A 4ICLA 2WFBA 2XY5A 4DWIA 4LSLA 4B9LA 1SL0A 5AZIB 4OPAA 3WXIA 5KTQA 3LM9A 3QIOA 3OYJA 1CZBA 1NNEA 5AQLA 4FOEA 4IKFA 5C25A 1RDUA 4K0KK 4ZHRA 1SKRA 4JAXA 1KQSM 3ASMA 4DHYA 3ENOA 1W97L 1RBSA 4FO0A 1IKWA 4FK4A 3CQXA 4E3SA 3H45C 3H1VX 3LANA 3QESA 5T7BA 2GX9A 4ISEA 3ULEB 5AQVA 2VCPA 3OW2M 3CIPA 2G8FA 3HM9A 4DSLA 3SUQA 4QAGA 4E1MA 1Q9XA 3WXLA 4F8RA 4CJRA 3HK2A 2O8FA 3O9UA 2YJFA 3U9ZA 1BI4B 1KVBA 3CCJN 5LL6Z 1IJJA 5F2RA 2W41A 1BA1A 3O4NA 1KVCA 2A1RA 1RT2A 2F4VK 5HRPA 2G8IA 4RW6A 4JD2A 1TAQA 3OVNA 1HNVA 4NYFA 1NG9A 2HNYA 4BRKA 3PV8A 1KTQA 3VTHA 1U48A 3DXKA 3VTIA 1JLGA 4CECA 4J2AA 3CC4N 5C24A 3WXKA 3R6MA 4KH4A 4OPHA 2WTUA 1HX1A 3LALA 4RW4A 1NK4A 2OZMA 2NRTA 5AFUA 3MX5A 4YY3K 3PO5A 1NGCA 1XHZA 2D0BA 5FDLA 3LDSA 1S1UA 4X62K 2WC9A 2RKIA 1OH8A 3DXMB 3MAQA 3OYLA 3D45A 3TSUA 4CGHA 3HTVA 4HWIA 3ZSYA 3P31A 1S5JA 4KREA 4KH6A 3ZSWA 4BDYA 4CBWA 1HQUA 3I0SA 4KHWA 4H8KA 4AM6A 3CCMN 3HOTA 1J9AA 4O5BA 4JHDB 3VF4A 3THWB 4KHNA 2A40A 3V9UA 3JSMA 5AQYA 4I6MA 1NGHA 2OZSA 4WCEL 2FSNA 4M7XA 4O5FA 4DTPA 2DFFA 3KLHA 4EZ9A 2JWKA 1RDBA 4FCYA 3GG4A 3TTFA 1GLLO 3BY5A 1EETA 2P9NA 3LPTA 3OY9A 1BHLA 3CC7N 2KFZA 3OYCA 1GOCA 1ZBUA 3WEEB 4WFAL 1Q82O 4K42A 2OPSA 4CW7B 4B3SK 3L3UA 3V1QA 4CZJA 4BRIA 3OYEA 4BC4A 2RPIA 3QEPA 1RT1A 4IEEA 4LY7A 1HMVA 1IKYA 1NKEA 2D1KA 1NK5A 1HR0K 1J5OA 1QSLA 1BU6O 3AVFA 3P39A 4JKAA 3DLGA 5M1QA 4DV3K 2R7YA 2HBJA 4IXCA 4M3TA 4WFBL 4DFKA 3VF6A 3QETA 5DMRA 1P8ZA 1WOQA 4CIFA 3U4LA 4M41A 3OTOK 1XI1A 3NE6A 4JI0K 5AZJB 5AQMA 5M1PA 3AAQA 3CFRA 5AR0A 4YOYA 3LDOA 4KB1A 1WSGA 3VEVA 4AH9A 3ZT3A 4AHRA 4CD1A 4HTUA 1KSPA 3HSCA 2FSJA 3CYMA 3IDHA 3DI6A 3K9JA 3SPZA 1OKJA 2P9LA 4BREA 3AGRA 4BE2A 2P9PA 4FLXA 2E2PA 4B9QA 4FJJA 1RBUA 1VSHA 3AVIA 5EXWA 1IBKK 3OYHA 1EWRA 4K8ZA 2NRXA 3C6TA 4M7YA 1QZ6A 3BF3A 5HBMA 4E19A 2P9IA 3C6AA 3RR8A 3QEXA 2XY8A 4PL8A 3THYB 3BZKA 2ZWHA 4BACA 3N4PA 1NJWA 3KK2A 3VA3A 1NJIO 1S72N 2ZQBA 3KKSA 1HYZA 1NGBA 4CJLA 1X3NA 1C0GA 4FL9A 3O9RA 3VQ5A 4WFNL 4OGCA 4FW1A 1NGFA 3QNNA 2WOMA 4NLBA 3P4IA 1BQMA 4DR5K 3BUZB 1YJNN 4BWMA 3SMSA 4DR4K 1QQOA 1JLBA 4XH1A 1YTUA 4BQZA 1QQMA 1G15A 4NO7A 4BVPA 1HJRA 3VGMA 3OJUA 3OYIA 4IZ9A 3LZIA 5JVHL 4B9SA 1LV5A 1ASWA 3R9PA 2D4WA 4MLEA 3VA0A 2VQEK 3SQ1A 3S3MA 4JKGA 1N8RO 1QHTA 1RDDA 4JKBA 1N36K 2YNFA 4BR2A 3WXJA 2HHTA 5J2PA 2HNDA 3M5RA 4CFCA 1RDWX 4MDBA 1F21A 3ID8A 3S3OA 5H1SQ 3EZWA 4CERA 1TKZA 1Z26A 4KI4A 4IG0A 3NH1A 4KAZA 4L8RB 4RW7A 3O80A 3LPUA 4FJIA 3S3NA 4BGBA 2AA4A 1XMOK 3O1BA 1IH7A 1ITGA 4KI6A 3BF1A 1XC3A 5GAEP 4K41A 1N6QA 4FJLA 2FBXA 2O8EA 2HNZA 3QBWA 4GVMA 2ITGA 4CEOA 3A8YA 3OYNA 1RTJA 2P9UA 2IAJA 4IJAA 4GNIA 1NMNA 3AVGA 3ZETB 4H0YB 1Y97A 4A62A 2NNWA 3DMJA 2ZM6K 4FYDA 2E4LA 2YNIA 4OKJA 4W5NA 4ID1A 4ELUA 3TAPA 5KPZA 4DR7K 1GLEG 1XUPO 4CBUA 3PX0A 3U8XA 3FZMA 4OGEA 2Q2RA 4FWKA 1VSEA 4OVLA 4Z94A 2P5GA 1HRHA 4CE9A 3CM6A 4ID5A 3VEXA 4FJXA 4WYBA 2XY7A 1HYVA 5AQZA 4AHCA 3HP9A 3SPYA 3HVRA 3NBPA 1VQON 1NM1A 5JLHA 4CZGA 3SAFA 1E4GT 4FJKA 4CZKA 2XHBA 4H5RA 2GTDA 4KTQA 4H0TB 3LP2A 5JS2A 3O3HA 3SJHA 5FROA 1BGXT 1WLJA 2UUBK 1CZ9A 3IKMA 4CJUA 3WQUA 4BRGA 1Q9YA 3RSEA 2KZMA 3DLEA 1N33K 5BRHA 1VSKA 1VQLN 3WNHA 1SL2A 1YUWA 3P83D 2DPNA 2KZZA 3SQ4A 4B8CA 3I55N 2BE2A 5C42A 2YI1A 5TKYA 4E0DA 3O3FA 1X9JA 4B8AB 1MDUB 1R59O 5K14A 2LSNA 2E20A 3PY8A 2F8SA 4FWSA 1KXPA 1HKCA 5KPRA 1TKTA 3OS2A 3TAEA 3LDQA 2QK9A 2A5XA 3LL3A 4JD2B 2NUBA 3O8MA 2G8UA 5HLFA 3O4WA 2QWQA 1RT7A 3L2UA 2DFEA 1YTAA 1VSJA 4IDKA 4C1NI 1DEJA 3C6HA 1VQ4N 1DT9A 2ZJQL 5AQSA 3WNFA 4G9ZA 1QVGM 1HUXA 4GV6A 4CF2A 3VMFB 3SUNA 2HSTA 4RCHA 4MDAA 4Z4GA 1D8YA 3HZ6A 4XEIA 2YNGA 4GMJB 2OYQA 4FLTA 1NK9A 3SV4A 3T7ZA 5FPEA 2UYTA 4M3WA 3E9OA 4W5QA 4C8NA 4KTWA 5KQDA 3ZEUB 3VGKA 1C0FA 2IS3A 3EO3A 3T1HK 2EX3A 3K5LA 4B9UA 4R79A 1MA9B 2ZJPL 3K59A 1T6CA 1BWFO 4CK1A 4M3ZA 1VQNN 4A61A 4B1XB 3K57A 1YAGA 2VWBA 3VQEA 1UWBA 3AO1A 1LWFA 3F9MA 4BGAA 3SBGA 3V81A 3AVKA 2V51B 4DSFA 3THXB 3AO3A 2KQ2A 5BN9A 3VOVA 4AHTA 4XIUA 5FRMA 3CI5A 4CEFA 3LDNA 4B3OA 3SNNA 5DM6L 3EKSA 1OH6A 3MCPA 1TKDA 2NRVA 3J7YP 5JMVA 1O1WA 1RTIA 4DQRA 4N5SA 4O0IA 4CIGA 4F3TA 1S1TA 2FLOA 3CG7A 3ULDA 4MLHA 1CXQA 1S3XA 3M1FA 1HNWK 3AY9A 1L3TA 1WSJA 1K8AO 2P9SA 3IRXA 4CF1A 1U49A 3CQ8A 3HVTA 3ALYA 4QS7A 2QI2A 2HOEA 3VF2A 1TL1A 4BY9C 4C8LA 2O8BB 1NJZA 1C0UA 3DJCA 1NGEA 3MMVA 4CGFA 3UKRB 5DM7L 3RMBA 3CCVN 2IIRA 5C2DA 4FJ7A 1DTTA 1BIZA 5HRRA 1VQPN 4C8OA 1K8KB 3C0BA 3FZKA 4CHPA 2O8CA 2QWOA 5JLFA 3R1XA 3KLFA 2HHHK 2QKKA 4H0XB 4X64K 2CGKA 1JKHA 2NRZA 4DV6K 2P1JA 4M45A 1REVA 3D2FB 1FXXA 3DLBA 5TKWA 3WNGA 2BANA 2E2NA 2P51A 2GWKA 3MN9A 4K25A 3EY1A 1GLJO 4FM1A 3HL8A 4DFMA 1L5UA 4OX9K 1EQYA 3W3DA 4H0PA 1T8EA 1TK0A 4E7KA 1D5AA 4CGIA 2QWLA 3ZX2A 5DK5A 4JYAK 4CHYA 5BR8K 3E9PA 5BR9A 1LCUA 3QLHA 1YVUA 2P9LB 4CJ3A 3KK7A 5GADP 3CCQN 1NGGA 3H1QA 1YT3A 3VQQA 1IKVA 4H5VA 4BG9A 3MXMA 4DF8A 3E66A 3S41A 1X9MA 4BRFA 3Q7BA 5A2QO 4Q5VA 3NGZA 4B9VA 2HF3A 3RRHA 1ZC6A 2KFNA 3VQ7A 2OPPA 3W0LA 1IBLK 1IKXA 1LAVA 1QE1A 4A2BA 5LMNK 4FJMA 4FLWA 4C8MA 3VEZA 4IFYA 4FJHA 2ITMA 2QWRA 1DTQA 5CYMA 1WBDA 3HSTB 2YHWA 1KVAA 1YVNA 3N4QA 5AQHA 1C1AA 1Z6RA 2A6AA 3ENBA 3CPWM 4C8KA 3O6WA 1U04A 5HRNA 1RT3A 4C23A 3K2PA 4ELTA 4BRCA 4ELVA 2WBNA 4YDUC 1M1KO 1NWKA 1GOBA 4DLGA 4BR4A 3V9WA 1Q86O 4U67L 1RCHA 4V19S 2JLEA 3JXUA 5SWMA 4OPJA 1WSIA 4A5BA 3L4QA 1KFDA 4BC2A 4DQSA 3CERA 2FBTA 5JVGL 3CJ9A 4YOTA 2AP1A 2Z1GA 3IG1A 4CEDA 3OS1A 4KKOA 4MQ3A 1IBMK 1NK0A 3G0ZA 4YFUA 2O8DA 4B3TK 1TVRA 3PSFA 5BN8A 3HRGA 1BG3A 3V9ZA 4CJ5A 3M8PA 4YORA 1V4TA 4ZTFA 4CF8A 3KD5E 5HRSA 3RVCA 1XNRK 2DFHA 5KPTA 4DSEA 4CZIA 1UAXA 3KLEA 3THVA 1JCFA 3RMAA 3LZJA 5FPDA 3DLRA 4DR1K 5AQXA 1YJ9N 4KHYA 4AM7A 2OTLN 3TAGA 1Q81O 4LD0A 1Z05A 4LH5A 2FF3B 4F4KA 1E3MA 2HBMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3L4Q A;  3OA9 A;  3KWG A;  4OPA A;  3EE8 A;  2RHK A;  3EE9 A;  3M5R A;  3D6R A;  3P39 A;  3O9S A;  3O9R A;  3O9U A;  3P31 A;  3O9T A;  3O9Q A;  3F5T A;  2KKZ A;  4OPH A;  2GX9 A;  3P38 A;  3RVC A;  3KWI A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1U2V A;  4YOV A;  5J2M A;  2HBL A;  2HHX A;  3VN5 A;  3SK3 A;  4E1N A;  2J4R A;  3SBT A;  1RT5 A;  2RHK A;  2V7Y A;  3HYF A;  4CEZ A;  4WQ4 A;  1HLU A;  5JS1 A;  1YI2 N;  3HOS A;  1ZBL A;  3CF5 L;  1W7A A;  3VQA A;  1JL2 A;  4GY2 B;  4JK7 A;  1NMD A;  5J1E A;  1N34 K;  4KHU A;  3K0S A;  5AQK A;  2QWM A;  4CHZ A;  3UE5 A;  3HPH A;  4CJW A;  4JI3 K;  1SQK A;  3CCU N;  4JV5 K;  4B1W B;  1T03 A;  1Y64 A;  3TPQ A;  2W42 A;  3ZT4 A;  4JRP A;  3VQ6 A;  3O9S A;  4CJ4 A;  4RW9 A;  4J8F A;  4CF9 A;  5ELZ A;  1VRU A;  3C7N B;  1UOC A;  2W6K A;  4LC9 B;  1S1X A;  5LY3 A;  4CZM A;  2BDP A;  4M3Y A;  1FKP A;  1WN7 A;  2QM1 A;  3DOK A;  4Z4F A;  3KVG A;  5GAH P;  2IVO A;  3RRG A;  4IBN A;  1KRP A;  3OYF A;  1ZXO A;  4WQ5 C;  4I9Q A;  2KW4 A;  1UA0 A;  4O44 A;  3NMU A;  2E1Y A;  3UKU A;  3QER A;  4UQG A;  3AO5 A;  4ILJ A;  3NH2 A;  1BOT O;  3QIP A;  3ZSR A;  1BCO A;  2OPQ A;  1OH7 A;  1VQ9 N;  1LWC A;  1Q18 A;  3BP8 A;  2O8D B;  3LP1 A;  3OBW A;  4BE1 A;  5LJV A;  4OKE A;  4CJE A;  3AA3 A;  3T1A A;  1QSY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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