3P4IA

Crystal structure of acetate kinase from mycobacterium avium
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
ARRVLVINSGSSSLKFQLVDPESGVAASTGIVERIESSPVPDHDAALRRAFDMLAGDGVDLNTAGLVAVGHRVVHGGNTFYRPTVLDDAVIARLHELSELAPLHNPPALLGIEVARRLLPGIAHVAVFDTGFFHDLPPAAATYAIDRELADRWQIRRYGFHGTSHRYVSEQAAAFLDRPLRGLKQIVLHLGNGCSASAIAGTRPLDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPSVVSYLCHTAGMGVDDVESMLNHRSGVVGLSGVRDFRRLRELIESGDGAAQLAYSVFTHRLRKYIGAYLAVLGHTDVISFTAGIGENDAAVRRDAVSGMEELGIVLDERRNLPGAKGARQISADDSPITVLVVPTNEELAIARDCVRVLGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Increasing the structural coverage of tuberculosis drug targets.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acetate kinase
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium avium
total genus 123
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2010-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3p4iA02
3H6EA 3HZ6A 5KQDA 1HPMA 1SAZA 4JN4A 3WQUA 3A5LC 4B1YB 2A40A 4XEIA 2QM1A 3RSEB 4CD1A 1GLEG 1MA9B 1MDUB 3DAWA 4BRIA 2QWPA 3FFKB 1XQSC 3DXMB 5EXWA 1ZC6A 3UKRB 3VEWA 5F2RA 1V4SA 2D1KA 4PKHA 3H45C 5AQMA 4FWLA 1Z05A 3BF1A 3QDKA 3O4WA 4FWSA 4H0XB 5AQLA 3A0IX 5BPNA 4BVPA 2Q2RA 3O1BA 4BGAA 5F1XA 2P9KB 4BC5A 2FSJA 3EZWA 3DXKB 1DEJA 4CZGA 4ISEA 4XH4A 3M3ZA 4BRAA 3FZKA 3VEVA 4FPAA 2CH6A 3LL3A 2FF3B 3D2EB 5LJVA 2VCPA 2YHXA 3LDQA 4BR9A 1QQMA 3MN5A 1BUPA 4M7XA 3D2FA 3WEEB 2YJEA 1NBWA 5I9EB 3CJBA 3IUCA 4BR4A 4EIAA 5BRHA 4FWQA 3U4LA 2P9PA 3VEOA 1GLFO 5AQSA 4H0TB 5AQQA 3CJ7A 1GLCG 2HOEA 4K41A 4AM6A 5KPTA 3QB0A 3G25A 4FL9A 5AQPA 3H46O 1HKGA 4IO8A 5KQ8A 3OHRA 2GWJA 4A61A 1G99A 4XH5A 5FPEA 1V4TA 1Z6RA 2IIRA 3BF3A 3FZHA 2VWBA 1DKGD 1JCFA 3VGMA 5LY3A 3IDHA 1NGIA 2P9LA 1NGJA 2GELA 1HKBA 3UKUA 2E88A 3ATVA 2QXLA 3U8XA 1T44A 2FSKA 3JS6A 3ZEUA 2ZGZA 3R9PA 4C23A 2GUPA 3J8AA 5BPMA 3VGKA 3ENOA 1BO5O 4WQ5C 3QICA 5FPNA 3BEXA 1NWKA 3MDQA 4BR7A 4F9OA 3IFRA 1DGKN 3RSEA 1IJJA 1X3MA 1NLVA 3O08A 2V51B 4B9QA 2P9NB 1QZ5A 1E4GT 4BRKA 1NGEA 3DXMA 3JXUA 3UKRA 2QWNA 2YI1A 3ZX0A 3CJAA 1NGAA 5EOYA 4CZEA 2P9IB 4BVOA 2ITMA 1NMDA 4BC3A 5E84A 3VPZA 3VGLA 4ISFA 4JNEA 2ZGYA 3MN7A 1HJOA 3I33A 2QWMA 1RDWX 1Y64A 3GDQA 3LM9A 4IZ9A 4FPBA 1K8KA 2QW9A 5CE3A 1WUAA 4BR2A 3VF2A 4QS8A 3WXIA 4BRQA 1YVNA 3ULEB 3W0LA 2Q97A 3C7NA 4DCHA 1Q18A 1QQOA 4JAXA 2E1ZA 5AQRA 2F9WA 3O1WA 3QBXA 1LOTB 1NGBA 2BUPA 3WEEA 4BQLA 2IVPA 3SMPA 5AQHA 1LCUA 3ZETB 4RTFD 3VF4A 2E8AA 3O6WA 3LDPA 3O8MA 2E2QA 3B8AX 4M7YA 3QBWA 1ZBSA 2ASOA 3CQXA 5AQOA 5BRDA 4CZIA 3VEXA 5AQJA 3SJHA 3HSCA 1U2VA 4JHDB 2A42A 4QS9A 1C0FA 4CZKA 2IVNA 5ELZA 4LC9B 5AZIA 3DJCA 1BDGA 1CZAN 5E26A 5AFUA 4AM7A 2H3GX 2V7YA 3GG4A 4BRPA 3UE5A 2GEMA 3SMSA 3A8YA 4MO5A 4KBOA 2P9UA 4BRHA 2W40A 1TUYA 3AAPA 5ADXA 5AQXA 2E1YA 4GY2B 2YHYA 4JD2A 1RFQA 1TYQA 1QHAA 4H0PA 4DHYA 2ZWHA 3HI0A 3CJCA 3WT0A 1BA0A 1NGFA 2J4RA 3QMLA 4B1VA 2E2NA 3F9MA 5TKYA 1ATSA 1BG3A 1BOTO 3EL2A 4MLHA 1QQNA 4A2BA 2Q36A 2YJFA 2FSNA 3TU5A 4CZMA 1ZXOA 4BG9A 4YDUA 4MO4A 4BRFA 4BGBA 5AQGA 3HM8A 4FSVA 1H1VA 4BRLA 3FZMA 1R59O 5AZJA 2D0PA 2V7ZA 1X3NA 3H1QA 4B1UB 3U9ZA 4BRCA 4NB4A 3S41A 3WXLA 2E2OA 1XC3A 4CI6A 3EKSA 3M1FA 3L4IA 1RGIA 1NGHA 1IG8A 4WYBA 1E4FT 4FWPA 3MCPA 2CGJA 1SQKA 1YAGA 3KVGA 3A5MC 3H1VX 5JLHA 1YUWA 2YCHA 3I8BA 3O80A 3P4IA 4EHUA 3W3DA 2YHWA 1BA1A 2CH5A 4B1ZA 4BROA 4A62A 3UB5A 5AQNA 1C0GA 3CQYA 4CD3A 4RWTA 2HF4A 3VENA 5JLFA 2ASPA 3CERA 3ZETA 1EQYA 3H3NO 2QWLA 4B1XB 3ID8A 2A41A 1ATRA 2QWQA 3BUZB 4EAHD 2W41A 5AQTA 3D2FB 3HBTA 3FR0A 5AQUA 1MWMA 3TPQA 4FWMA 4CZFA 3LDNA 3ENHA 5FPMA 5F0XA 2P9KA 4PL7A 1GLAG 4H5NA 4FWOA 4IJNA 1GLJO 3DXKA 3FZFA 4FWKA 2GWKA 3MMVA 4K42A 4FOEA 1HKCA 4H0YB 4NO7A 1D4XA 4FWNA 4Y0WA 1J6ZA 3ZX3A 3SK3A 3FGUA 3ZX2A 4A2AA 2WUSA 3D2EA 3EO3A 4MLEA 2AP1A 4XH1A 4H5TA 5AQZA 5AQWA 4H0VB 2VYPA 2KHOA 4HTLA 4L3QA 4O8KA 1T6CA 2Q1NA 4BC2A 5BREA 1WOQA 4H03B 4DQ8A 3L6QA 5LJWA 4CJ7A 2E2PA 4FWRA 1MWKA 3ZEUB 4ISGA 4BG8A 2CGKA 1BWFO 3VEZA 4BRMA 5AQVA 5AQYA 4H0OA 4RCHA 5AFUH 3QFPA 4IWVA 2P9SB 3FE1A 4WQ4A 3L0QA 3CJ9A 3LDLA 3WXJA 4BR5A 2NZTA 3HTVA 2QWRA 5AQFA 5ADXH 5BR9A 3WQTA 4YDUC 2IVOA 2FLOA 1NM1A 3BP8A 4CBWA 2Q0RA 1GLBG 1S22A 1NGDA 1P8ZA 4I6MB 3AARA 1T6DA 2D4WA 1X9JA 2PAVA 4IXCA 5AQIA 2Q0UA 1K8KB 4CZLA 1KAXA 3MK6A 3WUHA 3KHYA 4DB3A 3AAQA 4O5FA 4PKGA 3LDOA 3C7NB 2P9NA 4H5WA 5AQKA 5EY4A 5KPRA 1YXQA 2FXUA 2GTDA 4HWIA 3MN9A 2QWOA 2FF6A 3CI5A 4E1JA 4M63C 4CZJA 3CJ1A 1HLUA 3VETA 2NRHA 2P9IA 3O5BA 4BRDA 3VEYA 4CZHA 3WXKA 1OKJA 1ESVA 3GE1A 2I7PA 2I7NA 1HUXA 2A6AA 5FPDA 4FO0A 4BRNA 2E20A 3VESA 2EWSA 3A5OC 3ULEA 1U2VB 3FLCO 4Z94A 3EN9A 5AZIB 5BN9A 1KXPA 3ATUA 1JCEA 4BRGA 3CHWA 3SLCA 3GL1A 4CBUA 3FZLA 4EHTA 2D0OA 2HMPA 3EKUA 2P9UB 4J8FA 1QZ6A 4QS7A 4PL8A 1SZ2A 3MN6A 1HX1A 4JD2B 1TYQB 3GOIA 2A5XA 2OANA 2UYTA 4GNIA 4K43A 5JICA 3CIPA 3VERA 2P9SA 4JHDA 1S3XA 2F9TA 3D7EO 2P9PB 5AR0A 4K25A 4B1WB 2BTFA 3CETA 4BQZA 2V52B 1TUUA 1NGGA 1GLDG 1BU6O 3M6GA 3U9DA 5BPLA 2ZF5O 1KAYA 3IMXA 1KAZA 3R6MA 4WQ4C 2A3ZA 5BN8A 2Q31A 4I6MA 4CBXA 2DPNA 5AZJB 4EFHA 3LM2A 4H5VA 2P9LB 3GBTA 1XUPO 4BR0A 3R8EA 2CGLA 3KZBA 3H3OB 4PKIA 5JMVA 2NLXA 2ASMA 4BREA 3UKUB 5B8HA 1NGCA 5EX5A 4WQ5A 3VOVA 1GLLO 3VF6A 5BRFA 4FOIA 3QFUA 1JCGA 2AA4A 5EVZA 2PBDA 4BC4A 3AY9A 3DWLA 4H5RA 5KPZA 2HF3A 1U6ZA 4IJAA 3C0BA 3A5NC 1ATNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H6EA 3QEXA 4GVEA 2HVHA 3CG7A 4B1YB 1TV6A 1BQMA 4BY9C 4MFBA 2HNZA 4CJPA 4DFMA 1SUQA 2FBXA 4NYNA 3QETA 4B08A 3QERA 2JWKA 3C94A 5EXWA 4Z0UA 5F2RA 3H45C 4FWLA 1S1WA 3V81A 4H0XB 1TK8A 3NMUA 1C1CA 5CZ1A 4B9MA 2Q2RA 2P9KB 3AA5X 2FSJA 4FJ9A 2YKNA 3EZWA 1W2BM 1DEJA 4JK7A 4CZGA 3LPTA 1BIZA 1RT2A 3NE6A 3SAHA 2GUIA 1JLFA 1HPZA 4ELTA 4JK9A 3VEVA 3D2EB 2VCPA 2YHXA 1S1XA 2R7YA 3LDQA 3AVHA 4WFNL 3THXA 1KD1O 4YY3K 4IFEA 3KLFA 2ATQA 3DMJA 3SNNA 1TAQA 1QQCA 4E7IA 2KW4A 4FWQA 4ILHA 3U4LA 4CIGA 2P9PA 2Z1HA 1NJYA 4OKKA 2HNDA 1S1VA 4DTPA 1VQON 1GLCG 4OO1J 3QB0A 2G8UA 1HMVA 5AQPA 3H46O 1GOBA 1HKGA 5KQ8A 2GWJA 1G99A 4M3WA 2IIRA 3FZHA 4Z4EA 4YOUA 2GELA 3C6TA 3ATVA 3NAEA 2QXLA 3VQ9A 3AGRA 4LD0A 3U8XA 2GV9A 5LL6Z 3OJUA 1N5YA 4DR2K 1WBDA 3VGKA 1OH6A 3ENOA 3G6EN 1VQ5N 4IG0A 4BR7A 1X3MA 1JLBA 1NLVA 3SUOA 2V51B 4CGDA 2DFFA 3T1HK 2BE2A 1E4GT 4CJTA 1NGEA 2QXFA 2QWNA 3ZX0A 4R5PA 3LAMA 4C1NI 1U45A 1NJIO 3TAGA 5M1FA 4GKKK 1NMDA 4BC3A 4YOVA 1IKYA 5E84A 3O4NA 2G8KA 3AO5A 4K8XA 3S3MA 2QWMA 1VQPN 3IRXA 3LM9A 4FPBA 1K8KA 4BR2A 3PLAA 1RT7A 4BRQA 3W0LA 3QNOA 3C7NA 2HHUA 1NK6A 4CHYA 2IVPA 4JKDA 5C24A 3H08A 2Y1IA 4U7BA 4CJWA 4DMNA 3O8MA 3KJVA 1VQ7N 2E2QA 3V9XA 5AQOA 3VTHA 3DOLA 2I5JA 4JI4K 3K58A 1EX4A 2XRIA 3E9OA 4DWIA 3LAKA 2JGUA 4Z4IA 4CZKA 3AVGA 5E26A 1KFDA 4AM7A 1ZBFA 4DQRA 2H3GX 2V7YA 3SMSA 4KBOA 3V4IA 5GINA 3QEVA 1TUYA 5AQXA 2KQ2A 2QA4N 1LW0A 4DHYA 1KRPA 3MEDA 2ZWHA 3HI0A 4UY8O 3VQAA 4B1VA 4PQUA 4DSLA 1ATSA 1BOTO 3EL2A 4AHCA 1QQNA 3CCQN 2YJFA 3AO2A 1Q8IA 2KZZA 2O8DA 4MO4A 1VSKA 5AQGA 4OKEA 1T8EA 1HR0K 4DTMA 4OPJA 2D0PA 4OPHA 4LF8K 3HT3A 3H1QA 1ASWA 3SQ0A 1XC3A 4B9VA 3M1FA 1YIJN 3BZKA 4O0JA 3RTVA 4IEIA 1T3VA 1YVUA 1E4FT 2CGJA 1SV5A 3KLHA 2IC3A 3H1VX 5JLHA 3CC7N 1MU2A 4O0IA 3P4IA 1VQ8N 3W3DA 4FJNA 2YHWA 1R0AA 4B1ZA 2BANA 3IG1A 1JKHA 1GOAA 1SL1A 3H3NO 4Q5VA 3VMFB 4EAHD 3TWHA 3D2FB 4V19S 1UA0A 4CEAA 2RHKA 4CJQA 3RMDA 4CJKA 4NCBA 5F0XA 3O9TA 2VWJA 4PL7A 4H5NA 1IG9A 5E41A 5FRNA 3MMVA 3TTDA 4J2AA 3R1XA 2F96A 4H0YB 4WFAL 1D4XA 2HHSA 4DFKA 1RBVA 3THYB 1J5EK 5M1NA 4LFCK 3EO3A 2NRTA 4ILJA 4WCEL 5AQZA 4N41A 1RDAA 2IS3A 2VYPA 3OYDA 1NKEA 5AJ3K 1RT1A 4HTLA 4L3QA 3TAMA 1X9MA 5K14A 4DQ8A 4CJ7A 2E2PA 4JKAA 4CIFA 3AVCA 3HXMA 4DF8A 4N56A 2NRRA 3ZEUB 2AJQA 3VQEA 4AH9A 3VEZA 3O3FA 1KC8O 4H0OA 3ZSOA 3THVA 1WSHA 4O4GA 2RPIA 3FE1A 1ASVA 1BI4B 3OBYA 3QINA 3PO5A 1SS6A 3DLGA 2PFUA 2ZJPL 3CM5A 4CK2A 3ZSYA 1JXEA 1RTIA 4X65K 2F8SA 1P90A 3CCLN 3V6DA 3KWGA 3U6FA 4CZLA 3KHYA 5C15A 4DB3A 3J80O 4O5FA 1IBMK 3LDOA 1KTQA 4CF0A 3M8RA 1BCOA 3ID6A 2E4LA 3K5LA 1EWQA 5JVGL 5GAHP 2GTDA 4QCLA 4AQYK 4X64K 1NK5A 2QWOA 2FF6A 3CI5A 3EYZA 1XI1A 3CJ1A 1KLNA 4CVNE 1OKJA 1ESVA 3GE1A 1LW2A 2LSNA 3TAQA 4F4KA 4N47A 2PYLA 4DUZK 3OYEA 5FPDA 4XIUA 3I56N 3VA0A 3ULEA 2RN2A 3C6UA 3N4PA 3EN9A 5AZIB 4Y1CA 1JCEA 4KHPK 4FZZA 1TVRA 4TSXA 4E1NA 4CBUA 1K8AO 1FJGK 4EHTA 4I9QA 3CCSN 4M45A 1SZ2A 5CZ2A 4E7HA 4RW7A 4CF2A 1NKCA 1TYQB 3EY1A 2B6AA 2RE2A 3NH0A 2A5XA 3NGIA 4FK0A 2OANA 2KZMA 1DT9A 3K5NA 3RR8A 2HHWA 3HM9A 3VQ7A 1TKZA 4YOXA 1RT3A 5AR0A 1BI4A 2HHVA 4OGCA 4B1WB 3OS1A 3HK2A 1TUUA 4DSIA 2W6LA 4DV3K 1VSLA 1KAZA 3HPHA 2Q3SA 2Q31A 1X1PA 4CBXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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