3LM2A

Crystal structure of putative kinase. (17743352) from agrobacterium tumefaciens str. c58 (dupont) at 1.70 a resolution
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
225
structure length
225
Chain Sequence
MAEDQTVLAIDIGGSHVKIGLSTDGEERKVESGKTMTGPEMVAAVTAMAKDMTYDVIAMGYPGPVVHNKPLREPVNLGEGWVGYDYEGAFGRPVRIVNDALMQAIGSYNGGRMLFLGLGTGLGAAMIVENVAQPMEIAHLPYRKGKTYEHYVSEAYREKKGNAKWQKRVQDVVERLSAALEPDEVVIGGGNVERLENLPPKCRRGDNAMAFEGGFRLWKNADLIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Putative kinase. (17743352) from AGROBACTERIUM TUMEFACIENS str. C58 (Dupont) at 1.70 A resolution
rcsb
molecule keywords Putative kinase
molecule tags Transferase
source organism Agrobacterium tumefaciens
total genus 58
structure length 225
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3lm2A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3lm2A01
3HM8A 4EIAA 1NWKA 3ZX2A 1KAYA 4BRPA 4MO5A 5AR0A 1QHAA 1MA9B 3A5OC 4I6MB 4WQ5A 1ATRA 4BVOA 4EFHA 5BPLA 4BG8A 1DKGD 2P9UA 1NLVA 2E1ZA 4CZFA 4JHDB 4XH4A 3AARA 1IJJA 3O6WA 4FWPA 3VESA 4ISFA 3GG4A 4FSVA 2P9NA 2QXLA 3DXKA 3LM9A 3ZEUA 1YXQA 1BUPA 4BC3A 2P9PB 2J4RA 2NZTA 2BTFA 5AZIB 4CZLA 4IJAA 4CZMA 3H1VX 1KAXA 1RDWX 4BGAA 2W40A 4K42A 2FF6A 2GUPA 3O8MA 3UKRA 2A5XA 3WXJA 4H5NA 4IO8A 3H3NO 4Y0WA 3MN9A 2CH6A 4PKHA 3VGLA 5FPNA 5F1XA 4B1YB 1U2VB 5AQMA 3D2FA 1YAGA 4H03B 2Q36A 4C23A 4H5WA 3VEXA 3DJCA 2E2PA 3LDPA 1GLAG 4BQLA 3DWLA 4GY2B 4ISGA 4PKGA 3L0QA 2Q1NA 1S3XA 2V52B 3DAWA 1TUUA 2CGLA 5KPTA 3ATVA 3W0LA 4IZ9A 1GLCG 2QM1A 4H0YB 1MWMA 2V7YA 1QZ5A 3WQUA 1BU6O 3VEOA 4B1ZA 1HKCA 4IWVA 2A40A 4HWIA 4B9QA 4DB3A 1YUWA 2EWSA 3C0BA 3DXMA 5AQIA 5BR9A 1DGKN 3CJ7A 1S22A 2P9UB 2IVPA 4BRLA 2ZGZA 3ATUA 3LM2A 4FOEA 5BRFA 5AQWA 2PAVA 3U9ZA 1XC3A 2P9NB 3GL1A 3DXKB 3L4IA 2YHWA 2IVOA 3QBXA 3ZEUB 4BVPA 3KVGA 3QMLA 2QWNA 5ELZA 1TYQA 1HKGA 3MDQA 1Y64A 3CQYA 1LOTB 4F9OA 2E20A 3O80A 4BR4A 5LY3A 1NGHA 1NMDA 4BREA 4MO4A 3FGUA 4PL8A 3IFRA 3I33A 3D2EA 3H45C 3HZ6A 3UKRB 5AQXA 5BRDA 1HX1A 1ZBSA 4KBOA 2Q2RA 2FLOA 1GLEG 3C7NA 1ATSA 4H0TB 3FZLA 3ZX3A 4MLEA 3D2FB 3JXUA 4GNIA 3ULEA 3BUZB 4H0OA 3CHWA 2YJFA 5AQOA 3KZBA 5I9EB 2ASMA 4BRFA 2Q0RA 3U8XA 4PL7A 3FZHA 3SK3A 4BRHA 3CQXA 1EQYA 1XUPO 1GLDG 4M63C 5KPRA 3RSEA 1V4TA 5EVZA 2IIRA 1SAZA 2ZWHA 4AM6A 3QBWA 5ADXA 5E26A 3A5NC 3ENHA 4FWOA 4BR7A 2ASPA 2QWQA 4FWMA 5FPEA 2VYPA 5EOYA 4WYBA 5AQVA 3BF3A 2QWMA 5LJWA 2A41A 3VEZA 3UKUA 2ITMA 3DXMB 2H3GX 5EY4A 5AZJA 5AQUA 1X9JA 1P8ZA 4XEIA 3MN6A 1T6DA 1D4XA 3P4IA 3G25A 4ISEA 3F9MA 3QB0A 3VENA 2P9IA 2GTDA 3AY9A 4QS9A 1HPMA 4BRAA 4FPBA 2CGKA 1TYQB 4FPAA 3VPZA 5BN8A 4BRMA 2E1YA 1NGGA 3AAQA 2HF3A 2D1KA 1SZ2A 2W41A 3QDKA 1NGJA 1BA1A 1NGDA 1XQSC 5LJVA 3FR0A 1NBWA 3D2EB 1V4SA 2HOEA 4O5FA 5BREA 3FE1A 4O8KA 4CBXA 3WT0A 3C7NB 1T6CA 4H5TA 4H0XB 1SQKA 3ULEB 3M3ZA 3GDQA 4CJ7A 3HSCA 3CI5A 1BG3A 4FOIA 3CJ9A 4WQ5C 5AQLA 4CZIA 1GLLO 3A0IX 2CH5A 5AQGA 4CZJA 1HKBA 3RSEB 4H0PA 3U9DA 1NGCA 4YDUC 1HLUA 2VCPA 2GEMA 3FZMA 5AQNA 1OKJA 3IMXA 4BC2A 3EZWA 3GBTA 5AQJA 2ZGYA 4BRCA 1BDGA 3UKUB 3QFPA 1KAZA 1JCEA 5AZJB 4BQZA 2FSJA 1GLJO 4EHTA 3VF6A 3VERA 2FSNA 3SMPA 3FZFA 1ATNA 1J6ZA 3MMVA 3VEVA 2P9IB 2DPNA 1C0FA 2AP1A 2I7PA 4L3QA 3LDQA 5AQHA 2CGJA 1MWKA 4BRNA 4CZKA 3VF4A 1NGFA 1CZAN 1E4FT 2QWRA 5AQQA 3FLCO 3VETA 1T44A 3L6QA 4BGBA 4E1JA 4FL9A 4JN4A 2E2OA 1NGAA 3WUHA 5AFUA 4K43A 3IDHA 5CE3A 2GWJA 2OANA 1X3MA 5TKYA 4CZGA 1KXPA 2F9WA 1LCUA 1E4GT 1RFQA 2E8AA 3CERA 3R9PA 3LL3A 2QW9A 2A6AA 3H6EA 3GOIA 4CZHA 5FPMA 3KHYA 1QQNA 4QS7A 4QS8A 5BPMA 4FO0A 2IVNA 3H1QA 5ADXH 3BP8A 2NRHA 4JD2A 1GLFO 2PBDA 3B8AX 3S41A 5AQFA 5KQDA 4MLHA 5F2RA 2V7ZA 1BWFO 2NLXA 2HF4A 4HTLA 4NO7A 3HBTA 3VF2A 3UB5A 5JLHA 3WXLA 1QQOA 2AA4A 3VOVA 4A62A 1NM1A 1HUXA 2YHYA 4BRQA 1Z05A 3EO3A 1QZ6A 1IG8A 4M7XA 4B1VA 3D7EO 4CI6A 3O1BA 1JCFA 3ZETA 1X3NA 2Q97A 4JNEA 2D0PA 5JICA 3MN7A 4B1UB 1NGEA 3MCPA 3M6GA 3J8AA 3O5BA 3CJCA 3ID8A 4A2AA 3H3OB 4WQ4C 1HJOA 2P9LA 2E2NA 3A8YA 1YVNA 1TUYA 4BROA 3ENOA 4YDUA 2Q0UA 1NGBA 5BN9A 4K25A 1H1VA 2YCHA 3QFUA 2D0OA 3CIPA 5EX5A 3I8BA 4AM7A 3EN9A 4XH1A 3O4WA 2D4WA 4FWSA 1BO5O 4FWKA 4BG9A 4BRKA 5AQZA 4JD2B 3R8EA 3SJHA 3ZX0A 1R59O 3AAPA 4XH5A 2UYTA 1ESVA 3IUCA 4BR0A 2HMPA 4M7YA 2BUPA 1G99A 1BA0A 2P9KA 3WEEA 3H46O 4IJNA 5AQRA 3U4LA 4B1WB 2P9SA 3EL2A 1QQMA 3FZKA 1C0GA 5BPNA 5F0XA 4FWQA 3VGMA 5B8HA 5KQ8A 3MK6A 2V51B 3M1FA 3ZETB 2YJEA 2FF3B 4CZEA 1WOQA 5AQTA 3OHRA 2E2QA 1GLBG 1U6ZA 4CBUA 1K8KA 4EHUA 2I7NA 4H5RA 3CETA 3A5MC 4PKIA 5AFUH 3WQTA 4A2BA 3BF1A 3GE1A 4B1XB 2P9LB 4NB4A 2YI1A 3LDOA 5FPDA 3EKSA 4I6MA 3SMSA 5BRHA 1ZC6A 2FXUA 5AQSA 4CBWA 4DQ8A 1BOTO 3JS6A 2GELA 4BC4A 3SLCA 4BRGA 4RTFD 4BRIA 4FWLA 4H0VB 3HI0A 5JLFA 1RGIA 5AQPA 4JHDA 1WUAA 4CD3A 4RCHA 1DEJA 3WXKA 1ZXOA 1NGIA 1Z6RA 2Q31A 3A5LC 2A3ZA 2P9PA 3R6MA 4BRDA 4J8FA 4IXCA 2E88A 3VEWA 5AZIA 4Z94A 5E84A 3TPQA 3W3DA 5EXWA 1JCGA 3HTVA 3LDNA 2VWBA 4BR5A 4BC5A 5AQKA 2P9KB 3O08A 3WEEB 3MN5A 4FWNA 4K41A 4RWTA 1MDUB 3WXIA 2YHXA 2FSKA 3TU5A 2KHOA 3CJ1A 4H5VA 2QWOA 2A42A 1U2VA 3LDLA 3VEYA 3CJAA 2QWPA 4LC9B 4EAHD 2P9SB 3BEXA 4DCHA 3VGKA 4BR9A 2QWLA 2GWKA 5KPZA 2ASOA 4WQ4A 5AQYA 3FFKB 3EKUA 2WUSA 4DHYA 4CD1A 1K8KB 4FWRA 4A61A 3O1WA 3CJBA 2F9TA 2ZF5O 3QICA 3UE5A 4BR2A 4JAXA 5JMVA 1Q18A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYHA 4WFNL 4EIAA 3KLGA 1QHAA 1WBDA 3I56N 4BVOA 4EFHA 3OJUA 3F9KA 4ELUA 2VWKA 4DV3K 1EO1A 3MEGA 3NGIA 4KHWA 1WBBA 4DS5A 1A5WA 3VESA 4FWPA 4W5QA 2F8SA 3GG4A 1JXEA 4M3YA 1YXQA 1BUPA 4J2AA 4OJRA 4DR1K 3I55N 4LF6K 4CJVA 4F3TA 1TL3A 1KAXA 1RDWX 4I7FA 4LH5A 4KHPK 1OVYA 1NNEA 3D6RA 3KK2A 5IWAK 3RMAA 3QEVA 5FPNA 2D0AA 4FLXA 1U2VB 3TSUA 1J5OA 1W0HA 1YI2N 4FM2A 1TVRA 3D2FA 4M3TA 4IDKA 4H03B 1NK9A 4O5BA 3VEXA 1RBTA 3DJCA 3HJFA 3LDPA 4R5PA 1NK5A 3SQ0A 5M1QA 5HP1A 4GY2B 4ISGA 1S5JA 3L0QA 2Q1NA 4JI6K 3OYGA 1IBKK 3DAWA 1FKPA 2CGLA 2Z1JA 3PSIA 4CF2A 5T7BA 5CR4A 3CFOA 1ZBLA 3C95A 4CJEA 1HQEA 4N56A 3DM2A 4LF7K 4B1ZA 4KTWA 1NU0A 4HWIA 4B9QA 4CJQA 3CJ7A 3HXMA 1S22A 1T7PA 5FRMA 3RMCA 1CZBA 2YNIA 3E9LA 5GADP 4AILC 1NOZA 4YHHK 1YJ9N 3G6EN 5M1OA 4M45A 2QWNA 5ELZA 1N32K 2UXDK 4F9OA 1RBSA 5HRRA 3O80A 4YOWA 4BR4A 2HNZA 1XHXA 4FJ7A 3L2QA 1NMDA 4BREA 3I33A 3H45C 5BRDA 1HX1A 4FW2A 2Q2RA 2FLOA 2QA4N 1GLEG 4CEZA 1BCOA 3ZX3A 3AA5X 4MLEA 3IKMA 3D2FB 2YJFA 4CIFA 2ASMA 4QAGA 4BRFA 2UXCK 4X64K 1VQ9N 4LFBK 3P31A 4DMNA 3CQXA 4M63C 1GLDG 2O4IA 3RSEA 1V4TA 4KHSA 2IIRA 1SAZA 3QBWA 5E26A 3ENHA 1OVQA 3M8PA 3DLHA 4CJ4A 1WN7A 4WYBA 4BE0A 1F21A 3BF3A 2QWMA 4IG3A 4DUYK 2A41A 3DLEA 1TGOA 3VEZA 1QS4A 4LSNA 1VSEA 5AZJA 4PQUA 1LWCA 4C8NA 2FBVA 1ZYQA 3DLLL 2WBNA 4JKAA 4C1NK 1X9MA 1GOAA 1HPMA 4V19S 4PY5A 5FRNA 2E1YA 4CF1A 4NCAA 1VQNN 2W41A 3QDKA 3N4PA 3D0PA 2IAJA 4FJIA 5LJVA 4O0IA 4O5FA 3ZSXA 3FE1A 4O8KA 3WT0A 2JLEA 4CEBA 1T6CA 3L2RA 2KLAA 3HSCA 3VQ5A 2DFEA 3AVMA 1HYVA 4ID5A 4WQ5C 4E7HA 3LPUA 3L2WA 1Q81O 1L5UA 3OYKA 4KTQA 1KCFA 3VQQA 3RSEB 1JL2A 3CCVN 1W9HA 1CXQA 4YDUC 2KZZA 3FZMA 3DRSA 1OKJA 4BC2A 4BRCA 4DFPA 1BDGA 2E6LA 4CGFA 2RF2A 1KAZA 3FFIA 3EZ5A 5AZJB 4BQZA 3ZSVA 1IG9A 1GLJO 2XY6A 3VF6A 1VSLA 2ZD1A 3FZFA 5C25A 1ATNA 2BANA 2DPNA 4EZ9A 1C0FA 2AP1A 2I7PA 3G71N 2CGJA 4CZKA 3VF4A 1B9DA 1RT2A 4LFAK 5KRTA 3FLCO 4MDBA 1NK8A 1L3TA 3P1GA 4E1JA 4FLVA 4DLGA 4MQ3A 2PY5A 3IDHA 3L3UA 3J7ZO 4LF9K 2OANA 4DLEA 4LF8K 5TKYA 3DLRA 1NK7A 2F9WA 4KFBA 1LCUA 2E8AA 3R9PA 2FC0A 2QW9A 3CCLN 2A6AA 5J1EA 3GOIA 3O9RA 3SI6A 3DOLA 5FPMA 1QVGM 4RW6A 4M3RA 1QQCA 3OYNA 3OA9A 4L8RB 4JD2A 4Y1CA 1FW6A 2Z1HA 1HMVA 4GKKK 1N34K 1IBLK 3KK7A 4OPHA 1FJGK 2QTDA 2VQFK 2VG6A 1BHLA 3V9WA 5F2RA 4Q0BA 3VQEA 2HF4A 3B6OA 2NNWA 3HBTA 3NAEA 4AHUA 1KD1O 1QQOA 3VOVA 2YHYA 1HUXA 1RTJA 4BRQA 3EO3A 1Q82O 4LD0A 5GAHP 4B3RK 4E7LA 1J5EK 4DKWA 3ZETA 4OGCA 4JK7A 1O13A 3SYZA 4CJ5A 4B1UB 3ID6A 2XO7A 3M6GA 3O5BA 4CF8A 3ENBA 4FJLA 1JLGA 3VQBA 2X78A 1RTIA 1TKZA 2IDOA 4C8LA 4RG8A 3LZIA 1I39A 1VQ7N 3KKRA 3QINA 2YCHA 4AHCA 3QFUA 2D0OA 4HVJA 3EN9A 4O8UA 4W5TA 2QXFA 2BDPA 1OH7A 1XNQK 4JD2B 1M90O 3K5MA 1R59O 1J53A 1K9MO 4O55A 3MEDA 3CG7A 1ESVA 1RT1A 4BR0A 1SL0A 4M7YA 2ZJQL 5E41A 1IKVA 4DF4A 4OLBA 3OYBA 2HHVA 4B9MA 3QEPA 3QERA 4CCHA 1UWBA 4JRQA 1VQON 1QQMA 5F0XA 1E3MA 3MK6A 3LDSA 2HHXA 3ZETB 2YJEA 2FF3B 3MEEA 1REVA 4BE2A 3PX4A 3VN5A 1WOQA 4JKGA 4KH5A 3HPHA 4CBUA 4EHUA 5HL7L 1J9AA 1RDDA 3KIOA 4KHQA 5M1KA 4KREA 2YI1A 3QEXA 4CHQA 4XIUA 4CEQA 1ZC6A 2DTUA 4DQ8A 4QCLA 1HQUA 1BOTO 4E1NA 4NYNA 2QEXN 4BRIA 4FWLA 4F8RA 4LF4K 4FM0A 5JLFA 3HI0A 1XNRK 4I9QA 4JHDA 4JI7K 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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