3WQTA

Staphylococcus aureus ftsa complexed with amppnp
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
374
structure length
370
Chain Sequence
HYYVSIDIGSSSVKTIVGEKFHNGINVIGTGQTYTSGIKNGLIDDFDIARQAIKDTIKKASIASGVDIKEVFLKLPIIGTEVYDESNEIDFYEDTEINGSHIEKVLEGIREQETEVINVFPIRFIVDKENEVSDPKELIARHSLKVEAGVIAIQKSILINMIKCVEACGVDVLDVYSDAYNYGSILTATEKELGACVIDIGEDVTQVAFYERGELVDADSIEMAGRDITDDIAQGLNTSYETAEKVKHQYGHAFYDSASDQDIFTVEQVDSDETVQYTQKDLSDFIEARVEEIFFEVFDVLQDLGLTKVNGGFIVTGGSANLLGVKELLSDMVSEKVRIHTPSQMGIRKPEFSSAISTISSSIAFDELLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of FtsA from Staphylococcus aureus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein FtsA
molecule tags Structural genomics
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 121
structure length 370
sequence length 374
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-02-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02491 SHS2_FTSA SHS2 domain inserted in FTSA
A PF14450 FtsA Cell division protein FtsA
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wqtA02
5BPMA 1YXQA 3VF2A 4BRPA 4FWKA 3M1FA 2PAVA 1K8KA 1NM1A 4JD2B 4BVOA 3VEOA 4H5WA 4BG9A 2VYPA 3GDQA 4I6MB 3VF6A 3BF1A 1ZC6A 3O80A 3FZLA 1NGEA 3FZFA 3EKSA 3H46O 4FSVA 3U4LA 1H1VA 2UYTA 2YI1A 2PBDA 4FPBA 4H0PA 3FLCO 3CJ7A 1V4TA 4QS9A 5AQRA 4H03B 4WQ5A 4ISFA 2ZGZA 1T6CA 1V4SA 4B1ZA 5AQFA 3DXKA 4CZJA 3D2EA 3LDLA 1NGIA 3VEYA 1KXPA 2H3GX 4FO0A 2W40A 3EKUA 3CJBA 4BREA 4JNEA 2QWNA 4BC4A 3ZX3A 3L6QA 2V52B 3TU5A 2NZTA 2YJFA 3O8MA 3QBXA 1R59O 4BG8A 4WQ4A 1QQOA 2A5XA 2QM1A 3AARA 4PKGA 4B1YB 3ULEA 4BVPA 4FWQA 4RTFD 3ZETA 5ADXH 1HKGA 3ZX0A 2Q36A 2D1KA 5BN8A 2D0OA 4FWOA 3IDHA 1HLUA 4CZHA 2NRHA 4BROA 5BN9A 3VGKA 5FPMA 2P9PB 5KQ8A 2Q0RA 1JCFA 2P9LA 4EAHD 1E4GT 4JHDB 5BRDA 4O8KA 1XQSC 3QICA 3D2FA 5AQJA 1TUYA 2D0PA 4BRCA 5KPZA 2P9NA 4FWNA 2CH5A 1HX1A 5KPRA 3ZEUB 1TUUA 3FZKA 5AQHA 3QB0A 5EXWA 4B9QA 2BUPA 2GWKA 2GUPA 3BP8A 3HZ6A 5AZIB 1U2VA 3HM8A 2V7YA 2A6AA 3BF3A 2ZGYA 3FFKB 3A5MC 3VGMA 2FF6A 5AQYA 5AQKA 4FWLA 2GEMA 2QWMA 3ATUA 4NB4A 4K25A 2P9IB 1GLEG 4HWIA 3DJCA 4QS8A 3UB5A 4B1WB 4FL9A 1S3XA 3AY9A 3CQXA 3DXMA 3DAWA 2ZF5O 1JCGA 3TPQA 2P9KB 1NGGA 4PL7A 3IFRA 3WXLA 1OKJA 4CZFA 1SAZA 1ESVA 4H0VB 1LOTB 4BRQA 2YHXA 1KAYA 1XC3A 3VPZA 1KAZA 4XH5A 3MN9A 5I9EB 3VEVA 2P9UB 2GELA 2Q31A 3ENOA 5E84A 2F9TA 2Q1NA 4BC5A 1DKGD 1BA1A 3UKUA 5AQMA 2E2QA 3JXUA 3MN7A 2E2NA 1GLFO 1QHAA 1XUPO 4ISEA 4H0OA 1GLAG 5JLFA 5AQNA 3WT0A 3U9DA 1BU6O 2YHYA 3HBTA 4CJ7A 2CH6A 3KHYA 3QFUA 5AFUA 3EN9A 3H6EA 2DPNA 1MDUB 5FPDA 3FE1A 1DEJA 2P9SA 3I8BA 4GNIA 3FGUA 1NMDA 4K43A 2GWJA 1NGFA 4M7YA 4IZ9A 1NGJA 1E4FT 4BR7A 5EX5A 1ATNA 3SMSA 5JMVA 2HF3A 2YCHA 1YUWA 3CHWA 4BRMA 3CJ9A 3RSEA 2W41A 4H0TB 5KQDA 4O5FA 1GLCG 2P9KA 5AQUA 5KPTA 2QWOA 3C7NB 4AM6A 2NLXA 3I33A 1D4XA 4H0XB 4B1UB 1BOTO 1TYQA 4FWMA 3GBTA 3LDQA 5AR0A 4JAXA 5E26A 2E1YA 1LCUA 2FLOA 4WYBA 4IO8A 5FPNA 5AQSA 1DGKN 5BPLA 1BDGA 3HI0A 5AQVA 4XH4A 3HTVA 1HKCA 1P8ZA 1T6DA 3LDOA 4BC3A 1ATSA 4BR4A 4JD2A 4RCHA 2E20A 1IJJA 1NGHA 3IMXA 3VERA 1GLDG 1C0GA 4I6MA 3AAQA 3R6MA 4YDUC 5AZJB 5F0XA 2AA4A 3WXKA 3A0IX 3HSCA 5AQOA 3CETA 3U8XA 4A62A 5EVZA 5AQZA 1MA9B 3KVGA 3J8AA 3MN5A 3LL3A 1NGAA 4EFHA 4AM7A 3QFPA 4BRDA 3C0BA 1SZ2A 3H3OB 2WUSA 3LM2A 3MN6A 4BR9A 2ASMA 2QWLA 4CD1A 5LJVA 2CGLA 2E88A 4MO5A 1Z05A 3WXJA 4DCHA 5ELZA 3B8AX 2Q2RA 2Q0UA 3CQYA 4CZGA 2V51B 3OHRA 4BRHA 4FWPA 1RDWX 4MLEA 4CBWA 5EOYA 3WEEB 4K42A 3FZHA 3R8EA 3H3NO 4H5NA 4BRFA 4A2AA 2E2PA 5BR9A 5AQWA 3EL2A 2ZWHA 3UKRB 4BC2A 4B1XB 2EWSA 4BGBA 1EQYA 1ATRA 4FWSA 4IWVA 4M7XA 1NBWA 3VEWA 2IVNA 1K8KB 3VEXA 3A5NC 3SJHA 2E2OA 4PKIA 1MWMA 1Q18A 2ITMA 4BQZA 1ZXOA 1WOQA 4LC9B 3EZWA 4H5TA 2AP1A 4BRAA 5CE3A 4DB3A 2P9PA 3H1QA 3WQUA 5BRHA 2IVOA 4DQ8A 4ISGA 4BRGA 1CZAN 3MDQA 5TKYA 4JHDA 3CJCA 1NGBA 4IJNA 4YDUA 2IIRA 4CBUA 3M3ZA 3GE1A 3R9PA 4GY2B 3DXKB 4CZEA 3QBWA 2BTFA 3ZEUA 3FR0A 3A5OC 4CZLA 4RWTA 3MCPA 2F9WA 3GG4A 2A40A 2HMPA 3BUZB 1C0FA 3QDKA 4M63C 1YVNA 1Y64A 3WUHA 2FF3B 2YJEA 5AZIA 1HKBA 1G99A 2FSNA 2FSJA 3O1BA 4DHYA 3O6WA 1SQKA 3H1VX 2J4RA 4JN4A 4Y0WA 1BA0A 2P9IA 4BR5A 1RGIA 3ULEB 3VGLA 1QQMA 5AQXA 1NGCA 2QWRA 5JLHA 3A8YA 3CJ1A 3SMPA 4EHUA 2IVPA 2KHOA 3O1WA 3ZETB 4K41A 4XEIA 3VESA 5F1XA 3VETA 5ADXA 3LDPA 2I7PA 4C23A 2QWQA 3L4IA 3W0LA 5AQGA 3ATVA 3AAPA 4CZKA 2V7ZA 3H45C 2P9UA 4PKHA 5BRFA 4CZIA 2P9LB 5LJWA 2CGKA 4BR2A 3O08A 4FOIA 3D2FB 3SK3A 4E1JA 3P4IA 3F9MA 4MLHA 2P9NB 4H5RA 2E1ZA 1HUXA 1HPMA 2QW9A 1ZBSA 5AFUH 1RFQA 2CGJA 4J8FA 2A3ZA 4BRIA 1T44A 4BRLA 4XH1A 1U2VB 2VCPA 3EO3A 2ASOA 3A5LC 1QZ5A 2HF4A 2QXLA 4QS7A 3JS6A 1MWKA 1IG8A 3CI5A 4BRNA 5AQQA 3ID8A 3GL1A 1KAXA 1J6ZA 3CERA 5FPEA 4BR0A 1NGDA 4L3QA 3DXMB 1YAGA 5AQLA 3CIPA 5AQIA 1NLVA 3C7NA 5LY3A 4NO7A 3GOIA 3CJAA 1BG3A 4CBXA 4CZMA 3MK6A 5AQPA 4BGAA 4FOEA 4IJAA 2FSKA 1U6ZA 3KZBA 3FZMA 1BWFO 3UE5A 2YHWA 1X3NA 4FPAA 5AQTA 1GLBG 2VWBA 1X3MA 3S41A 3UKUB 2I7NA 3VF4A 4FWRA 5JICA 1WUAA 4PL8A 3MMVA 3ENHA 3LDNA 4IXCA 4WQ5C 5AZJA 5BREA 1S22A 2HOEA 1QQNA 2OANA 2Q97A 3VENA 3SLCA 3BEXA 4A61A 3M6GA 4H5VA 4KBOA 3VEZA 5BPNA 3DWLA 3L0QA 3LM9A 4EIAA 2ASPA 3W3DA 4F9OA 3VOVA 4EHTA 1BUPA 2P9SB 5EY4A 4Z94A 3ZX2A 1QZ6A 3IUCA 4HTLA 5F2RA 3G25A 3U9ZA 4B1VA 2QWPA 3WQTA 1Z6RA 2E8AA 1NWKA 4MO4A 5B8HA 3RSEB 3O5BA 1BO5O 3D2EB 4BQLA 4BRKA 4WQ4C 1X9JA 2D4WA 3D7EO 1GLJO 1TYQB 3WEEA 4CD3A 4A2BA 2FXUA 1HJOA 2A41A 3O4WA 1JCEA 3QMLA 2GTDA 4CI6A 4H0YB 3UKRA 3WXIA 1GLLO 2A42A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N5SA 3HPOA 3OBYA 2IOCA 1VQ6N 3CC2N 2D0CA 4FWKA 1IBLK 3M1FA 4JD2B 1O13A 2HHWA 3RMBA 4X66K 3VF6A 3BF1A 4NYNA 4O0JA 3O4NA 3V9XA 3H46O 1RCHA 3DLHA 3MWPA 3U4LA 2YI1A 2PBDA 4FPBA 3BZKA 1V4TA 3CYMA 3AVGA 1NKEA 5AQRA 4DQPA 5HRPA 3PX0A 3THXA 4WQ5A 3RWUA 4YOVA 2RF2A 3QNNA 3ID6A 3RR8A 4IG3A 4NCBA 1KXPA 2H3GX 4JKAA 3OYBA 1T03A 3AVJA 3K5MA 3OYGA 2D0AA 3ZX3A 3DMJA 2HBLA 2NZTA 2YJFA 3O8MA 4CFAA 1R59O 1T05A 4FK2A 4BG8A 4Q5VA 4DSKA 2DTUA 1QQOA 1J5OA 3SUQA 2VQEK 5C10A 4LF4K 4OGEA 1VRTA 3KTQA 3ZX0A 1BL3A 5JVHL 2DY4A 4CHZA 4CZHA 4BROA 3CCMN 5FPMA 3PX6A 3SJJA 4JI0K 3CPEA 3HYFA 2G8WA 3L2VA 4J2DA 4N47A 2EHGA 1M1KO 1CXUA 4KHQA 3VMFB 5BRDA 3D2FA 5AQJA 4X64K 3S3NA 3NVMA 4HUGA 3AVLA 1HPZA 5KPZA 1RDBA 3AGKA 2CH5A 3ZEUB 4AH9A 4B9VA 3NH0A 2GUPA 1U2VA 1JXBA 2V7YA 2A6AA 2EX3A 2ZGYA 3THVA 2IS3A 4FWLA 4CJEA 4BE1A 3ATUA 4NB4A 3EY1A 5HP1A 2O8DA 1GLEG 4FJHA 4HWIA 4DR1K 4QS8A 1HR0K 4B1WB 3CQXA 3QERA 2WTUA 2P51A 1A5WA 5FDLA 4RW9A 1DT9A 4PL7A 2X6SA 3VQBA 4JI8K 1VSKA 1D8YA 5HL7L 4CFDA 3SAFA 1XC3A 1KAZA 1EETA 3MN9A 1REVA 1OH6A 2UUAK 2FBVA 2Q31A 5E84A 1HYVA 4J2BA 1BA1A 4JKEA 4OKKA 3JXUA 3MN7A 3E9PA 5M1FA 2QK9A 2XY5A 1QHAA 3ZSRA 4YHHK 5JLFA 4JK8A 3VQ6A 1QVGM 3DOLA 4A59A 3HO1A 2CH6A 1KSPA 4DS4A 2DPNA 4CJTA 3R1XA 2HB5A 3M5RA 4K43A 4HHTA 1CLQA 4IZ9A 3ZSXA 4FJXA 3CG7A 4LFAK 3L2RA 3G0ZA 4KPYA 3CHWA 3OYKA 4BRMA 3ZT0A 5AQUA 3SAGA 3RTVA 4B3TK 4OPAA 3TI0A 1VQNN 4B1UB 1BOTO 4FWMA 3VTHA 3LDQA 5H1SQ 3CCJN 5E26A 2E1YA 4O5BA 3AO3A 3DLKA 3OJUA 1LAVA 1HNIA 1OVQA 4FJ9A 2KTQA 1BDGA 3KK3A 2I5JA 4YOUA 4CEBA 1P8ZA 4FLTA 1J53A 4M45A 3P83D 1IJJA 1C1CA 2YNGA 3N4QA 5AZJB 1TK8A 1RT4A 3SV3A 3A0IX 4CK3A 1B92A 3SAHA 4GKJK 3I0SA 2NRWA 4NYFA 5EVZA 5AQZA 1NKBA 3MEEA 1VQ8N 3MN5A 4UQGA 3CPWM 4DV0K 4CJFA 3QFPA 3C0BA 2HHSA 3LM2A 4AHCA 1HMVA 3HXMA 3PO4A 2O8BA 4MO5A 2RE2A 1Z05A 4HUEA 5HRNA 5HBMA 2Q2RA 3ITHA 4FW2A 2V51B 3VA3A 1VQPN 3KD5E 3E01A 4FM2A 1BCMA 3KD1E 5EOYA 2IAJA 4W5QA 3J7AP 4K42A 3H3NO 4BRFA 1HYSA 4A2AA 2KQ2A 3EL2A 4CF2A 1NK9A 3PLAA 4JRQA 3RMCA 3S9HA 1D9DA 4BGBA 2NNWA 4FWSA 3NBPA 2IVNA 3VEXA 3A5NC 3SJHA 3HOTA 3CM5A 1NJZA 1WOQA 4LC9B 3CD6N 2AJQA 3QNOA 2W6KA 4Z4CA 4K0KK 2IVOA 1TKDA 4ISGA 4ILGB 3KIOA 3CJCA 1NGBA 4YDUA 2IIRA 1JXEA 3L8BA 5J2QA 1LWFA 4CBUA 1KQSM 2NRZA 2ZM6K 1N36K 3QBWA 4LFCK 4JI6K 3FR0A 4FJ5A 5FRNA 3HT3A 4M63C 1TKZA 3O1BA 3BDPA 4Y0WA 3RRGA 1WSJA 4NXNK 5J2PA 3QEXA 4BR5A 1RGIA 1W7AA 4M3WA 5JLHA 4CJ3A 4FJGA 4K41A 5HLFA 1YT3A 4YNQA 3AVHA 1JLAA 3LDPA 3AVKA 3J81O 2QWQA 4CF1A 3OYJA 3NF9A 2HBKA 3ATVA 4NXMK 1NNEA 1BIZA 2V7ZA 2P9UA 4GVMA 3HP6A 4KFBA 2P9LB 3SUOA 3A2FA 1IH7A 4CEAA 4FOIA 3IKMA 3SK3A 4E3SA 4E1JA 2PYLA 3P4IA 3F9MA 3KLFA 2P9NB 3THWA 3VN5A 4OLAA 1YTUA 1HUXA 4KV8A 3LDSA 4DR5K 3MAQA 2QW9A 3T1YK 2PZSA 5AFUH 4E7HA 1NK7A 1VSIA 3OYLA 4J8FA 2LSNA 1Z26A 3EO3A 1VAZA 2ASOA 3LAMA 4RW4A 4CHYA 4DQQA 2HHQA 4E1NA 4QS7A 1IKYA 5DM6L 1ASWA 1IG8A 3NF7A 4HVJA 3R3LA 1Q82O 3THYA 3AVIA 5FPEA 1S9GA 4B9UA 5AQLA 3CIPA 1NLVA 3C7NA 4KTZA 3V9UA 3QO9A 1BG3A 1VSLA 1XNQK 3KZBA 1QSSA 1Q81O 4B9MA 3ISNC 4DFKA 3BY5A 3MXJA 5SZTA 4KHWA 4FWRA 1Q8IA 1J9AA 3QIPA 4YOYA 3HOSA 5FROA 1TK5A 3LDNA 4DQRA 1YF5L 5BREA 4FJMA 4M42A 1S22A 2HOEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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