3VF6A

Glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 177

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
457
structure length
451
Chain Sequence
HHENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGESVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
50100150200250300350400400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 177
structure length 451
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vf6A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vf6A01
1P8ZA 3MN9A 3MCPA 3UKUB 4FL9A 4WQ5A 2KHOA 4JD2B 3QBWA 4FWMA 4BC4A 3CJ1A 3ZEUB 1ATNA 1SZ2A 2EWSA 4K41A 5AQOA 5AQRA 2NZTA 4FO0A 1NGHA 1NWKA 1LCUA 4IO8A 3A5NC 5TKYA 4L3QA 2PBDA 2VYPA 5AQGA 5AQWA 2V51B 4MO5A 2IVOA 3ATUA 1HX1A 1QZ5A 3ZETB 3LDQA 3O5BA 1YAGA 3M3ZA 4BGBA 3S41A 4WQ5C 2BTFA 2E88A 2YHXA 4H5RA 3VEWA 3FZMA 4DCHA 1HKGA 3A0IX 3CJAA 1GLAG 4QS7A 3VGMA 4BRGA 1GLBG 5BR9A 5AQNA 1ZBSA 3LDOA 3VESA 3CJCA 4CD1A 3SK3A 1BUPA 4IJNA 3FZKA 5AQPA 5AZJA 4BRPA 4CD3A 3QDKA 3BF1A 4PL8A 2FSKA 5I9EB 3M1FA 3R6MA 2GUPA 3C7NB 4J8FA 4IJAA 2P9IA 4CZFA 4FPAA 1WOQA 2A41A 1D4XA 1CZAN 1S22A 2FF6A 3C0BA 3ID8A 4CZMA 1OKJA 1MA9B 3WUHA 1K8KB 4M63C 1K8KA 3CQXA 3LM9A 4CZEA 4K43A 3R8EA 3EN9A 4F9OA 5KPTA 1NGIA 2H3GX 5EXWA 4K25A 3VEZA 4H5TA 5AQKA 2QWRA 3UE5A 5ELZA 1GLCG 2GEMA 2I7NA 3B8AX 4BRAA 2NLXA 3VERA 5BRFA 3VGKA 3A5MC 2FSNA 5AZIA 5BN9A 2E2NA 3VF6A 3U9DA 2D0OA 2QM1A 1Z6RA 1LOTB 1V4SA 2D0PA 1GLLO 4DHYA 5B8HA 3DAWA 4EIAA 3I33A 1R59O 3I8BA 3L4IA 4LC9B 5LJVA 3MDQA 3BEXA 4FWQA 3SMPA 4CZJA 1NBWA 5CE3A 1X3NA 1ATRA 2GWJA 1XQSC 4K42A 5AQZA 2ASPA 2FSJA 3TU5A 1GLJO 3DXMA 3KVGA 4EAHD 4PL7A 2QW9A 4PKHA 4BR5A 3HTVA 4DB3A 1U2VA 4BGAA 4CZKA 3QMLA 5AQLA 2QWMA 3CIPA 1T6CA 1ZC6A 4O8KA 5AR0A 4M7YA 1T6DA 1IJJA 4KBOA 3DXKB 3O6WA 2A5XA 3F9MA 4B1UB 1NGJA 2IIRA 3VEOA 4BR0A 1Q18A 3HZ6A 4BRMA 2P9UB 2AP1A 3MN7A 4B1WB 1TUYA 4BG8A 2D4WA 1G99A 3WT0A 4H5NA 5BPLA 4JHDB 3H3OB 3AARA 5F2RA 2IVPA 1X9JA 2Q0UA 2VWBA 3U9ZA 4E1JA 3D2FA 3WQUA 3HI0A 4GY2B 4B9QA 3TPQA 1IG8A 2D1KA 3P4IA 5AQQA 2HF3A 4BR4A 3UKUA 5E84A 3O4WA 3G25A 4JD2A 2CGLA 4YDUA 3ZEUA 3AAPA 3GL1A 5AQUA 3VENA 3ATVA 3HSCA 2A3ZA 3BP8A 3R9PA 1GLDG 2V7YA 2YJEA 3ZETA 2HOEA 5JMVA 3SMSA 2E2PA 4H0OA 2F9TA 5EVZA 1MWKA 4YDUC 4BQZA 3WXKA 4BR7A 4BRIA 3IUCA 4BRCA 3VOVA 5KQ8A 5AQSA 3O8MA 4PKGA 1NGDA 3MN5A 4BRHA 2QWOA 4BR2A 3C7NA 4WYBA 2QWPA 1T44A 5JLHA 1S3XA 1SQKA 2V52B 3M6GA 3GDQA 3W3DA 3FE1A 3AAQA 3MN6A 1NGFA 3ZX0A 4FSVA 5FPDA 3QICA 2E1YA 3CI5A 2FXUA 2YCHA 5AQXA 3EZWA 2Q36A 3GG4A 1U6ZA 4RCHA 3VF2A 2P9SB 3VEVA 4H0TB 1ESVA 2FF3B 4B1YB 3H6EA 2GELA 4EFHA 2P9LB 1BO5O 3QFPA 3L0QA 4C23A 3A5LC 1NM1A 1X3MA 4M7XA 1HLUA 2P9KB 1NGEA 3CETA 3J8AA 4XEIA 4BC5A 4XH1A 4BG9A 5JICA 4B1XB 3WEEB 1DKGD 2E1ZA 4FWOA 3SJHA 1BG3A 4IWVA 2W40A 4CJ7A 4FPBA 3WQTA 5BREA 1C0GA 1E4GT 4B1VA 2QWLA 2QXLA 3FZFA 3IMXA 3MMVA 4B1ZA 4Y0WA 5AQYA 3CJ9A 4WQ4A 2Q1NA 4EHTA 5BRDA 1DEJA 4FOEA 5KQDA 2ZWHA 4A2BA 5LY3A 3EKSA 3MK6A 4ISGA 1KAXA 2AA4A 5JLFA 4CBXA 2GTDA 4Z94A 1HKCA 1C0FA 1YUWA 2A6AA 3QBXA 1RFQA 4H5VA 3H3NO 3FR0A 3DXKA 1BWFO 5AFUH 4CZLA 5FPEA 4JNEA 4H0XB 2YHYA 3OHRA 2ITMA 2P9UA 3ULEB 1QQOA 4WQ4C 1Z05A 3VPZA 4HTLA 4H0VB 1BA1A 4JHDA 1TYQB 2ZF5O 3D2EB 1HPMA 1E4FT 3RSEB 1GLEG 1NGGA 3A5OC 4NO7A 4BQLA 3KZBA 4BRLA 1XC3A 3H45C 4ISFA 5LJWA 2P9PB 4I6MB 3DWLA 5KPRA 4FWSA 3LDNA 4BVPA 1MDUB 3VEYA 3WXLA 3L6QA 1EQYA 1HUXA 4H5WA 4EHUA 3UKRB 3LDLA 4IXCA 5EY4A 5AQTA 2QWQA 2P9NB 4FWKA 4CI6A 2CH5A 1ATSA 1SAZA 5AQFA 2I7PA 1KAYA 3O1WA 2Q0RA 3VEXA 1BU6O 3QB0A 4ISEA 4BRDA 5KPZA 3GOIA 3U4LA 4CBUA 1KXPA 4IZ9A 3CJ7A 4A2AA 1XUPO 2PAVA 3A8YA 1GLFO 4HWIA 3VETA 4BROA 4O5FA 4BVOA 4BREA 1BA0A 3EL2A 1J6ZA 2J4RA 2Q2RA 2ZGYA 5BN8A 4BR9A 5BRHA 3CQYA 2YHWA 5ADXH 4CBWA 3GE1A 3BF3A 4NB4A 1NMDA 4H0YB 2HMPA 3ENOA 1H1VA 3IDHA 2A42A 3H1QA 4QS9A 3LDPA 1NGCA 3U8XA 4BC3A 1BDGA 2DPNA 4BRQA 3CERA 4H0PA 3FGUA 5FPMA 4MO4A 4FWRA 1JCGA 3W0LA 5AZJB 1TUUA 4XH5A 3HBTA 3H1VX 3CJBA 1JCFA 1RDWX 3O1BA 2NRHA 4H03B 2P9IB 3O80A 2P9SA 3IFRA 3FZHA 1NGAA 4CZHA 5AQHA 4A62A 1NLVA 5AFUA 2WUSA 1BOTO 2P9LA 4FWNA 1QQMA 1JCEA 2YJFA 3BUZB 3QFUA 4AM6A 5EX5A 2E2OA 1YXQA 3FZLA 3LM2A 2OANA 2P9KA 3WXIA 1QZ6A 2HF4A 3CHWA 2UYTA 3EKUA 4JAXA 4CZGA 4BRNA 3ZX2A 4MLEA 2YI1A 3FLCO 3JXUA 3WEEA 4BRFA 1HKBA 1ZXOA 3VF4A 4AM7A 3EO3A 4BRKA 1V4TA 5BPNA 2E20A 5AZIB 3VGLA 1DGKN 2ASMA 3O08A 3HM8A 1RGIA 3JS6A 2E8AA 4DQ8A 4A61A 1QQNA 2E2QA 3ENHA 3AY9A 3DJCA 4FWPA 4MLHA 2GWKA 5FPNA 2V7ZA 5AQJA 1MWMA 5F1XA 2CH6A 1WUAA 4CZIA 3DXMB 4PKIA 3LL3A 5F0XA 5AQIA 3KHYA 3SLCA 3UB5A 2F9WA 3ULEA 1QHAA 1U2VB 2A40A 4GNIA 4FOIA 5AQMA 3H46O 2CGJA 1Y64A 1TYQA 2VCPA 3D2EA 3D7EO 5ADXA 4XH4A 3RSEA 2Q97A 2FLOA 4FWLA 2Q31A 3ZX3A 2ASOA 2P9PA 4I6MA 2QWNA 3WXJA 5EOYA 5BPMA 4RWTA 3FFKB 5E26A 3GBTA 2CGKA 4RTFD 4BC2A 1KAZA 2IVNA 1HJOA 3UKRA 5AQVA 2BUPA 2ZGZA 4QS8A 2P9NA 2W41A 3D2FB 1NGBA 1YVNA 4JN4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P8ZA 4FL9A 3QBWA 2VQEK 1IBMK 1JKHA 1X9SA 1ATNA 1HNIA 4FO0A 3O3FA 4W5RA 3ZSOA 2VYPA 1WN7A 2E6LA 3C95A 3ATUA 4KH5A 4YOVA 4YOYA 3ZETB 3LDQA 3S41A 2BTFA 2E88A 1B9FA 4H5RA 1KFSA 1EWQA 1HKGA 4BRGA 1GLBG 4DSKA 3CYMA 2P5OA 3CJCA 4CD1A 4FM2A 1GOCA 5AZJA 1KFDA 4JKFA 2O8FA 3M1FA 3O9RA 1T3VA 4CF1A 2W6KA 1XHXA 2AJQA 1WOQA 2A41A 3K5LA 1CZAN 4UQGA 1L3UA 3C0BA 3ID8A 3OYFA 5IWAK 4CZMA 1MA9B 1K8KB 4M63C 3P38A 3CQXA 4CZEA 4DR7K 2PY5A 4F9OA 1VQON 3H08A 4JKCA 4K25A 3SCXA 1HQEA 3K57A 3TAPA 1JLCA 4B3SK 4M3WA 1QVFM 3EYZA 4CEDA 3VGKA 1A5XA 2FSNA 5BN9A 3SAFA 1NKBA 2E2NA 3B6PA 1JLAA 2D0OA 1QSSA 2QM1A 2XRIA 4HTUA 4JI0K 1TAQA 3VTIA 4KTQA 2DY4A 4EIAA 2X6NA 3I33A 1NOYA 4KPYA 4CFCA 4CZJA 3K0SA 4FLYA 2F8SA 3OYMA 1IKYA 1X9WA 5CY4A 2ASPA 5AQZA 2FSJA 4B9LA 4KHWA 3SI6A 3TU5A 1GLJO 1LWFA 3CMAN 5KRTA 4FLXA 3HTVA 4IOCL 2D5RA 3T7ZA 3I0SA 4OVLA 5GIPA 2QWMA 1KQSM 4CJUA 4M7YA 4DFMA 1IJJA 4CJLA 2A5XA 3M5RA 4GV9A 4B1WB 2IDOA 1J53A 1G99A 1M90O 1S1VA 3CPEA 4JK9A 3WT0A 4ID1A 5LL6Z 4DTUA 1OH5A 4WCEL 1X9JA 3V1RA 2Q0UA 1XHZA 2Z1HA 3IS9A 1C1BA 3G0ZA 5FRMA 3ENBA 4GY2B 5KRSA 1K73O 4BR4A 5E84A 3DI6A 4ELTA 1EWRA 2HHXA 3AVGA 3G6EN 1OH8A 4DKWA 4E1MA 3J7YP 2DTUA 3ATVA 3MX5A 3HSCA 3RMBA 1IO2A 2V7YA 4DU4A 2OZMA 3SYZA 2B6AA 5CYMA 3SAGA 2E5LK 4JRPA 3THVA 2KFNA 4FJMA 3C6HA 3VOVA 5KQ8A 5AQSA 1NGDA 4I9LA 3SUPA 3C7NA 2JGUA 1RT5A 4JKBA 3GDQA 1VQLN 4N41A 1NGFA 4M3TA 4FSVA 4PA1A 5FPDA 3IAYA 1U45A 4DV1K 2FXUA 4MQ3A 3SAHA 2Q36A 4FM0A 3MEDA 2IS3A 3VEVA 4H0TB 2RE2A 4DQQA 3OYBA 2GELA 1U4BA 3ITHA 1KVAA 1BO5O 5FROA 3QFPA 4C23A 1X3MA 3KK1A 2P9KB 4R5PA 1KRPA 4KHYA 3K9KA 3LDSA 4CHYA 3NF8A 3AGRA 4XH1A 4ZTJA 2WONA 2HVHA 1IBKK 3SJHA 4IWVA 4C8OA 4LSLA 2W40A 3BDPA 1BIZA 3WQTA 1SKSA 4KREA 4JI8K 2YNHA 4C8MA 1C0GA 1VSLA 5I42A 3ZT2A 2O8BA 5CYQA 2QXLA 4CE9A 3CMEN 4B1ZA 1HYVA 1NNEA 5LMNK 4A59A 5HRNA 4EHTA 5BRDA 1DEJA 5BR8K 3SQ1A 4A2BA 3EKSA 4FVUA 2AA4A 2QKBA 3QIPA 4Z94A 1YUWA 1HRHA 2A6AA 2YNGA 3H3NO 4OX9K 4CZLA 3LPTA 3R1XA 3OHRA 1QTMA 1QHTA 4GVMA 3ULEB 3P5JA 1Z05A 3EEQA 2D0BA 4DV5K 4HTLA 3AVAA 4JHDA 5HOOA 2ZF5O 3D2EB 1HPMA 5SZTA 1GLEG 2P51A 3SQ0A 3T1HK 2XY6A 4NO7A 3KZBA 4FJ8A 3KLFA 4ISFA 5AJ3K 4I6MB 4CHQA 5KPRA 1LAWA 4FWSA 3G71N 3QO9A 3SUQA 3VEYA 3WXLA 2G8IA 2WFBA 5EY4A 4IXCA 4JKGA 3NH2A 3O9SA 2WTUA 2O8EB 2ZE2A 1SAZA 5AQFA 4OJRA 3NF9A 4DSEA 1KAYA 4DTXA 1BU6O 4GKKK 2GV9A 3GOIA 1XNRK 3V9XA 4CBUA 1KXPA 4M3UA 3CJ7A 3OA9A 1HQUA 3CCSN 1GLFO 5KI6A 1TL3A 4DV7K 2NRXA 3EL2A 1J6ZA 5C25A 5BN8A 4FK4A 1DTQA 3GE1A 1NMDA 2O8DA 3IG1A 1L3VA 4OGCA 4FLZA 3H1QA 4KH6A 3DRPA 1NGCA 3U8XA 3CCUN 1VQ5N 2WC9A 4H0PA 3FGUA 5FPMA 4MO4A 4FWRA 1HNZK 5AZJB 3RWUA 1TUUA 2O8FB 1JCFA 4NCGA 4H03B 2HHQA 4AHRA 4OKEA 4NLCA 1RT7A 5HLFA 3F9KA 3DLLL 4NXNK 4A5BA 1JCEA 2YJFA 3BUZB 1VSIA 4C1NI 1YXQA 3DRRA 1YI2N 3CHWA 3I8DA 2UYTA 3ZYYX 4BRNA 3ZX2A 3SV4A 3V9SA 4W5QA 1NJYA 2DFEA 3FLCO 3E9OA 3WEEA 3C65A 3CCMN 4DQRA 2YNIA 4OLAA 1V4TA 4AH9A 2JWLA 1D5AA 1DGKN 1NK7A 3DLBA 2F7TA 4DV3K 3HM8A 1RGIA 1RT4A 3ALYA 4KTWA 4A61A 1QQNA 3V4IA 3I0RA 5DMRA 2PYLA 4YY3K 3AY9A 3DJCA 4CEBA 2GWKA 5FPNA 3F73A 4DSFA 1RCHA 5C15A 5F1XA 2CH6A 4CZIA 1SV5A 5AQIA 4X62K 1WBBA 3HO1A 2Q3SA 1Q7YO 4Q5VA 2W42A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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