3LM2A

Crystal structure of putative kinase. (17743352) from agrobacterium tumefaciens str. c58 (dupont) at 1.70 a resolution
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
225
structure length
225
Chain Sequence
MAEDQTVLAIDIGGSHVKIGLSTDGEERKVESGKTMTGPEMVAAVTAMAKDMTYDVIAMGYPGPVVHNKPLREPVNLGEGWVGYDYEGAFGRPVRIVNDALMQAIGSYNGGRMLFLGLGTGLGAAMIVENVAQPMEIAHLPYRKGKTYEHYVSEAYREKKGNAKWQKRVQDVVERLSAALEPDEVVIGGGNVERLENLPPKCRRGDNAMAFEGGFRLWKNADLIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Putative kinase. (17743352) from AGROBACTERIUM TUMEFACIENS str. C58 (Dupont) at 1.70 A resolution
rcsb
molecule keywords Putative kinase
molecule tags Transferase
source organism Agrobacterium tumefaciens
total genus 58
structure length 225
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3lm2A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3lm2A01
5FPEA 3VESA 2D0OA 1TUYA 2FXUA 5AQFA 4J8FA 1BOTO 1QZ5A 3L4IA 4WYBA 4BR2A 5AR0A 3SMSA 4CZKA 3ID8A 4O5FA 4BG8A 1KXPA 2GTDA 1QZ6A 1BA1A 1T44A 4K43A 5B8HA 3CQYA 3LDPA 4FL9A 1R59O 4CZEA 4YDUC 3U9ZA 1KAYA 1NGHA 2ASOA 4BRQA 3M1FA 3VEXA 4FPAA 2VYPA 3WXLA 4DCHA 1GLFO 3QICA 3MN9A 2Q31A 2E88A 2QWRA 3BUZB 3GOIA 1NGBA 5BRFA 1G99A 5AQTA 3IMXA 2Q0UA 2P9UA 3C0BA 3D2FA 1NM1A 1S22A 2QXLA 3O1BA 1BO5O 3I33A 4EHTA 4FWOA 4A61A 3UB5A 3U4LA 3DXKA 5BPNA 3HSCA 3D2EB 3VPZA 5AFUA 1GLBG 4BRHA 1TYQA 3A8YA 3HBTA 1MDUB 5BRHA 1BDGA 4B1VA 4BR9A 1H1VA 4H0PA 4B1ZA 3LL3A 4FWPA 5F2RA 3C7NA 3H1VX 3VF4A 4FWRA 1XC3A 3R6MA 4AM7A 5F1XA 1D4XA 1HX1A 4XH1A 5AZIB 4WQ5A 2D1KA 5FPNA 2A40A 2QM1A 3CJ7A 3SMPA 2IVPA 2GEMA 3EKSA 3VF6A 3QFPA 4B1UB 3RSEB 1NGCA 2F9TA 1HKGA 4CZFA 2A6AA 2ITMA 1BA0A 2ZF5O 4EHUA 2Q97A 3UE5A 1QQOA 1MWMA 3M3ZA 4H5VA 2FLOA 3ZETA 5AZJA 4DQ8A 2D4WA 4BRCA 3B8AX 2QWOA 4B1XB 1Z05A 4FWLA 4HTLA 3CQXA 2J4RA 1GLJO 2E20A 3L6QA 4RWTA 4BGBA 3BF3A 2ZWHA 4B1YB 4A2AA 4JHDB 3ZEUB 1KAZA 4EFHA 5AQRA 1QHAA 4MO5A 4RTFD 4FWQA 1SZ2A 3GDQA 3O08A 3CJ1A 4MO4A 3CJAA 3J8AA 4HWIA 2FF3B 2HOEA 3QB0A 5I9EB 2QWNA 3DAWA 3FZHA 3KHYA 3AAPA 3CHWA 5TKYA 3WEEA 4IO8A 2E2NA 3BF1A 3VENA 4JNEA 4KBOA 4B9QA 1HJOA 2Q36A 5BN8A 5AQIA 2BTFA 4NO7A 1RDWX 4DB3A 1IG8A 3MN6A 4GNIA 5EOYA 3EN9A 5BREA 2YHYA 2I7PA 4FWMA 4JN4A 4B1WB 3AAQA 4BQZA 4BC4A 1OKJA 2E2PA 3TU5A 4BRDA 3EKUA 2P9KA 3WXIA 4H0XB 3ATUA 2FF6A 3H6EA 2A41A 4FSVA 5BPMA 1NMDA 3EL2A 3MN7A 4CD1A 2CH5A 1C0FA 2P9LA 3UKRA 2OANA 2FSNA 1ATSA 3O6WA 4H5TA 4JD2B 3JS6A 2WUSA 2DPNA 4H0YB 3QFUA 1RFQA 2YCHA 2E8AA 3VGKA 2YHXA 4EAHD 4A62A 2P9PB 4GY2B 1GLAG 2A3ZA 3JXUA 4A2BA 4CBXA 2ZGYA 3M6GA 3UKUB 2ZGZA 3SLCA 4BR0A 4FWNA 4QS8A 3BP8A 5BN9A 3AARA 3MK6A 1K8KA 2V7ZA 3R8EA 4JAXA 4PKGA 1WOQA 5FPMA 5EXWA 4BRLA 4M7XA 3QDKA 4MLHA 1NGJA 1EQYA 1P8ZA 4FPBA 4PKHA 2V52B 3ZX0A 3H3OB 3VF2A 5LY3A 3CJCA 3VETA 4BC3A 1HKBA 4FWKA 2QWLA 2YJEA 3HTVA 4ISFA 5AQYA 4I6MB 3D2EA 3ZX3A 2UYTA 4O8KA 1C0GA 1J6ZA 2ASPA 3ENHA 3W0LA 3WXJA 1ZXOA 4FOEA 2E1ZA 4H0TB 4CBWA 4CZHA 3O4WA 4CBUA 2W40A 2AA4A 2P9NB 1YAGA 3CETA 1NLVA 4IJAA 3WXKA 4BRPA 5AQMA 5AZIA 1LOTB 3CIPA 3S41A 1NGGA 5E26A 3U9DA 4BRIA 5AQQA 4DHYA 5KPZA 5AQVA 5AQGA 3RSEA 3FZKA 3MN5A 3D7EO 3CI5A 4EIAA 4YDUA 1YVNA 4BR7A 1Z6RA 3ULEB 3FZMA 2EWSA 2E2OA 5KQ8A 4BRNA 5AQOA 4Y0WA 4BRFA 5EVZA 2CGJA 1SQKA 5KPTA 5BRDA 3VERA 2P9IB 4QS7A 5ADXH 5KPRA 1TUUA 1JCFA 3MDQA 3WQTA 5KQDA 3EO3A 5EX5A 2ASMA 3ZETB 2A5XA 4MLEA 3DXMB 4H5NA 4M63C 2A42A 3I8BA 4H0OA 3W3DA 3CJ9A 2NZTA 4JHDA 5AQHA 1U2VB 3A5OC 3ZEUA 4BROA 4BR4A 4BRGA 5BR9A 2Q0RA 3WUHA 5AQJA 4FO0A 3LDNA 1NGFA 3R9PA 5BPLA 3H45C 3VEVA 2Q2RA 5LJWA 4CZIA 3G25A 4CZJA 4H5WA 5AQNA 3O8MA 1V4SA 3VGMA 1X3NA 4K42A 4BRMA 2W41A 3GL1A 5CE3A 2GWKA 1BUPA 3H3NO 3MMVA 3VEZA 3IUCA 3VEWA 1XQSC 5AQSA 4WQ4C 5ELZA 1JCEA 1HUXA 1RGIA 1S3XA 3WQUA 1YXQA 2PBDA 1T6DA 4PKIA 1NBWA 1NGIA 3DJCA 4ISEA 4M7YA 3FR0A 1BU6O 5FPDA 5JLHA 1DKGD 5LJVA 3HI0A 2P9KB 3OHRA 3FGUA 5JMVA 2HMPA 2QWMA 1E4FT 5AQLA 3LM9A 4JD2A 5E84A 2P9LB 3UKRB 4LC9B 3H1QA 3U8XA 1K8KB 2P9SB 5JICA 2IVOA 2D0PA 1HPMA 4CI6A 2P9PA 5AQWA 5AQKA 3ATVA 2BUPA 3KVGA 2AP1A 4WQ5C 3VOVA 3GG4A 1V4TA 2PAVA 3HZ6A 2GELA 2KHOA 3UKUA 3L0QA 3A5NC 4XH5A 5F0XA 2YJFA 2NLXA 4IWVA 1NGAA 1GLEG 2VCPA 2E1YA 1X9JA 2CH6A 1IJJA 3IFRA 3A0IX 2IIRA 1ZBSA 1BG3A 1BWFO 4BR5A 2CGKA 2F9WA 3IDHA 3O80A 4CJ7A 3ZX2A 1KAXA 3DWLA 1U6ZA 2P9UB 4BRAA 3A5LC 3D2FB 4E1JA 2QWQA 1QQMA 4WQ4A 1Q18A 3GE1A 3DXKB 3LM2A 2Q1NA 4I6MA 1SAZA 4IXCA 3VEYA 1TYQB 2I7NA 4BC5A 2FSJA 1DGKN 3WT0A 4L3QA 1YUWA 1WUAA 2H3GX 4AM6A 3LDOA 3QBWA 4NB4A 4Z94A 1LCUA 4IZ9A 1HLUA 4CZMA 3QMLA 5AFUH 2HF4A 2P9NA 2GUPA 4BVOA 3C7NB 5JLFA 5AQPA 3H46O 1ESVA 3EZWA 4FWSA 3TPQA 2V7YA 3SJHA 4CD3A 4K41A 2HF3A 4BC2A 2QW9A 5ADXA 5AQUA 4H0VB 1E4GT 3ULEA 3F9MA 1DEJA 2FSKA 4BG9A 1Y64A 5AZJB 2P9IA 4H5RA 1MWKA 3CJBA 2QWPA 3O1WA 2E2QA 3AY9A 3GBTA 2CGLA 1GLLO 2V51B 3LDLA 4RCHA 3BEXA 4PL8A 3DXMA 4BGAA 3VEOA 1HKCA 3FZFA 5EY4A 1U2VA 4BQLA 4F9OA 2VWBA 3LDQA 4CZGA 1GLCG 4FOIA 1JCGA 2NRHA 4CZLA 3MCPA 2YI1A 1MA9B 3A5MC 4PL7A 1T6CA 3CERA 4IJNA 2IVNA 3WEEB 3FZLA 3SK3A 3HM8A 4XEIA 4BRKA 2GWJA 1NGEA 1NWKA 3FLCO 4BVPA 3ENOA 3VGLA 4BREA 1X3MA 1ATNA 4ISGA 4K25A 4C23A 4H03B 1NGDA 4XH4A 3P4IA 1ZC6A 3KZBA 1CZAN 5AQZA 3FE1A 4QS9A 1GLDG 1ATRA 3QBXA 3O5BA 3FFKB 2YHWA 5AQXA 1XUPO 1QQNA 2P9SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CG7A 3NF6A 5DK5A 3QESA 3L2QA 1NNEA 4Y1CA 2ATQA 3DRRA 4CZKA 3JAMO 3E9PA 1NG9A 2GTDA 3THWA 3SPYA 3E9LA 5C15A 3CQYA 3Q7CA 3LDPA 1R59O 1KAYA 1NGHA 1QQCA 3RMBA 3M1FA 3VEXA 2ZE2A 3C94A 4JK8A 3ZSRA 1QE1A 5DMRA 1OH7A 3NVKA 3VQBA 2FBVA 1S1VA 3AA3A 5I42A 2Q31A 2E88A 4B9NA 5AQTA 5KTQA 4FJ9A 5HROA 4FCYA 3I33A 1NOYA 4LF9K 4EHTA 3TI0A 4FWOA 3SUQA 2HSTA 3U4LA 5T7BA 5BPNA 3D2EB 3VQQA 1GLBG 4DF4A 2OZMA 3VQPA 1I94K 3RRHA 4BR9A 1TKZA 1VQNN 4H4MA 3T1HK 3ZSWA 3C7NA 3VF4A 4FWRA 4RW7A 4FJNA 1XC3A 4FXDA 3R6MA 3AVFA 4WQ5A 2D1KA 3J7ZO 2QM1A 5M1FA 3SMPA 3HRGA 4O44A 1K8AO 4FLVA 3RSEB 4DR2K 2ITMA 3NF9A 4CHZA 3G6EN 3OJSA 2VWKA 4CEAA 3ZETA 5EU7A 1TVRA 4BRCA 3B8AX 2QWOA 4HTLA 3M8PA 2J4RA 3DLBA 4RWTA 3DLEA 4B1YB 3IRXA 5CYQA 4KHNA 3QO9A 3VQEA 3ZEUB 3VA0A 2YX6A 3NBPA 3KD5E 1S6QA 4CEZA 3V9XA 1Q7YO 4W5OA 3CFPA 1NJIO 4DV1K 4MO5A 3UIQA 3DRPA 5MLCQ 3CJ1A 3KKSA 3U3YA 4CEDA 3LWLA 3AAPA 4JEPA 4H4OA 3CHWA 1KFSA 4B9VA 2E2NA 1U4BA 3ZSOA 1NK6A 4JNEA 4KFBA 1J9AA 2OPRA 1N34K 1HR0K 4Z4CA 3MN6A 1KVAA 5EOYA 3S3NA 2G8VA 3LAKA 4BQZA 4BC4A 2E2PA 1SKWA 1YVUA 3EKUA 4IFEA 4I9QA 1SL2A 2Z1GA 3G71N 5BPMA 4JKCA 4DTUA 4CD1A 3SV3A 1C0FA 1NK7A 2OANA 1ATSA 3O6WA 1FKOA 4JD2B 4H0YB 3K0SA 1L3UA 3CCSN 1RFQA 3AVBA 3C6TA 5C2DA 2E8AA 3P5JA 4EAHD 2X74A 4LFAK 3JXUA 4N41A 4IDKA 1TK5A 3QIPA 4BR0A 5BN9A 3HPGA 4Z4HA 4OKKA 3AVJA 3R8EA 5DM6L 3OY9A 1T03A 2OPPA 4O4GA 4KB0A 4BRLA 5CHIA 4FLXA 3EE9A 2F8TA 4K8XA 1P8ZA 1JLGA 1S5JA 3CQ8A 3BDPA 5H1SQ 4OLBA 3VF2A 1YTAA 4FK4A 1WAJA 2XRIA 3T1AA 1WSFA 4E19A 3EYZA 2FBTA 4ELUA 4KO0A 2QA4N 1WBBA 1EXQA 1WSEA 3J80O 2HHHK 5AQYA 5SZTA 1FJGK 3ZX3A 2GV9A 1IBLK 4MQ3A 2ASPA 1QSSA 3W0LA 4K8ZA 1ITGA 2O8FA 4GVMA 4FOEA 4CZHA 4CBUA 2W40A 2AA4A 3CETA 4OPJA 4IJAA 4I2PA 1M1KO 1R0AA 2YNGA 3U9DA 4BRIA 2F4VK 4DHYA 5KPZA 1RDUA 3ITHA 1D5AA 3V9ZA 2IC3A 3MN5A 3VQDA 3F73A 1YVNA 5FRMA 1HNVA 4BRNA 5AQOA 4OPAA 4ILHA 1C0UA 2FBXA 5KPTA 5BRDA 1JLAA 1Q8IA 3KLHA 4B3RK 3MX2A 3NF7A 1XMQK 4CF9A 4DR6K 3EY1A 3RRGA 2JWLA 2E4LA 3CJ9A 5M1OA 3LZIA 1IKVA 1O13A 4BROA 1U2VB 1NGFA 1JL2A 1BQNA 3VQAA 1IG9A 4LF5K 2HHUA 3TTFA 5GAEP 4IEIA 3DLHA 4B3SK 3GL1A 1TAUA 3MMVA 2OPQA 3VEZA 3VEWA 3VQ6A 3M8SA 4WQ4C 1RGIA 1L3SA 2DFEA 4YOXA 3WQUA 1YXQA 3OW2M 2JWKA 4PA1A 1T6DA 1TGOA 1N8RO 3DJCA 4M7YA 3KLEA 2OPSA 4E7IA 4RG8A 3RMDA 3L8BA 3P1GA 4CIGA 4FJIA 5J2QA 1RILA 1E4FT 5AQLA 5J2MA 3LM9A 4JI3K 5E84A 2P9LB 1K8KB 3A2FA 3AA5X 1NU0A 3ZCMA 5JICA 3HOTA 2NRVA 4IOXA 2P9PA 3CXCM 4FLTA 4DSFA 3QEIA 3KVGA 2AP1A 1EETA 3HZ6A 4W5NA 3THWB 4B3OA 4C8MA 3G4SN 4EP5A 2ZM6K 3OYGA 4LFBK 5GINA 1NGAA 4YHHK 4JS4A 2E1YA 1VQ7N 4HCBA 4WCEL 2IIRA 4KHYA 4L8RB 3QEPA 2HMIA 1C6VA 2EHGA 4FJMA 1YJNN 1J54A 3K9KA 1CXUA 4M3YA 1I3AA 1EWRA 4DLGA 4M3XA 4J2BA 3A5LC 3AGKA 1WNSA 5KGXA 5JVGL 4CGDA 3THYA 2XY7A 2I7NA 4L3QA 1LWEA 4X65K 3ULDA 4NB4A 4YOTA 4CZMA 1RDBA 2P9NA 3C7NB 3LPTA 3CFRA 4GV3A 4AF1A 4FJKA 4W5TA 3TPQA 1I39A 4WFBL 5I3UA 5C25A 4JV5K 5GIOA 5ADXA 3ZSVA 3CPEA 4KREA 1E4GT 4R5PA 1A5VA 2BE2A 3VQ9A 1LAVA 1Y64A 3SI6A 5J2PA 3CJBA 1VQMN 2E2QA 1QHTA 4FW2A 1GLLO 1W7AA 3L2VA 1U04A 5GAGP 1MU2A 3O3GA 4YFUA 3DXMA 2G8IA 5EY4A 4ILGB 3L3VA 3N4PA 4LSLA 2XO7A 3KK3A 1VQ9N 4KTZA 4KHUA 4FOIA 4CEFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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