3VOVA

Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
MKVVGLDLGGTKIAAGVFDGKRLLSKVVVPTPKEGGERVAEALAEAAERAEREAGVRGEAIGLGTPGPLDFRRGVIRNIPGVQDFPIRRILEEATGRPVFLENDANAAALAEHHLGAAQGEESSLYLTVSTGIGGGVVLGGRVLRGERGQGGELGHLTLLPGGPACGCGLEGCLEALAAGRALERDATYAFQRPVDTRELFRLFQAGDPKAERLVLQAARYVGIGLASLVKAFDPGVVVLGGGVALNAPEGYWEALLEAYRRYLQGWEAPPLRRARLGAEAGLLGAALTAYLEVKDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization and crystal structure of the thermophilic ROK hexokinase from Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Thermus thermophilus
total genus 95
structure length 297
sequence length 300
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vovA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vovA02
5F1XA 1D4XA 3EN9A 3R6MA 4FL9A 1NGHA 4BRPA 3HM8A 5AQKA 4BRLA 4HTLA 4CZLA 2HOEA 2WUSA 4BVOA 1DKGD 3L0QA 1XC3A 5BRHA 1GLEG 1BU6O 2IVOA 3FZFA 3I33A 1HLUA 1Q18A 1IG8A 3DWLA 3IUCA 1QZ6A 3WUHA 2QWRA 4BR9A 4JHDB 2HMPA 3A8YA 3CJBA 2GEMA 2H3GX 4GY2B 4FWPA 3AARA 3L4IA 3B8AX 3DAWA 3JS6A 5BRDA 4BRCA 3LDPA 4KBOA 4CZGA 3A5MC 4FOIA 3VPZA 1SQKA 3D2FB 4FPAA 4CZHA 3LDQA 4M7XA 1ZBSA 3BF1A 1QHAA 3CJ1A 4FPBA 4BGAA 4B1VA 5I9EB 3LDNA 5EY4A 2W40A 4H03B 1XQSC 2IVNA 5AQXA 2P9IA 4FWKA 4H5WA 2PAVA 3EKSA 1OKJA 5ADXH 1HJOA 2P9PB 1TYQB 1BUPA 2E1YA 2FSNA 2GWJA 2QWQA 3FZKA 4CZMA 4MLEA 3IDHA 3SMPA 4PKHA 2Q31A 3UKUB 3A5LC 4EHTA 5BN8A 2FSKA 2A6AA 2FXUA 5F2RA 2ZGYA 4H0YB 4PL8A 3LL3A 3JXUA 2V7YA 1BWFO 4A62A 4H0XB 4XH5A 4XEIA 3R9PA 3BF3A 5AQFA 4BQZA 4BR4A 3QFPA 3ID8A 2AP1A 3VEWA 3VEZA 2BUPA 3VOVA 3FZHA 4M7YA 1NGJA 2P9SB 3TU5A 2W41A 2PBDA 1QQMA 3KVGA 2NRHA 3LM9A 1BG3A 2QM1A 3VENA 4MLHA 4BC4A 3GBTA 3CQYA 1RFQA 3ZX2A 3A0IX 3D2FA 4RCHA 1U6ZA 4YDUA 4BR0A 4BROA 2E2PA 2A40A 3OHRA 4WQ4A 1TUUA 3U8XA 4JN4A 3KHYA 5KPTA 2KHOA 2P9KB 3CJ9A 1NGGA 1ZXOA 2ASPA 5AQOA 3VEVA 4BRIA 4BRFA 2E2OA 2P9PA 1TYQA 5EXWA 4CZKA 1T6DA 1GLLO 5BR9A 4HWIA 3P4IA 4FWSA 3SMSA 4A61A 2UYTA 2CH5A 2ITMA 3SJHA 2Q97A 3FZMA 1Z6RA 3GG4A 3UKUA 4ISFA 4MO4A 2QWNA 3TPQA 5AZIB 1GLDG 3D2EB 3VGLA 5AQRA 4H0OA 4QS8A 2NZTA 3ZEUB 2ZGZA 1HKGA 1NGFA 2Q0RA 4YDUC 4BRNA 3H6EA 1R59O 3MDQA 2FF3B 4DCHA 4WQ4C 4JAXA 4BG8A 2ASOA 2ZF5O 4BR5A 3HI0A 4B9QA 3KZBA 2A41A 3AY9A 3ENHA 3L6QA 2P9SA 5AQTA 4FOEA 2E88A 2GWKA 2D1KA 2CGJA 4FWQA 3MN9A 3HBTA 3C7NA 1LOTB 3HSCA 2GTDA 3VF2A 3FLCO 2QW9A 5F0XA 5BN9A 1T6CA 3O80A 4K43A 3GL1A 3SLCA 4BRDA 3ULEB 4CZJA 1JCFA 3C0BA 4H5VA 1BDGA 1BOTO 1NGEA 1U2VB 3CI5A 5B8HA 4CI6A 3ENOA 5BREA 2CGKA 3H46O 2P9KA 3FE1A 2VWBA 4L3QA 4GNIA 4WQ5A 4Y0WA 2A42A 2EWSA 2Q2RA 3CJAA 1X9JA 1GLAG 3CHWA 1J6ZA 1V4SA 2E8AA 4EAHD 1G99A 2V7ZA 5AZIA 3D2EA 4H0VB 3VERA 1GLCG 2I7NA 1NWKA 4CD3A 1RDWX 2FSJA 1YVNA 3ZEUA 2ZWHA 1RGIA 1P8ZA 1WUAA 4DB3A 1BA1A 1S22A 2HF4A 3CIPA 4XH4A 3VESA 5KPRA 4BC3A 4E1JA 2YJEA 3WXIA 3FFKB 3I8BA 5CE3A 4CD1A 3U9DA 4B1WB 4IXCA 4A2AA 4H5NA 4K42A 4WQ5C 4PKGA 5BPMA 5KQDA 3WQUA 5AQGA 4BRGA 5E84A 4CZEA 2Q36A 4B1UB 1JCEA 5LJVA 5BPLA 3CERA 3DXKB 5JLHA 2I7PA 3ZETA 1EQYA 4EFHA 3CJ7A 4FWOA 1NLVA 3ULEA 1QQOA 1MA9B 3WT0A 1ATRA 3H45C 2HF3A 1C0GA 4BRMA 1K8KB 1U2VA 4B1YB 4AM6A 1Z05A 4QS9A 1HKBA 3C7NB 2IIRA 3EL2A 3EZWA 5AQPA 1YUWA 3FZLA 3DJCA 2QWLA 1ATSA 5LJWA 3IFRA 1TUYA 2FF6A 4PL7A 4IJAA 1C0FA 4O5FA 1HKCA 5AR0A 3LDOA 4MO5A 5AZJB 5EVZA 2QWMA 3GDQA 1E4FT 5AQJA 3O1WA 3BEXA 4LC9B 4XH1A 4EIAA 4CBUA 3BUZB 2VYPA 3G25A 4QS7A 1IJJA 3BP8A 3UB5A 3A5OC 1MWMA 4PKIA 2E2QA 4ISEA 2J4RA 3VF4A 4WYBA 3HTVA 1NGIA 1NGBA 4CZIA 1YAGA 3WQTA 4BG9A 5FPMA 2ASMA 4K25A 1BO5O 3FR0A 1T44A 5KPZA 4Z94A 3CQXA 2NLXA 5E26A 3QDKA 1CZAN 1ATNA 1Y64A 4BVPA 1NM1A 3F9MA 5ELZA 1BA0A 4B1ZA 5AQHA 3DXKA 4IJNA 4FWMA 2Q1NA 3CJCA 4DHYA 2GELA 1SZ2A 2IVPA 5AQUA 3VEYA 3VETA 1ESVA 3M3ZA 4BRQA 3H1VX 1K8KA 5EOYA 4FWRA 4BGBA 5JLFA 4BQLA 3O08A 3EO3A 1NBWA 3W3DA 4BRKA 4NO7A 1GLFO 2QXLA 3MK6A 3QFUA 5AQLA 2BTFA 2D4WA 1HUXA 4I6MB 5KQ8A 2YI1A 3QBWA 3MN6A 2P9LA 2VCPA 3ZETB 3WXLA 5FPNA 5AQVA 2FLOA 3AAPA 5LY3A 3MN7A 1H1VA 4H0PA 4H5TA 2P9UA 1NGAA 2E20A 1KAYA 5AZJA 4J8FA 1DGKN 3VGKA 2A5XA 3H3NO 3UE5A 3DXMB 2YCHA 4AM7A 4BRHA 1MWKA 1NGCA 3QMLA 1WOQA 4M63C 4RWTA 3M6GA 2F9TA 3QB0A 1QQNA 4F9OA 5AQZA 3UKRB 4BR7A 2D0PA 4H5RA 1XUPO 3J8AA 4CJ7A 1NGDA 5AQNA 4CZFA 5JICA 3WXKA 3SK3A 3WEEA 5FPEA 3O5BA 1GLJO 2E2NA 5AQYA 3ZX0A 3RSEB 3ZX3A 4ISGA 3IMXA 3LDLA 1DEJA 1ZC6A 1HX1A 5EX5A 3VF6A 1KXPA 5AFUA 2DPNA 2F9WA 2Q0UA 3HZ6A 3VEXA 3WXJA 5AQMA 3GE1A 4CBXA 2A3ZA 2YHWA 3AAQA 3O1BA 1YXQA 3GOIA 4I6MA 1X3NA 1SAZA 2YHYA 2OANA 4FWNA 4JD2B 4RTFD 2P9NB 5FPDA 4FO0A 4BR2A 4BRAA 4O8KA 3M1FA 3VEOA 2YHXA 1KAZA 1MDUB 2GUPA 4JNEA 4B1XB 5AQSA 4K41A 2CH6A 3O8MA 3QICA 3DXMA 1HPMA 1S3XA 3W0LA 3A5NC 2P9LB 5JMVA 4JHDA 5BRFA 1E4GT 4IO8A 3MCPA 3D7EO 3UKRA 2V52B 2P9UB 4H0TB 4NB4A 4C23A 3O6WA 4FSVA 2CGLA 4BREA 3ATVA 3FGUA 4A2BA 2V51B 3U9ZA 3O4WA 1LCUA 4EHUA 2QWOA 3QBXA 3LM2A 1KAXA 3ATUA 5AQQA 3S41A 2YJFA 3RSEA 4IWVA 3U4LA 3MMVA 3R8EA 3MN5A 5ADXA 4CBWA 4BC5A 4BC2A 3CETA 4IZ9A 1V4TA 3WEEB 4FWLA 5TKYA 5AQIA 4DQ8A 5BPNA 1QZ5A 2D0OA 1X3MA 3VGMA 2QWPA 4JD2A 2E1ZA 1JCGA 2P9NA 1GLBG 3H3OB 3H1QA 1NMDA 3EKUA 5AQWA 2P9IB 2AA4A 5AFUH
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI7K 5C42A 1BCOA 3OJUA 3NMUA 3ASMA 1NGHA 4BRPA 1BIUA 3HM8A 4BRLA 2HOEA 5BRHA 1GLEG 3DOLA 5J2QA 3LZJA 4NCBA 4MDAA 3QLHA 3CCRN 4BACA 4J2AA 3K58A 3V1OA 3HVTA 2WOMA 2HMPA 3CJBA 2NUBA 5M1FA 2Y1IA 2HHQA 4CHOA 2KW4A 3OYNA 3KTQA 1CZBA 4CJEA 4HCBA 4C8MA 4GY2B 4AHVA 4FWPA 2YKNA 3L4QA 4JS5A 3NGIA 3OYEA 3VA3A 5J2PA 2O8BA 4CZHA 4LY7A 4KB0A 1E3MA 3T69A 3BF1A 4FPBA 4BGAA 3AO3A 3HPHA 2W40A 1XQSC 3KWIA 5AQXA 1J53A 4AF1A 2YHBA 4CJVA 2QWQA 4CESA 3TAQA 4N76A 1YI2N 1SL1A 1TK0A 4FJ8A 3SMPA 4PKHA 4ELTA 2O8EA 4FXDA 4Q0BA 1L3UA 3TTFA 2DFEA 2NRZA 5BN8A 4YFUA 3F5TA 4H0XB 2BE2A 1LAVA 4JI1K 3R9PA 3RRGA 1VQ7N 2FBTA 4KB1A 1ZYQA 5M1OA 3VEZA 3KWGA 3VOVA 1ILYA 3FZHA 4M7YA 4C8NA 4LFBK 1TL1A 3KVGA 5JS2A 3AV9A 4CEAA 3T3FA 2UUCK 4CHNA 4MLHA 4BC4A 3ZX2A 3D2FA 4GV6A 4YDUA 4MDBA 4BROA 2E2PA 1I94K 5KGWA 4RW6A 4E89A 5C12A 3RMCA 4JN4A 3ZT3A 4KV8A 4PUOA 4CHYA 1KLMA 3CMAN 4BWJA 1VSHA 4HWIA 2JGUA 4CJTA 4FWSA 4A61A 2QA4N 1FJGK 2ITMA 3FZMA 3GG4A 4IEEA 3LAKA 3QEIA 1VQPN 2HHXA 3D2EB 3L2VA 2NZTA 2PFUA 2RF2A 1ITGA 4YDUC 1R59O 4DCHA 3N4PA 4JAXA 3MXJA 3PV8A 3DLBA 1RBUA 3OYLA 2YNFA 3TSQA 4BE0A 1HQEA 3AY9A 4KHNA 3PSFA 4DS5A 2G8WA 4HUGA 3WNHA 1FW6A 3MN9A 2ZJRL 2GTDA 3TAPA 1T6CA 5GAHP 1HYZA 3MWTA 2OPQA 3SLCA 3JYTA 1JCFA 3C0BA 4N56A 1BDGA 1BOTO 4IEIA 3SV4A 3AGKA 4WFBL 5BREA 3H46O 4KHQA 3OS1A 3FE1A 2A42A 3VQBA 1WB9A 2Q2RA 3TAGA 4O8UA 2NRTA 3VQEA 4KRFA 1HPZA 1NJIO 2DFFA 3HO1A 4FLWA 5AZIA 3LP2A 4H0VB 2VWJA 4MFBA 1RDWX 2FSJA 3HVRA 3ZT4A 3J81O 3TAFA 3KD1E 3CC7N 3ZT0A 4DB3A 1BA1A 2HF4A 4XH4A 3VESA 4CEBA 4DTSA 2O8CB 4CK2A 1YF5L 4CERA 2YJEA 3WXIA 3HM9A 4DV5K 4GKKK 2HB5A 3THVA 5GIOA 4IG3A 4H5NA 4BDYA 4YOTA 1DTQA 1WLJA 3AGRA 5AQGA 4DV6K 4CZEA 4OLAA 1N34K 1JCEA 1XI1A 3CERA 3DXKB 4FK0A 3L2RA 2VG5A 1EQYA 4JKBA 1TKTA 4O4GA 1ATRA 1C1CA 2HF3A 4IG0A 4JI3K 2XRIA 1U2VA 2KQ2A 4FLVA 1JL2A 4KHYA 1VQON 3C7NB 2RPIA 2HNDA 3DJCA 2O8DA 1ATSA 4RW7A 1BIZA 4PL7A 4F3TA 3Q7CA 1HKCA 3PUFA 4JV5K 4B9NA 4MO5A 1WSGA 3ZT1A 3K9JA 2GV9A 3T1AA 4LC9B 5C0YA 4B9UA 4EIAA 1KVCA 3BUZB 1RT6A 3G71N 1IJJA 3BP8A 1W0HA 3A5OC 2BH1A 3HYFA 2KTQA 3TABA 3HTVA 5FPMA 4K25A 1BO5O 3U3YA 1T44A 3N4QA 2AJQA 3NFAA 3BZCA 3ULDA 1Y64A 1BI4A 1WBDA 3SV3A 5J2NA 1REVA 4Z4HA 3QINA 4FWMA 4E3SA 3RVCA 4DHYA 4X62K 5D3GA 2GELA 2IVPA 5AQUA 4AILC 3VEYA 4BRQA 3M3ZA 3VTIA 4FJMA 4FJ5A 4DR2K 3SBGA 4C1NK 2B5JA 2QXLA 4B3MK 2D4WA 2WBNA 1VQ9N 2P9LA 1KVAA 3DLGA 3I8DA 3WXLA 4DU3A 2W6LA 2D0AA 4H5TA 2E20A 2E6LA 4J8FA 5AZJA 2ZJPL 4A57A 1JLBA 2A5XA 1RDBA 3M8RA 3CCQN 4F8RA 2Z1GA 3QMLA 4AHTA 4JKGA 4ILGB 3M6GA 2KZMA 4OX9K 3G10A 3QB0A 5AQZA 3AVJA 3HOTA 4H5RA 1QSYA 4DR4K 1XUPO 3QESA 4CZFA 4IBNA 5CZ1A 1N8RO 3SK3A 3WEEA 4KO0A 1Q8IA 2HW3A 4F2RA 2D5RA 3IMXA 1D8YA 1DEJA 5EX5A 3TI0A 3C6TA 1VQ6N 4W5NA 2Q0UA 3PIOL 4CJRA 2OYQA 1HNIA 3NE6A 3LP3A 5AQMA 3GE1A 2NRVA 2PYJA 3NGYA 3C95A 3AAQA 4FZYA 2WONA 4I6MA 1HNVA 5I3UA 5H1SQ 3P39A 4BR2A 2BDPA 4O8KA 3M1FA 2X74A 1RBVA 4AHCA 3ALYA 2GUPA 1KTQA 4OLBA 2WTUA 2ZE2A 4F3OA 3O8MA 3AVIA 3L2QA 4LF5K 4JHDA 2OPRA 1VAZA 4GVEA 3RMDA 4ILJA 2P9UB 2V52B 3E9LA 3TARA 5BR8K 2QKKA 3O6WA 4CGIA 2CGLA 5HP1A 2LSNA 4BREA 4JS4A 3ZSYA 2O8FA 3CQ8A 4DSEA 1S1VA 1FKOA 2QEXN 4EHUA 2QWOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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