3MXJA

Crystal structure of the mtrex1 apoprotein
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
229
structure length
210
Chain Sequence
LPHGHMQTLIFLDLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALEPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDVLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
molecule tags Hydrolase
source organism Mus musculus
total genus 71
structure length 210
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxjA01
2RN2A 3NH0A 3L2QA 2QKKA 4CHOA 3EZ5A 1QS4A 4PA1A 4DSLA 2B5JA 1VSHA 3KKRA 4B8CA 3QEPA 1JKHA 4ICLA 4TSXA 3OYCA 4B9LA 4C8MA 2IDOA 1K6YA 1ZYQA 2HHXA 2XY8A 4CECA 4FJ9A 1EXQA 2P51A 3HM9A 1RBSA 5HRPA 3MAQA 4W5QA 3HP6A 4CEQA 4LH5A 3QLHA 1JL2A 3KD1E 1J54A 3HP9A 1Z26A 1S6PA 5HLFA 1VRTA 2HVIA 5D3GA 2E6MA 1RT2A 3TAFA 1WAJA 3C94A 4O44A 5HBMA 3TARA 1NK0A 1TAUA 5SZTA 4FJXA 1RT1A 1BL3A 1FKOA 1RT6A 4B8AB 3M8QA 2ZQBA 3ITHA 2YNHA 4CK3A 1U45A 4KREA 4KHYA 3ZSZA 1RCHA 4B08A 4IKFA 1S1VA 3KD5E 4KHWA 3SI6A 3TWHA 3DOLA 3L3VA 3SUOA 1FK9A 3KIOA 3L3UA 3CG7A 3LPTA 3PV8A 4DU1A 3L2VA 1KVCA 1QQCA 4I2PA 4OKJA 3VQDA 3K57A 1D9DA 4CJSA 4CGHA 4E89A 3KLHA 3PO4A 1DTTA 3MXMA 1HNIA 2XO7A 4CJKA 4L8RB 4IG0A 5C24A 3ZSYA 2KFZA 4OLAA 1QE1A 3TR8A 1YVUA 5CYMA 5HRNA 3NBPA 4KB0A 4JRQA 3IS9A 1RBRA 1JLGA 5I3UA 2HNYA 4CGIA 4AILC 3EY1A 3LDSA 4RW4A 3D0PA 3HJFA 5J2NA 4DTRA 4W5OA 2VG5A 4N47A 1HPZA 4CJ3A 2KZZA 2HNDA 3ZSXA 3ISNC 4CGJA 3AA5X 1ITGA 3OYMA 2Z1JA 5KGWA 4DTUA 4FJLA 4DFJA 1J53A 1RBVA 4DSEA 4HCBA 1RT5A 3AO1A 2OZSA 2DFHA 1GOCA 4CEEA 1Q9XA 3O4NA 2PYJA 4FJ7A 2Z1GA 1L3SA 3AVAA 3C95A 3QESA 2R7YA 3DLHA 4E3SA 4C8KA 2ZE2A 3KLIA 4IDKA 5C25A 1VSJA 4W5TA 4CGDA 4FJGA 1JLBA 1VSEA 3O3FA 2RPIA 3AA3A 2FBTA 2FBVA 1JLAA 3AA2A 3AVHA 1C1BA 3FFIA 3O4QA 4CF0A 4CFDA 1SL1A 3KLEA 5FRMA 1ZBLA 3PO5A 3NGIA 3CFRA 4PQUA 3E01A 4FLYA 4RW7A 4C8LA 4J2EA 4CIEA 4AHUA 2G8KA 1RTJA 1UWBA 3AVNA 3CM5A 1IKWA 3I8DA 3VQAA 3M8RA 2OA8A 4FK2A 3HSTB 1JLQA 1XC9A 4FZXC 3HPOA 3DOKA 4DTJA 3THVA 4FJJA 4KB1A 4CERA 3OJSA 4B9TA 4DSIA 1ZBIA 1KVBA 4B9MA 4E7KA 4NCBA 4IBNA 4N41A 2XRIA 4M3YA 3WNFA 1WNSA 3SNNA 1U48A 5KGXA 3TABA 3OYEA 4CJQA 4Z0UA 4CFAA 5HRRA 4H8KA 3CQ8A 5HP1A 3S3NA 1QSLA 3VQEA 1RDCA 4M42A 4ZTFA 1NK6A 4DQIA 4Z4GA 4DLEA 1TAQA 1LW0A 4I9QA 4EP5A 5J2QA 4CJLA 1QSSA 5CYQA 3PY8A 3OYNA 4KI4A 3OYDA 3KJVA 1SKRA 1L3VA 1VSDA 4DS4A 1KVAA 3LANA 4DTPA 1WSHA 2PZSA 1WSEA 2IC3A 3VQQA 3M8SA 4OVLA 4CE9A 4DLGA 4M41A 1BGXT 3D45A 3LAMA 3DYAA 4EZ6A 3QNOA 3DRSA 3ZT1A 3V9ZA 1I39A 1RILA 4DFKA 1G15A 4DQSA 1LWEA 4M45A 4CGGA 3C6UA 3AVCA 3DM2A 3P5JA 4I2QA 3VQ9A 3VA3A 4DSJA 4M3XA 5FDLA 2NUBA 4FJ8A 1VSMA 4CJEA 2G8IA 2G8UA 3DLBA 1VRUA 2GV9A 4O5BA 1IKYA 1BI4B 3AO2A 4CEZA 2RKIA 3AVFA 4BE1A 4DTXA 3MEGA 3S3OA 1YTUA 1RTHA 3AVLA 5K14A 4CF1A 4K8ZA 4KKOA 3TAGA 1QSYA 2OZMA 3OYBA 3T3FA 2Y1IA 2EX3A 1JXEA 3UIQA 4RG8A 3VQCA 1Z25A 3NGYA 4CJTA 3ALYA 1ZBUA 2QK9A 2G8WA 1IKXA 3OS0A 4KV8A 3WNGA 1TK0A 3NF7A 4FVMA 4N76A 2VWJA 3ULDA 1KFSA 1JLCA 2EHGA 1TV6A 1N5YA 2YV0X 4DQPA 4CJPA 1C1CA 1O1WA 4M3ZA 5FRNA 4O55A 3L2WA 4BACA 4E7JA 4F2RA 1SL0A 4FXDA 1IH7A 2HVHA 1VSFA 4FYDA 1TGOA 4B9UA 1I3AA 1WLJA 4QAGA 3CYMA 4FLWA 4DSKA 2ETJA 2YHBA 4UQGA 3VN5A 3V1RA 4J2AA 4FJ5A 1TK5A 2HHQA 2B6AA 1QHTA 3VQ7A 2D0CA 4NCGA 2G8FA 3VA0A 3LWMA 1C6VA 3SQ1A 3QIOA 3OYFA 5HRSA 3O3GA 2F8TA 2HHWA 1WAFA 1KFDA 3LP1A 2D5RA 3ZSWA 3AO5A 3JYTA 4F8RA 3TAEA 4OGCA 3AO4A 4OKKA 5CZ1A 1J5OA 1BIUA 3V1OA 3TAMA 4ZTJA 1X9MA 2G8HA 3RWUA 1HMVA 4FJKA 3KTQA 1YTAA 3SQ2A 3T1AA 2IAJA 2GUIA 3T19A 4KI6A 4PWDA 3TAQA 3MECA 2D0BA 3HT3A 3RR7A 3DLRA 4CJWA 1TL1A 4IFVA 3SCXA 3VQ4A 4PUOA 1VK0A 4HUFA 3SV3A 4Z4IA 4CIGA 3SV4A 4CF8A 1IG9A 1XHXA 3U6FA 4KTWA 3K2PA 2Z1IA 3QEXA 4E19A 1A5XA 4CFCA 1C1AA 1S1UA 5J2MA 4KAZA 1KTQA 3VQPA 3V1QA 1UA1A 4AHTA 1RDDA 2X6NA 4DTNA 3DMJA 4E7LA 1LW2A 1W9HA 3G10A 2YHAA 3AVMA 2HHVA 2LSNA 1NKBA 1MU2A 3HPHA 3WNEA 4CIFA 1ASUA 3AVIA 2Q3SA 4CESA 4C8NA 3U3YA 3ZSRA 2FBXA 1CZBA 1RT3A 3V9XA 2WONA 4H4OA 4Q0BA 1D8YA 2HW3A 4BWMA 3EYZA 3V4IA 4CJVA 4ELUA 3NE6A 3OYIA 3MXIA 1NOZA 3KK3A 4DSFA 2X74A 1KRPA 1ASWA 4DF4A 1SUQA 3TI0A 1DLOA 5C42A 1RT7A 2QXFA 2HHUA 1RNHA 4BDZA 4FK0A 3KK1A 1Q8IA 4CEBA 1RDAA 2GBZA 3CFOA 1HYZA 1RBUA 4I7FA 4CHPA 1IO2A 2DFFA 3VQBA 4EP4A 3K59A 4CGFA 2YKNA 3DRRA 4FCYA 4OKEA 4QCLA 3NF9A 2JLEA 1SKWA 3OYLA 4DU4A 1KCFA 3SPZA 4FJIA 4FJHA 5KRTA 1TKTA 1TKZA 3P83D 1REVA 4FW1A 1CXUA 4DFMA 3SUQA 4KRFA 2X6SA 1BQNA 2I5JA 1UOCA 4AHCA 1HQEA 4LD0A 4Q5VA 4BE2A 4CHZA 4BWJA 3I0SA 1HRHA 2O4GA 3BGRA 3NH1A 3NGZA 3IG1A 2XY5A 1D9FA 4B9NA 1NK7A 1NKEA 3LAKA 1TL3A 2YKMA 1TKDA 4W5RA 3RMDA 4E1NA 3NAEA 1S1XA 4CF9A 3V81A 4B9SA 2F8SA 1X1PA 4DTSA 4LH4A 4FW2A 3S9HA 3V6DA 1RTDA 3BDPA 4KHSA 3OVNA 5CY4A 1S9GA 1WSIA 2FBYA 3HVRA 4BDYA 4DTMA 1T8EA 1FXXA 5E41A 3ZSQA 3K5MA 1VSIA 5KRSA 3KK2A 4KPYA 5DMRA 1TKXA 2KZMA 4FLXA 3NDKA 4DU3A 3SUNA 4Z4EA 1XI1A 3H08A 1QTMA 4CCHA 2F96A 2KW4A 1GOAA 4YNQA 3HO1A 2QKBA 2E4LA 1CXQA 2YNFA 3HYFA 4JLHA 5JS1A 3RMCA 3QINA 3L2UA 3HK2A 2E6LA 4LSNA 4FJNA 1L5UA 4GW6A 4CHQA 4XIUA 3ZT3A 1B9DA 4JS5A 5J2PA 2P5OA 4NYNA 4ZHRA 2KTQA 4YFUA 2OPRA 4LY7A 3RRGA 1EX4A 4HUEA 4CJUA 3L2RA 4B3OA 1KSPA 1C0UA 2BANA 3LZIA 3HPGA 4Y1CA 3MEEA 5EU7A 3VQ6A 4AHRA 3SQ4A 1WSFA 4BDPA 4KTZA 4C8OA 3ZT0A 4RW9A 1BISA 1S5JA 1VSKA 4DF8A 3IRXA 1HYVA 5T7BA 4F2SA 1B9FA 1BCMA 1RTIA 2VWKA 4CEAA 4FZZA 3G0ZA 3QETA 2BGGA 4KHUA 1LAWA 4Y1DA 3RTVA 4N56A 4FM1A 1T05A 4I9LA 2YNIA 4DQRA 1X9SA 4J2BA 3NCIA 3QERA 1HYSA 3V9SA 4FLZA 3TANA 1YT3A 2HHSA 1BCOA 3JSMA 4Z4FA 2PYLA 4G1QA 3V9WA 3SPYA 3L8BA 4ELVA 1SKSA 3ZCMA 4K8XA 3A2FA 4FLVA 4CEOA 3V9UA 2ITGA 4OPKA 2VG6A 3SJJA 1JLEA 3AVKA 4WE1A 4J2DA 5I42A 1LWCA 3MXJA 2KFNA 1L3UA 1BI4A 3OYGA 4DFPA 1KLNA 4CJ4A 4E7HA 1Y97A 4B9VA 2OPQA 1EKEA 1GOBA 1B92A 3KLGA 4IFYA 3AVGA 4CJ5A 4OPJA 1SV5A 4HHTA 4DG1A 5DK5A 4AHVA 1T03A 1U49A 3HXMA 1C0MA 4FZYA 4CK1A 4CJFA 5J1EA 1NJYA 3RR8A 3PX4A 4FK4A 4W5NA 4E1MA 3OJUA 1L3TA 4EZ9A 2ZD1A 4E7IA 1UA0A 4H4MA 1NK9A 3KKSA 3U3GA 2D0AA 5FROA 2BDPA 1DTQA 1EETA 3HVTA 3S3MA 4E0DA 4KHQA 4F3TA 1SL2A 5KI6A 3QEVA 2HHTA 1NK8A 4CHYA 3PX0A 1A5WA 4M3WA 1N6QA 3SQ0A 1S9EA 4CHNA 2X78A 4NYFA 1LV5A 3AO3A 4FJMA 4IG3A 1FKPA 3LP3A 2YNGA 3DRPA 1T7PA 1D5AA 2P5GA 2XY7A 4Z4CA 1NK4A 1F21A 2KQ2A 3LWLA 3PUFA 2IGIA 4GMJB 4AH9A 3DLGA 1NOYA 2WOMA 3K5NA 4DTOA 1C0TA 3K5OA 3RRHA 4O4GA 5CZ2A 1U4BA 4CK2A 4R5PA 1HNVA 3SUPA 1CLQA 4LSLA 1CZ9A 1JXBA 3OYAA 4DS5A 2VG7A 2PY5A 3AVBA 3I0RA 2A1RA 2AJQA 3ZSVA 4KO0A 4DQQA 3IAYA 5JS2A 1LWFA 3OYHA 3MEDA 2HB5A 5SWMA 4N5SA 4MFBA 2IS3A 3QNNA 1RDBA 3DLKA 2XHBA 4HTUA 3SYZA 1HJRA 3NF6A 1R0AA 1NJWA 1TVRA 1XWLA 4RW6A 4HVJA 3RMAA 4ID1A 3DI6A 3NFAA 4KTQA 2A1SA 4KFBA 4OJRA 3QIPA 3LZJA 1BHLA 1JLFA 3LP0A 3NHGA 4OLBA 2HNZA 1HQUA 3B6OA 4MQ3A 3RMBA 2P1JA 2ATQA 2JGUA 1Q9YA 4M3UA 2HMIA 1UAXA 2B4JA 3OY9A 1U04A 3CM6A 4FM2A 1W0HA 4CEDA 4KHNA 3QEIA 2IOCA 2O4IA 3VQ8A 3OYKA 3P1GA 3LP2A 2DY4A 1S6QA 4FM0A 2W42A 1TK8A 3PX6A 1XHZA 1ZBFA 1ASVA 4O0JA 4PY5A 5HROA 1WSGA 5KTQA 2XY6A 4NCAA 2Y1JA 2FC0A 1LAVA 4CFBA 3WNHA 3K58A 4DWIA 4HCCA 4HUGA 2DTUA 4JRPA 1RT4A 3F9KA 3LALA 4BE0A 3VQ5A 3QEWA 1A5VA 3DLEA 4FLTA 2OPSA 3AVJA 4GVMA 3B6PA 3CFPA 4JS4A 3HL8A 2G8VA 1IKVA 2DFEA 2BE2A 3ZT2A 3SZ2A 1X9WA 1S1WA 1NK5A 3K5LA 1NKCA 4FLUA 1NJXA 3M8PA 4ELTA 4AHSA 3QO9A 1RBTA 1WN7A 2OPPA 3ZSOA 1BQMA 4M3RA 3TAPA 4M3TA 2Z1HA 3NF8A 4Z4HA 3C6TA 3F73A 4QOZB 4RW8A 1ZBHA 4CJRA 3AV9A 1JL1A 4DMNA 4ID5A 4OGEA 3KLFA 3OYJA 4F4KA 3OS1A 1J9AA 1S1TA 1BIZA 3AA4A 1NJZA 1U47A 4O0IA 2OYQA 4F3OA 3ZT4A 3NH2A 4CF2A 1EP4A 3LPUA 1VSLA 3O3HA 1KLMA 1WSJA 3OS2A 3ASMA 2RF2A 4CEFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L2QA 4CHOA 5LL6Z 5DM6L 3KKRA 4ICLA 2UYTA 4H5VA 5GAHP 3VPZA 4FJ9A 1EXQA 1VQPN 5LMUK 5FPDA 2E20A 1WOQA 3QLHA 1JL2A 2V51B 3LDPA 3HP9A 4PKHA 4H0XB 1VRTA 3TTCA 3C94A 4O44A 5HBMA 3HOSA 1RT1A 1RT6A 4B8AB 2YNHA 3A0IX 4CK3A 5MLCQ 4KREA 3GL1A 5KPTA 3D7EO 3KIOA 3HSCA 3LPTA 1I94K 1KVCA 1QQCA 2YI1A 4I2PA 4OKJA 3K57A 4CJSA 3KLHA 1DTTA 4IG0A 2KFZA 1T3VA 1WBDA 4JRQA 3IS9A 1K8KA 1HPMA 5C12A 2HF3A 3EY1A 3LDSA 4RW4A 3FZFA 5J2NA 2KZZA 2Z1JA 4FJLA 1RBVA 4RWTA 3AO1A 1GOCA 4CEEA 3I55N 2FF6A 3DLHA 2R7YA 4C8KA 1VSEA 4BRAA 2FBTA 2FBVA 3AVHA 4CFDA 3HI0A 1LOTB 3NGIA 3BF3A 4B1VA 3H1VX 4C8LA 4AHUA 3KK7A 4JNEA 4C1NK 3VEZA 2QWOA 3VQAA 3M8RA 4DQ8A 3DAWA 4IJNA 5B8HA 4KB1A 3OJSA 4DV0K 1ZBIA 4A2AA 3CC7N 4B9MA 1ATNA 1X3MA 2O8BA 3H1QA 3OW2M 1XMQK 4CFAA 4Z4GA 3VQEA 4DQIA 4IDHA 4DLEA 1TAQA 3AAQA 3KJVA 4FWLA 3WQTA 2A3ZA 5ADXA 1IBLK 4U7BA 3TTFA 4YORA 3G25A 3ZT1A 3G4SN 1I39A 3CCVN 4A5AA 4DQSA 2NRHA 1YI2N 3C6UA 3P5JA 4I2QA 3VA3A 3H3NO 5FDLA 2NUBA 4FJ8A 2G8UA 2CH5A 4O5BA 3PSFA 4CEZA 3AO2A 5JICA 3AVFA 3SBGA 4BE1A 3S3OA 3CC2N 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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