3QICA

The structure of human glucokinase e339k mutation
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
452
Chain Sequence
YFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVKSDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of E339K mutated human glucokinase reveals changes in the ATP binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 452
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qicA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3qicA01
1KXPA 3S41A 1KAYA 1TUYA 5EXWA 2FXUA 4BG9A 5BRFA 3FGUA 4B1VA 4BRAA 1YUWA 1ATSA 2QM1A 2VWBA 2YI1A 3CJBA 4LC9B 1T6CA 4XH1A 5FPEA 3CQXA 1JCFA 2Q31A 1T44A 2A3ZA 2D1KA 3H3OB 4JAXA 2QXLA 3H3NO 3O4WA 4JNEA 4XEIA 4YDUA 4BGAA 5ADXH 3I8BA 2VYPA 1NGJA 2PAVA 5AQKA 4CBUA 5LJVA 2WUSA 5AQMA 3VPZA 4CI6A 1X9JA 2NZTA 5AQHA 3GBTA 4WQ5A 1XQSC 4DQ8A 4AM6A 1HJOA 2QWOA 3VF4A 5B8HA 1NGEA 4MO4A 3HBTA 3BEXA 3WQUA 1ESVA 1NLVA 3EN9A 2F9TA 3FZFA 3W0LA 5AQIA 3VEWA 2ASPA 4IO8A 4FWLA 1BO5O 3AAPA 4PKGA 1JCEA 4B9QA 1G99A 4I6MB 4BR0A 5I9EB 5ADXA 1QZ6A 4RTFD 2ITMA 2P9UB 5AZJB 1V4TA 4FWRA 3MCPA 3A5NC 4I6MA 2P9KB 4GNIA 1E4FT 4FWNA 2E1ZA 3M3ZA 2P9UA 4H0OA 5AZJA 4BROA 4A2AA 2GUPA 4CD3A 3VEVA 2P9KA 4BG8A 5BR9A 4BQZA 4CZLA 3BP8A 1NGIA 2GELA 2ZF5O 4BRDA 4PL7A 5KQ8A 3GL1A 1NGAA 3LM9A 3GE1A 3C0BA 1GLDG 4FWKA 2GWJA 3I33A 5AQRA 1S3XA 3MN7A 1IG8A 2FSKA 3L0QA 3QFUA 3WXJA 3LDNA 1C0FA 1GLLO 5BN9A 5BN8A 5KPZA 3MMVA 1S22A 4DHYA 2E8AA 5AQJA 3VEOA 3LDLA 2QWQA 2YJEA 3DWLA 2KHOA 4A62A 3VENA 2YHWA 5FPNA 2E2NA 3HSCA 4CZEA 4IWVA 3FFKB 2CGLA 4M63C 4PKIA 3CERA 4BR9A 1SZ2A 5JICA 4CJ7A 4EIAA 1OKJA 4FSVA 3A5MC 4K42A 3A5OC 3A8YA 2AA4A 3AARA 3UE5A 3ULEB 3HTVA 4H5TA 3VOVA 1BU6O 3U4LA 5FPDA 3FZKA 5AQZA 4YDUC 2FSNA 2FSJA 1HX1A 1Q18A 1LOTB 3ULEA 2I7NA 3H1QA 4MO5A 3WXKA 1R59O 3CQYA 4AM7A 4B1XB 2E2OA 1X3MA 2V51B 3GG4A 3O08A 2P9PB 3VGMA 3OHRA 4JHDB 1BDGA 4J8FA 2FF3B 4WQ5C 2V7YA 3U8XA 1NBWA 1ZBSA 4B1ZA 3ID8A 4XH5A 4MLHA 4CZMA 2P9PA 3VERA 1U6ZA 3F9MA 4JHDA 4IJAA 3D7EO 3LDPA 3VESA 2NLXA 2GWKA 4BR5A 3TU5A 3L6QA 4BGBA 4NB4A 5F2RA 5AQOA 1EQYA 1BUPA 3LL3A 5AFUA 4RCHA 3H6EA 2BUPA 4PKHA 4CZGA 5BPNA 2FF6A 1Z05A 4IZ9A 3WXLA 3H45C 3A5LC 4BC4A 4EFHA 3QMLA 5EX5A 3SK3A 2NRHA 3MN6A 3SJHA 2D0PA 1C0GA 1NGBA 1D4XA 3M1FA 4H0PA 2QWMA 3DXMB 2Q2RA 4BREA 1ZXOA 3B8AX 3VGLA 5AQWA 2CH6A 3LDQA 4RWTA 3O1BA 1BOTO 4WQ4A 4DB3A 2CH5A 3L4IA 2HF4A 3DXMA 3DXKB 5CE3A 2Q1NA 1CZAN 4H5VA 2ZGYA 4FO0A 1KAZA 2QWLA 4BRNA 2BTFA 3DXKA 3SMSA 4Z94A 4ISFA 3MDQA 4BVPA 2V7ZA 1YXQA 1NMDA 3JXUA 1GLCG 3RSEB 2GEMA 3UKRB 4WYBA 3ATUA 3CETA 5E26A 5AQFA 5AQXA 1KAXA 3EKUA 3CI5A 4ISEA 2OANA 3VF6A 1HUXA 2H3GX 3UKRA 3RSEA 1QQNA 3IDHA 2A42A 1GLJO 1GLEG 4FOEA 5AQSA 1E4GT 1ZC6A 2CGKA 5EY4A 3TPQA 4K43A 4FWSA 5BPMA 4Y0WA 5AQQA 2IIRA 3GOIA 2ZWHA 4K41A 4O8KA 3VEXA 2ASOA 2IVPA 3QB0A 1HKBA 4BC3A 1YVNA 4M7XA 1U2VB 2QWPA 5AQUA 4EAHD 1X3NA 5JLFA 4C23A 3WEEB 2V52B 4CBWA 4MLEA 3ZETB 5E84A 4JD2B 1P8ZA 1U2VA 5AQVA 3BUZB 4H03B 4NO7A 3WQTA 3WEEA 2AP1A 2F9WA 4BRQA 3VGKA 3ZETA 2D4WA 4JD2A 3UB5A 3H1VX 3QBXA 4FPAA 5AR0A 1NGFA 3U9DA 3FZLA 4IXCA 3C7NB 4E1JA 5BRHA 5LY3A 1QZ5A 2A41A 5AFUH 4QS7A 2Q36A 3WT0A 1ATRA 1GLAG 4BQLA 3CHWA 2QWNA 2ZGZA 3O6WA 5LJWA 3ZEUB 3FZHA 3QDKA 3R9PA 4B1UB 4H5NA 4B1WB 4FWMA 2QWRA 4ISGA 3ZX2A 3MN5A 3IUCA 1DEJA 1HPMA 2D0OA 3ZEUA 4BRPA 3EO3A 3J8AA 4BRLA 3KHYA 3O1WA 3M6GA 1HKGA 1WOQA 3O8MA 5BRDA 5AQNA 2Q0RA 4BRCA 3G25A 2P9SB 4BRKA 2YCHA 4EHUA 1Z6RA 3HI0A 2P9NB 4CBXA 5KPTA 4WQ4C 1MWKA 4CD1A 4BRFA 4M7YA 2YHXA 3D2EB 2P9SA 4B1YB 1SAZA 2P9NA 4XH4A 3FZMA 4BVOA 5F1XA 2A5XA 3IFRA 1NGGA 3D2EA 3DAWA 1LCUA 2E2QA 3EZWA 3FLCO 1NWKA 1DGKN 3EKSA 1K8KB 4EHTA 1IJJA 5KQDA 3VEYA 3JS6A 3GDQA 2CGJA 3EL2A 3CIPA 1K8KA 4BC5A 2HOEA 1GLFO 3CJ1A 4JN4A 5F0XA 1MA9B 4L3QA 5AQPA 1TUUA 4CZJA 1ATNA 3CJAA 1RDWX 2GTDA 1WUAA 1NGHA 5ELZA 3QICA 5EVZA 3SLCA 4BRMA 3D2FB 2P9IB 2PBDA 4K25A 5AQLA 3WXIA 3W3DA 1BA0A 3KVGA 4H0VB 3ZX3A 1QQOA 4FL9A 3VETA 4BR7A 2P9LB 2A6AA 1QQMA 4HTLA 3D2FA 2P9IA 3LM2A 5AQTA 3VEZA 3H46O 2DPNA 4H0XB 3ATVA 3R8EA 1T6DA 4H0YB 1H1VA 2UYTA 4H5WA 4DCHA 1J6ZA 3UKUB 2P9LA 2FLOA 3KZBA 4GY2B 3ENOA 3ENHA 2E20A 4QS8A 3QFPA 4CZHA 4FOIA 3MN9A 4O5FA 1RGIA 1NM1A 2I7PA 2J4RA 1HKCA 4FWPA 3UKUA 3HZ6A 4HWIA 3AAQA 3CJ9A 2EWSA 3MK6A 4BRHA 1NGDA 5BREA 1GLBG 3R6MA 1Y64A 4H5RA 4QS9A 2QW9A 4A2BA 5TKYA 3AY9A 1MWMA 2Q97A 3FR0A 3U9ZA 4BC2A 1YAGA 2IVOA 4CZIA 5AZIB 5JLHA 3IMXA 2YJFA 3LDOA 4H0TB 5FPMA 4BRIA 1BA1A 3CJCA 3DJCA 4BR4A 5AZIA 2ASMA 4A61A 1SQKA 3VF2A 3C7NA 4CZKA 3ZX0A 1RFQA 2E2PA 2E1YA 2HMPA 3CJ7A 3BF1A 1MDUB 3BF3A 4F9OA 2VCPA 3A0IX 5JMVA 3P4IA 5BPLA 1NGCA 4FPBA 4KBOA 1V4SA 4IJNA 2W41A 4BR2A 5AQYA 1DKGD 3FE1A 1BWFO 1QHAA 3QBWA 2W40A 3O80A 2A40A 2Q0UA 3HM8A 4PL8A 1XC3A 5KPRA 2E88A 1TYQB 4FWOA 4FWQA 1BG3A 4CZFA 3O5BA 5AQGA 1JCGA 3SMPA 1HLUA 3WUHA 1TYQA 5EOYA 1XUPO 2HF3A 4BRGA 2YHYA 2IVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKGB 2OA8A 3S41A 2Y1JA 1TUYA 5EXWA 5TKWA 1S1UA 4BRAA 1YUWA 2VWBA 2YI1A 3CJBA 5FPEA 5KRTA 3CQXA 1XWLA 5J2QA 3H3OB 4N56A 3H3NO 3QIOA 1XHXA 3U6FA 4BDZA 4CBUA 4LF7K 2WUSA 4CI6A 3VPZA 1TL1A 1HYVA 2NZTA 3BGRA 4DQ8A 4DU4A 1QS4A 3C94A 4NLCA 1RTJA 2P1JA 3BEXA 3OVNA 1XHZA 3W0LA 3E01A 3I55N 4BY9C 3RWUA 4R79A 4CJEA 3AAPA 1VSHA 4PKGA 4FJXA 4DQSA 4DV0K 3DLKA 4I6MB 3T7ZA 3AVCA 4CEOA 5ADXA 4DSLA 1QZ6A 2D0AA 4GKKK 3OYIA 2Y1IA 3LALA 3P31A 3A5NC 3M8QA 4GNIA 1ZBFA 4M3YA 4Z0UA 1VQ8N 2P9UA 5AZJA 4BROA 2QA4N 2E6LA 2GUPA 2W6LA 1VQ7N 5BR9A 4OPJA 3WNHA 3RMCA 3BP8A 2ZF5O 4BRDA 3AO4A 2BANA 3C6HA 4DSFA 1NGAA 1VQ6N 3VMFB 3CQ8A 1S3XA 3L0QA 3J80O 3SAFA 5K14A 1I94K 5KPZA 1Z26A 4CECA 2JLEA 4B8CA 3NGIA 2E8AA 5C42A 3KLGA 3CCVN 1X1PA 2QWQA 2YJEA 3DWLA 3NDKA 4JI0K 4M3RA 3E1YA 1A5WA 3MWPA 3DOKA 2E2NA 3HSCA 3FFKB 1IO2A 4PKIA 1TAQA 1RBSA 2KKZA 4UY8O 2JWLA 4EIAA 1G15A 3AVJA 1HR0K 3A5MC 4K42A 3A5OC 1N8RO 1TKTA 4IFVA 2ZQBA 4O5BA 4YOUA 3TAQA 1NK7A 1IKYA 1BU6O 1N5YA 3U4LA 5HRPA 1Q18A 1YT3A 4AHUA 4O44A 3H1QA 3WXKA 1CZBA 2E2OA 1X3MA 3VGMA 2OZMA 3OS1A 1BDGA 2F8SA 2FF3B 3IAYA 3ZSOA 3U8XA 3OW2M 1ZBSA 4B1ZA 1RDDA 4LF5K 4CIGA 4MLHA 4YORA 5CY4A 3KK3A 2P9PA 1WBDA 4JKDA 4JS5A 4DR1K 4IJAA 4FVUA 3HL8A 4DKWA 3VESA 1HQUA 2O8BA 3VQBA 3L6QA 1RTHA 4OX9K 4DV7K 1BUPA 3HXMA 4CZGA 3OJSA 2Z1JA 1HNVA 1Z05A 4LF4K 1RTDA 4CVNE 3H45C 4LH5A 1QQCA 4BC4A 3EEQA 3SK3A 4JK9A 1L3TA 1XMOK 3ZT4A 1S9GA 1C0GA 2HBLA 4CJUA 1L3UA 4NCAA 1ZXOA 5GIPA 4RW6A 3K5OA 3CG7A 1ILYA 4RWTA 5C10A 4DF4A 3SJJA 4B08A 3KLEA 3NVMA 5LMNK 1CZAN 1EP4A 5C15A 1WB9A 3DM2A 2QWLA 3DXKA 3OYNA 1WNSA 2UUBK 1N36K 3H08A 4DV3K 3L2VA 1HNXK 3MDQA 4BVPA 4DQQA 3QLHA 2O8DA 1GLCG 4WYBA 3ZT1A 1TKXA 4DUYK 3QEWA 4HHTA 2F8TA 1KAXA 2O8CA 3CI5A 3CYMA 2NNWA 2B6AA 3VF6A 1U04A 4ILGB 2NRZA 3NH0A 4XIUA 1HJRA 1FK9A 3DLGA 4CFAA 3THYA 1R0AA 4E7IA 4MFBA 4CJ5A 5EY4A 3HPOA 2ZE2A 3V9WA 3F73A 2P5GA 3D45A 4FWSA 2B5JA 3ENBA 1S1TA 5AQQA 4LFAK 4K41A 4M42A 3VQQA 2ASOA 2IVPA 2YKMA 3QB0A 2O8EB 1C1BA 3I56N 4CGGA 5AQUA 1X3NA 5MLCQ 3SUQA 2V52B 3LZJA 3T19A 3ZETB 5HL7L 1GOCA 1M90O 4FJMA 3AO2A 4NO7A 3WQTA 3OYCA 3WEEA 2AP1A 2RF2A 1KLMA 1X9SA 1NJIO 4HTUA 1BI4A 2D4WA 3UB5A 4JD2A 5AR0A 3CCQN 4Y1DA 3U9DA 3MEDA 4IXCA 3C7NB 1X9WA 1YJ9N 1K73O 4E0DA 3A2FA 3WNGA 3LZIA 5C0YA 1BCOA 5AFUH 1WSFA 3SAHA 2Q36A 4C8MA 3NE6A 3ISNC 3O6WA 3ZSRA 3SPYA 3CC7N 1A5VA 3ZEUB 3TANA 4B1UB 4LF9K 1QSSA 2VQEK 3P39A 3MXJA 4CW7B 3BDPA 3IUCA 4FZZA 1VRTA 1UA1A 3HPGA 4KH6A 4J2DA 3QEPA 1YVUA 3M6GA 3NF9A 1JLQA 3O8MA 4J2EA 4IEEA 4WF9L 3PLAA 5AQNA 4X65K 2P9SB 4DR2K 4CF0A 4EHUA 1RILA 3HI0A 4CBXA 2DY4A 1MWKA 4DQPA 3AVBA 4M7YA 1UOCA 2VG7A 3C95A 2P9NA 4QCLA 4BVOA 2O4GA 4A59A 2A5XA 3QINA 1HYSA 2E2QA 4JKAA 4N76A 4OGCA 1RT1A 3EKSA 5FDLA 1K8KB 1EXQA 4EHTA 2GBZA 3VEYA 2O8FA 4B9TA 3GDQA 4Q5VA 3EL2A 2OTLN 3CJ1A 2GV9A 1MA9B 4L3QA 4JRPA 4PA1A 3CJAA 1SKWA 1SL0A 3OYMA 4YY3K 2X78A 3W3DA 4DTPA 4H0VB 3MCAB 5GADP 4E1NA 1VSJA 4FL9A 4BR7A 5J1EA 5AQTA 3H46O 4B9NA 3AA5X 3AVAA 4H0XB 4CFDA 4PWDA 4H0YB 3VQ6A 3QNOA 3ENOA 4QS8A 3THXB 1Q9XA 2J4RA 4I2PA 3UKUA 2OPRA 1CXQA 1CLQA 3CJ9A 2EWSA 4CF9A 4DFMA 3MK6A 1NJYA 3TSPA 2IAJA 3EE9A 4A2BA 1IKWA 4ZHRA 3U9ZA 3HSTB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1KXP A;  3S41 A;  1KAY A;  1TUY A;  5EXW A;  2FXU A;  4BG9 A;  5BRF A;  3FGU A;  4B1V A;  4BRA A;  1YUW A;  1ATS A;  2QM1 A;  2VWB A;  2YI1 A;  3CJB A;  4LC9 B;  1T6C A;  4XH1 A;  5FPE A;  3CQX A;  1JCF A;  2Q31 A;  1T44 A;  2A3Z A;  2D1K A;  3H3O B;  4JAX A;  2QXL A;  3H3N O;  3O4W A;  4JNE A;  4XEI A;  4YDU A;  4BGA A;  5ADX H;  3I8B A;  2VYP A;  1NGJ A;  2PAV A;  5AQK A;  4CBU A;  5LJV A;  2WUS A;  5AQM A;  3VPZ A;  4CI6 A;  1X9J A;  2NZT A;  5AQH A;  3GBT A;  4WQ5 A;  1XQS C;  4DQ8 A;  4AM6 A;  1HJO A;  2QWO A;  3VF4 A;  5B8H A;  1NGE A;  4MO4 A;  3HBT A;  3BEX A;  3WQU A;  1ESV A;  1NLV A;  3EN9 A;  2F9T A;  3FZF A;  3W0L A;  5AQI A;  3VEW A;  2ASP A;  4IO8 A;  4FWL A;  1BO5 O;  3AAP A;  4PKG A;  1JCE A;  4B9Q A;  1G99 A;  4I6M B;  4BR0 A;  5I9E B;  5ADX A;  1QZ6 A;  4RTF D;  2ITM A;  2P9U B;  5AZJ B;  1V4T A;  4FWR A;  3MCP A;  3A5N C;  4I6M A;  2P9K B;  4GNI A;  1E4F T;  4FWN A;  2E1Z A;  3M3Z A;  2P9U A;  4H0O A;  5AZJ A;  4BRO A;  4A2A A;  2GUP A;  4CD3 A;  3VEV A;  2P9K A;  4BG8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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