3MXMA

Trex1 3' exonuclease v201d aicardi-goutieres syndrome mutant
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
229
structure length
226
Chain Sequence
LPHGHMQTLIFLDLEATGLPSSRPEVTELCLLAVHRRALENTSISQGHPPPVPRPPRVVDKLSLCIAPGKACSPGASEITGLSKAELEVQGRQRFDDNLAILLRAFLQRQPQPCCLVAHNGDRYDFPLLQTELARLSTPSPLDGTFCVDSIAALKALEQASSPGSRKSYSLGSIYTRLYWQAPTDSHTAEGDDLTLLSICQWKPQALLQWVDEHARPFSTVKPMYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/dna
source organism Mus musculus
publication title X-ray Crystal Structures of TREX1 3' Exonuclease Autoimmune Disease Mutants
rcsb
molecule keywords Three prime repair exonuclease 1
total genus 77
structure length 226
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.11.2: Exodeoxyribonuclease III.
pdb deposition date 2010-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3mxmA01
4CF2A 1JXBA 5KRTA 4CEBA 2DTUA 3AVAA 4B08A 2X74A 3AV9A 4LH5A 3VQ7A 3U6FA 4DG1A 4CIGA 4KHYA 1YTUA 3RMDA 3TR8A 3L2QA 3NE6A 5J2NA 4M42A 2KW4A 1REVA 5EU7A 1VSJA 4FM0A 3QEXA 3P83D 4OVLA 4N5SA 2OA8A 4CIFA 3OYFA 1BCMA 4M45A 4CHQA 1O1WA 3ZSXA 1XI1A 4CHPA 2ATQA 3CFPA 4E7JA 3T19A 1RBTA 4FYDA 5T7BA 1U47A 3PUFA 3U3GA 4EP5A 3S3MA 1TK5A 2EHGA 3ZSWA 3OJUA 4DSKA 1BISA 2P1JA 3WNHA 4B9LA 4FJ8A 3RMBA 3AA2A 3PX4A 5HROA 1VRTA 3AVFA 3K5OA 1HJRA 1XWLA 5HBMA 3OYGA 4FLWA 5KRSA 2YV0X 3NFAA 3RRGA 4Y1CA 4M3XA 2HHWA 1A5WA 4IG3A 1NOYA 1RBVA 2IGIA 5CYMA 3WNFA 1RT1A 2OPRA 4HCCA 1RTHA 1LWCA 1HYSA 4CEAA 4KHUA 1C0MA 1RBUA 4OKJA 4AH9A 1UAXA 2VWKA 3L3UA 5C25A 3RR7A 3E01A 5FRMA 1B9FA 1KFDA 4ZHRA 2Z1JA 1FKPA 3SUQA 3MXJA 1T03A 4B9MA 1A5VA 1IKVA 4FJNA 1VSIA 3LALA 3VQEA 3NAEA 3LZJA 3ZSVA 2HHTA 3SUOA 1BHLA 3THVA 2XY8A 2QXFA 3V4IA 4RW6A 2HHVA 1CZ9A 3KKRA 3AO2A 4B9UA 4CK3A 3IRXA 2KFNA 4IFYA 3LP3A 4CIEA 3TARA 1YT3A 2OPSA 3CFRA 1YTAA 2X78A 2D0AA 3QEVA 2DFEA 3SQ4A 1EP4A 5HP1A 1L3UA 1U4BA 1IO2A 5FRNA 3P1GA 3VN5A 3HT3A 2IAJA 4DLGA 4DTNA 3EY1A 4BE1A 4C8KA 5KI6A 4DS4A 3AA3A 4CJEA 4DTJA 3SV4A 3EZ5A 4FM2A 1R0AA 2FBTA 3LAKA 1ZBLA 3TAFA 3MEGA 4CHNA 1RT5A 3NGYA 3OYDA 4DTRA 1S6PA 1C0UA 2QK9A 1GOAA 1TV6A 3M8PA 3WNEA 1ASWA 3QEPA 1XHZA 3K59A 4DQRA 3SUNA 1GOBA 4OLAA 3PY8A 3QIPA 1SL0A 2G8HA 3RMCA 1Q8IA 3O4NA 4W5TA 1RDBA 3PX6A 1KLNA 1HNIA 4ICLA 4O55A 4C8NA 1QSSA 4O0IA 3KLGA 1B92A 4E7KA 4GVMA 1C0TA 4BDPA 1DLOA 4Z4GA 3V9WA 1S1XA 3SYZA 3SI6A 4I9LA 4CJTA 1WSJA 3TAPA 1IKYA 3VQ6A 3NHGA 3RR8A 1CXUA 1S1UA 1J9AA 4AHRA 3LANA 5JS1A 1CZBA 3V9XA 3K58A 1NJWA 1TKDA 3CM5A 1EXQA 1S1VA 4UQGA 3KD1E 3QEIA 4CEQA 2KTQA 2B4JA 3AVBA 4QAGA 4DSFA 4CJSA 4OPKA 1BI4A 2JGUA 4RG8A 2BANA 1WN7A 1J54A 3C94A 1L3SA 2DFHA 2KQ2A 1T05A 3OS2A 1IG9A 3OYMA 3NGIA 1SKRA 4Z4FA 3AVKA 1CXQA 4DSIA 3SPZA 4JRQA 1VRUA 3O4QA 1D9FA 3SZ2A 4DU1A 3V9ZA 2WONA 2ZD1A 3SPYA 2E4LA 3DRSA 3NH0A 1CLQA 3L2UA 4HUGA 1G15A 3C95A 3OYLA 2EX3A 3NCIA 1TKXA 5HRSA 4YFUA 4M3UA 3OYBA 2HNZA 2YNGA 1VSEA 2FC0A 4CEDA 4CJRA 3SQ2A 2OZSA 4FZZA 4KRFA 4M3YA 2IDOA 3SJJA 4CJVA 2IC3A 1LWFA 1S6QA 5CYQA 3LP1A 3PX0A 4C8LA 3VQBA 2GUIA 4DFMA 4Z4IA 4PQUA 4Q0BA 2KZMA 2RKIA 3QINA 3MAQA 1UWBA 4BDZA 4KB0A 5K14A 4OJRA 1BQNA 1ZBFA 2Z1GA 3AA4A 3OJSA 3D0PA 1JLFA 4K8ZA 1TGOA 3VQ4A 4M3TA 3KIOA 1D5AA 3HPHA 3IG1A 4CGGA 3AO1A 4MQ3A 4OPJA 4LY7A 4RW7A 1RILA 3T1AA 1UOCA 1EX4A 1NK4A 1XHXA 3VQCA 2Q3SA 5J2PA 2PYJA 4BE2A 1RT3A 4AHTA 1TK0A 1RCHA 4FLVA 1QSLA 4CJFA 4CK1A 3OYJA 3EYZA 4ZTJA 1RTDA 5HRPA 1UA1A 1NK9A 1RT6A 3DRRA 4LSNA 1BQMA 4DFPA 1Z26A 3HJFA 4CJUA 3L8BA 4E0DA 3KK3A 4FLXA 4E7HA 4JRPA 3AVHA 1HQUA 4RW9A 1TK8A 4CJLA 3OYIA 4BACA 1WSFA 2XY5A 3HSTB 4M3WA 3QLHA 3MXMA 1J53A 2WOMA 3AO4A 4FXDA 4ELUA 1U04A 3LP0A 3AVGA 4HVJA 2FBYA 3U3YA 2D0BA 4DWIA 1ITGA 3RRHA 4AHVA 3ZSZA 4XIUA 4CJWA 1QTMA 3OYEA 3IAYA 1C6VA 4WE1A 4I2PA 4NYNA 1IH7A 1NJXA 4HCBA 1VSFA 4CEFA 3IS9A 2HNYA 1A5XA 1WLJA 2XY6A 3AVJA 2D5RA 3OYAA 1D8YA 3V6DA 1LAVA 5KTQA 1MU2A 4OGCA 4FJ7A 4FZXC 3LWMA 1SKSA 4CF9A 1U49A 3OS1A 3M8QA 2KZZA 1VSMA 3OY9A 4EZ6A 3NH2A 1W0HA 2G8WA 4CECA 3DOKA 4Q5VA 1JL1A 3O3GA 3TI0A 1T7PA 2F8SA 2GBZA 3LAMA 3ASMA 3OYHA 1QQCA 3I0SA 4KTWA 4G1QA 2XY7A 2NUBA 1VSHA 4NCAA 3KLEA 2P51A 4OGEA 3HM9A 3VQ9A 2VWJA 1RBRA 4DTSA 2BDPA 4DSLA 3HO1A 4KPYA 4FJGA 3DLGA 1WNSA 1NK8A 1Z25A 5CY4A 2BGGA 1QHTA 3SQ1A 2YHAA 4CJQA 4HHTA 3F9KA 3C6TA 3O3HA 4CESA 4E1NA 3CFOA 4ID5A 2F96A 3LDSA 1WSIA 1S9GA 4KTZA 3OYKA 4GMJB 1KSPA 3PV8A 1LWEA 1KVCA 1ZBHA 2PZSA 3CQ8A 4AILC 3PO4A 4DQPA 3S3OA 4I9QA 4KTQA 1L5UA 2YHBA 2VG7A 3P5JA 1DTTA 3O3FA 4HUEA 4R5PA 4DMNA 4CEOA 1WSGA 4J2AA 1KVBA 4W5OA 3QERA 1S1TA 4B9NA 4W5NA 4CGDA 4KI4A 4CF0A 4CJ4A 3CM6A 4J2EA 1SL2A 1KVAA 1TVRA 3B6OA 4O44A 4J2DA 3BDPA 3JSMA 3AO5A 1C1AA 2VG6A 3OYCA 1RDCA 3B6PA 3K2PA 4FLTA 4FJKA 4JS5A 3SQ0A 4N56A 3ZT2A 1LW0A 3OS0A 4DF4A 3DOLA 5I3UA 4CHYA 4FJHA 4FK0A 4QCLA 2Y1IA 1TL3A 4O5BA 2Z1IA 5HLFA 4M3RA 5D3GA 1NOZA 3S3NA 4FJMA 3TANA 2XHBA 4DSEA 1RT2A 2ETJA 2DY4A 4DQIA 1B9DA 2KFZA 4KB1A 3TAEA 2RN2A 3L2VA 4NCBA 1ZBIA 4E7LA 4CEZA 3T3FA 3KJVA 1JXEA 4I7FA 3JYTA 1FK9A 1K6YA 1N5YA 3F73A 1WSEA 3V9UA 3SCXA 5HRNA 1KLMA 3HYFA 2HMIA 3ITHA 4KO0A 4Z4EA 4DTPA 1RT4A 1NKBA 4DS5A 4Y1DA 4FCYA 4H4OA 4J2BA 2A1SA 4YNQA 1VSLA 4DU3A 2O4GA 1L3VA 4B9TA 3WNGA 4KREA 5DMRA 2X6NA 1Y97A 1NJYA 5I42A 1RNHA 3G10A 3K5LA 4FLUA 1NKCA 2PY5A 3ZT0A 4CERA 1QE1A 1SV5A 2VG5A 3AVMA 3HP6A 4CE9A 3K5NA 3TAGA 1T8EA 4AHCA 2HNDA 4IBNA 4KV8A 1UA0A 4JS4A 1RDDA 3I0RA 1BIZA 3NF8A 1J5OA 2G8IA 5J2MA 3KK1A 3G0ZA 3AA5X 3H08A 2G8KA 4IKFA 3HVRA 1KTQA 4H8KA 4CJ5A 1X9SA 1TAUA 3L3VA 2B6AA 3VA3A 1RTJA 4I2QA 4KKOA 1TKTA 3KLHA 4DSJA 4N41A 1TAQA 3AO3A 2YKMA 2XRIA 4KHWA 2ZE2A 4TSXA 1NK0A 3K57A 1VSKA 3KTQA 3MEEA 5SZTA 4FJ9A 2YNFA 4Z0UA 3VA0A 3V81A 4FK4A 3ZSOA 3TAMA 4E3SA 2P5OA 4L8RB 4E89A 3SUPA 3LZIA 1RT7A 3HPOA 4CHZA 2R7YA 1ASVA 1BL3A 1SUQA 3HPGA 1HYZA 4RW8A 4E1MA 2YNHA 3V1QA 4CGIA 1D9DA 4OLBA 3MEDA 1C1BA 3QESA 4FJJA 5SWMA 5JS2A 4M41A 4DU4A 3HK2A 2IOCA 1BIUA 2IS3A 4MFBA 4BE0A 3DRPA 4KI6A 2AJQA 1JLAA 4KAZA 2HHXA 1EKEA 2A1RA 2W42A 5KGXA 1JL2A 3DMJA 3UIQA 1SKWA 4C8MA 1S1WA 4PUOA 1F21A 1BI4B 4K8XA 3I8DA 5C42A 1KCFA 3HP9A 4CGJA 2LSNA 4FJ5A 3KKSA 4LD0A 4PWDA 1S9EA 4AHUA 3VQAA 4C8OA 3HVTA 3DLHA 5FDLA 4NCGA 4CFAA 1HRHA 3MXIA 2G8VA 2G8UA 3SNNA 4FW2A 3TWHA 2GV9A 1BGXT 4W5QA 4F4KA 4F3OA 3ZT1A 4B8AB 4HTUA 3ZCMA 1TL1A 5KGWA 4Z4CA 1N6QA 1XC9A 3C6UA 1KRPA 4CK2A 1GOCA 4BDYA 5CZ2A 1HNVA 4CJKA 1VK0A 4CCHA 1RDAA 1X9MA 3VQ8A 4FM1A 3VQDA 1QS4A 2HVIA 3RTVA 3KD5E 1Q9YA 1FKOA 2OZMA 1JLBA 3ZT4A 1NKEA 3ZT3A 1WSHA 5J2QA 4JLHA 3NF6A 4CFDA 3SV3A 3QNOA 4DTXA 4M3ZA 3QIOA 4W5RA 1U45A 3DLEA 4O0JA 3DI6A 1IKXA 3RWUA 3OYNA 2HHUA 4FVMA 4ELVA 4CJPA 1NK5A 2HW3A 2JLEA 4CFBA 4BWMA 3NGZA 4FJIA 1JLEA 1I39A 2G8FA 4OKEA 4KFBA 4Z4HA 4ELTA 4PY5A 1ZBUA 3VQQA 1HYVA 3ULDA 3L2RA 4EZ9A 1EETA 1BCOA 1JLQA 3DLBA 3DM2A 4DLEA 4EP4A 4F8RA 3D45A 3KK2A 2B5JA 3V9SA 4DFJA 3DLKA 1JLCA 3LP2A 4CFCA 1JLGA 2OPPA 3QNNA 3NDKA 2I5JA 3ZSYA 3KLIA 3M8RA 4AHSA 2HHSA 4DTOA 4F2RA 1HPZA 1ASUA 2E6LA 3AVNA 2OYQA 1U48A 3NH1A 4NYFA 5C24A 1HMVA 3HXMA 2D0CA 3ZSQA 2RPIA 1NJZA 3PO5A 4DTMA 4N76A 3LPTA 4B9VA 3HL8A 3M8SA 4RW4A 5HRRA 3RMAA 4DQQA 4B3OA 5J1EA 4DFKA 4FJXA 4N47A 4KHSA 3DYAA 3TAQA 4KHNA 1JKHA 1FXXA 2E6MA 2ITGA 1X9WA 4FK2A 4H4MA 2F8TA 4CEEA 1YVUA 4FJLA 1DTQA 3NF9A 3MECA 2RF2A 2FBVA 1NK6A 2YNIA 3NF7A 4O4GA 3AVIA 3QO9A 2Z1HA 3QETA 2QKBA 1LV5A 4DTUA 3CG7A 1WAFA 3NBPA 4FLZA 1Q9XA 2ZQBA 3CYMA 4E19A 1QSYA 3TABA 1KFSA 4OKKA 2HHQA 4CGFA 3LPUA 4ID1A 2Y1JA 3V1OA 2HB5A 4FZYA 2QKKA 1SL1A 3BGRA 1VSDA 1L3TA 4F3TA 1HQEA 1ZYQA 1RBSA 4FW1A 4IFVA 4CF8A 2P5GA 4DF8A 3V1RA 1C1CA 4IG0A 4LH4A 1NK7A 1W9HA 4B8CA 1WAJA 1RTIA 2XO7A 3ISNC 5FROA 2FBXA 3OVNA 3VQPA 3S9HA 5DK5A 3KLFA 4BWJA 2DFFA 4CF1A 4IDKA 5E41A 4HUFA 3ZSRA 4CJ3A 2X6SA 4PA1A 3K5MA 2O4IA 4E7IA 3VQ5A 3DLRA 4DQSA 1X1PA 2BE2A 2OPQA 3A2FA 3ALYA 4FLYA 3AVLA 4B9SA 4KHQA 3QEWA 2YKNA 5CZ1A 2PYLA 2HVHA 1LAWA 4QOZB 1S5JA 3LWLA 3AVCA 3L2WA 4CHOA 1LW2A 4LSLA 4GW6A 4ZTFA 3FFIA 1IKWA 4CGHA 1I3AA 4F2SA 1TKZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZYYX 4CEBA 1HUXA 2I7PA 1NJIO 1YTUA 2ZGZA 3TR8A 5J2NA 4M42A 4B9QA 3PSFA 4FM0A 1ZC6A 4N5SA 3K9KA 2OA8A 4C1NK 3W0LA 4E7JA 1MDUB 1RBTA 4ILHA 5T7BA 5EY4A 3E9OA 5AQTA 4DSKA 3ZSWA 3ZETB 2O8CA 2WBNA 2P1JA 4B9LA 3PSIA 3AA2A 4BG8A 5HROA 1XWLA 4JI1K 4V19S 5KRSA 4OPAA 4IG3A 1NOYA 1RBVA 3TTFA 1RT1A 1QZ5A 4OKJA 1UAXA 2VWKA 3F2KA 5C25A 3E01A 4QS9A 1E3MA 1KFDA 3R9PA 1VQ7N 2Z1JA 3MXJA 1A5VA 1SQKA 2UXDK 3LZJA 2HHTA 2QXFA 2NRVA 1CZ9A 3KKRA 3AO2A 2KFNA 3S41A 4CIEA 1NWKA 2D0AA 1L3UA 4CI6A 3HT3A 4DLGA 5AZIA 3EY1A 4C8KA 3SV4A 3EZ5A 3LAKA 4E1JA 1IBKK 2P9PA 3NGYA 3OYDA 4BG9A 1S6PA 1C0UA 2YJFA 3QEPA 3DXKB 1QVFM 2HBJA 4OLAA 3O4NA 3PX6A 4FJGA 1HNIA 4ICLA 1B92A 2ASMA 1DLOA 4JI6K 1Q82O 1S1XA 3CERA 4CJTA 2KLAA 3CC2N 1CXUA 5F0XA 5JS1A 3LANA 3UKUA 3V9XA 1TKDA 3CM5A 1DT9A 1EXQA 1S1VA 3AVBA 4A59A 3MWTA 1BI4A 4OPKA 1WN7A 2KQ2A 3QBWA 5LY3A 3OYMA 1SKRA 3TSPA 1CXQA 3IUCA 4JRQA 3SZ2A 2HOEA 3DRSA 3VEXA 3L6QA 4LFBK 3GE1A 1M1KO 5C0YA 5HRSA 3RSEB 4CJRA 4M3YA 5B8HA 3SJJA 3ULEB 4CJVA 2IC3A 4DFMA 2KZMA 4BDZA 5M1FA 2P9NB 1BQNA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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