3QICA

The structure of human glucokinase e339k mutation
Total Genus 168
50100150200250300350400450020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
452
Chain Sequence
YFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVKSDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
50100150200250300350400450400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of E339K mutated human glucokinase reveals changes in the ATP binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 168
structure length 452
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qicA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3qicA01
1RDWX 4XEIA 3ATUA 2Q0UA 3BF1A 2P9UB 3CJ9A 1TYQA 1BOTO 5FPNA 4BRAA 3C7NA 5AZJB 3A5OC 5JLFA 3O80A 5BPNA 5ADXH 3F9MA 4FO0A 3LM2A 5EX5A 3EN9A 4BG8A 4EFHA 3ATVA 1V4TA 1HKBA 3FZLA 3EKUA 3GOIA 4LC9B 1QQOA 5E84A 3W0LA 2A3ZA 3H46O 3H3NO 3ID8A 2CGLA 4JN4A 4FL9A 5AQYA 3TU5A 3VENA 4RWTA 3FZHA 3QICA 4BR9A 4MO5A 4FWLA 1NLVA 4CZGA 4EIAA 1XQSC 5FPDA 2P9SA 5AQOA 2FXUA 3ZETA 3DXMB 4HTLA 5EVZA 1ATRA 4K43A 2E2QA 3I8BA 5I9EB 4FPAA 1BDGA 2NLXA 2QWOA 2P9IA 4WYBA 5BRFA 2E88A 4H0PA 1BA0A 2H3GX 5B8HA 4A2AA 2FSKA 4CD3A 5TKYA 4BRPA 3ULEB 3CI5A 3WQUA 4DB3A 2QXLA 3BUZB 2HOEA 1HPMA 3DJCA 1Z6RA 4BRQA 2P9KB 5AQVA 2P9NA 1MWMA 1NGAA 2P9PB 1MWKA 4CZLA 3M6GA 2P9UA 3D2FB 4WQ4A 3SLCA 3FGUA 3QMLA 1RGIA 3L4IA 3GDQA 3O1BA 4PKHA 3EKSA 3EO3A 4YDUC 4CZMA 2HF3A 1LOTB 4FWMA 3GL1A 3KZBA 3IFRA 2QWQA 2D4WA 5AZIA 3G25A 5FPEA 2YCHA 2D1KA 1GLBG 5AQZA 2ZGZA 4PL8A 4EHTA 2GEMA 3ENOA 2CH5A 3QFUA 4PKIA 3P4IA 2A5XA 5AQKA 1X9JA 3WXLA 4JNEA 5AR0A 2A6AA 4BQZA 2DPNA 2GTDA 1JCEA 3UKUB 4B1WB 4BGAA 4BGBA 3QBXA 3DXMA 4BR0A 3U4LA 4WQ5C 2Q97A 2D0PA 1SAZA 1SZ2A 1OKJA 2GUPA 2CGKA 1KAZA 2Q1NA 4H0XB 2W41A 3ULEA 2E2PA 2AA4A 3O5BA 5KPTA 5AQMA 2P9KA 3GG4A 2NZTA 4AM7A 5KPRA 3FFKB 4IXCA 1NGCA 3WT0A 4M63C 4BC4A 4CZHA 4B1YB 1J6ZA 3KVGA 3U8XA 2QW9A 5EOYA 2V7YA 5AQUA 4BRLA 3HM8A 5FPMA 3M3ZA 3HSCA 3LDLA 1WUAA 2FSJA 4FWSA 1Y64A 3LM9A 5CE3A 5EY4A 1ATNA 3VOVA 3BP8A 4FWQA 4DCHA 3UKRB 3EL2A 2PBDA 4KBOA 1QZ5A 1DEJA 1E4FT 3AARA 4BQLA 3QB0A 3SK3A 3VGMA 1HKGA 4XH1A 3DXKB 2ASOA 2V51B 3A5NC 4YDUA 1TUYA 1ATSA 1HLUA 1QQMA 4H5WA 4BRCA 5KPZA 4JD2A 1S22A 2EWSA 1C0FA 1BWFO 4CBUA 2FLOA 2E1ZA 2I7PA 3H3OB 1YXQA 4DHYA 2E8AA 3U9ZA 3ZX0A 1GLLO 4JHDB 2WUSA 1KXPA 3FZMA 4RTFD 4BVOA 3D2EB 1XC3A 3AAPA 3D7EO 3CQYA 4BROA 4BRHA 3GBTA 1V4SA 1IG8A 1DKGD 1Z05A 1JCGA 4WQ5A 3O08A 1NGFA 1ZC6A 4MLEA 1Q18A 4B9QA 5ADXA 4O5FA 1GLDG 1KAXA 3VEWA 1T44A 2QWPA 1BU6O 2OANA 3MN7A 3JS6A 4BC2A 1SQKA 5AQLA 5AQRA 1GLAG 5AQSA 4IJNA 3FLCO 4BRIA 4CZIA 5KQDA 3VEYA 3VEXA 4IJAA 4Z94A 5AZJA 1S3XA 2J4RA 3QFPA 1IJJA 4XH5A 3FR0A 1BUPA 1C0GA 3S41A 5F0XA 4FPBA 4M7XA 5JLHA 4IZ9A 1YVNA 3VGKA 4O8KA 1G99A 2E2NA 4MO4A 4MLHA 3TPQA 4NO7A 4BC3A 2HMPA 4FWOA 5BN9A 2IVOA 4H03B 3L0QA 1GLCG 5JICA 3WQTA 5F1XA 1ZXOA 1NGHA 2GWKA 3IMXA 4A62A 2QM1A 4GY2B 5BRDA 3UB5A 3ZEUB 1D4XA 3CIPA 4JHDA 4RCHA 2YHWA 2YJEA 2HF4A 3L6QA 3WXKA 2AP1A 3H6EA 5AFUH 1NGDA 4B1UB 1TYQB 1NGGA 5E26A 4H0YB 3C7NB 2V7ZA 3VF4A 4H5NA 4GNIA 2ASPA 1QHAA 4BG9A 4HWIA 3VF2A 5EXWA 4AM6A 4IWVA 2QWMA 3FZKA 3VEOA 1YUWA 1X3NA 1BO5O 4H0TB 3MN6A 2Q2RA 3CETA 3HZ6A 4BRNA 3SMPA 3A5MC 1CZAN 2I7NA 3H1QA 3MN9A 4CZJA 5JMVA 1NGBA 3VEVA 2D0OA 2P9PA 2KHOA 4FWKA 3D2FA 3HI0A 2E1YA 5BREA 4ISGA 3R8EA 5F2RA 1HUXA 3VEZA 2A41A 5AQNA 3SMSA 4ISEA 3ZX3A 3M1FA 5BR9A 4QS9A 4K42A 4CD1A 4FWRA 5ELZA 4J8FA 2GWJA 3O4WA 3LDPA 4B1XB 3ZX2A 4QS8A 1DGKN 2P9IB 3BEXA 4H5RA 4CJ7A 4EHUA 3EZWA 4BRGA 4BREA 3OHRA 1NM1A 4M7YA 5AQXA 3I33A 3SJHA 4K41A 3DWLA 2E20A 2YJFA 5AQFA 3IDHA 3WEEB 2ZF5O 2YHYA 3UKUA 3FE1A 4CZEA 1KAYA 3QDKA 5BRHA 4ISFA 3O6WA 3CJ7A 3MCPA 1QZ6A 3O1WA 4H0VB 4IO8A 1XUPO 3DAWA 1T6CA 3MK6A 3QBWA 2QWLA 4E1JA 2CH6A 2FSNA 1QQNA 3LDNA 3WXIA 2IIRA 5AZIB 3WXJA 3MN5A 5BPMA 2VCPA 3LDQA 3U9DA 3HBTA 3HTVA 3UE5A 3KHYA 3FZFA 3CJCA 2V52B 3CERA 5AQTA 1BA1A 3CJAA 1RFQA 2YI1A 4H5TA 4B1VA 1U2VB 3CQXA 4B1ZA 4I6MB 2E2OA 4FWNA 3BF3A 3MMVA 4FOIA 3RSEB 1H1VA 1TUUA 2P9LB 5AQIA 5LY3A 1HX1A 1X3MA 4DQ8A 3WUHA 1BG3A 3UKRA 5AQQA 2IVNA 2CGJA 2ZGYA 4H5VA 1K8KB 4NB4A 1EQYA 4JAXA 3W3DA 2FF6A 1YAGA 4FSVA 3A0IX 3JXUA 2ITMA 3VF6A 4BR2A 4FOEA 2Q0RA 3VETA 4C23A 5LJVA 3DXKA 4BC5A 5AQJA 3WEEA 1GLFO 4CI6A 1T6DA 4BR7A 4BRDA 4BR4A 4CZFA 5AQWA 4L3QA 1NBWA 3H1VX 2Q36A 3R6MA 3CJBA 3AAQA 2A40A 2F9WA 2QWRA 3IUCA 1ESVA 2IVPA 4A61A 5AQGA 4PKGA 2GELA 4PL7A 2ASMA 4K25A 3H45C 4XH4A 5AQHA 1HJOA 2Q31A 2F9TA 4CBWA 3D2EA 1LCUA 1P8ZA 5LJWA 3CHWA 2VWBA 3VERA 1NGEA 4QS7A 1R59O 4BRFA 2UYTA 1NWKA 3VGLA 5BPLA 1GLEG 4BR5A 1MDUB 1GLJO 4BRMA 1JCFA 3VESA 4A2BA 3AY9A 3A8YA 5BN8A 3O8MA 3CJ1A 1ZBSA 2QWNA 3LL3A 4CBXA 1U2VA 2VYPA 3GE1A 4I6MA 1MA9B 3A5LC 2BUPA 2BTFA 4JD2B 2A42A 2FF3B 3VPZA 2PAVA 4H0OA 3RSEA 1HKCA 2P9LA 1NGIA 4EAHD 3C0BA 3R9PA 4FWPA 1NMDA 4Y0WA 1K8KA 1U6ZA 4F9OA 2P9SB 3ZETB 3J8AA 5AFUA 3MDQA 1E4GT 4WQ4C 3LDOA 2NRHA 5KQ8A 2W40A 3B8AX 4BRKA 3ENHA 4BVPA 4CZKA 1NGJA 2ZWHA 5AQPA 3ZEUA 2P9NB 2YHXA 1WOQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RDWX 1KSPA 2WOMA 3M8QA 3TABA 3AVHA 2NRZA 3BF1A 3CJ9A 4RW4A 1BOTO 2RE2A 4ID5A 5FPNA 4BRAA 5HROA 2G8KA 2UXBK 5C15A 3AVFA 5DM6L 3A5OC 1VSEA 5BPNA 4FO0A 1L3SA 5EX5A 3HRGA 1B9DA 3HM9A 4R79A 4LC9B 1KLMA 1NNEA 1RTHA 2A3ZA 3H46O 3H3NO 3THWB 1OH5A 4IFEA 4W5NA 5H1SQ 3TU5A 4DU4A 4J2EA 2O8DA 1XWLA 3AVLA 4AH9A 2RPIA 1NLVA 1WAJA 4EIAA 3CPEA 4C1NK 3DLLL 1ASUA 3HPHA 4IKFA 3DXMB 4K43A 2YX6A 2UUBK 4WYBA 1JLFA 3MX5A 1SKRA 2E88A 4B08A 4OLBA 2NRXA 4A59A 1U47A 4NXMK 5C10A 3TARA 3BUZB 1XNRK 4LF5K 4KPYA 1HRHA 5AQVA 2OCEA 4N76A 4DKWA 3T1HK 5JVGL 1NGAA 1YVUA 4CZLA 1IBLK 4DV0K 3O4QA 1HPZA 4WQ4A 3SLCA 3PO5A 3QMLA 4KAZA 5M1PA 4DUYK 4CZMA 1WSJA 2HF3A 3RMAA 1VHXA 1LOTB 5GINA 1X1PA 2E6MA 3KZBA 4JI1K 3G25A 1NK6A 3I0RA 4Z4IA 4I2QA 2R7YA 5AQZA 2GEMA 4GV3A 5HP1A 5AQKA 4YHHK 4QCLA 2HHUA 3OS0A 3E9PA 1JCEA 4BGAA 4E7KA 4IDHA 4FZXC 4OKEA 4NYNA 4IFVA 3V9ZA 1TAUA 2Q97A 3CFRA 3K58A 3OJSA 3PSFA 3ZSWA 4H4OA 4YOVA 2W41A 1BHLA 1RBRA 3ULEA 3HJFA 4O4GA 1LWEA 5CHIA 4NXNK 3VQ5A 3FFKB 3KD5E 3AVKA 3SZ2A 5DM7L 4CZHA 3KVGA 3U8XA 2QW9A 4CEAA 1X9MA 2WFBA 5AQUA 1P90A 2UXDK 3HM8A 1E3MA 1BISA 3OTOK 4DU1A 3TAEA 3BDPA 5EY4A 3VN5A 1B9FA 3BP8A 1BL3A 4XIUA 4YY3K 3ASMA 2PBDA 3EL2A 5M1OA 3SK3A 3AVAA 4B8CA 2V51B 2YHAA 1JLGA 4X62K 3AVCA 2WONA 1T3VA 2EWSA 4LSLA 1C0FA 4CBUA 2PY5A 1VQLN 4B3RK 3S3OA 4PY5A 2FLOA 3LP2A 2I7PA 3N4QA 3H08A 1BQMA 4Z4EA 1YXQA 1KRPA 3CMAN 2E8AA 3NMUA 1YI2N 4KREA 3P5JA 4JHDB 2OYQA 3LPTA 3NF7A 3CCQN 2UXCK 1BCMA 3GBTA 3QEPA 1DKGD 1Z05A 2DTUA 1VQ7N 1JCGA 3CM6A 4JK7A 3EY1A 4HCBA 3QEWA 5C2DA 1GLDG 1KAXA 2X6SA 4FJJA 3NGYA 2GUIA 1BU6O 3CD6N 2YV0X 3ZSRA 3OYFA 4CIGA 1NKBA 3LWLA 4O0JA 4CZIA 1RT7A 5AZJA 2J4RA 3S41A 5SWMA 4XH5A 5JLHA 1BUPA 3HOSA 1J5OA 2PZSA 4FPBA 1DTTA 3VGKA 4RW6A 2BANA 4F2SA 5BN9A 4B9TA 2IVOA 4Y1DA 1Q82O 4Q0BA 2QK9A 3U6FA 5F1XA 1I94K 1NGHA 2HVIA 4DV6K 3EEQA 2D5RA 1NMNA 1MU2A 4DQPA 3EE9A 3ZYYX 4RCHA 1TK0A 3HVTA 2AP1A 3F5TA 3CXCM 4AHCA 4FLVA 1XMOK 4DTOA 3MWTA 4DTUA 4CEQA 1QHAA 4BG9A 4HWIA 1U4BA 5TKWA 4E89A 2VWJA 1X3NA 4F8RA 4M42A 4H0TB 3MN6A 2GV9A 4FZZA 1HYSA 4C8KA 2Q2RA 1FKOA 4BRNA 1YHQN 1CZAN 1TKTA 2I7NA 4CGJA 4CZJA 5JMVA 3M5RA 2HNDA 5JS2A 2D0BA 4DSEA 1K73O 4CGGA 3C6TA 1IG9A 1TL3A 3O9TA 3OVNA 2D0AA 5AQNA 3M1FA 1C1AA 4QS9A 1KTQA 4CD1A 1ITGA 5ELZA 3L2WA 2GWJA 4PQUA 3LDPA 4Z4HA 1IKWA 1YTUA 2HHWA 3NDKA 4EHUA 4Z4CA 5I42A 4BRGA 1N33K 4KHUA 4BREA 1RILA 3DOLA 1NM1A 1Z25A 4GV6A 4M7YA 1X9WA 2HW3A 1GOAA 4OPKA 5FDLA 2E20A 2YJFA 3WEEB 4DFPA 3QETA 3FE1A 3NFAA 3RWUA 1ASVA 3QDKA 1ZBFA 4OPJA 3SQ1A 2XY5A 3MCPA 3T1AA 4H0VB 3KK2A 3DOKA 1S6PA 2YNIA 3VQ7A 4YOTA 1RT4A 2E4LA 2FSNA 3KKRA 3LDNA 4YOYA 4DV3K 4BWJA 3WXJA 2VCPA 1C0UA 3LDQA 3U9DA 3HTVA 4J2BA 3UE5A 4DTXA 2V52B 3JSMA 4JK9A 3CJAA 4DR3K 1L3TA 1RNHA 3MXJA 2O8CB 4DQQA 5I3UA 1L3VA 4CF8A 1IO2A 1RFQA 3DLGA 4KTWA 1XHZA 1U2VB 4DLGA 4I6MB 1YT3A 2VWKA 4ELUA 1S1UA 2WC9A 2HBLA 4FOIA 2XY8A 4FLUA 4X66K 3RSEB 1H1VA 4DG1A 5LY3A 3QERA 4FW2A 4B9UA 2GX9A 5HOOA 1OH6A 3LALA 1QSLA 4FSVA 3A0IX 4MDAA 2ITMA 3VF6A 2Q0RA 3NF9A 4CEFA 3N4PA 5AQJA 4PHTX 4KHPK 4B3MK 4CJWA 1I3AA 4BDYA 3IUCA 4M3ZA 4A61A 4PKGA 3V9UA 3CCJN 4XH4A 1HJOA 4BDZA 4IDKA 2HHQA 3D2EA 4CK1A 2FBXA 1A5WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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