The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
118
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structure length |
118
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Chain Sequence |
ASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAW
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conservation of a crystallographic interface suggests a role for beta-sheet augmentation in influenza virus NS1 multifunctionality.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Influenza a virus
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| total genus |
32
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| structure length |
118
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| sequence length |
118
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-05-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KWI A; 3L4Q A; 2RHK A; 3P31 A; 3M5R A; 3O9S A; 3O9R A; 3EE9 A; 3F5T A; 3EE8 A; 3RVC A; 3O9U A; 3OA9 A; 3P39 A; 3D6R A; 3KWG A; 4OPA A; 3O9T A; 4OPH A; 2KKZ A; 2GX9 A; 3P38 A; 3O9Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JLQ A; 2YJF A; 1Q9X A; 3EY1 A; 2P9L A; 3EN9 A; 5AZI B; 4LFC K; 4CFB A; 3WNE A; 4IG3 A; 1N36 K; 4GY2 B; 3FLC O; 2QWO A; 4KRF A; 4DTN A; 5FLX O; 2F9W A; 4DSF A; 1VSD A; 5JVG L; 4L8R B; 1X3M A; 1K9M O; 4KHN A; 3SAG A; 4M3Y A; 5KPT A; 3AAR A; 3I8B A; 3NF6 A; 3VQ5 A; 4JKF A; 4DV4 K; 1U45 A; 3P83 D; 4BGA A; 3RRH A; 1TYQ B; 3WXL A; 3ZT0 A; 4DB3 A; 3SQ4 A; 1OH8 A; 4CW7 B; 2F8T A; 1YIT N; 4KB0 A; 3TSQ A; 3CFP A; 1ATN A; 4W5Q A; 5GAG P; 3HOS A; 2P9P A; 3BZK A; 4YOR A; 2HNZ A; 4CER A; 3KIO A; 5C2F A; 4N41 A; 5JVH L; 4DTJ A; 4B3R K; 3OBY A; 3BP8 A; 4Z94 A; 3NVK A; 1HKG A; 1RT6 A; 1J5O A; 1UOC A; 2ZM6 K; 1UAX A; 1WOQ A; 2OA8 A; 4CEZ A; 1KLN A; 1IG8 A; 4WFA L; 1HMV A; 4I9Q A; 1E3M A; 2P9S A; 3T1A A; 5HRR A; 4B1Y B; 4JKC A; 4BE2 A; 3DLB A; 3HL8 A; 2FBT A; 4WYB A; 3ZLJ A; 2ZJP L; 4CJ4 A; 1R0A A; 4AHR A; 3HPO A; 3MK6 A; 5KPR A; 4A5A A; 1NGC A; 4QOZ B; 1TKZ A; 1BU6 O; 1G15 A; 1NBW A; 2ETJ A; 3M6G A; 1ZBF A; 3MX2 A; 1Q8I A; 1QQM A; 3QIO A; 1X9M A; 4FM2 A; 1IBM K; 4BRK A; 3ULD A; 1QHT A; 3BUZ B; 1YJN N; 1V4S A; 4CJT A; 1JLE A; 3TSP A; 1S9G A; 4I9L A; 3QES A; 1OVY A; 3MN5 A; 1T44 A; 4FM1 A; 1DEJ A; 3AVK A; 1Q82 O; 2F8S A; 2QTD A; 2DY4 A; 2FSN A; 3SK3 A; 1VQK N; 2E8A A; 4E7L A; 4WQ4 A; 3QEI A; 3G10 A; 1B92 A; 2PY5 A; 2IVO A; 2VQE K; 4FJH A; 1ZYQ A; 5M1Q A; 3C95 A; 2P9S B; 2PFU A; 3DLH A; 3DLR A; 3B8A X; 3NGI A; 1XI1 A; 4BRP A; 1NK0 A; 3TAN A; 3RMA A; 1KVA A; 1VQO N; 2VGN A; 3CXC M; 5JLH A; 2D4W A; 1WSI A; 3OYG A; 1C0M A; 4CFC A; 3RMD A; 1NOY A; 3VF4 A; 1NWK A; 4EIA A; 3CJA A; 3QEW A; 3EZW A; 2VCP A; 3QER A; 2NNW A; 4IFV A; 4B1W B; 4DR2 K; 1EET A; 1MWK A; 4E7I A; 1TUU A; 3TWH A; 5EU7 A; 2KLA A; 1L3S A; 4JD2 A; 3AO2 A; 1Y97 A; 3U3G A; 2NZT A; 2Z1J A; 4FWS A; 1JL1 A; 2P9I A; 4JKH A; 5FPE A; 1X3N A; 1ASU A; 4RW6 A; 4KH4 A; 3HPH A; 4G1Q A; 3K0S A; 1A5W A; 4BR0 A; 4CFD A; 1KLM A; 4DTU A; 4BDZ A; 4A5B A; 3G0Z A; 4OPK A; 5KRS A; 2QA4 N; 4DV0 K; 3S9H A; 1MWM A; 1J9A A; 1GLC G; 4CHY A; 1VSF A; 2PYJ A; 1NK8 A; 2QWL A; 2D0O A; 2VG6 A; 2DFF A; 4CJ5 A; 1LW2 A; 1YXQ A; 3T3F A; 4BY9 C; 4ID5 A; 1YUW A; 4AH9 A; 1Q7Y O; 3SBG A; 2PBD A; 3VEO A; 3LDQ A; 3ZYY X; 5E41 A; 1UA0 A; 3C7N A; 1KFD A; 5AQR A; 3HST B; 3PV8 A; 4DWI A; 3RMC A; 4JD2 B; 4CJQ A; 3QIN A; 1RNH A; 2HW3 A; 4NLC A; 1RBS A; 2NRZ A; 4YFU A; 3O9R A; 3TAF A; 1VQ6 N; 3SV4 A; 4JK8 A; 3LZJ A; 3ISN C; 4CZK A; 2P9I B; 1RT3 A; 2GUP A; 4FWR A; 4W5N A; 3CJC A; 3ZSQ A; 4AHS A; 3NH0 A; 5LMN K; 4DV1 K; 2G8K A; 4LFB K; 3MCP A; 3H46 O; 2RE2 A; 2GTD A; 2OCE A; 1YVU A; 2CH6 A; 3CM5 A; 4QAG A; 3SQ2 A; 3C65 A; 3O3H A; 2B5J A; 1VRT A; 3LWL A; 4DQP A; 1NGJ A; 2AA4 A; 3T1H K; 4CIG A; 4J8F A; 4YHH K; 4CEQ A; 2YV0 X; 2KZZ A; 1NKB A; 1GLF O; 1S6Q A; 3R9P A; 2IVN A; 4WE1 A; 5KRT A; 3C7N B; 3SQ1 A; 4DUY K; 4JI3 K; 1ZBI A; 5KGW A; 2ZE2 A; 3QFP A; 1JXB A; 2XY5 A; 3JAM O; 3ALY A; 3L2V A; 4CGD A; 2F7T A; 1N8R O; 3AVL A; 4CGJ A; 4YOT A; 1QQN A; 4JKE A; 1O13 A; 2FXU A; 3LP1 A; 3R3L A; 1IG9 A; 4EHT A; 1F21 A; 1Z25 A; 3V81 A; 4NLB A; 4BQL A; 3AAP A; 3U6F A; 3D6R A; 1DKG D; 4FJ7 A; 1B9F A; 1WSE A; 3DXM A; 4Q5V A; 3RR7 A; 1BIZ A; 2YX6 A; 4KHS A; 2UXB K; 1SAZ A; 4FVM A; 1LWE A; 1QSL A; 3VEN A; 4WF9 L; 1RT5 A; 3E9P A; 3CFR A; 3F5T A; 4BRE A; 1IBK K; 4DQS A; 2RKI A; 5FPN A; 4KHU A; 4DQI A; 3WQU A; 4IOX A; 2NRW A; 2EWS A; 4DV2 K; 3LAK A; 4DU4 A; 3DJC A; 3U3Y A; 3CG7 A; 4JRP A; 4IOA L; 5GAE P; 3O8M A; 5I9E B; 4X66 K; 3F73 A; 1RBR A; 1YJ9 N; 1DTT A; 4CJ3 A; 2QWP A; 3SAH A; 4H0V B; 3NGY A; 4F4K A; 3QO9 A; 3KLH A; 3K57 A; 4E7J A; 4FJM A; 4FJ8 A; 3EE9 A; 3QEX A; 1RDA A; 1GOA A; 3G6E N; 4KHQ A; 1RGI A; 3O9U A; 4CIE A; 2UUB K; 1SL0 A; 4HHT A; 3MED A; 3VPZ A; 1C6V A; 1C0T A; 3L2Q A; 4DFK A; 1T05 A; 4Z4G A; 1HRH A; 3K59 A; 4JS4 A; 4DQR A; 2E2N A; 3BF1 A; 2O8C A; 2BH1 A; 1GLL O; 1RTI A; 4GNI A; 4EZ9 A; 1S5J A; 3UKU A; 4FPB A; 3DXM B; 1NLV A; 3PUF A; 4MDA A; 3NDK A; 2ITG A; 2WUS A; 1RBU A; 3AVM A; 3HTV A; 2A1S A; 3TAB A; 3A8Y A; 3ZSX A; 4DFM A; 4BG8 A; 3M3Z A; 1JLG A; 5GAH P; 2AP1 A; 3QDK A; 5BR9 A; 2QW9 A; 4KTQ A; 3A5M C; 3BEX A; 2YCH A; 1ZBS A; 4OLA A; 1VSJ A; 1K6Y A; 3TI0 A; 1VSM A; 1RT4 A; 3JSM A; 1S72 N; 3SQ0 A; 4B1U B; 1HNW K; 5ELZ A; 4FJL A; 3R1X A; 5FRN A; 1Q18 A; 1C0G A; 4BE1 A; 1NNE A; 4CES A; 4B9S A; 5AFU H; 1XNR K; 2ZD1 A; 2LSN A; 3L4Q A; 4FPA A; 3OYA A; 2KFZ A; 3CPE A; 1ILY A; 3QNO A; 3CJ1 A; 4BC2 A; 5KQ8 A; 4A62 A; 2IVP A; 4CHN A; 4DTP A; 1J5E K; 3KK7 A; 3UKU B; 3A5O C; 5B8H A; 3OYF A; 2Q1N A; 4OPH A; 4L3Q A; 3TAP A; 3F2K A; 3OJU A; 3BZC A; 1VQ8 N; 2FLO A; 1S1X A; 4B8A B; 3KHY A; 4BVO A; 3EEQ A; 3MX5 A; 3BY5 A; 3W0L A; 3UE5 A; 4C1N I; 4DR3 K; 4K0K K; 3KK3 A; 3QNN A; 4K8X A; 1GOB A; 4KTW A; 4F9O A; 4DF4 A; 1BCM A; 3BDP A; 5HRN A; 3OYK A; 4DV3 K; 4N56 A; 1VSI A; 3LPU A; 4YDU C; 5A2Q O; 2KHO A; 2HF3 A; 4O0J A; 2XY6 A; 4DU1 A; 2V7Z A; 3TSU A; 1HQE A; 3E9L A; 4LF9 K; 4BRC A; 3SUP A; 3TTF A; 2GUI A; 1X9S A; 4NXN K; 3VF6 A; 1C1C A; 4DSI A; 3LAL A; 4LFA K; 4U7B A; 4H5W A; 3CPW M; 3G71 N; 1BI4 B; 1OVQ A; 3ENH A; 3J7Z O; 3V9Z A; 4E89 A; 4YOX A; 4PL7 A; 4CD3 A; 4JI7 K; 4ISF A; 3J81 O; 4BG9 A; 5AQO A; 4LF5 K; 1BWF O; 1Z05 A; 2F4V K; 4KHP K; 4EZ6 A; 2JWL A; 4H4O A; 1YTU A; 3OYB A; 4CBU A; 3VEX A; 1S22 A; 3RR8 A; 3CER A; 3KLE A; 3AO4 A; 3HOT A; 1WSF A; 3DXK A; 1DTQ A; 4LH5 A; 1T7P A; 3CD6 N; 2P9U B; 4OVL A; 1WB9 A; 4CJP A; 1BGX T; 3HM8 A; 3QIC A; 3SMP A; 3CC7 N; 3QIP A; 3OA9 A; 4NB4 A; 4JN4 A; 4FWQ A; 4PKG A; 4NCA A; 3HK2 A; 1WSG A; 3L6Q A; 4H4M A; 3K9K A; 4EFH A; 2YNI A; 5LY3 A; 4C8M A; 4M7X A; 4OGE A; 4BRM A; 3TAM A; 3SCX A; 2FBY A; 2V7Y A; 5DM6 L; 1KVC A; 3OHR A; 5AQF A; 5SWM A; 5J2M A; 4HCC A; 4UQG A; 2A41 A; 3HVT A; 3S3O A; 4B9Q A; 1LOT B; 3HJF A; 1T6D A; 2ZWH A; 4WCE L; 3CQ8 A; 4CHO A; 5EOY A; 4CZH A; 1BO5 O; 2HBM A; 3SPZ A; 3T7Z A; 3A2F A; 2Q97 A; 4PKI A; 5T7B A; 2WC9 A; 2HST A; 4FM0 A; 4CHQ A; 3DXK B; 4FWP A; 2F96 A; 4AM7 A; 4A61 A; 4CF1 A; 4J2E A; 3DLG A; 1S6P A; 3I0S A; 2QEX N; 4CGH A; 4DCH A; 5EX5 A; 1W2B M; 1VSL A; 4H03 B; 3N4Q A; 3F9M A; 4KHW A; 3FR0 A; 1KQS M; 3VQP A; 3J80 O; 1NK7 A; 1CZA N; 3MEC A; 4CIF A; 4OX9 K; 2YJE A; 2G8U A; 1RDD A; 3HBT A; 4LH4 A; 1NKC A; 2HHX A; 3KK1 A; 3KD5 E; 3W3D A; 4CJU A; 2G8I A; 3CI5 A; 3CMA N; 2O8B A; 3OYH A; 1D5A A; 5AFU A; 2XO7 A; 4KB1 A; 5JMV A; 4MQ3 A; 3NGZ A; 2D0B A; 4JI0 K; 3TTD A; 5M1K A; 3A5N C; 4FJ9 A; 2P9K A; 3FZM A; 3MEE A; 2O8E A; 4JNE A; 4KTZ A; 2ATQ A; 4W5T A; 3HSC A; 1RIL A; 4GV3 A; 3SMS A; 3SUO A; 4DSJ A; 3C6H A; 1WSJ A; 1HPM A; 2IIR A; 3H1V X; 3PSF A; 1T6C A; 3VEZ A; 3KLF A; 3U9Z A; 2QWR A; 4PL8 A; 4YNQ A; 1IH7 A; 2B6A A; 3EL2 A; 3VEW A; 3CCU N; 2WTU A; 4H0T B; 3FGU A; 3I56 N; 3OYD A; 3NF8 A; 2Z1H A; 2VWB A; 3ZSR A; 4AIL C; 4CF9 A; 3ATU A; 5C2D A; 4HUE A; 4JI1 K; 4ZHR A; 3PIO L; 3M8P A; 4B9M A; 3D2E A; 3MN7 A; 4FO0 A; 3IAY A; 3NHG A; 4JI5 K; 2Q0R A; 1VSH A; 3QFU A; 3QBW A; 2OZS A; 3PO5 A; 3OY9 A; 1C0U A; 2O8B B; 4ISE A; 3AVJ A; 2VWJ A; 1KC8 O; 3LM2 A; 4CBW A; 2YI1 A; 4YY3 K; 4MFB A; 2O8E B; 3O4N A; 5FPM A; 5K14 A; 2P9L B; 4BRD A; 3TAG A; 3ASM A; 1SV5 A; 5I42 A; 4XIU A; 4ELT A; 2A40 A; 4AF1 A; 2P5O A; 1HKB A; 1NJY A; 1SL1 A; 4KI6 A; 4FLV A; 3M1F A; 4KH5 A; 4DR1 K; 1NMN A; 3O4W A; 3CJ9 A; 3TAQ A; 4KBO A; 1W97 L; 3DOL A; 4DQQ A; 4DTS A; 3THX A; 4IBN A; 3SLC A; 4JK7 A; 3THW A; 1A5V A; 2FBV A; 4CK2 A; 4F2S A; 4N47 A; 4O5F A; 2W40 A; 3LDO A; 4DTR A; 1WBB A; 3AA4 A; 4JHD A; 1E4G T; 2YHX A; 3AGK A; 4FSV A; 3D2E B; 1JCF A; 4XH1 A; 4R79 A; 4DTM A; 5GIO A; 4CEE A; 4H0P A; 4B08 A; 3E9O A; 3OYE A; 3DAW A; 5CYM A; 3CHW A; 2P9P B; 1X9W A; 4PWD A; 3VQ9 A; 2DFE A; 4M3X A; 3JXU A; 4H8K A; 1NK4 A; 4GKK K; 4AHC A; 3PY8 A; 3CCQ N; 4R5P A; 1L5U A; 2BDP A; 1TK8 A; 3OJS A; 3V9S A; 2P1J A; 3NFA A; 4WFN L; 1L3U A; 1R59 O; 1XQS C; 4HVJ A; 3NBP A; 1QVF M; 4IZ9 A; 5AQS A; 3M8S A; 4DG1 A; 4IOC L; 4J2B A; 1NGH A; 1QHA A; 1BA1 A; 1H1V A; 3AO3 A; 4CEA A; 2A3Z A; 1HUX A; 3THW B; 2KKZ A; 4M41 A; 2QKK A; 2O8F A; 3CC4 N; 4JHD B; 1ZBL A; 4Y0W A; 2QWN A; 4GVM A; 1VRU A; 4FLX A; 3HI0 A; 3EE8 A; 3MDQ A; 1QSY A; 1NM1 A; 5CYQ A; 4Z4E A; 4FXD A; 1NGF A; 3M8R A; 3FZL A; 5J1E A; 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5CR4 A; 5TKW A; 3QET A; 1QQO A; 4B3T K; 3WT0 A; 5J2P A; 3T19 A; 4Z4C A; 5C0Y A; 3ITH A; 3MAQ A; 4FLU A; 4FJK A; 4RW8 A; 4DSL A; 2D1K A; 2IAJ A; 2G8H A; 4Y1D A; 1C0F A; 1BL3 A; 4E1J A; 4RW7 A; 4CZM A; 2W6L A; 1MDU B; 1I94 K; 3CCS N; 4W5O A; 1VQL N; 3OW2 M; 2FC0 A; 2YHW A; 4OKK A; 1C1A A; 4M3Z A; 3PX6 A; 5DM7 L; 3NH1 A; 5CE3 A; 4X64 K; 4BQZ A; 4CF0 A; 4E19 A; 1VQ5 N; 2QM1 A; 3O9Q A; 5D3G A; 5C24 A; 2X78 A; 3AGR A; 1EP4 A; 4JI4 K; 1T03 A; 2HMI A; 4FJJ A; 1JLA A; 4DS5 A; 5C25 A; 2YKM A; 4CJR A; 5IWA K; 2BUP A; 3NE6 A; 1Y64 A; 1TL3 A; 4MO5 A; 1HNZ K; 3AO1 A; 3VQA A; 4M45 A; 3R8E A; 3AV9 A; 3IKM A; 3PLA A; 1O1W A; 1RCH A; 3P5J A; 4NCG A; 4BRF A; 1DGK N; 4X62 K; 4CGG A; 3CQX A; 3MXJ A; 4CZF A; 5H1S Q; 1S1U A; 3CCR N; 3O1B A; 4KHY A; 3KK2 A; 2QK9 A; 3EKS A; 1K8K A; 3F9K A; 4FLY A; 4J2D A; 1BQN A; 4CZE A; 2Z1G A; 2YHA A; 1QSS A; 3QEP A; 3MXI A; 5BR8 K; 4CGF A; 4YOW A; 4C8L A; 4H0O A; 4U67 L; 3A5L C; 5GIP A; 4FK2 A; 1U2V A; 2E88 A; 3OBW A; 5KTQ A; 1FJG K; 5C15 A; 2X6N A; 3NF9 A; 1SL2 A; 3VQ4 A; 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