3CCSN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccsN00
1VQ7N 1YJWN 1Q81O 1S72N 4WFAL 5JVHL 3CMAN 1QVGM 1YJNN 3CCJN 4IO9L 5GADP 4UY8O 5GAHP 2OTJN 1OVYA 3CCRN 1KQSM 3CCEN 1K8AO 1YIJN 1VQNN 1K73O 2QEXN 1VQMN 4U67L 3G4SN 3CC4N 3DLLL 3CCUN 3I56N 3OW2M 4IOCL 2ZJRL 1W2BM 5GAGP 2OTLN 4WFNL 1QVFM 1VQ5N 1YHQN 1VQLN 1VQON 3G6EN 1KD1O 1VQKN 3CCVN 1M1KO 1N8RO 1VQ8N 1Q86O 3CCSN 5JVGL 4WFBL 1VQPN 3CCLN 3CC7N 3I55N 1YITN 1Q7YO 3PIOL 1YJ9N 2QA4N 3PIPL 3CD6N 5GAEP 3CCMN 5HL7L 1Q82O 2ZJQL 5MLCQ 3CPWM 1KC8O 1VQ6N 1NJIO 1VQ9N 3CCQN 1M90O 1ILYA 5DM7L 3J7ZO 4WF9L 4WCEL 3G71N 1VQ4N 5DM6L 2ZJPL 1K9MO 1JJ2M 3CF5L 3CMEN 3CC2N 4IOAL 5H1SQ 3CXCM 1YI2N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B9LA 3V9WA 1S72N 1U4BA 4WQ4C 4WYBA 2GEMA 1WN7A 2QWNA 3CJAA 4B1ZA 1YTAA 1NGBA 4DTJA 3SYZA 1A5VA 1FKOA 1W97L 4KV8A 5BRFA 4DV4K 3ITHA 3U3YA 1S1XA 4JI1K 4I6MB 3QBWA 4CEAA 3D0PA 3PO5A 3CETA 1ZBLA 2QTDA 3HXMA 3THXA 3G0ZA 3DMJA 3THYB 2ZJRL 4J2AA 1VSMA 1ZBHA 5M1QA 3QERA 4PL8A 3LWLA 4IDHA 2WUSA 4CEDA 3VQ6A 3OYMA 4LFAK 1NGDA 1RT7A 3AO1A 4GMJB 3ZSVA 4HUGA 4CCHA 1C1BA 4CI6A 1J5EK 2UYTA 4LF5K 3L4IA 1GOAA 1VQPN 3CCLN 1NGGA 2FBXA 3AAQA 2YCHA 3LDQA 4RW7A 4JKDA 4YHHK 4CD3A 4IXCA 5AFUA 1L3VA 3M3ZA 1NJXA 1XC3A 4BDPA 2QW9A 3TAEA 3DWLA 4FZZA 3AA5X 3EZWA 3UKUB 4OGEA 2W41A 2P9IA 1GLAG 3A5NC 2IGIA 1MU2A 4O5BA 5AQRA 3EZ5A 4DMNA 4I7FA 3NMUA 1S9GA 3I0SA 1NGIA 3CCQN 3DLEA 4CJ5A 2QK9A 2E5LK 1T6DA 2P5GA 1S1WA 3EY1A 2HBKA 3T1HK 1P8ZA 1XWLA 2Z1HA 4CFCA 1WOQA 2HMIA 2OZSA 4GV3A 3CYMA 3WQTA 1BIUA 3SJHA 1U2VB 1RDCA 1IBMK 4B3OA 3NH2A 3IRXA 3PY8A 4B9TA 3DRRA 1QE1A 3VQPA 1FXXA 2ASMA 3HBTA 2CGJA 4KB1A 4MO5A 3T7ZA 4N5SA 1TKTA 2O8DA 3O3HA 5T7BA 3E9PA 3ULDA 5EXWA 3R6MA 5CR4A 1E4GT 5FRNA 2AP1A 3Q7CA 2W40A 5M1PA 5A2QO 5J2PA 2JGUA 2A1RA 2E1ZA 3DLLL 4IEEA 4BREA 3OYGA 4JKCA 1J6ZA 2BTFA 4YNQA 3VEYA 3L3VA 3C7NA 1QHTA 5JMVA 4H5RA 1WBBA 3SV3A 2V7YA 2YHWA 1TUUA 3D2EB 3KHYA 3CCSN 2CGKA 1ZBUA 2P9KB 3O4QA 2PBDA 3VTIA 2F96A 4R5PA 1K8KB 1GLDG 2O8EA 1RTJA 4FPBA 3MEDA 2KKZA 5B8HA 4EHUA 5BRHA 3KLHA 2Y1IA 3ENHA 4BRKA 1QZ5A 5BRDA 5M1NA 4WQ4A 4XH1A 1VSHA 4DTMA 4ID5A 3VMFB 3OVNA 1NGJA 1JLCA 4DV2K 3OBWA 1Q82O 3CG7A 4BC5A 4F2SA 3MCPA 3TTFA 3AO3A 3EKUA 2D1KA 2ITGA 3P39A 3V1OA 5EY4A 2RE2A 1HQUA 1KFDA 3RRGA 3MAQA 2P9IB 4BRCA 4LF4K 1C0FA 1HLUA 5AQLA 4N41A 5IT9O 3SBTA 3ENBA 3JS6A 2IIRA 3MN5A 3J80O 4FJIA 5H1SQ 4DQSA 2D0BA 1YJWN 1B9DA 1RNHA 4AHRA 3ZSWA 1EKEA 4YOYA 3CMAN 1WAFA 3ZSRA 4X65K 5IWAK 4CVNE 3ZSYA 5KTQA 1NGFA 2CH5A 2P9UB 1HRHA 1VRTA 3ZEUB 5GIPA 3KWGA 4CGHA 2Q1NA 1K8AO 4C8NA 3K0SA 1L3SA 5AQUA 2ETJA 1IBKK 1NGAA 4H0XB 4AHCA 4KHSA 3LM9A 2XHBA 3QEXA 1C6VA 4A59A 3TARA 1F21A 4CZEA 4ILHA 3IFRA 3M8QA 4FCYA 1Z05A 4F3OA 1I3AA 3D45A 5AR0A 2X74A 1QVFM 4CBUA 4H0YB 4GV6A 1BA1A 3JXUA 4E7IA 3VENA 1RT2A 3L2VA 1KAZA 4FL9A 3VQBA 2GELA 2YKMA 4HVJA 4XEIA 3QETA 4BRGA 2IAJA 5CZ2A 4CJPA 4I2PA 4RCHA 5C2DA 3C7NB 4KH5A 4BR7A 2E88A 4WFBL 2CGLA 4DR5K 4FJGA 3LAKA 3R8EA 3I55N 4K25A 1YITN 3PIOL 4CEFA 3IUCA 3SQ2A 2VWJA 4HTUA 3HRGA 4CF9A 2BUPA 5AQXA 5CYMA 1S3XA 4MLEA 4KAZA 3AVBA 1X9WA 4JRQA 4GV9A 2HVIA 5LJVA 2G8VA 4PKIA 3OY9A 4NLCA 4JKEA 3JSMA 1HNZK 3RMAA 1S5JA 5MLCQ 4KO0A 4H0PA 1X9JA 3OYLA 3HT3A 1T7PA 3S3NA 1CZ9A 4RG8A 4FM0A 3PUFA 4XH4A 5M1KA 1SAZA 3DXKA 4FK0A 4BE0A 1XNRK 3LPUA 3QESA 1UAXA 3CFOA 2O8BA 5C42A 1WB9A 3ID6A 1NK0A 3L8BA 1C0GA 3LDNA 2E2PA 3MN9A 1DTTA 3ALYA 3M1FA 4LH4A 3LZIA 1YAGA 3KWIA 5BR9A 1YVNA 3HSCA 3KD1E 4FXDA 3UE5A 4CJ3A 3UKRA 2Z1JA 4KHPK 1D4XA 2YHBA 3O3GA 3RSEA 3ZETB 1RBUA 3I8DA 3VQDA 2JWLA 3SQ0A 5GADP 4FWRA 3NVMA 2RKIA 4KFBA 5FPNA 4ILGB 3RMCA 1Q8IA 1RTDA 1ZBFA 2H3GX 3NDKA 4CGFA 4HUFA 5F2RA 4BRDA 1TKZA 2XY5A 3IKMA 3TTDA 2IS3A 3T19A 1MA9B 1BUPA 2G8WA 1EXQA 1YTUA 3A0IX 3BUZB 3QDKA 3JYTA 3R3LA 4B3TK 1DT9A 3O9UA 4FJ8A 2GUIA 4JK7A 3HI0A 3AV9A 4JHDA 2WTUA 4IFVA 2E2OA 3CPEA 3TSUA 1V4TA 4MLHA 4N76A 3AGRA 4JLHA 4CEOA 5CZ1A 3VQ7A 1N5YA 4PY5A 2OA8A 5CY4A 3FZLA 4FYDA 2HNYA 2FBYA 4DR2K 4AQYK 2GTDA 4JD2A 2BDPA 1C1AA 1CXUA 3TAQA 3AVHA 3THWA 1BGXT 3RWUA 4FOIA 2KW4A 1OH5A 1SZ2A 3MXJA 1U47A 1CLQA 4LFBK 4NXNK 3EO3A 4OKKA 3M6GA 1SL0A 3GE1A 1HR0K 1BIZA 3P4IA 5FRMA 5AZIA 5C25A 3HM9A 1J54A 1KLNA 3V9SA 4FJHA 3P83D 4Q5VA 2VG6A 3ZYYX 3NGIA 1RT1A 5BREA 2EHGA 3CJ1A 4F9OA 1VSDA 4FJLA 5JICA 1IH7A 4BQZA 3OYDA 4GW6A 3DLKA 1JL2A 4W5TA 1LV5A 3ID8A 3VQ9A 5BPMA 3K9KA 3R1XA 1S1TA 3OYEA 3A5LC 4IWVA 1WBDA 5AZJA 4LD0A 2WOMA 3RVCA 2XY8A 4R79A 4CFBA 3U9ZA 4H03B 4KBOA 4BRPA 2O8FB 3RSEB 1HPMA 3DLRA 4B8AB 3O4NA 5BR8K 1HX1A 4QS7A 1P90A 3WT0A 1CZAN 3D6RA 4Y0WA 3OYAA 3SV4A 1RDUA 4DFJA 1FKPA 1DKGD 1MWMA 1JLQA 2E8AA 3ZX3A 4A5AA 4CJKA 5KGXA 4I6MA 2FSKA 2KQ2A 3SAHA 3QO9A 1EO1A 4DSIA 4LH5A 5AQZA 4DR3K 1SKWA 3THYA 5J2NA 1D9FA 4M42A 3VOVA 2WBNA 2PFUA 4LSNA 3QNOA 5KQDA 1VSLA 3K5MA 4B1VA 3CJ7A 3TPQA 2OYQA 3P5JA 4A57A 4IG3A 5KGWA 2O4GA 3K5LA 4EZ6A 1KAXA 5JLFA 1Y97A 2OANA 1GLCG 4CF2A 1XNQK 4JD2B 2NRXA 4O8UA 4OGCA 3NE6A 1KXPA 4CEQA 5AQYA 4DV0K 1RDDA 5C12A 2W6LA 2BANA 2GUPA 3ZT1A 4JI0K 3O9RA 4C1NK 4B9UA 4JRPA 3U9DA 2GBZA 3BGRA 4FJ9A 1NM1A 3DOLA 4HUEA 1S1VA 1QTMA 2WONA 2YI1A 4JNEA 4OPAA 2GWKA 1YT3A 1GLEG 4IJAA 1H1VA 2A41A 4CD1A 3L2UA 1Q81O 1NOZA 5KRSA 1ASVA 3MXMA 4WFAL 5C24A 3F9MA 1BL3A 3NH1A 3UIQA 3H3NO 4DS5A 1U2VA 3K5OA 3EEQA 5AJ3K 2UUBK 4Z4EA 4IJNA 1HUXA 3TANA 4J2EA 1KVBA 3HM8A 3K58A 4KPYA 3IG1A 3SNNA 3DM2A 1L5UA 2FF6A 4H0VB 1W7AA 5AZJB 3EN9A 3RTVA 4IFEA 1SS6A 5AQNA 3M5RA 3O3FA 4BE1A 2V7ZA 3CQYA 4IBNA 4XIUA 3HP6A 4FLZA 4CW7B 4NO7A 2HVHA 2NLXA 1U48A 3TWHA 1VQON 4B8CA 3OJUA 3ZLJA 2ITMA 2FC0A 4IDKA 3A2FA 2XY7A 4FWOA 1N8RO 4B3RK 4CGGA 4H0TB 2Q2RA 3EYZA 4CZJA 3AO4A 4CHOA 3O5BA 3QICA 4KTWA 4M3UA 2UUCK 4BQLA 4CZIA 2D0PA 3VETA 3QEIA 4L3QA 2HBLA 5JS2A 4E19A 3NH0A 3LP0A 3TAFA 3VA0A 2A1SA 3D2EA 4DTXA 2QXFA 3RMBA 4E7KA 4M3XA 1NBWA 2P9KA 4EP5A 4DB3A 2E6MA 1O1WA 3ZT3A 4DLEA 5HL7L 1K8KA 4CESA 3MDQA 3AVCA 5KPRA 1UA0A 2VGMA 2Q36A 3TR8A 4DR6K 2OPSA 3HP9A 2QKBA 1ILYA 4NCAA 2UXBK 2IC3A 1T05A 5DM6L 3J81O 3ZT2A 4GVMA 4BRIA 3Q7BA 4BWMA 2D0OA 1Q9YA 2WFBA 3K9JA 5ADXA 4CJFA 3VPZA 3THVA 4DFPA 4DS4A 4OO1J 2HF4A 4BR5A 4YORA 3V9XA 4IFYA 1W0HA 4F2RA 1BCOA 1JCFA 4FLXA 4Z0UA 5SWMA 1RGIA 4B1UB 1ITGA 4JK8A 4Z4HA 3VQ5A 1LCUA 4DQRA 4FK4A 3MXIA 1BQNA 3CHWA 4B9MA 1MDUB 1HNWK 3M8SA 3HO1A 3S3OA 3M8RA 3V4IA 3LPTA 1J53A 4FJMA 1TK5A 1UA1A 2P9UA 3PX0A 2F8SA 3ZEUA 5GAGP 3VQ4A 4DTPA 5AQIA 1HJOA 4FPAA 3HPOA 2HNDA 4KHUA 3CQXA 1S6QA 1VK0A 3L0QA 3TAPA 4PUOA 3HJFA 3HK2A 4OPHA 1VQ8N 3O4WA 4DTRA 1D8YA 2F4VK 2FLOA 5LL6Z 2ZWHA 3AO2A 1RDAA 1HMVA 3KK3A 1TL1A 3QLHA 4I9LA 4FK2A 2JLEA 1QSLA 2QXLA 4W5QA 2QI2A 4BVPA 2F8TA 3MX5A 3C95A 3NGYA 3WUHA 3PX6A 3VF4A 3AARA 2DPNA 4HTLA 1IG9A 2XRIA 4JAXA 4RW6A 3ZSXA 3U8XA 1VRUA 3NF9A 3E9OA 3L3UA 1NKEA 2RN2A 1S1UA 4BRFA 4LF6K 4E7JA 4JKHA 1N6QA 4FJNA 4FSVA 4M41A 3J7ZO 1G15A 1BOTO 1BWFO 1K6YA 4QS8A 4Y1DA 3PLAA 4F4KA 3OHRA 5TKYA 1Z26A 2HSTA 4CFAA 4FLVA 4MDBA 1TAUA 4JKAA 3DI6A 4RW8A 3GOIA 1XUPO 3S3MA 3A5MC 3ZSZA 4JEPA 3EL2A 3SUOA 2KHOA 1FK9A 3VQEA 3MEEA 3FZHA 4IO9L 3IDHA 3SJJA 5AQSA 1NGCA 2YV0X 5HBMA 5GAHP 1IKVA 1OVYA 1QQNA 4DKWA 5JS1A 4FM1A 4ILJA 3ZX0A 3KJVA 1BHLA 1X9MA 1HQEA 4B9VA 4U67L 1ESVA 3DYAA 2OCEA 4AH9A 3ZETA 4QS9A 4DTOA 2VWKA 1TV6A 3VF2A 4IOCL 4PKHA 1W2BM 1B92A 1KTQA 3C94A 2OTLN 3LZJA 3KVGA 3KLFA 4E7HA 4KB0A 1SL1A 1VAZA 1VQLN 4F8RA 1KD1O 4PQUA 4X66K 3DLBA 4BY9C 1ZBIA 1LAWA 4KI6A 4JI2K 5AQKA 4CJ7A 3KK1A 1HNXK 2Z1IA 2A40A 1YJ9N 4NYNA 4OPJA 5ADXH 3AY9A 5I9EB 2WC9A 1JLBA 4Z4FA 3J7YP 3QEWA 5FLXO 1IBLK 4JI3K 2D4WA 3VEZA 2VYPA 3OS2A 2Q0RA 4JKGB 2Q31A 4LC9B 1HKGA 3D7EO 4CGJA 4DSEA 4OLAA 5AQVA 4Z4CA 4J8FA 2UXCK 4YDUC 1N33K 4KH4A 1WSGA 3NGZA 4WCEL 3LP1A 2P1JA 4LY7A 1JJ2M 4LF9K 1XI1A 2Q97A 3CC2N 4CBWA 3TI0A 3AGKA 1RTHA 5TKWA 1T3VA 3NBPA 4EAHD 3E1YA 4DSJA 1WSEA 3VERA 5EVZA 4CE9A 4BRAA 1NK5A 1ZXOA 5JVHL 4BRLA 3WNHA 2IOCA 1NK9A 2D0CA 3VGKA 1L3UA 2DFHA 5EX5A 2G8HA 3CIPA 3OYKA 3ASMA 4YOWA 4CF8A 1KQSM 3CCEN 5LJWA 3PX4A 2E1YA 2P9PB 1QSYA 1VQMN 3LM2A 3C0BA 3BEXA 3CI5A 3KKSA 4BG9A 4DQPA 3B6OA 4ZTFA 4ELTA 3CERA 2I5JA 4KH6A 2IDOA 2E6LA 3IS9A 4F3TA 3MWPA 3AVMA 2O8FA 4ICLA 1VQ5N 1CXQA 3J8AA 4FVMA 3CJ9A 1J9AA 1YHQN 3VEXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VQ7 N;  1YJW N;  1Q81 O;  1S72 N;  4WFA L;  5JVH L;  3CMA N;  1QVG M;  1YJN N;  3CCJ N;  4IO9 L;  5GAD P;  4UY8 O;  5GAH P;  2OTJ N;  1OVY A;  3CCR N;  1KQS M;  3CCE N;  1K8A O;  1YIJ N;  1VQN N;  1K73 O;  2QEX N;  1VQM N;  4U67 L;  3G4S N;  3CC4 N;  3DLL L;  3CCU N;  3I56 N;  3OW2 M;  4IOC L;  2ZJR L;  1W2B M;  5GAG P;  2OTL N;  4WFN L;  1QVF M;  1VQ5 N;  1YHQ N;  1VQL N;  1VQO N;  3G6E N;  1KD1 O;  1VQK N;  3CCV N;  1M1K O;  1N8R O;  1VQ8 N;  1Q86 O;  3CCS N;  5JVG L;  4WFB L;  1VQP N;  3CCL N;  3CC7 N;  3I55 N;  1YIT N;  1Q7Y O;  3PIO L;  1YJ9 N;  2QA4 N;  3PIP L;  3CD6 N;  5GAE P;  3CCM N;  5HL7 L;  1Q82 O;  2ZJQ L;  5MLC Q;  3CPW M;  1KC8 O;  1VQ6 N;  1NJI O;  1VQ9 N;  3CCQ N;  1M90 O;  1ILY A;  5DM7 L;  3J7Z O;  4WF9 L;  4WCE L;  3G71 N;  1VQ4 N;  5DM6 L;  2ZJP L;  1K9M O;  1JJ2 M;  3CF5 L;  3CME N;  3CC2 N;  4IOA L;  5H1S Q;  3CXC M;  1YI2 N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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