3OW2M

Crystal structure of enhanced macrolide bound to 50s ribosomal subunit
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 23S RIBOSOMAL RNA
molecule tags Ribosome
total genus 49
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
M PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ow2M00
3CC7N 3PIOL 1K8AO 1Q86O 2QEXN 1VQPN 5GAGP 1VQ6N 1YITN 3J7ZO 4WFBL 3CF5L 2ZJRL 1QVGM 1YI2N 3CMEN 1K9MO 4IO9L 2ZJPL 3OW2M 1KC8O 1YHQN 1YIJN 1YJWN 3CXCM 1Q7YO 1VQ8N 5JVHL 1JJ2M 1YJNN 1Q82O 3CD6N 5HL7L 1VQON 3CPWM 4WFAL 1N8RO 1OVYA 1NJIO 1VQ5N 3G4SN 3I55N 3CCRN 4UY8O 1VQ9N 5GAHP 5JVGL 1VQMN 1KQSM 1QVFM 2ZJQL 4IOAL 1M90O 1VQNN 1KD1O 1M1KO 5DM7L 3CCJN 4WF9L 1K73O 1W2BM 1YJ9N 4U67L 1VQ4N 1S72N 5GAEP 3CMAN 5H1SQ 4WFNL 5GADP 5MLCQ 4IOCL 3CCSN 1VQ7N 3CCQN 1Q81O 3I56N 3CC4N 3G71N 1ILYA 5DM6L 3DLLL 3CCLN 3CC2N 3CCMN 1VQKN 3CCEN 3PIPL 3CCVN 1VQLN 2QA4N 2OTJN 3CCUN 3G6EN 2OTLN 4WCEL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NOZA 4M7XA 3U6FA 3OJSA 4H4OA 4BC5A 3NF6A 3DXKA 1RT5A 4DV7K 3GL1A 3VESA 1VQPN 3OYKA 3V1OA 2NRRA 3ZEUA 3WEEB 4BRDA 2E5LK 3J7YP 3FZMA 4XH5A 3LDOA 1DTQA 1Z6RA 4PKGA 5AQLA 4E89A 4H8KA 1GLLO 3MK6A 4DB3A 2R7YA 1N5YA 4O55A 4I2QA 3GBTA 5KQ8A 1F21A 5GIPA 4JN4A 2FF6A 3RVCA 4FWLA 3VF4A 2P1JA 4M3TA 1GLEG 4JLHA 3V1RA 1S22A 4CJ3A 4I9QA 4O8KA 5HL7L 4ILGB 3THWB 4WFAL 3V6DA 4IEEA 1U6ZA 3C6HA 5K14A 1DKGD 3CJ9A 4BRPA 5AQFA 4CJQA 4DQPA 4DR5K 2WC9A 3ALYA 4NYNA 3BP8A 4O0JA 1KVCA 4JKCA 2VQFK 1ZBSA 3IDHA 4B3TK 1M1KO 3LDLA 3ZEUB 4JRPA 4I7FA 4L8RB 3I8BA 4WF9L 1C0GA 3R6MA 5AQRA 3VGLA 1SL2A 4BC3A 2E88A 5GAEP 3SPYA 2YJEA 4JS5A 4DLGA 4CBUA 2G8IA 4HCCA 2PZSA 3DI6A 3THYA 1XNQK 2F8SA 3AVKA 5HLFA 1X1PA 1TVRA 2ITGA 1RDWX 2V52B 4IOCL 1GLJO 4KH6A 1K6YA 2X78A 2X6NA 4IG3A 2HNYA 3I56N 4JI4K 4DV5K 4A62A 3SCXA 1HJRA 3MEDA 1NK7A 3DLBA 4BWJA 3P38A 3B8AX 4BRLA 4YFUA 2Q3SA 4FL9A 4MFBA 4DV6K 4E0DA 4CF1A 3CCUN 5C42A 5CR4A 2ZGYA 4M41A 3D2EB 3CM6A 3AAQA 4Z0UA 3HTVA 1TKTA 1KLMA 4ID1A 3IS9A 5CE3A 3P39A 1R59O 1ATSA 2W40A 4CZMA 3LP2A 3FE1A 3CETA 4IG0A 3CF5L 4WQ5C 3A8YA 2HVIA 1C0UA 1T44A 2VG5A 3SQ1A 3EE8A 4AQYK 3IRXA 4HVJA 4FWSA 2P9SA 2PYJA 4CD3A 2GBZA 5JVHL 4Y1CA 5DK5A 1YJNN 5KPRA 3V9ZA 2GELA 4OGEA 1N8RO 1D9DA 1CLQA 3I55N 3WNGA 4LSNA 4FLYA 4DMNA 4FPBA 5JICA 4DTPA 5JVGL 1QVFM 3V81A 3WXLA 4ILHA 3C65A 3VN5A 2B4JA 5FPNA 2UXBK 4CJVA 1S1UA 2QI2A 4BE1A 4RWTA 4DS5A 3VTIA 4CF2A 5FRMA 1YVUA 3U4LA 4M3ZA 4EP4A 1HLUA 2ASOA 1YJ9N 3ZSRA 4DLEA 4CHQA 5AQJA 3P31A 4K41A 3S41A 1YXQA 4BVOA 1WOQA 1JLFA 1FXXA 2RN2A 1MDUB 3MWPA 4O5BA 4JK7A 1ZBIA 3CCSN 2P9SB 1Q81O 4NXNK 5BREA 4B9VA 4FYDA 2E2NA 3M1FA 4HUGA 4KHYA 4NYFA 3LWLA 3A5NC 2NRXA 5KPZA 4K0KK 1UA0A 3HOSA 3UB5A 3VQ5A 2YHWA 3RMAA 4AILC 4FJNA 3M5RA 4WCEL 2ETJA 3W0LA 3WNFA 4Z4IA 4B1WB 3SBGA 1HYVA 1CXUA 3M3ZA 1HNVA 4QAGA 1SAZA 1YTUA 4GVMA 3RR8A 3R8EA 1JL1A 2F8TA 1NGGA 3HL8A 2DFFA 1XHXA 3BUZB 4CHOA 1YI2N 5LL6Z 1N34K 1JLAA 2I7NA 3O1BA 1LAWA 4CF0A 2O8DA 4E3SA 3QEVA 4LFAK 4N56A 3T1YK 4AHCA 4Z4GA 3MCAB 3O5BA 3NHGA 4ISEA 1TAUA 4CZFA 4CBWA 3FFKB 5AQYA 3VOVA 3DYAA 3KKSA 5FROA 3AVHA 3K5LA 2VG7A 3K9KA 3L3VA 4DQSA 3VGKA 1NU0A 4C1NK 3D6RA 4UQGA 4DKWA 1KD1O 4YORA 2ZWHA 4FJHA 4A2AA 1QS4A 2D4WA 1C6VA 5I9EB 4E7HA 1NNEA 1IV0A 4U67L 2Q31A 2PFUA 1JCEA 3LZIA 1JLQA 2HHXA 5AQWA 1RT3A 2P9KA 1RT1A 3QIOA 1IBLK 4JI1K 3H6EA 4E1NA 1HNZK 2FBXA 5FLXO 3CCQN 4OPHA 2O8DB 1WSEA 5AFUH 3WXMB 4A57A 2XHBA 3SV3A 1LWFA 1BISA 3Q7CA 1WBBA 4EHTA 2CGJA 4X64K 2PAVA 4GVEA 1NGFA 3IAYA 3KZBA 1XMQK 5AJ3K 4C8KA 3T3FA 5AQVA 5CHIA 2Z1HA 2KHOA 2RF2A 3KTQA 3TI0A 2NZTA 3HM8A 1P8ZA 3QMLA 1WNSA 1QQNA 5AQOA 4GV3A 1S9GA 4NXMK 4DQIA 3ZSOA 4OPKA 3H45C 4IBNA 3KD1E 4CHZA 3VETA 4CCHA 3ENOA 4M7YA 4IO9L 3NBPA 2VCPA 1NGHA 3RMBA 1NGBA 4YOVA 1KTQA 2P9KB 1LAVA 2VYPA 2P51A 4YNQA 4K8XA 4KHSA 2OPPA 4H0PA 1JJ2M 3WNEA 5J2MA 4OLBA 4HUFA 3OYJA 3U8XA 2NRHA 5AQPA 4GV9A 4LD0A 1NK0A 3LDSA 1HNXK 3SPZA 4CZGA 1W9HA 1XMOK 3FZLA 1RBVA 5C15A 2IVNA 1VQ5N 4DV3K 3LL3A 4BC2A 3CCRN 1WSJA 3D0PA 4Q0BA 4B1VA 3A0IX 3CERA 3D2FA 3NH0A 1LWCA 4BR0A 4PKHA 4BY9C 3AA2A 2FSNA 3AVNA 3HVRA 3UE5A 3AGKA 2HOEA 1SV5A 1X9JA 2VQEK 3G25A 1K73O 4Z94A 4CGIA 1RFQA 4FLTA 4FJIA 3DLEA 4Y1DA 3VQDA 3BGRA 4X62K 4CGGA 4KREA 4HHTA 4B9MA 4DSJA 2X6SA 3P5JA 4ZTJA 4OPJA 4KKOA 4DF8A 3LPTA 3HT3A 1QHTA 2Y1IA 1EWRA 1VSFA 1S1VA 3EKSA 1U47A 1LV5A 2F7TA 1W97L 1IKXA 1UA1A 4PY5A 3ZT1A 1B92A 1NG9A 3UKRA 3ZSVA 1HKCA 3PIPL 1Q9YA 1VQLN 3QFUA 1E4GT 4QS8A 4FJLA 3VF2A 3SBTA 3T7ZA 4J2EA 4CVNE 3EE9A 5AQZA 4KHQA 3E9OA 3D2FB 4ELVA 3MN6A 1J5OA 4LF4K 2A42A 1RDBA 1YITN 4YOWA 4CJLA 4CIGA 1VHXA 3KIOA 4DR2K 1BCMA 1N36K 1N32K 3H3NO 3K58A 1TUYA 3MX2A 2NLXA 2BGGA 4J2BA 3D45A 1KRPA 3CXCM 4E1JA 1TKXA 5AQQA 3LM2A 4AF1A 4FK2A 2XY6A 4IJAA 1UOCA 4IXCA 3O4WA 5DMRA 4FJJA 5F2RA 1RTDA 3VERA 3OYEA 2IOCA 3EYZA 2YJFA 3UKRB 3O9QA 1SKRA 1FJGK 1VSMA 3OYGA 5GAHP 4CD1A 1G15A 4KTWA 2QK9A 3QBXA 4FJ7A 2AJQA 3AO2A 5JS1A 2FBYA 3NVKA 4G1QA 4Z4HA 5HP1A 3VQBA 1XWLA 1S1WA 3AY9A 1Q8IA 5AZJA 3S3MA 4MLEA 3SAGA 4M3XA 2A5XA 1VSDA 4B9NA 4BG9A 1XUPO 3ZLJA 4JEPA 1TUUA 4DTRA 4KRFA 2O4IA 1XC3A 3V1QA 5AQSA 3NGZA 2YHYA 2ZD1A 4Z4EA 4CJRA 3M8QA 3TSPA 1HPZA 5JMVA 5J1EA 1EWQA 4ILJA 4GW6A 1GLAG 4E19A 2IAJA 4DFKA 3S3OA 3TWHA 4CZEA 4IOXA 3G0ZA 1H1VA 1A5WA 3OY9A 4DUZK 3O08A 4TSXA 5ADXH 1WSIA 1IG8A 1S3XA 3OBYA 4BRMA 4JHDA 3N4PA 4DSLA 3FZHA 5KGWA 2UUBK 1KVBA 3F2KA 4CK1A 4RW9A 3OYCA 3T1HK 1Z05A 2FC0A 4CEZA 1HPMA 5I42A 2F4VK 4KAZA 1CZ9A 2PY5A 3VEYA 2WFBA 3SUOA 4B9LA 1Y64A 2EHGA 2UXCK 1DLOA 2QWNA 1REVA 3FZKA 3L2WA 4GNIA 2GTDA 5C25A 4N5SA 3OS0A 1U4BA 2Z1IA 1X3NA 4CJ7A 4H0OA 4N47A 4J2DA 3KLHA 4OKJA 4CFCA 3RSEA 4JKEA 3TAMA 4BR2A 3OYDA 4H0VB 5BN9A 3QNOA 4FJ5A 4JK9A 1N33K 3TANA 3ZX2A 4H0TB 1VSLA 4YOYA 4ICLA 2P9LA 1EKEA 5AQKA 4FJMA 3VQPA 3ZSQA 3T19A 4CF9A 3VEVA 1XQSC 4LC9B 1ZBUA 2P9UA 2QKBA 3MMVA 2E6MA 4IDHA 5HRSA 4OKKA 1LW0A 3O9TA 5KRSA 3VPZA 1JLBA 4BRKA 1HR0K 3DM2A 2RPIA 3IFRA 5LMNK 2UUCK 4Y0WA 3OJUA 4HUEA 1BGXT 1KAZA 3O3FA 3DWLA 5KQDA 3DLRA 3KK1A 3CC4N 1DT9A 2E8AA 4IJNA 4M63C 3VENA 5HROA 5DM6L 2ZM6K 3DXKB 1K8KA 4DTUA 3NMUA 3RSEB 3WNHA 3PX6A 3PY8A 5AQTA 1NGDA 4LF5K 2GWJA 3KLEA 2BUPA 2P9NA 3TABA 1B9DA 3EZWA 3CC7N 2P9LB 3JYTA 1HKBA 1RDUA 3MAQA 3CI5A 4KHUA 3O3GA 4DWIA 4H5WA 1ATRA 2P9UB 3RR7A 4JI8K 1NJYA 3NGIA 5AZIA 3AV9A 3GG4A 1KLNA 3J81O 4CJ5A 3MX5A 1L3TA 3ASMA 4EP5A 3SMPA 2ATQA 3TTFA 4B9QA 4FWMA 3NFAA 3H1QA 1NKCA 1RDDA 3RMDA 4C8NA 4LFCK 3NAEA 1NK4A 2HHHK 5EU7A 2HBMA 5KTQA 5M1OA 2YI1A 5FPEA 3K5MA 4FM0A 4GV6A 1K8KB 2X74A 4QS7A 5AQNA 5FDLA 1U49A 1OVYA 4CGJA 2NUBA 4JKDA 2IIRA 2YX6A 4KH5A 4A61A 4RW7A 1HNWK 5AQIA 1NMDA 1T3VA 1VSHA 2YNHA 5C2DA 3THYB 3O9UA 3IMXA 4IOAL 3HK2A 4BRAA 5BR8K 5HRPA 4F3TA 3MXMA 3O9RA 3P83D 2HMIA 4FM1A 3TPQA 3RWUA 4DV4K 4H5RA 2HHUA 5AZIB 1FKOA 3KVGA 4W5NA 4H0XB 4NCGA 4B1XB 4NB4A 1SQKA 4HCBA 1U04A 2OZMA 2IGIA 2YNIA 3O80A 4FOEA 5M1QA 3QIPA 2D0AA 4B9SA 1ITGA 3AVBA 4B1UB 5EY4A 2QWPA 1VSJA 1C0FA 3AVFA 1QE1A 4DUYK 3QESA 4RW8A 2Q36A 1ASVA 3NH2A 1SUQA 3CCVN 2DPNA 3G6EN 3AARA 3JXUA 1CZBA 1DGKN 5KI6A 4CFAA 4YDUC 4CJFA 4H4MA 1BIUA 5LMUK 2HNDA 3KWIA 4N41A 3TAQA 4EZ9A 4JI7K 4CEQA 3UKUA 2Q0UA 2VGMA 4DF4A 3EKUA 5KRTA 1D9FA 3W3DA 3FZFA 5BR9A 4O5FA 3S9HA 3CJ7A 4DU1A 1RBSA 1QVGM 1EO1A 3SUQA 4OO1J 3T69A 4H5TA 1HKGA 1S6PA 1KC8O 5D3GA 3K0SA 1YIJN 3LDNA 4FPAA 5SZTA 1YJWN 3ZSWA 4OJRA 4CGDA 2YNGA 2OYQA 4Z4FA 4DFMA 5CZ2A 1BUPA 2FXUA 2CGKA 3QFPA 4RG8A 2GUPA 4BR7A 1WSGA 3TTDA 4ISGA 1NK6A 2FBVA 1R0AA 4ZTFA 4K25A 2FSJA 4DTMA 4BRQA 4CHPA 1VAZA 4C8OA 3EZ5A 1VQ9N 4LF9K 3ID6A 3EEQA 1KQSM 3ITHA 3MEEA 2D0CA 1NGCA 2ASMA 3WXJA 4H5NA 2VWJA 5BPLA 1T03A 3TAEA 2RE2A 2E1ZA 4JRQA 4CESA 4CZLA 4DU3A 4Q5VA 3UKUB 3VEOA 4CEOA 3SAFA 1ZYQA 2E2OA 4KPYA 3B6PA 1JL2A 2HBLA 2XY8A 4YHHK 2O8FA 4I6MA 4JS4A 4KI4A 2DFHA 3AAPA 3FLCO 4BGAA 2FBTA 4FXDA 2YHBA 1V4TA 2BE2A 3AO3A 3ID8A 3PLAA 5KPTA 5GIOA 2OA8A 3CFRA 1ZBFA 2O8CA 3CFPA 3C6UA 4FW1A 1HNIA 3ENHA 4C8MA 2Z1GA 1E3MA 4FWOA 4GKKK 3U9DA 3VA3A 2E6LA 2VWBA 2YKMA 1VQKN 1BQMA 3OS1A 2Q2RA 4DFJA 3L2UA 1B9FA 4FZYA 1TAQA 4L3QA 3F9KA 1HX1A 2QXFA 3SK3A 1N6QA 2KZZA 1SL1A 3I0SA 3PIOL 4JI0K 3OA9A 3MEGA 3ULDA 3L0QA 1W2BM 4V19S 4FLWA 1HYSA 3D7EO 5IT9O 3G10A 4WYBA 4WFBL 4J8FA 4BDYA 1SS6A 3OYLA 4B3MK 1T6CA 3QLHA 1X3MA 5AQXA 2O8FB 4AHTA 4I6MB 5J2QA 4DTOA 3QEXA 3VGMA 3EL2A 5KGXA 3QERA 4CECA 3J8AA 5C12A 1W0HA 3CHWA 3WUHA 2WONA 2HHQA 4CZKA 4FZZA 4FJ8A 4QCLA 5AQUA 4JYAK 2F9TA 1J53A 4DR3K 4JAXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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