3QBWA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to adenosine diphosphate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
347
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFSRAVLNIGGFSNVSLLRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 111
structure length 347
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA01
1TUUA 1SAZA 2DPNA 4JAXA 4CD1A 1NM1A 3GOIA 1TYQB 2V7YA 3LM9A 2YI1A 3MK6A 3VEWA 4IJAA 2ZGZA 3R9PA 2FXUA 4DHYA 2E88A 1CZAN 4GY2B 3VF6A 1C0FA 5BR9A 3SMSA 1BU6O 4H5NA 3FZHA 3O1BA 3IMXA 1K8KA 3EL2A 4DB3A 3CJ1A 4CZMA 4CZGA 3VGKA 4BROA 3MCPA 4JD2B 4PKHA 4H0YB 2Q97A 2F9TA 3L0QA 4AM7A 3CQYA 3VEOA 1HKGA 2NLXA 5AZIB 2QM1A 4MLEA 4FWSA 2VCPA 5AQOA 5JLFA 4FWOA 3W0LA 4BQZA 4FWMA 1XC3A 3VGLA 4DCHA 1H1VA 2P9PB 3SMPA 3DXKA 3VEXA 1QQNA 3FZFA 1U6ZA 2Q0UA 3QBXA 2P9NB 3WEEB 3FZLA 2Q0RA 4B1XB 4Z94A 5FPEA 1KAZA 1D4XA 2Q2RA 1LOTB 4PKIA 4FWRA 4PL7A 1NGDA 1KAYA 5FPMA 3H3NO 3CJAA 2YHYA 4RCHA 2Q1NA 5JICA 4CBWA 3SK3A 2ZF5O 1JCEA 1RGIA 3DJCA 4ISEA 3VF2A 4ISGA 3VETA 2D4WA 4BRDA 3A5OC 3UE5A 5AFUA 2P9SA 2CH5A 3CJCA 1X3MA 1IJJA 2KHOA 2P9IA 3BF3A 3VERA 3CQXA 4M7YA 4BR4A 4CI6A 2CGJA 4Y0WA 4H5WA 4F9OA 5B8HA 3HTVA 3ATUA 4EFHA 4RTFD 4BQLA 3ZETA 2J4RA 3LDNA 1G99A 5E26A 3C7NB 4K43A 3JXUA 1HPMA 3VESA 3FGUA 5AQGA 4CZLA 4BR9A 2E1ZA 3O4WA 3BUZB 5EX5A 1BDGA 4FL9A 4YDUA 5BRHA 1S3XA 1GLJO 4BRPA 3D2FA 1QQMA 3TU5A 4BRQA 5BPNA 1QQOA 2ASPA 1WUAA 4CZKA 4FWPA 5FPNA 4L3QA 1K8KB 3VEZA 2E1YA 5EVZA 4AM6A 5LY3A 3B8AX 1HX1A 4DQ8A 3EKSA 4FWNA 1NGIA 3HSCA 5AQMA 3D2EA 2PBDA 4CD3A 3F9MA 1GLDG 2A3ZA 3KZBA 1NGFA 5EY4A 3GE1A 1ATNA 4BRFA 1MDUB 4HTLA 2GUPA 3O08A 4LC9B 4BGAA 4BRKA 4E1JA 5ADXH 4A2AA 2FF3B 2VYPA 4BREA 4IXCA 3DXKB 4YDUC 1HJOA 2FSNA 4BC3A 3O80A 4QS7A 4FSVA 4O8KA 4K41A 1EQYA 4CBXA 2GELA 3EO3A 4M63C 1XQSC 3ENOA 3WQUA 3GDQA 4XH4A 4B9QA 1WOQA 5LJVA 2E2OA 3O5BA 4J8FA 3KVGA 4CZEA 4B1VA 3D7EO 3RSEA 4BVOA 1ZC6A 4HWIA 2QWQA 5AQJA 2P9SB 3SJHA 4FOEA 5BRDA 5AQSA 1DKGD 2GWJA 3M3ZA 2P9UA 4JHDA 4BRAA 3OHRA 4EIAA 2P9IB 4WQ4A 1ZBSA 1NGAA 3WXIA 2QWOA 4H0PA 1SQKA 1KXPA 2UYTA 1NGJA 3LDPA 4H0TB 3IFRA 4CJ7A 3A0IX 1BG3A 1P8ZA 2EWSA 4A2BA 3ZETB 2IIRA 1E4GT 5AQWA 1TUYA 5BRFA 4BG8A 5F0XA 4WYBA 4O5FA 5KPRA 4K25A 4B1WB 2AP1A 3VPZA 2YHWA 2IVOA 3VOVA 1GLBG 2GEMA 2ZGYA 4IO8A 3A8YA 1C0GA 3LDLA 2AA4A 1HKBA 1ATRA 3H3OB 1KAXA 2P9KB 1GLFO 5JLHA 4RWTA 1GLAG 3GG4A 4K42A 2E2QA 1JCGA 3WT0A 3TPQA 1YXQA 1T6CA 4BC4A 4EHTA 3BF1A 5AQPA 2D0PA 4BVPA 3MN7A 4QS8A 1S22A 4WQ4C 2YHXA 3MN6A 2QWPA 4H5RA 2CGKA 2FSKA 2VWBA 1V4TA 5TKYA 3M6GA 5AQRA 3D2EB 2PAVA 1JCFA 3U4LA 1MWKA 5AFUH 3O8MA 2CGLA 2V7ZA 3CJ9A 4BRIA 3LL3A 1HKCA 3VF4A 4C23A 5AQVA 1ESVA 1Y64A 2NRHA 2GTDA 5BPMA 1NGBA 3ZX2A 1NGGA 2V52B 1NWKA 2HOEA 3MN5A 1NBWA 3MN9A 5ELZA 4KBOA 5F1XA 3HI0A 4H5TA 3WQTA 5EXWA 1QZ6A 3CI5A 3FZMA 3H1VX 3L6QA 4A62A 2NZTA 4BR0A 3KHYA 4H03B 5EOYA 1HLUA 3JS6A 4PKGA 5KPZA 4CZJA 4CBUA 4XH1A 2YJEA 4M7XA 4H5VA 3QMLA 4BGBA 3ZEUA 3CERA 2P9UB 4JHDB 1Z05A 2HF4A 3WEEA 3BEXA 3ZX0A 3WUHA 1V4SA 1NLVA 1QZ5A 3QICA 3DWLA 2A40A 2QWMA 2IVNA 2ASMA 1J6ZA 1SZ2A 5AQHA 1QHAA 1HUXA 5BN8A 4I6MA 5JMVA 2WUSA 3WXJA 3AAPA 2F9WA 1BOTO 4MO4A 3U8XA 5I9EB 1BA0A 3ENHA 5KPTA 2P9LA 2QW9A 5BN9A 2I7PA 3DAWA 3UKRA 5ADXA 3P4IA 3BP8A 1NGHA 4NB4A 4CZFA 3G25A 3CHWA 5AQXA 5AZJA 2FF6A 2A6AA 3H1QA 2E2NA 1Z6RA 1T44A 3I8BA 3S41A 3MMVA 3L4IA 4BC5A 1YVNA 1U2VA 3FLCO 4BRCA 5AQQA 4GNIA 2QWRA 3U9ZA 3VGMA 5LJWA 4B1YB 3H6EA 2A41A 3GBTA 3GL1A 4BRHA 2Q36A 1IG8A 3QFPA 4WQ5A 2V51B 1GLLO 2YJFA 1DGKN 4MO5A 3UKUA 2W41A 3IDHA 4FPBA 3M1FA 5KQDA 4BRGA 2E8AA 3A5LC 4QS9A 3FZKA 3ATVA 5AQNA 4JN4A 1BUPA 4FOIA 3AY9A 5F2RA 1E4FT 2A5XA 4ISFA 3QBWA 2CH6A 3CETA 3LDQA 1LCUA 3H45C 3QFUA 4H0OA 1GLCG 5BPLA 4FWLA 3H46O 3D2FB 3W3DA 3ULEA 3FFKB 4BR7A 1DEJA 3QB0A 3CIPA 4FPAA 2GWKA 5E84A 4IZ9A 3AAQA 3DXMA 3VENA 2YCHA 4IJNA 3O1WA 4FO0A 4NO7A 3WXLA 4WQ5C 4FWQA 1GLEG 3ZEUB 1XUPO 1TYQA 1MWMA 4BG9A 3J8AA 2ZWHA 1T6DA 2FLOA 5AQLA 3I33A 3HBTA 4BRNA 3CJBA 2QWNA 1Q18A 5AQKA 4I6MB 3WXKA 1NGCA 4FWKA 2BTFA 1RDWX 5AQZA 3ID8A 4JD2A 2BUPA 2E2PA 1BWFO 3C0BA 4EHUA 2P9LB 1YAGA 5AZIA 3UKRB 5AR0A 4BRLA 5FPDA 4B1UB 3R6MA 2D1KA 3VEVA 3R8EA 2QWLA 5BREA 3LM2A 5AZJB 2HF3A 3AARA 4MLHA 5AQTA 3O6WA 2FSJA 4B1ZA 1RFQA 3CJ7A 3RSEB 1BO5O 4A61A 2ITMA 2I7NA 2P9PA 3EN9A 2E20A 1U2VB 1X3NA 3FE1A 2IVPA 3QDKA 2P9NA 4CZHA 3MDQA 4H0XB 5AQFA 4EAHD 1X9JA 2P9KA 4PL8A 3UKUB 3SLCA 4JNEA 5KQ8A 2ASOA 1BA1A 4H0VB 3A5NC 3EZWA 3LDOA 4BR5A 3FR0A 3ZX3A 2Q31A 1YUWA 1NGEA 5AQYA 2HMPA 4CZIA 3IUCA 2A42A 3UB5A 4XH5A 4BC2A 3HM8A 1R59O 1NMDA 5AQUA 1OKJA 3U9DA 1ZXOA 2D0OA 5AQIA 5CE3A 1MA9B 1ATSA 4XEIA 3ULEB 2OANA 3VEYA 4BR2A 2QXLA 2W40A 3EKUA 3HZ6A 3C7NA 4BRMA 3A5MC 3DXMB 4IWVA 2H3GX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ASWA 5J1EA 4FJ8A 1WSFA 4I2QA 3OBYA 1NM1A 3VEWA 3MK6A 4CJ4A 5GIOA 4DHYA 4DFPA 1P90A 4FLTA 3ZSQA 1QSLA 5CZ2A 1X9MA 1QHTA 4JKCA 1U47A 3IMXA 3EL2A 3T1HK 1D9FA 3MCPA 4H0YB 2HVIA 3VQ9A 2NRVA 1HNIA 5E41A 2NLXA 5GAGP 4MQ3A 2VCPA 5AQOA 2XY8A 4BQZA 4K8ZA 4DSKA 3E01A 3SNNA 2ZJPL 3NFAA 3IG1A 3VGLA 1L3SA 3SMPA 1VK0A 3FZFA 2Q0UA 3QBXA 2YHAA 3WEEB 4B1XB 3B6OA 1WAJA 2Q2RA 1WSHA 4PKIA 4PL7A 2VGMA 3H3NO 1IKVA 1EP4A 5JICA 1TKDA 4JLHA 3LPUA 1RGIA 3QLHA 5HOOA 3RRHA 3VF2A 4ISGA 3A5OC 4WFBL 4DFJA 1RBRA 2CH5A 1X3MA 4V19S 3WNHA 2KHOA 4DV7K 4IEIA 3QEPA 3LDSA 3CQXA 4CEBA 4BR4A 3S3OA 4JS4A 4F9OA 1WAFA 2GBZA 3ZETA 4F4KA 2DY4A 4N41A 2O8EB 4DSJA 4CW7B 3OYMA 4M3RA 3L2WA 4GKJK 3C7NB 3JSMA 5KRTA 3DOLA 4FJ9A 5GINA 5JS1A 3BUZB 4BDYA 1L5UA 1TL3A 3BY5A 3V9ZA 1A5XA 4YDUA 4DKWA 1C1CA 3K5LA 4GKKK 3PUFA 3TU5A 3CM6A 1UA0A 5BPNA 2ASPA 4LF4K 4CZKA 5FPNA 4B8CA 3KWGA 1HR0K 4E7HA 3G0ZA 2HHTA 1Y97A 3DLKA 2IDOA 4CJQA 1UOCA 3B8AX 1HX1A 3NVKA 1YTUA 1NGIA 3HSCA 2QKKA 1GLDG 3KZBA 3KTQA 5EY4A 1HNXK 4IDKA 3GE1A 1WN7A 4A5AA 4U67L 4R5PA 3PIOL 3EYZA 3PSFA 2VG5A 2IAJA 4HCCA 4E1JA 3CC7N 2QK9A 3TAGA 4W5NA 3CCVN 4LF7K 4JKBA 1NKEA 4BC3A 3O80A 4FZYA 4O8KA 4K41A 2GELA 3OYAA 1NK9A 4OKKA 3GDQA 3V4IA 2E2OA 2KZZA 4IKFA 3O5BA 4J8FA 3V1RA 1SKRA 4OGEA 1N33K 1VQ8N 5AQSA 1DKGD 4YOWA 3OHRA 4FK0A 2D0BA 4Z4GA 1ZBSA 4JKDA 3WXIA 1CLQA 1SQKA 2W42A 1NGJA 2LSNA 3IFRA 3T1YK 1BG3A 2QI2A 4BE1A 1RBTA 1LW0A 2QA4N 4DV1K 5TKWA 4WYBA 1LAWA 3CCLN 3OJSA 1HNWK 3DYAA 2YHWA 2ZD1A 2GEMA 4C1NI 3SUPA 2WBNA 4IO8A 4H8KA 1C0GA 4MDBA 1HKBA 1K8AO 2XY6A 1JCGA 2NRXA 1S6PA 2GV9A 1FKOA 2YV0X 1XHZA 3AV9A 3BF1A 5AQPA 4BVPA 2W6LA 4O8UA 3O3HA 4BWMA 4FK4A 2YHXA 3TARA 3ZLJA 1Q9XA 2RKIA 4FJLA 2CGKA 2VWBA 1V4TA 2HBMA 5TKYA 1VRTA 5AQRA 1IKWA 3D2EB 1RTDA 1FW6A 3OYKA 2DFEA 2IC3A 1RBSA 2CGLA 2V7ZA 4KKOA 3KK3A 3HJFA 4KI4A 1KVBA 4FCYA 3CFOA 4X65K 3V1OA 2AJQA 3IKMA 1U49A 1GOAA 1YITN 2NRHA 3E66A 1OH6A 4M3YA 1MU2A 3C95A 4DS5A 3MXIA 1NWKA 4JKGA 5F1XA 2D5RA 3TAMA 3SCXA 3CI5A 3FZMA 3NMUA 4CIGA 4WFNL 3CCJN 1NK4A 2X6SA 4A62A 3I0SA 3MXJA 4EZ6A 3JS6A 4CZJA 3AVNA 1RDUA 3C94A 3QMLA 4B9VA 3KD5E 1HYVA 2P9UB 1Z05A 3NAEA 2HF4A 3BEXA 2WONA 3WUHA 4JI2K 3VA3A 3QICA 4OO1J 3M5RA 2QWMA 3QEIA 4KB1A 4LY7A 3O9TA 1J6ZA 1O13A 3S9HA 2EX3A 3VTHA 1QHAA 1J9AA 4I6MA 1W7AA 4OVLA 1BL3A 3N4QA 1JL1A 2FBTA 2F9WA 3U8XA 4HCBA 1WB9A 1HMVA 3UKRA 4N76A 3P4IA 3BP8A 3AA4A 3G6EN 1NGHA 3MEGA 4B9NA 3CHWA 2FF6A 3OYGA 3H1QA 3P31A 3I8BA 1BIUA 3CXCM 1U2VA 3FLCO 5C2DA 3OYIA 5LJWA 4GNIA 3VGMA 3H6EA 2A41A 3AO2A 1XI1A 2YNHA 3UKUA 3DMJA 4ZTJA 4GVEA 3ZSVA 1ASVA 3CD6N 5C25A 4YOTA 5KQDA 3O4NA 4BRGA 3LAKA 3KLFA 3NHGA 3ATVA 3DRRA 4J2DA 1YVUA 3AY9A 1I94K 1REVA 3VQ8A 4RG8A 4OLAA 3LDQA 1LCUA 1RCHA 1GLCG 4FWLA 3ZT1A 4B8AB 3KD1E 4AH9A 5DM7L 4BR7A 1DEJA 1U4BA 4KHYA 3CYMA 1OVQA 3CIPA 2ZJRL 5CYMA 3B6PA 4FPAA 2GWKA 5E84A 4IZ9A 1VQNN 1DLOA 3OS0A 4FO0A 4NO7A 3WXLA 2Y1IA 4WQ5C 1GLEG 3OS1A 1RT5A 3NH2A 4CHQA 1MWMA 4BG9A 3J8AA 4DMNA 4EP5A 4JS5A 2HW3A 3L8BA 3JYTA 4B3RK 1QVFM 3NVMA 3HBTA 5AJ3K 3SJJA 4CK2A 1C0TA 2QWNA 3KWIA 1EWQA 1NGCA 2BTFA 1KFSA 1RDWX 2BDPA 3ID8A 4C8NA 1RNHA 2UXDK 3PLAA 4MDAA 5GAHP 4IDHA 2P9LB 1TVRA 1LAVA 3CM5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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