The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
118
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structure length |
118
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Chain Sequence |
ASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAW
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conservation of a crystallographic interface suggests a role for beta-sheet augmentation in influenza virus NS1 multifunctionality.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Influenza a virus
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| total genus |
32
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| structure length |
118
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| sequence length |
118
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-05-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3OA9 A; 4OPA A; 3O9Q A; 3P38 A; 3P31 A; 3RVC A; 3O9U A; 3F5T A; 2RHK A; 4OPH A; 3O9R A; 2KKZ A; 3O9T A; 3EE9 A; 3O9S A; 3D6R A; 2GX9 A; 3KWI A; 3EE8 A; 3P39 A; 3L4Q A; 3M5R A; 3KWG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JLE A; 4ID5 A; 2O8E B; 2D1K A; 1Q7Y O; 2E2N A; 2D0B A; 3H08 A; 4GMJ B; 1ZBS A; 4FLV A; 3B8A X; 3MWP A; 4J8F A; 1HX1 A; 4BRH A; 4CJ3 A; 2UXD K; 3I8D A; 1S9E A; 1BA1 A; 2NNW A; 3AAP A; 4EIA A; 3BEX A; 4ILH A; 3CI5 A; 3LDP A; 4FJX A; 4NXM K; 3LP1 A; 4CHO A; 3L8B A; 3QIO A; 4QS9 A; 1Q9Y A; 5J2M A; 3DXM B; 5CZ2 A; 4CJR A; 3CQX A; 2HNY A; 5AQU A; 4BE1 A; 4LH5 A; 4CI6 A; 3DLG A; 3MED A; 4I9Q A; 1B92 A; 1Q82 O; 1LW2 A; 1ZXO A; 4RW8 A; 2JWL A; 5BRD A; 3EZ5 A; 4CE9 A; 4Z4G A; 2VG7 A; 2OTL N; 2HNZ A; 4BR7 A; 2AJQ A; 4WCE L; 1HUX A; 2ZGY A; 1BO5 O; 3G0Z A; 3CCM N; 1TGO A; 5AQJ A; 3VQ6 A; 3AA5 X; 5J2P A; 4K0K K; 5I3U A; 4W5N A; 3ZT2 A; 5AZJ B; 4N47 A; 5SWM A; 2FF6 A; 4CEO A; 3UKR A; 3C94 A; 4E3S A; 2GEM A; 1Q18 A; 3H6E A; 2O8B A; 3KZB A; 4DCH A; 3TR8 A; 5GAH P; 1NNE A; 4A2B A; 2PZS A; 1R0A A; 1I39 A; 3UB5 A; 3MCA B; 3WNH A; 3IDH A; 1P8Z A; 4HUF A; 2NRR A; 1EQY A; 4KHQ A; 4PKI A; 3V1Q A; 4DS5 A; 4OKE A; 3L3V A; 1QHT A; 5KPR A; 1CZB A; 1A5W A; 4B3M K; 4CIE A; 3AVA A; 1OH8 A; 3K5L A; 4PY5 A; 3HTV A; 2PBD A; 3ZX0 A; 2F9T A; 1WNS A; 4YOR A; 1VSD A; 4KTZ A; 3UKU B; 1NG9 A; 3D2F B; 2E1Z A; 3O5B A; 4H5R A; 1SKW A; 2DTU A; 3V6D A; 2QXL A; 4M3Z A; 3ZYY X; 1WUA A; 3L0Q A; 1C1B A; 5JVG L; 2AA4 A; 4C8N A; 5CE3 A; 2RN2 A; 4Z4H A; 4PUO A; 5AQP A; 1KC8 O; 4KAZ A; 1RTH A; 3TPQ A; 1TAQ A; 4DTR A; 2F96 A; 4DLG A; 2ASM A; 3PLA A; 2FBV A; 4EZ6 A; 3LDL A; 2BE2 A; 4GNI A; 1KSP A; 4W5T A; 1BI4 B; 3AGK A; 4AIL C; 4I9L A; 1U49 A; 1B9F A; 1BIS A; 2HHH K; 4CHQ A; 4H8K A; 2QWR A; 1KVA A; 2W41 A; 5GIO A; 3VTH A; 5KGX A; 3KLI A; 4A61 A; 4O8U A; 4BVP A; 4E1J A; 2QA4 N; 3WXM B; 4LF7 K; 3H45 C; 1BCM A; 2FXU A; 4AM6 A; 1TL3 A; 1UOC A; 1ZC6 A; 4J2D A; 3D2E A; 4JI4 K; 1HYZ A; 5CZ1 A; 1NGB A; 3AAQ A; 3B6O A; 4JV5 K; 4IWV A; 5C15 A; 5CYQ A; 2HB5 A; 3SPY A; 1RIL A; 2HOE A; 1VQL N; 3CCQ N; 1WN7 A; 5AQO A; 4E19 A; 5KQ8 A; 5ADX H; 1HQE A; 2IGI A; 3TAG A; 4BR2 A; 1YTU A; 3H46 O; 4FWS A; 3ULD A; 4DR6 K; 3BF3 A; 2X6N A; 4LFA K; 4FWO A; 2ZQB A; 1SKS A; 2HHX A; 5HRS A; 3E01 A; 3UKR B; 1HLU A; 1QQN A; 1RT7 A; 4F9O A; 3HYF A; 4XH5 A; 4JKG A; 1S1X A; 2KQ2 A; 4BRD A; 4DB3 A; 4DTU A; 3VQ4 A; 2O8B B; 5C42 A; 1BDG A; 4ICL A; 1TK5 A; 1LWE A; 3QIC A; 3VEZ A; 5AJ3 K; 1TYQ A; 4ZHR A; 3SAG A; 4N76 A; 5AQX A; 1TK8 A; 3QBW A; 4B3R K; 1U48 A; 3SUP A; 1SKR A; 3GG4 A; 5EXW A; 4FYD A; 3VQ8 A; 3KK3 A; 4BE2 A; 4DV7 K; 2KZM A; 2VQE K; 2Z1H A; 1N8R O; 3FLC O; 4ISG A; 3V1O A; 2JWK A; 3HP9 A; 3PX4 A; 4FWM A; 2HHV A; 2IAJ A; 2CGJ A; 2E4L A; 4CGF A; 1U45 A; 4OLA A; 4CJT A; 3BGR A; 3QML A; 2RF2 A; 1ZBU A; 4N56 A; 1WSF A; 1NJY A; 4FM1 A; 1RBS A; 2A3Z A; 1V4S A; 5AQF A; 4BRM A; 1Q81 O; 3NFA A; 3LPT A; 4CEB A; 2B5J A; 4EP5 A; 3TWH A; 4O4G A; 2G8F A; 4O8K A; 3K58 A; 4KH5 A; 2YHA A; 1YT3 A; 3OYD A; 2IC3 A; 3K9K A; 1QZ5 A; 4OX9 K; 1IBM K; 3DLR A; 5GAE P; 3Q7C A; 2D0P A; 2GBZ A; 1RDU A; 1RT6 A; 3NHG A; 4MQ3 A; 3AY9 A; 4DMN A; 4FVU A; 1WOQ A; 3DWL A; 4CIF A; 1RBV A; 3CC4 N; 4DR5 K; 1XNQ K; 4CBX A; 2X6S A; 4OKJ A; 5D3G A; 1EWR A; 3D2E B; 1TAU A; 4YY3 K; 4B1W B; 4DV3 K; 4JAX A; 4JNE A; 3NGY A; 4DF8 A; 5C25 A; 2BAN A; 4CEC A; 4BR5 A; 2HW3 A; 3CJC A; 3HPO A; 3OYN A; 2FSN A; 1QSS A; 2PY5 A; 4B9T A; 5AQH A; 2VWJ A; 4BGB A; 4LD0 A; 1QVF M; 3T7Z A; 1IKY A; 1FW6 A; 2P9L B; 3WXJ A; 3OJS A; 1NGI A; 2E6M A; 5FDL A; 4JKG B; 3C0B A; 3QFP A; 1A5V A; 2E2P A; 3SAF A; 5K14 A; 3KK2 A; 3CXC M; 4DTM A; 1TYQ B; 3V9X A; 1T03 A; 1KD1 O; 1I94 K; 1ESV A; 1HJR A; 4AHC A; 3O9R A; 2YCH A; 5FPE A; 4B3S K; 4BG8 A; 4BC3 A; 1HMV A; 3LAK A; 2O8C A; 1IBL K; 3CQY A; 5M1Q A; 1RTI A; 3VQ9 A; 2NZT A; 5J2N A; 1SZ2 A; 3DRR A; 2KFZ A; 3R8E A; 4KBO A; 2FF3 B; 1FKO A; 1KVB A; 1XC3 A; 4DTP A; 1XHZ A; 1O13 A; 2HBJ A; 4I6M A; 1TKX A; 2V52 B; 3NH2 A; 3NH1 A; 3O9U A; 4BQL A; 3D7E O; 4C8M A; 3KD1 E; 3EE9 A; 4CHY A; 2P9S B; 1KRP A; 1GLD G; 3CIP A; 1RDC A; 1GLE G; 1OH6 A; 4KKO A; 1VQM N; 4PKH A; 1S1W A; 5KGW A; 4BDZ A; 4DR3 K; 4OGE A; 4JKA A; 3OVN A; 1ITG A; 4M3Y A; 3V4I A; 4WQ4 A; 4H4O A; 4GY2 B; 3M8P A; 1U2V A; 3OYK A; 4A57 A; 1DLO A; 3D45 A; 5TKY A; 2P51 A; 1T44 A; 2HF4 A; 3RRH A; 1NOZ A; 4ELV A; 3L2R A; 2FSJ A; 4FSV A; 1NK8 A; 1RBT A; 4FXD A; 1X1P A; 1A5X A; 3O08 A; 4JN4 A; 4CK2 A; 1YUW A; 3RSE A; 3ATV A; 4Z4E A; 4F3T A; 3O3H A; 3AO1 A; 2J4R A; 1IV0 A; 4GW6 A; 3CMA N; 3F2K A; 1HKG A; 3J7Y P; 4CZK A; 1NWK A; 1VRT A; 3GDQ A; 1NGG A; 4DR7 K; 3NVM A; 4JKB A; 2A41 A; 3CM6 A; 3SQ1 A; 2PYL A; 4FJN A; 4OKK A; 4EAH D; 4RTF D; 3C6U A; 3VGK A; 3DAW A; 3M8S A; 4F2S A; 4CFC A; 1IJJ A; 1VQN N; 3HPH A; 2FBX A; 4CGH A; 3TAN A; 3U8X A; 5MLC Q; 3LL3 A; 3K57 A; 2QEX N; 4BRE A; 3O80 A; 1HKC A; 1LAW A; 3QDK A; 4C23 A; 4CEZ A; 3CQ8 A; 2D4W A; 3U3G A; 4LSN A; 4FLX A; 1OKJ A; 1QHA A; 4BC2 A; 1NGF A; 3TAF A; 4CHZ A; 3P4I A; 4KTQ A; 2O4I A; 3JYT A; 4DUY K; 4M7Y A; 3HM9 A; 3HRG A; 3VQA A; 5AQZ A; 3E9L A; 1VSI A; 2HBL A; 3HOS A; 3PX6 A; 4DV2 K; 2G8U A; 3SBT A; 3TSP A; 3OJU A; 2YNI A; 3LAN A; 1C0F A; 3MN6 A; 3SLC A; 1NK7 A; 4CBW A; 4MDB A; 4BWM A; 3VF6 A; 2QW9 A; 2HHU A; 1RTJ A; 5AQR A; 5KPT A; 4CEQ A; 4BWJ A; 4MDA A; 4FJK A; 4K8Z A; 3ZSY A; 4M3X A; 3OYL A; 5I42 A; 4H4M A; 3OS1 A; 1L3V A; 4CD1 A; 1SAZ A; 4OPA A; 3DMJ A; 3E66 A; 2VGN A; 4ISF A; 1BIZ A; 2IIR A; 4LY7 A; 4JKC A; 3WEE A; 2ZJR L; 1T8E A; 1QZ6 A; 4LC9 B; 3LWL A; 5CR4 A; 4H0T B; 1RT4 A; 1U2V B; 3DXM A; 4DTO A; 3IFR A; 2D0O A; 4DV1 K; 2XY6 A; 5E26 A; 4C8L A; 1N36 K; 2QK9 A; 3HP6 A; 2KFN A; 1UWB A; 1JCG A; 4FOI A; 4M3R A; 2B6A A; 4H0X B; 2ITM A; 1NJI O; 3LAM A; 2RHK A; 4BRA A; 4BAC A; 4BRO A; 4CFB A; 3NBP A; 1C1A A; 1MWM A; 1J6Z A; 4YOU A; 1RDA A; 1QQM A; 3C65 A; 3AVC A; 2VG5 A; 5AFU A; 5AZJ A; 3IMX A; 5CYM A; 4X65 K; 1YVU A; 3AVB A; 3L6Q A; 4FWQ A; 1RNH A; 1C6V A; 1J54 A; 5BPN A; 4B1Y B; 1JCF A; 2PFU A; 4DV4 K; 2IOC A; 1K9M O; 3JAM O; 1K6Y A; 3V81 A; 3J7A P; 1UA1 A; 2IVO A; 3LDQ A; 4IFY A; 4MLH A; 4Z0U A; 4M3W A; 4NLB A; 2XO7 A; 1NGD A; 4FK0 A; 3ZT0 A; 4KI6 A; 1S6P A; 2W6L A; 3DLE A; 1S72 N; 5LJW A; 1IKV A; 4U7B A; 3VEX A; 3FR0 A; 3N4P A; 5JLH A; 3RWU A; 4M3T A; 3RMA A; 3WNE A; 1RT2 A; 3IG1 A; 3UKU A; 2OA8 A; 3SV4 A; 1RT5 A; 4FO0 A; 1EET A; 1L3S A; 1YJW N; 4WQ5 A; 5KPZ A; 3QBX A; 3VQ5 A; 1T7P A; 5HRP A; 3HOT A; 3MX5 A; 3VQC A; 5AQL A; 4IEE A; 3O3F A; 1FKP A; 3P5J A; 1E4F T; 1SQK A; 2YJF A; 4KHW A; 3EKS A; 4FW1 A; 1ILY A; 3HVT A; 4FK2 A; 3BZK A; 3G25 A; 2ATQ A; 4LF4 K; 3ZSW A; 2GV9 A; 4YOW A; 1WSE A; 2ZJP L; 3H1Q A; 3L3U A; 2G8I A; 1BI4 A; 3O4Q A; 2QWL A; 3WEE B; 4FJM A; 2YKM A; 3M5R A; 2P9P A; 5AQY A; 4OO1 J; 4CEA A; 3CHW A; 2WOM A; 3C6H A; 3TTD A; 2V7Y A; 3QES A; 3ZLJ A; 3K0S A; 1N6Q A; 1VQO N; 3VGM A; 2ASO A; 3NF6 A; 4DU1 A; 1YJ9 N; 3F9M A; 3VEO A; 3HJF A; 4B9S A; 2A1R A; 4XH4 A; 2OAN A; 3S9H A; 2YJE A; 3VA0 A; 4FW2 A; 1Y97 A; 3U6F A; 4RW6 A; 3U9Z A; 4FJJ A; 3ATU A; 1EO1 A; 5FRN A; 2O8D A; 4WF9 L; 1VQ9 N; 1SL2 A; 1BWF O; 1RDB A; 4Y0W A; 2W42 A; 2OZM A; 3LWM A; 5BPL A; 4KH6 A; 5SZT A; 4JS5 A; 4HCB A; 4DV6 K; 2KLA A; 1BUP A; 1XWL A; 3H3O B; 5JVH L; 2Q0R A; 3BDP A; 1HYS A; 4BRI A; 4M63 C; 2NRW A; 1RDW X; 4CJF A; 4HUG A; 3FGU A; 1KCF A; 3NVK A; 4GKK K; 3VTI A; 4AH9 A; 3TAP A; 4B9V A; 1J9A A; 1SV5 A; 3RMB A; 3SZ2 A; 2P9N A; 3ZT1 A; 3SUN A; 3CM5 A; 3KHY A; 1W7A A; 3UE5 A; 5HBM A; 1ASU A; 1ZBF A; 3AA4 A; 1CZA N; 3QEI A; 3B6P A; 4JI3 K; 4CZM A; 3AO4 A; 1QVG M; 4H0O A; 2QWO A; 4BRK A; 4O0I A; 2WTU A; 3V9S A; 1IG9 A; 1VSE A; 4JK9 A; 3FFK B; 5M1F A; 3CCR N; 2GWK A; 4F3O A; 1YTA A; 2GWJ A; 1UA0 A; 2HF3 A; 1C1C A; 1HRH A; 4E1M A; 2D5R A; 4IDK A; 1ZBL A; 4DQI A; 2OCE A; 2QWQ A; 4JS4 A; 3RMD A; 2G8K A; 4CVN E; 1Q9X A; 3ZSQ A; 4CJ5 A; 2VWB A; 1MA9 B; 3LP3 A; 4BRL A; 3VQ7 A; 1NMN A; 3A5L C; 2XY7 A; 2P9P B; 3LP0 A; 1WSG A; 3WXK A; 1HNX K; 3DOK A; 3T1A A; 5BRH A; 4H0Y B; 1WLJ A; 4G9Z A; 4DU3 A; 2GUI A; 1LWF A; 4WFN L; 4EZ9 A; 2ZF5 O; 4DSJ A; 3IRX A; 3K59 A; 3MAQ A; 4WFB L; 4W5O A; 3O1B A; 5AQQ A; 5GIN A; 1REV A; 5HRR A; 4CK3 A; 2O8D B; 4FLW A; 1YJN N; 4M3U A; 4NYN A; 4IFE A; 2ZM6 K; 1MU2 A; 1MDU B; 4DSF A; 4RG8 A; 3FZH A; 4BRF A; 1NJW A; 2OZS A; 4HCC A; 1BIU A; 2P9L A; 4CW7 B; 1RBR A; 3PSI A; 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4BY9 C; 3QLH A; 4LF5 K; 2YNF A; 3AV9 A; 2Z1G A; 5F0X A; 5AFU H; 3K2P A; 3M1F A; 1QSY A; 2R7Y A; 5AQT A; 4KTW A; 4A59 A; 4FLU A; 3VES A; 3CD6 N; 3S3N A; 4CEE A; 2CGL A; 1YIT N; 4F8R A; 2DY4 A; 4KHY A; 2NRX A; 3I56 N; 1DKG D; 2P9U B; 5LL6 Z; 1JLQ A; 5AZI B; 4QOZ B; 3VMF B; 2OTJ N; 3OYC A; 4CEF A; 4FWP A; 4ILJ A; 4CZE A; 1FJG K; 4MO5 A; 5GAD P; 3QER A; 2LSN A; 3VER A; 1O1W A; 5M1K A; 3FFI A; 4BR0 A; 1Z6R A; 4NB4 A; 4QS7 A; 2VCP A; 4CF8 A; 3FZM A; 3DRS A; 4X66 K; 2E88 A; 4DG1 A; 5HL7 L; 4BR9 A; 3RRG A; 4PQU A; 3WT0 A; 1IKW A; 1VK0 A; 3VEN A; 4IOA L; 1L3U A; 4KRF A; 4CHN A; 4O55 A; 2HBK A; 1UAX A; 3ZSX A; 4J2E A; 3CCE N; 3GBT A; 3AVG A; 1YAG A; 2QKK A; 4EFH A; 4FCY A; 3D6R A; 4KRE A; 2YI1 A; 1D9F A; 1C0T A; 4ELT A; 1E3M A; 1DTQ A; 1N32 K; 2VG6 A; 4WQ4 C; 4BRN A; 3BUZ B; 3C7N B; 3CCU N; 4H5N A; 1GLF O; 4HWI A; 4DTX A; 2HHS A; 4JRP A; 4YNQ A; 5DM6 L; 3ALY A; 2OYQ A; 4GV3 A; 3T3F A; 1KLN A; 1NGE A; 3V9W A; 3E9P A; 2UUA K; 4GVM A; 1XQS C; 2HVH A; 1JLF A; 1D5A A; 2UUC K; 1JLC A; 3AVM A; 2YKN A; 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