3QICA

The structure of human glucokinase e339k mutation
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
452
Chain Sequence
YFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVKSDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of E339K mutated human glucokinase reveals changes in the ATP binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 452
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qicA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3qicA01
4KBOA 2F9WA 4QS9A 4ISGA 4K41A 3DXKA 3R6MA 3L4IA 4FWMA 2FXUA 4BC2A 2ASMA 2I7NA 2P9LB 2NLXA 4H5RA 1HUXA 4BRQA 1JCEA 2QWQA 3VF2A 4BRFA 1T44A 5LY3A 1NMDA 2V52B 4FWSA 4EHTA 4BRGA 5AQHA 3BEXA 4BR4A 5AQYA 3WXKA 4M63C 3FE1A 3MN5A 1RFQA 4BR2A 5AQPA 1K8KB 4H0PA 4WYBA 3VGKA 2E20A 4CZLA 1C0FA 3U4LA 3A0IX 2GEMA 3L6QA 4BC4A 3WT0A 1GLBG 4AM6A 3MK6A 5AQQA 2P9UB 3ZETB 5KQDA 3CJ7A 4CZMA 2IIRA 2E2OA 1GLLO 2Q31A 3CIPA 4CZFA 4FL9A 2P9LA 2E1YA 3QBWA 2W41A 2VWBA 5ADXH 4FWNA 4BC3A 3O1WA 3ZX2A 4CBXA 3VOVA 4H03B 3QMLA 4H5WA 2HF3A 3CJ1A 4FWQA 3VEWA 3AAQA 3U9ZA 2YHXA 4FOEA 1DGKN 1K8KA 2P9SB 2HMPA 2E2QA 4BRIA 3RSEB 3CI5A 3L0QA 3B8AX 4BR7A 5BPNA 1QQNA 1JCGA 5AQSA 4BRHA 2CGJA 1RGIA 3UKRA 4EIAA 4B1XB 1XUPO 1P8ZA 4BGAA 1V4TA 2QM1A 3AAPA 3W0LA 2ASOA 4Z94A 3ZETA 1GLAG 2YHYA 3I33A 5JLHA 5AZIB 1HKBA 1NGCA 2QWPA 3MDQA 2A3ZA 3UKUB 4CZEA 2BTFA 2ZF5O 3FZFA 1X3NA 4BR9A 4WQ5A 4XH4A 2VYPA 1YUWA 1E4GT 4B1ZA 1U2VB 2V7YA 1EQYA 3CHWA 3WXIA 3DXKB 1ATRA 3D2FA 3MN6A 3MCPA 4WQ5C 3RSEA 5AQFA 4WQ4A 2P9IA 3MN7A 2FSJA 3QFUA 3UB5A 2EWSA 4BRLA 5BREA 5LJWA 3H45C 5EVZA 3EKUA 5F0XA 1HKGA 4IZ9A 3KZBA 1KAXA 1MWKA 3BF1A 2AA4A 3WQTA 2E1ZA 4IJNA 5AQUA 4IJAA 3EZWA 3SMPA 1LOTB 3LDQA 3WEEB 1NGGA 3GDQA 1T6DA 3H1VX 4I6MA 4FO0A 2ZGYA 1NGJA 3W3DA 1DEJA 2HF4A 4JHDB 1NGHA 3QICA 4GNIA 5FPNA 1H1VA 5CE3A 3QB0A 2QWOA 3FFKB 4JN4A 1HPMA 3HTVA 5KPZA 5AQJA 5BR9A 3O08A 4ISEA 3VPZA 4BRNA 5AQMA 4QS8A 4H5VA 4BC5A 1NBWA 1BU6O 3EL2A 2A42A 3FZKA 5KQ8A 2QXLA 3WQUA 1HKCA 4H5NA 3C0BA 4PKGA 2A6AA 3H3OB 5BN8A 1MDUB 4ISFA 2GELA 3WEEA 5AFUA 3S41A 5JMVA 2FSKA 3IUCA 2CH5A 4MO5A 3O1BA 3UKRB 2A41A 3O80A 4JHDA 4LC9B 2IVOA 2YI1A 2P9KB 3HI0A 3DJCA 4RWTA 3ULEA 3ATVA 2P9NA 3G25A 4BRAA 1GLJO 3CJAA 2ZGZA 5AZJA 4FPBA 3H46O 5F1XA 4HWIA 4BG8A 3SJHA 4PL7A 1ESVA 3GBTA 2OANA 2NRHA 4B1UB 2E2PA 1IG8A 3D2FB 3HZ6A 1X9JA 3C7NB 4XEIA 2D4WA 3SMSA 3VETA 4O8KA 3GG4A 4FOIA 4K25A 2P9IB 5BN9A 4BR5A 5FPMA 4H0XB 5EX5A 4K42A 3VEOA 2FF3B 1NGEA 3WXJA 2ZWHA 3CETA 1G99A 1QHAA 5BPLA 5JLFA 2P9KA 3GOIA 2CGKA 3LDOA 2A5XA 3I8BA 2FF6A 3FZMA 4FWKA 2GUPA 4I6MB 4BQLA 4B9QA 4DB3A 5AQVA 1XQSC 2F9TA 5BPMA 2IVNA 3D7EO 3VEVA 4BVOA 3QDKA 4JD2A 2DPNA 5E84A 1WUAA 4CZIA 3CJBA 3BUZB 3C7NA 4BVPA 2YHWA 3H6EA 5B8HA 5AQRA 3A5NC 2GTDA 3M3ZA 3P4IA 5ELZA 4A62A 4YDUC 4DQ8A 4EHUA 1C0GA 3LDNA 4RCHA 5AR0A 3IDHA 2BUPA 2FSNA 2P9PA 3FGUA 2Q1NA 4CD1A 1HX1A 2QWMA 3A5MC 3CQXA 1NGIA 5EY4A 3WXLA 3M6GA 4EFHA 2QW9A 3AY9A 1BDGA 1BOTO 4L3QA 3FR0A 3H3NO 1TYQA 3ENOA 3KVGA 3VERA 3ZEUB 3HM8A 4FWPA 4MLHA 4BQZA 2E88A 2Q0RA 2AP1A 4B1VA 4RTFD 4CI6A 1QQMA 3TPQA 4CZJA 5FPDA 2WUSA 3U9DA 4CBUA 3ULEB 2FLOA 2P9NB 3LDLA 5KPTA 1NWKA 3ID8A 1S22A 5AQXA 4QS7A 1ATNA 5FPEA 1SZ2A 5AQIA 3IMXA 2HOEA 3VF4A 1HJOA 5AZJB 4DHYA 3CERA 2E2NA 1NGAA 3EKSA 1GLEG 3DXMA 1LCUA 3ATUA 1GLFO 3GL1A 5AQOA 1GLCG 3LL3A 4BROA 1BWFO 2KHOA 1IJJA 5AQGA 1Y64A 1BO5O 3CJCA 5ADXA 3LM2A 2CGLA 3ENHA 4IWVA 5AQWA 5BRFA 1KAZA 4CJ7A 3ZX3A 4CD3A 1YVNA 2J4RA 3J8AA 3ZX0A 1YAGA 3ZEUA 3AARA 4H0TB 4M7XA 4NB4A 4C23A 1BA0A 3A8YA 4FPAA 4B1WB 3GE1A 5AQTA 3HSCA 1ATSA 3A5LC 4MLEA 3DWLA 4E1JA 2QWNA 4BREA 2D0PA 3VESA 2YJFA 4H0YB 1BA1A 1QZ5A 3LDPA 4F9OA 3EO3A 4FWRA 5EXWA 2W40A 2E8AA 4FSVA 4BRKA 4DCHA 3CJ9A 2PAVA 2VCPA 1WOQA 3KHYA 4CZKA 1BG3A 3O8MA 1KAYA 4A61A 4JAXA 3FZHA 1TUUA 4JD2B 4CBWA 2Q36A 1TUYA 3O4WA 1S3XA 5F2RA 2GWKA 1T6CA 4BRPA 3OHRA 1SQKA 4PKIA 4PKHA 3LM9A 4HTLA 2H3GX 1CZAN 4A2BA 2Q97A 3DAWA 1J6ZA 1U6ZA 4MO4A 2GWJA 1Q18A 1ZC6A 3MN9A 5E26A 1R59O 1HLUA 4O5FA 4M7YA 2P9PB 5AFUH 4K43A 1NGDA 4CZHA 1Z6RA 3MMVA 1NLVA 2QWRA 2V51B 3EN9A 3VGMA 4IO8A 4IXCA 1NGBA 4BRDA 1MWMA 4H0VB 3SLCA 2ITMA 1TYQB 3R8EA 2D1KA 3O6WA 3H1QA 3CQYA 4H0OA 2ASPA 3O5BA 4JNEA 4YDUA 2CH6A 4A2AA 2P9UA 2Q0UA 2YJEA 3HBTA 4FWOA 4H5TA 4AM7A 1QZ6A 4BG9A 1BUPA 2A40A 4Y0WA 3FZLA 2V7ZA 5AQZA 3UE5A 4BRMA 3DXMB 2I7PA 5AQNA 3M1FA 4NO7A 3IFRA 5LJVA 3D2EB 3FLCO 1E4FT 2YCHA 4PL8A 5BRDA 1SAZA 5AQKA 1QQOA 2IVPA 1KXPA 4XH5A 3VF6A 1NM1A 5I9EB 1ZXOA 4XH1A 3R9PA 4FWLA 2P9SA 5JICA 3QFPA 1DKGD 1YXQA 2PBDA 3BF3A 4BR0A 3VEYA 1X3MA 3JS6A 4J8FA 4BGBA 1D4XA 4BRCA 2QWLA 1JCFA 3VEXA 3JXUA 5TKYA 1OKJA 4GY2B 1RDWX 1Z05A 1ZBSA 4WQ4C 5AQLA 1MA9B 5BRHA 1GLDG 2NZTA 5AZIA 3WUHA 3VGLA 2UYTA 1XC3A 3F9MA 1NGFA 3UKUA 4B1YB 3BP8A 3SK3A 3TU5A 4CZGA 5KPRA 3VEZA 5EOYA 3D2EA 2D0OA 2Q2RA 3QBXA 3A5OC 4EAHD 1U2VA 1V4SA 3VENA 3U8XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F9WA 4ISGA 1VSKA 3DXKA 4DV5K 4W5QA 2FXUA 3CCQN 3THYA 3OJUA 3JSMA 2F4VK 1BIZA 2VGNA 4N56A 3MCAB 2QWQA 4I7FA 5CR4A 4BRFA 4O4GA 1BI4B 3KLIA 3LP0A 4BR4A 1S6QA 3MN5A 3S9HA 2E6MA 2QTDA 5HRRA 4H4MA 1Q86O 4ELUA 4KHUA 2KTQA 3A0IX 2GEMA 3O3GA 4BC4A 3OS2A 4ELTA 5I3UA 1XHXA 3G4SN 4LD0A 3V9ZA 4DQQA 4AM6A 2FBXA 3OYCA 1XWLA 3QNNA 5KQDA 4DTNA 1KVAA 3CIPA 1TGOA 4CZFA 2P9LA 4K8ZA 1NNEA 3TI0A 2VWBA 2FBTA 4FWNA 3TR8A 3K5MA 4CBXA 3VOVA 4DSLA 4H03B 1VQMN 4CEBA 3OYEA 2HNYA 2KFZA 3QIOA 1DGKN 1CXUA 3SBTA 2HMPA 4M3TA 2E2QA 4PQUA 3RSEB 1NK5A 3DLEA 1TKTA 1RGIA 3UKRA 4EIAA 4B1XB 1XUPO 4BGAA 4FM0A 4LF9K 4DV4K 3KLGA 2VQFK 2BANA 1HKBA 4WE1A 3CC7N 2O8BB 4CHOA 1X9MA 2BTFA 3CCVN 4OPJA 3VQBA 1A5VA 3O9TA 4XH4A 1WBDA 1YUWA 2O8CA 2V7YA 4ZHRA 5LMUK 4DG1A 1ATRA 3MN6A 4I9LA 4FJXA 3J7ZO 4WQ5C 4JK9A 2O8EA 2P9IA 3MN7A 4DTUA 5FRMA 2FSJA 4E7LA 5JS1A 3MWTA 4CHQA 3NDKA 3EKUA 4Z4FA 3BF1A 4CJ4A 3QEVA 3PO5A 4IJAA 1SUQA 3SMPA 4QCLA 3WEEB 1KSPA 1RT5A 1OVYA 3H1VX 5KRTA 1C0TA 3K59A 1NJXA 1DEJA 1DTTA 2HF4A 4DV2K 2Y1IA 1QQCA 5FPNA 3K5NA 4FLTA 4CF8A 3V1RA 1L5UA 1YT3A 5M1KA 1TKZA 3SZ2A 5BR9A 3O08A 1T8EA 4GV6A 3THVA 1ZBIA 1F21A 4QS8A 4JKBA 1Q81O 4OPKA 4Y1CA 2A42A 2QXLA 3VQ7A 3WNGA 3G0ZA 5J1EA 1VRUA 3WQUA 4H5NA 3C0BA 5M1PA 4C8KA 4GW6A 1JLCA 4OGCA 1MDUB 1HNIA 2NRTA 4NCBA 3NF9A 5AFUA 3ZLJA 2FBVA 4G9ZA 2QI2A 1FK9A 4ID1A 3ITHA 4LC9B 4NXMK 4FZXC 3HI0A 3DJCA 1X9WA 2E4LA 5KTQA 3ULEA 1NJYA 3ATVA 3OYHA 1S5JA 4BRAA 3KWGA 2P1JA 3O3FA 3VQCA 3SCXA 4FPBA 1YTUA 4E1MA 2WOMA 4HWIA 1K9MO 4PWDA 1RBUA 1ZBHA 3GBTA 3P1GA 2NRHA 3D2FB 1X9JA 4DFMA 4XEIA 4FLYA 4O8KA 4K25A 3THXA 4BR5A 3AO3A 3RTVA 1XNRK 3VQ9A 1KVBA 5EX5A 3H08A 4K42A 1DLOA 1TV6A 3VEOA 1NGEA 2PY5A 5JVGL 3CETA 3S3MA 1ZBLA 1IV0A 1BQMA 2P9KA 4DU4A 4CF2A 3GOIA 1NOYA 1W9HA 3ENBA 2A1SA 3M8SA 4O44A 3LAMA 5KRSA 4ZTJA 4LH5A 3QO9A 4YOUA 1XQSC 3L8BA 4OPAA 3D7EO 4BVOA 4DLGA 4KPYA 4KRFA 1X1PA 5C0YA 4JD2A 5E84A 1ZYQA 1SL1A 3LDSA 3CJBA 1MU2A 1S72N 3C7NA 3AA2A 2VG5A 3M3ZA 4JI2K 4JI6K 3SAFA 3J7AP 3M5RA 1YHQN 3LDNA 4CJQA 3IDHA 4CESA 2FSNA 1HX1A 1LAWA 2QWMA 4X62K 5EY4A 3M6GA 2UXBK 4FK0A 5C2DA 1TYQA 3VERA 2WONA 4X66K 4FWPA 5HRPA 3OYDA 4MLHA 4BQZA 2E88A 1FKPA 2Q0RA 2AP1A 5GAEP 1L3SA 3HK2A 2Z1JA 1VSEA 1HYZA 3P31A 1QQMA 2IGIA 2WUSA 4BWMA 4CBUA 2FLOA 3NF8A 3ID8A 4M45A 1GOCA 3AGKA 5FPEA 5AQIA 3AO5A 3VF4A 1HJOA 4U7BA 3ATUA 1N33K 3MWPA 1SKRA 1R0AA 4BE2A 1GLCG 4LH4A 3LL3A 4IFVA 1BWFO 2KHOA 2R7YA 4M42A 3IAYA 3U6FA 1D9FA 1IJJA 1BO5O 3LM2A 3ENHA 4GVEA 5AQWA 5BRFA 5FROA 2F8SA 4ILHA 5BR8K 4JKAA 3ZYYX 2J4RA 3J8AA 3ZX0A 1T05A 3NAEA 4NB4A 4C23A 1C0MA 1BA0A 3A8YA 4FPAA 3HSCA 1ATSA 3A2FA 1UA0A 4JI3K 1A5WA 3DWLA 3VN5A 3MXMA 3VQ5A 1HYSA 2YJFA 4H0YB 1TL3A 4A5AA 5HROA 3NE6A 4LY7A 4AQYK 3VQQA 3AGRA 4BRKA 2IC3A 2NUBA 2ZJPL 4CZKA 1NKBA 4Z4IA 4JKCA 1J9AA 4A61A 4JAXA 3FZHA 2OPPA 1TUUA 2YNGA 4CBWA 2WC9A 1U45A 3MEGA 3O4WA 1S3XA 5F2RA 3LWMA 1T6CA 3HRGA 1NG9A 4BRPA 3CC4N 2F8TA 3V1OA 3S3OA 4BDYA 4DSKA 4HTLA 3L2VA 1CZAN 4A2BA 4KH5A 1QHTA 4W5NA 1J6ZA 3NH0A 3LP3A 5E41A 5E26A 4KTQA 1HLUA 4O5FA 4M7YA 4K43A 4KKOA 1XMQK 3HXMA 4CHZA 3HP9A 1KFSA 1BQNA 1NGBA 2ITMA 4XIUA 2D0BA 1VQ4N 5CY4A 1VQ5N 3H1QA 3E1YA 5K14A 3OYMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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