3CCUN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2482c
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccuN00
1VQPN 1ILYA 3CC7N 1VQ9N 5H1SQ 3CCVN 1Q82O 3CC2N 4IOCL 5MLCQ 3CCRN 1K9MO 3I55N 3G4SN 3J7ZO 3CCMN 1KD1O 1Q86O 1VQON 1JJ2M 1KC8O 1KQSM 1Q81O 1VQLN 5DM7L 3CF5L 3G6EN 1M1KO 2QEXN 4WFNL 1OVYA 4WF9L 1S72N 1YJWN 2ZJPL 3CPWM 1YJ9N 1YHQN 1VQ8N 5GAEP 4U67L 5GADP 1YI2N 1N8RO 1VQKN 5GAGP 1VQMN 3DLLL 3CC4N 3CCQN 5JVGL 3PIOL 1Q7YO 1VQ4N 3CCEN 1QVFM 4IO9L 3CMAN 1NJIO 3CD6N 3I56N 3CCSN 2OTJN 1W2BM 4IOAL 4WFAL 5GAHP 3CCJN 1VQ5N 3CMEN 4WCEL 4UY8O 1VQ6N 2ZJRL 3G71N 5HL7L 3CXCM 1YIJN 1VQ7N 3OW2M 1VQNN 4WFBL 5DM6L 1K73O 1QVGM 3PIPL 2QA4N 3CCLN 1YITN 5JVHL 1K8AO 3CCUN 1M90O 1YJNN 2ZJQL 2OTLN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQPN 2YJFA 1NGAA 1JLBA 3ZEUB 4FJGA 2P9PB 1VQ9N 3ZX2A 4KHSA 2W6KA 4E7KA 3TI0A 3GE1A 4JD2B 3NF7A 4KRFA 3HM8A 4JI6K 4CJWA 4M63C 2QK9A 1K6YA 3UB5A 2F7TA 3ISNC 3IUCA 4PHTX 4FJNA 3K9JA 2Q0RA 3TAGA 2YHXA 1JLGA 3N4QA 2B6AA 5BRHA 1VSDA 2G8KA 4FJIA 1NG9A 4I2PA 2E5LK 5BN8A 3O80A 4DSLA 2FF6A 3VGMA 2CH5A 5AFUA 1NJWA 1OVQA 1QHAA 4CI6A 4HTUA 3AV9A 2KQ2A 3TSQA 4CJRA 2ZJPL 2V51B 2QWNA 3RMDA 3CJCA 3TU5A 2ZGZA 2P9SB 4WQ4A 1DLOA 4Z0UA 1D9DA 1YAGA 4H4OA 4YOUA 1VSHA 4RWTA 3VQ7A 2OA8A 1HNIA 4FW1A 2HBJA 3HVTA 4C8KA 1Z25A 1Y97A 3VERA 4BRHA 1KFSA 3FZHA 4CGGA 2DFEA 1S22A 1Q8IA 2IDOA 1BOTO 4WCEL 4LF6K 4DUZK 2HVIA 1I3AA 5HL7L 2F8SA 4YOTA 3P4IA 1UA0A 4CK3A 2HBLA 4JV5K 3ZEUA 4M7YA 2P9PA 3NE6A 1YITN 3QBWA 3SMSA 3DLHA 4BRPA 1BCMA 1T44A 4JD2A 3AVKA 3IFRA 5CHIA 1JXEA 2JWKA 3MDQA 4E1NA 1NK9A 4AH9A 1HX1A 3K5OA 4FWLA 4CEDA 2ASOA 4DKWA 3S9HA 2F9TA 4BGAA 2EWSA 4HTLA 4FJLA 3K2PA 1QSSA 4DF8A 4KO0A 3G10A 4CEAA 2Z1HA 4K0KK 3VENA 4LFCK 3ZT4A 4KH5A 3SQ1A 1L3SA 4BGBA 1U48A 3WXJA 4CZIA 5ADXA 1EQYA 4BR2A 2P9SA 1KQSM 1TAUA 2RHKA 2D0CA 3QETA 3HP9A 2A1SA 4H8KA 4MLEA 2QTDA 4YHHK 3MMVA 1HYSA 3LDSA 4WFNL 2ASMA 4JS4A 3OJSA 1Z26A 3TAEA 4KI4A 4JKEA 1P8ZA 3HO1A 3L4QA 4FJ8A 4OO1J 1HMVA 4LY7A 2CH6A 2D0PA 4YOWA 3OYAA 2D4WA 4WQ4C 3NH2A 4ELVA 4BR0A 2DFHA 5CYMA 3CC4N 3VF6A 5TKYA 3PIOL 1UAXA 1V4TA 1DGKN 3CCEN 1BQNA 4DR3K 3O4QA 3LZIA 4Z4IA 4Y0WA 4DU1A 3CD6N 4IOAL 1RILA 2YNIA 3PY8A 4C1NK 4ELUA 2E88A 2YHWA 5HRNA 1XWLA 3EZ5A 1B9DA 5BR8K 4JRPA 5AZIB 3F73A 3MAQA 5AQVA 4CF8A 3SNNA 4LF8K 2IGIA 4CZJA 4BC5A 3O3FA 3R9PA 3VQAA 5AQSA 2RF2A 3R6MA 4KHNA 5T7BA 4NCAA 3PV8A 3R1XA 4FLVA 1A5WA 3OYKA 3M8QA 2A5XA 2JGUA 4PKIA 1HYVA 3LWLA 3H46O 1MWKA 3C6AA 1DKGD 4BRAA 5B8HA 1NK0A 4R5PA 3OYCA 5FRNA 4H5RA 4BC2A 2FBTA 2Q97A 1NGFA 3A5OC 4IOCL 1C1AA 3PO5A 4K25A 3QFUA 4OX9K 3PX6A 3IMXA 1L3UA 5E41A 1BA0A 3HL8A 4IEIA 4JI8K 4FLZA 1NOZA 1Q81O 3O08A 2OPQA 4RG8A 3VF4A 1XC9A 4KB1A 4Z4FA 1QSLA 2W41A 2RE2A 4HVJA 4ELTA 3TARA 3TAPA 1NJZA 4X65K 1U6ZA 3HPOA 4BR5A 5J2MA 4H5WA 2HHTA 5KTQA 5F2RA 1QQNA 2P9NB 4KI6A 3CQ8A 3PSFA 3VETA 4ID1A 1BI4A 3UE5A 2PYLA 3CYMA 4BG8A 4OPAA 2IC3A 4KKOA 5BR9A 1T6DA 3A5NC 5AZIA 3MXMA 4JLHA 3V9SA 1RBSA 5KRTA 1NGIA 1NGEA 2VG7A 2YNFA 3ID6A 4CEFA 3C95A 2VGMA 4DR5K 4LF4K 4BDPA 1C1CA 3FGUA 1NU0A 5EU7A 4B9SA 3MCPA 1JLFA 4FXDA 2V7ZA 3H45C 2P5OA 4QOZB 1RTJA 3MWPA 3VQCA 3HK2A 4K43A 4FO0A 2O8FB 2GWKA 2F9WA 4HUGA 3O9RA 4U7BA 3DRRA 1OH5A 4IFYA 3L6QA 4JS5A 4EFHA 3SCXA 4DR2K 4CE9A 4BRFA 3SZ2A 3D2EB 4ILHA 3CQYA 1U2VB 4ZTJA 2F96A 3KLGA 1S6QA 3LDLA 1LAVA 3NAEA 1NBWA 1A5VA 4F4KA 5K14A 4A5AA 2CGKA 2BDPA 3W3DA 3O1BA 2P1JA 3SAGA 1JJ2M 4RW6A 2YHAA 4JI0K 1NM1A 3RMCA 4DQRA 4DFMA 2HHQA 2P9NA 5AQLA 4CZGA 5DM7L 1YUWA 1X1PA 3J80O 4JYAK 2UYTA 3BUZB 3M5RA 1B92A 4CHYA 4L8RB 4CHQA 2WONA 1YJ9N 1IJJA 4JI2K 1SS6A 4F2RA 4N76A 1VQ8N 3NFAA 4CJLA 4IEEA 2WC9A 2V52B 3BP8A 1KLMA 1KSPA 3GBTA 1ZC6A 2HHWA 1HQEA 3GG4A 2VGNA 1J6ZA 1HNWK 3T7ZA 1YT3A 1KFDA 4B1XB 1SQKA 3ZSXA 3O5BA 4B1VA 1JKHA 4CFAA 3TR8A 3ZX3A 4DV7K 4LH5A 2E20A 2Q31A 1X9WA 3DLBA 1C0FA 1VQ5N 2O8FA 3GL1A 1S3XA 4BRCA 4DR4K 2EHGA 1SUQA 2HNDA 1NKEA 1FKPA 1OKJA 1NMDA 5J1EA 2FBXA 4CJPA 5GINA 3TSUA 1KTQA 4B1ZA 1WSEA 5BRFA 4KBOA 3DLGA 5EY4A 1Q18A 3D2EA 2BH1A 4DV5K 4CGHA 4CFBA 1U2VA 3IAYA 5AQIA 2Q3SA 3EKSA 3ATVA 3TTDA 4CFDA 4M3TA 4E7HA 2OPSA 3T3FA 3PX4A 2ZE2A 1RDAA 1S1VA 3V81A 3K59A 4B9QA 3WXIA 4KHQA 4IKFA 4I2QA 4FJ5A 4HUEA 4PKHA 1ITGA 3L3UA 3BF1A 3OS0A 3V1RA 3MXJA 3J7ZO 1NK5A 4LSNA 5TKWA 1VAZA 5BPLA 4OPJA 5I42A 5LMUK 1BG3A 4GVMA 3DMJA 4W5QA 3O3HA 3D0PA 4GMJB 3QNOA 1J5EK 5C42A 1HPZA 3O4WA 2QEXN 3RRGA 1NMNA 2BUPA 3EN9A 4BR9A 3CERA 5AJ3K 4WF9L 4B1YB 4AM6A 2WFBA 1I39A 4PL8A 3F9KA 4DV1K 4AILC 1CZBA 2GTDA 3V9ZA 3O9QA 1NK7A 2ZWHA 4E1MA 1QHTA 4B9UA 2OZMA 1Z6RA 4B3OA 1ZBFA 4HCCA 3AVAA 1J9AA 4DTRA 3M8RA 1RTHA 4CEOA 2XO7A 3I8BA 4LF9K 5KPRA 1BIUA 5J2PA 2KFZA 3ZSWA 1ASUA 4CVNE 1XI1A 3V9XA 3M3ZA 5C0YA 1R0AA 1IKYA 1VK0A 2KLAA 3HJFA 2OTJN 4O0JA 1W2BM 4JKBA 1SKSA 3KTQA 1NKCA 2HMIA 3G25A 2O8BB 4FZYA 3AARA 4JKHA 4E3SA 3A0IX 2KZZA 1LW2A 3LP1A 1SKRA 1NJXA 3HYFA 3C0BA 4BDYA 3CXCM 4E19A 4BRQA 3O9UA 3SI6A 1SL0A 1J53A 3S41A 1WAJA 4DQIA 4OGEA 3CCLN 4C8OA 5E84A 3WQUA 2P5GA 3MN5A 1JLEA 4CF2A 4DV4K 3LP3A 2QWPA 2HBMA 4KHYA 4J2AA 1IKWA 4FK2A 1BIZA 4DQSA 1ILYA 4BQLA 2JLEA 5CE3A 3CC7N 2QXLA 4F2SA 3LANA 2Y1JA 1E4FT 2I7PA 1RT3A 4RCHA 1HUXA 2ITGA 5AQWA 4HCBA 5MLCQ 1E3MA 3AO5A 4LF7K 4G1QA 1BCOA 3KWIA 1Q86O 4NYNA 4FL9A 4NCGA 5KQ8A 4W5NA 3V9WA 4PL7A 1RDUA 2AP1A 2BANA 3SLCA 4PY5A 3S3MA 4CBWA 4DTJA 1IBLK 4BE0A 3C6UA 3DXKB 1SAZA 4FJ9A 1RTDA 4CBUA 1HKCA 5HRSA 4CZLA 3K57A 3L8BA 3QEPA 1IBMK 5BREA 4OKEA 2D0OA 4GKJK 1ZBHA 3SPYA 3DJCA 2F8TA 3KVGA 4JI7K 3AO4A 3O1WA 4YY3K 2CGLA 4LFBK 3T1HK 3KKRA 3PUFA 4XEIA 4B9LA 4Y1DA 2O8BA 4YOXA 2YHYA 3KLIA 4O55A 4QS8A 1OH8A 3KK7A 4NYFA 2OANA 3QEXA 3O9TA 4FPBA 3H08A 1LCUA 3MX5A 1F21A 4E7LA 3AY9A 3RMBA 4K42A 2NRHA 4BC3A 4FJ7A 1VSIA 4WFAL 3LALA 2A41A 3FLCO 3ZT0A 1VQ6N 4IFEA 3LM2A 2NNWA 3L0QA 1W9HA 1G99A 1VSJA 5AQGA 3ZETB 1HKGA 4IG0A 1QQMA 1BL3A 1UOCA 4CJKA 2NRXA 1XHXA 5AR0A 4GV6A 1GLAG 1BWFO 1RGIA 2E4LA 4CGDA 4BY9C 3M1FA 3LP0A 4CECA 1KAXA 3QMLA 4A62A 3AO1A 3QERA 4QCLA 3K58A 5AQTA 1RTIA 4AHSA 3LAMA 3C6TA 1RBTA 2UUAK 4B3RK 1L5UA 3DWLA 4DTOA 4JI4K 3DXKA 3B6OA 3BZKA 2QWOA 4G9ZA 3A8YA 4MFBA 3I55N 1VSEA 2VWBA 4QS9A 3H1QA 3QICA 5FDLA 4FJJA 5LMNK 5KPZA 2DPNA 2HF4A 3P83D 2QWLA 2HHXA 2PY5A 5IWAK 4BACA 4FWOA 3KHYA 5EX5A 4FJKA 3ITHA 3K5NA 3J81O 2ASPA 4DTNA 3VA0A 5AQOA 3HZ6A 3J7AP 3VQQA 3AVLA 1XHZA 4ICLA 5AQMA 5C24A 4ILGB 2Z1GA 4RTFD 3MN6A 4FK0A 1S9EA 1G15A 3LZJA 4BVOA 1VQ4N 2VCPA 1U49A 3ENBA 5BPMA 5BPNA 3ZETA 4BRIA 3I56N 4IFVA 1RDBA 3HPHA 4H5TA 4FWKA 3CIPA 2YV0X 4NLCA 1QZ6A 1WSHA 1N5YA 5GIOA 2HW3A 4BE1A 3NF6A 4EIAA 4DQPA 3W0LA 5M1OA 3WXMB 3AVGA 3QNNA 1ZBUA 4GY2B 2RPIA 3U9ZA 1C6VA 3HBTA 3T69A 1MA9B 3ULEB 2R7YA 5JVHL 3V9UA 1TK8A 4CJ7A 1TV6A 1VRTA 3MN9A 3CCUN 4GW6A 3H1VX 1D9FA 3DM2A 3ZYYX 5IT9O 3AVNA 2P51A 2HVHA 3A2FA 4YDUA 1TKDA 2XY7A 4FM2A 4Z4HA 5JLFA 4CJ4A 3JYTA 2O4GA 1WNSA 3GDQA 5AQYA 1JLAA 3OVNA 5JS1A 1LV5A 4JKDA 4CJQA 4F8RA 4KHWA 3THXB 4MDAA 1U4BA 3SJJA 5JLHA 4H0YB 3RRHA 1Q9YA 4A2BA 3VEZA 4AHCA 4Z4EA 1C0MA 1RCHA 4JK9A 3I8DA 5CZ2A 4CJVA 4PA1A 4RW8A 4K8ZA 4H0XB 2IS3A 1W0HA 4FM1A 5AFUH 3WNFA 4CGIA 3VGLA 1XC3A 1UWBA 3SV4A 3JAMO 4FLTA 3ZX0A 1GLFO 3RTVA 2OCEA 1GOBA 4A57A 1VHXA 4CZEA 2UUBK 1MDUB 3KLHA 4H03B 2VWJA 3AAQA 4AHRA 3SQ4A 3VOVA 4DFPA 5I9EB 3LWMA 2XHBA 4OKKA 1YF5L 3V1OA 3OYGA 3U3YA 4DTMA 5FPDA 1X9JA 3VN5A 3HI0A 4FVMA 4NCBA 1CXQA 1TK0A 4M3XA 4J2EA 1LAWA 4JKGB 1TAQA 4H5VA 2NRTA 5CR4A 4N5SA 3KD5E 1RBRA 4BC4A 3ULEA 3WXLA 5FPEA 2ZQBA 3P31A 4DTSA 3AO3A 4B3SK 1T05A 4FW2A 1S1XA 2A40A 3HM9A 3MEEA 2FSKA 4KH6A 3KJVA 2NRWA 1VQ7N 4WFBL 1TYQB 1WOQA 4OKJA 3SYZA 3U4LA 3PIPL 2D0BA 4CHZA 4I6MB 4MLHA 4BWMA 3NGIA 3THXA 4JNEA 1K8AO 2WBNA 1IV0A 5KI6A 1JL1A 2W42A 2HHSA 2GBZA 3CJAA 1DTQA 3TPQA 4JKCA 4YDUC 2ETJA 3O6WA 2FBVA 1KVAA 3A5LC 4IJAA 1K8KB 1E4GT 4CF0A 4CD3A 3QEWA 4CF9A 4KHPK 4B9TA 2KHOA 1N6QA 4A61A 2V7YA 1QSYA 5H1SQ 4BWJA 4DWIA 2VG5A 1IKVA 2UXBK 4C8NA 3VQ5A 3VESA 3CC2N 1LW0A 3BEXA 1CZAN 3U8XA 1BHLA 1X9MA 5ADXH 1IG9A 1BGXT 5FRMA 2D0AA 4CESA 3SAHA 2BTFA 5KQDA 1BQMA 4CHOA 4JHDB 1ZYQA 1VQLN 1U47A 2DTUA 3CFOA 1S1WA 1C1BA 1M1KO 4M3UA 3QFPA 3AVFA 3KK1A 2HHUA 5J2NA 2UXCK 2B5JA 3E66A 5EVZA 2Q2RA 1TK5A 1CXUA 1JXBA 4DV2K 4CEZA 3QIOA 3PX0A 4JKGA 2A1RA 4DS5A 1WSGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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 1VQP N;  1ILY A;  3CC7 N;  1VQ9 N;  5H1S Q;  3CCV N;  1Q82 O;  3CC2 N;  4IOC L;  5MLC Q;  3CCR N;  1K9M O;  3I55 N;  3G4S N;  3J7Z O;  3CCM N;  1KD1 O;  1Q86 O;  1VQO N;  1JJ2 M;  1KC8 O;  1KQS M;  1Q81 O;  1VQL N;  5DM7 L;  3CF5 L;  3G6E N;  1M1K O;  2QEX N;  4WFN L;  1OVY A;  4WF9 L;  1S72 N;  1YJW N;  2ZJP L;  3CPW M;  1YJ9 N;  1YHQ N;  1VQ8 N;  5GAE P;  4U67 L;  5GAD P;  1YI2 N;  1N8R O;  1VQK N;  5GAG P;  1VQM N;  3DLL L;  3CC4 N;  3CCQ N;  5JVG L;  3PIO L;  1Q7Y O;  1VQ4 N;  3CCE N;  1QVF M;  4IO9 L;  3CMA N;  1NJI O;  3CD6 N;  3I56 N;  3CCS N;  2OTJ N;  1W2B M;  4IOA L;  4WFA L;  5GAH P;  3CCJ N;  1VQ5 N;  3CME N;  4WCE L;  4UY8 O;  1VQ6 N;  2ZJR L;  3G71 N;  5HL7 L;  3CXC M;  1YIJ N;  1VQ7 N;  3OW2 M;  1VQN N;  4WFB L;  5DM6 L;  1K73 O;  1QVG M;  3PIP L;  2QA4 N;  3CCL N;  1YIT N;  5JVH L;  1K8A O;  3CCU N;  1M90 O;  1YJN N;  2ZJQ L;  2OTL N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VQP N;  2YJF A;  1NGA A;  1JLB A;  3ZEU B;  4FJG A;  2P9P B;  1VQ9 N;  3ZX2 A;  4KHS A;  2W6K A;  4E7K A;  3TI0 A;  3GE1 A;  4JD2 B;  3NF7 A;  4KRF A;  3HM8 A;  4JI6 K;  4CJW A;  4M63 C;  2QK9 A;  1K6Y A;  3UB5 A;  2F7T A;  3ISN C;  3IUC A;  4PHT X;  4FJN A;  3K9J A;  2Q0R A;  3TAG A;  2YHX A;  1JLG A;  3N4Q A;  2B6A A;  5BRH A;  1VSD A;  2G8K A;  4FJI A;  1NG9 A;  4I2P A;  2E5L K;  5BN8 A;  3O80 A;  4DSL A;  2FF6 A;  3VGM A;  2CH5 A;  5AFU A;  1NJW A;  1OVQ A;  1QHA A;  4CI6 A;  4HTU A;  3AV9 A;  2KQ2 A;  3TSQ A;  4CJR A;  2ZJP L;  2V51 B;  2QWN A;  3RMD A;  3CJC A;  3TU5 A;  2ZGZ A;  2P9S B;  4WQ4 A;  1DLO A;  4Z0U A;  1D9D A;  1YAG A;  4H4O A;  4YOU A;  1VSH A;  4RWT A;  3VQ7 A;  2OA8 A;  1HNI A;  4FW1 A;  2HBJ A;  3HVT A;  4C8K A;  1Z25 A;  1Y97 A;  3VER A;  4BRH A;  1KFS A;  3FZH A;  4CGG A;  2DFE A;  1S22 A;  1Q8I A;  2IDO A;  1BOT O;  4WCE L;  4LF6 K;  4DUZ K;  2HVI A;  1I3A A;  5HL7 L;  2F8S A;  4YOT A;  3P4I A;  1UA0 A;  4CK3 A;  2HBL A;  4JV5 K;  3ZEU A;  4M7Y A;  2P9P A;  3NE6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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