3WQTA

Staphylococcus aureus ftsa complexed with amppnp
Total Genus 121
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
374
structure length
370
Chain Sequence
HYYVSIDIGSSSVKTIVGEKFHNGINVIGTGQTYTSGIKNGLIDDFDIARQAIKDTIKKASIASGVDIKEVFLKLPIIGTEVYDESNEIDFYEDTEINGSHIEKVLEGIREQETEVINVFPIRFIVDKENEVSDPKELIARHSLKVEAGVIAIQKSILINMIKCVEACGVDVLDVYSDAYNYGSILTATEKELGACVIDIGEDVTQVAFYERGELVDADSIEMAGRDITDDIAQGLNTSYETAEKVKHQYGHAFYDSASDQDIFTVEQVDSDETVQYTQKDLSDFIEARVEEIFFEVFDVLQDLGLTKVNGGFIVTGGSANLLGVKELLSDMVSEKVRIHTPSQMGIRKPEFSSAISTISSSIAFDELLD
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural genomics
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
publication title Crystal structure of FtsA from Staphylococcus aureus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein FtsA
total genus 121
structure length 370
sequence length 374
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-02-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02491 SHS2_FTSA SHS2 domain inserted in FTSA
A PF14450 FtsA Cell division protein FtsA
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wqtA02
1Z6RA 1GLCG 3ZETB 1BO5O 1C0FA 1T44A 3MMVA 3VETA 1E4GT 5LJVA 2IVNA 4B1UB 5FPNA 1BA0A 5ELZA 2F9TA 1GLFO 3MN6A 1K8KA 4CZIA 3VPZA 3M6GA 4E1JA 2IVPA 3VEXA 5KPTA 5BN9A 5F2RA 5AZIA 3TU5A 3UKUB 2E2QA 2ASMA 3C7NB 3H6EA 4RCHA 3M3ZA 4FO0A 3CETA 3KHYA 2QW9A 4BRKA 1ZC6A 1XUPO 4CBUA 3O80A 4FWRA 4ISFA 4O5FA 3JXUA 1GLDG 2DPNA 2YHXA 4RWTA 1JCFA 4IZ9A 4XH4A 2E8AA 4FWKA 3TPQA 2CGLA 2ZF5O 4BQLA 1E4FT 2AP1A 2CGKA 3H3OB 4B1VA 1MWMA 4BRGA 4BRPA 1YAGA 3GE1A 3VOVA 4Z94A 1ATRA 2P9NB 3SMPA 3BUZB 4IO8A 3VGMA 3IFRA 3FZHA 1KAXA 4DHYA 1NWKA 3G25A 2D0PA 2A41A 1NGDA 5AQOA 4A62A 4FWNA 2QM1A 1YUWA 1ATNA 3UKUA 5JICA 3AY9A 4H0VB 2VYPA 2QWRA 1KAYA 2E1YA 3A8YA 4JNEA 4CZFA 4CZKA 3J8AA 4FWQA 1LOTB 2QWLA 2ZWHA 3BF1A 3ZEUA 2GWKA 2A5XA 1Z05A 5BRFA 3H1QA 1LCUA 4BRDA 4LC9B 3SMSA 1SZ2A 5FPEA 3B8AX 3CJ1A 3CQXA 3VEYA 4FWLA 4CJ7A 5F1XA 4MLHA 4GY2B 4IWVA 3WEEB 2PBDA 1NGGA 1P8ZA 2CH5A 2V7YA 3FZFA 1NGIA 3JS6A 3ULEB 5BRHA 4L3QA 3CJBA 2D1KA 3L4IA 3RSEB 2NZTA 3LDNA 3HZ6A 2HF4A 1ATSA 1NM1A 4NO7A 4BRQA 2I7PA 3IDHA 2E1ZA 3QDKA 2P9SB 3FZKA 3FFKB 3H1VX 1K8KB 1U6ZA 3O4WA 1RDWX 3QBXA 4BRMA 2UYTA 3FZLA 1MA9B 4H5RA 4CBWA 4PL7A 1ZXOA 1ESVA 5AQUA 3SK3A 1MDUB 3H3NO 1ZBSA 3MN7A 4FOEA 4PKGA 2BUPA 2E88A 4IXCA 2P9UA 3ZX2A 4A2BA 1BDGA 3C0BA 4AM7A 2GELA 4CZLA 4EIAA 2IVOA 2FSJA 5E26A 1Q18A 1QQOA 3VF2A 3CJ9A 1G99A 3ULEA 3LM9A 4B1XB 1WUAA 1H1VA 3D2EB 2AA4A 3LDQA 3MK6A 4XH5A 3RSEA 3GBTA 3VEVA 2YJFA 2GTDA 4DQ8A 5KPRA 5AQVA 4FOIA 4JHDA 1QHAA 4WQ5C 3CHWA 2P9SA 4H5TA 2VWBA 3MN9A 1YVNA 4CI6A 4BRAA 4BG8A 1EQYA 3GDQA 4C23A 2FXUA 1S3XA 1CZAN 5AZJB 3UKRA 2CH6A 3MDQA 5EVZA 4FPAA 2VCPA 1QZ6A 3AARA 3S41A 3EZWA 1X9JA 3ZEUB 5LJWA 4WYBA 3VGKA 4FWSA 1BWFO 4A61A 2P9KA 3D7EO 4H0TB 2NRHA 3QB0A 3O1BA 3D2EA 1Y64A 4BC3A 5AQKA 3LM2A 2HOEA 4MLEA 4H0PA 2E2OA 3CJ7A 5JMVA 1XC3A 1HPMA 4BR4A 3VEOA 3QBWA 3UB5A 4BC4A 3VEWA 3KVGA 3ATUA 2P9PA 3P4IA 3DWLA 1BOTO 2YJEA 2P9LB 1J6ZA 2WUSA 4MO5A 5AFUA 5AQYA 2GEMA 3CJCA 4KBOA 5E84A 4BG9A 4H5VA 4M7YA 3SLCA 3MCPA 3QFUA 3GG4A 5AZJA 4I6MA 2FSKA 1BG3A 4H0XB 2QWPA 3HTVA 2Q1NA 4GNIA 4BVPA 4DB3A 2BTFA 4FSVA 4BR9A 5BPMA 2QWQA 2YCHA 3A5MC 4CD1A 5KPZA 1HLUA 4BR7A 4BC5A 4WQ4A 5I9EB 2NLXA 1IG8A 4CZGA 3ENHA 1RGIA 5AFUH 4BGAA 5AQRA 5JLHA 3R9PA 2P9UB 1QQMA 5BRDA 3EO3A 4K43A 3HBTA 1JCGA 4BRHA 4B1WB 4Y0WA 3VERA 1NGAA 3EKSA 3SJHA 4DCHA 5BPNA 3WQTA 3HSCA 4FPBA 1X3MA 2P9LA 5AQGA 4HWIA 4JAXA 1HKBA 4RTFD 5FPMA 3W3DA 2YI1A 4JHDB 3I8BA 1WOQA 1BU6O 1NBWA 4BRFA 4H5WA 5BPLA 1JCEA 4HTLA 5AQFA 4B1YB 4YDUA 3U8XA 5BREA 4XH1A 4K42A 4EHUA 1S22A 3M1FA 3WXKA 4JD2A 3UKRB 4AM6A 1QZ5A 3ENOA 5AQIA 1T6DA 3VGLA 5EX5A 1HJOA 3VF4A 4H5NA 1HKCA 4BR2A 4BRNA 2P9KB 3LDLA 2D0OA 2PAVA 1T6CA 2P9IA 4J8FA 5ADXA 1DGKN 4B1ZA 3GL1A 2Q97A 1TUUA 1IJJA 3ATVA 5KQDA 2YHYA 4O8KA 4FWOA 3L6QA 2ZGZA 3WQUA 1NGCA 4PL8A 4K41A 2YHWA 5LY3A 3QICA 1GLBG 3A0IX 4BREA 1GLEG 5AQJA 1BUPA 3CERA 3QMLA 3O5BA 2Q31A 3O6WA 2P9PB 3CJAA 2E20A 2Q0RA 3H46O 1D4XA 5ADXH 1DEJA 4H03B 2QWOA 3U9DA 1NLVA 4CBXA 1HUXA 4I6MB 3A5OC 5EXWA 4PKHA 5JLFA 2A40A 3I33A 4BQZA 3L0QA 2F9WA 2EWSA 1HKGA 3CI5A 3IUCA 4BVOA 1GLAG 1V4TA 5AQPA 5AQSA 2J4RA 4JN4A 4WQ5A 3GOIA 2FSNA 2CGJA 3ZX3A 4FWMA 1TYQA 2ASOA 2FLOA 4K25A 3AAQA 3VF6A 2OANA 3ID8A 3IMXA 1R59O 4BR5A 1HX1A 3FLCO 5TKYA 3U4LA 4BC2A 4ISEA 2IIRA 5AQNA 3LDPA 1KXPA 1U2VA 4BRIA 4BR0A 2FF6A 1XQSC 3DXMA 1NGFA 1OKJA 3O8MA 3R6MA 2ITMA 2D4WA 2ASPA 2FF3B 2V7ZA 3CQYA 3ZETA 3DXKB 5BR9A 3EN9A 1RFQA 2KHOA 3A5NC 4ISGA 1MWKA 5AQMA 4WQ4C 2HMPA 5EY4A 2W40A 5AQQA 3F9MA 1SAZA 3FGUA 3LL3A 4FL9A 5AQXA 3WXIA 4H0YB 1QQNA 4PKIA 2HF3A 4BGBA 3FE1A 3ZX0A 4CZEA 4JD2B 3WXJA 4QS9A 3HM8A 5AQZA 2I7NA 5EOYA 3C7NA 5AQLA 4BROA 3VENA 3A5LC 1NGBA 3H45C 2P9IB 3WXLA 3DAWA 3W0LA 5AR0A 1DKGD 2QWNA 3BEXA 3CIPA 5B8HA 5AQHA 1NGJA 1TUYA 3VESA 1GLLO 4A2AA 4CZHA 1YXQA 1GLJO 3D2FB 3BF3A 3DXKA 2H3GX 4IJAA 4QS8A 4M7XA 4CZMA 2QWMA 4YDUC 4B9QA 3DJCA 4H0OA 3QFPA 2E2PA 3FZMA 3WT0A 2P9NA 2ZGYA 4NB4A 1NMDA 3EKUA 3EL2A 4CD3A 4EAHD 5KQ8A 1NGEA 1BA1A 1X3NA 4F9OA 2Q2RA 5CE3A 4BRCA 1C0GA 3AAPA 4MO4A 5AQWA 5BN8A 3UE5A 3O08A 2GUPA 3HI0A 4M63C 2W41A 3U9ZA 4FWPA 3WUHA 5AQTA 2V51B 3R8EA 4IJNA 2Q36A 3LDOA 3BP8A 1TYQB 5AZIB 2A42A 1NGHA 3MN5A 1KAZA 3VEZA 4EFHA 2V52B 2Q0UA 3D2FA 2A6AA 1V4SA 3O1WA 2GWJA 5F0XA 5FPDA 4XEIA 2E2NA 2A3ZA 3WEEA 1U2VB 4CZJA 2QXLA 4BRLA 4QS7A 3FR0A 4EHTA 1SQKA 3DXMB 3OHRA 3KZBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NDKA 3ZETB 1KLMA 1BO5O 1CXUA 3Q7CA 1T44A 4KRFA 1A5WA 5FPNA 4E7IA 3VN5A 4FJLA 4FJ5A 4F2RA 4CJTA 1K8KA 3OBYA 1E3MA 4AHSA 4E1JA 5I3UA 4BDZA 1XNRK 2QKKA 5AZIA 3BGRA 3KK2A 2E2QA 3H6EA 1BQNA 4FO0A 2QW9A 4OPJA 1VQ9N 4BRKA 1ZC6A 1KVBA 1I94K 3PIOL 4KHPK 2UUCK 2XRIA 1CXQA 3P5JA 4O5FA 3JXUA 2DPNA 4DU3A 1XMOK 2YHXA 4XH4A 3O4QA 4DSLA 1Q9XA 3HPOA 3O9QA 4OKKA 2AP1A 4RW7A 4CVNE 1MWMA 3I56N 1YAGA 4Z94A 1ATRA 3SMPA 3OY9A 3IFRA 1O13A 3K2PA 4DTJA 4A62A 2KW4A 1D8YA 3V81A 5I42A 4KTQA 3KWGA 4B9TA 3KLEA 3T1YK 5HLFA 3NH1A 1X9WA 3S3MA 1IBLK 1YIJN 3RVCA 2F7TA 3LP2A 3N4QA 4FWQA 4LF8K 2QXFA 3NF7A 3ZEUA 4CJUA 4E7HA 2XY8A 1Z05A 3LAKA 4FLWA 4X62K 3G6EN 3OYHA 4DV1K 1SZ2A 4KB1A 1I39A 4FWLA 2WFBA 4W5QA 1NGGA 1P8ZA 3AVNA 2CH5A 4JK8A 1TV6A 3ULEB 1X9SA 4L3QA 2OCEA 3L4IA 2FBYA 2NZTA 4JKCA 4Z0UA 3G0ZA 3HZ6A 1N5YA 4M3TA 5CZ1A 1NM1A 4BRQA 2PFUA 1RT1A 3Q7BA 3H1VX 3O4WA 5D3GA 4BRMA 1RBUA 1MA9B 4LD0A 1ZXOA 4GMJB 3SK3A 3CM5A 4CIFA 2DY4A 1MDUB 3F73A 3U3YA 4NYFA 3SPZA 3P1GA 3DLKA 2BUPA 2OPSA 2G8HA 3RMDA 2E88A 1VSFA 3NFAA 4IXCA 4JI3K 3G71N 1RDCA 1N33K 2FSJA 4YOTA 1EKEA 5HBMA 3VF2A 1Q86O 3LDQA 4XH5A 3RSEA 4CK3A 1TKZA 2YJFA 1NJZA 5T7BA 4OPKA 3OJUA 2BGGA 3AA3A 4A5BA 3TTFA 5C12A 3DLHA 3ISNC 4H5TA 4KH6A 5LL6Z 4CI6A 3HM9A 4OO1J 5FROA 4FJMA 5J2PA 1NJYA 1NK9A 1IV0A 3NAEA 2CH6A 3LWMA 1YT3A 3HVRA 3S41A 4JKDA 3EZWA 3VTHA 4DUZK 4DTUA 4GV6A 5LJWA 3VGKA 4CFDA 3LP0A 4A61A 4CHQA 1L3TA 4H0TB 5C15A 1Y97A 4LH4A 3O9UA 3VQ4A 1T8EA 3O1BA 1KC8O 3CYMA 2HOEA 4H0PA 1BGXT 2PYLA 4FZZA 3TSPA 2ZQBA 5JMVA 3LZJA 3SV4A 3HO1A 5JVGL 4BR4A 1GOAA 3B6OA 1QVFM 3ENBA 4I2PA 3UB5A 3HOSA 4BC4A 3CCJN 4DQPA 3P4IA 3T19A 4FJ8A 4M3UA 1J5OA 4JK7A 1J6ZA 4OKEA 3LPUA 3K0SA 2WUSA 3E66A 5E41A 4BG9A 1JXBA 4CEOA 4CJSA 3GG4A 1D9FA 3QIPA 2NRTA 3CD6N 4BVPA 4DB3A 4V19S 3TR8A 3FFIA 5KPZA 5C24A 4W5RA 2HBKA 3OYCA 2VQFK 2UU9K 1T3VA 4ICLA 3KK3A 2VQEK 4DSFA 2UUBK 4H4OA 3R9PA 2P9UB 1VQNN 1F21A 4K8ZA 2GUIA 3QEXA 4M45A 4DLEA 3SJHA 1BI4B 3VQ8A 3HSCA 1VQPN 4MDAA 5CZ2A 3HPHA 5FPMA 5SWMA 3KLGA 2YI1A 2Z1JA 3ZSVA 4CIEA 3PUFA 1JXEA 1UAXA 4DG1A 5BPLA 3DLLL 4IFYA 4DLGA 5TKWA 1XMQK 1GOCA 3VQQA 4JYAK 3C6TA 2PZSA 3MX5A 4K42A 4DFKA 4LF6K 2RN2A 4YOXA 1YF5L 3L2UA 3UKRB 1S1TA 3ENOA 2HHVA 3AA4A 4CEEA 5CR4A 3KLFA 3VGLA 2YHAA 3B6PA 1RT6A 2O8DA 4BR2A 1NOZA 1IKYA 4BRNA 2HHWA 4AF1A 4CGFA 3GL1A 2Q97A 4DV4K 3QESA 3ZSZA 3ATVA 4O8KA 4FK4A 1YJ9N 4PL8A 1NGCA 2A1SA 3J7YP 4M3WA 3QICA 4BREA 3QO9A 2P9PB 2E20A 5JVHL 5ADXH 4H03B 1ASWA 3V9WA 4CEAA 1TGOA 2YHBA 1U49A 4CBXA 1NLVA 1WSFA 4CCHA 4PKHA 4IKFA 1QSYA 1NKBA 2F9WA 2EWSA 4DSJA 1V4TA 5AQPA 3VQBA 4JKHA 2J4RA 1UA0A 3GOIA 3OJSA 4JRPA 2CGJA 3TAFA 4K25A 2HBMA 2O4GA 3A2FA 4KB0A 2OANA 3HSTB 3IMXA 1HX1A 5FDLA 5C10A 2IC3A 1NU0A 3HP9A 5AQNA 3LDPA 2O8FA 2O8EA 4BRIA 3EZ5A 5C42A 2XY6A 3ULDA 3I8DA 1OKJA 3R6MA 2D4WA 5CHIA 3MXMA 2G8IA 3ZETA 3OYLA 3DXKB 3CCEN 1RTIA 2P51A 4B3SK 5HOOA 5HRSA 3LL3A 4FL9A 3WXIA 4JKEA 3FE1A 3O3FA 4CZEA 4JD2B 5LMUK 1TKDA 3PO5A 4LFCK 5AQZA 3J7AP 5EOYA 1VQON 1J9AA 1VSJA 4JLHA 3THWB 1FJGK 4WE1A 3AVHA 5CYMA 4DFPA 4DTRA 4DFJA 1NGBA 5M1NA 3TABA 2FC0A 3PLAA 3WXLA 3W0LA 3CIPA 4N41A 4O4GA 1GLLO 3F2KA 4CZHA 3P38A 4IJAA 3CFRA 2JLEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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