3VEVA

Glucokinase in complex with an activator and glucose
Total Genus 180

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
455
structure length
450
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
50100150200250300350400400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 180
structure length 450
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vevA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vevA01
2YJFA 3ZEUB 5E26A 2H3GX 2P9UB 5ADXH 3CJBA 4M7YA 4BG9A 1TYQA 1NGFA 3DXKA 4H0XB 5AQZA 2CH5A 2P9LA 3GG4A 5FPNA 4DB3A 4H5RA 1ATSA 2YI1A 4FWSA 2NLXA 3WQUA 3RSEA 4BQZA 2IVNA 3VGLA 3EZWA 1IG8A 2FLOA 4ISGA 4A2AA 3A5OC 2A6AA 2I7PA 2Q0RA 3QICA 2OANA 5KQ8A 3O1BA 3VEVA 1Y64A 2QWNA 5BRHA 3HI0A 1TUUA 1U2VA 3GE1A 4RWTA 3VEYA 5FPMA 4BR4A 3L4IA 1MWKA 1ATRA 1YXQA 3IUCA 2P9PA 1X3MA 4K41A 1NLVA 2P9NB 3CHWA 3VGMA 5ELZA 1GLAG 4BRKA 3FFKB 1QZ5A 4RCHA 1JCEA 3QFUA 1CZAN 5F2RA 1K8KA 3WXLA 4PKGA 3W3DA 4CZKA 1GLJO 5EY4A 3EO3A 3BP8A 3F9MA 3QBWA 1JCGA 3ATVA 3CJ1A 3H46O 2KHOA 4FWQA 2QW9A 2FF6A 1RGIA 2P9KB 1BDGA 3GOIA 3WT0A 1X9JA 2ITMA 3UKUB 2BUPA 3CQXA 3SK3A 1NGEA 3HSCA 3R6MA 3R8EA 3UKRA 1NGHA 3WQTA 4A62A 1E4GT 3S41A 3ULEA 2Q1NA 5EOYA 4WYBA 3M1FA 1ESVA 3EKSA 1NGDA 5AQVA 1NGGA 4F9OA 4BC5A 2GWJA 3QFPA 4PKHA 3CI5A 2ZF5O 5AQSA 4MLHA 3QBXA 3BUZB 2NRHA 2E1ZA 4RTFD 4MLEA 2E1YA 4M7XA 4BR2A 2A42A 3O8MA 3BF3A 4M63C 3R9PA 1KAXA 4BRIA 4K42A 1BUPA 3HZ6A 3FZLA 3H3OB 1JCFA 3TPQA 2FSJA 4CBWA 4H0YB 2ZGZA 4H0TB 4CZJA 2IVPA 2FSNA 3FZFA 5KPTA 2FF3B 1YAGA 3BF1A 2IIRA 1YUWA 3ZETB 5JLHA 1QHAA 4CD3A 4JHDA 2QWQA 4H03B 1KAZA 1C0GA 4HWIA 4Z94A 4PL8A 4EIAA 1Z6RA 2YHYA 4WQ4C 3C7NB 3MCPA 3VEZA 2D4WA 4BRPA 5AQYA 4WQ4A 5KPZA 2WUSA 3ZX2A 1BWFO 3D7EO 3SMPA 2A41A 4FWLA 5F0XA 3MN6A 3LDOA 2P9SA 4FPBA 4BREA 1QQMA 2EWSA 4BROA 3J8AA 5AQQA 1T6CA 3VENA 3H1QA 1QZ6A 1LOTB 3BEXA 1GLCG 1DGKN 3VPZA 1QQNA 2E2PA 1SAZA 2VYPA 1RDWX 2A3ZA 4IO8A 4XH4A 4BR7A 4CZHA 3DXMB 2UYTA 3M3ZA 4MO5A 1P8ZA 5AQWA 5AZIB 3ZX0A 3UE5A 4CZMA 4O5FA 4BVOA 4DCHA 1NGAA 5LJVA 4BGAA 3O1WA 4BC4A 3U4LA 1NGBA 3LDNA 3L6QA 4K43A 1NGIA 1C0FA 3A0IX 2HMPA 3OHRA 3QB0A 3WEEA 4BRQA 4H0PA 4BRAA 3EL2A 2YHWA 2HF4A 4B1YB 2PAVA 5B8HA 3D2FB 3HM8A 4CJ7A 3D2EA 5AQMA 3SLCA 3VF2A 4WQ5C 1WOQA 4JN4A 1BA1A 1BA0A 4JNEA 4WQ5A 2QXLA 3LL3A 1T6DA 5AQHA 2Q0UA 3G25A 3EKUA 2I7NA 4BR0A 3H45C 5BREA 1Z05A 5EX5A 4BRLA 5AZJA 4FOEA 4IXCA 4JD2A 3QDKA 1SZ2A 2V7ZA 4B1XB 4CZEA 1MA9B 2GWKA 3DJCA 1GLFO 3QMLA 3WXKA 3WUHA 2V52B 4A2BA 1GLDG 2Q2RA 2Q97A 1HPMA 2F9WA 3ZEUA 2P9UA 2YCHA 1LCUA 5LJWA 5I9EB 1ZBSA 3H6EA 5AQTA 3U9ZA 4BRHA 5BPNA 2GELA 5AR0A 5AFUA 5AQXA 2E2QA 2CGLA 4IWVA 3MDQA 4H5VA 3JS6A 4KBOA 3HTVA 4XH1A 4QS9A 4BRDA 4I6MB 2NZTA 4NB4A 2A40A 4FO0A 4H5WA 5BPLA 3MN7A 5AQIA 1TYQB 3C0BA 4FSVA 4C23A 1EQYA 3DXKB 3W0LA 3VESA 2P9LB 5AQRA 2P9NA 3GBTA 3SMSA 1DEJA 3L0QA 4CZGA 4L3QA 2VCPA 1HLUA 1S3XA 4PKIA 2P9IB 3LM2A 4AM7A 1V4SA 5FPEA 1BG3A 3CERA 4LC9B 4BQLA 2CGJA 2YHXA 3O6WA 3KHYA 1OKJA 1X3NA 3MN9A 4ISEA 1NWKA 1KXPA 1U2VB 2V51B 2CH6A 4H0VB 2E2OA 5E84A 1TUYA 3UB5A 1MWMA 2P9KA 3M6GA 2QWMA 5AQFA 2P9PB 3VF4A 1U6ZA 3UKUA 5EXWA 3FGUA 4H5TA 3I33A 3SJHA 1HJOA 1K8KB 3ENHA 1ATNA 2E8AA 4NO7A 1G99A 4O8KA 4FPAA 2ASPA 5AQJA 2GUPA 3A5LC 3LM9A 4FWMA 3CJAA 1WUAA 4HTLA 3ID8A 3WXIA 5FPDA 4YDUC 4BRFA 1RFQA 4B1WB 4FWPA 4YDUA 1J6ZA 3A5MC 3H1VX 3UKRB 5BN8A 1XQSC 2GEMA 5EVZA 3ULEB 1Q18A 3DWLA 3FE1A 4EAHD 3A5NC 3IMXA 2HF3A 4B1UB 2W40A 4XH5A 3O4WA 5AQOA 1BOTO 4XEIA 4CZFA 5AFUH 5AQUA 3O5BA 4FL9A 1SQKA 4PL7A 4B9QA 3ZETA 3MN5A 5F1XA 3WXJA 3AY9A 1NGJA 5JMVA 2A5XA 5KQDA 1NM1A 2E2NA 3VEOA 2CGKA 3EN9A 3TU5A 4JAXA 2F9TA 1R59O 2PBDA 2P9IA 1GLLO 3AAQA 1QQOA 3C7NA 2ASOA 4BVPA 5JLFA 4EFHA 4FWOA 1T44A 3ENOA 4BR5A 1BU6O 1KAYA 2D1KA 5JICA 3O08A 4CD1A 4GY2B 2YJEA 3CJCA 1D4XA 4Y0WA 3VEXA 4CBUA 2AP1A 3FZKA 5AQPA 1IJJA 1ZC6A 3AAPA 4JHDB 3FZMA 2GTDA 3MMVA 2Q31A 5BPMA 3U9DA 5TKYA 3CIPA 4FWRA 4BRGA 3P4IA 3DXMA 4A61A 5KPRA 3LDQA 4K25A 1GLEG 4MO4A 4DQ8A 4ISFA 5AZIA 5ADXA 3GDQA 3VOVA 1XC3A 3HBTA 5AQLA 4BRCA 3CJ9A 4QS8A 2P9SB 2ZWHA 4E1JA 4B1VA 4BC3A 4BRMA 3FZHA 1NMDA 4CZLA 1NGCA 5AQNA 3VERA 3CETA 3CJ7A 5AQKA 4DHYA 1HKCA 3VGKA 4CBXA 3FR0A 1H1VA 3DAWA 1ZXOA 3B8AX 3ATUA 1V4TA 4FWKA 3ZX3A 2V7YA 3LDPA 2FSKA 1HKGA 3VEWA 3D2FA 2FXUA 2E20A 4AM6A 4EHTA 5AQGA 2ASMA 4H0OA 3RSEB 4IJAA 1HUXA 1BO5O 1E4FT 4FWNA 4J8FA 1MDUB 3GL1A 4BRNA 3H3NO 4CI6A 5CE3A 5BRFA 1HKBA 3WEEB 2J4RA 5BR9A 4GNIA 2D0OA 4FOIA 5BRDA 2QWOA 2QWRA 3IDHA 1DKGD 3IFRA 4CZIA 4EHUA 4H5NA 1GLBG 4BC2A 3O80A 3D2EB 3KVGA 3CQYA 3KZBA 3A8YA 2QWPA 2ZGYA 2VWBA 4QS7A 2IVOA 4IZ9A 1YVNA 3AARA 3FLCO 4B1ZA 1XUPO 1NBWA 2E88A 3VETA 4BR9A 2DPNA 3I8BA 2HOEA 5AZJB 3JXUA 2D0PA 4JD2B 2QWLA 2BTFA 3LDLA 3MK6A 1HX1A 4IJNA 4BGBA 2W41A 4BG8A 1S22A 5BN9A 4I6MA 5LY3A 3VF6A 2QM1A 2AA4A 3U8XA 2Q36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WAJA 2H3GX 2G8FA 1TL3A 2O8BA 4BG9A 1TYQA 4O8UA 1RILA 1VSIA 4M3XA 1E3MA 2P9LA 3O9SA 4KO0A 3V4IA 4FZZA 4PQUA 1CZ9A 1IH7A 3U6FA 4BQZA 3PY8A 4ISGA 1U45A 3PX0A 2JWKA 2I7PA 4DR1K 1UA1A 4F3OA 2OANA 5KQ8A 3CMEN 1HYSA 2NUBA 3HI0A 1N6QA 1XMOK 3OVNA 4OGCA 5KRSA 4CK3A 2D0AA 4LF7K 1YXQA 2FBXA 3HOSA 1JL2A 1NLVA 1A5XA 2W6LA 3O9UA 5ELZA 1BGXT 4RW4A 1QZ5A 3QFUA 1VSDA 3CFPA 2E4LA 1OH7A 1SV5A 1QE1A 3W3DA 1NOZA 1WSJA 2WFBA 4J2BA 4CZKA 1KFDA 5EY4A 3OYJA 5HRNA 3KLGA 4CF8A 1P90A 3ALYA 4AHCA 4DTNA 3WT0A 3UKUB 4CF9A 2BUPA 4GV6A 4FK2A 1GOCA 1J5EK 4FLTA 2Q1NA 4Z4HA 2HHTA 4JK8A 4G1QA 5KGXA 4JYAK 1SS6A 4DV6K 4BC5A 2XY7A 3E9LA 3MEGA 2A1RA 4PKHA 1UWBA 4X62K 2HB5A 4MLHA 4ZHRA 3BUZB 2PYJA 4KTZA 4RTFD 4MLEA 1EXQA 3RTVA 1BI4B 2RE2A 3HK2A 4BRIA 4K42A 1BUPA 3M8QA 2HNDA 3FZLA 1JCFA 4OO1J 1VHXA 3T7ZA 5M1KA 4FVMA 4ILJA 3A2FA 3BF1A 3MCAB 4CD3A 3KD1E 4FJ8A 1S1XA 2YHYA 3PLAA 3C7NB 3MCPA 3VMFB 4JKHA 4BRPA 2JLEA 4Z0UA 2HHVA 1HQEA 3FFIA 3PV8A 4KHPK 2IDOA 4JKAA 4E89A 5F0XA 3MN6A 5KGWA 1ASUA 3G4SN 1WSEA 2IOCA 3AVMA 5AQQA 4CGFA 3VENA 1VSKA 3VPZA 1QQNA 5C10A 3TAMA 2VGNA 5KTQA 3AA2A 2A3ZA 3Q7BA 4DU1A 2UYTA 4MO5A 3LZJA 4B3MK 1P8ZA 4I2PA 3CCQN 2O8EB 3DRRA 3LALA 4E7JA 4BVOA 5LJVA 3OYHA 2B6AA 3T1YK 3NHGA 4BC4A 3TABA 1C6VA 5HLFA 2FC0A 1B9FA 4IBNA 4K43A 5IWAK 1C0FA 2O4GA 5M1PA 2HMPA 4DV3K 3BZKA 4AILC 1NJYA 3J7AP 3QB0A 4BRQA 2DY4A 4H0PA 4BRAA 4B9NA 4HUFA 3ZSOA 1JJ2M 3AGKA 3CCLN 4CJ7A 3D2EA 5AQMA 3SLCA 2ZE2A 4DSJA 1JLFA 1S9GA 4LH4A 2KFZA 1IKVA 3LL3A 3K5MA 4AF1A 1T6DA 3AVNA 3B6PA 3H45C 4CHNA 3PX4A 1NJWA 4IKFA 3MX5A 5AZJA 3NF9A 4IXCA 1I94K 3I55N 3B6OA 1YJNN 1SZ2A 2V7ZA 4JKCA 1MA9B 3DJCA 3QO9A 4KH4A 4E19A 4FLYA 3WXKA 1R0AA 3TAFA 4JI0K 5E41A 4FJ9A 3THVA 1BIZA 5LJWA 1QSSA 4CGHA 4I9LA 4BRHA 2X74A 4C1NK 2UUCK 2HNYA 3PIPL 5AQXA 2CGLA 4IWVA 2VQFK 3BY5A 4H5VA 3G71N 4JRQA 3P39A 4KBOA 4GV3A 3HTVA 5GAHP 3M8RA 3TAEA 4QS9A 4I6MB 4N76A 2A40A 4H5WA 3TSPA 5T7BA 2OZMA 3DXKB 5HP1A 4IG3A 3VN5A 3CFRA 1NJXA 1BHLA 4CEOA 4AQYK 1FW6A 2VCPA 4I9QA 3V9SA 3T69A 2P9IB 4AM7A 1V4SA 5FPEA 4BQLA 4IDHA 3QIOA 2VGMA 1JLBA 5FRNA 2IGIA 1QHTA 3MN9A 5HOOA 5A2QO 4WFNL 2YKMA 5E84A 3HSTB 2VG7A 2QWMA 2I5JA 4QAGA 4X65K 4F2SA 2F8SA 3UKUA 1NOYA 1JL1A 2YNGA 1KFSA 3I33A 3SJHA 2XO7A 4DF4A 1RBVA 3RR8A 1HJOA 3Q7CA 1K8KB 1G15A 3J7ZO 4C8LA 2E8AA 3K59A 3RRHA 4DMNA 5AQJA 2ASPA 2OTLN 5GINA 3G6EN 4DUZK 5FPDA 3ZSYA 4M3RA 4LY7A 3VQ4A 4W5RA 3QETA 4CERA 5SWMA 1HNVA 3P5JA 3H1VX 3DLHA 1XQSC 5EVZA 1BI4A 1CXQA 3ULEB 4W5NA 3IMXA 2OYQA 4B1UB 3O4WA 1JLEA 1BOTO 2VWKA 3DLKA 4FL9A 1SQKA 1VQ8N 3CD6N 3WXJA 3N4QA 5AJ3K 3OA9A 1NM1A 1JKHA 3VEOA 3EN9A 2IC3A 1LAVA 3KK2A 1D9FA 4J2AA 3C7NA 4BVPA 5JLFA 5J2QA 4RW7A 4FWOA 4CFAA 5CYQA 4JI8K 1TAUA 1T44A 3ENOA 2R7YA 2RN2A 1CLQA 2YJEA 3CJCA 4CBUA 3FZKA 4JHDB 3OJUA 3KKSA 3L2WA 3TTCA 1NK7A 2HHWA 1GOBA 3LDQA 4JKFA 1GLEG 4LD0A 4K25A 4CEEA 3LZIA 2O8EA 3HBTA 5AQLA 3KKRA 4BRCA 3NH0A 4DUYK 4QS8A 2P9SB 3PO4A 4BC3A 3F73A 1RDDA 3FZHA 1NMDA 3V9WA 2UXCK 4CEBA 1YHQN 1VQ5N 3VERA 1QSYA 2DFFA 1HKCA 4ZTJA 1H1VA 3V1OA 3ZT4A 1GOAA 1RBUA 1ZXOA 4FJJA 2AJQA 2Y1IA 4HUGA 1V4TA 3ZX3A 3F5TA 4M45A 1T8EA 1TKDA 2E20A 4EHTA 4AHRA 1NKBA 1RDBA 2RHKA 4H0OA 3D0PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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