3P4IA

Crystal structure of acetate kinase from mycobacterium avium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
ARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIESSPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetate kinase
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium avium
total genus 123
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2010-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA02
4YDUC 3L6QA 1Y64A 4BVOA 3LDQA 3P4IA 3VEYA 4BROA 1LOTB 4LC9B 5TKYA 3ULEB 3BF1A 4CZKA 3MN6A 5KPTA 2Q1NA 3W0LA 1QQOA 1QZ5A 2NRHA 1BG3A 4FWOA 1XQSC 5AZJA 3G25A 2EWSA 2QWRA 3VGLA 1GLJO 1S3XA 3A5LC 2Q0UA 3HM8A 3EN9A 1GLAG 5AQWA 5BPNA 5AQRA 1IJJA 4BG8A 3CQXA 3VENA 5AQPA 4CZEA 2ASOA 2QWLA 3QFUA 4I6MB 4FOEA 1QHAA 1YVNA 5AQOA 4GNIA 4BGBA 3J8AA 3UKUA 1NBWA 4K42A 3MN9A 5FPDA 3M1FA 3LDNA 4WQ4A 3IDHA 5EVZA 1V4TA 5AQJA 4CZGA 4A2AA 1TYQA 2VYPA 5AQZA 4K43A 1MWKA 4CD3A 3FZFA 2HF3A 3C7NB 3VGKA 3W3DA 1RFQA 4B1XB 1LCUA 3RSEA 4FWNA 1G99A 1J6ZA 5BRDA 1BA0A 1SZ2A 5AQUA 3DWLA 2I7PA 4ISEA 2P9PA 3DXKA 2ZWHA 2E88A 2QM1A 4H0TB 3AY9A 2YHYA 1SAZA 4F9OA 1GLLO 3D2EB 2FSJA 3GOIA 2KHOA 4K41A 3H3OB 2PAVA 3O8MA 5LY3A 3GE1A 3A5NC 4BR0A 1D4XA 3CJAA 1CZAN 1X3NA 4FWQA 2A3ZA 1NGFA 2YJFA 3S41A 3D2FB 4DCHA 1XC3A 2CGJA 3DAWA 2ZGYA 1DEJA 1BUPA 3F9MA 4IJAA 4MO4A 4NO7A 4B9QA 3TPQA 2P9NB 3U4LA 3FR0A 5JLFA 1T6CA 1BO5O 2VCPA 2ZGZA 1YUWA 4WQ5C 5ELZA 3WEEA 3O5BA 3CJ7A 4IJNA 1NGBA 5FPNA 2IVOA 5AQQA 3LM9A 3B8AX 3QB0A 2P9KA 5AQMA 5CE3A 3SJHA 5I9EB 4A2BA 1NGCA 1X3MA 5AQKA 3H1VX 3SMSA 2P9IA 1YXQA 4ISGA 1YAGA 2FXUA 4QS9A 4RTFD 2FSNA 5AZJB 4CBWA 2W40A 2ASMA 3R6MA 5ADXH 3FGUA 3WQTA 3HZ6A 1Q18A 2GEMA 3O80A 5E84A 4AM6A 2E2NA 2HF4A 3A5MC 4CBUA 4FWKA 2GTDA 3CJ1A 4B1WB 3D7EO 2ASPA 1NMDA 5JLHA 3HI0A 3VEOA 3QDKA 1TUUA 4WQ4C 3IUCA 1ATNA 3DXMA 1ESVA 4H03B 3UKUB 2PBDA 3HBTA 3ID8A 1S22A 3DJCA 3M3ZA 4M63C 4WQ5A 5KQ8A 2GWKA 5AQIA 3LDPA 4A62A 3CERA 3TU5A 4L3QA 3LDOA 3MCPA 3C0BA 3RSEB 4CZHA 5B8HA 3IMXA 4JN4A 4IXCA 3AARA 2P9PB 3DXKB 5AQGA 3O1WA 4XH4A 3O6WA 3VF6A 4FSVA 3SK3A 5JMVA 4JHDA 2CH5A 2NLXA 4MO5A 2AA4A 2GWJA 3AAPA 1KXPA 5BN8A 5AZIB 2Q31A 4BRLA 1E4FT 5BRHA 4Z94A 1GLFO 3ZEUA 3CJBA 4MLHA 4QS8A 3KVGA 2P9LA 3VERA 3QBXA 3KHYA 1HPMA 1WUAA 2FF6A 2FLOA 1TUYA 5AQVA 4H5TA 3OHRA 2GUPA 4WYBA 2HOEA 4EHTA 4NB4A 3ZX2A 3I8BA 5FPEA 1QQMA 3VEXA 3ENOA 1JCGA 2A41A 3VEWA 3H3NO 2AP1A 3VEVA 2QWOA 4IWVA 4HTLA 4PKHA 3WEEB 1E4GT 3CETA 2P9UA 2Q36A 4H0VB 4PKGA 4BC3A 1T6DA 4HWIA 3ZETA 2V7ZA 2P9KB 4BRNA 4FWRA 5LJWA 5EOYA 2V52B 4FO0A 1HJOA 1KAXA 2D4WA 2P9SA 1NGAA 3I33A 3FZKA 2P9IB 3FZHA 5KQDA 4H0PA 2FF3B 4JAXA 1WOQA 3ULEA 2HMPA 1HKCA 1NGHA 1NGGA 4H5NA 4DB3A 3MN5A 2E2OA 3WUHA 3SMPA 3GBTA 2E2PA 1RDWX 3UKRA 1ZBSA 1MDUB 2Q0RA 3CI5A 4BRQA 4AM7A 3LM2A 2CGKA 2IIRA 4BRKA 3DXMB 5FPMA 5AQYA 5AR0A 2BTFA 2E8AA 5F2RA 3CHWA 4Y0WA 5LJVA 3WQUA 3QICA 4CJ7A 1DKGD 3JS6A 2E2QA 3MMVA 4BG9A 4EIAA 1U2VA 2H3GX 3A8YA 3VGMA 1GLDG 5AFUA 3LDLA 2ITMA 4B1ZA 3VPZA 1ATRA 3WXIA 3VF2A 5KPZA 1BWFO 3SLCA 3U9ZA 1GLCG 1JCEA 1ZXOA 2Q2RA 1OKJA 4C23A 1T44A 1R59O 3MN7A 4JHDB 2YCHA 2D1KA 4KBOA 4BRCA 1NGEA 3HSCA 4BRGA 4FWLA 2GELA 4A61A 5AQSA 3JXUA 3ZEUB 1BDGA 1QQNA 4CZFA 3CIPA 5BPLA 4BRIA 1SQKA 2F9TA 1U6ZA 4BR2A 4BRHA 3WXLA 2FSKA 2V51B 2I7NA 3LL3A 5F0XA 1TYQB 4MLEA 2QWNA 1NGJA 3EL2A 3EKSA 3UE5A 3R8EA 5EX5A 4M7YA 2D0PA 3ENHA 2YHWA 4K25A 2P9NA 4RCHA 3ZX3A 4FWPA 4BR7A 4BRPA 1H1VA 2P9UB 1V4SA 3MDQA 3HTVA 1K8KA 1GLEG 4JD2A 5AQXA 1NM1A 3ZETB 4FWMA 3QMLA 5AQLA 2P9SB 2WUSA 2VWBA 1HKBA 1X9JA 4H0XB 2A42A 3H1QA 3AAQA 3U8XA 1KAYA 3CJCA 4H0OA 1KAZA 2J4RA 4FPBA 1HX1A 3QBWA 4QS7A 3WXKA 1NWKA 4BC5A 3L0QA 4PKIA 2W41A 1NGIA 5EY4A 5KPRA 4O8KA 4EFHA 1ZC6A 3M6GA 3UKRB 3IFRA 1BU6O 4PL7A 4CZIA 4CBXA 3O08A 1GLBG 1Z05A 3KZBA 2OANA 4XH1A 3MK6A 4CI6A 1P8ZA 2IVNA 4BRDA 3R9PA 1EQYA 2CH6A 4BC4A 1IG8A 4JNEA 4FWSA 1MWMA 2E20A 4RWTA 4BRMA 5JICA 3FFKB 1U2VB 4BR4A 4DHYA 4EHUA 1NGDA 2QWMA 2V7YA 5EXWA 3VEZA 3CJ9A 1MA9B 2UYTA 4H5RA 3FLCO 3ATVA 4XEIA 4BQZA 3GG4A 4YDUA 1C0GA 2NZTA 4BR5A 2IVPA 2YI1A 2QW9A 4IO8A 5BREA 3O4WA 1HUXA 3ATUA 3ZX0A 4PL8A 3UB5A 3QFPA 4BQLA 4B1VA 4CZLA 4IZ9A 2A40A 4BGAA 3VOVA 2CGLA 1BA1A 5AZIA 4BC2A 1RGIA 3CQYA 4BRAA 3H46O 4I6MA 4DQ8A 3GDQA 1JCFA 3BF3A 3BUZB 3VF4A 4BR9A 3FZMA 3EKUA 5AFUH 5AQTA 2Q97A 1C0FA 4ISFA 2D0OA 5BPMA 4J8FA 3VETA 4BREA 2F9WA 3C7NA 1HLUA 3BP8A 3O1BA 4FOIA 3FZLA 4O5FA 4H0YB 1K8KB 2BUPA 5E26A 1XUPO 4CZJA 4JD2B 1DGKN 4B1YB 3FE1A 4M7XA 2A5XA 5BN9A 1NLVA 5BRFA 5BR9A 3D2EA 5AQFA 2A6AA 4EAHD 3H6EA 5AQNA 1BOTO 4FL9A 2E1ZA 2QWPA 1ATSA 3GL1A 4XH5A 4BRFA 2P9LB 4H5VA 4FPAA 4BVPA 1QZ6A 4E1JA 1HKGA 3WXJA 3BEXA 3H45C 4CD1A 5ADXA 3EZWA 3D2FA 2YHXA 4CZMA 3L4IA 3EO3A 3WT0A 3VESA 3A0IX 2E1YA 4B1UB 2QWQA 4H5WA 3A5OC 3U9DA 5F1XA 2YJEA 2ZF5O 2DPNA 4GY2B 2QXLA 5AQHA 1Z6RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PUFA 4BY9C 3I55N 1DLOA 4B3TK 4JRQA 3V1OA 3QEVA 3A2FA 3BZCA 3THXA 3RMCA 3MN6A 2Q1NA 1UAXA 2WTUA 1IBMK 2QWRA 3BGRA 3TI0A 4PUOA 5AQWA 4OVLA 4DV5K 1QVFM 4IEEA 4E19A 1RDUA 3AO3A 2KLAA 5AQPA 4CZEA 3CPWM 4NCAA 1S6PA 5AQOA 3CCEN 5C10A 1S5JA 4CK2A 1XC9A 3KLEA 4FZXC 4LF6K 3LDNA 4WQ4A 4LF4K 5EVZA 4CZGA 4A2AA 1L3TA 4CD3A 1MWKA 4JI1K 3FZFA 3KJVA 1WAJA 1BQNA 4E1NA 3ZSOA 2NRZA 4J2BA 3RSEA 4FWNA 1J6ZA 1HNVA 2YX6A 3DWLA 1JJ2M 2P9PA 4H4MA 2ZWHA 4DV3K 4IOAL 3AY9A 3S3MA 3KKRA 5HLFA 4G9ZA 3EE8A 4ICLA 3RRGA 2KHOA 2B4JA 1KRPA 4DSEA 4K41A 3EZ5A 1S9GA 2PAVA 4KHUA 2O8DB 1BCOA 1JLAA 3CJAA 4GW6A 4FWQA 4M3UA 3AVJA 1TK8A 1NKEA 2A3ZA 2YJFA 4DCHA 1YTUA 4UQGA 1J5OA 4CK1A 3ITHA 1DEJA 4MO4A 1TAUA 3QEWA 2RPIA 2QKBA 1T6CA 3SQ2A 3DOLA 2O8EA 4CIEA 3V6DA 2XHBA 1NGBA 1X9MA 4ELVA 1NOYA 4MFBA 5CYQA 5FRMA 1VQMN 3DRRA 4A2BA 1S1TA 4F2RA 2P9IA 1NNEA 3TAMA 1JLCA 2JWKA 5AZJB 5CR4A 1YITN 2W40A 4DV1K 3CCSN 3SPZA 2ASMA 4KV8A 3OS0A 5I3UA 4KH5A 4CFDA 3O80A 5E84A 2E2NA 1LAVA 4CIGA 1TKTA 1NMDA 5JLHA 4C8NA 3VEOA 4FJNA 3LANA 1D5AA 4WQ4C 1IKYA 1RT7A 3UKUB 3HBTA 3AVFA 4M63C 3CYMA 1HYSA 4U7BA 3C65A 3OYEA 3VQ7A 3CERA 3F9KA 3ZT1A 4MQ3A 3MCPA 2HHQA 1JXEA 2OZMA 4CEFA 3CFPA 1S1UA 3O1WA 3MX5A 4CHQA 5JMVA 2CH5A 4MO5A 4KHQA 2HSTA 3U3GA 3T1AA 5BRHA 5C15A 2UXCK 3CJBA 4AF1A 4MLHA 4LF5K 2VQEK 1VSJA 3NCIA 5AQVA 1Q82O 3KLFA 4DLGA 3OHRA 4KHSA 4F4KA 3HSTB 4JI4K 4GKKK 3VEWA 1YHQN 2R7YA 3VEVA 5CYMA 1RBVA 3KWIA 1E4GT 4PKGA 4HUFA 2V7ZA 5EOYA 2V52B 4K0KK 2D4WA 3JSMA 2P9SA 2G8HA 2W6KA 1HYZA 3I33A 2PYLA 3FZHA 1X9WA 4JAXA 3QNOA 1E3MA 1VSHA 3ULEA 1SKSA 3T1YK 1LW0A 3Q7CA 1HMVA 4HTUA 4CJ5A 3ZSRA 4DQRA 4DR1K 4CJVA 1OVQA 1VQ5N 3MN5A 4KAZA 3SMPA 4FM0A 3GBTA 2HBMA 3V9SA 3EEQA 1RDWX 1MDUB 1VHXA 3CI5A 2HW3A 4O44A 1C6VA 3AVGA 4BRKA 1WBDA 4EP4A 4DFPA 1VQ6N 4O55A 3OYAA 4V19S 2YNFA 5LJVA 3QLHA 4JV5K 1FJGK 4I2PA 5TKWA 1LV5A 3ZSQA 4BG9A 1JLQA 3A8YA 5AFUA 3TAGA 4FJ7A 4AHSA 3OYIA 2E5LK 3SYZA 2ITMA 4B1ZA 5HRRA 3VPZA 4DWIA 3L2RA 3SLCA 1B9DA 4AQYK 2HNYA 4E7HA 4DR7K 2ZQBA 4JLHA 3D45A 1TL1A 4JHDB 4IEIA 2D1KA 1NJZA 4FJHA 2D0BA 3S3NA 2XY8A 3HSCA 1MU2A 4BRGA 2PYJA 5DK5A 4BE0A 4WFAL 1BDGA 1QQNA 2O8FA 3CIPA 5BPLA 3OYFA 2O4GA 4CJPA 1VSEA 2HHHK 2FSKA 2V51B 2I7NA 4GVMA 3ZT0A 3MECA 2W6LA 3UE5A 1ITGA 1S6QA 4RCHA 3ZX3A 5EU7A 1BL3A 4CEEA 2P9UB 3MDQA 5AQXA 1GOAA 5M1KA 1WSIA 1KLMA 3HYFA 4NYNA 4YFUA 4CCHA 4OPHA 3L2QA 1QSYA 2A42A 3QERA 2OCEA 1KFSA 3LAKA 5CHIA 4Z4GA 5FRNA 4FPBA 3QBWA 1L3SA 2HMIA 1EP4A 1QQCA 4KTZA 4BC5A 4E7KA 4PQUA 1NGIA 5KPRA 4EFHA 3OYLA 3FFIA 3DLGA 2UUBK 4CEZA 1YI2N 4M45A 3E1YA 3O08A 1M1KO 1Z05A 3KZBA 3Q7BA 4OKJA 4OGCA 3NF6A 4CI6A 4BRDA 2CH6A 1HQUA 4DKWA 4RWTA 2BGGA 4BR4A 1RDDA 1WSGA 3CPEA 3VEZA 3ZSVA 3AO1A 3CJ9A 3KIOA 4FLXA 1O13A 1NK7A 3M8QA 1NU0A 1NJXA 4AHCA 3J80O 4IO8A 4FJ8A 3O4WA 2KZZA 3ATUA 3D0PA 3SJJA 2IC3A 1WSJA 3UB5A 3K9JA 2G8FA 3NBPA 1XHZA 5HRNA 3QO9A 4LY7A 2HHVA 1XMQK 1J9AA 1BA1A 1ILYA 4H4OA 5AZIA 1RGIA 3LP3A 3OBWA 1QVGM 4C8LA 4WFNL 5D3GA 1ASVA 3VQQA 1RCHA 2D0CA 3EKUA 3O9TA 2NRVA 2Q97A 4ISFA 1NMNA 3OY9A 5J2NA 1ZYQA 3LP0A 2PZSA 2A5XA 5BN9A 4DTRA 3HPHA 4JKGB 4I9QA 2VGMA 1UA0A 4YHHK 3PO5A 3CG7A 3IRXA 4EAHD 3DI6A 4JKFA 2HBJA 3J7YP 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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