3W0LA

The crystal structure of xenopus glucokinase and glucokinase regulatory protein complex
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
449
structure length
426
Chain Sequence
QNEVDQILSEFHLQEEDLHVLMCRMQAEMERGLHLETNEEASVKMLPTYVRSTPDGSEVGDFLALDLGGTNFRVMLVKVGEDLEGQWKVETKHKMYSIPVDAMTGTAEMLFDYIAECISDYLDQQNMKHKKLPLGFTFSFPVRNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHHCEVGLIVGTGCNACYMEEMSNVELVEGEEGRMCVNTEWGAFGDTGELEDFRLEYDRVVDEASLNPGQQLYEKMIGGKYMGELVRLVLIKMVNENLLFGGESSEKLKTRGAFETQFVSQIEADTSDFKQTLNILRTLGVQATIGDCHAVRLACESVSTRAAIMCSAGLAGILNRMRQSRREELLRITVGVDGSVYKLHPSFKDKFHATVLKLTSGCEITFIQSEEGSGRGAALISAVAYKMAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular basis for the role of glucokinase regulatory protein as the allosteric switch for glucokinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Xenopus laevis
total genus 149
structure length 426
sequence length 449
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3w0lA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3w0lA01
4JNEA 3MCPA 1GLCG 1NLVA 2QWRA 1D4XA 1ATSA 3SLCA 3F9MA 4MLEA 3DXKA 5AFUH 4BRMA 2CH6A 1NGEA 5JLFA 3I33A 4YDUA 3FE1A 2Q2RA 1LOTB 5BR9A 2CH5A 1QQOA 4BR5A 2VYPA 2H3GX 4Z94A 2P9KA 3VEYA 4NO7A 3DXMA 4JHDA 5FPDA 4RWTA 1BA0A 3D7EO 5F2RA 5JICA 2WUSA 3RSEA 3A5OC 5F0XA 4BRLA 3FZMA 3CETA 4H5VA 3BF3A 4H5NA 5CE3A 2YHWA 3UB5A 3H1VX 3U9DA 1HPMA 2Q36A 3M3ZA 3HM8A 3DWLA 1S22A 1WOQA 2P9SB 1K8KB 2P9IA 3C0BA 3MK6A 4CD3A 4EHTA 4CZLA 1BOTO 5AQNA 5BPNA 2P9NB 5JLHA 1NGAA 2ASPA 1DGKN 5EOYA 1BG3A 2D1KA 2IIRA 3FZKA 2BTFA 2J4RA 3B8AX 3VEOA 1ESVA 3CIPA 5BREA 2F9WA 5AZJA 1NM1A 1WUAA 2FF6A 3MDQA 3A5LC 4K43A 4RCHA 4I6MB 5AQQA 2D0PA 1T6DA 4E1JA 3P4IA 5LJVA 1MDUB 4A61A 4BR7A 3VGMA 3GBTA 4GY2B 4EFHA 3BUZB 4WQ4C 1BUPA 4BGAA 2A5XA 1BWFO 4H0YB 4BRIA 4PKGA 3L4IA 2NLXA 3EL2A 3HBTA 4CZKA 1QZ5A 4H0VB 1KAYA 3HZ6A 3VEZA 2YHXA 2D0OA 2QWOA 1V4TA 4IZ9A 3ATVA 3JXUA 4FWSA 3WXKA 4HTLA 1YUWA 5EVZA 1TYQB 2E2OA 1TUUA 4BREA 4BC2A 5BPMA 3VF4A 4BRDA 4BQZA 1HKBA 4AM6A 3CJ7A 3DJCA 1IJJA 3R6MA 2YCHA 4BC3A 4BRFA 3VENA 3R8EA 4BRQA 2I7NA 2P9UA 5KQDA 5F1XA 3U8XA 3GG4A 1NGFA 3OHRA 5AZIB 2ZF5O 3LDLA 2HF3A 5AQJA 1G99A 2GUPA 4BGBA 1GLLO 2E2QA 3EKSA 3D2EB 4H0PA 3SK3A 3QMLA 2NRHA 1RDWX 1YVNA 4AM7A 2FSNA 4WQ5A 3BP8A 3UKUB 4CZIA 4MO5A 5AQMA 4BRNA 3CQYA 3MN7A 2E88A 3CQXA 3M1FA 4JD2A 2CGLA 3FZLA 2D4WA 1ZXOA 2FF3B 2V51B 3CJCA 1NGBA 3GDQA 2YHYA 2FLOA 3HSCA 1YXQA 3QICA 2F9TA 5LJWA 4YDUC 3QDKA 3IMXA 2V52B 4C23A 1V4SA 4EIAA 3WEEA 4XH4A 4FWPA 3CHWA 4EAHD 2P9NA 3SMSA 1HX1A 3MN6A 3FZHA 1KXPA 1YAGA 1BO5O 4M7XA 3ZX3A 1J6ZA 2IVNA 1H1VA 1GLJO 2KHOA 3GL1A 1E4FT 3VEWA 1NWKA 3J8AA 3EN9A 4B9QA 5AQHA 4BRGA 3FGUA 1CZAN 4KBOA 5AQPA 1GLFO 1HKCA 1OKJA 3WXJA 3AAQA 4K41A 5E26A 4CZFA 3KZBA 3LL3A 1NBWA 3O5BA 5AQGA 3WQTA 1GLEG 4FPAA 4I6MA 3I8BA 5BRDA 2FXUA 3TPQA 2W40A 3SJHA 2UYTA 1S3XA 4BRAA 3HTVA 2E1ZA 4MLHA 3ZEUB 3ZETB 4ISGA 2ASOA 2P9LA 4BQLA 4BROA 2VCPA 4MO4A 4B1ZA 4PL8A 1GLAG 3A8YA 3EKUA 1U6ZA 1R59O 4FWMA 4BRKA 3CJBA 3DAWA 4IJAA 1SQKA 4IXCA 3D2FA 3TU5A 4F9OA 3WXIA 2GELA 2Q0UA 1HKGA 1IG8A 4B1XB 1KAZA 3A5MC 1MWKA 1NGGA 1NGJA 5JMVA 1JCFA 2P9KB 1DKGD 4CZJA 1NGCA 5KQ8A 3H3OB 3WUHA 1LCUA 2CGJA 2P9PA 4BRHA 1T6CA 1U2VA 2YJFA 4L3QA 5ADXH 4H5RA 1E4GT 4CZGA 3U9ZA 1C0FA 4J8FA 4EHUA 5BN8A 2GEMA 1ATNA 1JCEA 4A2BA 3VERA 2A6AA 3QFPA 4PKHA 2A3ZA 3QFUA 3O6WA 3HI0A 3O80A 3BEXA 4B1WB 4FSVA 3CERA 3BF1A 4IO8A 4CZEA 4BR0A 2V7ZA 4QS7A 4XH5A 5AQSA 4H03B 1Y64A 3FLCO 3LDQA 4FWLA 1RFQA 2QW9A 4BG9A 4CJ7A 2Q0RA 4H0OA 1X3MA 4WYBA 5AZJB 4B1YB 4FO0A 3LM9A 1Q18A 4BR2A 1MA9B 3M6GA 3VESA 4O8KA 2BUPA 4WQ5C 3ULEB 4DB3A 2PAVA 3H6EA 4FWNA 4QS9A 3LDNA 3WXLA 5EY4A 3VETA 3IDHA 2Q31A 4BG8A 2YJEA 4BR4A 5B8HA 1KAXA 3H1QA 4GNIA 4BR9A 1XC3A 2ZGYA 3ENHA 3FFKB 1SAZA 1NGHA 3LDPA 4FWKA 5EX5A 2HF4A 3FZFA 5FPNA 5BRFA 5AQIA 3C7NB 1HUXA 3G25A 3VGLA 2P9SA 4BVOA 3WT0A 1K8KA 5AQRA 4A2AA 5AQFA 2NZTA 1BU6O 3VEVA 1C0GA 2ITMA 2FSKA 1ZBSA 5AQWA 2QM1A 3UKRB 1X3NA 2P9UB 3AY9A 1HLUA 3H3NO 4JN4A 2Q1NA 3W0LA 2E1YA 2VWBA 4H5WA 2ZWHA 5E84A 2E8AA 1ZC6A 1QQNA 4FOEA 1GLDG 4M63C 2HOEA 3GE1A 3CJ1A 3VF6A 3O08A 1SZ2A 4BRCA 2IVPA 2PBDA 3QBWA 3H46O 5AQUA 5AFUA 4ISEA 2ASMA 4DQ8A 1Z6RA 5AQOA 5AQKA 3O1WA 4A62A 4O5FA 5AQYA 1NMDA 3AAPA 4H0XB 4FWOA 1DEJA 4BRPA 4JD2B 4DHYA 4H0TB 2E20A 2QWPA 2ZGZA 3KHYA 4FPBA 4HWIA 5AQVA 5KPRA 4ISFA 3LM2A 4XH1A 4FOIA 3O8MA 3IUCA 3ZX0A 1GLBG 3DXKB 5EXWA 3AARA 1TYQA 2QWNA 3WEEB 4QS8A 2AP1A 4Y0WA 3R9PA 4BC5A 4BC4A 4CZMA 3CI5A 3QBXA 3U4LA 3H45C 3DXMB 4JHDB 5AR0A 2HMPA 1QQMA 3RSEB 5AQLA 3L0QA 4CBWA 4B1UB 4FL9A 2EWSA 1QHAA 5AQTA 4CI6A 2OANA 5AZIA 4CBXA 2QXLA 3VEXA 3ID8A 2QWMA 3WQUA 5BPLA 5KPZA 3D2EA 2P9IB 5ELZA 3W3DA 4IWVA 3ULEA 3VPZA 3O4WA 1JCGA 3CJAA 2QWQA 4IJNA 2P9LB 3A5NC 4XEIA 3UKUA 3EZWA 4WQ4A 2AA4A 3FR0A 1TUYA 4BVPA 2QWLA 1T44A 4FWQA 4PKIA 4B1VA 2I7PA 3QB0A 5TKYA 2GWKA 1X9JA 3D2FB 4CD1A 3C7NA 3ENOA 1NGDA 5ADXA 3JS6A 3ATUA 3A0IX 5LY3A 2DPNA 3EO3A 1XUPO 2A42A 3VGKA 1HJOA 1BA1A 3GOIA 1Z05A 1BDGA 1P8ZA 5KPTA 4JAXA 4M7YA 3UKRA 5FPMA 4FWRA 4H5TA 2P9PB 3MN5A 2YI1A 3KVGA 1U2VB 2A40A 3IFRA 2FSJA 3CJ9A 2V7YA 4RTFD 5BN9A 1QZ6A 5AQXA 2GWJA 4LC9B 4CZHA 3SMPA 2Q97A 2IVOA 1XQSC 4K25A 3UE5A 3ZX2A 1ATRA 1NGIA 1RGIA 3VOVA 4NB4A 4PL7A 5AQZA 3S41A 4K42A 4CBUA 5I9EB 2E2PA 5FPEA 3MN9A 1EQYA 2GTDA 2CGKA 3L6QA 3ZEUA 3ZETA 3MMVA 2E2NA 3VF2A 1MWMA 4DCHA 3O1BA 5BRHA 2A41A 3LDOA 2W41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSWA 1ZBHA 3V9XA 4IFYA 2CH6A 1NGEA 5JLFA 3CCMN 2Q2RA 4JRQA 1N8RO 1QQOA 2F96A 4BR5A 5H1SQ 4DTUA 3U3YA 3O4QA 1VSMA 2I5JA 5JICA 4WE1A 4IBNA 5F0XA 3V1OA 4BRLA 3K57A 4KAZA 4DTXA 3UB5A 1X9MA 3D45A 5DMRA 2OTJN 1IH7A 3DWLA 3VQ4A 3CFPA 4BE2A 1K8KB 2P9IA 1S1VA 4FJGA 1IO2A 1BOTO 1RT6A 4DV3K 4E7KA 4JI0K 3BY5A 1Q7YO 2ASPA 4KRFA 3PIOL 4CK3A 4OPAA 1CXUA 1U04A 2Z1GA 4CFDA 4IOXA 4LF6K 1JLBA 5T7BA 3ZSXA 2P5GA 2J4RA 4B3RK 3WXMB 1ESVA 1U4BA 3CIPA 4K43A 5GAHP 4I6MB 5AQQA 4DS5A 3NF9A 4A61A 3T19A 3C95A 1UAXA 3GBTA 3DRPA 4O4GA 4JI3K 4F2SA 2OYQA 4BGAA 2A5XA 4E7JA 3VA3A 2QKKA 4PKGA 4J2AA 5TKWA 1QZ5A 3VEZA 3SZ2A 2YHXA 2WC9A 1Q9XA 2D0OA 3ATVA 3JXUA 4DV4K 4IDKA 4HTLA 5EVZA 4DTRA 4UQGA 4BREA 2QI2A 4KKOA 3TTFA 4AM6A 3AVHA 4WCEL 4DSIA 3RMAA 3TAEA 1SL2A 3AVFA 4FJXA 4AHUA 3GG4A 4JKHA 1NK9A 4DSJA 4CHPA 3HP6A 2W42A 1GLLO 3G0ZA 5CYQA 3PX4A 1NOZA 2O8EB 3AVNA 2NRHA 3NMUA 4AM7A 2IDOA 1RT5A 3SAGA 3UKUB 1BHLA 5HRPA 3CQYA 1E3MA 2BH1A 2E88A 3CQXA 3M1FA 1XNQK 1N33K 2D4WA 1RNHA 1ZXOA 3TAFA 2OA8A 1IKXA 5C2FA 4IO9L 3GDQA 3NVKA 2FLOA 3HT3A 2NRRA 3QICA 4Z0UA 3CPEA 4YDUC 1VQ8N 1O1WA 1J5OA 4X62K 3QNOA 1V4SA 4FJJA 4KHSA 3OYAA 3WEEA 4FWPA 4EAHD 2P9NA 2QKBA 3TSQA 1JLCA 3QNNA 1C0TA 1KXPA 1YAGA 3KK3A 1IKWA 2KHOA 1GLJO 2E6LA 1NWKA 3EN9A 4I9QA 2GX9A 2VG6A 3FGUA 4ELVA 1CZAN 4LF8K 4CJLA 2YHBA 3L2UA 3TI0A 1KVCA 4J2BA 3CD6N 4FLVA 2O8BB 1Q9YA 4K41A 4CZFA 4NYNA 2UU9K 3O5BA 1ASVA 3P83D 3PUFA 3VTIA 2UXDK 3V9ZA 1S3XA 4BRAA 1YJNN 3HTVA 2UUCK 4MLHA 4JK8A 2YNHA 4OKEA 2HBJA 1Q8IA 4YORA 2HHUA 4WF9L 3TAGA 5HRSA 3MCAB 1RT1A 3D6RA 1SQKA 4IJAA 3TU5A 4F9OA 2XHBA 4DTMA 5HOOA 3HJFA 2GELA 2Q0UA 2NRWA 3KIOA 2IS3A 1IG8A 1XMQK 1WAFA 1KAZA 4PWDA 1NGGA 1NGJA 2EHGA 4JKDA 4NCBA 2P9KB 4FJKA 2O8DA 1TVRA 4FZZA 4JLHA 4CZJA 3V6DA 4LF5K 1NGCA 5KQ8A 3H3OB 5HBMA 3HL8A 1LCUA 3EZ5A 3SPYA 1VSKA 2Z1JA 3E01A 4LSNA 3PX6A 1BCOA 3BZCA 4GVMA 4NLBA 3PSIA 5C25A 3BDPA 1S6PA 2A3ZA 1WSHA 2YNGA 3SV3A 4B3SK 3CCJN 1U47A 4ILGB 4CZEA 2RE2A 3VQBA 4H03B 2G8KA 1Y64A 2HNDA 1HR0K 4CESA 1HNZK 4E3SA 2Q0RA 3KK1A 4DFMA 4FM2A 3LWMA 4FW2A 4RW8A 3VMFB 4FZYA 1REVA 4ICLA 1WSIA 2GBZA 1KVBA 4DB3A 1LWCA 2PAVA 1OH7A 3VETA 5B8HA 3KLHA 3M5RA 4NLCA 4B3OA 4BY9C 2WFBA 3MWPA 3RRHA 1T03A 1SAZA 4KH5A 3TR8A 4FWKA 5EX5A 2IOCA 4CCHA 5BRFA 4KHPK 3C7NB 4G1QA 3CC7N 3OVNA 3VQPA 1K8KA 4K8ZA 1NK5A 4M3TA 3L8BA 2IAJA 1BU6O 3AVKA 3VEVA 4KTZA 5C12A 1KD1O 2FSKA 1ZBSA 5AQWA 4FK2A 2QM1A 3OBWA 2XY6A 3CCEN 3UKRB 2P9UB 3H3NO 1GOBA 4DR2K 4H5WA 1WN7A 5E84A 3QEPA 1BIZA 2AJQA 1GLDG 3GE1A 5HLFA 5SWMA 4CIGA 4AHSA 3QBWA 3DRRA 3CG7A 2RKIA 2ASMA 3AA3A 3HPHA 5AQOA 5IWAK 3OYGA 3LALA 1EX4A 4H0XB 2E6MA 4NYFA 4BDZA 3AO3A 4H0TB 1W9HA 4CF8A 4LD0A 4FOIA 3JSMA 5FLXO 3QEWA 5HROA 3BZKA 3M8SA 1NU0A 3HXMA 2QWNA 4LF4K 3C94A 4Y0WA 4DF8A 1XMOK 4CZMA 5K14A 4CF2A 1CZBA 3CI5A 3NFAA 4YOUA 1J5EK 1QQMA 1EWQA 1W2BM 4DMNA 2NNWA 3SUPA 3CFRA 2F7TA 4N76A 1NK0A 2OANA 3KLGA 2JWLA 3NBPA 4FLUA 4M3WA 3MECA 1NOYA 2QWMA 3MX2A 3RTVA 2P9IB 1QS4A 2O8EA 3ULEA 4DFKA 3KJVA 5C0YA 3CJAA 2P9LB 3UKUA 3EZWA 1N34K 2AA4A 1S6QA 2UXCK 4EZ9A 3OTOK 1UA1A 2NUBA 4FCYA 1Q82O 4E19A 1QTMA 2I7PA 3KK2A 3ZT0A 1X9JA 4JKBA 4Q0BA 1GOAA 1IV0A 5LY3A 2DPNA 1XUPO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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