3MXIA

Trex1 3' exonuclease d18n familial chilblain lupus mutant
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
231
structure length
219
Chain Sequence
TLPHGHMQTLIFLNLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALESQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDVLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
molecule tags Hydrolase/dna
source organism Mus musculus
total genus 78
structure length 219
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxiA01
3QEVA 3DYAA 3KD1E 1HPZA 1VSKA 3ZSRA 1BIZA 4B08A 1XWLA 1L3UA 1C0TA 2BDPA 2HVHA 5HRNA 4BE0A 4CF1A 1RTDA 4B9NA 1TAQA 3KKSA 1NOYA 3LZIA 4BE1A 4I2QA 3CG7A 3NF9A 3S3OA 1TK5A 4R5PA 1B9DA 4FZYA 2DY4A 4LY7A 4G1QA 3V6DA 3F9KA 3TARA 1Q9YA 1SKWA 4F4KA 4FJJA 4CEFA 1S1UA 4M3TA 4UQGA 2BANA 2X6SA 3TABA 3LP0A 3ASMA 2RN2A 3LWMA 1SL1A 4M3XA 3HK2A 1KFSA 2E4LA 1C6VA 1JL1A 3AO5A 2EX3A 4HTUA 4EP4A 4KTZA 3HO1A 5T7BA 4FJ7A 2E6MA 4Z4GA 3VQ5A 4CHNA 1U04A 1JLCA 3HVRA 2G8FA 1WSEA 3WNGA 4AHUA 1VSLA 3DOLA 4CEBA 1QSLA 1D9FA 4DLEA 2BGGA 4CGFA 2YKNA 4CJ3A 4DLGA 4JS5A 4DF4A 3OYJA 3SQ4A 4W5QA 4B3OA 2RPIA 3C94A 1RT3A 4B8CA 4FLTA 3LWLA 1CZBA 4CEOA 3ZT1A 3NHGA 4BACA 4CIFA 5C24A 4CIEA 2EHGA 3C6TA 1KLMA 3VQBA 1HYVA 3OS1A 3KK1A 3CFPA 2IDOA 5HROA 4KRFA 2AJQA 4DQRA 4L8RB 3LALA 3NDKA 5DMRA 5KI6A 3PUFA 4RW7A 1VK0A 4DU3A 1ASUA 1BGXT 1DTQA 3SUPA 2G8IA 1HQEA 1FKPA 1RBRA 3CM6A 4AHSA 3P1GA 4EZ6A 1IH7A 2WOMA 4IG0A 4HCBA 2GUIA 4J2AA 4N56A 4DWIA 4FYDA 1Z26A 1WLJA 1REVA 3HJFA 4KI4A 3VQ7A 3OYFA 1RTJA 1X9WA 4E1MA 3AVJA 4E7KA 4FVMA 3HPOA 4NYNA 1T8EA 4J2EA 3AVKA 4GW6A 4F3OA 3QINA 1C1CA 3HL8A 4PQUA 1O1WA 3AVIA 4NCGA 1GOBA 3DLRA 1EXQA 4CJRA 4N41A 3MAQA 5D3GA 4KHYA 3L8BA 4M41A 1NKEA 1Q9XA 1N5YA 3V9ZA 1J54A 4GVMA 3IS9A 3ZSYA 4W5TA 3EZ5A 1VSFA 1X9MA 4CJKA 4CGJA 4CEDA 4OPKA 1BCMA 3MEGA 2X78A 3OVNA 3I8DA 4J2DA 3AA4A 3VN5A 3ZSVA 4I9LA 4Z4HA 3OYCA 4M45A 1UA1A 3MEEA 3OYKA 1L3SA 1ZBUA 1RT5A 4MQ3A 2QK9A 2BE2A 3KJVA 2HNZA 3CFRA 4KHSA 2B6AA 5CY4A 3VQQA 4M3RA 4QCLA 3AO4A 3HYFA 4N5SA 1S5JA 4CF0A 2B4JA 1RDAA 3LZJA 4CCHA 2IGIA 1ZBIA 3RRHA 4ZHRA 3SUOA 3M8PA 4DQSA 4ICLA 4FJ9A 2LSNA 1D5AA 3AA2A 4CK1A 4LSLA 4E7HA 1ZYQA 4ELUA 4AHCA 5J2QA 3NGZA 4RW9A 1W0HA 4B9UA 3AO2A 4LH4A 4QOZB 2XY6A 3AVFA 4C8LA 2ZQBA 4CK2A 4DTMA 4CJ4A 2Z1JA 3NCIA 4Z4CA 4M3WA 1LAVA 3VA3A 2XO7A 3QEPA 4KREA 3ZSWA 4PUOA 1X9SA 3OS0A 2KW4A 4OVLA 5KRTA 1U49A 4DSJA 1LWEA 3AVAA 4RW4A 1C1BA 4CGIA 5E41A 2DFFA 2YV0X 3VQDA 1T7PA 4ZTJA 1WN7A 3TAMA 2I5JA 1JLFA 3T19A 3AA5X 1YVUA 4DQIA 4RW8A 1RBVA 3TI0A 4C8MA 5CYMA 1HQUA 4PY5A 2OPPA 1TV6A 3A2FA 4E3SA 4O4GA 4C8OA 3HP6A 3KD5E 4FLVA 2G8VA 1EP4A 3D45A 1U47A 4HUGA 1RT2A 4LSNA 3QIOA 5HRRA 4CF8A 1JLQA 1XHZA 4IBNA 2QKBA 3MXMA 1LW2A 3M8QA 1A5WA 3P83D 1CXQA 4FXDA 3LAKA 3EY1A 2VG5A 3LAMA 4Z4FA 1F21A 1HJRA 3HP9A 4FK4A 4KV8A 3KKRA 2HMIA 1KFDA 4O55A 3WNEA 3SJJA 3TAQA 2PYLA 4BDZA 1SKSA 4KHNA 4KHQA 4OKEA 3QESA 4CEQA 3QO9A 3NE6A 4O0IA 4OJRA 4W5OA 4E7JA 3DLHA 3RWUA 1S6QA 2XY8A 3PV8A 1HRHA 1VSEA 3V9WA 1KVCA 3V9SA 1S1TA 4CJ5A 4F2RA 4I9QA 2OPQA 3ALYA 1TKZA 2GBZA 4BE2A 4M3ZA 3AA3A 2OA8A 3VQPA 4Y1CA 1YT3A 5CZ1A 4NCAA 1DLOA 3T3FA 1BQMA 1RT1A 4FW2A 2OPRA 5CYQA 4CEEA 3SNNA 4CHZA 4FLUA 3L3VA 4DSFA 1UA0A 1RBTA 1L3VA 2X6NA 1EKEA 1BISA 2ATQA 2FBTA 5EU7A 4AHVA 3OYBA 1RT7A 1QSYA 2ZD1A 1TAUA 5J2PA 3OYMA 1S9GA 4E7IA 3RMDA 3KLIA 3TANA 1JLGA 2YNIA 3LP1A 5I3UA 3DMJA 3IAYA 4DTPA 3S9HA 1JXEA 3SI6A 3ITHA 1ASWA 2FBXA 2GV9A 4CEZA 4CF2A 4DU1A 3SQ0A 1U48A 3F73A 4FJ8A 3S3NA 4CJLA 1ZBLA 2KFZA 1TKDA 1NK9A 4XIUA 2HHSA 3VQ6A 4AH9A 4MFBA 2YKMA 1QTMA 4C8KA 4DS4A 4CK3A 4CE9A 2QKKA 4PA1A 3TR8A 3QNNA 1NOZA 2W42A 1ZBFA 1RT4A 3HM9A 4NCBA 3OJSA 3NGIA 4FJIA 3SUNA 1NJYA 3AVMA 3O3FA 4AHRA 3OYEA 3L2UA 3IG1A 3LP3A 1B92A 4F8RA 3DRPA 4DF8A 3VQAA 3TAGA 3NBPA 3S3MA 2HHUA 4M42A 4OKJA 1RT6A 2FBVA 2HNDA 3NF6A 4BDPA 3HPGA 3SV4A 3V9UA 4FJXA 2O4IA 2G8WA 4CJFA 1A5XA 3KK3A 1NK6A 1LW0A 4Z0UA 1VRUA 4O44A 2OPSA 3ZSZA 4DG1A 4RW6A 1LV5A 4KFBA 1G15A 1TGOA 1VSIA 3O4NA 4ZTFA 1W9HA 4CF9A 1VSJA 1S9EA 1LWCA 3P5JA 1A5VA 4CESA 1QS4A 4Y1DA 5K14A 1RTHA 5SWMA 2OYQA 4KPYA 4OKKA 5KGXA 2Y1JA 1TVRA 2Z1HA 1BIUA 3M8RA 3TAFA 1J53A 1SL2A 4FK2A 2HB5A 4M3UA 4KTQA 3L3UA 3K58A 2IOCA 3QETA 1IG9A 3RTVA 4YFUA 4FJKA 3TAPA 3BDPA 4OPJA 5J1EA 4HCCA 4I7FA 1HNVA 4W5RA 4FM2A 4OGCA 5HRPA 3SCXA 4HUEA 3L2VA 4FZZA 1TK8A 2KZZA 2ITGA 4IKFA 3K57A 3DLEA 1C1AA 3CFOA 1X1PA 2IS3A 4CHOA 4CJQA 2PY5A 2F8TA 3KIOA 3QERA 3PX4A 4FJGA 1B9FA 4KKOA 3VQEA 3K2PA 3VQCA 2R7YA 4BDYA 3LPTA 5KGWA 4FM1A 4DTRA 4DFMA 2KZMA 1I39A 3LP2A 4NYFA 3PO4A 2G8HA 4FJLA 1EX4A 1I3AA 2P51A 1JKHA 3V4IA 3SQ2A 2F96A 3KLFA 4CGGA 4WE1A 1IKWA 4OLAA 1BL3A 2JLEA 2OZSA 3AVLA 1C0MA 3NH2A 4FLXA 1RILA 2Z1GA 2DFEA 1JLEA 3L2RA 1NKBA 3V1OA 3THVA 1UAXA 3K5OA 5KTQA 1QHTA 1L5UA 1SV5A 1ASVA 4ELTA 3D0PA 3NF7A 3MECA 2XY7A 1BQNA 1WAJA 3C95A 3OY9A 1J9AA 2HHTA 1RBSA 2A1SA 4DTNA 1VSHA 4CECA 5HLFA 3HSTB 2A1RA 2KTQA 1EETA 1KVAA 3DOKA 3V81A 2YNHA 5C25A 3AVBA 4ELVA 3NH1A 2HHXA 3JYTA 1MU2A 4O0JA 2G8UA 1KVBA 3ZSXA 3DLGA 2KFNA 3DLKA 2P5OA 3OYGA 4OGEA 5FROA 4DTSA 2VG7A 3SQ1A 1R0AA 3NH0A 4IG3A 1T03A 1KLNA 1WNSA 1KRPA 4JRQA 4FJ5A 1RDCA 4E19A 3SUQA 3L2WA 4JS4A 3QEWA 1WSFA 3K5LA 4DSIA 3DRSA 1YTAA 5J2MA 3DI6A 3VQ8A 5SZTA 4H4MA 2ETJA 2IAJA 3RR8A 4KHUA 3TAEA 1YTUA 1JLAA 5JS1A 4DFKA 3NF8A 4CJPA 3OYDA 4KB0A 1BCOA 3AVNA 4IFVA 5J2NA 5HP1A 4FJNA 1FXXA 2NUBA 3C6UA 3LPUA 4K8XA 2Z1IA 4FLWA 1WAFA 3KLHA 3HXMA 3V1QA 4CHPA 3SYZA 4HVJA 4DFJA 1XHXA 5DK5A 3ZT4A 1K6YA 4LD0A 1HYZA 3OYHA 1U45A 1NJZA 1BI4B 2IC3A 3M8SA 3PO5A 2YNFA 1RCHA 2P1JA 3O3HA 4TSXA 1WSJA 1IKYA 3FFIA 3ZCMA 4E7LA 3UIQA 4M3YA 3U3YA 2HVIA 2YHAA 1RDDA 3IRXA 3CQ8A 1Q8IA 5FDLA 4C8NA 1RTIA 1S1WA 1UWBA 3TWHA 1L3TA 1HYSA 4EP5A 3QEIA 1Y97A 3AVCA 1NK8A 4ID1A 4IFYA 1BHLA 4B8AB 4I2PA 4CERA 4DS5A 4CJEA 1IO2A 3ZT0A 1XI1A 4E0DA 2XHBA 1GOCA 3CYMA 1CLQA 3AVHA 4DTXA 1SKRA 1SUQA 1JLBA 1WSHA 4CJVA 4FJMA 2DTUA 4FW1A 1S1XA 4CJTA 1KCFA 3EYZA 3NAEA 2D0BA 3G10A 3T1AA 3VQ9A 1KTQA 1UOCA 1U4BA 3BGRA 4JLHA 2XRIA 1VSMA 1TL1A 3U6FA 4FJHA 3AO3A 3HT3A 4K8ZA 4CJUA 1QQCA 2FBYA 3O3GA 3KK2A 2XY5A 3CM5A 3VQ4A 1TK0A 4B9MA 3MXIA 4CIGA 4FLYA 1KSPA 5FRMA 2KQ2A 1RDBA 1WSIA 4GMJB 3OYIA 3K5NA 4EZ9A 4FLZA 1GOAA 1TKXA 1NK0A 2HHWA 1T05A 3K5MA 4DMNA 1LAWA 4J2BA 3AO1A 2X74A 4KO0A 4E1NA 1LWFA 4DU4A 1XC9A 2P5GA 2HHQA 4KAZA 2OZMA 4CHYA 3OJUA 1FKOA 3OYNA 2YNGA 4HUFA 2D5RA 2D0CA 3G0ZA 3NGYA 3AVGA 1JXBA 4LH5A 4ID5A 5C42A 4O5BA 2E6LA 2WONA 3HVTA 1TKTA 3OYAA 3ZT3A 4Q5VA 4DQPA 1NJWA 3KTQA 1RBUA 3ZSQA 3NFAA 3RMCA 3OYLA 2QXFA 4B9LA 4KI6A 3SPZA 1D9DA 1BI4A 3O4QA 3V1RA 4KTWA 4CFCA 4CFBA 1N6QA 1NK4A 2FC0A 3DLBA 2HNYA 5HRSA 1NJXA 3V9XA 4DSLA 3SPYA 1VSDA 1S1VA 4FZXC 2VG6A 1S6PA 4CFAA 3HPHA 4F3TA 3ULDA 3RRGA 2O4GA 4Z4EA 4CJWA 3L2QA 1FK9A 1HNIA 2JGUA 3SZ2A 1NKCA 5KRSA 4CEAA 4BWJA 3KLGA 5I42A 1IKXA 2D0AA 3QLHA 3WNHA 4DTOA 4B9SA 1J5OA 3LANA 4DTUA 4QAGA 2DFHA 1QE1A 3I0SA 4PWDA 3B6OA 3ISNC 4AILC 3MEDA 1ITGA 3AV9A 3PX6A 4DFPA 2F8SA 3H08A 4IDKA 4YNQA 4JRPA 2HHVA 4N47A 1DTTA 2Q3SA 5CZ2A 3RR7A 3SV3A 2PYJA 3QIPA 4W5NA 4DSEA 1RNHA 1CXUA 2RKIA 4CHQA 2VWKA 4B9TA 2RF2A 4KHWA 1VRTA 4HHTA 3QEXA 5FRNA 3MXJA 4FK0A 4H8KA 3JSMA 1NK7A 3ZSOA 3DRRA 3KLEA 3WNFA 2VWJA 4BWMA 1CZ9A 3QNOA 3VA0A 3B6PA 1WSGA 4RG8A 4FCYA 4DSKA 4FM0A 4KB1A 3RMAA 4B9VA 1NK5A 1Z25A 4CJSA 1QSSA 2B5JA 3RMBA 2PZSA 4Z4IA 1HMVA 1JL2A 3U3GA 3ZT2A 4CFDA 1D8YA 1ZBHA 4DQQA 3OS2A 2ZE2A 3I0RA 3DM2A 2HW3A 4Q0BA 4AHTA 4N76A 2Y1IA 3PX0A 3LDSA 1TL3A 2G8KA 3PY8A 4DTJA 5JS2A 4CGDA 5HBMA 4H4OA 4E89A 3K59A 3E01A 4CGHA 2YHBA 4F2SA 1IKVA 1C0UA 4OLBA 1SL0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QEVA 3KD1E 4A59A 1HPZA 1BIZA 3D2FB 1XWLA 4KH4A 1C0TA 1C0FA 5EX5A 3SAHA 4BE0A 4XEIA 1S3XA 4NXNK 2Q31A 1TAQA 3VERA 4FZYA 3B8AX 5FPEA 4LY7A 1Q9YA 4FJJA 1SKWA 1S1UA 5AZJA 3O9UA 4UQGA 5A2QO 3LWMA 2RN2A 1EO1A 4IO9L 4CZLA 1JL1A 4H0TB 2EX3A 4EP4A 3HO1A 2E6MA 3VQ5A 4CHNA 3HVRA 1YJNN 3F9MA 4CEBA 3DOLA 4BR7A 3EKUA 4CGFA 4AM7A 4CJ3A 1QZ6A 2E8AA 1MWMA 1RT3A 4LFCK 1YF5L 3NHGA 4BACA 3J7YP 2EHGA 5HROA 3QBXA 2IDOA 2HHHK 3LALA 4PKGA 5BN9A 3UKRB 1VK0A 1ASUA 1DTQA 1RBRA 3CM6A 1K8AO 4I6MA 1BDGA 3P1GA 1IH7A 4JV5K 4FYDA 4WQ5A 2VQEK 3HJFA 4JKEA 2QM1A 1X9WA 4E1MA 5KPRA 2P9IA 3AVJA 4E7KA 4FO0A 1T8EA 4LF9K 4J2EA 4F3OA 3THXB 1C1CA 4FWPA 1O1WA 4CD3A 1EXQA 2HBJA 4C1NI 4CJRA 3MAQA 4N41A 1J54A 3IS9A 4W5TA 1X9MA 2YHYA 3K9JA 4CEDA 1BCMA 3CMAN 3MEGA 3OYCA 4I9LA 1YI2N 2QK9A 2GWJA 4H5VA 4KHSA 3VQQA 1OH5A 4QCLA 2QTDA 4N5SA 3T1HK 2B4JA 3HOTA 4F9OA 2UXCK 4ZHRA 3M8PA 4O8UA 4E7HA 3A0IX 1ZYQA 4ELUA 5J2QA 3NGZA 4RW9A 2ZJQL 4LH4A 3E1YA 3J7ZO 4LF8K 2ZQBA 4DR7K 4DTMA 3NCIA 4JNEA 1NU0A 3VA3A 5C10A 1MWKA 3ZX0A 3OS0A 1LWEA 5E41A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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