3VF6A

Glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 177
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
457
structure length
451
Chain Sequence
HHENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGESVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 177
structure length 451
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vf6A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vf6A01
4H5VA 5AQPA 2HMPA 1BOTO 3RSEA 1NGCA 3VEOA 2P9UA 3WQUA 4BC2A 3AAPA 1X9JA 1EQYA 2V52B 5AZIA 1HX1A 1YAGA 3HTVA 1ATNA 1JCFA 3U8XA 4B1VA 2Q0UA 2HF3A 1XUPO 3QDKA 2V7YA 3L4IA 2VWBA 3CJ7A 4FWSA 3ZX3A 5BRHA 2FF6A 1DKGD 1K8KB 3AARA 4BRDA 4IJAA 3D2EA 3EKSA 4NO7A 4DHYA 1NGJA 4PL7A 1GLDG 2QXLA 3DJCA 4RWTA 2FXUA 2E2OA 4BRNA 4RTFD 3S41A 3ULEA 1S22A 4H5RA 2P9NA 5BPLA 2QWLA 3C0BA 3A5NC 2A3ZA 4H0VB 1BDGA 3WUHA 2P9PB 3D2FB 3LDNA 4H0XB 3HI0A 2QWQA 3CETA 4CZLA 3H3NO 3VF2A 1Z05A 4BR0A 4DQ8A 3CI5A 4E1JA 3ATVA 5E84A 3LDPA 5BRDA 3LDOA 3EO3A 3DXKA 3R8EA 5AQTA 2PBDA 3GE1A 2YJFA 1NGIA 4DB3A 3M3ZA 2E2PA 3H3OB 3O5BA 3GBTA 4CZFA 4QS7A 5AQHA 1KAXA 4I6MA 5AQGA 2Q0RA 5AQVA 4FPBA 1ATRA 3FGUA 5AQMA 4FWQA 4CZIA 4EHUA 1X3MA 1ATSA 4B1ZA 5AQFA 2D0OA 4BR2A 2E8AA 2GELA 5AQRA 5AQSA 5EXWA 5JICA 2PAVA 5BPMA 4BGAA 4Y0WA 4M7XA 3ENOA 4MLHA 3U9DA 4GNIA 5EOYA 3R9PA 4CZEA 2FSNA 5AR0A 2D1KA 2P9KB 2FF3B 3KHYA 5E26A 4EAHD 3CJCA 1J6ZA 2Q36A 4CZJA 2NLXA 4H0YB 1E4GT 1JCEA 1V4TA 2P9LA 3VENA 4BRCA 5JLFA 3VGKA 3BF1A 3H6EA 3CJ9A 4WQ4C 5ADXA 1SQKA 2BUPA 4FO0A 1X3NA 4IXCA 1QQNA 3VESA 1GLBG 3U4LA 3VEYA 4CZMA 3CJAA 3ATUA 2QWPA 4BC3A 3UE5A 2ZGZA 2CH6A 2FSJA 1IG8A 2E2NA 2EWSA 2H3GX 1BA0A 3VEWA 2GWJA 5BREA 2Q31A 2WUSA 1NWKA 3BF3A 1E4FT 4MO4A 3LL3A 4JHDA 4BQLA 2FSKA 2YHYA 3QICA 4BREA 4F9OA 2QWNA 3VF6A 3LDQA 3WQTA 2CH5A 2YCHA 4BRGA 2ZGYA 4FWPA 4WQ5C 2ASPA 5EY4A 4BG8A 4JD2B 3MDQA 5FPNA 2P9IA 1OKJA 3FFKB 3BEXA 2E88A 2FLOA 5KQ8A 3H46O 3ID8A 1TUYA 2E2QA 5BRFA 1NGHA 4CZGA 3WXKA 1ZXOA 1HKGA 1KAZA 4B1XB 5ELZA 4CBWA 4BR7A 4BVOA 4BC4A 1V4SA 4FWMA 4BQZA 4BC5A 3AY9A 3IFRA 3WEEA 1NMDA 4H5NA 4MLEA 4O5FA 2Q2RA 4FWRA 1HPMA 1NGDA 3MCPA 4WYBA 1TYQA 1LCUA 1NLVA 3OHRA 1TUUA 1GLLO 3KZBA 3W0LA 4K25A 4XEIA 3VF4A 3EN9A 3ZETB 4QS8A 5AZJB 4FPAA 3SMSA 4BRMA 4H03B 3FZHA 5FPDA 5LJVA 4FL9A 4XH5A 3C7NB 1YVNA 4FWLA 5FPMA 3M6GA 2A41A 4EHTA 3A5OC 5BN9A 4K42A 5I9EB 2J4RA 4BRPA 1NBWA 3I8BA 4K43A 1IJJA 1ZC6A 3GOIA 3HSCA 3JXUA 5AQZA 4BRLA 3O1BA 1K8KA 3CJ1A 3ZEUB 3DXMB 5KQDA 1NGGA 3EZWA 3O1WA 3UKRB 3CIPA 1HKBA 4AM7A 2W40A 3L0QA 3QBWA 4CD1A 1U6ZA 3FR0A 3O80A 4XH1A 3AAQA 1BO5O 4O8KA 4BRKA 3A8YA 1U2VB 5F2RA 3VPZA 3KVGA 4QS9A 4CBUA 3LM2A 4C23A 2P9PA 3D2FA 4FWOA 2Q97A 4FWKA 3I33A 2KHOA 3FE1A 4PKIA 3FZKA 1MWMA 3O6WA 3F9MA 1GLCG 3P4IA 2P9SB 4JN4A 1ESVA 2E20A 1C0FA 5AQLA 1T44A 3MK6A 4B1WB 5FPEA 3SLCA 3H1VX 4ISFA 4CI6A 1NM1A 5AQJA 3MN5A 3UKUB 3DAWA 2A42A 4BRFA 3ENHA 1Y64A 3MMVA 4BROA 4BRIA 3EL2A 2Q1NA 2CGKA 3IDHA 5AQKA 3CQYA 4HWIA 2DPNA 5TKYA 2AP1A 2I7NA 2A5XA 4K41A 3TU5A 1QZ5A 4BG9A 3RSEB 2P9UB 1SZ2A 4BR5A 3VEXA 2P9KA 5AZIB 1BWFO 5AQQA 3QMLA 4BRAA 3GG4A 1BU6O 2QW9A 4IZ9A 4B9QA 1LOTB 3BP8A 1NGFA 3H1QA 4GY2B 3SK3A 4A2BA 4FOEA 2QWOA 3A5LC 3D2EB 2UYTA 1DEJA 4BVPA 2VYPA 3WXIA 2CGLA 3MN7A 1XC3A 5AQNA 4FSVA 5EVZA 4FOIA 1GLAG 5AFUH 3ULEB 1SAZA 1NGEA 2P9NB 2D4WA 2GUPA 4FWNA 1C0GA 4BGBA 3GL1A 3EKUA 4JAXA 4H0PA 3UB5A 4J8FA 1KAYA 5KPTA 2IVOA 1RGIA 2NRHA 3CERA 3IMXA 5LY3A 3J8AA 3VGLA 3DXKB 5CE3A 2V7ZA 1Q18A 1WUAA 4BR9A 2YHXA 4Z94A 2ASMA 4CD3A 5BPNA 1BUPA 1MA9B 2CGJA 3SJHA 4CBXA 3LDLA 4HTLA 4JD2A 4I6MB 1GLFO 1T6CA 3WXJA 1KXPA 1HLUA 3H45C 4H5TA 1G99A 1HJOA 4CZHA 4NB4A 2GEMA 5JMVA 4CJ7A 5KPZA 1CZAN 1ZBSA 1NGBA 5AQIA 3U9ZA 3QB0A 3O8MA 3ZX2A 2BTFA 1QZ6A 4PL8A 1BA1A 1MWKA 1Z6RA 4IWVA 1H1VA 2ASOA 2NZTA 3QFPA 3FZFA 3VERA 3HM8A 1QQOA 3M1FA 5ADXH 3MN6A 3TPQA 4YDUC 5AQXA 3HBTA 3CQXA 2IVNA 4YDUA 5AQWA 3QBXA 3O08A 5B8HA 5AFUA 4H0OA 1GLEG 2P9LB 3QFUA 4A61A 1NGAA 2QM1A 2YHWA 2V51B 4EFHA 3VETA 3ZETA 5AZJA 5AQOA 1T6DA 2HOEA 5AQYA 1S3XA 3C7NA 3CHWA 3HZ6A 2ITMA 2QWRA 5LJWA 5BR9A 2E1YA 5KPRA 2IIRA 4B1UB 1P8ZA 1R59O 1XQSC 4KBOA 2A6AA 3A0IX 4DCHA 2IVPA 3ZEUA 3DXMA 2F9WA 4LC9B 2AA4A 3VOVA 1MDUB 3UKRA 4AM6A 2A40A 2YJEA 4JHDB 2OANA 4H5WA 1D4XA 4BRQA 2HF4A 4A2AA 4L3QA 2QWMA 1U2VA 4ISEA 3WT0A 3A5MC 3D7EO 3VEZA 3SMPA 3MN9A 3VGMA 3FZLA 1QHAA 1GLJO 2P9IB 1HKCA 4H0TB 3BUZB 1RDWX 2GTDA 3FLCO 2E1ZA 2YI1A 3IUCA 4ISGA 4EIAA 1BG3A 4WQ4A 3WXLA 1JCGA 2ZWHA 5JLHA 3O4WA 2P9SA 4A62A 4JNEA 1HUXA 3R6MA 5AQUA 3CJBA 3DWLA 3W3DA 5F0XA 1DGKN 3L6QA 4IO8A 3ZX0A 1RFQA 1YXQA 2W41A 4BRHA 3GDQA 3UKUA 1YUWA 3G25A 4B1YB 3VEVA 4BR4A 2GWKA 3B8AX 4M7YA 5EX5A 3WEEB 2F9TA 4IJNA 1QQMA 4XH4A 1TYQB 1WOQA 4CZKA 5F1XA 3JS6A 4M63C 2I7PA 4RCHA 2ZF5O 5BN8A 3LM9A 4PKGA 4PKHA 4WQ5A 4MO5A 2D0PA 3FZMA 2VCPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H5VA 1NGCA 2P9UA 4KHWA 3EY1A 3AAPA 4YOXA 1EQYA 2HB5A 5M1FA 5AZIA 2X6SA 1S9GA 1YAGA 4FJ9A 3CJ7A 1VQ5N 3TAQA 1DKGD 1K8KB 3AARA 3L3VA 1VSKA 4IJAA 4C8NA 4CK3A 4NO7A 3SNNA 3VQ4A 5C0YA 3KTQA 1S6PA 3DLGA 5LL6Z 2YNHA 3O9QA 4RTFD 3OYKA 3F73A 3AVKA 4WE1A 1HQEA 3T7ZA 4H0VB 4YNQA 3LDNA 4H0XB 3HI0A 1IKVA 4O8UA 3VF2A 1Z05A 2Q3SA 3LDOA 4Q0BA 3DXKA 4CF8A 3R8EA 4A5BA 3V4IA 4DG1A 3PY8A 1ZBFA 3GE1A 2YJFA 4DV4K 3K5OA 1XMQK 4LH4A 4FLVA 3SAGA 2IGIA 2VGNA 1RDBA 3O4QA 5AQGA 4FM0A 2GX9A 2Q0RA 4CJTA 2YNGA 3AVGA 5AQMA 1J9AA 1RDDA 4FWQA 4B1ZA 3EE9A 4IFVA 3VQ7A 4DSKA 3RR8A 1LWCA 1N36K 5AQSA 5JICA 5HL7L 4ID1A 3AGKA 4BGAA 4M7XA 1L5UA 5AR0A 1IBLK 5E26A 2G8IA 1TKXA 2O8BB 3CJCA 3DLKA 1E4GT 1V4TA 3ZSYA 5I3UA 1ASVA 4KHNA 3BF1A 3H6EA 5CHIA 1VSHA 2G8KA 3MXMA 4WQ4C 4O44A 5ADXA 4CJPA 1QQNA 4PHTX 3OYLA 1VQNN 4CZMA 4AQYK 1YHQN 3KLHA 4CW7B 2QWPA 3KK1A 3OS2A 3EYZA 2FBTA 4E7JA 5J2QA 1BCMA 1EETA 2KQ2A 4DR4K 2KLAA 4JEPA 2WUSA 4JKGB 4BWMA 3LL3A 4BQLA 4LF7K 1R0AA 2BANA 3K0SA 2YHYA 3QICA 1VQ9N 2QWNA 3CCQN 4BRGA 4J2AA 4CJQA 3AV9A 3P39A 4FWPA 2ASPA 5CYMA 5FPNA 3FFKB 1YITN 4E7KA 1WSEA 3DRPA 1TUYA 2OA8A 3CCJN 3V9WA 1T7PA 5IT9O 4J2EA 3VQ5A 3WXKA 1RTDA 1ZXOA 4NCGA 1LAWA 4OKKA 2ZE2A 3TTCA 1HMVA 2PFUA 1YI2N 4JI3K 4KPYA 4FWMA 1TK8A 4M3XA 1KCFA 2NRTA 4KH4A 2OYQA 1BGXT 1JKHA 4GVEA 4KTQA 3WEEA 4O5FA 1I39A 3THWB 4JI1K 2Q2RA 4ELUA 1RTJA 1HNIA 5JVHL 5TKWA 3NH1A 4FJXA 4CEOA 3KZBA 3TR8A 4JKBA 3EN9A 2WTUA 4IEIA 1W0HA 3CC2N 3SMSA 4BRMA 3MX5A 3C7NB 1WNSA 3M6GA 3DLBA 5BN9A 4CGJA 5JS1A 3P31A 2KFNA 1VRUA 4B3OA 3QEVA 1NBWA 5AQZA 3GOIA 3DLRA 3K5NA 4FJ8A 1S72N 1XI1A 1D9FA 3CJ1A 3ZEUB 4B9NA 4Y1CA 1NGGA 1QTMA 1OH5A 3PLAA 2IAJA 4AM7A 1LWEA 4DR2K 3QBWA 3HVTA 4WF9L 4ZHRA 4O8KA 3OYAA 3NAEA 2LSNA 1U2VB 5F2RA 4OX9K 4DS4A 4QS9A 4KI4A 1RBUA 1BIZA 1KD1O 2Z1GA 3D2FA 3CD6N 3C65A 3I33A 4U7BA 3ZSQA 3FE1A 4Z4GA 4OLAA 4DUZK 3O6WA 1KC8O 1GLCG 3QNNA 1RNHA 3G10A 4E0DA 3CMAN 3DAWA 1N8RO 3L4QA 3NHGA 4N41A 3ENHA 3SPZA 4BRIA 3PO4A 5E41A 2Q1NA 4LF4K 5FROA 4OLBA 3V1RA 4FLYA 2VG6A 1HQUA 4CIEA 1C1CA 2DPNA 1NK6A 2A5XA 2O8EA 2P9UB 4BR5A 4Z4FA 4U67L 3HVRA 4AHTA 3ZT0A 3AA2A 2P9KA 5AZIB 4B9MA 3T1HK 1BWFO 3QMLA 4ZTFA 4M3UA 5LMNK 1K73O 2HNDA 1ASUA 4FW2A 3DI6A 4IZ9A 4B9QA 2W6KA 1VQ4N 1LOTB 3SK3A 4CJRA 3SUOA 2E4LA 3MECA 4FOEA 1L3SA 2QWOA 2RF2A 1GOAA 3MWPA 3RMDA 3A5LC 4K8ZA 1RDCA 3EZ5A 3LP1A 2NRRA 3HM9A 1M1KO 1NJWA 1GLAG 4CEAA 4JI2K 1NGEA 3G0ZA 1JXBA 4I7FA 3QNOA 3KWGA 3QEIA 3ZCMA 1IV0A 3EKUA 4CK2A 3OYFA 3HXMA 3QIOA 3UB5A 4YOVA 4FLWA 1RGIA 3IMXA 3DXKB 3OVNA 1Q18A 4NYFA 3C6TA 3EE8A 4CD3A 1L3VA 4BWJA 3ID6A 2CGJA 3QO9A 4BE2A 4M3TA 4FVUA 2NRZA 4HUGA 1G99A 1HJOA 3AA3A 4E7LA 5JMVA 4CHQA 4FJIA 4CHPA 1NJZA 3NGYA 3QESA 1LV5A 2YKMA 5AQIA 3U9ZA 4F2RA 3QB0A 3CM6A 4WFNL 3OYHA 1BA1A 3E66A 4LFCK 1Z6RA 1EO1A 4DWIA 4FJ5A 3DRSA 1XMOK 3CCRN 4PA1A 4FJNA 1Q9YA 1KLMA 2VG5A 1RTIA 5AQXA 3QBXA 3O08A 2GV9A 3OBWA 4H0OA 3MWTA 3C95A 3OJSA 2QM1A 4M45A 1Q9XA 3CCMN 2QKKA 5SWMA 4ILHA 1XNRK 4HCBA 2HOEA 3ZSRA 2X6NA 1S3XA 4AH9A 4CFDA 4CJEA 4FZXC 3MXIA 3O9UA 5LJWA 3KKRA 5BR9A 2E1YA 3QERA 4FK4A 2IIRA 4OKJA 1VQ7N 1L3TA 5J2MA 2KW4A 2YHBA 1OH8A 2WBNA 2HBLA 1NJYA 4DCHA 3DLHA 3IKMA 3DXMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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