3CCEN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535a
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 52
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cceN00
3CCVN 1M1KO 1K9MO 1Q7YO 3I56N 3G71N 4WFNL 1YJNN 1YHQN 1KC8O 4WCEL 4IOCL 1YJWN 3CPWM 5GAGP 3CF5L 3CCMN 2ZJRL 1YITN 1QVFM 3CC4N 1S72N 1VQMN 1Q86O 5DM6L 3CCRN 1NJIO 3CC7N 1VQ5N 1VQ7N 1QVGM 1VQ9N 4WFAL 4WFBL 1N8RO 1VQPN 1K8AO 3CMAN 5JVGL 1YI2N 1JJ2M 1VQ6N 1OVYA 5HL7L 5GAEP 5GADP 3CCUN 5H1SQ 3CCJN 2ZJQL 1KQSM 2ZJPL 3I55N 2QA4N 2OTLN 1KD1O 1ILYA 4IO9L 1YJ9N 3J7ZO 4IOAL 1M90O 1VQLN 1YIJN 3CD6N 1VQ4N 1K73O 4UY8O 3CC2N 3CCSN 1W2BM 5GAHP 3OW2M 1VQON 4WF9L 3DLLL 3CCLN 1Q82O 3CXCM 2QEXN 3PIOL 2OTJN 5MLCQ 5DM7L 3PIPL 3CCEN 3G6EN 3G4SN 3CCQN 1VQ8N 3CMEN 5JVHL 1VQKN 1Q81O 4U67L 1VQNN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VK0A 1RTJA 3ZT3A 4CBUA 4DTOA 1XC9A 5AQOA 4CEEA 2HHTA 3CPWM 3H45C 1GLFO 1CLQA 1H1VA 1WAJA 2WONA 4B9NA 4A57A 2QM1A 4AHVA 1N34K 1J9AA 1LWEA 2ZE2A 2YHXA 2GBZA 4N76A 3DRSA 4Z0UA 3CC4N 2UXDK 5AZJB 5E41A 4EHUA 4K8ZA 3WQTA 5DM6L 4BG8A 1YTUA 2E8AA 2YX6A 4CGFA 3ZT1A 2G8FA 4E3SA 3NAEA 4PKIA 1VQ5N 3DRRA 1RT2A 3NF8A 1BWFO 3PV8A 4O8UA 1U2VA 1JJ2M 4Z4EA 4B1UB 5GADP 2G8KA 2HHXA 3KWIA 3BF1A 3O3FA 1GOBA 3LWLA 3SUNA 1ZXOA 3AO1A 1I3AA 3AAQA 3AVIA 1IO2A 1KD1O 4LC9B 3O1WA 4BRKA 2P9KB 3O9RA 3J7ZO 2QTDA 3A5OC 4FXDA 3PO5A 1VAZA 1M90O 2QKBA 4CZHA 3C94A 4CJ4A 4GV9A 1NJZA 1U47A 1VRUA 2XO7A 2P9SA 4KHYA 2P9SB 4N41A 3ZX0A 3BZKA 3T69A 3VQEA 1O13A 2BANA 1G99A 4JEPA 2F9WA 1TYQB 5AQUA 2W6LA 4AHCA 2J4RA 3VQ7A 3H1VX 1QQCA 5HRPA 3K9KA 3ZEUB 3ZX2A 3HP9A 3NF9A 2F8TA 5CYMA 4JI8K 3RMDA 4B9TA 3L4QA 2XRIA 3TAMA 1NKBA 2O8FB 3QERA 3LDNA 3U9ZA 3LP3A 4OO1J 2ATQA 4IOXA 1Q7YO 1KAZA 1TUUA 1DGKN 1JLFA 1SS6A 3L2UA 2YI1A 3OS0A 3R8EA 4RW6A 4DFMA 2VCPA 4CJEA 5KPRA 1HQEA 1IBLK 2ZJRL 1OKJA 3CFOA 1SKSA 4HTLA 4CZIA 3I8DA 3QIOA 4GMJB 3WQUA 1S1WA 1L3SA 1Q9YA 3D2EB 2HBKA 5B8HA 3U3GA 2GX9A 2UYTA 1KVBA 4CJUA 3TAFA 4Z4FA 1NOZA 4LD0A 4KI6A 3Q7BA 2G8WA 4X65K 1ASVA 3HPHA 3D0PA 3CIPA 3O5BA 2YHBA 1BI4B 4FJ7A 1WAFA 4B8AB 4CI6A 3AVHA 1BCOA 4DU4A 1EXQA 3KK1A 4DTPA 4LF5K 1CZ9A 4ISFA 1ATRA 3FFIA 4YORA 1S1TA 5LJWA 4KB0A 5C42A 2D0CA 1P8ZA 2FSJA 1KCFA 1R59O 3KD5E 4CJPA 4LH5A 2YHAA 4DTXA 4DV3K 3DWLA 1N5YA 4FK4A 1D5AA 5AQVA 4ELUA 4CF9A 4W5QA 1SAZA 2A41A 2HOEA 3F73A 5D3GA 4EZ6A 4LF8K 3M3ZA 2XY8A 1HMVA 3AAPA 3WEEB 4E1JA 1NJWA 4KHSA 4KH4A 3PIOL 4EP4A 1TV6A 3K5LA 1ESVA 1D9FA 3SMSA 1TVRA 5I42A 1EX4A 3CCEN 3MCPA 3MWTA 1GOCA 3L2RA 3HOSA 3SJHA 2W6KA 2RKIA 1BCMA 2HMPA 3MX5A 1KFSA 1VQNN 1BQMA 4YOXA 3NE6A 2PY5A 4B1YB 3MN9A 1Q8IA 3MK6A 1NU0A 3AA2A 2Q0RA 1J5EK 3G71N 2KZZA 1MDUB 3B6OA 1YJNN 2FSNA 3JXUA 3EN9A 4JD2A 4CZKA 2G8IA 1NMDA 1BA0A 3DXKA 4O5FA 3ZSVA 2OA8A 3V9SA 3OJUA 3BGRA 4DLGA 3RMCA 4XH1A 1NK0A 4IG3A 3WNHA 4FWPA 4JNEA 2VWKA 3NMUA 4KAZA 2GWKA 1XHXA 3D2FA 2F4VK 3DOKA 2HF3A 2UUCK 3L3UA 3K59A 3OYDA 4KHQA 3MWPA 1HNWK 4HUFA 1DEJA 2OZSA 4CZJA 4DR4K 4M3XA 4YOVA 4Z4IA 3RR8A 3OVNA 5I9EB 1YI2N 5BREA 3FFKB 4RW8A 1T7PA 4G1QA 1OVQA 3GG4A 3HM8A 4BRHA 3TI0A 4BRIA 4B3RK 2KFZA 3TAQA 3ITHA 3BY5A 4HTUA 2OPRA 4FM2A 3NH0A 3R3LA 3L3VA 4RG8A 2D0OA 4GKJK 4OKEA 2VQEK 1DKGD 3V9WA 5SZTA 4OKKA 4HUGA 4BC2A 4B9QA 3NCIA 4OVLA 4JI5K 3CC2N 4BRPA 4FYDA 4Z4GA 2ZD1A 3V9XA 4O55A 4Z4HA 1RT5A 1ZBSA 3DLBA 2QWNA 3UIQA 2ASOA 5FDLA 1KTQA 3PIPL 4IEIA 3GDQA 3V9ZA 3R1XA 3OYFA 4E19A 3AVGA 3KKSA 4FZZA 1WSHA 5HRRA 5AQQA 1TL1A 2DTUA 3O9QA 4WYBA 1HLUA 3EKSA 3ZETA 4H0YB 2ASMA 3H1QA 4CJTA 3SQ2A 2ITMA 1R0AA 2O8CB 1IV0A 5AFUA 4DFPA 1JLQA 4A62A 3P31A 3WNFA 4B3SK 3TPQA 4WCEL 3P38A 1JLAA 1DLOA 4AM7A 2ZGZA 4H03B 3ULEA 3B8AX 4FLZA 3DYAA 4K0KK 4FWLA 4DUZK 2IGIA 1V4TA 4R79A 1X9JA 1RBRA 1RTIA 3QLHA 2NRHA 4J8FA 1S6QA 4CK2A 3OBYA 3ZSWA 4B1WB 4DR3K 4CFBA 3ASMA 1E4GT 5BN9A 4DQIA 5AQGA 4BRLA 1SV5A 3IFRA 5KRTA 3TARA 4M3TA 3A0IX 5J2MA 1GLCG 1VQPN 4FCYA 4M7XA 5M1NA 5AQTA 4DF8A 2E1ZA 2FSKA 1EWQA 3H6EA 1ITGA 2YJFA 4W5TA 5FPNA 2WTUA 3VQ8A 2RPIA 4PL8A 3QBWA 4CK3A 1BIUA 3CERA 3VPZA 1N36K 3WNEA 3FE1A 3F2KA 4JLHA 4BDZA 3NFAA 5TKWA 1HNXK 1I39A 1T03A 5AQFA 3O9SA 4HVJA 1RDBA 4BWJA 3J7AP 4CHZA 3IMXA 2A3ZA 4C8MA 3CJ1A 4CGHA 1NKCA 1UA1A 4M42A 5HOOA 5GAHP 4B9LA 4OJRA 4EP5A 2F9TA 3TU5A 1W0HA 4CW7B 1D8YA 3OHRA 1ZYQA 4CK1A 5GIPA 3HBTA 2EWSA 4BE0A 2X6NA 1SUQA 3P5JA 2NLXA 4BACA 3G4SN 4DMNA 3OYBA 4CE9A 3RWUA 4M3WA 1QZ5A 4LF6K 1LCUA 3K0SA 4IZ9A 2QWQA 1GOAA 2G8VA 3KK3A 1BG3A 4JKHA 3QEIA 1U6ZA 2OYQA 1CZBA 2KTQA 4BR4A 1K9MO 4CEAA 1DT9A 3A5NC 3CJAA 4CF0A 1X9SA 3KLHA 4CZMA 4I2QA 4Z4CA 5FRNA 1RILA 2HNDA 4AHRA 3SAGA 4CJVA 3AO4A 1JL1A 1C0FA 4FJJA 1S1VA 4H8KA 4RTFD 4CFCA 3AA4A 3CJ7A 2VWJA 5EY4A 4GVMA 3IUCA 4FWKA 1N32K 3SNNA 2Q2RA 5CZ1A 1NJIO 1TL3A 3WXJA 5ADXA 3E66A 1GLEG 1YT3A 4I6MA 3RMBA 2BDPA 4DV7K 4XIUA 3QETA 4H4OA 2QI2A 3SYZA 3P4IA 3VA0A 4CJWA 3V4IA 1NK8A 1JLGA 2HNYA 3SUOA 1S9GA 5GIOA 4IJAA 3SV3A 1RGIA 5JLHA 2E1YA 4IO8A 4U7BA 3JSMA 3ZT0A 5AFUH 4NB4A 3LWMA 4H0TB 2I7PA 2P9NA 2P9NB 4F3TA 3KIOA 4DKWA 1KSPA 2Z1GA 5CE3A 1QE1A 3VGMA 5BR9A 5HRNA 4DWIA 1HPZA 2HB5A 5FPDA 3OW2M 4WF9L 5C12A 1X9MA 3AO3A 1QS4A 2O8BB 3A5MC 1UOCA 2IOCA 3BDPA 3LZJA 4AILC 3ATVA 4BVPA 5TKYA 1GLAG 2EHGA 1HKCA 2F96A 4DTNA 3TAEA 1L5UA 1S1XA 4PWDA 5FRMA 4KB1A 4AHSA 3TSUA 5AZIB 5AQZA 3CPEA 4ZTJA 5J2QA 1V4SA 1JLEA 3VQ9A 1J6ZA 3QFPA 1CXUA 2P5OA 5SWMA 3D6RA 1J54A 4DTRA 3LANA 4JI4K 2ZWHA 4OLAA 3JAMO 5LY3A 3HJFA 4B9UA 3HM9A 2P9UA 4C23A 4OGEA 3ZT4A 1NGEA 3J8AA 1C0TA 4DU1A 3K2PA 4XEIA 1QQNA 1S9EA 3PY8A 3SCXA 3KWGA 1MA9B 1BGXT 1A5XA 3QNNA 1WBBA 2ZM6K 4JKGA 4JKGB 1C0UA 4C1NK 1QHAA 2EX3A 4J2BA 1K8AO 3SPZA 4H0XB 1JLBA 3AVCA 1ZBLA 3TAGA 1RTHA 1E3MA 3CCUN 4QAGA 4Y1DA 3T3FA 4L3QA 3G0ZA 3I55N 4E7HA 4JKAA 1L3UA 2QWPA 3VF4A 4B9MA 5FPEA 3F9MA 3SLCA 1XHZA 2JLEA 1J53A 1NNEA 2D0BA 4E7KA 4CD3A 1XUPO 1HRHA 3AGRA 3CD6N 2F7TA 1U2VB 3CCSN 4J2EA 5HROA 1W97L 4OPJA 4DSKA 4DF4A 1NMNA 4BR7A 4BY9C 4QOZB 5MLCQ 4OPAA 4ELVA 4KH6A 5ADXH 4NCGA 1KAXA 1T6CA 4WE1A 2DY4A 1IKWA 1U04A 3G25A 3I0SA 3HOTA 3VF6A 2R7YA 1YUWA 1Z05A 4H4MA 3K57A 4KBOA 3MCAB 1EO1A 1N33K 2QXFA 3BP8A 1IKXA 1NOYA 4B3MK 4AF1A 2Q97A 4CJKA 3MAQA 2CGLA 3W0LA 2XY5A 4YOTA 2HHQA 3O08A 4E1MA 3DJCA 4DTJA 3L2VA 4OPKA 3SJJA 4FLTA 3THYA 4FLWA 4PL7A 1S6PA 2QWLA 1LWCA 4FWRA 2VGNA 3AVKA 1ZBUA 3P39A 3C7NA 1VQMN 3MN5A 4WQ4A 1EQYA 3EE8A 4CHPA 4BRAA 3SPYA 3ULDA 4E1NA 4CJ7A 3MXIA 1LW0A 3LP2A 4FW2A 5FLXO 2OZMA 1VSIA 3LM9A 4WFAL 2A1SA 1MWMA 3HI0A 2UXCK 3CMAN 4LF9K 2HNZA 2E88A 3CM6A 4FWSA 3FZKA 5HLFA 3DRPA 5FPMA 3J80O 3NGYA 2QA4N 4BWMA 2BE2A 3K5NA 4BQZA 4CJQA 2FXUA 2Q0UA 3ZYYX 3SAFA 4CZFA 1G15A 4GKKK 1NGHA 3CJ9A 5KQDA 3MEGA 5T7BA 3PX0A 3SK3A 4EAHD 4YNQA 3AA3A 2UXBK 3VTHA 3VERA 1FW6A 3LDPA 1RTDA 3BZCA 3ZSXA 3PUFA 1NK9A 2YNHA 3OYCA 1T6DA 3H3NO 1X3MA 1RDDA 4DG1A 1JCGA 4F2SA 2GELA 1WUAA 3TANA 1RT4A 2E20A 1C0GA 3SBTA 1WN7A 2VYPA 4BRNA 3EL2A 4M63C 1UWBA 4CEZA 1Q9XA 3EE9A 1LWFA 4H0PA 1SL0A 1NKEA 4B1XB 1ZC6A 3CQYA 3OS1A 3KZBA 2OPQA 1C1BA 4IG0A 3AVJA 3PSIA 2HSTA 1UAXA 2HMIA 3DI6A 3TABA 3VOVA 3PX4A 3AVBA 1NJYA 2IVPA 2OPPA 2D5RA 4DV2K 1NJXA 4IXCA 2B4JA 3ZSZA 2KW4A 4KI4A 4IOCL 2I5JA 3V1OA 3GE1A 2NZTA 4K43A 1I94K 1YVNA 2GEMA 1BHLA 4KTZA 2AP1A 2JWLA 1IBMK 4BRFA 4NO7A 3VEOA 4CHYA 1SKRA 4M45A 1S1UA 5C2DA 4IJNA 3B6PA 3I33A 2CGKA 5CHIA 2QKKA 4BDPA 1ZBHA 4KHNA 2VGMA 4JD2B 3VGKA 4JI7K 1LV5A 3DXKB 4NYFA 1K8KA 1K8KB 3L2QA 4JI6K 4DQQA 4DQRA 4LY7A 5H1SQ 3KJVA 1KQSM 2IIRA 3ZCMA 1IKVA 2HW3A 3I0RA 3D2FB 4DTMA 1FKPA 4CECA 2VG6A 3TTDA 3SUPA 2VWBA 4IKFA 1U48A 4FSVA 3N4PA 1TUYA 5AQIA 1HKBA 4JKEA 2DFHA 3P1GA 3F5TA 2ZQBA 4FOEA 1VQON 1RT3A 4KTWA 1RCHA 1YF5L 3H3OB 1TKXA 4FZYA 3NBPA 3C6AA 5C10A 5M1PA 3DXMA 2X6SA 3AO5A 2GWJA 1Y97A 2UUBK 3OY9A 4Z94A 2KFNA 1ZBIA 3KLIA 4CZGA 4M41A 3TSPA 1VQ8N 3LL3A 2PYJA 5JVHL 1Q81O 3TWHA 3LDOA 2A42A 3QB0A 3OS2A 4DCHA 3O9UA 5CY4A 2AA4A 1HQUA 4N5SA 4O8KA 2VG5A 3HVTA 2P9LA 5AQWA 5F0XA 3NGZA 2Q31A 4WFNL 4I2PA 3C0BA 4DS4A 1YHQN 1SL1A 2O8EA 1FJGK 3U4LA 4IBNA 3KTQA 5C2FA 3C6HA 1LW2A 4N47A 1SZ2A 2V52B 3D45A 2KZMA 1IG9A 4M3UA 1NK7A 4CJRA 2NRWA 4MO4A 3ZETB 1YTAA 4CEQA 1P90A 3H08A 3OYKA 4H5WA 1WSJA 1T8EA 3CCRN 1GLLO 1NK6A 4KRFA 2JWKA 2KLAA 5KGWA 5KPZA 3HL8A 2NRTA 4CJ5A 1KVCA 5ELZA 5BPNA 3TTFA 4WFBL 2QW9A 3ULEB 3V1RA 4YOWA 3M8SA 4LH4A 3AVAA 3QEPA 4WQ4C 2QXLA 2ZJQL 4Y1CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CCV N;  1M1K O;  1K9M O;  1Q7Y O;  3I56 N;  3G71 N;  4WFN L;  1YJN N;  1YHQ N;  1KC8 O;  4WCE L;  4IOC L;  1YJW N;  3CPW M;  5GAG P;  3CF5 L;  3CCM N;  2ZJR L;  1YIT N;  1QVF M;  3CC4 N;  1S72 N;  1VQM N;  1Q86 O;  5DM6 L;  3CCR N;  1NJI O;  3CC7 N;  1VQ5 N;  1VQ7 N;  1QVG M;  1VQ9 N;  4WFA L;  4WFB L;  1N8R O;  1VQP N;  1K8A O;  3CMA N;  5JVG L;  1YI2 N;  1JJ2 M;  1VQ6 N;  1OVY A;  5HL7 L;  5GAE P;  5GAD P;  3CCU N;  5H1S Q;  3CCJ N;  2ZJQ L;  1KQS M;  2ZJP L;  3I55 N;  2QA4 N;  2OTL N;  1KD1 O;  1ILY A;  4IO9 L;  1YJ9 N;  3J7Z O;  4IOA L;  1M90 O;  1VQL N;  1YIJ N;  3CD6 N;  1VQ4 N;  1K73 O;  4UY8 O;  3CC2 N;  3CCS N;  1W2B M;  5GAH P;  3OW2 M;  1VQO N;  4WF9 L;  3DLL L;  3CCL N;  1Q82 O;  3CXC M;  2QEX N;  3PIO L;  2OTJ N;  5MLC Q;  5DM7 L;  3PIP L;  3CCE N;  3G6E N;  3G4S N;  3CCQ N;  1VQ8 N;  3CME N;  5JVH L;  1VQK N;  1Q81 O;  4U67 L;  1VQN N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VK0 A;  1RTJ A;  3ZT3 A;  4CBU A;  4DTO A;  1XC9 A;  5AQO A;  4CEE A;  2HHT A;  3CPW M;  3H45 C;  1GLF O;  1CLQ A;  1H1V A;  1WAJ A;  2WON A;  4B9N A;  4A57 A;  2QM1 A;  4AHV A;  1N34 K;  1J9A A;  1LWE A;  2ZE2 A;  2YHX A;  2GBZ A;  4N76 A;  3DRS A;  4Z0U A;  3CC4 N;  2UXD K;  5AZJ B;  5E41 A;  4EHU A;  4K8Z A;  3WQT A;  5DM6 L;  4BG8 A;  1YTU A;  2E8A A;  2YX6 A;  4CGF A;  3ZT1 A;  2G8F A;  4E3S A;  3NAE A;  4PKI A;  1VQ5 N;  3DRR A;  1RT2 A;  3NF8 A;  1BWF O;  3PV8 A;  4O8U A;  1U2V A;  1JJ2 M;  4Z4E A;  4B1U B;  5GAD P;  2G8K A;  2HHX A;  3KWI A;  3BF1 A;  3O3F A;  1GOB A;  3LWL A;  3SUN A;  1ZXO A;  3AO1 A;  1I3A A;  3AAQ A;  3AVI A;  1IO2 A;  1KD1 O;  4LC9 B;  3O1W A;  4BRK A;  2P9K B;  3O9R A;  3J7Z O;  2QTD A;  3A5O C;  4FXD A;  3PO5 A;  1VAZ A;  1M90 O;  2QKB A;  4CZH A;  3C94 A;  4CJ4 A;  4GV9 A;  1NJZ A;  1U47 A;  1VRU A;  2XO7 A;  2P9S A;  4KHY A;  2P9S B;  4N41 A;  3ZX0 A;  3BZK A;  3T69 A;  3VQE A;  1O13 A;  2BAN A;  1G99 A;  4JEP A;  2F9W A;  1TYQ B;  5AQU A;  2W6L A;  4AHC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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