3QBXA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
362
structure length
353
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLLPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 118
structure length 353
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA01
2FSKA 4L3QA 3DXMA 5BPNA 3S41A 3D2FB 3CJBA 4JAXA 1D4XA 2DPNA 5BRHA 3MN7A 4MO5A 3A0IX 4I6MB 1K8KA 4HTLA 1KAZA 3MN5A 4BRMA 1G99A 3SMSA 1E4FT 1ESVA 1U2VA 4PKIA 3R9PA 4H5NA 2QWNA 4BRFA 2YI1A 1GLBG 2GWKA 4FOIA 4WYBA 2NRHA 5EX5A 3SLCA 5JICA 1BU6O 4MO4A 3VETA 2VCPA 3FZKA 3AAPA 4CD3A 2PBDA 1ATSA 4BQLA 4BR4A 2QWLA 1CZAN 1SZ2A 1TYQB 3GDQA 3UKRA 2P9UA 1GLEG 1X9JA 3CJ7A 1RGIA 3L6QA 1GLCG 3ZETA 4E1JA 2P9IA 3OHRA 3CJCA 1IG8A 3VF6A 1BA0A 1NGBA 4CBXA 5KQ8A 4H5WA 3U9ZA 5JLFA 3DXKB 3LDNA 4FWLA 1YVNA 1MWMA 3FZMA 2GWJA 4H0XB 3O80A 3L4IA 4WQ5A 3VEZA 4H0PA 4JHDB 5AQYA 2IVPA 4IZ9A 3WEEA 3ATVA 5F1XA 1Z05A 4A2BA 5FPDA 3FZHA 2VWBA 3VF2A 1NGEA 1NLVA 1X3NA 2FF3B 5BRDA 3VERA 4IJAA 5AQTA 2E1YA 3VGLA 4CZIA 3BUZB 3ZX3A 5KPZA 3O1WA 4K42A 2Q97A 1GLFO 3O08A 1HKCA 3BF1A 2AA4A 1BG3A 5BPMA 3H1QA 3IDHA 1WOQA 3C7NB 3DJCA 3CQXA 3D7EO 2F9WA 4JD2A 1TUYA 3WQUA 4EHUA 3AAQA 3MCPA 5AFUA 3DAWA 3ATUA 2E2OA 4K43A 3FFKB 4B1UB 1S22A 4BVPA 2P9LA 2GTDA 4J8FA 4LC9B 3FZLA 4BR2A 3UKUB 5BPLA 1T44A 1HJOA 4FWRA 2P9NA 3VESA 4BR5A 2ASMA 1HLUA 4CZEA 2GUPA 3IMXA 1QZ5A 2HF4A 4C23A 4ISFA 1DEJA 2QM1A 3A5LC 1NGIA 3GOIA 2YJEA 4H5VA 3I33A 1BA1A 2KHOA 3H6EA 4BR7A 5FPEA 4CD1A 3EL2A 3EN9A 1Z6RA 1NGGA 3LM2A 3LDLA 5AQKA 4M7YA 4FL9A 3SJHA 2YCHA 3FLCO 2P9KA 5AQHA 3D2EA 2A42A 3ULEA 2D1KA 2D4WA 4CZMA 1GLDG 2P9PA 5ADXH 4XH4A 4A2AA 3U8XA 1XC3A 4B1ZA 4BRDA 3CETA 3GBTA 1ATRA 1ATNA 4H0TB 2ZF5O 4BRKA 5AZJA 4QS7A 3H45C 1RDWX 4CZJA 4DHYA 4A61A 2YHWA 3I8BA 4MLEA 2PAVA 1ZBSA 1HKGA 5F0XA 2ASOA 1NWKA 2FSJA 2QWMA 3BEXA 5AZIB 4EHTA 2GEMA 1NGDA 2AP1A 2QWOA 2YHYA 3HM8A 3A5MC 3HZ6A 4FO0A 3GL1A 1T6CA 5EOYA 3CJ1A 1HUXA 2Q2RA 1WUAA 2QWQA 3VEYA 1DKGD 1NGAA 3DXMB 1YUWA 4GY2B 5AQMA 3U9DA 1OKJA 3VF4A 4RCHA 4DB3A 1BUPA 1BWFO 3QFPA 3U4LA 4IWVA 1K8KB 3MN6A 4IO8A 5FPMA 5AQGA 4BREA 4BG8A 3UE5A 3GG4A 4BC5A 4QS8A 1U2VB 3CQYA 4RTFD 1E4GT 3W3DA 4BG9A 2IVOA 2I7PA 3WXKA 2E1ZA 4B9QA 5EY4A 3ID8A 4FWSA 1XQSC 3ZEUA 4BC3A 5AQFA 4CBWA 4EIAA 4PKGA 1C0FA 5AQXA 5AQWA 2WUSA 3TPQA 5AQQA 1HKBA 5F2RA 5ELZA 4CZKA 1BOTO 1IJJA 2P9SA 2NZTA 4PL8A 4CJ7A 1ZC6A 2D0OA 3KZBA 3BF3A 4O8KA 4EAHD 2P9UB 4WQ4C 1QZ6A 5JMVA 5AFUH 3ZETB 1NGHA 4FPAA 2QW9A 2P9IB 2A5XA 3TU5A 3H3NO 5FPNA 3QFUA 2IIRA 1BO5O 3WEEB 3VEVA 4AM7A 5E26A 4XEIA 3WUHA 3VEOA 3FZFA 3QMLA 2FSNA 4XH5A 4BRNA 4M7XA 3R6MA 1NM1A 2HMPA 3A5OC 4PL7A 4CZFA 4FWMA 5I9EB 2EWSA 3O8MA 3C0BA 2CGLA 4BRLA 5BR9A 5EVZA 4JD2B 4FOEA 1GLJO 4BC4A 1JCGA 3EZWA 3ENOA 4IXCA 4CBUA 2Q36A 2V51B 1QHAA 5TKYA 1JCFA 3EKSA 2E2PA 4H5TA 1S3XA 1V4SA 3RSEA 1SQKA 1YXQA 1QQMA 4EFHA 1NGCA 2E2NA 1ZXOA 2P9LB 5AQOA 3A8YA 3SK3A 4H0YB 5LY3A 3HBTA 1KXPA 2CGKA 2V52B 3AY9A 3B8AX 1C0GA 2P9NB 2BUPA 3MN9A 5AQSA 1NGJA 5KQDA 2ASPA 4BRCA 3QICA 3DWLA 3D2FA 2FXUA 5AQLA 3CERA 4I6MA 4DQ8A 4FWQA 4BR0A 4QS9A 1HX1A 2ZGZA 5AQNA 4JNEA 5AQJA 4FWKA 4A62A 3HI0A 1X3MA 1U6ZA 3AARA 4FWPA 2P9KB 3WQTA 1NBWA 1XUPO 3D2EB 5AQRA 1KAXA 3ULEB 3ZX2A 3G25A 4BGAA 4Y0WA 2VYPA 2CGJA 2P9PB 3M6GA 3CJAA 2Q0UA 5ADXA 4JN4A 4BR9A 2OANA 4BRPA 4IJNA 2W40A 4AM6A 2E8AA 2HF3A 3L0QA 3H46O 3O5BA 5AZJB 2Q31A 4M63C 5BREA 1TYQA 4BC2A 2Q1NA 4BRGA 4XH1A 4WQ4A 1GLLO 2A41A 1MDUB 1LOTB 1Q18A 2GELA 2A3ZA 4H0VB 3KVGA 3DXKA 1JCEA 5AQUA 4B1XB 3CI5A 3ENHA 2QXLA 4JHDA 1HPMA 5AR0A 3LL3A 5LJVA 4CZHA 1Y64A 3CJ9A 3EO3A 2UYTA 4YDUC 3LM9A 3EKUA 1BDGA 1QQOA 3WXJA 3HTVA 5AQPA 4B1VA 2J4RA 3QBXA 2I7NA 4FWNA 1R59O 1NGFA 3WT0A 5AQZA 2YJFA 2E88A 5EXWA 1GLAG 3O1BA 3MMVA 3UKRB 3C7NA 5E84A 1J6ZA 1YAGA 2HOEA 3GE1A 4H03B 1QQNA 3F9MA 3CHWA 3JXUA 4CZGA 4H0OA 4FPBA 1TUUA 1LCUA 5BN9A 4B1YB 2A40A 3UKUA 3VGKA 3FR0A 4KBOA 4NO7A 3ZEUB 3H1VX 2D0PA 4BRAA 1H1VA 3IUCA 2IVNA 2ZGYA 2E20A 3A5NC 3QDKA 5KPTA 1NMDA 4H5RA 3IFRA 4MLHA 2P9SB 3VEWA 2QWRA 3MK6A 3MDQA 4BROA 2FF6A 4ISGA 4K41A 5BN8A 2CH6A 3ZX0A 4BGBA 3VOVA 3FE1A 3SMPA 2FLOA 3LDPA 4K25A 4RWTA 4FSVA 3H3OB 4BQZA 5KPRA 4PKHA 3CIPA 4NB4A 2NLXA 1DGKN 2ZWHA 5LJWA 3FGUA 2W41A 2V7ZA 2BTFA 4BRIA 4WQ5C 1P8ZA 3BP8A 4HWIA 4FWOA 3KHYA 4F9OA 3M3ZA 3QBWA 4CZLA 3JS6A 3J8AA 4CI6A 1SAZA 1V4TA 1KAYA 3VEXA 1EQYA 5AQVA 2V7YA 4Z94A 4BRQA 3R8EA 2E2QA 2CH5A 2ITMA 3VGMA 4ISEA 2H3GX 3VENA 3HSCA 3QB0A 4GNIA 2F9TA 3UB5A 4B1WB 5CE3A 3WXLA 5BRFA 3LDOA 3W0LA 2QWPA 4O5FA 5AQIA 3LDQA 2A6AA 1MA9B 3O6WA 3VPZA 3O4WA 3RSEB 2Q0RA 4BRHA 3M1FA 4BVOA 5AZIA 3WXIA 3P4IA 4DCHA 5B8HA 4YDUA 5JLHA 2YHXA 1MWKA 1RFQA 1T6DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KRSA 2FSKA 4L3QA 3SNNA 5BPNA 3PO5A 4C8OA 3PUFA 4M3WA 4IDHA 3AVHA 3MN7A 3A0IX 4C8MA 4E7HA 3PX4A 3HVTA 4DQPA 4YOWA 3TI0A 1ESVA 1U2VA 4JKDA 3R9PA 4FVMA 3SCXA 2WC9A 3CCUN 5DM6L 1GLBG 3THVA 1XNRK 2NRHA 2WBNA 1BU6O 3I55N 2VCPA 2VG7A 3C95A 1NJIO 3L8BA 3AAPA 4CD3A 3L2UA 1N8RO 2PBDA 1K6YA 4ELVA 1CZAN 4KPYA 3OYKA 4QCLA 3UKRA 4N76A 2FBXA 4E1JA 2YKNA 1JKHA 3OHRA 3CJCA 4OKKA 3VF6A 4U7BA 1NGBA 3CC4N 5CY4A 4RW8A 2WOMA 1TKZA 5JLFA 1YVNA 4ELUA 4H0XB 3WEEA 3O80A 4JHDB 5DK5A 1RDUA 4H4OA 2PFUA 3ATVA 2HHHK 1Z05A 3UIQA 4FW1A 3SUOA 3NF6A 3ZSVA 3FZHA 3CCLN 4CGDA 2HNYA 3T69A 4DU3A 4AHCA 2OZMA 1VSMA 3ZSWA 2O8CA 4WFNL 3CMAN 1M1KO 1A5WA 3BUZB 3O1WA 4LSNA 4CIEA 4FCYA 1GLFO 3O08A 5CHIA 4DUYK 3T3FA 5IT9O 5BPMA 4CJUA 1Q9XA 4KHYA 3C7NB 3WQUA 2F9WA 4CVNE 3DAWA 4M45A 3ATUA 3T1YK 1S1VA 2BH1A 3FFKB 2X6NA 1HMVA 4LC9B 3UKUB 1T44A 4NXMK 3TSPA 3CCJN 4F4KA 1NKCA 4CF2A 2I5JA 2P9NA 2G8IA 2ASMA 1HLUA 4CZEA 4F3TA 3OY9A 1QZ5A 3KWIA 5FLXO 1WBBA 2X6SA 3O3HA 4ISFA 4KO0A 4HUGA 4ZTJA 3A5LC 3GOIA 5JVGL 2YJEA 3I33A 4KHUA 3SQ4A 1RT4A 4O4GA 1BA1A 1KRPA 3H6EA 4M3UA 1XHZA 2HHVA 1UAXA 1Z6RA 3LDLA 5J2PA 3D2EA 4LF7K 4CF0A 2B4JA 3P5JA 4NYNA 5HRSA 4A2AA 5CYQA 1YJNN 1KTQA 4DTOA 2ZF5O 3CXCM 2OPSA 2OPQA 1B9DA 2XY5A 4CZJA 1JJ2M 4DHYA 1D9FA 5M1QA 3SUNA 2ZM6K 1RBSA 2O4GA 4N41A 2YHWA 1EETA 4C8NA 3CD6N 3SAGA 4DV7K 1O13A 1ZBSA 3NGYA 5F0XA 4PY5A 1VSLA 1T03A 1NKBA 2KTQA 2YHYA 1VQ9N 4FO0A 5C15A 4IFEA 3K2PA 1FKOA 3CJ1A 2IAJA 4CEOA 3QEPA 4FK0A 1NGAA 2ZJQL 1UWBA 3DXMB 4GY2B 3SBTA 4PA1A 3VF4A 2HNZA 1SL0A 1X9MA 3QIOA 3NVKA 5HROA 4IFVA 4IO8A 4R79A 4M42A 4KREA 3UE5A 1SKWA 3BGRA 3PV8A 3OBWA 4E7LA 2IVOA 4CFBA 5C2FA 2E1ZA 4B9QA 2XY7A 4FWSA 4DQQA 4CFDA 4PKGA 3MAQA 3OJUA 4CECA 4FJMA 3HT3A 1RBRA 4CJ7A 1ZC6A 3KZBA 3M8RA 4EAHD 1S1TA 1J53A 4W5QA 1QZ6A 3L3VA 2YV0X 5JMVA 3NCIA 1NGHA 4DS4A 2QW9A 2P9IB 4RG8A 3JSMA 3J7AP 4KH6A 1YJWN 3JYTA 5FPNA 3O4NA 1IKWA 1KCFA 2JWLA 3WUHA 3T1HK 3VEOA 3FZFA 3QMLA 4XH5A 4BRNA 5HRRA 1CLQA 2RN2A 2ZJPL 1NM1A 1U49A 4C8LA 1N5YA 5I9EB 2O8FB 1WSJA 5H1SQ 5EVZA 1SL1A 1VSFA 4BDPA 3EKSA 4ELTA 1TKTA 4M41A 1ZXOA 4CJQA 3G6EN 3AVNA 4B9UA 3OYLA 3B8AX 4I7FA 1C0GA 3MN9A 4IG0A 3WNHA 1NGJA 4DKWA 3LP3A 3QICA 4BRCA 3D2FA 5SZTA 1HNXK 3DOLA 4OPHA 4LSLA 1WAFA 1TK5A 1NKEA 5AQNA 4L8RB 2QK9A 2VQFK 2OA8A 4A62A 3HI0A 3SI6A 3C94A 3AARA 3CPWM 3WQTA 1NBWA 5AQRA 3ULEB 4BGAA 2VYPA 5DMRA 1N36K 1JLEA 2P9PB 3M6GA 1QSLA 2Q0UA 3L0QA 3H46O 4DR1K 4M63C 3DLGA 2Q1NA 4KTWA 4BRGA 4JI6K 1WSEA 2A41A 1MDUB 1QVGM 1GOAA 1RBVA 1T05A 2A3ZA 4CCHA 2FC0A 4H0VB 4I9LA 4BWJA 3F73A 3THWA 1TK8A 5C2DA 4CHYA 4JKHA 1LAWA 1HPMA 1FW6A 4YOTA 4CZHA 1Y64A 3VQCA 4KV8A 1X9SA 4WFBL 5JS1A 5AQPA 3AA3A 2I7NA 3NF9A 4FWNA 1VSHA 1VSKA 2Z1HA 3WT0A 5KTQA 4BY9C 3KLIA 1Q9YA 2VWKA 1N32K 4KHWA 4JKGB 4OLAA 4M3TA 4BDYA 4LD0A 1KVAA 4OPAA 2HB5A 3T19A 3JXUA 3AO1A 3QEWA 2HBJA 4B1YB 3LP0A 1VQPN 4CJEA 4KBOA 4NO7A 3VQDA 3LPUA 3ZEUB 4FLXA 3RMDA 5HBMA 1H1VA 2ZGYA 3A5NC 4ILGB 3P1GA 3CM6A 2WONA 3IFRA 4MLHA 2P9SB 2QWRA 3NDKA 4ISGA 1W97L 4M3YA 3VQ8A 4BGBA 3FE1A 3SMPA 1BISA 4BWMA 1SL2A 2ATQA 4BQZA 3DRPA 3NF7A 4GVMA 2NLXA 1DT9A 3LWMA 3ZT3A 5GAHP 2DTUA 1VQLN 4JRPA 1L5UA 3VA3A 2YNIA 4F9OA 3QBWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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