3MXJA

Crystal structure of the mtrex1 apoprotein
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
229
structure length
210
Chain Sequence
LPHGHMQTLIFLDLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALEPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDVLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Mus musculus
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
total genus 71
structure length 210
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxjA01
3RMAA 3B6PA 3NDKA 1RDDA 3V1OA 3ZT4A 4CHYA 1KLNA 5CZ1A 1T03A 3MXIA 4NYNA 4N56A 1HPZA 4EP4A 4FLTA 2Y1JA 1DLOA 3VA3A 4LY7A 4O44A 1JL2A 2YKMA 3NHGA 1KRPA 2XRIA 4ELUA 4KPYA 2OPQA 3CFPA 1C0MA 3JSMA 5HRPA 1HMVA 3SQ2A 3LAMA 1NJZA 2YHAA 2B4JA 3NAEA 3KLIA 1HYZA 1N6QA 2FBTA 1BISA 4MFBA 3L2WA 3HXMA 3RMBA 3QNNA 1JLAA 1KFDA 1NOYA 3HK2A 2RF2A 3ZT3A 4KREA 2KW4A 3RWUA 1BL3A 4F8RA 2I5JA 3LP3A 4RW7A 4PA1A 3AVMA 5KRTA 5J2PA 4ZHRA 1ASWA 4FXDA 1NKCA 3WNHA 3U3GA 1T7PA 3AVHA 3SQ4A 1SV5A 4J2AA 1S1WA 3OY9A 4DLGA 2PYJA 4FJ7A 4I2QA 4DMNA 4CF8A 1T05A 1A5VA 2XY7A 1LWEA 1EXQA 2D0AA 2FBVA 2VG5A 3DLGA 4FVMA 4CF2A 3NE6A 4BDZA 4FM1A 4DQIA 1TAUA 2GBZA 3QIPA 4B8CA 5T7BA 2VG7A 1RTIA 1NK6A 1Q8IA 3OS0A 3AVJA 5KTQA 3QLHA 5JS2A 4CEEA 3SQ0A 3VQ6A 3SNNA 2X6NA 3C94A 4CEAA 1ZBIA 3PX6A 2RN2A 3ZSXA 2KZMA 3M8SA 3L2RA 4NCAA 5FRMA 1JXEA 4OKJA 3CG7A 1JLEA 3OYGA 4CJTA 2P5GA 5C24A 4KHSA 4BE2A 3CM6A 3QINA 2G8FA 3L2VA 2HHTA 2P5OA 1ASVA 4KV8A 1O1WA 4N47A 3ZSYA 4CJVA 4KHYA 3HSTB 4DS5A 5DK5A 4B3OA 3HL8A 2OZSA 5HRRA 3PY8A 3NF9A 3HPHA 1S6QA 3TARA 2YKNA 4JRQA 4I9LA 4CGDA 3MEGA 4AH9A 2XO7A 1J9AA 5KI6A 1NK4A 1IO2A 1TKTA 1VRUA 4FLXA 3DLHA 4CJUA 3HM9A 1TKZA 1C1AA 3F9KA 2FC0A 1KVCA 5KGXA 4KHUA 1HQUA 1X9SA 1EETA 3DRRA 3AVAA 1JLQA 4J2DA 4O0IA 3LAKA 1BGXT 1HNIA 4O0JA 3LWLA 4AHUA 1QHTA 1QQCA 2ZD1A 3DLRA 3D0PA 4DTRA 1S5JA 3SUOA 4DSKA 3ALYA 4Y1CA 2F96A 4M3RA 4DFKA 5CY4A 4FZYA 3AO4A 2RPIA 3LPTA 2KQ2A 3VQ4A 2OPRA 3SV4A 4M3UA 2HB5A 1QTMA 4KTZA 1RT4A 4DG1A 4DQSA 3E01A 3DRPA 3OYHA 3IG1A 1ZBFA 3HP9A 3IRXA 1W0HA 4Q5VA 1RBTA 4B08A 2LSNA 4DLEA 3P83D 4CJ5A 2E6MA 4CK2A 3HYFA 5I42A 4FZXC 3AVCA 1C0UA 3MAQA 4FM2A 1ZBHA 1QS4A 1C0TA 3OYMA 4CJWA 3L8BA 3WNEA 4UQGA 3OYFA 3DLBA 1GOBA 1YVUA 1TK8A 4ID1A 3RMCA 1NK8A 2HNZA 1RILA 3K57A 1WNSA 4FJHA 4I7FA 1RBSA 1LWFA 3TANA 4DFJA 4B9LA 4PWDA 1KTQA 1C6VA 2E6LA 3S3MA 1YT3A 1RBRA 3AA5X 3QERA 3RTVA 3O4NA 2G8WA 5HRNA 2Z1HA 1BIZA 4E1MA 1RBUA 4LSNA 1TK5A 1NK7A 1VSEA 4CJSA 4AILC 4H4OA 5HBMA 2QXFA 3BGRA 3OS1A 4DQQA 5J1EA 1MU2A 3VQDA 2DFHA 2HHWA 2ZQBA 3DOKA 3HVTA 4K8ZA 4QAGA 4J2BA 4N76A 5FDLA 3ZT0A 4ZTJA 1X9WA 4FK0A 1TKXA 2G8UA 3L3UA 3K5LA 4KRFA 3ZSRA 3KLFA 2PYLA 1TL1A 3UIQA 3C6TA 2PY5A 1B9FA 1C1CA 4CHNA 4IG0A 4DU1A 3AO2A 1IG9A 3V6DA 1JXBA 1WSFA 4IFVA 1F21A 5I3UA 3MXJA 4DU4A 1BHLA 4KTWA 3LZIA 3G10A 2ITGA 1SKWA 1TGOA 4H8KA 4O5BA 2IOCA 1S1UA 3T3FA 1UA1A 3O4QA 4H4MA 3VN5A 3DM2A 4KTQA 1KVBA 3QETA 2QK9A 1IH7A 3AA2A 4LH5A 3VQQA 3QEPA 3KK2A 3KK3A 4M3YA 1WAJA 4FJKA 1X1PA 1LV5A 1VSJA 2Z1JA 4ID5A 4AHCA 4DF4A 1VSHA 3S3NA 1BCOA 2A1SA 2OYQA 2G8IA 1LWCA 3AO3A 3ZT2A 2HNDA 4AHSA 4F2SA 3FFIA 3K2PA 1HRHA 4HUGA 1QE1A 4DSLA 1S6PA 3AVLA 3SI6A 4E7JA 5JS1A 1EP4A 4GVMA 4CJRA 4JRPA 4M42A 4BE1A 5SZTA 3U3YA 4CEBA 4Z4FA 1CXUA 2IAJA 4IFYA 5KGWA 2XY6A 1KSPA 4IBNA 4Y1DA 4E7HA 4FJNA 2O4IA 4HCCA 1NOZA 1X9MA 3BDPA 3PO4A 2HHSA 1JLFA 1XC9A 2RKIA 4N41A 4CGGA 1NJYA 4M3XA 1VSKA 4AHTA 4NCBA 1SUQA 3KK1A 5C25A 1A5XA 2OPSA 4CHOA 3K5MA 1ITGA 1REVA 4BE0A 4B9NA 1RT1A 1JLGA 2HHXA 4CFDA 2ETJA 4B9UA 4HTUA 1RTHA 3LP0A 4AHVA 2X78A 3V9UA 1RTDA 1WSHA 2F8SA 4EP5A 1KFSA 3KLEA 3VQEA 1BIUA 3VA0A 2EHGA 1VRTA 2OZMA 3O3HA 2KFZA 4M45A 1GOAA 4ICLA 1VSFA 3TR8A 2WOMA 4E89A 3THVA 3LPUA 4E0DA 2DFFA 4KB1A 4CFCA 1ASUA 2QKBA 3K5NA 4B9TA 1N5YA 4CGHA 2FBYA 3P5JA 4CHZA 3IS9A 1QSYA 4CIEA 4HHTA 3TAMA 4HUEA 1NJXA 3G0ZA 2O4GA 5KRSA 3OJUA 3SJJA 1SL2A 2JLEA 3C6UA 2IGIA 3VQBA 3OYJA 2HHQA 4OKKA 4W5OA 3CM5A 1FK9A 4Z4GA 1HJRA 2AJQA 4RW9A 1R0AA 3ZSOA 3S9HA 1YTUA 3PX4A 3AVBA 3EY1A 4RW4A 5HROA 2ZE2A 3D45A 4W5RA 2Y1IA 3OYNA 4KB0A 4HUFA 1RCHA 1WLJA 3TWHA 3VQ9A 2OPPA 4CJ4A 3OVNA 1XWLA 1ZBUA 3TAEA 3HPOA 1I39A 1LW0A 4JS4A 3K58A 4CGJA 4FCYA 4FLYA 3MEEA 4DTUA 2HHVA 2BE2A 1WSEA 1K6YA 4FYDA 2DFEA 3VQ8A 3V1QA 3ZSWA 1UA0A 1GOCA 5D3GA 1IKXA 3VQCA 2P1JA 2P51A 3TAGA 2G8VA 3T19A 5K14A 3VQAA 3NF8A 4YNQA 3NFAA 3V9SA 4F3OA 1RTJA 4XIUA 4CGFA 4CK3A 4OPJA 3LALA 4JS5A 1BI4A 4TSXA 3O3GA 4FM0A 2BDPA 4F4KA 2WONA 5EU7A 2G8HA 1I3AA 1BCMA 4DTJA 2HW3A 3HPGA 4PY5A 3NH1A 4Z4EA 1W9HA 1KVAA 1RDCA 2YNHA 4GMJB 3TAQA 3V4IA 3QESA 4MQ3A 1CZBA 1SL0A 1JKHA 1RT6A 4CF9A 1ZBLA 2PZSA 4QCLA 4DSEA 3DI6A 3KIOA 2VWJA 4DSFA 4ZTFA 2HVHA 1BI4B 4E1NA 3S3OA 4C8OA 4FW2A 5HLFA 2IDOA 4B9MA 1D9DA 1TL3A 4CEFA 4W5TA 2FBXA 3SZ2A 3I0SA 1D5AA 1Y97A 4LD0A 4CCHA 2HMIA 3AVGA 2HHUA 1Z26A 4R5PA 3ZT1A 1J53A 3AV9A 1B92A 4FJ5A 1S1TA 2IC3A 3SCXA 4KAZA 4DU3A 1HYSA 3VQPA 1RT2A 4O4GA 4EZ9A 3AO5A 3DYAA 5FROA 2BGGA 4FW1A 3I8DA 1YTAA 4CEQA 3AA3A 2X6SA 2GUIA 1JLCA 1NK0A 3H08A 4OLAA 4KHQA 1IKYA 3DRSA 3VQ5A 4NYFA 4B9SA 4W5NA 4GW6A 3LZJA 3QEIA 3M8RA 3O3FA 3KTQA 3B6OA 3KD5E 4M41A 4E7IA 4FJXA 2X74A 4E19A 3OYBA 2D0CA 4OGCA 4KKOA 1U48A 1L5UA 3V9WA 3WNFA 4Q0BA 2KTQA 4Z4IA 1NKEA 4DF8A 1RDBA 1WN7A 1QSSA 2DTUA 1WAFA 1EX4A 4DSIA 4CERA 4YFUA 3RMDA 1XHZA 3TAPA 3NBPA 4FLVA 4WE1A 1U45A 4E7KA 4O55A 1L3VA 4B8AB 1RT5A 4KFBA 1NK9A 1VSIA 5J2MA 3SPZA 3AVKA 3PUFA 4LH4A 5J2NA 3KLGA 5SWMA 3KJVA 4CJ3A 4FJGA 3ZCMA 4NCGA 1RBVA 3LP2A 2Z1GA 1KLMA 3ZSVA 1SL1A 1TKDA 4KI4A 2KZZA 4EZ6A 4DTPA 4HCBA 4KHNA 4M3WA 4FLWA 4I2PA 4OGEA 1Q9XA 1TVRA 3KKRA 4FK2A 1HYVA 3QEXA 1Z25A 3KKSA 2G8KA 3AA4A 3OYKA 4M3TA 4HVJA 4DS4A 1T8EA 3RRGA 2R7YA 4L8RB 4RG8A 3K59A 4BWJA 3KLHA 1J5OA 4AHRA 3OYCA 4J2EA 3DLEA 4FJIA 1DTQA 5CZ2A 3TABA 1SKSA 3QEWA 3JYTA 1EKEA 4CEDA 3OYLA 1VSLA 1IKVA 3QNOA 1VSDA 2A1RA 4CHQA 4ELVA 3T1AA 1CZ9A 1JL1A 1S1VA 3ITHA 3M8PA 2D5RA 3QO9A 1UOCA 4DQRA 1D9FA 3L2UA 2HVIA 3LANA 1TV6A 3OYAA 3NF7A 1U47A 3NGYA 2ATQA 1NJWA 4C8KA 2YHBA 4CFBA 4DTNA 5HRSA 4CJKA 3SQ1A 4I9QA 4DFPA 1RT7A 1D8YA 3LP1A 1C1BA 4CHPA 3F73A 1LW2A 4DFMA 4DTSA 4BDPA 3SPYA 2YNIA 4C8MA 2GV9A 3K5OA 4CIFA 3U6FA 4FJ9A 3NCIA 3ZSZA 1FKPA 3LDSA 1ZYQA 2EX3A 3I0RA 5C42A 3IAYA 3HJFA 3A2FA 1XHXA 3V1RA 1WSJA 3SUQA 2B6AA 3QIOA 4DTOA 5J2QA 4CEZA 2XY5A 3LWMA 3CYMA 3NF6A 3OYDA 3SV3A 1S1XA 4FZZA 1S9GA 1UWBA 4M3ZA 3KD1E 3QEVA 1BQNA 4JLHA 4IG3A 4BWMA 1KCFA 2DY4A 4LSLA 4Z4CA 1FXXA 2IS3A 2VWKA 1RNHA 5E41A 4BACA 2B5JA 4CESA 3MEDA 4RW8A 2Z1IA 5HP1A 1A5WA 2D0BA 4CJPA 1Q9YA 1U49A 4FJLA 4CJLA 3NH2A 3MECA 4CFAA 3OS2A 2F8TA 4W5QA 3DLKA 3TAFA 3DMJA 4C8LA 4OPKA 4CJEA 1U04A 1DTTA 4PUOA 1TK0A 4DTXA 4CF0A 1HNVA 1WSIA 2BANA 3CQ8A 4PQUA 3RR7A 3OYEA 3P1GA 1SKRA 4ELTA 4IKFA 1RT3A 3EZ5A 1XI1A 4CJQA 3M8QA 4C8NA 2JGUA 4Z0UA 3HP6A 2YV0X 4OJRA 4RW6A 2QKKA 3L3VA 3AO1A 1IKWA 1WSGA 2NUBA 4QOZB 4BDYA 2XY8A 4E7LA 1U4BA 4CEOA 4F3TA 5DMRA 1G15A 3HT3A 2VG6A 3AVFA 3VQ7A 3RRHA 3RR8A 3SYZA 3V9ZA 4FJ8A 2HNYA 4G1QA 2KFNA 4CECA 3DOLA 3AVIA 5CYMA 1BQMA 2YNGA 4OVLA 4FLUA 2OA8A 1CXQA 3L2QA 3ULDA 1J54A 4DSJA 3V81A 1LAVA 3EYZA 1VSMA 4N5SA 4OKEA 3ASMA 4CK1A 3ISNC 3ZSQA 1UAXA 3C95A 1LAWA 4CJFA 3NH0A 3SUPA 4E3SA 1L3TA 4FJMA 1TAQA 3PV8A 1L3UA 3MXMA 3CFOA 4CF1A 4K8XA 3NGZA 1HQEA 3SUNA 3V9XA 3NGIA 2Q3SA 4CIGA 4FJJA 5CYQA 4CGIA 3CFRA 1CLQA 1VK0A 1NK5A 4FK4A 4B9VA 3HO1A 4Z4HA 2XHBA 4IDKA 1QSLA 4F2RA 1JLBA 1L3SA 4FLZA 2YNFA 2W42A 3TI0A 2E4LA 4KI6A 3PO5A 3HVRA 4DWIA 4KHWA 4OLBA 1RDAA 1S9EA 3AVNA 5FRNA 3OYIA 3OJSA 1B9DA 4KO0A 3WNGA 1FKOA 4DTMA 3PX0A 4DQPA 1NKBA 4CE9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RDDA 4CHYA 1KLNA 5CZ1A 4CZGA 3MXIA 1XMOK 4YOVA 4H0VB 4N56A 5B8HA 1YJ9N 3VA3A 4FWPA 2J4RA 1JL2A 3NHGA 2XRIA 4KPYA 4FWLA 2NRRA 5AQGA 3RVCA 1N6QA 2FBTA 1BISA 4K42A 4MFBA 1YJWN 3E9OA 3HK2A 4F8RA 5J2PA 5AZJA 4BRQA 3WXJA 1NKCA 3TU5A 2NRHA 1T7PA 1SV5A 3WT0A 5BRFA 4CF8A 1T05A 3O9QA 1TAUA 3QIPA 5T7BA 2VG7A 3TPQA 4YDUC 5AZJB 5JS2A 5MLCQ 3VQ6A 2QWRA 2RN2A 4DV3K 3L2RA 5FRMA 3VPZA 4OKJA 5EVZA 3P4IA 3CG7A 4KHSA 3FFKB 3LDLA 1WOQA 5ELZA 1ASVA 5GADP 4KHYA 4WYBA 2WTUA 4H0TB 4EHTA 4B3OA 2OZSA 5HRRA 3PY8A 3HPHA 3TARA 4CGDA 4LF4K 1J9AA 4JKGA 1VRUA 1C1AA 2BUPA 2NRZA 1KVCA 1MWMA 3AVAA 1JLQA 3G4SN 4J2DA 3LWLA 3D0PA 1Q9YA 2ZD1A 4DSKA 4A62A 2F96A 3MCPA 1BO5O 1Q82O 4FZYA 4MDBA 4JKGB 3VQ4A 4U7BA 5CR4A 3SV4A 3I56N 2BH1A 1QTMA 4FWQA 4DV0K 3PLAA 4F2RA 3DRPA 2A41A 2LSNA 3P83D 4CJ5A 4KH4A 5I42A 4PKGA 2QWLA 2VCPA 3AVCA 4FM2A 2H3GX 3L4IA 3L8BA 3WNEA 2V51B 4UQGA 1GOBA 1YVUA 3CPEA 3RMCA 1NK8A 2HNZA 1NG9A 1RILA 2ZJRL 4IJNA 5ADXH 2E2PA 4IOXA 3S3MA 1YT3A 3E1YA 2VQFK 1HKBA 1OVQA 2E88A 2P9SB 3QERA 4GKJK 5HRNA 1BIZA 4CJSA 4AILC 4DQQA 2HHWA 1MU2A 3DOKA 4N76A 3N4QA 4X62K 2QW9A 3L3UA 3SMPA 5AR0A 3ZSRA 3K5LA 2G8UA 4KRFA 4LF7K 4JK9A 4CHNA 4IG0A 1OKJA 3V6DA 1JXBA 1IBKK 1MDUB 4YHHK 1F21A 5I3UA 2GELA 2NRWA 2ITGA 3G10A 4KH5A 3WQUA 2IOCA 1S1UA 1IH7A 4LH5A 3QEPA 4BGBA 1HNXK 3DLLL 4ID5A 5JLFA 3AY9A 1BCOA 1VQ8N 3AO3A 4JKEA 2HNDA 5AQYA 4F2SA 3K2PA 1HRHA 3AVLA 4GVMA 4FWKA 4BE1A 2GEMA 4M42A 5AQRA 5SZTA 3U3YA 2IAJA 4IFYA 4H0OA 4Y1DA 4WFNL 4BRGA 2HHSA 5CHIA 2HBMA 3KZBA 4AHTA 3GE1A 3HOTA 4EIAA 2Q0UA 5C25A 2UXDK 4C23A 1RT1A 2QWPA 1VQ9N 1IG8A 2CH5A 1QQOA 5AQPA 4AHVA 3LP0A 4FVUA 2X78A 4B1VA 1WSHA 3NVKA 1BIUA 1Z6RA 3O3HA 3G25A 3TR8A 5EX5A 4E89A 3THVA 3LPUA 4KB1A 2DFFA 1WB9A 1GLBG 3OBYA 2UXCK 5C15A 1E4GT 4CHZA 3IS9A 1QSYA 4DV1K 4HUEA 4HHTA 1NGIA 3TAMA 3BY5A 1NJXA 5KRSA 4XH5A 4YOXA 4W5OA 5BPMA 1FK9A 4FWSA 5BPLA 1HJRA 2AJQA 4RW9A 1R0AA 5IWAK 3ZSOA 1YTUA 3PX4A 3EY1A 4BG8A 4GY2B 4IOCL 1EWRA 2QA4N 1JCEA 1HX1A 3KWIA 1XWLA 3CCMN 2E2OA 4JS4A 3K58A 2HHVA 1WSEA 4FYDA 3V1QA 5JMVA 1GOCA 1IKXA 3TAGA 1KAYA 3T19A 1NM1A 5F2RA 4YNQA 3ULEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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