3VF6A

Glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 177
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
457
structure length
451
Chain Sequence
HHENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGESVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 177
structure length 451
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vf6A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vf6A01
1NGFA 5AQLA 2ITMA 3UB5A 3VF2A 3RSEB 1KAYA 3GL1A 4M63C 2NRHA 1IJJA 2H3GX 5ADXA 5LJVA 4PKHA 2FLOA 1T6DA 5BR9A 1XQSC 4FSVA 3VEVA 3O08A 2NZTA 1YAGA 3IUCA 4FWOA 2Q31A 3FZLA 4FPAA 3FZMA 2Q36A 1GLEG 4FWPA 4XH1A 1K8KA 2HF4A 3P4IA 3G25A 3DXMB 2WUSA 4BC5A 3EZWA 3H3NO 3DXKB 4H5WA 5AQSA 5AQUA 3FE1A 4BQLA 1JCFA 1C0FA 1NMDA 4EAHD 1D4XA 4BRDA 3GOIA 1P8ZA 4ISEA 3VGLA 4BC4A 2W41A 4CJ7A 1LCUA 4A2AA 1BDGA 3LL3A 2F9WA 2P9LB 2V52B 4H5TA 1GLBG 3UKUA 3D7EO 4O5FA 1YXQA 5JLHA 2P9UA 3EKUA 3GDQA 2A3ZA 1BA0A 4HWIA 1Y64A 3MDQA 4CZEA 4BROA 4BRKA 3MN6A 1NGJA 3H46O 3FFKB 2CH5A 1BOTO 5KPZA 4HTLA 4O8KA 2E1YA 1BU6O 4H5VA 2E2PA 2OANA 4EHUA 1ATSA 5AR0A 3VETA 4CZJA 5AQFA 3WXKA 1JCGA 1CZAN 2E8AA 3H6EA 5AQQA 3O6WA 1BA1A 2FF3B 3C7NA 3MCPA 5E84A 4BVPA 2GWKA 2QWPA 4A2BA 4H0VB 2ASMA 4H0YB 2QM1A 1BWFO 5ELZA 1MWMA 2A40A 3QICA 2DPNA 2P9NA 3SJHA 2PBDA 1NGIA 4AM7A 3KVGA 4WQ5C 5AFUH 3L6QA 4IXCA 3CJAA 3ID8A 3M1FA 5AFUA 1HUXA 3SMPA 4CD3A 3FGUA 4CBUA 2IVOA 1R59O 1HJOA 5AQZA 3R8EA 4NB4A 4DQ8A 5AQPA 3LM9A 3O8MA 3VEXA 4B1XB 2QWLA 1HPMA 3JXUA 3MN9A 2V51B 3CJ1A 1S22A 3AARA 4B1UB 1NGHA 3OHRA 1NGGA 5BRFA 3ZEUB 3VPZA 3R6MA 3ZETB 3LDOA 2QWNA 4QS7A 3VGKA 4DB3A 3QFPA 3F9MA 1HKCA 1NWKA 4CZIA 1RGIA 2FSNA 1IG8A 2Q0RA 5AQTA 5EOYA 3VEWA 3BF3A 3RSEA 1NGEA 5AZIB 5BRDA 3H3OB 4A62A 3WXIA 3D2EB 4DHYA 1MWKA 1RFQA 3H1VX 3CHWA 1NBWA 4BC2A 4QS9A 4MO5A 2YI1A 1QZ6A 5EXWA 3B8AX 4H0XB 3I33A 5AQGA 1QZ5A 3CJCA 1E4GT 2QW9A 2YHYA 4K43A 1GLDG 4BR0A 2CGLA 4CBXA 5BPLA 3UKRB 2Q0UA 3GE1A 1QQOA 3L0QA 3ULEB 1H1VA 3W3DA 3BUZB 2AA4A 3HBTA 1NGBA 4BRNA 3DXKA 4BVOA 4GY2B 4BRLA 5B8HA 3D2FB 1X9JA 5BN9A 2CGJA 2P9SA 2UYTA 2E20A 4FWNA 5BPMA 4EFHA 2P9LA 4KBOA 5BN8A 4BC3A 3A5MC 2HMPA 1TYQA 2P9IA 3IMXA 4LC9B 2ZGZA 4M7XA 5I9EB 4IJAA 2F9TA 4WQ5A 5KPTA 3BF1A 1OKJA 3TU5A 3QBXA 3BEXA 4IO8A 4BR7A 4F9OA 3KZBA 2FXUA 1WOQA 4IWVA 4YDUC 3DWLA 1K8KB 3M6GA 5FPEA 5EX5A 3TPQA 4BR4A 5JLFA 2YHXA 1X3NA 3CIPA 4L3QA 3VF4A 3FZFA 3A8YA 4CBWA 4GNIA 3GG4A 3SMSA 1ATNA 1SZ2A 3MN7A 5AQKA 3O80A 2ZGYA 3AY9A 1E4FT 2VWBA 2V7YA 2Q97A 4FO0A 4BGBA 4BRQA 4EIAA 3AAQA 1DKGD 2J4RA 4BR9A 3VERA 4BREA 4M7YA 3CQXA 2NLXA 3CJBA 2P9PA 2EWSA 3LDNA 4BGAA 4RCHA 4CZGA 2V7ZA 4H0PA 1XC3A 3LDLA 3MN5A 1KAZA 3UKUB 4DCHA 2Q2RA 4JHDB 5JMVA 3U9DA 1QHAA 3WEEA 2P9UB 5AQYA 3C0BA 2FSKA 3HM8A 1KAXA 3FR0A 4B1YB 4WYBA 3HZ6A 3CJ7A 4XH5A 3WQUA 5FPDA 2GWJA 2IVNA 4H0OA 4MLHA 3ATVA 3EL2A 3SLCA 1JCEA 2E1ZA 3I8BA 2E2NA 3QB0A 5AQIA 2P9KA 2A6AA 2BTFA 2KHOA 5EY4A 4B1ZA 4J8FA 5AZJB 1U6ZA 4JD2A 3C7NB 3HSCA 3H45C 3A5LC 4MO4A 3VENA 1YUWA 3QDKA 1GLFO 4IZ9A 2P9NB 3VEOA 3O1WA 1T44A 4JAXA 1U2VB 3ENOA 5LJWA 5KQDA 4CZLA 5TKYA 1DGKN 3VEZA 2QWRA 2E2OA 4PKIA 5JICA 3ZX3A 5BPNA 5AQMA 4AM6A 2YJFA 2CGKA 4JN4A 5AQVA 2D0PA 3IDHA 4I6MB 4ISFA 2YCHA 1T6CA 3FLCO 4BRMA 4EHTA 2HF3A 1QQNA 3IFRA 4FWLA 1KXPA 4YDUA 4CZHA 2YHWA 1S3XA 5BREA 1NM1A 5F2RA 4B1VA 4H0TB 3KHYA 2VCPA 5AQJA 3HI0A 3VESA 2GEMA 4B9QA 5CE3A 1HKGA 3DXMA 1ZC6A 4ISGA 3WUHA 4FWSA 4A61A 1QQMA 1WUAA 4H5NA 4BRAA 4FOIA 1RDWX 3H1QA 4RTFD 2HOEA 2IVPA 1NGDA 5AQRA 3M3ZA 3MK6A 1Z6RA 3U4LA 5AQNA 2I7NA 5KQ8A 4BR5A 1NGAA 4CD1A 3VEYA 3R9PA 4FWMA 3VGMA 2CH6A 3WXLA 1NGCA 5AQOA 3S41A 4BRCA 1HX1A 2AP1A 1BO5O 1SAZA 5KPRA 4JNEA 3MMVA 5FPMA 3WQTA 5F1XA 2E88A 4PL7A 4FOEA 4C23A 1HLUA 1Z05A 2ZF5O 5AQWA 3L4IA 1XUPO 2D1KA 1J6ZA 2D0OA 3CQYA 4FWQA 4FL9A 3CJ9A 4BRFA 4BRHA 4CZFA 3ZX0A 1YVNA 4BRGA 4CI6A 3U8XA 2P9SB 3J8AA 1MDUB 3EKSA 1ESVA 1V4SA 1GLLO 1TYQB 2P9IB 2I7PA 3O4WA 1DEJA 2FSJA 2VYPA 4JHDA 3CI5A 3QBWA 1TUYA 1ATRA 3HTVA 4BQZA 5FPNA 3FZHA 3ENHA 4CZKA 2ASOA 4K41A 4XH4A 4B1WB 5BRHA 3A5NC 1MA9B 4PL8A 4BRIA 2FF6A 3JS6A 1ZBSA 4WQ4A 3FZKA 4MLEA 3U9ZA 3QFUA 2A5XA 3A0IX 2A41A 3EO3A 3QMLA 2GTDA 5AZJA 3UE5A 1GLAG 4QS8A 1C0GA 2GUPA 1G99A 2ZWHA 4RWTA 2D4WA 4H03B 4K25A 3CETA 4K42A 3CERA 2QWOA 3ZEUA 4BG9A 3AAPA 3ZETA 2P9PB 1ZXOA 2GELA 1U2VA 1GLCG 2PAVA 2IIRA 3GBTA 4FWRA 4Y0WA 5F0XA 5E26A 3DJCA 5AQXA 4E1JA 1X3MA 3ATUA 1NLVA 4FWKA 1GLJO 3WEEB 5AZIA 2W40A 4BRPA 4BR2A 3O5BA 2ASPA 3W0LA 2E2QA 3D2EA 3EN9A 4I6MA 5EVZA 2Q1NA 4CZMA 3LDPA 2YJEA 3A5OC 3BP8A 3WXJA 1LOTB 2A42A 4IJNA 1HKBA 4WQ4C 3LM2A 1Q18A 2QXLA 1EQYA 3LDQA 2BUPA 3WT0A 3VF6A 2P9KB 3VOVA 3UKRA 1TUUA 4H5RA 1BG3A 4JD2B 3ULEA 4NO7A 3ZX2A 4BG8A 5AQHA 3O1BA 5LY3A 4Z94A 3DAWA 4FPBA 2QWQA 2QWMA 1V4TA 1BUPA 4PKGA 4XEIA 1SQKA 3D2FA 5ADXH 3SK3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW4A 1NGFA 1Z25A 3UB5A 3ITHA 3RSEB 2QKKA 2UXCK 4DQIA 5BR9A 4Z4IA 4FSVA 4F8RA 4IKFA 3NGZA 4DV2K 3DLBA 1QVFM 1YAGA 1UA1A 2OTJN 4GVMA 4FWOA 2Q31A 3RR7A 3FZLA 1Z26A 4FPAA 3I8DA 3TWHA 4FWPA 4XH1A 3KK3A 3DM2A 3E01A 1F21A 4PQUA 3TANA 2HMIA 2HBMA 2WC9A 3DXMB 1C1CA 4LH5A 4BC5A 1RT1A 5J2MA 3S3MA 4DSEA 1JCFA 1S72N 4EAHD 4BRDA 3OYCA 4RW6A 2YHBA 3L4QA 1LCUA 4J2AA 1C0TA 3TAPA 2HHXA 4H5TA 1KRPA 3UKUA 3MXIA 3PO5A 4ID5A 3CCVN 3P38A 1YTAA 3QLHA 3QINA 4K0KK 1BA0A 5HRNA 2XRIA 3ZT3A 3IRXA 5KPZA 2CH5A 3SV4A 3OYGA 1QQCA 3SBGA 3U3GA 4HHTA 2BGGA 4X66K 4F3OA 4C8NA 4KPYA 3PX0A 1C6VA 1NK0A 3O6WA 1T05A 1B92A 4LF6K 4H0VB 1BWFO 4NLCA 5J1EA 4CECA 3P39A 1JLFA 5HLFA 1M1KO 1EO1A 3KVGA 4WQ5C 5J2QA 4JI5K 2D5RA 3ZSQA 4JI1K 3CPEA 1WBDA 4CGDA 5A2QO 4E1NA 2O8BB 2FBVA 1W9HA 3V4IA 1HUXA 4JK7A 4CBUA 4GW6A 1R59O 1RBVA 5M1QA 4KI6A 1NKCA 2QK9A 4NB4A 4FJMA 4DQ8A 3NE6A 3VEXA 4PHTX 5GAGP 2VG5A 2FBXA 3BZKA 1JL2A 1VQ8N 2V51B 4HUFA 1TVRA 1XHXA 2A1RA 1VSDA 3C6AA 3HPHA 5BRFA 3R6MA 1VQNN 4CFCA 2KZMA 3B6PA 2IC3A 2JWKA 1Q86O 4M3ZA 3NGYA 4FZXC 1KFDA 3K5MA 2HB5A 1NK5A 3VEWA 1NGEA 5AZIB 3V6DA 3RVCA 4OGCA 1CZBA 2ZM6K 1WAFA 4DHYA 3AA5X 4WFAL 5C25A 2HVHA 4MO5A 2O8EA 2YI1A 2ITGA 3J80O 3CJCA 1E4GT 4ELUA 5GINA 4OX9K 3O9TA 5C2FA 4EZ9A 4Q0BA 2AA4A 3OY9A 2OTLN 4BRNA 3RRHA 4FJJA 5M1PA 4LF5K 4DR2K 3O4QA 4NXMK 5B8HA 2O8CB 5BN9A 1CZ9A 5BPMA 4EFHA 3G4SN 3LP0A 4JRPA 5CZ2A 3E9PA 5I9EB 1I94K 4IJAA 3EE8A 5LMNK 3KZBA 1S1XA 1S6QA 4JK8A 1X3NA 2GV9A 2IAJA 5LMUK 2QEXN 1TGOA 4DQRA 3E9LA 4CE9A 3QIOA 4KH4A 1ATNA 3VTIA 3K57A 3VQEA 5AQKA 4ILHA 4FLUA 1E4FT 2V7YA 4EIAA 2J4RA 3NH2A 3CQXA 4OKKA 1TKDA 4HUGA 3PIPL 3LDNA 3J7YP 4RCHA 4H0PA 3MN5A 5KTQA 1GOBA 2NRRA 2YNGA 4E7LA 3CMEN 5C15A 4JHDB 5AQYA 1O1WA 3C0BA 2FSKA 1VSIA 1KAXA 2HHUA 2F7TA 1JJ2M 4WYBA 4FJHA 3HZ6A 4C8MA 5FPDA 2GWJA 1OVQA 1ZBFA 4MLHA 1N5YA 2XHBA 2NRWA 3OYMA 3QB0A 4WFNL 4FYDA 5EY4A 2NUBA 4B1ZA 4J8FA 1XHZA 3C7NB 3HSCA 4DR6K 2O4GA 3QDKA 3AVHA 3ID6A 3T19A 1TKTA 2P9NB 5M1NA 3O1WA 1T44A 1U04A 3LPUA 5LJWA 2RKIA 2YKMA 2GBZA 5I3UA 4U67L 4BY9C 5BPNA 4JYAK 3KK7A 1RDDA 1RT7A 4AM6A 2X74A 4JN4A 5AQVA 5CY4A 1C1AA 4ISFA 2RPIA 2NNWA 4CEOA 4PA1A 3T1YK 4FZYA 2AJQA 4GV6A 3QEPA 4BWJA 1QQNA 2ZJPL 2VQFK 4FWLA 1S3XA 5BREA 4E7HA 4BDZA 3EYZA 4H0TB 2F96A 3KHYA 4B9TA 3ZT2A 4LSNA 3LALA 1ZC6A 4CFAA 3WUHA 3TAMA 4KI4A 3T3FA 4FOIA 3CXCM 4RTFD 2HOEA 3P5JA 1JLGA 4CF1A 4DSJA 4IDKA 4L8RB 4CF0A 4CHPA 4CK1A 2Z1IA 5C42A 4CD1A 1JLBA 1LW2A 1N32K 4CJTA 1BI4B 3O3GA 1NGCA 3OS1A 1SAZA 4CEFA 4JKFA 1RTIA 4C23A 4OVLA 2IS3A 1N36K 3AVLA 1NOZA 4FWQA 1KLNA 2G8IA 2G8KA 4BRHA 1TK0A 4CZFA 3NFAA 4E3SA 5SWMA 3SCXA 1ESVA 2ZQBA 3VQ6A 4DSFA 4HVJA 1VQLN 3TABA 2HHSA 4J2EA 1A5VA 4OLAA 4CIFA 4DV1K 4ZHRA 3ENHA 2ASOA 3OBWA 4PL8A 1O13A 2GUIA 1ZBSA 3OYAA 2HBJA 3KKRA 3P83D 3C94A 3QFUA 1KVBA 2A41A 3EO3A 1SS6A 1RBUA 1ILYA 3K0SA 4JKAA 1CLQA 3UE5A 1GLAG 1YITN 1R0AA 4QS8A 3OJUA 4RWTA 4K25A 4RG8A 1SKRA 3CERA 3OYLA 3ZEUA 4DUYK 3AAPA 3LPTA 1U47A 1ZXOA 1WLJA 1Y97A 2GELA 3O9SA 3MEDA 1HNVA 4FWRA 4Y0WA 2OA8A 5F0XA 4E89A 2LSNA 3DJCA 4E1JA 3T1AA 3ATUA 1J54A 5JS1A 3LP2A 4KTWA 3W0LA 4JS5A 4DSLA 4I6MA 3LDPA 2YJEA 3O9QA 5M1KA 1S1UA 5AJ3K 3HPOA 4WQ4C 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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