3W0LA

The crystal structure of xenopus glucokinase and glucokinase regulatory protein complex
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
449
structure length
426
Chain Sequence
QNEVDQILSEFHLQEEDLHVLMCRMQAEMERGLHLETNEEASVKMLPTYVRSTPDGSEVGDFLALDLGGTNFRVMLVKVGEDLEGQWKVETKHKMYSIPVDAMTGTAEMLFDYIAECISDYLDQQNMKHKKLPLGFTFSFPVRNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHHCEVGLIVGTGCNACYMEEMSNVELVEGEEGRMCVNTEWGAFGDTGELEDFRLEYDRVVDEASLNPGQQLYEKMIGGKYMGELVRLVLIKMVNENLLFGGESSEKLKTRGAFETQFVSQIEADTSDFKQTLNILRTLGVQATIGDCHAVRLACESVSTRAAIMCSAGLAGILNRMRQSRREELLRITVGVDGSVYKLHPSFKDKFHATVLKLTSGCEITFIQSEEGSGRGAALISAVAYKMAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular basis for the role of glucokinase regulatory protein as the allosteric switch for glucokinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Xenopus laevis
total genus 149
structure length 426
sequence length 449
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3w0lA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3w0lA01
2FSJA 3QB0A 4NO7A 3FLCO 1LOTB 2QWQA 3FZKA 4IXCA 3VENA 3ID8A 5LJWA 1H1VA 4K43A 2QWMA 1KXPA 1TYQA 5E84A 4BQZA 1NMDA 4IJNA 4JD2A 4PL7A 4WQ5C 3JS6A 3VGMA 3TPQA 3VEXA 2P9IA 3FZLA 3VOVA 1NGHA 4BROA 2A6AA 5AZIA 1QQNA 1SQKA 3AY9A 2F9TA 3ZETB 1BU6O 2ITMA 1MDUB 2Q31A 4M7YA 2A5XA 5AQYA 3FZMA 1XC3A 2ASOA 4BGBA 1J6ZA 4IZ9A 3AAPA 3IUCA 4FL9A 4CZKA 2P9KA 3DAWA 3UKUB 2GUPA 5AQJA 3CI5A 1QQOA 1WOQA 4E1JA 4A2AA 2CH5A 2YHXA 3R9PA 3DXMA 3LL3A 4BR9A 2CGJA 3LM9A 1EQYA 4BC3A 2HOEA 3L0QA 4FWRA 5EX5A 2ZGYA 3HI0A 4XH1A 3VETA 4CZHA 3B8AX 3QFPA 3LDPA 2Q0RA 1NWKA 3LDNA 4FOEA 5BR9A 1GLFO 2VWBA 1WUAA 5AQRA 4CBWA 5EOYA 4H0OA 3WXJA 1RGIA 3CIPA 5BPNA 1R59O 2OANA 1Z05A 2NRHA 2P9PA 5AQVA 3WT0A 3AAQA 3VF6A 2E2NA 1GLJO 3GBTA 4JAXA 1XUPO 1BA0A 3KVGA 4BR4A 4L3QA 5AQMA 4CBUA 3ENHA 3CERA 4CZJA 1T6CA 4A62A 3GG4A 1E4FT 4BRIA 5AQFA 4EAHD 2V7ZA 2E20A 3UKRB 3VF2A 3VESA 3O6WA 1X9JA 1RDWX 1Y64A 1DEJA 4PL8A 3P4IA 4RCHA 4B1YB 2Q2RA 4BRMA 3EKUA 4H0PA 3I8BA 4BRFA 4CZFA 4JN4A 1C0GA 1ZC6A 3ZX0A 5AQNA 2J4RA 1QHAA 3O80A 3SLCA 5AZJA 5BPMA 3VGLA 3WXKA 5BRDA 4LC9B 4FO0A 1YAGA 3C7NB 3MCPA 4FWQA 5ELZA 1BG3A 1DKGD 3VF4A 4RWTA 4K41A 1ESVA 4WQ4A 1U2VB 4FPBA 3EN9A 5EVZA 4YDUA 3MN5A 2CGKA 2A3ZA 5ADXH 4A2BA 1KAZA 1DGKN 1LCUA 5JMVA 3QFUA 2E1YA 4K25A 3FZHA 4MO4A 3SMSA 4CI6A 4DQ8A 5AQSA 4AM7A 1K8KB 2ZF5O 2P9UB 2WUSA 2D4WA 5AQIA 2DPNA 4FWSA 3O5BA 1GLLO 1V4TA 1NBWA 3H45C 3HZ6A 5CE3A 1MWKA 1TYQB 5AQPA 2FSKA 3DXKA 4JD2B 1GLEG 1NGDA 1SAZA 2P9IB 1HKBA 4MLEA 1BO5O 2QXLA 2YCHA 5AZIB 4F9OA 5FPDA 1KAYA 5KPTA 5EY4A 3A5NC 3ZX3A 3EKSA 3A5LC 3H3OB 2ASPA 5TKYA 5AQXA 4ISFA 3VPZA 3O4WA 4EFHA 3QBXA 5BRFA 3QICA 2P9KB 3U9ZA 1YXQA 1YVNA 3BUZB 2A40A 4FOIA 1HPMA 4PKIA 1S3XA 1X3NA 3DXMB 3WXLA 3H3NO 4BR5A 2FSNA 3I33A 3O8MA 3R8EA 2CH6A 1ZBSA 2ZWHA 1BA1A 5FPNA 2UYTA 3D2EA 4BRGA 3CJ7A 3GL1A 2YJFA 2P9NA 2QW9A 1NGGA 2I7NA 4WQ5A 3ENOA 3FFKB 1IJJA 3CQYA 4HWIA 3BF3A 3CJAA 3IDHA 1GLAG 1Z6RA 3IMXA 1NGIA 2I7PA 3D2FA 5AQUA 4BRDA 3U9DA 4MO5A 4BRPA 4GY2B 2QWNA 3VEOA 4BG9A 2F9WA 2Q1NA 1QZ6A 2P9PB 3H6EA 3GOIA 1BUPA 2P9SA 4AM6A 1P8ZA 2QM1A 2NZTA 4GNIA 1NM1A 2V7YA 4CD1A 4BGAA 3O1WA 4FWNA 4H5NA 3MN9A 1JCFA 2CGLA 1ATSA 4FWKA 4HTLA 4I6MA 2YJEA 2W41A 3LDLA 3CJBA 4BR7A 2VCPA 5AQKA 3BF1A 4CD3A 5AFUH 3M1FA 3WUHA 3A5MC 4IWVA 4JHDA 3LDQA 3SK3A 1ZXOA 2HMPA 3EO3A 3L4IA 5ADXA 2EWSA 2VYPA 5LJVA 2W40A 3CHWA 4H5WA 1GLCG 3QBWA 5AQTA 5AZJB 3UB5A 3AARA 3A8YA 1QQMA 2IVOA 3HTVA 3R6MA 4J8FA 3W3DA 4B1XB 5BPLA 2GELA 2QWPA 1S22A 2E8AA 1HKCA 4FSVA 5BN9A 3ZEUA 5AQZA 2E88A 3ZX2A 1QZ5A 1X3MA 3FZFA 1KAXA 2FLOA 3JXUA 3HSCA 3MMVA 4QS9A 3MDQA 4BRCA 2A41A 3WXIA 3ULEB 5BREA 3GDQA 4BVOA 5AQHA 3J8AA 3KZBA 4BVPA 3H46O 2GWKA 5BN8A 4H03B 2QWRA 3ULEA 2YI1A 4ISEA 4CZGA 3DXKB 3H1QA 2IVNA 3LM2A 2HF4A 4BRKA 2E2OA 3HBTA 4A61A 2QWOA 4PKHA 4B1WB 1NGJA 4BR2A 3D7EO 3DJCA 2D0OA 2Q97A 4BC5A 4BRAA 3VEVA 3W0LA 4C23A 1BOTO 1NGEA 5AR0A 4FWMA 3WEEA 1BDGA 1GLBG 2E1ZA 5BRHA 3HM8A 2V52B 2NLXA 3MN7A 4H5VA 2P9LA 4K42A 1TUUA 1JCEA 2YHWA 4H5RA 4O5FA 4BG8A 4H5TA 1ATNA 4PKGA 3D2EB 5F1XA 3OHRA 3L6QA 3VEYA 2P9NB 5FPMA 1MA9B 4FWOA 3RSEA 1OKJA 1MWMA 3CJ9A 5LY3A 5KPZA 1G99A 1NGFA 3M6GA 4QS7A 3D2FB 5JLFA 5AQOA 1JCGA 5AFUA 3GE1A 4DCHA 1XQSC 2AA4A 2P9SB 2D1KA 1D4XA 4BREA 2FXUA 1NLVA 1IG8A 3ZETA 2E2QA 2IIRA 4EHUA 3QMLA 2PAVA 5B8HA 2IVPA 1Q18A 4IO8A 4O8KA 4Y0WA 4FWLA 4XH4A 3CJ1A 4I6MB 4CZEA 4ISGA 3UKUA 4MLHA 3BP8A 4B1UB 4FWPA 3WQTA 4KBOA 4JHDB 4EIAA 2GTDA 2ZGZA 3FR0A 5AQLA 2QWLA 3BEXA 1CZAN 1HLUA 1NGAA 4BRLA 5EXWA 4FPAA 4BQLA 5FPEA 5KPRA 5E26A 3MK6A 2KHOA 4B9QA 1T6DA 4CZLA 5KQDA 1HKGA 2HF3A 4XEIA 1YUWA 3CJCA 3FE1A 4DHYA 3EL2A 2ASMA 1E4GT 2Q0UA 3VEZA 1ATRA 3U4LA 4BRQA 2BTFA 3IFRA 1C0FA 3ZEUB 5I9EB 3ATVA 1HUXA 4BRHA 4WQ4C 3CETA 3M3ZA 4XH5A 4YDUC 3G25A 3TU5A 2FF6A 4CBXA 1HX1A 1RFQA 4M7XA 3LDOA 5AQQA 3UKRA 4B1VA 3ATUA 3KHYA 3O08A 4IJAA 3EZWA 5F2RA 1HJOA 1GLDG 2D0PA 2FF3B 1V4SA 1U6ZA 2V51B 1TUYA 2BUPA 3S41A 2AP1A 3WQUA 4BC2A 3FGUA 4CZIA 3H1VX 2Q36A 4B1ZA 3VGKA 4NB4A 5F0XA 4WYBA 4BR0A 5KQ8A 4H0YB 3C0BA 3CQXA 4CJ7A 5AQGA 4JNEA 4QS8A 1NGCA 3U8XA 3C7NA 4CZMA 3F9MA 1SZ2A 1BWFO 3QDKA 2H3GX 3UE5A 3A5OC 4H0TB 3WEEB 4BC4A 3O1BA 4BRNA 1U2VA 3VEWA 4M63C 4RTFD 4H0VB 4EHTA 5JICA 4H0XB 1T44A 2P9LB 3MN6A 2GEMA 3VERA 1NGBA 3A0IX 4DB3A 2PBDA 1K8KA 3DWLA 2E2PA 2P9UA 2A42A 3SJHA 5JLHA 2YHYA 3SMPA 4Z94A 3RSEB 2GWJA 5AQWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DRRA 1W97L 2FSJA 4OGCA 4MFBA 3OYHA 3FLCO 2DTUA 1DTQA 4IXCA 3V9WA 3N4PA 4JI0K 2KW4A 5LJWA 4K43A 2QWMA 4WE1A 3VQEA 1NMDA 3MEGA 4B9NA 1C0TA 4JI4K 1RTDA 3TPQA 4K0KK 3FZLA 3KLFA 3QEIA 3G0ZA 4BROA 4TSXA 1TL3A 2A6AA 1QQNA 2X78A 2Q31A 4M7YA 1WSFA 1VRTA 2OTJN 1J6ZA 3ALYA 3AAPA 4FL9A 4CZKA 4N5SA 4DTJA 3THYA 1TKTA 3UKUB 4CESA 2UXDK 4Z4CA 4CJKA 3LPUA 4KHUA 3U3YA 1NNEA 3ZSXA 4LH4A 4FJXA 4AH9A 1EQYA 4OPHA 4BC3A 1N6QA 3HOTA 4Z4EA 1OVYA 3OYKA 3OYMA 4ID5A 5J2NA 1GLFO 2VWBA 2HBKA 2UXCK 4IFYA 3D6RA 4H0OA 3HVRA 3OYIA 1R59O 2OANA 1JLQA 2NRHA 3NFAA 3VF6A 2G8KA 1ASWA 4DF8A 4JAXA 4OX9K 2JWLA 3PX6A 3MWTA 1BA0A 3L4QA 3MAQA 2DY4A 4X62K 4B3RK 3ENBA 2PZSA 4DV6K 4CFBA 2G8FA 4A62A 1E4FT 4BRIA 5AQFA 4EAHD 3UKRB 3VF2A 3VESA 1Y64A 3SUNA 4PL8A 1K9MO 1HYVA 3EKUA 1D8YA 1HNIA 4OPJA 3ZX0A 1J5EK 4JKCA 2ZD1A 3B6PA 1RTIA 3SLCA 4KH4A 4CJQA 4K8XA 4FO0A 1YAGA 5M1OA 1NG9A 1RNHA 2VGMA 4UQGA 2Z1IA 3AVJA 3G10A 3QEWA 4FM2A 1ESVA 1TKXA 4C8KA 3LP2A 5EVZA 4CGHA 1QE1A 4YDUA 1VSLA 2A3ZA 2CGKA 1LCUA 4DQ8A 1VQPN 5AQSA 4AM7A 3ZCMA 4N76A 4FJHA 5CZ2A 1WNSA 2IGIA 2D4WA 4FW2A 4F3OA 1CZ9A 2DPNA 4WFAL 1ZBUA 4KI6A 1NJIO 1SKRA 4FJKA 5CE3A 4LF4K 3J7YP 3CF5L 3DXKA 2KQ2A 1GLEG 4F3TA 1NGDA 1SAZA 4JI2K 1VQ7N 4MLEA 3LANA 2YCHA 4F9OA 1UOCA 4JKFA 2WC9A 1LW2A 5HL7L 3AGKA 3O4WA 3ZSWA 3QBXA 5BRFA 1JLEA 1U49A 3THYB 2KLAA 3DLRA 4FOIA 1HPMA 2HSTA 1S3XA 1X3NA 4ILGB 4BR5A 3K58A 2FSNA 3R8EA 3MEDA 4RG8A 1ZBSA 5FPNA 4CGGA 4YOUA 2YJFA 2P9NA 4WQ5A 3AVCA 3C95A 3CJAA 4B3OA 4G9ZA 3IMXA 4MO5A 4BRPA 1WB9A 5HP1A 3CFOA 2QWNA 1QZ6A 1VQMN 1BUPA 2HNZA 2P9SA 1A5VA 1P8ZA 1IKVA 3T1AA 2JLEA 3AVFA 3MN9A 1WBDA 5FRMA 1Q9YA 1ATSA 3OTOK 3KLGA 3M8PA 4FZZA 4I6MA 2XY5A 2YJEA 2W41A 1Q81O 1NKEA 3AO4A 1WLJA 3EE9A 2VCPA 4H4OA 3BF1A 5AQKA 3ZSZA 4FLTA 4JKBA 3O9SA 3WUHA 2O8EA 4K8ZA 1HYZA 3QERA 4KHPK 3LDQA 1ZXOA 4DTUA 2HMPA 3C6TA 4CK1A 3CCRN 4XIUA 3MXIA 3HVTA 1RTJA 1F21A 5AQTA 3MXMA 3AARA 2OZMA 5MLCQ 1LWCA 1NK7A 3PUFA 1TGOA 1QQMA 4LFAK 3AVMA 2VQFK 1VAZA 4GV6A 4LY7A 4G1QA 4B1XB 4HTUA 1Z25A 2ITGA 4CEDA 3OS2A 3NH2A 3PIOL 2P5GA 1HKCA 4FSVA 2D5RA 4E7IA 5IT9O 5AQZA 3ZX2A 1X3MA 4DTXA 3MX5A 2O4IA 1JL1A 3JXUA 3HSCA 3MMVA 4QS9A 5LMUK 2ZJRL 1ITGA 3V1OA 3HRGA 3H46O 3CCLN 3OJUA 2YI1A 5DK5A 4W5NA 1KVAA 3DXKB 3NGYA 4CJPA 4L8RB 1XHXA 3AA2A 1QVGM 1NJYA 2X6NA 5CYQA 4PKHA 4NLBA 4B1WB 1NGJA 1KLMA 4DLGA 1RBSA 3QETA 5FRNA 3VEVA 1NJZA 4FWMA 4LSNA 2OA8A 2UUBK 3WEEA 1A5WA 3CQ8A 4DQRA 3R1XA 3HM8A 3LZJA 2NLXA 3MN7A 1TUUA 4BY9C 5C42A 3SPYA 4BG8A 4M41A 3OHRA 4A5AA 2HVHA 3VEYA 4CJFA 2P9NB 5FPMA 1TKDA 3CJ9A 1UAXA 4DUYK 5M1NA 1G99A 3BY5A 1O1WA 5JLFA 4KTQA 5AQOA 3G6EN 5AFUA 1S9EA 2X6SA 3PSFA 1RDCA 1XQSC 2AA4A 2P9SB 4JKEA 4YORA 1QSSA 4BREA 1VSDA 1IG8A 1WAJA 2IIRA 3J7ZO 4N47A 5B8HA 4I7FA 2W42A 4IO8A 1FK9A 3WNFA 1TL1A 1RBTA 4I6MB 4M3RA 3AO5A 4LF7K 3DOKA 3NF9A 3BP8A 2O8EB 5M1FA 3K0SA 3KIOA 3SAFA 4FM1A 3BEXA 3V81A 1CZAN 2G8WA 1NGAA 1X1PA 4BRLA 4JKHA 5FPEA 3HJFA 5C2FA 3TARA 4CF2A 3OBYA 4OJRA 4GW6A 1UWBA 3ZT4A 4B9QA 4CHPA 4CZLA 3I0RA 1HKGA 3PX4A 2G8VA 4XEIA 2RHKA 4E7JA 3EYZA 4KO0A 3CCSN 3CJCA 3FE1A 4DHYA 3EL2A 1KSPA 2ZE2A 4PY5A 3S3NA 3K5OA 3KTQA 2Q0UA 3VEZA 3HXMA 1C0FA 4EZ9A 4IOAL 3C6HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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