3S41A

Glucokinase in complex with activator and glucose
Total Genus 176

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
176
sequence length
455
structure length
448
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
50100150200250300350400400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Designing glucokinase activators with reduced hypoglycemia risk: discovery of N,N-dimethyl-5-(2-methyl-6-((5-methylpyrazin-2-yl)-carbamoyl)benzofuran-4-yloxy)pyrimidine-2-carboxamide as a clinical candidate for the treatment of type 2 diabetes mellitus
doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 176
structure length 448
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3s41A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3s41A01
2V51B 3H3OB 1H1VA 3JS6A 4YDUC 3U9DA 3CI5A 4FWQA 3GE1A 4LC9B 4B1UB 3WXIA 4L3QA 1NGEA 1NGGA 4PKHA 2BUPA 1GLLO 4Z94A 1U6ZA 3O8MA 5AQNA 4YDUA 4BRPA 4BR9A 2VWBA 3ULEA 5E84A 3CERA 4BRMA 3FE1A 1C0FA 3GL1A 3HBTA 4BR5A 3WXJA 1LOTB 2CH6A 4B9QA 4BVOA 2E1YA 3KVGA 4H5TA 1Z05A 4AM6A 4KBOA 4MLHA 2YHYA 4RCHA 5F2RA 1YUWA 3KHYA 2V7ZA 4JNEA 3EKUA 4BRGA 1K8KB 2QWRA 4FWLA 3MMVA 3WUHA 1GLCG 4BG8A 1QQNA 5AQUA 2CH5A 3MK6A 5AFUH 3P4IA 1C0GA 1XC3A 2Q1NA 3LL3A 4FOEA 5AQWA 5BRFA 3CQXA 3LM2A 2Q2RA 2UYTA 2ZGZA 3ENOA 1JCEA 4MO5A 3HTVA 2YJFA 1E4GT 3FZLA 4WYBA 5BPNA 3CIPA 4CJ7A 4Y0WA 2QWMA 2GEMA 1HKCA 2J4RA 4JD2A 3H45C 1JCGA 2P9SA 1RDWX 2D4WA 4EFHA 1E4FT 3QICA 4FSVA 2E2QA 2H3GX 4EIAA 3QFUA 1DKGD 3BEXA 3EKSA 2A6AA 4H0TB 1NGJA 4QS8A 5B8HA 4F9OA 1GLJO 3U4LA 4CBWA 4BGAA 3A5LC 5ADXA 2E2OA 5TKYA 4PKIA 3AAPA 3UB5A 3OHRA 4ISFA 4JHDB 3CJ9A 3QFPA 4PKGA 1G99A 5BR9A 3VENA 1V4SA 2QXLA 1QZ5A 1BA0A 2NLXA 3DXKA 2IVPA 2QWOA 2P9UA 2IVNA 4CZMA 1Q18A 4NB4A 4CBUA 1HPMA 3MDQA 3U9ZA 4J8FA 2OANA 2W41A 4CZIA 5AQKA 3DWLA 3ID8A 5BPLA 1MWKA 3R8EA 4CZFA 2CGJA 3R6MA 5AQVA 5AZJB 2ITMA 2I7PA 3ZEUA 3WEEB 3VEYA 2E20A 1NGCA 2GUPA 3HSCA 4H0XB 2FF6A 2CGKA 5AQFA 5AQZA 5EY4A 4BR2A 4CZEA 3DXMA 1U2VA 3W3DA 5LJWA 5KQDA 3RSEB 2P9LA 5AZIB 1BDGA 3VEXA 5AQSA 1KAXA 4IO8A 4RTFD 3FZHA 5EVZA 1QQMA 4B1VA 1GLBG 4IJNA 3VEVA 3SK3A 2YJEA 2ASMA 3EL2A 1XQSC 4E1JA 3LDOA 1D4XA 4PL8A 1T44A 3CHWA 1J6ZA 2CGLA 2P9KB 1GLFO 5I9EB 4CD1A 4CZKA 1NGAA 1NGHA 4FO0A 4H5RA 3LDQA 2D0OA 5E26A 3UKRA 4BQZA 3CJCA 1ZC6A 3SLCA 3S41A 3VEWA 3D2EB 4IWVA 1OKJA 3R9PA 3UKUA 5ELZA 1BO5O 4QS9A 2ZWHA 2AP1A 3W0LA 3A5NC 2P9PA 1HLUA 4H0OA 3H6EA 1NLVA 3VEOA 5AQTA 2P9IB 5AFUA 4EHUA 5BREA 4IZ9A 5JLFA 3L0QA 4ISEA 1XUPO 2FXUA 1IJJA 2FLOA 5AQLA 2P9NA 1BWFO 4JD2B 3VGKA 4FWOA 3HI0A 3FZMA 1ATSA 2P9SB 3KZBA 3LDNA 4H5WA 1TUYA 3HM8A 4BREA 2ASPA 2GELA 2NRHA 3GG4A 4PL7A 4XH5A 4FOIA 4A62A 1NGBA 1DGKN 4MO4A 1NGDA 4FWSA 5AQYA 4DCHA 1T6DA 4WQ5C 3B8AX 1ZXOA 4FPAA 3H3NO 3WQUA 3VEZA 3ATVA 3DAWA 3GBTA 3O4WA 3C0BA 1LCUA 5EOYA 3VGMA 4XEIA 3FFKB 1ESVA 2FSNA 3MCPA 4XH1A 3VF4A 3EZWA 4DHYA 4BRNA 4RWTA 5CE3A 3L6QA 3CJAA 3O1WA 2WUSA 4B1WB 3J8AA 4BRFA 2FSJA 5AQMA 3I8BA 2FSKA 2ZF5O 1X3MA 1SZ2A 1HJOA 2QWLA 4EAHD 1TYQB 1K8KA 5EXWA 1ATRA 3D2FB 3WXLA 4BC3A 4GNIA 1NM1A 3AAQA 3ZETB 1S3XA 1NGIA 2QW9A 3VGLA 3ZEUB 3G25A 5BN8A 3FR0A 3UE5A 3VERA 4K42A 3O1BA 1WUAA 1ZBSA 1JCFA 3CQYA 3DJCA 4BRKA 4CZJA 1U2VB 3VESA 2F9TA 3A0IX 3C7NA 3MN9A 3FZFA 1Y64A 2D0PA 5JMVA 2YHWA 5KPZA 1GLAG 3VPZA 3F9MA 1YXQA 5ADXH 2GWKA 3SMPA 3M6GA 4O5FA 5JICA 4BC5A 2QWNA 1P8ZA 2QWQA 3ULEB 4K41A 3A5OC 3A8YA 1V4TA 1X3NA 4JN4A 1ATNA 4BC2A 3CJ7A 1GLEG 3LDPA 4BRLA 2DPNA 1Z6RA 1BOTO 3IFRA 1NGFA 5FPDA 2E2PA 2PAVA 4FL9A 5AQRA 3ENHA 4B1YB 5AQQA 4EHTA 5LY3A 1CZAN 2IIRA 4BRIA 1SAZA 4C23A 1YAGA 1NBWA 4WQ4C 4IJAA 1MWMA 1BUPA 5FPNA 2NZTA 1HUXA 4BC4A 2HF4A 1NMDA 3TU5A 1GLDG 3MN5A 4IXCA 3IUCA 3QMLA 5AQPA 4BG9A 4CD3A 2A5XA 1BA1A 2BTFA 2PBDA 2VCPA 4BQLA 2Q0UA 5JLHA 3ZX3A 4BVPA 1KAZA 5AZJA 2Q0RA 1KXPA 3WEEA 3QBXA 2AA4A 3EN9A 4CBXA 3CETA 4FWMA 3ZX2A 4FWRA 5KQ8A 5BRDA 2D1KA 2A41A 2YCHA 3RSEA 5AZIA 4H03B 5KPTA 2E2NA 4I6MA 5AQIA 1SQKA 4BR0A 1MDUB 2HOEA 2A42A 3WT0A 4M7YA 5AQXA 2KHOA 2GWJA 4FPBA 5EX5A 3VETA 5AQJA 3CJ1A 3U8XA 1QQOA 2P9KA 4BRHA 1NWKA 1HKBA 3O80A 4WQ5A 4A2BA 5AQOA 3O5BA 1DEJA 1QZ6A 2YI1A 3A5MC 5AQGA 1BU6O 1QHAA 3D2EA 2F9WA 4BRCA 1BG3A 3O08A 3DXKB 2V52B 2QM1A 3LM9A 3HZ6A 4DB3A 2P9UB 2IVOA 2I7NA 4FWPA 3FGUA 5AQHA 1HX1A 3VF2A 2E8AA 3ATUA 3H1VX 4CI6A 3C7NB 3ZX0A 3VF6A 4NO7A 2P9IA 2Q31A 3M1FA 4CZHA 3GOIA 4O8KA 3O6WA 3QBWA 3QB0A 4B1ZA 4MLEA 1HKGA 2E88A 1R59O 3LDLA 4H5NA 5F0XA 3EO3A 3H1QA 4HWIA 3I33A 1X9JA 3H46O 3IMXA 3WQTA 1RGIA 4CZLA 4H0VB 4K25A 2V7YA 4H0PA 2GTDA 3GDQA 3AARA 3DXMB 5KPRA 1KAYA 4FWKA 3QDKA 2P9LB 1EQYA 4A2AA 4BRDA 2QWPA 4M7XA 2Q36A 3MN6A 2HMPA 4JAXA 4AM7A 2EWSA 4BRAA 1RFQA 4FWNA 5BRHA 3M3ZA 4K43A 4BROA 2A3ZA 2E1ZA 2FF3B 4BR7A 3FZKA 4H5VA 4CZGA 3BUZB 3BF1A 1MA9B 3L4IA 3MN7A 4ISGA 5LJVA 3UKRB 3AY9A 1TYQA 4QS7A 3SMSA 3FLCO 3SJHA 4A61A 2ZGYA 5BN9A 4HTLA 3D2FA 3CJBA 3ZETA 5FPEA 4JHDA 3UKUB 1YVNA 3VOVA 5AR0A 1S22A 2A40A 2Q97A 3D7EO 3JXUA 1T6CA 1TUUA 1WOQA 2W40A 3BP8A 2P9PB 3BF3A 4XH4A 3IDHA 4WQ4A 3TPQA 3WXKA 2HF3A 5F1XA 4B1XB 2VYPA 4GY2B 4DQ8A 5BPMA 1IG8A 4M63C 2P9NB 4I6MB 4BRQA 2YHXA 4H0YB 4BGBA 4BR4A 2ASOA 5FPMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3T1HK 3JS6A 1DTTA 3U9DA 3GE1A 1UA1A 3WXIA 4L3QA 4JS5A 1Y97A 4RW8A 2BUPA 1W97L 4DLGA 3OYIA 4BRPA 4BR9A 1RTJA 3AVFA 3GL1A 4MFBA 2WBNA 3WXJA 1N5YA 5GIPA 5CZ2A 4FK0A 4CHYA 3IRXA 4AF1A 4N56A 4H5TA 1Z05A 4G9ZA 3OS2A 2BE2A 4KBOA 4CJSA 2YHYA 1C0UA 3LWLA 1YJWN 4DKWA 2YNHA 4CFCA 5JS1A 2A1SA 3AGKA 3TTCA 1NKBA 4JNEA 3CFOA 3AVGA 4CGDA 1S6PA 4BRGA 2HHUA 3O9QA 2WONA 3THXB 4FWLA 4ELVA 3MMVA 1QQNA 3SCXA 4BWMA 4O0JA 4WF9L 5BRFA 1QQCA 4JKAA 3D6RA 1ZBFA 3DOKA 4JK7A 2Q2RA 4DU1A 3AO2A 3THYB 1E4GT 4FZXC 3CXCM 3CIPA 2Q3SA 2HBJA 4Y0WA 2HMIA 2EHGA 3OW2M 4FJGA 4FZZA 1G15A 1EX4A 4CGJA 1S6QA 2P9SA 1E4FT 4FSVA 4M45A 3OJSA 3AO4A 5M1OA 4JKBA 1VSFA 2A6AA 4CBWA 1S1VA 4BGAA 4RW9A 1F21A 4YNQA 4DU4A 3OHRA 4CECA 2UXDK 3VENA 4ILJA 5GAHP 4CIGA 1TVRA 1V4SA 2NLXA 3HM9A 4N76A 3HP6A 4LFCK 3AVCA 2NRVA 4YOXA 2P9UA 5GAEP 2PY5A 4CZMA 4KI6A 3ZSZA 4WFBL 4UQGA 3DYAA 1HPZA 4NYFA 4DUYK 3AA3A 3JSMA 4LFBK 3VTHA 1Q7YO 2CGJA 3R6MA 1X9SA 5JVHL 2ITMA 1N32K 2I7PA 3WEEB 1FW6A 2E20A 1K9MO 3HSCA 3OYCA 4H0XB 1ZBHA 1KSPA 5I42A 1TK5A 3HO1A 1QSYA 2CGKA 5AQFA 1DTQA 4X66K 4IEIA 1JXBA 5D3GA 5AZIB 3VEXA 4IO8A 3CCJN 3FZHA 4LF5K 4DMNA 5KRSA 3SV3A 3RR7A 3TSQA 3MWTA 3V1OA 2XHBA 2YJEA 3KWIA 4XIUA 5GIOA 1NGHA 2D0OA 1IKYA 4JI7K 3UKRA 4BQZA 3CCMN 1L3TA 1ZC6A 1IBLK 4AQYK 1S9EA 3L2VA 2ZJRL 3OYBA 1IG9A 3OJUA 3ZT3A 4KH5A 1WSHA 2XY5A 3W0LA 3A5NC 1NK7A 3TAEA 5FRNA 2P9PA 4YHHK 5AQTA 5AFUA 1N6QA 3L0QA 4KHSA 1XUPO 2FLOA 4UY8O 1TKTA 1RT3A 3VGKA 4FWOA 3C65A 2OPPA 4H5WA 4O55A 1VQON 3DLGA 5C42A 3GG4A 3HVTA 4FWSA 5AQYA 1YTUA 4JEPA 1T6DA 4CGHA 2HHQA 1SV5A 4FPAA 1YIJN 3VEZA 2E5LK 3DAWA 3PX4A 3NE6A 3GBTA 1IBKK 4CJ3A 4CHPA 2G8IA 1LCUA 2NRZA 5EOYA 4XEIA 3L8BA 3RTVA 3ZT4A 4DSJA 4JI0K 4RWTA 1KLMA 3O1WA 2B6AA 2OYQA 4B1WB 4BRFA 1WLJA 1JLGA 1SKSA 4C8NA 3VN5A 4LH5A 2YHAA 3C6UA 3M5RA 4CHZA 1RT7A 3LP0A 4YORA 3THXA 5EXWA 4EZ9A 1ATRA 4IFVA 3HSTB 4BC3A 4DR4K 1NGIA 3SUNA 4NLCA 3G25A 1D9DA 4H4OA 3VERA 1TKDA 3V1RA 3RRGA 4BRKA 1CLQA 4RW7A 2F9TA 3A0IX 4F4KA 4NCBA 3MN9A 5JMVA 3K5MA 3VPZA 1YXQA 2R7YA 2OPQA 5HRPA 3M6GA 4O5FA 5JICA 3NF9A 3M8PA 1LAWA 1KTQA 1Z25A 4LY7A 4LF6K 2QTDA 4E7LA 3TAFA 3A8YA 3BY5A 3G10A 1ATNA 3NGYA 3P31A 3CJ7A 3E66A 3DLHA 4BRLA 2DPNA 1BOTO 3IFRA 5FPDA 4ELUA 1OH5A 4C23A 4BRIA 4O44A 1NBWA 1S1TA 1X1PA 3OTOK 1BUPA 4DTMA 1W0HA 5HRRA 2NZTA 3M8QA 1BL3A 3P39A 4KPYA 1LWCA 3QMLA 4BG9A 1BA1A 3CPEA 2PBDA 2VCPA 2UXBK 4A5AA 1WAFA 3VQQA 3NF6A 4DSLA 4CEQA 2Q0RA 1KXPA 3WEEA 4Z4IA 4N47A 1YJNN 4CBXA 3PIOL 3SAGA 4FWMA 5C10A 2FBXA 2JWLA 3ZSOA 4DR6K 4FM0A 2YCHA 5AZIA 3V9UA 4H03B 2YKMA 1W2BM 5AQIA 3PIPL 3ZSXA 4JI6K 4I9QA 4M7YA 5AQXA 4JKEA 3OYAA 4FJMA 3O9SA 3RWUA 1OVQA 1QQOA 3SUQA 3LAKA 3ID6A 4WQ5A 4A2BA 4DF8A 1CXUA 3V81A 4NYNA 1TGOA 4CEDA 1WSFA 4BRCA 2V52B 1IKXA 4DB3A 1QVGM 1JLAA 4DV6K 3FGUA 3KLIA 3SJJA 3VQDA 2E8AA 3ATUA 1NK8A 4CI6A 4LSNA 2ZJQL 3VF6A 4NO7A 1ILYA 1JJ2M 3O6WA 4FW1A 4B1ZA 1B9DA 1KD1O 2YNGA 3RMCA 4AHSA 1U47A 4ID1A 4CF9A 1RGIA 4K25A 4H0PA 1XWLA 3AARA 4C8MA 3WXMB 4NXMK 4O5BA 4M7XA 1REVA 2Q36A 3NFAA 2EWSA 2ATQA 3NVMA 1WB9A 1RFQA 4Z0UA 5BRHA 1T8EA 2B4JA 2XRIA 2GV9A 2FF3B 3FZKA 3P1GA 4BWJA 3BUZB 4C8LA 1N34K 3DLKA 1MA9B 3AO1A 2VWJA 3AY9A 3V9WA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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