3W0LA

The crystal structure of xenopus glucokinase and glucokinase regulatory protein complex
Total Genus 149
50100150200250300350400020406080100120140
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
449
structure length
426
Chain Sequence
QNEVDQILSEFHLQEEDLHVLMCRMQAEMERGLHLETNEEASVKMLPTYVRSTPDGSEVGDFLALDLGGTNFRVMLVKVGEDLEGQWKVETKHKMYSIPVDAMTGTAEMLFDYIAECISDYLDQQNMKHKKLPLGFTFSFPVRNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHHCEVGLIVGTGCNACYMEEMSNVELVEGEEGRMCVNTEWGAFGDTGELEDFRLEYDRVVDEASLNPGQQLYEKMIGGKYMGELVRLVLIKMVNENLLFGGESSEKLKTRGAFETQFVSQIEADTSDFKQTLNILRTLGVQATIGDCHAVRLACESVSTRAAIMCSAGLAGILNRMRQSRREELLRITVGVDGSVYKLHPSFKDKFHATVLKLTSGCEITFIQSEEGSGRGAALISAVAYKMAV

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH2 (20-38)TI1 (13-16)TI2 (14-17)S7 (223-230)3H1 (231-233)TIV1 (39-42)AH12 (354-390)TI4 (42-45)TIV5 (219-222)S6 (213-219)TI5 (43-46)TVIII1 (46-49)S1 (51-57)EMPTYTI6 (58-61)S3 (76-86)AH5 (172-185)TIV2 (59-62)TII1 (63-66)TIV3 (73-76)S2 (67-73)S5 (139-142)S4 (92-102)TI7 (87-90)AH3 (105-109)AH13 (404-408)AH14 (410-424)TI9 (191-194)TIV8 (257-260)TI15 (259-262)TII2 (252-255)TI12 (249-252)TI13 (250-253)TIV7 (235-238)S8 (243-247)TI14 (254-257)AH11 (339-348)TIV9 (260-263)AH9 (290-305)AH7 (265-273)TIV12 (287-290)TIV10 (274-277)AH8 (282-286)TIV11 (278-281)AH10 (325-332)TII4 (319-322)TI17 (316-319)TI'2 (309-312)TIV13 (314-317)TI16 (315-318)S9 (395-402)TVIII3 (392-395)AH6 (198-208)TI8 (132-135)AH4 (112-130)TI11 (234-237)TII3 (276-279)TI'1 (308-311)TI18 (335-338)TII5 (424-427)AH1 (6-13)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Xenopus laevis
publication title Molecular basis for the role of glucokinase regulatory protein as the allosteric switch for glucokinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 149
structure length 426
sequence length 449
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3w0lA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3w0lA01
3CHWA 4WQ4A 3QFPA 3LM9A 3VERA 2KHOA 3W3DA 4XEIA 3VENA 4JAXA 3H3NO 1BA1A 1HPMA 1NGHA 1WUAA 4B1WB 3WXJA 1X3MA 2P9SA 1K8KB 2Q97A 4BVOA 4FWMA 4L3QA 3R9PA 4BRAA 3WEEA 3BUZB 1TUYA 2E88A 2OANA 4BR7A 2I7PA 4BRHA 3A5LC 1C0GA 2ASOA 4B1ZA 1Z6RA 1GLAG 3WT0A 3SLCA 4YDUA 4IWVA 4BR4A 2YHXA 2CGLA 4DCHA 1T6CA 3WXLA 5AQUA 1S3XA 2CH5A 5AZIA 1U2VB 4FWSA 3CJ7A 4RTFD 4WQ4C 1E4GT 4ISFA 3BEXA 3CQXA 1ZBSA 3O1WA 3DJCA 4CZLA 1D4XA 4QS9A 4ISGA 5AQOA 2E1YA 4DB3A 2D0OA 4IJNA 3LDLA 1IJJA 3CJ9A 3EN9A 2QWOA 1MA9B 4BRQA 2QW9A 2W41A 5AFUH 3SMSA 3H1QA 2P9KA 2P9PB 3QB0A 4BRNA 5LY3A 2YJFA 4H5VA 3WXKA 4H5RA 3W0LA 4YDUC 3EL2A 5FPDA 1HLUA 5AR0A 2VWBA 3VEOA 2E2OA 3FZLA 3O4WA 5E84A 3AAQA 1HKCA 3VEWA 4CBWA 5JLFA 3LDPA 4CI6A 3EZWA 4CZHA 2QWRA 3KHYA 3DAWA 3VEVA 1BG3A 1DKGD 3CJAA 5AQTA 1GLEG 1NMDA 4E1JA 3VF6A 1SQKA 3VPZA 1ESVA 3S41A 2V52B 3I8BA 4JD2B 3FGUA 1GLDG 3AY9A 3P4IA 3ATUA 3FR0A 3SK3A 1TYQA 4CZJA 4NB4A 3VOVA 2D0PA 2FLOA 3FZFA 5I9EB 3A5OC 1ATSA 1KAXA 4AM6A 4BC4A 1Q18A 3CETA 2FSJA 3WQTA 1Y64A 5BPNA 1NGEA 2P9IB 3DXKB 3J8AA 2QXLA 1U6ZA 3VETA 3C7NA 1NGBA 5BN9A 5F1XA 2FSNA 4H5TA 4IXCA 3HTVA 2GTDA 2V51B 5EOYA 2E2QA 1KAZA 4PL7A 4FWRA 3ENOA 4MO4A 1XQSC 3FZHA 2ASPA 3VEYA 3UKRA 3H1VX 3QBXA 1MDUB 5AQGA 1ATRA 3FFKB 3D2EB 3GBTA 4BQZA 3BP8A 1NGDA 3L6QA 4RWTA 3ZEUA 1MWKA 3O8MA 2YHWA 2E1ZA 3O08A 1RFQA 3IUCA 4BGAA 3VEZA 3VF4A 1J6ZA 3GDQA 4JHDB 2I7NA 1JCFA 2E20A 1T6DA 1IG8A 4I6MA 3H3OB 5AQJA 3FE1A 1XUPO 1BOTO 2VCPA 4O8KA 5JICA 4CBXA 3HZ6A 5AQNA 1G99A 3IMXA 4FO0A 3C7NB 5AZJA 5LJWA 1YUWA 3HI0A 3VGLA 3ZETA 3ID8A 4BRDA 4CD1A 5AQMA 2J4RA 3D2FA 1SZ2A 3BF1A 1NGFA 1KAYA 2IVPA 2A6AA 4QS8A 2QWPA 4H0VB 5AQLA 2P9LA 1LOTB 3DXMB 4WQ5A 2E2PA 2FSKA 1P8ZA 2CGJA 5AQIA 5JMVA 2P9NA 2P9UB 3H46O 4O5FA 3U9DA 3CERA 5BREA 3KVGA 1QQNA 4BR9A 2WUSA 3A0IX 3O5BA 4BRCA 3VGMA 3MN6A 1WOQA 4BR0A 4H0OA 4JNEA 4CZIA 2NZTA 2P9SB 1QZ6A 1QQMA 2E8AA 3JXUA 3U8XA 5AQXA 2EWSA 5AQZA 3H45C 1BU6O 4JN4A 1ZXOA 4FL9A 3WEEB 3WUHA 3L4IA 4BQLA 2YCHA 1KXPA 1NGJA 3D7EO 5AQSA 1TUUA 2NRHA 4PL8A 3F9MA 2YHYA 2ASMA 4FWPA 4EFHA 1QZ5A 4WQ5C 4H0YB 5AQKA 3MMVA 4CJ7A 3CQYA 1NGGA 4B1UB 2NLXA 2QWQA 3UKUA 3BF3A 5BR9A 1LCUA 5AZIB 2PBDA 5FPEA 2GEMA 5EX5A 2QM1A 3RSEA 2ZGYA 4B9QA 1Z05A 3ENHA 3ZX2A 4BRFA 5AQRA 4XH4A 1SAZA 3GOIA 2YI1A 3QDKA 1MWMA 1GLCG 2AA4A 2HF4A 1BA0A 3O80A 4RCHA 4H5NA 4HTLA 4H0TB 1OKJA 4CBUA 1HKBA 3LDOA 4K25A 3ULEA 4GY2B 2Q36A 1QHAA 4H0PA 5AQWA 4CD3A 2Q1NA 1HKGA 4EHUA 2P9KB 3AARA 5TKYA 3LDQA 2BTFA 2QWNA 5ADXA 3EKSA 4CZEA 4M7YA 4GNIA 2ZWHA 2E2NA 2CGKA 4A2BA 2F9TA 3IDHA 4PKIA 5FPMA 5LJVA 3MCPA 3CI5A 1X3NA 4FPAA 1K8KA 4FOIA 1GLBG 5E26A 3GG4A 1BWFO 3UE5A 1GLJO 2IIRA 3I33A 5AQQA 3LM2A 4PKGA 4PKHA 4BREA 3A5NC 2QWMA 4Z94A 1HJOA 3HBTA 5EVZA 1ZC6A 5BRDA 1H1VA 2F9WA 5BN8A 4K41A 1TYQB 3GL1A 4HWIA 1CZAN 1U2VA 5EY4A 2V7YA 1GLFO 2QWLA 1NGIA 1ATNA 2AP1A 1X9JA 3TU5A 2Q31A 4FWNA 2HOEA 1GLLO 4FWLA 2GUPA 5KPRA 4QS7A 4A61A 3OHRA 4NO7A 1BO5O 4BC5A 2Q2RA 4CZKA 4A62A 5AQYA 5BPMA 3DWLA 1EQYA 4BRMA 2A5XA 3VF2A 2GWKA 2P9PA 4M63C 3R8EA 3FZMA 5ADXH 4B1YB 2FF6A 4ISEA 2Q0UA 2D4WA 4BRIA 4BR5A 1DGKN 5FPNA 1RGIA 4EHTA 4FPBA 1DEJA 3IFRA 4EIAA 3HSCA 2UYTA 3MN9A 4CZFA 1C0FA 2CH6A 3MK6A 3GE1A 3UKRB 3ZX3A 4IO8A 2ITMA 3AAPA 5CE3A 3G25A 3M6GA 4FWKA 4MLEA 4MO5A 5F2RA 3ZEUB 4JD2A 3CJBA 4J8FA 1NGAA 5KPZA 2ZGZA 2HF3A 1NBWA 1JCEA 1HUXA 3WXIA 4A2AA 4I6MB 2DPNA 1YVNA 2A3ZA 5ELZA 3M1FA 4B1VA 4BROA 4XH5A 5AQVA 2V7ZA 4DHYA 5B8HA 4K42A 1QQOA 2H3GX 2FF3B 4MLHA 2GELA 3ZX0A 4BG8A 1NGCA 4KBOA 4AM7A 4BC2A 3SJHA 4XH1A 5AZJB 3LDNA 2P9IA 3A8YA 5EXWA 3DXKA 3ZETB 1R59O 3HM8A 2D1KA 2BUPA 4BRGA 4C23A 1NM1A 1HX1A 3D2FB 4BVPA 3FLCO 2GWJA 3JS6A 3B8AX 4H5WA 2P9LB 1NWKA 3U9ZA 3ATVA 2PAVA 3O1BA 4K43A 2IVOA 5BRFA 2FXUA 1JCGA 3WQUA 2P9NB 2W40A 4BG9A 3C0BA 1XC3A 2YJEA 3SMPA 5AQPA 3D2EA 5KQ8A 2A41A 4FSVA 4M7XA 1S22A 3O6WA 1RDWX 1V4TA 5AQFA 3U4LA 3QICA 3MN7A 4BRKA 2Q0RA 3EKUA 4BC3A 2IVNA 3TPQA 4JHDA 1YAGA 2HMPA 4FOEA 3L0QA 3VEXA 3QFUA 5AQHA 5KQDA 5KPTA 3R6MA 1BUPA 3H6EA 2A40A 3M3ZA 5BRHA 4BGBA 4B1XB 1YXQA 4BRPA 4EAHD 3UB5A 4IZ9A 4FWOA 5JLHA 3UKUB 3EO3A 3RSEB 3CJ1A 2A42A 3QBWA 3MDQA 3CJCA 4DQ8A 2ZF5O 1BDGA 5BPLA 1NLVA 4CZMA 4BR2A 4CZGA 4Y0WA 4LC9B 3CIPA 4WYBA 3MN5A 4H0XB 3VESA 5F0XA 3FZKA 1T44A 3DXMA 3KZBA 2VYPA 4H03B 5AFUA 3QMLA 3ULEB 4F9OA 1E4FT 2P9UA 3VGKA 4IJAA 3A5MC 3LL3A 4BRLA 4FWQA 1V4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CHWA 3M8QA 3VENA 2YKMA 1VSLA 3RTVA 4J2BA 4CECA 4JKBA 4W5OA 3OS2A 1GOAA 1ZBLA 3WXMB 3AA3A 4B9NA 4O0IA 4K8XA 2I7PA 3T69A 3A5LC 1C0GA 3CQ8A 3WT0A 4YDUA 2YNIA 4IWVA 4BR4A 2YHXA 2CGLA 1T6CA 3NGZA 4LY7A 3L2WA 1Q81O 3PIOL 4CEFA 1TKDA 1S3XA 5AZIA 4FWSA 4RTFD 4E0DA 4CJWA 3CQXA 3O1WA 1BHLA 3KKRA 2HW3A 1B9DA 1RDCA 2UUBK 1FJGK 3HM9A 4MDBA 2VGMA 3AV9A 5AFUH 3SMSA 2W42A 3OYDA 3B6PA 1OVYA 3G4SN 1Z26A 3DLKA 4H5RA 3SQ4A 1Y97A 3OYGA 2VWBA 3VEOA 3ZSWA 1L3VA 1TKZA 1VQ7N 3HL8A 1HKCA 4W5NA 5JVGL 4AHVA 3CCLN 4IFEA 2QWRA 3SQ2A 4DUZK 2G8FA 4GKJK 4ILHA 5AQTA 1LWCA 1SQKA 3VF6A 4M3WA 4Q0BA 2V52B 4JI0K 2X74A 4WF9L 4CF8A 1YJWN 3QO9A 3OYCA 2Z1GA 1ZBFA 4BWMA 1D9DA 4NB4A 1QVGM 3WNFA 3RMBA 1JLBA 1VAZA 2FLOA 1SL2A 3FZFA 3K58A 1DTQA 4N41A 3MWPA 1IKWA 4CEBA 2XRIA 3DXKB 1WSHA 3ENBA 5HOOA 4K8ZA 1NGBA 1O1WA 2B6AA 1VRTA 2ZD1A 5JS2A 3K2PA 4I2PA 3KIOA 1YIJN 1NK9A 1RTHA 1KRPA 2YKNA 3CCRN 4B9UA 1IO2A 4B8AB 3P83D 3J7ZO 3H1VX 3QBXA 5AQGA 3KWGA 4U7BA 5LL6Z 4DR2K 1QTMA 5C42A 2QEXN 4BQZA 3BP8A 4CIGA 4DSFA 4ZHRA 2O8DA 4YNQA 2OZMA 4GMJB 3GDQA 4LSNA 4CEAA 3CPEA 1R0AA 1NJYA 4CESA 3P39A 2ZJPL 1XUPO 1VSIA 2VCPA 3OYAA 2ZJQL 4KV8A 1N32K 5AZJA 3P31A 4IOAL 5LMUK 2OPQA 1S72N 3MECA 1S1TA 1S1UA 5AQMA 2J4RA 1HRHA 1SZ2A 1KAYA 2A6AA 1W0HA 4H0VB 1I3AA 1SUQA 2VWJA 4DUYK 4DV6K 1JXBA 4WQ5A 2FSKA 5JMVA 1HR0K 3TARA 4CF2A 4Z0UA 3KVGA 1VK0A 4C8LA 3O5BA 3VGMA 3MN6A 4X65K 4ID1A 1WOQA 3N4PA 4CFAA 4WFNL 1IKVA 3AO4A 4CZIA 1BIUA 2AJQA 3SNNA 3OYFA 2GBZA 3JXUA 1WSIA 3H45C 3NVMA 3WUHA 4KHSA 2VG7A 5HP1A 3NFAA 2NRHA 1SS6A 1YT3A 4KHYA 4H0YB 5AQKA 3NCIA 2KTQA 4F8RA 3AVJA 3DLBA 2QWQA 5BR9A 1LCUA 5FPEA 4DV5K 3AVFA 4CGDA 5AQRA 2NUBA 2B4JA 3LP2A 3GOIA 1MWMA 1VSEA 2QXFA 3N4QA 4JK7A 4H5NA 4HTLA 5M1PA 4CBUA 3LDOA 3HO1A 3J7YP 4H0PA 4CD3A 4CF9A 2Q1NA 2KZMA 3KLGA 3VQ7A 3O9UA 2BTFA 2ZM6K 3EKSA 4CZEA 3TI0A 2CGKA 2HNYA 2QK9A 4C8MA 5LJVA 1HNIA 5FPMA 3CI5A 4BE1A 3L2UA 3V9SA 3C95A 3MEDA 1D8YA 3EY1A 5E26A 4W5RA 1BWFO 3ZT3A 1CZBA 3VMFB 4EZ9A 3DLEA 4ELVA 5HLFA 3MEGA 1Q9XA 1HJOA 3H08A 3HBTA 3LDSA 3L3VA 1ZC6A 2HHUA 3L2QA 3OYNA 4K41A 1CZAN 5GAHP 5EY4A 1FK9A 2V7YA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CHW A;  3M8Q A;  3VEN A;  2YKM A;  1VSL A;  3RTV A;  4J2B A;  4CEC A;  4JKB A;  4W5O A;  3OS2 A;  1GOA A;  1ZBL A;  3WXM B;  3AA3 A;  4B9N A;  4O0I A;  4K8X A;  2I7P A;  3T69 A;  3A5L C;  1C0G A;  3CQ8 A;  3WT0 A;  4YDU A;  2YNI A;  4IWV A;  4BR4 A;  2YHX A;  2CGL A;  1T6C A;  3NGZ A;  4LY7 A;  3L2W A;  1Q81 O;  3PIO L;  4CEF A;  1TKD A;  1S3X A;  5AZI A;  4FWS A;  4RTF D;  4E0D A;  4CJW A;  3CQX A;  3O1W A;  1BHL A;  3KKR A;  2HW3 A;  1B9D A;  1RDC A;  2UUB K;  1FJG K;  3HM9 A;  4MDB A;  2VGM A;  3AV9 A;  5AFU H;  3SMS A;  2W42 A;  3OYD A;  3B6P A;  1OVY A;  3G4S N;  1Z26 A;  3DLK A;  4H5R A;  3SQ4 A;  1Y97 A;  3OYG A;  2VWB A;  3VEO A;  3ZSW A;  1L3V A;  1TKZ A;  1VQ7 N;  3HL8 A;  1HKC A;  4W5N A;  5JVG L;  4AHV A;  3CCL N;  4IFE A;  2QWR A;  3SQ2 A;  4DUZ K;  2G8F A;  4GKJ K;  4ILH A;  5AQT A;  1LWC A;  1SQK A;  3VF6 A;  4M3W A;  4Q0B A;  2V52 B;  4JI0 K;  2X74 A;  4WF9 L;  4CF8 A;  1YJW N;  3QO9 A;  3OYC A;  2Z1G A;  1ZBF A;  4BWM A;  1D9D A;  4NB4 A;  1QVG M;  3WNF A;  3RMB A;  1JLB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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