3P4IA

Crystal structure of acetate kinase from mycobacterium avium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
ARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIESSPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetate kinase
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium avium
total genus 123
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2010-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA02
1HLUA 4LC9B 5BN9A 3LDQA 2I7NA 3VF2A 4CZEA 4Z94A 5LY3A 1TYQA 3VPZA 4BRQA 3AARA 4BQZA 3VGLA 4FSVA 4QS7A 1G99A 3CJBA 4AM7A 2V7ZA 3WQUA 2E2QA 1K8KA 4CBWA 4FWNA 4M7YA 3CQXA 3MMVA 2GELA 5JICA 1X9JA 3HBTA 2P9IB 1C0GA 2ZWHA 1TUUA 2W40A 4MO4A 5AQMA 2Q1NA 3FR0A 1KAYA 4IJAA 5BPLA 4BR7A 1Q18A 2YJFA 3EKSA 1RDWX 3C0BA 3D2EB 1X3NA 5AQRA 5KQDA 3WT0A 2D0PA 1Z6RA 3JS6A 4IJNA 3HSCA 3VGKA 2FSNA 3U9ZA 4BRNA 2HF3A 3VEYA 4FWMA 5BREA 4NB4A 3AAPA 4B1UB 5AFUH 3TPQA 2YHYA 3H3NO 3M1FA 3ULEA 2QWRA 1NBWA 4CZHA 5B8HA 1XC3A 2Q0RA 4PKHA 5AZJA 3SMSA 2P9NB 4FWSA 4E1JA 1ZXOA 3MN7A 3M3ZA 5AQSA 1LCUA 2QWNA 2YCHA 5KPZA 4BROA 4BRCA 4CZLA 4CD3A 1RFQA 2A3ZA 4H0OA 5TKYA 4K25A 5EX5A 4CBUA 3I33A 5ELZA 5AQWA 4M7XA 4RWTA 3O4WA 1T44A 1T6CA 4BR9A 2VWBA 2E20A 3EN9A 5AQOA 2J4RA 4EAHD 5BRFA 3UKUB 3ZETB 1BOTO 1TUYA 4WQ4C 2QWOA 3S41A 4CI6A 3FZFA 4GNIA 2VCPA 4DB3A 4F9OA 2WUSA 4BRFA 1U2VA 4BR5A 3BUZB 3FZKA 3CJ9A 1H1VA 2KHOA 5E26A 2A6AA 3EL2A 5AQIA 1HX1A 2AP1A 2QWQA 3KVGA 1S3XA 2FSJA 2P9PB 3C7NB 3DXMA 3O08A 5EVZA 3LDOA 3QMLA 5BPNA 3QFUA 1XQSC 1NLVA 2P9KB 3WUHA 3R8EA 5AQHA 1U6ZA 5EXWA 1DKGD 3SJHA 4FWOA 3ATVA 2GUPA 1ZC6A 2QWPA 1J6ZA 1P8ZA 3ZEUB 4I6MB 4ISFA 3CJCA 1QZ6A 3L0QA 3U4LA 1ATRA 3KZBA 3CIPA 3O1WA 3AY9A 3UKRA 1QQNA 3R9PA 4BREA 3KHYA 3B8AX 3D2FB 5AZIB 3LM2A 4O5FA 4BRKA 1HKBA 3CJ7A 3FGUA 1NGJA 1WOQA 3M6GA 3FZLA 4BVOA 1YUWA 3ZX2A 3H46O 1ZBSA 2PBDA 2HOEA 4CZMA 3A5OC 5ADXH 1MA9B 1NGHA 4KBOA 1NGDA 3BF1A 4FOEA 2F9TA 1LOTB 2FF6A 2ZGYA 4M63C 4WYBA 2PAVA 3QICA 5AQZA 4ISEA 2VYPA 5FPNA 1NGAA 4WQ5C 5KPRA 2P9SB 4FPBA 4HWIA 2OANA 1HKCA 4K42A 4CZJA 1R59O 1NM1A 3O80A 2GWJA 2E1ZA 3FLCO 4JHDB 1NGFA 1NGIA 4BVPA 3MN9A 2Q0UA 3L4IA 1GLFO 2QXLA 4EFHA 4B1XB 1GLCG 5ADXA 1TYQB 3UE5A 4BRAA 2D4WA 3D2EA 2GTDA 4CZGA 3DJCA 4EIAA 1NGEA 1QQOA 1K8KB 3IFRA 4YDUC 3O8MA 3VEVA 4FO0A 4K41A 4MO5A 2IVPA 2BUPA 4B1VA 4BC4A 1V4TA 5AQKA 3FE1A 5EOYA 4BR0A 4WQ4A 1SZ2A 2P9NA 3SK3A 4JN4A 2UYTA 3EO3A 5BRHA 4DQ8A 3MN5A 2D0OA 3W3DA 3CJAA 1BG3A 4BG9A 2A5XA 3A8YA 2QM1A 4H0XB 4BRDA 3GE1A 2YJEA 1HKGA 2CH5A 2FXUA 3H3OB 2ZF5O 2HF4A 5JLFA 2V52B 1BUPA 4CZIA 4B1WB 4MLEA 4CD1A 5AFUA 2QWMA 4PKIA 1GLLO 4RCHA 4PL8A 2GEMA 5AQPA 4RTFD 2P9UA 3TU5A 3UKUA 3ZETA 4L3QA 2CGLA 3D7EO 2CH6A 1GLBG 1GLEG 4H5NA 5AQFA 5E84A 1QZ5A 3RSEA 3WXLA 3CJ1A 1OKJA 4H5RA 3VERA 3HTVA 5AQUA 1NGCA 3QBXA 3G25A 4H5WA 4B1ZA 2GWKA 2ZGZA 4BRMA 1QQMA 1ATNA 2E2NA 3MK6A 3MCPA 3QB0A 4FOIA 1NMDA 3C7NA 1X3MA 4A61A 4ISGA 4BRLA 1GLJO 5BRDA 4BR2A 5AQLA 2QWLA 4CZKA 4BGAA 3W0LA 4JNEA 2HMPA 5BPMA 2V7YA 4XH1A 5F2RA 3HI0A 3O1BA 4PL7A 4BG8A 1BO5O 1JCEA 4I6MA 3DXKB 3FZMA 3WXIA 3WXJA 4QS8A 4BGBA 3EZWA 1JCFA 4A2BA 4J8FA 1JCGA 3H1VX 2Q97A 1BDGA 3VESA 3VOVA 5AZIA 4A2AA 3J8AA 3VEWA 3WXKA 3R6MA 3ZX3A 4GY2B 1NGBA 4IXCA 4JD2A 3LDPA 1CZAN 1ESVA 4EHUA 2E2OA 2P9LB 4BC2A 3GL1A 3WEEB 2QW9A 2FF3B 3H45C 1GLAG 1YVNA 4IZ9A 2E8AA 3UKRB 1XUPO 3H1QA 3LDNA 3O5BA 3QFPA 4BC3A 2FSKA 3ENHA 1HJOA 4YDUA 2A42A 1MWKA 2A40A 2A41A 3P4IA 3CHWA 1T6DA 3JXUA 1WUAA 2H3GX 4BC5A 5F0XA 3GDQA 4MLHA 4DHYA 2P9IA 2I7PA 4FWPA 4JHDA 3VF6A 4FL9A 1YAGA 2NLXA 5AQJA 4BRGA 1YXQA 1DGKN 3ATUA 1RGIA 2NRHA 3QBWA 1IG8A 1SAZA 2EWSA 4H0VB 3IMXA 4FWQA 4FPAA 5BN8A 3MN6A 3U8XA 3VEXA 4H5VA 2ASOA 5I9EB 2NZTA 5CE3A 1ATSA 4XEIA 3LL3A 5LJWA 4H03B 4HTLA 1QHAA 1IJJA 2E2PA 3HM8A 5AQVA 2FLOA 4CZFA 3HZ6A 4NO7A 3A5LC 3CI5A 3BF3A 4K43A 3VGMA 5KPTA 2IVNA 1BA0A 3BP8A 3GOIA 4B9QA 4C23A 3MDQA 4IO8A 2Q31A 1HPMA 5AQGA 3DWLA 2E1YA 2D1KA 3GBTA 5EY4A 3ULEB 4BRIA 2IIRA 1BU6O 1V4SA 2ASPA 2V51B 3CQYA 5AZJB 2CGKA 4JAXA 5AQQA 5FPMA 3VF4A 4O8KA 1E4FT 2YHXA 3VEZA 3VETA 3EKUA 4AM6A 3SLCA 4CJ7A 4BRHA 4Y0WA 3A5MC 3AAQA 3CETA 3ZX0A 4QS9A 2YI1A 5LJVA 1DEJA 2CGJA 3H6EA 3LM9A 5AQNA 2Q36A 3F9MA 3CERA 4CBXA 4FWLA 4PKGA 2P9UB 3VEOA 3SMPA 2P9PA 3FFKB 3BEXA 1D4XA 4BRPA 2E88A 2DPNA 2BTFA 4B1YB 1C0FA 1HUXA 5AQYA 4FWRA 4FWKA 4EHTA 3L6QA 3LDLA 2P9KA 3RSEB 1U2VB 2YHWA 1SQKA 4XH4A 1GLDG 3ZEUA 3I8BA 1Z05A 4DCHA 5BR9A 4H0TB 1MWMA 4WQ5A 5FPEA 2AA4A 2Q2RA 3DXKA 1E4GT 5FPDA 3DXMB 5AQTA 3A5NC 3D2FA 3IUCA 5JMVA 1EQYA 4BQLA 3GG4A 1BWFO 3DAWA 4A62A 3O6WA 5JLHA 1MDUB 1NWKA 2ITMA 1Y64A 5AR0A 2P9LA 4H5TA 3WEEA 3OHRA 3WQTA 2F9WA 3A0IX 2IVOA 4H0YB 4H0PA 3VENA 4BR4A 5KQ8A 2ASMA 3ID8A 3U9DA 1BA1A 4IWVA 1NGGA 2P9SA 1S22A 3ENOA 3IDHA 2W41A 4XH5A 3QDKA 3FZHA 4JD2B 1KAXA 5F1XA 3UB5A 1KAZA 5AQXA 1KXPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V1QA 4KHWA 1C0UA 1XC9A 4LF7K 4DSJA 2HB5A 4QS7A 4JI2K 3OYMA 4ZHRA 4FVMA 1HRHA 4KH4A 3THVA 3CQXA 4L8RB 4CJEA 3V9ZA 1X9JA 4N5SA 3G6EN 1C0GA 1TUUA 4DU4A 3OS2A 5AQMA 3CG7A 1KAYA 2P5OA 3EKSA 4CJRA 2B5JA 3TAFA 3KJVA 5KQDA 2D0PA 1Z6RA 3JS6A 4IJNA 1NJYA 3NBPA 2E6MA 3SPZA 4NB4A 3AAPA 1FK9A 1S1XA 4HCBA 4O0IA 1JLAA 1NBWA 4K0KK 4F2RA 1BQNA 4E1JA 4BY9C 1WSFA 4W5OA 4DTOA 3SPYA 4KKOA 3MN7A 1YJ9N 1UAXA 4DQQA 3P83D 1RBTA 2HHQA 1K8AO 4CZLA 1ILYA 1RDUA 5TKYA 2FBTA 3VQ5A 3VA0A 4RWTA 2NRZA 1T44A 1T6CA 2F8SA 3EN9A 1KVBA 4EAHD 2J4RA 4KPYA 4FYDA 4DQRA 4IG3A 4BE2A 2YNIA 5CYQA 4YNQA 2UXCK 4E7HA 2VCPA 2D0AA 3TTFA 4DB3A 4DU1A 2JWLA 2OPPA 2WUSA 4BRFA 4ZTFA 4NLCA 5T7BA 3K9JA 3CC2N 5D3GA 5E26A 5M1QA 1VSKA 5AQIA 5DMRA 3V1OA 1T3VA 2IS3A 4KHPK 1S3XA 2FSJA 2P9PB 5M1FA 1N34K 3WXMB 2DFFA 5EVZA 2OPRA 3QFUA 3OYHA 2OCEA 1W9HA 2P9KB 2HHHK 5GAHP 5AQHA 1RTIA 1TVRA 1N32K 4KB0A 1P8ZA 3O4QA 3ZEUB 4JI0K 1GOAA 2FC0A 4CHYA 3NGIA 1LAVA 1SV5A 3C6HA 3LPUA 3U4LA 2HBMA 3KZBA 3AO4A 3CIPA 1BL3A 1YVUA 2O8DA 3B8AX 1DLOA 1ASVA 2NRWA 1RTHA 3FZLA 2NRTA 3T3FA 1YUWA 2NRVA 2WFBA 2HOEA 3AO5A 5ADXH 2PYJA 3K5MA 1VQ6N 1NGDA 3I56N 5FRMA 5FLXO 5AQZA 5FPNA 4WQ5C 4FM2A 2Y1JA 5GADP 5KPRA 1XNQK 4DTSA 4FPBA 1DT9A 1WSHA 3CFRA 1RTDA 2OANA 3ZSZA 3HK2A 3L4QA 1R59O 3TSQA 1ZBHA 2GWJA 1NK7A 4JHDB 4RW6A 4BVPA 4MDAA 3MN9A 4CEAA 3AA2A 2QXLA 1GLCG 3M8QA 4M41A 2D4WA 3D2EA 3ZSXA 4CZGA 1IKWA 4OO1J 1T05A 3MX2A 1NGEA 1WN7A 2Z1HA 3IFRA 4CVNE 3J81O 1L3TA 4YDUC 2RKIA 2HBJA 2HW3A 4AILC 3L8BA 2IC3A 3ASMA 3Q7BA 1NJIO 1XNRK 2BUPA 3V4IA 4A59A 3OS0A 3AVIA 1TKXA 4IKFA 2DTUA 1WSIA 3IG1A 1JLBA 4I9QA 4EZ6A 5BRHA 3MN5A 3W3DA 1ZBLA 3A8YA 4FJIA 2FBXA 4DSIA 2X6SA 2FXUA 4DV7K 2OA8A 5JLFA 1TKDA 2WOMA 4B1WB 3CC4N 3P1GA 2YNGA 3EY1A 2Z1IA 4DV3K 2GEMA 5AQPA 2P9UA 3ZETA 3O3HA 2WTUA 1GLBG 1GLEG 4Z4FA 3B6OA 3CJ1A 2ETJA 5IWAK 2LSNA 1TKZA 3QBXA 4DTRA 4W5QA 1X9MA 2GWKA 2ZQBA 1X1PA 4LSLA 4JKGB 2KZZA 3ZSRA 3HP9A 3MK6A 4BDYA 3MCPA 4JI5K 1YT3A 5HRRA 4E7IA 4BRLA 2QK9A 1XI1A 5BRDA 3PX4A 3VN5A 3W0LA 3TTCA 1R0AA 1BO5O 1JCEA 4I6MA 3IRXA 1A5VA 5TKWA 3T19A 3WXJA 4BGBA 5CHIA 1HJRA 4GV6A 4A2BA 4JI6K 4J8FA 2QI2A 1BDGA 3VESA 1N36K 1J5EK 1E3MA 3TABA 3CFOA 3EE8A 4IXCA 2PZSA 3LDPA 4GKJK 1CZAN 4KRFA 1ESVA 3JSMA 1NJWA 4EHUA 2E2OA 5HRNA 2FF3B 1QSYA 4JK7A 3CCEN 1YVNA 3H1QA 3QIOA 1RT5A 2FSKA 4BE0A 2BGGA 4FLWA 3NHGA 4U67L 3ZT4A 1VHXA 3BY5A 4DTJA 4YDUA 3SCXA 2A42A 4O8UA 1MWKA 2A41A 1WNSA 4FJ9A 4BE1A 1KQSM 4PY5A 2H3GX 4IBNA 1SL2A 1ASUA 4C8LA 3K2PA 4DHYA 1YTAA 2ATQA 3VF6A 2VQFK 4FWPA 2OPQA 4JI3K 2BE2A 1Z25A 2NLXA 1VSLA 3MAQA 3V9UA 1BGXT 1RBVA 1DGKN 4CK2A 4DV2K 2NRHA 2HMIA 3QBWA 1SAZA 1KD1O 4LY7A 2DFHA 3CCRN 4H0VB 5C12A 3IMXA 4FWQA 1N8RO 4KHSA 5I9EB 2NZTA 2P51A 1ATSA 4XEIA 5LJWA 2E2PA 1WAJA 3HM8A 4I7FA 3QERA 5LMNK 4WFBL 3BF3A 5KPTA 3ZT3A 1BA0A 1C1AA 3SI6A 1XMOK 1HMVA 2Q31A 3VQ6A 3KK2A 1HPMA 1WLJA 2XHBA 5AQGA 1Z26A 4CJSA 4LF9K 2E1YA 3GBTA 5EY4A 5IT9O 2ASPA 1V4SA 4FJ5A 1U49A 4NCGA 1L3SA 3G71N 1W0HA 4DS5A 3KTQA 4JAXA 2PYLA 3DOKA 5FPMA 3LWMA 3VEZA 4F4KA 3SLCA 4CJ7A 5CY4A 4BRHA 4Y0WA 1TL3A 3AO3A 2Q3SA 4DTMA 4M3RA 3CXCM 3E9PA 4CHZA 3QEXA 3LM9A 5AQNA 4DR7K 3F9MA 3PUFA 4YOVA 5JVHL 1KLMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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