3WQUA

Staphylococcus aureus ftsa complexed with atp
Total Genus 117
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
374
structure length
370
Chain Sequence
HYYVSIDIGSSSVKTIVGEKFHNGINVIGTGQTYTSGIKNGLIDDFDIARQAIKDTIKKASIASGVDIKEVFLKLPIIGTEVYDESNEIDFYEDTEINGSHIEKVLEGIREQETEVINVFPIRFIVDKENEVSDPKELIARHSLKVEAGVIAIQKSILINMIKCVEACGVDVLDVYSDAYNYGSILTATEKELGACVIDIGEDVTQVAFYERGELVDADSIEMAGRDITDDIAQGLNTSYETAEKVKHQYGHAFYDSASDQDIFTVEQVDSDETVQYTQKDLSDFIEARVEEIFFEVFDVLQDLGLTKVNGGFIVTGGSANLLGVKELLSDMVSEKVRIHTPSQMGIRKPEFSSAISTISSSIAFDELLD
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS2 (15-24)S1 (5-11)TIV12 (352-355)TIV1 (12-15)TIV11 (351-354)S4 (41-42)S3 (27-37)S14 (202-207)TI1 (24-27)AH10 (360-376)TIV3 (41-44)S5 (45-46)TIV2 (38-41)TVIII1 (46-49)AH3 (162-174)AH1 (49-67)S6 (73-78)TIV9 (217-220)TIV4 (80-83)S12 (150-161)S7 (83-93)TIV7 (147-150)S11 (145-147)S9 (121-133)TII1 (142-145)TVIII2 (139-142)S8 (98-100)AH2 (102-113)TI'2 (133-136)TIV5 (132-135)S10 (137-139)S13 (178-184)TIV8 (208-211)AH4 (185-188)AH9 (332-338)3H1 (189-192)AH5 (195-200)S15 (212-218)AH7 (247-257)S16 (221-228)AH6 (232-243)S17 (270-274)TIV10 (266-269)S18 (281-285)S19 (320-323)AH8 (286-311)3H3 (325-328)3H2 (262-264)TI2 (275-278)TI3 (316-319)TII2 (329-332)S20 (344-346)3H4 (357-359)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Structural genomics
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
publication title Crystal structure of FtsA from Staphylococcus aureus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein FtsA
total genus 117
structure length 370
sequence length 374
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-02-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02491 SHS2_FTSA SHS2 domain inserted in FTSA
A PF14450 FtsA Cell division protein FtsA
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wquA02
3SK3A 4CBWA 1QZ5A 1C0FA 4RWTA 5KQDA 1QHAA 4BGAA 3CERA 5FPEA 3BEXA 5EVZA 3VEOA 2D1KA 3VEWA 4BR4A 2GEMA 3BF1A 3WXLA 2EWSA 3DXMB 3VGMA 3R9PA 3CETA 1BUPA 4JN4A 2GELA 4BRPA 4CZHA 4BROA 3O1BA 4BC2A 4I6MA 4ISGA 4FWPA 1U2VA 4CZEA 4BRQA 3UKRB 4H5NA 5KPTA 4B1YB 4Y0WA 3LM2A 4FOEA 4BG9A 2P9PB 2GUPA 2YI1A 2UYTA 3H3NO 4A2BA 4DQ8A 5AQNA 2ZGZA 1T44A 5KQ8A 1SAZA 1GLBG 3CJCA 4KBOA 3I8BA 4DHYA 4E1JA 4PL8A 3LDNA 2V52B 3QBWA 5BPNA 4BR9A 4MLHA 3VGKA 3DJCA 3P4IA 5AQOA 4EFHA 1TUYA 2QW9A 3FE1A 1SQKA 2E1ZA 3DXMA 4FPBA 1S22A 3O5BA 3O08A 4BRMA 3LDQA 3H45C 1EQYA 3WEEB 5CE3A 4BGBA 1JCGA 1OKJA 2VWBA 3LDLA 3HM8A 4BRCA 1P8ZA 1NLVA 2P9PA 5AQUA 4DB3A 1J6ZA 2QWQA 1LCUA 5AZJB 1KAYA 2I7PA 2Q36A 3GOIA 2E20A 3F9MA 4K42A 1KXPA 4WQ4A 4BRAA 4CD3A 4DCHA 2E2NA 2W40A 3ZX3A 2DPNA 2P9NB 1WOQA 3O80A 4GY2B 4JD2A 4BC3A 1KAZA 5AQWA 4BR0A 1BDGA 3AAPA 4CZFA 4BVPA 3ATVA 4C23A 2P9IA 3I33A 4M7XA 5AQLA 4NO7A 3BP8A 3JXUA 4CBUA 3CI5A 2A3ZA 4O8KA 2NZTA 3UE5A 3WEEA 3CJAA 4B1VA 3IMXA 2A41A 5ELZA 3VEYA 3DAWA 4YDUA 3FGUA 3J8AA 4BRKA 5KPRA 3EZWA 2CGJA 3FZFA 4K25A 1SZ2A 5AZJA 2H3GX 4PKGA 4HTLA 5AQMA 3WUHA 2CGLA 3U8XA 1GLCG 2F9TA 4CI6A 4FWKA 5TKYA 5E26A 2YJEA 2E2PA 2E2QA 2QWLA 4FPAA 3GL1A 4H0TB 1MWMA 1XUPO 3FR0A 1DGKN 3DWLA 5FPNA 3A0IX 4BQZA 3BF3A 1BU6O 1NWKA 1G99A 5AQRA 3ZX0A 3EKSA 1GLLO 3VERA 1YVNA 3O8MA 3GBTA 4H5WA 3KHYA 1GLFO 1HJOA 1MWKA 5EOYA 3VEXA 4WQ5A 4FO0A 3O6WA 4BRGA 4BREA 5JLFA 3D2FB 1GLDG 3MCPA 1NGJA 4BR5A 3HBTA 4CZMA 4BRDA 1K8KA 5AQIA 3C7NB 5EX5A 1HX1A 2Q0UA 3ZEUB 3IDHA 1NGHA 3EL2A 5EY4A 3ATUA 2QWOA 4FWMA 3EN9A 1ZXOA 3D2EB 5BPMA 3ULEA 5AFUH 3CJ1A 3R6MA 3W0LA 2NLXA 1QQOA 1ATSA 2VYPA 3VENA 5BN8A 4JHDA 1D4XA 4CBXA 5BRFA 1NGAA 4JD2B 5AQQA 4NB4A 4F9OA 5F2RA 4BRFA 2Q31A 1DEJA 4FWNA 3SMPA 4B1ZA 3GE1A 4FSVA 2P9IB 2V7YA 3D2FA 3MN5A 1NGBA 2QM1A 2HMPA 4QS9A 4XH5A 4H0YB 2YJFA 1Z6RA 1RGIA 1NBWA 1C0GA 3C7NA 3FZMA 3RSEB 3QB0A 3ZEUA 3BUZB 2FXUA 2E2OA 2QXLA 2W41A 2OANA 4Z94A 4BC5A 4FWOA 3D2EA 1U6ZA 1IJJA 2P9UA 1NGGA 2Q0RA 4H5RA 5EXWA 3QBXA 5F0XA 3CQXA 3AY9A 3ENOA 3FZHA 4MO5A 5I9EB 2BTFA 5AQXA 2YCHA 4H0PA 5AQGA 3LL3A 2YHYA 4QS7A 1S3XA 1BO5O 2D4WA 3ZX2A 3U9ZA 2GWJA 3GDQA 4CZKA 3IUCA 1NGFA 4ISEA 1HKBA 1TYQB 1XQSC 2HF3A 4WQ4C 4XH4A 3RSEA 5AQVA 4LC9B 1MDUB 2AP1A 4RTFD 4JNEA 5JLHA 3MN9A 4IXCA 3O1WA 1RFQA 3CJ7A 5AQJA 5ADXA 1XC3A 1JCEA 4H0OA 5FPDA 2E8AA 3U9DA 5AZIA 3AAQA 5BN9A 2IIRA 4PL7A 5AR0A 5AQPA 4H0VB 4AM7A 1K8KB 5JMVA 4EIAA 2QWNA 3LDOA 2CGKA 4FWQA 2A5XA 4K43A 3B8AX 4YDUC 1Q18A 4O5FA 2ASMA 2I7NA 4IO8A 5ADXH 3DXKA 3QFPA 2P9SB 5AQSA 3ID8A 3OHRA 5AQKA 4J8FA 1HKGA 3ULEB 3JS6A 3QICA 1CZAN 1TYQA 3A5NC 1QZ6A 1HPMA 1DKGD 4MO4A 5BRDA 3UKUA 4FWSA 1E4GT 4JHDB 3CIPA 3LM9A 4CZJA 2PBDA 5AQHA 2YHXA 4FWLA 2IVOA 2E1YA 1HLUA 2VCPA 5BR9A 4BR2A 4BG8A 2D0PA 1T6DA 4BQLA 1BA0A 3U4LA 5AFUA 3W3DA 1ATRA 3WT0A 5KPZA 1IG8A 2ITMA 4CZLA 1WUAA 3M1FA 4H5VA 3VESA 3VETA 1BA1A 1V4TA 3H1VX 3HI0A 3G25A 4A61A 4CZGA 2FF6A 2KHOA 2P9SA 3IFRA 1YUWA 4M7YA 4EAHD 4H0XB 4B9QA 4WQ5C 2QWRA 1QQMA 3SJHA 1Y64A 3MK6A 2A6AA 2P9UB 4H03B 1GLAG 2GWKA 2ZF5O 3HZ6A 4A62A 2YHWA 3QFUA 4BRNA 2CH6A 4QS8A 5F1XA 5E84A 1BG3A 2AA4A 3FFKB 3WXIA 3L6QA 3TPQA 1X9JA 3QDKA 1GLJO 3MN6A 2A42A 2WUSA 5AQTA 1T6CA 2QWPA 3D7EO 1KAXA 3CQYA 3KZBA 3EO3A 3VOVA 3VF4A 3CHWA 3FZLA 3TU5A 4CD1A 3A5OC 4JAXA 2IVPA 1Z05A 3ZETB 4EHTA 2PAVA 4B1UB 1NGCA 4EHUA 2QWMA 3H6EA 2E88A 3SMSA 3A8YA 3EKUA 4IWVA 4AM6A 4M63C 2A40A 2D0OA 3MMVA 3C0BA 3WQUA 3VF2A 1X3NA 4GNIA 1HUXA 1YAGA 5AQZA 1TUUA 5AZIB 4BR7A 1BOTO 4HWIA 1NM1A 2ASOA 4ISFA 2ASPA 1NGEA 4PKIA 3WXKA 3HTVA 4BVOA 2FSNA 2ZWHA 1R59O 3VPZA 5LJVA 2J4RA 1HKCA 3CJBA 2CH5A 3UKRA 1H1VA 1MA9B 3DXKB 3A5LC 5BRHA 2Q1NA 1ATNA 3M3ZA 4PKHA 3R8EA 4BRIA 1NGDA 2FSJA 3VF6A 2F9WA 5FPMA 1ZBSA 1GLEG 4FOIA 1YXQA 3ZETA 2FF3B 4XH1A 3L0QA 3VEVA 4XEIA 3S41A 4BRLA 3H3OB 3UKUB 2ZGYA 3WXJA 4B1WB 2Q97A 5BPLA 3MN7A 2P9LB 3HSCA 3UB5A 1E4FT 4L3QA 4RCHA 3A5MC 2FSKA 4IZ9A 4A2AA 5LJWA 3QMLA 3CJ9A 4CJ7A 2P9KB 1RDWX 5AQYA 3H1QA 3VGLA 3FZKA 3LDPA 1NMDA 2HF4A 3M6GA 3SLCA 4MLEA 5AQFA 3VEZA 3WQTA 1JCFA 4FL9A 2NRHA 2BUPA 3AARA 2IVNA 3GG4A 4H5TA 3L4IA 4CZIA 1ESVA 4B1XB 4BRHA 5BREA 3ENHA 2HOEA 2P9NA 3O4WA 3MDQA 2P9LA 1X3MA 4I6MB 3FLCO 4IJNA 1U2VB 2FLOA 2Q2RA 2V51B 4K41A 2V7ZA 5LY3A 1BWFO 3H46O 4FWRA 1QQNA 4IJAA 4WYBA 1NGIA 1LOTB 2P9KA 5B8HA 4BC4A 5JICA 1ZC6A 1V4SA 2GTDA 3KVGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THWB 3SK3A 2HHQA 4CBWA 1C0FA 1SKSA 1LWCA 3CC7N 1JLAA 5FPEA 1J5EK 1HYSA 4BR4A 4ID1A 4WF9L 3PX6A 1SUQA 1NNEA 3R9PA 2GELA 4ILJA 1VQ5N 1NKEA 4BROA 3CPEA 5J1EA 1U2VA 4PA1A 4H5NA 1VRTA 4JK8A 2QXFA 4BG9A 1VQLN 3QO9A 5EU7A 2YI1A 4JKGB 2W6LA 3TAMA 4DR4K 3M5RA 4KBOA 5HRSA 3I8BA 1B92A 3LDNA 3IAYA 3SQ1A 1VSMA 3OBYA 4M3UA 2XY8A 3J7ZO 4FJGA 3WXMB 3CMAN 2BANA 1WB9A 4FLZA 1SQKA 3O3FA 2X6SA 4OKJA 1N32K 4JI8K 2O4GA 3WEEB 4BGBA 3KKSA 3TARA 4JI0K 4Z4EA 2QTDA 4DMNA 1N36K 4DSJA 4N56A 1JCGA 1OKJA 3LDLA 4DTXA 3HJFA 4DB3A 5AQUA 3T7ZA 3O3GA 5AZJB 2I7PA 5M1FA 5DMRA 3GOIA 4IDHA 3P39A 4B8CA 4DCHA 5CYMA 2W40A 1EKEA 2DPNA 2W42A 4YFUA 4GY2B 1KAZA 5C15A 5GINA 3U3YA 2ZJPL 5J2MA 3C94A 2HBKA 4M7XA 3CCSN 3NFAA 4A5AA 5AQLA 4KB0A 4PQUA 4ELUA 3QEVA 3VQCA 4LF9K 3UE5A 3CJAA 3SI6A 5GAGP 3VEYA 2FC0A 3JYTA 1M90O 3BGRA 5KPRA 2CGJA 1QHTA 3PUFA 4LY7A 1XMOK 2H3GX 4PKGA 2PFUA 5M1OA 1VK0A 1WSGA 3TAEA 3AVIA 4OO1J 3LWLA 4E7HA 3T19A 3DRPA 4KHNA 1S1UA 1L3TA 1ZBIA 1VSKA 1DGKN 5HLFA 3O4QA 2QI2A 3BZCA 1BU6O 1NWKA 4CJSA 4CEFA 1G99A 3ZLJA 4GV9A 3ZX0A 1GLLO 4F2SA 3KHYA 1NKCA 1TVRA 1U4BA 2YHBA 1NJWA 2HMIA 3L3UA 3L2WA 1S1XA 1IKYA 3CFOA 4CEOA 5EOYA 3QEXA 3OY9A 1VSDA 4N76A 3ZT0A 1VSEA 4W5TA 2Z1JA 4BRDA 3AVFA 1HX1A 2Q0UA 3SAFA 1NGHA 2RHKA 3EL2A 3UIQA 3SAHA 1RDCA 2I5JA 3EN9A 3CYMA 1ZXOA 4JKCA 5BPMA 3NGYA 4BE2A 4CGGA 4DSKA 4FJIA 4JV5K 3K5LA 2D0AA 1QQOA 5FDLA 3VENA 3AO3A 2VQEK 4CBXA 5J2QA 1WNSA 4DQPA 1K73O 1A5WA 4CJEA 1Z26A 3F9KA 4FSVA 2P9IB 3D2FA 4IOAL 3LDSA 1XHZA 4CW7B 1JXBA 3C7NA 4B3OA 1BIZA 3QB0A 4Z0UA 3T1YK 3BUZB 4HHTA 1YT3A 1NK9A 4ZHRA 1W7AA 1SV5A 4C8KA 3KWGA 1HPZA 1NGGA 4H5RA 3K58A 3THXB 4LF8K 4O5BA 4NCAA 2BTFA 4DV2K 4DR7K 2NRXA 4CF0A 2YCHA 4JK9A 1WBDA 4H0PA 5AQGA 3LL3A 3HPGA 4QS7A 1S3XA 1BO5O 3ZX2A 1Y97A 5FROA 4XH4A 4WQ4C 3NCIA 2EHGA 1OH6A 2AP1A 2FBXA 4W5QA 4DFKA 3V4IA 2GBZA 1RILA 4JNEA 2OYQA 2UXDK 2KZMA 1RFQA 5ADXA 1XC3A 2NNWA 4DUZK 1EP4A 4DTRA 1QSSA 2HB5A 3QESA 4AM7A 5JMVA 4ID5A 4EIAA 1KD1O 1VAZA 1S9EA 3B8AX 3J7YP 3ID6A 3S3MA 2QKKA 1Q18A 2G8KA 2ASMA 2I7NA 4IO8A 3A2FA 3DXKA 1OH7A 2O8CA 3QFPA 4O55A 5C10A 5AQSA 3VQQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3THW B;  3SK3 A;  2HHQ A;  4CBW A;  1C0F A;  1SKS A;  1LWC A;  3CC7 N;  1JLA A;  5FPE A;  1J5E K;  1HYS A;  4BR4 A;  4ID1 A;  4WF9 L;  3PX6 A;  1SUQ A;  1NNE A;  3R9P A;  2GEL A;  4ILJ A;  1VQ5 N;  1NKE A;  4BRO A;  3CPE A;  5J1E A;  1U2V A;  4PA1 A;  4H5N A;  1VRT A;  4JK8 A;  2QXF A;  4BG9 A;  1VQL N;  3QO9 A;  5EU7 A;  2YI1 A;  4JKG B;  2W6L A;  3TAM A;  4DR4 K;  3M5R A;  4KBO A;  5HRS A;  3I8B A;  1B92 A;  3LDN A;  3IAY A;  3SQ1 A;  1VSM A;  3OBY A;  4M3U A;  2XY8 A;  3J7Z O;  4FJG A;  3WXM B;  3CMA N;  2BAN A;  1WB9 A;  4FLZ A;  1SQK A;  3O3F A;  2X6S A;  4OKJ A;  1N32 K;  4JI8 K;  2O4G A;  3WEE B;  4BGB A;  3KKS A;  3TAR A;  4JI0 K;  4Z4E A;  2QTD A;  4DMN A;  1N36 K;  4DSJ A;  4N56 A;  1JCG A;  1OKJ A;  3LDL A;  4DTX A;  3HJF A;  4DB3 A;  5AQU A;  3T7Z A;  3O3G A;  5AZJ B;  2I7P A;  5M1F A;  5DMR A;  3GOI A;  4IDH A;  3P39 A;  4B8C A;  4DCH A;  5CYM A;  2W40 A;  1EKE A;  2DPN A;  2W42 A;  4YFU A;  4GY2 B;  1KAZ A;  5C15 A;  5GIN A;  3U3Y A;  2ZJP L;  5J2M A;  3C94 A;  2HBK A;  4M7X A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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