3VOVA

Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
MKVVGLDLGGTKIAAGVFDGKRLLSKVVVPTPKEGGERVAEALAEAAERAEREAGVRGEAIGLGTPGPLDFRRGVIRNIPGVQDFPIRRILEEATGRPVFLENDANAAALAEHHLGAAQGEESSLYLTVSTGIGGGVVLGGRVLRGERGQGGELGHLTLLPGGPACGCGLEGCLEALAAGRALERDATYAFQRPVDTRELFRLFQAGDPKAERLVLQAARYVGIGLASLVKAFDPGVVVLGGGVALNAPEGYWEALLEAYRRYLQGWEAPPLRRARLGAEAGLLGAALTAYLEVKDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Characterization and crystal structure of the thermophilic ROK hexokinase from Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Thermus thermophilus
total genus 95
structure length 297
sequence length 300
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vovA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vovA02
1ZXOA 4WQ4A 2ZWHA 2HF4A 2P9SA 1BG3A 5EX5A 3A5MC 1V4SA 1K8KA 1T6DA 4BRKA 5BRHA 2E2QA 2V52B 4H0TB 1QQMA 1HX1A 2W41A 2BUPA 4BVPA 2VYPA 2CGKA 1NGIA 4JD2A 4PKGA 3CJBA 1S3XA 3LDLA 4EHTA 3BUZB 5FPMA 1YVNA 3EL2A 4XH5A 3WXIA 1NGCA 3L4IA 3UE5A 3VEZA 2IVNA 1WOQA 4EFHA 4H0OA 4H5VA 3BEXA 3VEVA 2FF3B 2YI1A 4BGAA 4MLEA 4QS7A 1BUPA 2F9WA 4BROA 3IFRA 4E1JA 5BN8A 3P4IA 4BR5A 3FZLA 5KPRA 3VEXA 2P9SB 5AQXA 3QBXA 2ZGYA 3MMVA 1RDWX 1C0FA 2KHOA 1K8KB 5EOYA 5ADXA 4H5WA 3SLCA 4CD1A 3HSCA 3FLCO 4LC9B 4JD2B 4NB4A 2A41A 4IWVA 1D4XA 2E88A 4FOEA 3LDNA 3VEYA 3ZEUA 4BREA 2YCHA 3H1VX 3TU5A 3ZX3A 2E20A 3SK3A 2D4WA 1OKJA 5BRFA 2IVPA 1V4TA 4B1WB 4YDUA 4DHYA 4CZMA 3GOIA 4F9OA 2AA4A 4BC4A 5JICA 3WXLA 1HLUA 2A40A 1XUPO 4I6MA 3WXKA 2Q2RA 3ATUA 1GLAG 3CQXA 2FF6A 1NM1A 3GG4A 4BG8A 1NGHA 4PL8A 1XQSC 1GLDG 3CERA 3WEEB 2HF3A 1J6ZA 3C7NA 1QZ5A 5AR0A 5EY4A 4H03B 3UKUB 1HJOA 4IZ9A 3H6EA 3M3ZA 4XEIA 2E2OA 5BR9A 4CZKA 1MDUB 4H0XB 3L0QA 4B1XB 1S22A 1QHAA 4QS9A 5F2RA 4FWRA 5AQQA 3R6MA 3ZEUB 2A6AA 5AQJA 1IG8A 3M1FA 1RFQA 2QWMA 2E2NA 3ULEA 3O80A 2BTFA 1DEJA 3HBTA 4RWTA 4I6MB 4FPAA 2E2PA 3ZETB 1NGEA 3H46O 5AQFA 4DQ8A 1JCGA 1NGDA 3ENHA 3LDPA 1IJJA 3UKRA 4FWMA 4BR7A 1LCUA 4MLHA 1ATRA 3C7NB 4BR9A 3J8AA 3L6QA 1T6CA 3FZFA 1Q18A 3QFPA 1GLFO 4M7YA 4IJNA 4XH4A 4QS8A 3FGUA 4H5RA 3EZWA 2V7ZA 2J4RA 5AZJA 2QWPA 5BPLA 3VF6A 5BPMA 5AQKA 3FZHA 5AQHA 4ISFA 2HMPA 4CBXA 4FWOA 1GLLO 2UYTA 4FPBA 4CBUA 4EAHD 2V7YA 3H3OB 3EN9A 3CJ7A 1TUUA 5AQWA 2P9NA 2QWNA 4BG9A 4WQ5A 4J8FA 3ULEB 2FSKA 1JCFA 2Q1NA 3FR0A 5BREA 2ASMA 4IXCA 4BR2A 2P9PA 4FWQA 2NLXA 3R9PA 1G99A 2OANA 1GLBG 4BVOA 4CZHA 4BQZA 2GELA 4KBOA 1MA9B 5FPEA 3SMSA 3A0IX 4BRMA 5ADXH 3UKRB 2CGLA 3KVGA 1HUXA 3D2FA 3LDQA 3TPQA 3VENA 1E4FT 2FSNA 1CZAN 1KAXA 2A3ZA 3JXUA 4BQLA 4CZGA 5AQMA 2CH6A 2F9TA 1BWFO 4JAXA 3CJAA 3IMXA 5AZJB 3WQTA 4O8KA 3WEEA 3U9DA 3FFKB 1DKGD 2W40A 2QWQA 3O8MA 4BRPA 3UKUA 1BA1A 1NWKA 2Q0RA 3U8XA 3EKUA 3JS6A 2P9NB 1JCEA 3BF3A 1BU6O 1NMDA 3HM8A 4PKIA 5AQGA 1HKGA 2P9PB 2GWKA 3VPZA 1EQYA 2GUPA 3MN5A 3U9ZA 4Z94A 3D7EO 5BN9A 3GDQA 4MO4A 2CGJA 5I9EB 5KQDA 4BRCA 1NGGA 5AQPA 3D2FB 4B9QA 1ESVA 3O1WA 4NO7A 3AARA 3A5OC 4ISEA 1NGFA 1KXPA 3A8YA 4BRIA 1NLVA 2NRHA 2E1YA 3ZETA 1SAZA 3G25A 2I7NA 1GLEG 3O5BA 1HPMA 4FWPA 3O6WA 4H0VB 4L3QA 3DAWA 2DPNA 1X3MA 3FE1A 2YJEA 3DWLA 4Y0WA 4AM7A 4FSVA 4O5FA 3DJCA 5LJVA 2YJFA 2PBDA 2E1ZA 2ASOA 3CIPA 3VF2A 1WUAA 5AFUA 5FPDA 4BRQA 4CZLA 5KPZA 4CZEA 4A2AA 1SQKA 4H0PA 4FL9A 4K41A 3QFUA 1HKBA 5KQ8A 4EIAA 5JLFA 4M7XA 3ENOA 4FWKA 3DXKA 2VWBA 3EKSA 2H3GX 3RSEA 4WQ4C 4BC2A 4BRGA 3GE1A 5JLHA 1ZBSA 5AQUA 1X9JA 4B1VA 4PL7A 2ASPA 1NBWA 2FXUA 2D0OA 3O1BA 5BPNA 4DCHA 4CI6A 2I7PA 3FZKA 4FOIA 3CQYA 4B1YB 2YHWA 3UB5A 1QQOA 1RGIA 3QB0A 4FO0A 5E84A 2A5XA 4JHDB 2GTDA 2QM1A 3VETA 4BRLA 2NZTA 3QBWA 3GL1A 3VERA 3QICA 3MCPA 3LL3A 3KZBA 3A5NC 4BC5A 4GY2B 3CJCA 3DXKB 3WXJA 3LM2A 2D0PA 4GNIA 3RSEB 4BRDA 1NGAA 3LM9A 2FLOA 3OHRA 1Y64A 4CJ7A 4BGBA 4CBWA 3QDKA 2Q0UA 3AAQA 1U2VA 3SJHA 1E4GT 2ZGZA 3O08A 1KAZA 1ATNA 2P9KA 3CETA 3A5LC 3U4LA 2Q97A 5B8HA 5JMVA 5F1XA 3VGMA 3CJ9A 2P9IA 3VEOA 4C23A 5AQZA 4BRFA 2VCPA 4A62A 1YUWA 4HWIA 5TKYA 4CZFA 1ZC6A 5AQSA 4RCHA 1KAYA 3ATVA 4YDUC 1X3NA 4HTLA 4FWSA 3LDOA 3AAPA 1ATSA 3HTVA 3D2EA 2ZF5O 1BA0A 3AY9A 2A42A 4ISGA 5AQNA 2AP1A 5AQRA 1XC3A 1TYQA 2QWOA 3BF1A 3KHYA 3BP8A 3WT0A 3H3NO 1U2VB 4K25A 3I33A 3VGLA 2YHXA 2Q36A 2P9KB 2IIRA 2P9UA 3DXMA 4FWNA 5EVZA 4AM6A 3C0BA 3MN6A 3O4WA 2HOEA 3ZX2A 3WQUA 5AFUH 3IUCA 5F0XA 3B8AX 2E8AA 2P9IB 3SMPA 3CI5A 1MWKA 3WUHA 5EXWA 4H5NA 1C0GA 1H1VA 5KPTA 4RTFD 3EO3A 5AQTA 3GBTA 1T44A 2FSJA 1Z6RA 5BRDA 4BRAA 2QXLA 3VEWA 4H5TA 4IO8A 4CD3A 4JHDA 1DGKN 3CJ1A 4H0YB 2Q31A 4B1UB 1NGBA 4EHUA 1QZ6A 1TUYA 3D2EB 2P9LA 1NGJA 2PAVA 1YAGA 1GLJO 5ELZA 2ITMA 1TYQB 4K42A 5AZIA 4WYBA 3HI0A 1Z05A 3F9MA 3VGKA 4CZIA 1BDGA 3VOVA 3VESA 4A2BA 1U6ZA 4A61A 5AQOA 4FWLA 2P9UB 3DXMB 2V51B 3MN9A 5AQLA 4BRHA 3MK6A 3VF4A 1BOTO 2IVOA 2D1KA 4BC3A 1GLCG 3IDHA 2QWLA 5LY3A 4JN4A 3I8BA 2QWRA 5AQIA 3H1QA 1SZ2A 1R59O 4M63C 4XH1A 3S41A 4IJAA 4BR0A 3MN7A 2WUSA 2CH5A 5AQVA 3W3DA 4PKHA 1MWMA 3R8EA 4WQ5C 4BR4A 5CE3A 1P8ZA 3QMLA 3M6GA 1HKCA 2GEMA 5FPNA 4DB3A 1YXQA 4B1ZA 4MO5A 4K43A 4JNEA 3W0LA 2GWJA 3H45C 3MDQA 2EWSA 1LOTB 2P9LB 2YHYA 3FZMA 3ZX0A 3HZ6A 5AZIB 4BRNA 3ID8A 1BO5O 5E26A 5AQYA 5LJWA 4CZJA 1QQNA 2QW9A 3CHWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZXOA 1K8AO 1EO1A 4KHSA 2HF4A 1IKVA 4GKJK 5J2QA 4IDHA 5EX5A 5KGWA 1XNRK 2VQEK 1BI4B 3OS2A 1K8KA 5BRHA 4BRKA 4FLUA 4FZYA 2KFZA 2CGKA 4ILJA 3QEVA 3I0RA 4PKGA 1S3XA 3O4QA 3LDLA 4LF8K 1HNIA 3SPZA 3RTVA 1Y97A 1NGCA 1K9MO 3HJFA 3P5JA 4J2AA 3M8QA 4EFHA 4EP4A 2YI1A 4FW2A 4MLEA 4GV9A 2F9WA 3E1YA 3IFRA 4HVJA 4IEIA 3OYFA 1KD1O 3ITHA 4ID1A 5BN8A 3AA2A 2PYJA 4E19A 5AQXA 3ZSRA 3AVBA 4JKCA 1VSHA 4OGCA 4Z4FA 5TKWA 2BE2A 1RDWX 3LANA 4FLTA 1NK7A 4OKKA 3FLCO 4LC9B 4AILC 2HNYA 1CXQA 4JD2B 3SYZA 4RW7A 2E88A 1RNHA 4DV0K 2B5JA 1KVBA 1N36K 4CFAA 3ZEUA 5JVHL 4B9VA 1HYSA 3SK3A 5BRFA 2IVPA 2YNGA 3R1XA 1V4TA 3HXMA 2KKZA 4AQYK 4PUOA 3QESA 3T1HK 3O9RA 3WXLA 2A40A 3PSFA 2Q2RA 4M3ZA 2FF6A 3S3MA 2P5OA 4FJMA 4PL8A 3V9XA 3ZSZA 3CERA 2JGUA 1U4BA 2HHTA 3KLEA 5AR0A 5EY4A 1HJOA 5CYMA 3M8RA 3H6EA 4GV3A 2E2OA 1WN7A 4QAGA 4V19S 1S22A 3O3GA 5F2RA 1UWBA 3J80O 4DS4A 2G8VA 3R6MA 5AJ3K 3HO1A 4AH9A 1IG8A 4E7IA 3ULEA 4C1NI 4C8OA 4I6MB 4F3OA 1B92A 4E1NA 1NGEA 4BY9C 5C15A 1XC9A 1JCGA 1OVQA 3LDPA 1IJJA 3RWUA 4BR7A 3J7AP 4MLHA 4YOWA 4Q0BA 1ATRA 3C7NB 3ISNC 2YNIA 2JLEA 3DOLA 3J8AA 3LP3A 2A1SA 4U67L 2KW4A 1J9AA 2OCEA 4QS8A 3MXMA 3LPUA 1XNQK 2J4RA 4JLHA 3VF6A 3B6OA 4UQGA 1I39A 3NE6A 4FWOA 1GLLO 1JL2A 4B8AB 3CJ7A 4J8FA 2HVIA 5I3UA 3Q7BA 5BREA 1VSDA 2P9PA 2NLXA 2QKKA 4O0IA 3NBPA 4BVOA 2NRWA 5FPEA 3SMSA 4BRMA 4CEEA 3UKRB 3ZLJA 4ELTA 3KVGA 3LDQA 2RKIA 4CHPA 1ASUA 3D6RA 3VQ6A 4DR5K 1KAXA 2G8WA 3C6UA 1HRHA 3AO5A 3H08A 4I2QA 4O8KA 1WAJA 3PX4A 1C6VA 3A2FA 1U49A 3ZT0A 4JI0K 3O8MA 4IFYA 1ASWA 1KTQA 3UKUA 5M1KA 1BA1A 1NWKA 2Q0RA 3EE8A 3OYNA 3BF3A 1K6YA 1TKTA 4OJRA 5AQGA 2GWKA 3AA5X 2GUPA 3DM2A 4Z94A 3D7EO 1L3UA 5BN9A 2O8DA 4MO4A 2CGJA 4N47A 4YOTA 4BRCA 4FZXC 5AQPA 3V4IA 3AVAA 3O1WA 2G8KA 1NK8A 1QTMA 3A8YA 4BRIA 2NRHA 3I55N 4KH5A 1RDCA 4KKOA 2PY5A 2NRRA 4FJ5A 1X9MA 4FJ8A 1W7AA 1S1UA 1J5EK 1DLOA 4AM7A 4DTMA 1VQLN 5LJVA 1EX4A 1ASVA 4KHYA 4CEBA 2E1ZA 2UUCK 2ASOA 1ZBLA 1YHQN 5KRTA 4CECA 1I94K 4HHTA 4CZEA 4H0PA 4K41A 3CPWM 4X64K 3MX2A 4M7XA 4ELUA 2VWBA 3LPTA 5C24A 4CCHA 2H3GX 3L2RA 4BRGA 3CC2N 3NAEA 3AVFA 4FJHA 4BDYA 1QSSA 1VQ9N 3SZ2A 4YOXA 3L8BA 4FLYA 4B1VA 4A5AA 4PL7A 3PSIA 2FXUA 2WOMA 1U48A 1WB9A 4JK8A 1FW6A 3O1BA 3PO5A 3PIOL 2I7PA 3O3HA 3FZKA 4BDZA 3I8DA 1QQOA 1RGIA 3PLAA 1FK9A 3L3VA 3VETA 1JLAA 4OLBA 3OBYA 4CGGA 1ZBHA 1JLBA 1U47A 4GV6A 4GY2B 3CJCA 4O5BA 3DXKB 3LM2A 3MEDA 2O8CB 1U45A 4ILHA 4OPHA 1NGAA 2W42A 1QSYA 1DTQA 3L4QA 3WNGA 1HNXK 2XRIA 2LSNA 2VG7A 3QDKA 1VQ6N 2KLAA 3QIPA 3CXCM 1KAZA 3THYA 1ATNA 4CERA 3U4LA 3SUOA 3P38A 2P1JA 5FROA 2F96A 3L3UA 3VGMA 3KJVA 4O4GA 3SUNA 1RILA 4NCBA 4KB0A 1IBKK 5AQZA 4BRFA 4JS5A 1KC8O 3RMAA 4W5RA 2E5LK 1XHXA 4LH5A 3LZJA 1NJYA 1FKOA 1TL1A 2DFFA 3NDKA 3K58A 5MLCQ 4FWSA 3LDOA 2VGNA 2HHVA 3C94A 1RDUA 1RTDA 1LW2A 4LF7K 5SZTA 5IT9O 4O44A 2A42A 5AQNA 5JS1A 1R0AA 3KHYA 3BF1A 1XI1A 4N41A 3AVCA 1D9DA 1RDBA 5LMNK 4NLBA 3VGLA 2BGGA 4DV4K 1RT6A 2YNHA 4FWNA 4M3XA 4AM6A 4DSFA 4BE2A 2VWJA 4E1MA 5AFUH 3TTFA 3B8AX 3VA0A 2G8UA 5HRSA 1CZ9A 1C0GA 1H1VA 4YHHK 5KPTA 4B3TK 4FJIA 3OS1A 4DSLA 1Z6RA 4WCEL 1QQCA 2QA4N 2KQ2A 4CK1A 1M1KO 4KRFA 2Q31A 4B1UB 4DTRA 1NGBA 2XY6A 4LF4K 3D2EB 1NNEA 3VQAA 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1B9FA 3OVNA 4MDAA 5LL6Z 3M3ZA 5BR9A 3HRGA 4AHSA 4IO9L 3PY8A 1MDUB 4B1XB 3L0QA 3KD5E 3P39A 4FWRA 4NXNK 2E6MA 1TK5A 4CJRA 2A6AA 1VSKA 1YI2N 3UIQA 1S1TA 3N4PA 3VQ8A 1GOBA 3M1FA 4E7JA 3ZCMA 2BTFA 1DEJA 4CFDA 3TSPA 2E2PA 3RMCA 3U3YA 3KD1E 4HCCA 3H46O 5AQFA 4DQ8A 2YHAA 1Q81O 1C0MA 3CCQN 2BANA 4KV8A 3VTIA 4OX9K 3IKMA 4LH4A 3OYDA 3O3FA 1T6CA 1IKYA 1Q18A 3QFPA 4CGFA 4M7YA 1WNSA 1N32K 3DYAA 4XH4A 3P83D 4H5RA 3EZWA 2O8BA 5BPLA 4FLZA 4M42A 4TSXA 2HMPA 1TVRA 3T69A 2OZSA 4HCBA 2NRVA 4FPBA 4CBUA 4F2SA 3H3OB 1EKEA 1TUUA 5AQWA 4JI6K 2P9NA 3V1RA 4F3TA 2HBKA 2Q1NA 4CJSA 2AJQA 4RW6A 4BR2A 1G99A 2OANA 4BQZA 4KBOA 5ADXH 3S9HA 4FK4A 3KK7A 5C12A 4K8XA 3D2FA 3TPQA 3AVMA 2GV9A 3E9OA 1JJ2M 1CZAN 3V9ZA 4FYDA 4CF9A 5FDLA 4DKWA 1EXQA 3EZ5A 4H4MA 5AQMA 4FCYA 4IOCL 3DLKA 3HPOA 5AZJB 2D0CA 3WEEA 2B4JA 3U9DA 1RDDA 2QWQA 4BRPA 2YKMA 4MQ3A 3G10A 4DTPA 4KPYA 4B08A 1VRTA 3NH2A 4KI6A 2QK9A 3SUQA 3JS6A 1OH5A 1LWEA 4B8CA 1BU6O 4B9MA 4R79A 4PKIA 3OYBA 2PFUA 3N4QA 3VPZA 1EQYA 3MN5A 3MCAB 3TWHA 1GOAA 3GDQA 5FLXO 5KQDA 3WXMB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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