3VQ5 | Genus

Total Genus 48

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	48
sequence length	151
structure length	133
Chain Sequence	SPGIWQLDCTHLEGKVILVAVHVASGYIEAEVIPAETGQETAYFLLKLAGRWPVKTVHTDNGSNFTGATVRAACDWAGIKQEESMNKELKKIIGQVRDQAEHLKTAVQMAVFIHNHKRGYSAGERIVDIIATD

Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__5078652736550948__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__5078652736550948__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3VQ5/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__5078652736550948__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"5078652736550948","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3VQ5/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__5078652736550948__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5d0350eef238c47327cde799/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5d0350eef238c47327cde799/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5d0350eef238c47327cde799/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5d0350eef238c47327cde799/pdb.gz): 1096 ms

reading 133 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

133 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 19 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:132});backbone only;select *;

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Human immunodeficiency virus 1
publication title	Parallel screening of low molecular weight fragment libraries: do differences in methodology affect hit identification? pubmed doi rcsb
molecule keywords	POL polyprotein
total genus	48
structure length	133
sequence length	151
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-03-20

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H	3vq5A00

1B92A 4KRFA 3LP2A 3AVMA 4IFYA 3F73A 1SV5A 3VQEA 4AH9A 4FZXC 1C6VA 3G0ZA 1IKWA 4HUEA 4FJ7A 2GBZA 1U47A 2HHQA 3LPTA 4FLZA 1VRTA 3TAEA 4BDPA 5D3GA 2OPSA 3RMAA 3OVNA 4XIUA 3G10A 5I3UA 4J2DA 1UAXA 3T19A 1KVBA 1S6QA 3HPGA 3KLGA 1VSHA 3F9KA 3IRXA 3V1OA 1NK5A 3AA3A 3AVBA 4CFAA 4FM2A 2XY6A 1U04A 1A5WA 3OYJA 1N5YA 2BDPA 1BHLA 3OYHA 3V9ZA 4DTOA 3OJUA 2G8KA 2QKBA 1RTIA 2E6LA 1QSYA 1JLQA 3CG7A 3V9XA 2QKKA 2HMIA 4I9LA 2P51A 1IKYA 2BGGA 3KKSA 4ICLA 4FJMA 3OYCA 1F21A 1RDDA 5SWMA 4DWIA 4OPKA 5J2NA 4B9UA 2O4GA 5J1EA 3NH1A 4FZYA 4LH5A 3VQ6A 1TKZA 3K2PA 4CF1A 4CJ4A 3V4IA 3KKRA 3V81A 1WSGA 3ZSZA 2ETJA 4JLHA 3CM5A 3HJFA 3KTQA 1WSHA 2PY5A 5FRNA 1ITGA 1CLQA 3L3UA 1S1VA 3B6PA 2HHWA 1TK8A 1S1TA 2Y1IA 2NUBA 4I2PA 3AVKA 3DRRA 1SUQA 3DLKA 2Z1JA 3PUFA 4O0IA 4DU3A 4NCGA 1CZ9A 2KW4A 3DOLA 4IG3A 2FBXA 1B9DA 3O4NA 4E0DA 3CYMA 4ELVA 4MFBA 3CFOA 1BQNA 1BI4B 4CEFA 2JGUA 4BE2A 4FJLA 1QSLA 1NK4A 4FZZA 4JS5A 2F96A 3VQQA 2BE2A 3KK3A 3SNNA 4C8KA 1XC9A 1RT3A 4HTUA 3H08A 3LZIA 2I5JA 4CEQA 1WLJA 1L3UA 3WNFA 3B6OA 1IG9A 4FJIA 1VRUA 3O4QA 1C0TA 1GOCA 3SJJA 4I9QA 1YT3A 3QETA 2HHUA 4W5NA 1T7PA 3ISNC 1Q8IA 3ZSXA 3QEVA 1LWFA 1ASUA 2ATQA 4ID5A 1IH7A 3U3YA 3KJVA 2JLEA 3P1GA 1S1WA 2D0BA 3BDPA 1J53A 2DFEA 3AVLA 3KLFA 5HRNA 1J5OA 1KSPA 1RNHA 1U48A 1T05A 1D9DA 3PY8A 4AHRA 4CEZA 3MEGA 1TK5A 4CEAA 1NKCA 4H4OA 1BCMA 1TGOA 3OYKA 4CF0A 1L3SA 1REVA 4DLEA 4Q5VA 4DQRA 3C94A 2KFZA 1RT6A 4C8MA 4FXDA 1JXBA 3QO9A 1X1PA 4CECA 1S1XA 1TAQA 5E41A 4KHQA 2DTUA 1RBSA 2DFFA 3IG1A 4HVJA 4AHUA 3QNOA 1IKXA 3DOKA 5CYMA 2G8WA 1KRPA 3ZT4A 1DLOA 3AVNA 4CJWA 4LSNA 4B9MA 1EX4A 1Q9XA 3NAEA 3SCXA 5I42A 1K6YA 1D5AA 1QTMA 1RDBA 1J9AA 1RBUA 3CM6A 3AA2A 4E19A 2HNZA 3SQ2A 1XWLA 3ZSOA 4DG1A 4FJKA 4BWJA 2HHVA 4BWMA 4RG8A 1RBRA 3MECA 3L2UA 2HNYA 4CJPA 2IGIA 2IC3A 1NK7A 4FJ5A 4NYFA 2IOCA 2HB5A 5CY4A 4KTZA 4Z4CA 3WNHA 3DM2A 4B8AB 1KCFA 1NKEA 3TAQA 4CHQA 1D8YA 4KHNA 4M3UA 4E89A 1CZBA 1VSJA 1X9MA 2R7YA 3P83D 1QSSA 1FK9A 3V9WA 2E4LA 4KB0A 4PQUA 1S5JA 2E6MA 1RTJA 4CF8A 4M3RA 1I39A 1BL3A 4DFKA 3EYZA 4N56A 4NCBA 1GOAA 2PYLA 5J2QA 1BQMA 4CHZA 1TKTA 4KPYA 3CFPA 4CJKA 4E7KA 3OYLA 3AO4A 4N76A 1WSIA 2XY5A 4FJJA 3P5JA 1UOCA 2ITGA 4GW6A 5CZ1A 3D45A 1VSKA 4GMJB 3L2QA 3NHGA 1L5UA 4HCBA 4FM1A 1SKRA 4OKKA 3K57A 5HRSA 3VQ8A 5SZTA 2FC0A 4FK2A 4O44A 1QE1A 4Q0BA 4TSXA 3LWLA 5J2MA 2KZZA 4AILC 1JLCA 3S3NA 4M3TA 4CE9A 3C95A 4DTUA 3SPYA 2YNFA 4O4GA 4N47A 4W5RA 1A5XA 3M8RA 1SL0A 4DS4A 1WAJA 2W42A 4EZ9A 4IDKA 3OYFA 4QAGA 5HRRA 2AJQA 3NGYA 1UA1A 3NFAA 4Z0UA 1HYSA 3SQ0A 2EHGA 1W9HA 3AVAA 3TWHA 3SQ1A 4OGEA 1VSEA 4CFBA 4KI4A 2HW3A 4KTWA 3HT3A 4RW4A 2VWJA 3SYZA 4ELTA 4F3TA 4YNQA 2HHSA 1KTQA 5KGWA 4E7HA 2WOMA 3LAMA 3L2RA 4CJLA 4KTQA 4C8OA 4FLVA 4E7LA 4KI6A 4PWDA 3HPHA 2OA8A 4FYDA 4Z4IA 4F2SA 3DLEA 4J2EA 3NH2A 1VSFA 1C1CA 1WSEA 4DLGA 4FLXA 4BE1A 4DF8A 4DSJA 4CJRA 3OY9A 4OVLA 3ZSWA 4CGGA 4BACA 4KAZA 4B8CA 4DSFA 2RPIA 4DF4A 4M3WA 4CJUA 3SV4A 3PX0A 3VQBA 1NKBA 3HO1A 1ZBLA 4F4KA 4CFDA 3HP6A 1JLGA 2YKNA 4CJ5A 3AO5A 4GVMA 1KFSA 3DLHA 3MXJA 3CFRA 4J2AA 1IKVA 1YTAA 4DSKA 4Y1DA 2HHXA 4EZ6A 1TAUA 4KHSA 3QIOA 3OYEA 3LZJA 2G8FA 2X6NA 1Z25A 1S1UA 1JLEA 1RT5A 3CQ8A 3LWMA 3PX4A 1RT2A 3TR8A 2RF2A 3HYFA 2PYJA 1ZBUA 3C6TA 3ZT1A 1UA0A 3TANA 1C0UA 4O5BA 4CEOA 4CF9A 5HP1A 4DQPA 2XRIA 4C8NA 3RWUA 3HVTA 3OYBA 1TL3A 1DTQA 2RKIA 3TABA 4LD0A 4FK0A 4I2QA 4R5PA 3V9UA 4CEEA 3RMCA 2LSNA 3AA5X 3AVFA 3WNGA 4OKEA 2X6SA 4EP5A 1EP4A 3HL8A 1BISA 3VQ9A 4H4MA 4DFJA 3OYNA 3QEXA 3LP0A 4FLUA 3S9HA 1LWCA 3EZ5A 2KTQA 4CGIA 3THVA 4IG0A 3OS2A 1HQEA 4EP4A 4CERA 2P5OA 1FXXA 4LY7A 3NE6A 4CFCA 1KVAA 1HMVA 1EETA 4FLYA 1VK0A 1WSFA 4M3YA 2OPPA 2VG6A 4Y1CA 5HBMA 4F3OA 3L3VA 2XHBA 2D5RA 3VA0A 4NCAA 3AO1A 3OYAA 4DQQA 2Y1JA 1S9EA 1NJXA 3SI6A 3SV3A 1YTUA 3MEEA 3JYTA 1UWBA 3LPUA 3ZSVA 1Q9YA 1NJWA 4Z4GA 3SPZA 1NOYA 3AVCA 3DLBA 4B9VA 4HUFA 1C0MA 2XY8A 1KLMA 3LANA 4KKOA 2O4IA 4W5QA 1QS4A 3TARA 4O0JA 1WN7A 4CIGA 4JRPA 1BIUA 4FW1A 4B3OA 3BGRA 1NK9A 4M42A 1RTDA 4CGJA 4CIFA 3QINA 2G8UA 4FJ8A 4F2RA 4HUGA 3NGZA 1C1AA 3S3OA 1HQUA 2G8VA 3RR7A 4K8XA 5DK5A 3HXMA 4DQSA 1X9SA 4CCHA 4KB1A 3HK2A 3AA4A 4CJVA 2IDOA 1LAVA 5JS2A 1U4BA 3HVRA 3DLGA 4ELUA 4CF2A 4DTNA 3QLHA 4DTMA 2Z1GA 4N5SA 1HNIA 1HYVA 3I8DA 4DFPA 4CGFA 3IS9A 1RTHA 1RT1A 1WNSA 3RRHA 3NF8A 4BDZA 1RCHA 2GUIA 3LP3A 4OPJA 3K58A 4FJGA 3ZT0A 1HYZA 3QEPA 3U6FA 1G15A 4OKJA 1SL2A 3QEIA 5KI6A 3NH0A 5FDLA 3OS1A 3I0SA 3KLIA 3ASMA 4N41A 2YNGA 3M8QA 1RBVA 2ZQBA 4FJNA 4W5TA 3VQAA 3TAFA 1I3AA 4ZTFA 3JSMA 5C25A 3V6DA 1BI4A 1ZBFA 1XHXA 4FLTA 3LDSA 3TAGA 5K14A 3T1AA 1ZBHA 4LH4A 1JLFA 4E1NA 3RRGA 4FK4A 1ZYQA 5KRSA 5KTQA 3HSTB 1O1WA 2Z1IA 1L3VA 1U49A 2OPQA 3ULDA 3DLRA 5FROA 2FBVA 3SUPA 1BGXT 4KV8A 4WE1A 2YHBA 2XY7A 1DTTA 4JS4A 5CYQA 2G8IA 1NJZA 3RMDA 3PO5A 4B9SA 1RT4A 2OPRA 4CK1A 3MAQA 4ZTJA 4E7IA 1QHTA 4Z4EA 4CJTA 3HM9A 3QESA 1CXUA 4LSLA 1NOZA 3IAYA 3WNEA 3E01A 4CJQA 1GOBA 3QEWA 3KD1E 4KHYA 1S6PA 1HPZA 1ASWA 1CXQA 1TL1A 5FRMA 4DQIA 4G1QA 3AVHA 2GV9A 4CJ3A 4IBNA 4HCCA 4RW9A 5J2PA 4DSLA 3NCIA 4FJHA 1R0AA 4CJSA 4AHTA 3S3MA 2FBTA 3A2FA 4OLBA 1TKXA 1WSJA 2OZMA 2B6AA 3K5LA 4FM0A 4M3XA 1WAFA 4UQGA 1JXEA 3K5OA 3OYGA 5KRTA 4FCYA 5CZ2A 2B4JA 3AV9A 3VQ4A 2B5JA 4Z4HA 1N6QA 2YV0X 5DMRA 3V1RA 3AO2A 1SKWA 4B9NA 3VQ7A 1BIZA 1Y97A 4KREA 4MQ3A 4CEDA 4CHNA 4DTJA 3PO4A 3DI6A 3T3FA 2OZSA 4QCLA 1JL2A 1RT7A 3FFIA 4DTRA 3TAMA 4W5OA 3K59A 4E3SA 5HROA 3LP1A 3K5NA 3D0PA 3L8BA 4M45A 4AHSA 3QIPA 3I0RA 4O55A 5EU7A 1X9WA 2IAJA 3EY1A 3DRPA 2HNDA 3VQDA 3ALYA 1RDCA 1JLBA 1NK0A 2KFNA 2BANA 1HRHA 3VN5A 3VQCA 4ZHRA 3V9SA 3SUQA 1TVRA 1TKDA 1L3TA 4CHPA 4DTXA 4PY5A 3SZ2A 1XHZA 4FVMA 4CGDA 2A1RA 5HRPA 4H8KA 3UIQA 1JLAA 3KD5E 4CGHA 1JL1A 3DMJA 3QNNA 4CHYA 4E1MA 1HJRA 4KFBA 3OYIA 3AVJA 4FLWA 3DRSA 1NK6A 4F8RA 4M41A 4YFUA 1SL1A 4KHWA 4AHCA 3RR8A 1RDAA 3HPOA 3PX6A 3L2VA 1KVCA 1VSLA 2ZE2A 1KFDA 3PV8A 3DYAA 4K8ZA 4ID1A 1U45A 4FJXA 2HHTA 4IFVA 1SKSA 2IS3A 2VG5A 4NYNA 1W0HA 3AO3A 3AVIA 5C24A 4CESA 3OYDA 3L2WA 1NJYA 4Z4FA 3VQPA 4CEBA 2F8TA 1LW2A 3ZCMA 2X78A 3OJSA 2F8SA 4CK3A 4DMNA 1YVUA 2VWKA 3U3GA 3ZT3A 2XO7A 4B08A 2PZSA 3ZT2A 4BDYA 2D0CA 2YNHA 4E7JA 1S9GA 2Q3SA 1T8EA 1VSIA 4B9TA 1EXQA 1C1BA 3OS0A 2WONA 1LW0A 3QERA 2G8HA 2DY4A 2P5GA 3KLEA 4B9LA 3O3GA 1MU2A 1ASVA 1KLNA 4C8LA 4CIEA 5HLFA 4DSIA 2QK9A 2D0AA 4RW8A 3LALA 4AHVA 1TV6A 3NBPA 1J54A 3KK2A 4KHUA 2YKMA 2VG7A 4DTSA 2OYQA 4FJ9A 3KIOA 4IKFA 4RW6A 4PUOA 1B9FA 3LAKA 3SUNA 1QQCA 4KO0A 2DFHA 3MXIA 3ZSQA 3NGIA 2HVHA 4DTPA 4DSEA 2KZMA 3NF9A 3RTVA 2ZD1A 1LAWA 1VSMA 3C6UA 1NK8A 1D9FA 4FW2A 1IO2A 1RILA 2EX3A 3ZSYA 4DFMA 4QOZB 4DU1A 1HNVA 1LV5A 1Z26A 2FBYA 3M8SA 2X74A 3K5MA 4RW7A 3KLHA 5T7BA 1RBTA 1FKPA 3VA3A 4L8RB 2RN2A 3V1QA 3SUOA 3NDKA 3TAPA 1TK0A 4J2BA 3MXMA 1VSDA 3M8PA 3NF6A 4I7FA 3SQ4A 1XI1A 1ZBIA 1EKEA 3NF7A 4CJFA 4HHTA 2QXFA 3ZSRA 4OJRA 1FKOA 4CK2A 3MEDA 1A5VA 4OGCA 5KGXA 3OYMA 3ITHA 3KK1A 4DU4A 3TI0A 1LWEA 2A1SA 5JS1A 3HP9A 3VQ5A 4JRQA 2HVIA 1BCOA 3O3HA 4BE0A 4OLAA 3AVGA 2YHAA 3RMBA 1T03A 2Z1HA 4CJEA 5C42A 1JKHA 4PA1A 4CHOA 3O3FA 4DS5A 2YNIA 2P1JA 4M3ZA 2KQ2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3AVMA 2HBMA 2HBJA 3G0ZA 2GBZA 1DGKN 3LPTA 4XH1A 3RMAA 3G10A 5I3UA 1UAXA 3T19A 3HPGA 5AQGA 4HWIA 3MX5A 2NRTA 4CFAA 4FM2A 1A5WA 1WBBA 2E8AA 1BHLA 1NGEA 3OYHA 4B3TK 1JLQA 4B3RK 3KKSA 4ICLA 4FJMA 1RDDA 1YAGA 5J1EA 1HR0K 4DR2K 3MWTA 3WXKA 3CPWM 3KTQA 5FRNA 5GIOA 1S1TA 3VETA 4LF8K 2F7TA 3DRRA 3DLKA 4DU3A 3DOLA 1B9DA 2P9IA 4EFHA 3OTOK 5EVZA 3CFOA 1H1VA 1BI4B 3THWA 1QSLA 4JS5A 2F96A 3VQQA 4X66K 4C8KA 1RFQA 3VOVA 5DM6L 1RT3A 4CEQA 3WNFA 1VRUA 4W5NA 2HHUA 3QETA 1VQKN 1T7PA 4OX9K 1Q8IA 4CBXA 4ID5A 3VESA 3FZLA 3P1GA 1VAZA 2E2OA 5GAHP 1TGOA 3OYKA 1L3SA 4DQRA 4Q5VA 1RT6A 3QO9A 2VWBA 1S1XA 2VQEK 3FFKB 4AHUA 3THXA 4JK8A 3AVNA 4CJWA 5JMVA 3J81O 4FPBA 1K6YA 5KPZA 1V4TA 2NNWA 3AA2A 1HNWK 1NGFA 4ILHA 2HNYA 4FJ5A 2HB5A 3P39A 3DM2A 1D8YA 3TAQA 3HOTA 1CZBA 5AQZA 3P83D 5C12A 4PQUA 1T6CA 2E4LA 3K9KA 3EYZA 2HHHK 4KPYA 5AQTA 4CJKA 5E26A 3OYLA 4BRNA 4NXMK 4FJJA 3H6EA 2ITGA 4GW6A 4PL8A 3QDKA 5BRFA 3L2QA 4GMJB 4DR3K 3F9MA 3VQ8A 3B8AX 5F0XA 4O44A 1NGDA 3CCEN 4NB4A 4AILC 4BRPA 2YNFA 3QICA 4O4GA 3M8RA 4OO1J 1ILYA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3ZSQ A;  3NGI A;  2HVH A;  4DTP A;  4DSE A;  2KZM A;  3NF9 A;  3RTV A;  2ZD1 A;  1LAW A;  1VSM A;  3C6U A;  1NK8 A;  1D9F A;  4FW2 A;  1IO2 A;  1RIL A;  2EX3 A;  3ZSY A;  4DFM A;  4QOZ B;  4DU1 A;  1HNV A;  1LV5 A;  1Z26 A;  2FBY A;  3M8S A;  2X74 A;  3K5M A;  4RW7 A;  3KLH A;  5T7B A;  1RBT A;  1FKP A;  3VA3 A;  4L8R B;  2RN2 A;  3V1Q A;  3SUO A;  3NDK A;  3TAP A;  1TK0 A;  4J2B A;  3MXM A;  1VSD A;  3M8P A;  3NF6 A;  4I7F A;  3SQ4 A;  1XI1 A;  1ZBI A;  1EKE A;  3NF7 A;  4CJF A;  4HHT A;  2QXF A;  3ZSR A;  4OJR A;  1FKO A;  4CK2 A;  3MED A;  1A5V A;  4OGC A;  5KGX A;  3OYM A;  3ITH A;  3KK1 A;  4DU4 A;  3TI0 A;  1LWE A;  2A1S A;  5JS1 A;  3HP9 A;  3VQ5 A;  4JRQ A;  2HVI A;  1BCO A;  3O3H A;  4BE0 A;  4OLA A;  3AVG A;  2YHA A;  3RMB A;  1T03 A;  2Z1H A;  4CJE A;  5C42 A;  1JKH A;  4PA1 A;  4CHO A;  3O3F A;  4DS5 A;  2YNI A;  2P1J A;  4M3Z A;  2KQ2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3AVM A;  2HBM A;  2HBJ A;  3G0Z A;  2GBZ A;  1DGK N;  3LPT A;  4XH1 A;  3RMA A;  3G10 A;  5I3U A;  1UAX A;  3T19 A;  3HPG A;  5AQG A;  4HWI A;  3MX5 A;  2NRT A;  4CFA A;  4FM2 A;  1A5W A;  1WBB A;  2E8A A;  1BHL A;  1NGE A;  3OYH A;  4B3T K;  1JLQ A;  4B3R K;  3KKS A;  4ICL A;  4FJM A;  1RDD A;  1YAG A;  5J1E A;  1HR0 K;  4DR2 K;  3MWT A;  3WXK A;  3CPW M;  3KTQ A;  5FRN A;  5GIO A;  1S1T A;  3VET A;  4LF8 K;  2F7T A;  3DRR A;  3DLK A;  4DU3 A;  3DOL A;  1B9D A;  2P9I A;  4EFH A;  3OTO K;  5EVZ A;  3CFO A;  1H1V A;  1BI4 B;  3THW A;  1QSL A;  4JS5 A;  2F96 A;  3VQQ A;  4X66 K;  4C8K A;  1RFQ A;  3VOV A;  5DM6 L;  1RT3 A;  4CEQ A;  3WNF A;  1VRU A;  4W5N A;  2HHU A;  3QET A;  1VQK N;  1T7P A;  4OX9 K;  1Q8I A;  4CBX A;  4ID5 A;  3VES A;  3FZL A;  3P1G A;  1VAZ A;  2E2O A;  5GAH P;  1TGO A;  3OYK A;  1L3S A;  4DQR A;  4Q5V A;  1RT6 A;  3QO9 A;  2VWB A;  1S1X A;  2VQE K;  3FFK B;  4AHU A;  3THX A;  4JK8 A;  3AVN A;  4CJW A;  5JMV A;  3J81 O;  4FPB A;  1K6Y A;  5KPZ A;  1V4T A;  2NNW A;  3AA2 A; 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3VQ5A

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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