3TR8A

Structure of an oligoribonuclease (orn) from coxiella burnetii
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SNAMDFSDDNLIWLDLEMTGLDPERDRIIEIATIVTNSHLDILAEGPAFAIHQPDKLLTAMDNWNTSHHTASGLLERVKNSSVDEVEAETLTLAFLEKYVSAGKSPLCGNSVCQDRRFLSRYMPRLNQFFHYRHLDVTTLKILAQRWAPQIAAAHIKESQHLALQDIRDSIEELRYYRAHLLNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural genomics for drug design against the pathogen Coxiella burnetii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Oligoribonuclease
molecule tags Hydrolase
source organism Coxiella burnetii
total genus 62
structure length 184
sequence length 184
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.-.-:
pdb deposition date 2011-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3tr8A00
3TARA 4GMJB 4PY5A 1MU2A 5JS2A 4DG1A 4GW6A 1KVCA 3LWLA 2DFFA 3SUQA 1LWEA 2BANA 3AA4A 2X78A 2QKKA 4CJPA 4DFMA 1VSHA 2E4LA 4CF0A 3HSTB 4DQRA 2ZD1A 2YNHA 1WSHA 2RPIA 1UA0A 4FJLA 3AVCA 4JS5A 1NOZA 3HPOA 4DSJA 4ELUA 4EZ9A 3K5OA 2VWKA 4O55A 3V4IA 2DY4A 1YVUA 3PY8A 3TANA 3LANA 3TAPA 4CIGA 3LZJA 3DRRA 3M8RA 4NCBA 3ALYA 3CQ8A 3SV3A 3ULDA 1BQNA 3OYCA 1Z26A 4ZTFA 2G8WA 4CHYA 4C8KA 2HHQA 3V6DA 2I5JA 3P1GA 1JLGA 4C8LA 2ZE2A 3AVLA 5HLFA 4KB0A 4ICLA 5CZ2A 3K5LA 2KQ2A 3QESA 1Y97A 4B9UA 3OYJA 3WNHA 2HVHA 1DTTA 4FJHA 1UAXA 3SV4A 4DF8A 4XIUA 4DLGA 2R7YA 4DLEA 2Z1IA 4FJGA 1IO2A 4DQQA 4CJEA 1VSEA 3M8QA 2E6LA 1LW0A 1LWCA 4CGGA 4HHTA 3BDPA 2IS3A 2EX3A 4KHYA 2QK9A 4FXDA 3DLRA 2KZZA 3U3GA 3RMCA 2B4JA 3K59A 3MXMA 4OGCA 3M8PA 4DFJA 1L3TA 3NBPA 1A5XA 4FLVA 1RBUA 1NKBA 5HROA 4DSIA 4PUOA 1BQMA 4C8MA 3OYEA 4DU1A 4DQPA 3KD5E 1QTMA 4KREA 2RN2A 3LP0A 4DTOA 3QEIA 1J53A 3IRXA 3UIQA 4FJNA 4CJWA 3PUFA 4B9NA 1W9HA 1KSPA 3AVAA 3QLHA 4N76A 4NCAA 3OYLA 4B9SA 1WAJA 4FK2A 5DK5A 4AHUA 3AO2A 3AVNA 4OKJA 4FCYA 1YTUA 4DWIA 1HYSA 4I9LA 4HCBA 2D0AA 3T1AA 1KRPA 3SUPA 4FW2A 3AVKA 3KIOA 2XHBA 4KHWA 4M3XA 3SPZA 4PQUA 4KHUA 3QEXA 3P5JA 3CG7A 3WNEA 4ELVA 4W5TA 4CHOA 1JLQA 4N5SA 1LAVA 2G8VA 1UWBA 4J2AA 4OKKA 4HCCA 4KI6A 4B3OA 3T3FA 3KK2A 1ASVA 1TL1A 3ZT0A 4FJJA 1BGXT 2YNGA 3QO9A 1RDAA 1JLAA 1RT1A 3I0SA 2KTQA 1VK0A 3MXJA 2XY7A 2A1RA 1ZYQA 2HNYA 1BI4B 3DOLA 3SPYA 3QIPA 2Z1HA 1RDBA 1RT2A 2D0CA 3IG1A 1WN7A 4GVMA 4M41A 3ZSVA 3KK1A 1NK9A 1D9DA 2XY5A 3ASMA 3RTVA 3VN5A 4DS5A 4QCLA 3O4QA 1BIUA 4TSXA 3AO3A 4AH9A 3SUNA 3U3YA 1XI1A 3B6OA 3ISNC 3D0PA 3S3NA 1U49A 4CJQA 1HJRA 4CJUA 3F9KA 1X1PA 3D45A 3AO1A 4KTQA 2PYJA 3H08A 3AVJA 4BDYA 3FFIA 1I3AA 3NCIA 2RKIA 1RDCA 2YNIA 4CJ5A 2O4GA 4DS4A 3RMAA 1N5YA 2F8TA 2YNFA 4KTWA 1NKEA 1B9FA 1C0UA 2AJQA 4HTUA 1C0TA 4H4MA 4BE2A 4FVMA 3OS0A 3V9UA 1NJWA 1NKCA 4HUEA 1FKPA 4M3ZA 3QNNA 3K58A 3TI0A 4I2QA 3JSMA 4LSLA 3HL8A 1RBVA 3QEPA 4FJKA 3SCXA 2HMIA 4CJ4A 1G15A 3SQ2A 1U47A 4CF9A 1SUQA 3CFRA 4M3YA 1RILA 2FBYA 2YKMA 2YKNA 3NF9A 2XY6A 1L3SA 1NJZA 2HB5A 1FKOA 3IAYA 1RT5A 3V9ZA 4CF2A 2OPRA 2PZSA 5FRMA 1C0MA 4KHNA 5FDLA 4B9LA 1IKWA 4ID5A 3KJVA 2OZMA 1QQCA 1HQUA 3OVNA 1EP4A 3CFPA 3KKSA 2Y1JA 4Z4CA 3AA3A 4O0JA 3C6TA 3MECA 5CY4A 3NH1A 4E7JA 3CM6A 3OYMA 5HRPA 2HHTA 3WNFA 4CEOA 4DTNA 1JKHA 4KTZA 3MEGA 3NF7A 4FLUA 3RMBA 3TR8A 3BGRA 5J2MA 2VG7A 4DQSA 2LSNA 3VQAA 3DLBA 2EHGA 3HP6A 1JLEA 1TK0A 4LY7A 3LP1A 3SUOA 4N47A 1EX4A 1HNVA 4CESA 2JLEA 4O0IA 5C24A 5K14A 3OJUA 5KRSA 4CHPA 4W5QA 3VQPA 2NUBA 3G10A 1ZBHA 4O4GA 3OYFA 3QNOA 2FC0A 4E1NA 1L3UA 3NE6A 1KFSA 1VSKA 3KLEA 4JS4A 1KLMA 3VQEA 1S9GA 4IFYA 2G8FA 3VA3A 1QSSA 5J2NA 4FZZA 1TL3A 1GOAA 4I7FA 2P5OA 4FYDA 2Z1JA 1HYVA 3VQ7A 3U6FA 4FM1A 2B6AA 2W42A 2A1SA 3DLGA 1KTQA 1B92A 3TWHA 3OYNA 3I0RA 1SL1A 1WAFA 1Q9XA 4OPJA 1FK9A 1LAWA 4CCHA 3LPTA 2X74A 3MXIA 4F3TA 3SNNA 1SV5A 1DTQA 3SJJA 5CYQA 3VQ6A 1BIZA 4FJXA 5J2QA 1K6YA 4RW4A 3T19A 3SZ2A 1VRUA 3NF8A 4H8KA 1NJYA 1O1WA 1WSFA 3VQ9A 1VSJA 3K2PA 1QHTA 3ZSQA 4QAGA 4DFPA 2OYQA 2DTUA 4ZTJA 4I2PA 4CJKA 4DU3A 4IBNA 3ZSXA 4CF8A 2XRIA 1XHXA 4OVLA 1IH7A 2G8KA 4CGDA 4MFBA 4KAZA 3LAMA 3I8DA 3KLHA 4RG8A 1HYZA 2VWJA 4J2BA 3MEDA 5J1EA 4E3SA 1TK8A 4CHZA 4DSKA 1RT6A 4MQ3A 3HK2A 2Q3SA 3AVFA 1XHZA 4KHQA 3TABA 5JS1A 1HPZA 1S1WA 3PV8A 4L8RB 3L2VA 3S3MA 4N41A 2ITGA 4B8CA 2HHVA 3S3OA 3DRPA 4E7LA 4DSLA 4DSFA 3RR7A 1YT3A 1NK4A 4W5NA 1Q9YA 1HRHA 1D9FA 4KI4A 1U04A 2PYLA 2OPSA 3G0ZA 1JL2A 1XC9A 1WSEA 4Z4HA 4M3WA 3EY1A 1TKZA 4RW9A 4CJRA 3VQCA 4HUGA 4NCGA 2BE2A 3C94A 4B08A 1X9WA 1N6QA 1GOCA 1RBRA 4CK1A 3HVTA 4HVJA 1ITGA 1IG9A 3NHGA 3M8SA 1RBSA 5DMRA 4Z4IA 4AILC 1L3VA 4Q0BA 4EP4A 5HRSA 2ZQBA 1RTIA 4RW6A 1WSJA 4Z0UA 2VG6A 4E1MA 3P83D 4CEFA 4Z4GA 4BWJA 4JLHA 3AVIA 3V1OA 3DLHA 2RF2A 2X6NA 3IS9A 3ZSZA 1BI4A 1QS4A 2YHAA 4AHTA 4M3TA 3ZT2A 5D3GA 3NGZA 2IC3A 2KZMA 3AO5A 1HNIA 1JXBA 2DFEA 4CK3A 3K5MA 4RW8A 2HHWA 2PY5A 3AVBA 1FXXA 3AVHA 1WNSA 4EZ6A 1S6PA 2GV9A 5HRNA 1YTAA 1U48A 2IAJA 1X9SA 2IOCA 4FZXC 4ELTA 4C8NA 4J2DA 2F96A 3TAGA 2IGIA 1NK5A 1J5OA 4RW7A 4DTJA 4H4OA 4B9TA 3HXMA 1U4BA 1SKSA 1T8EA 1JLBA 3HVRA 1BCOA 4KKOA 1JL1A 4CEAA 5HRRA 3V9SA 4Q5VA 1VSFA 1U45A 5HP1A 2HVIA 3KK3A 4BACA 1LWFA 4KV8A 4DTXA 1CZBA 1I39A 4CJSA 3RWUA 3LZIA 1LV5A 3F73A 4FJIA 4DTMA 2KFZA 4FW1A 3AVGA 3VQQA 4K8XA 4R5PA 5J2PA 4PWDA 3DM2A 3C95A 3AA5X 4DTPA 3HP9A 4FLXA 3O3FA 3OYIA 1J9AA 1B9DA 1VSMA 1HQEA 3QIOA 4CEEA 1GOBA 3VQDA 4CEBA 3OYBA 3LWMA 1NK7A 4WE1A 4CFDA 3QEWA 4DF4A 3RRHA 1RTJA 1SKWA 1QSYA 4FJ7A 1C1CA 3E01A 4FJ8A 3VQ8A 4FLYA 2X6SA 3O3HA 4OLBA 4YNQA 1ZBUA 3LAKA 3NFAA 4FK4A 4KRFA 4Z4EA 3RR8A 5I42A 3O3GA 1R0AA 3HYFA 4FK0A 3HO1A 3QETA 3LDSA 3SQ1A 3ZSRA 2P5GA 4E7KA 1IKVA 3V1RA 4FZYA 2OPQA 4IFVA 2D0BA 1ZBFA 3TAQA 1Z25A 3DRSA 4NYNA 4Y1CA 3AA2A 4F8RA 3EZ5A 2B5JA 3AVMA 4CE9A 4FLZA 3V9WA 4DTUA 4LD0A 3THVA 3HT3A 5SWMA 4FM0A 3KD1E 2XY8A 4E7HA 2JGUA 3LALA 3OYHA 4CEQA 3DI6A 3L2RA 3ZT4A 3QINA 1D8YA 2HHSA 2YV0X 2OPPA 5CYMA 3ZSYA 2P1JA 4OKEA 4FLWA 2FBXA 4CFCA 1ZBLA 4KHSA 4IKFA 4W5OA 5KGWA 2BDPA 5KI6A 4CF1A 4YFUA 4DFKA 4OLAA 4IG0A 3KLGA 2OZSA 2OA8A 1VSLA 3DMJA 4NYFA 3OYKA 4BE0A 1NOYA 4LH5A 2HHUA 2IDOA 1S1VA 3V81A 3SQ0A 3PO4A 4BWMA 1QE1A 3TAMA 4E19A 4FJ5A 1T05A 3KLFA 3K5NA 3L8BA 3LP2A 3NF6A 4F2SA 2XO7A 1C6VA 1TVRA 1IKYA 4CHQA 4CGFA 4CK2A 1X9MA 3CM5A 1IKXA 1XWLA 3WNGA 5CZ1A 4CEDA 2QXFA 3CYMA 1CZ9A 2WOMA 4CFBA 5E41A 4UQGA 4CFAA 4CGIA 5I3UA 3NDKA 3RRGA 3VQ4A 5KGXA 1WSGA 2ETJA 5HBMA 1W0HA 4OGEA 4CEZA 2G8HA 3TAFA 1T7PA 1REVA 2HHXA 3HPGA 3SYZA 4E89A 1KLNA 3SI6A 1RT3A 4Z4FA 1ZBIA 1JLCA 3OYAA 1TGOA 2BGGA 2FBVA 3K57A 1C1AA 4CHNA 1UOCA 1CXUA 2GBZA 1VSIA 4CJVA 3S9HA 2HNZA 3KKRA 3HPHA 4M3RA 3OY9A 4OPKA 4BDZA 3SQ4A 1SL2A 1J54A 4F4KA 5C25A 1HMVA 4CIEA 3HM9A 4E7IA 2Y1IA 2G8UA 4KB1A 3QERA 4DMNA 2DFHA 3PX0A 1CLQA 3OYGA 4M42A 1RBTA 3ZCMA 3ZSOA 2HNDA 3PX6A 4C8OA 4N56A 3CFOA 4FJ9A 1KFDA 4B8AB 4BDPA 1A5WA 4CGJA 3JYTA 4AHVA 4CERA 1TV6A 3KTQA 4K8ZA 3QEVA 1S1UA 3MEEA 3V1QA 3DYAA 4BE1A 3VQBA 3C6UA 2P51A 3DLKA 1TK5A 3HJFA 3VA0A 5T7BA 3LPUA 4CJTA 3NH0A 1BHLA 1TKDA 2F8SA 1Q8IA 4AHSA 5KRTA 3OYDA 4DU4A 4OJRA 3L3VA 3L2WA 3ZT1A 1CXQA 3O4NA 1RDDA 1VRTA 4FLTA 4J2EA 4Y1DA 3VQ5A 5SZTA 4W5RA 3OS1A 4CJ3A 3A2FA 4CJFA 3AV9A 1ASWA 2KFNA 1QSLA 1DLOA 4LSNA 1D5AA 1BCMA 1JLFA 1S9EA 2VG5A 3KLIA 3EYZA 4ID1A 3NAEA 1SKRA 4LH4A 4DSEA 2O4IA 4CECA 4FJMA 3L3UA 4QOZB 3ZT3A 1WLJA 3ZSWA 2Z1GA 1WSIA 2D5RA 3NH2A 4JRPA 2HW3A 1A5VA 4ZHRA 1S5JA 4B9VA 5EU7A 4PA1A 4HUFA 1S1XA 1RCHA 3B6PA 4AHRA 1RTDA 1RT7A 1EXQA 4CJLA 4IDKA 2ATQA 1TAQA 4I9QA 5FROA 2FBTA 4B9MA 1TAUA 3V9XA 3TAEA 5FRNA 1L5UA 1KVAA 1LW2A 1S1TA 4F2RA 4DTSA 4E0DA 3OS2A 2QKBA 1VSDA 3NGYA 1UA1A 4KFBA 4KPYA 3PX4A 1ASUA 1TKTA 4G1QA 3OJSA 4IG3A 1C1BA 1KVBA 2E6MA 2GUIA 4AHCA 4FM2A 3RMDA 1NK0A 5KTQA 2WONA 2G8IA 4JRQA 4M3UA 4CGHA 4DTRA 3DOKA 1RTHA 1NK6A 3AO4A 4M45A 4CIFA 1NJXA 4DQIA 1TKXA 1RNHA 1T03A 1NK8A 5C42A 4O44A 4F3OA 3DLEA 4KO0A 3PO5A 3MAQA 1BISA 2KW4A 1RT4A 4EP5A 1BL3A 1F21A 3NGIA 1JXEA 1EKEA 3L2UA 2YHBA 1KCFA 3ITHA 1S6QA 1SL0A 4O5BA 1EETA 3LP3A 3L2QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JJ2M 4GMJB 1KAZA 1MU2A 3I33A 4DG1A 2AP1A 2DFFA 2X78A 3O6WA 2E4LA 4CF0A 1KQSM 4FWRA 4BGAA 4ELUA 3HPOA 4DSJA 3O9SA 2VWKA 4O55A 3U8XA 1YVUA 2WFBA 3J81O 1NMNA 4U7BA 3PSFA 3OYCA 3C65A 5HOOA 3V6DA 1JLGA 5C2FA 2ZE2A 4YOVA 4KB0A 1Q81O 4ICLA 5CZ2A 2KQ2A 1Y97A 3D2FA 3OYJA 4FJHA 2QXLA 3NVKA 2R7YA 5I9EB 4FJGA 1NGCA 1IO2A 1IV0A 1LW0A 2D0OA 4JKHA 4CGGA 3BDPA 2EX3A 4ILHA 5JLFA 4IFEA 4H0VB 5FLXO 4LFAK 2I7PA 4OGCA 2QI2A 2GTDA 4FLVA 1NKBA 4PUOA 4C8MA 3OYEA 4DQPA 3KD5E 2RN2A 3VEOA 3QEIA 3IRXA 1ILYA 2Q0UA 1W9HA 4B9NA 1WAJA 5JICA 3MWPA 3AVNA 5AQHA 1YTUA 4DWIA 1KRPA 2HSTA 3SUPA 4FW2A 3AVKA 4DR5K 2YHYA 3CG7A 4ELVA 4N5SA 2G8VA 1VHXA 4KI6A 3EN9A 1TL1A 3ZT0A 1TUYA 3QO9A 4M7YA 2KTQA 1VK0A 3MXJA 2XY7A 1ZYQA 2HNYA 3QB0A 3CCLN 4M41A 1QVGM 2IIRA 1K9MO 4GKKK 4JHDA 4H0XB 2QWNA 3RTVA 1VQPN 3CMAN 2E1ZA 4TSXA 1NGIA 2YX6A 3CHWA 1E4GT 1OH8A 3AO3A 5AZIA 3ISNC 4CJQA 5IT9O 4AQYK 3LDLA 4LC9B 3FFIA 1I3AA 3BP8A 1XNRK 3AGRA 4CJ5A 4L3QA 3J7YP 2F8TA 2D4WA 3VF6A 5GIOA 4JI2K 1E4FT 1TUUA 4H4MA 4HTUA 1I94K 4HUEA 3CCRN 3QNNA 3ENHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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