3CCVN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2616a
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 47
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccvN00
4U67L 3CCEN 4IOAL 1VQPN 5DM7L 5GAEP 3CCJN 5GAGP 5GAHP 1VQLN 1VQKN 4WFBL 1VQ4N 1YIJN 3I55N 5GADP 1Q82O 1NJIO 1YJWN 3G71N 5HL7L 1VQNN 4UY8O 1YI2N 3CXCM 3CCQN 4WFAL 3PIPL 3I56N 1YJNN 3G6EN 1VQMN 1M90O 2OTJN 1KC8O 2ZJPL 1KD1O 3CCRN 1ILYA 1Q86O 5JVHL 4IO9L 3CMAN 3CD6N 2OTLN 3PIOL 1YHQN 3OW2M 3CCMN 1VQ6N 5JVGL 1YITN 5DM6L 2QEXN 4WFNL 3J7ZO 3CC4N 2QA4N 4IOCL 1K73O 1OVYA 1VQON 1QVGM 3CCLN 3CPWM 3G4SN 3CC2N 1M1KO 1W2BM 5H1SQ 1KQSM 3CC7N 1VQ9N 1S72N 4WF9L 3CCVN 1YJ9N 1VQ5N 2ZJQL 1Q81O 1VQ7N 1VQ8N 5MLCQ 1N8RO 3DLLL 4WCEL 1JJ2M 3CF5L 3CCUN 1QVFM 3CCSN 1Q7YO 1K9MO 3CMEN 1K8AO 2ZJRL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GDQA 5LJVA 4BR7A 4CHNA 3U3YA 5BR9A 3JS6A 2X6SA 4JHDA 4KHSA 2EWSA 4WQ4C 3G10A 4KI4A 1WSFA 3DI6A 4IEIA 4WFBL 3HVRA 4M41A 2OYQA 4GVMA 2R7YA 1RTDA 2Y1IA 2Q0UA 3EKSA 3CQXA 1OKJA 2X6NA 3CM6A 4JKEA 3THVA 1DTTA 5T7BA 1RT4A 1HQUA 3SK3A 4JHDB 4B1XB 3U9DA 3MEEA 2UXDK 3SUPA 1Z6RA 2OTJN 4CHOA 4BQLA 1WSIA 3VQCA 4CJ3A 3EZ5A 3ATVA 1Q86O 4M42A 4GV3A 3MEDA 3BDPA 4M7XA 1B92A 3NFAA 3W3DA 1KAXA 3OYNA 4PL8A 1MWMA 5AQVA 3K58A 2WTUA 3K9JA 4KPYA 5CZ1A 4CZIA 3L0QA 5JVGL 3VOVA 4LFBK 3WEEA 4GW6A 3VQAA 3C6HA 3E01A 4IOCL 5FPDA 3ITHA 4FYDA 4CEFA 4N5SA 1HLUA 2FBTA 2E2QA 2GBZA 3LZJA 3ZT4A 3T19A 4E0DA 4CZLA 4BE1A 1BCOA 2F8TA 3IMXA 4DF8A 3O08A 4FJGA 3BY5A 3ID8A 4BG8A 3S9HA 4BROA 3V9XA 5FLXO 4HCCA 2EHGA 5AQSA 1KTQA 2A41A 1TKDA 3QESA 3GG4A 5BR8K 3DLEA 4DQQA 3C6AA 1GLBG 4Q5VA 2DFFA 3H3NO 1Q9YA 1TGOA 5FPMA 2GWKA 4CEEA 3OBYA 1WBBA 3O4QA 4H8KA 4JI7K 4ICLA 3VQ6A 1Q7YO 4H5WA 2P1JA 1RDCA 3HPOA 4A5BA 4OO1J 4FWNA 1VHXA 3WXKA 4DHYA 5F2RA 3MN7A 4CE9A 5DM7L 3SV4A 3AV9A 1SKRA 3C7NB 1Q9XA 4ID1A 3V4IA 3NGIA 4Z4EA 4X65K 5AQHA 3SNNA 3ZEUA 4G9ZA 2KW4A 4PY5A 2X78A 1G15A 2P51A 1C1CA 4AILC 3PV8A 3JSMA 3NF8A 3H6EA 3KVGA 4JLHA 4JK7A 5EX5A 3NF9A 3D2FB 2E20A 5BPNA 2FBVA 4R79A 1RBSA 5HRRA 1M90O 5BPLA 1OVQA 2VCPA 4IG0A 5C0YA 1A5WA 1D9FA 1E4GT 4FWPA 4IO9L 2P9IA 3ZEUB 4CVNE 3DRRA 4MLEA 3TSUA 2UXBK 4BVOA 3IG1A 1ZBHA 4FWSA 4CGIA 3VEVA 3DJCA 5DM6L 2PYJA 2RHKA 4FOEA 4BRAA 5KTQA 4B1ZA 3CQ8A 1BCMA 2ZE2A 4DV0K 4IBNA 1QQCA 4DV3K 3CCLN 5ADXH 3LM9A 1EWQA 3KD1E 1XI1A 1NK7A 3AAQA 2P9IB 1Z26A 1M1KO 3BF1A 2YJEA 1NGCA 1RDAA 1BI4A 2W40A 3FE1A 1KQSM 1HMVA 3O6WA 1BU6O 3L2QA 5AQGA 1IKYA 2GUIA 3GBTA 2QWRA 1GLEG 3A8YA 4H5TA 3L8BA 3JXUA 4JN4A 4FVMA 2XO7A 3TAQA 3IRXA 4JAXA 3P5JA 3HOTA 2HF4A 4PA1A 2XRIA 4H5NA 2UYTA 4KB1A 2IC3A 5KGWA 1HR0K 4I9QA 5KRSA 1N8RO 4JNEA 1BI4B 1X1PA 4FJKA 2ASPA 4BRHA 4JI0K 5I42A 2A5XA 1XHXA 4BC2A 1WOQA 4PKHA 1XC3A 1N33K 4DWIA 2HHUA 3MAQA 3QNNA 4CZMA 4JKDA 2ATQA 4FPAA 5HBMA 5M1NA 3MCPA 4AF1A 1U47A 2D4WA 4BG9A 4W5OA 4Z4CA 3O1WA 2GTDA 1WSJA 4B9TA 4E1NA 3HM9A 3SCXA 3VTHA 1X9SA 1VQPN 4PHTX 4DR5K 3LM2A 5LY3A 2UU9K 5CR4A 4R5PA 1VQLN 3GOIA 3L2RA 4DV2K 1Q82O 4DTNA 4PKIA 4CCHA 1C6VA 1NKCA 5AQTA 3VENA 4V19S 3O9TA 3P38A 4DFJA 1EXQA 4L3QA 1V4SA 4YOUA 4CESA 4JK8A 1ILYA 3QIPA 1A5XA 1GLJO 1P90A 4NLBA 5ADXA 4F3OA 1BA1A 2W6KA 2P5OA 4C8OA 1JCFA 3AVJA 1IKWA 5D3GA 3LP1A 4J2AA 1ATSA 5CHIA 4CGHA 3NDKA 3QBWA 4IJNA 3NF6A 4AHVA 2KTQA 1NJZA 2FLOA 2QI2A 5ELZA 4A5AA 3EL2A 4DF4A 1L3UA 1OVYA 4HVJA 3RMCA 2FBXA 1NGGA 4DTSA 4CF8A 3HPHA 1Z05A 4CHQA 1NMDA 4MFBA 3CPEA 4IG3A 3VEOA 3OYKA 2H3GX 3RR8A 2ETJA 1BDGA 4KHNA 3C94A 1Q81O 3OHRA 2P9SA 3P39A 2KKZA 4YORA 1W0HA 5BRFA 3I0SA 3BP8A 3G25A 3WNGA 5JS2A 1LAWA 2OZMA 2O8EB 4DSEA 2Q97A 4CJSA 5AR0A 1HKCA 5M1QA 3V1RA 1RT6A 1RGIA 3NH2A 4F2SA 5E26A 4IJAA 3DXKA 1NJWA 1SV5A 4IO8A 3OJSA 4NYNA 2NNWA 1ZBSA 1TAUA 2QTDA 1YT3A 4CFDA 4JD2A 4B9UA 3IAYA 3AO3A 3CIPA 3ZSXA 4YOYA 4FM0A 4I2QA 4H0OA 3MCAB 3C6UA 1BOTO 3VPZA 2HVHA 4RG8A 3KLEA 2KZZA 1RDUA 1NK4A 3DXKB 4BR4A 1JL1A 3LDLA 4B3MK 1HJOA 4ILHA 4FK0A 3G71N 2IGIA 4FLXA 4WQ4A 3CI5A 3NGZA 3PIPL 2BUPA 3JAMO 4FJXA 2HHWA 4MO4A 1HYZA 2VG5A 1G99A 4BR0A 4C1NK 5DK5A 3LP2A 4AM6A 2YHBA 3WNEA 5AQNA 1OH7A 5EU7A 3VQDA 2P9LA 3OW2M 4RW6A 5KPZA 4B1YB 2BH1A 3NAEA 3F2KA 1LW0A 4YOVA 3J8AA 3NMUA 3LAKA 2A42A 3LALA 4B08A 2Q2RA 2V51B 3QO9A 2E2PA 2P9NB 1W2BM 4M63C 3EZWA 1TK5A 4JS4A 2P9LB 3V1QA 4FW1A 4OPJA 1KAYA 3ISNC 2NRXA 3BF3A 4E7JA 1UAXA 3SMPA 3MDQA 2A1RA 4BRQA 5BPMA 4KTQA 4KTWA 3WXJA 2QXLA 4JRQA 1D4XA 3M1FA 3K59A 4YOXA 4JKBA 4KV8A 2Q3SA 1L3TA 1FXXA 4CZHA 2VGNA 3F5TA 5C15A 2XY8A 2ZQBA 2Q31A 1GOBA 5C24A 4ELUA 4J2DA 2Z1GA 3CM5A 2IS3A 5M1PA 1S6QA 3CCJN 4O8UA 3UKUB 5JMVA 1XMOK 2HHSA 3H1VX 5EY4A 4I9LA 1VK0A 4AHRA 5B8HA 1T8EA 4XH1A 1U04A 1RT7A 3U4LA 4CJUA 4DSKA 4WFAL 4FXDA 3I56N 3K57A 3ULEB 2AA4A 3ZSOA 2PYLA 4RW8A 1HPMA 2ZGYA 4DG1A 4W5QA 1WLJA 1R0AA 4CZFA 1N34K 2D1KA 4PQUA 4E7KA 1YVNA 3B6PA 3ZT1A 1ZBIA 1S1VA 1FJGK 3AAPA 4O4GA 3THXA 4IWVA 3SPYA 4C23A 2Z1IA 4AHCA 3L4IA 1KFSA 1HNIA 4FWOA 3O9UA 2Z1HA 4IKFA 1H1VA 3E1YA 1IV0A 1NK9A 2BGGA 4BRPA 2XY5A 5J2QA 1N36K 3AVHA 2YNGA 1U45A 2E88A 4OJRA 1S1UA 2VQEK 3SBGA 2WUSA 3DMJA 4JV5K 1HPZA 2QXFA 3ZX3A 2O8DA 4CGDA 4O5BA 1S1TA 1YXQA 3TPQA 4B3TK 4FJ5A 3DLHA 2D0OA 1W9HA 4CZKA 1J54A 4A61A 4KAZA 4BWMA 1KAZA 1NOZA 3DRPA 3AA2A 1SUQA 5AQUA 4K8XA 4A2AA 4LFCK 1NGDA 2PAVA 3F9MA 3CYMA 4LSNA 1JJ2M 3ZSRA 2QWOA 2O8BB 2BDPA 4KFBA 4B9SA 3SMSA 3SYZA 4C1NI 4B3SK 4LH5A 4DB3A 1LWEA 2OPPA 3FZHA 2QWQA 1YTAA 4BR2A 2FBYA 4OLAA 2CH6A 4C8NA 3DWLA 1EKEA 3J80O 1U2VB 4JI1K 1MA9B 1NM1A 4B1UB 3KKSA 4BDPA 2B5JA 2P9KB 4JI6K 3ZETA 1VSHA 4E7IA 4IEEA 2F9WA 1RTIA 5HLFA 3DXMB 4QOZB 3PX4A 1NJIO 4E19A 4J2EA 1L3SA 4ISGA 4MO5A 2JGUA 5KPRA 3L4QA 3DOKA 3SAGA 1KRPA 2OANA 3CCQN 4KH6A 1EQYA 3M6GA 4OVLA 3CERA 4YOTA 1KC8O 4I2PA 4BRMA 1KSPA 5BN8A 4E7HA 4CK1A 3ZETB 4AH9A 3P31A 4FJ9A 4C8LA 5C25A 2O4GA 1YHQN 2HHVA 4ELVA 1HQEA 2PFUA 1WSHA 3VEXA 2YNIA 2QEXN 1SZ2A 3SQ4A 3ENHA 1NBWA 4O0IA 3AVAA 3E9OA 1EETA 1KFDA 3FZKA 1EP4A 4A62A 1SAZA 3TSQA 3VERA 1EX4A 5EXWA 4CF1A 3S3MA 3DLBA 3CC7N 3DYAA 5LL6Z 3OYCA 2V7YA 2UUBK 4CF0A 4CF2A 3TAGA 4FJ8A 2WFBA 2ZF5O 5AQRA 3A2FA 4CF9A 1VQ7N 4FLUA 3AVMA 4JI3K 4BREA 4BR5A 1VQ8N 4LF4K 3VA0A 5I3UA 4JKFA 3FFIA 4FJ7A 4LC9B 4CJPA 1CXQA 4FWLA 4J8FA 5AQYA 4KKOA 3QEXA 4OX9K 4EHUA 1CZ9A 5IT9O 1RT3A 2Q0RA 3SI6A 4CGFA 5EOYA 1HX1A 2BTFA 4U67L 4MDAA 3OYMA 1TUUA 4FVUA 4CIEA 3HYFA 3HOSA 4CJFA 2YHWA 4M45A 3AA4A 3C7NA 3MX2A 4BRLA 4DTPA 1ATNA 3VF4A 4FLWA 4C8KA 4BGBA 4DR1K 1NGJA 1E4FT 1NKBA 4FJIA 1TL1A 4PL7A 3U8XA 1MWKA 4WQ5A 2HF3A 4EIAA 3T3FA 4KH4A 1SL0A 2DFHA 1TL3A 3DAWA 4FJMA 3D2FA 2ASOA 3HI0A 3QEVA 2FSJA 3ZSVA 5J2NA 3QINA 1WBDA 3SJHA 3M5RA 2AJQA 1BHLA 5LJWA 3OYFA 5J1EA 4CD3A 1S9EA 3CJ1A 4XH5A 1RT2A 1HNXK 3SZ2A 1GLCG 1IBMK 3AO4A 4I7FA 3TU5A 4Z94A 3OS1A 3QBXA 4CJ7A 4X66K 1HYSA 5C12A 4N41A 5EVZA 1VRTA 2HW3A 5C10A 3U3GA 3QEIA 3D2EA 3SUNA 4N56A 3O3HA 1WUAA 1VSKA 1DTQA 4DR3K 3LP3A 3C6TA 4HTUA 2UXCK 3AGRA 3Q7BA 5C42A 4FWMA 3VQ8A 2YNHA 1BO5O 4CGGA 1I39A 4FLVA 3VF2A 1RT5A 3K0SA 1Y97A 4EP5A 3D2EB 2P5GA 4K25A 1C0GA 3H3OB 1O13A 4BGAA 3V9ZA 3E9LA 3PO4A 5LMUK 1UA1A 1ASVA 2HB5A 3VQ4A 3CCEN 2HNDA 2ITGA 1LW2A 4ZTJA 4GVEA 3BEXA 1FW6A 2IIRA 4JKGA 2KLAA 4DLEA 1C0UA 4CJWA 2RN2A 2GX9A 3HJFA 3CJBA 4CHZA 1EWRA 4K43A 3TTFA 4B9LA 4NXMK 1TAQA 4OLBA 1C1BA 2RKIA 1VQMN 1XC9A 1KD1O 4GNIA 4JKGB 1RBUA 5AZJB 4U7BA 5F1XA 3THYB 4CZGA 4BACA 4JKAA 3T1HK 3S41A 2NRTA 2UUCK 4Z4IA 1UWBA 4H5VA 2VQFK 3L3VA 1Y64A 2YV0X 1TKZA 3ZCMA 1YTUA 4B1WB 4JEPA 3SBTA 4HUEA 3PIOL 2QK9A 2F7TA 3ASMA 2B4JA 3KIOA 4CEAA 3TWHA 4NB4A 3CC4N 1XUPO 2QA4N 4FO0A 1JLFA 1B9FA 1OH5A 2GUPA 3UKRA 4J2BA 2HBLA 4I6MA 1J6ZA 4CZEA 4E89A 2KQ2A 3RRHA 2OCEA 4DTMA 2OA8A 5AQQA 1IG9A 4WF9L 3SLCA 2Q36A 3AVLA 1RDDA 1YJ9N 2PZSA 3HTVA 3M8PA 3C0BA 4ELTA 4BY9C 5AFUH 2YJFA 4KHQA 1C0MA 3UKRB 5MLCQ 2O8FA 5HRSA 4I6MB 4FJJA 1Z25A 4DQRA 4Y1DA 2F96A 2O8EA 4YNQA 3K5MA 3CCUN 4LF7K 2Q1NA 3AA3A 3OVNA 5AQWA 2XHBA 4Y1CA 1JCEA 1K9MO 4FZZA 3KK1A 2NRRA 4AQYK 2D0PA 4DR2K 3E66A 2V7ZA 3PO5A 2O8FB 3DRSA 3PX6A 3QLHA 4AHTA 3VGLA 2YHXA 5GIOA 3V6DA 3WXIA 3ULDA 3O8MA 4WE1A 4QS8A 2VWKA 4Z4GA 1VQKN 4CEQA 4BC4A 3LDQA 3B8AX 4CHPA 4FJLA 3DLGA 1SS6A 3BGRA 3DOLA 1NLVA 3JYTA 3CFPA 2BANA 3AO5A 3I8BA 3A5LC 4B9QA 1BQNA 4HTLA 1QSYA 4WQ5C 3HSCA 3ZT2A 5BREA 3ZT3A 3VN5A 1RTHA 4LY7A 1KVCA 3IS9A 3VETA 3BUZB 3K5LA 1RCHA 1BIUA 1VRUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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 4U67 L;  3CCE N;  4IOA L;  1VQP N;  5DM7 L;  5GAE P;  3CCJ N;  5GAG P;  5GAH P;  1VQL N;  1VQK N;  4WFB L;  1VQ4 N;  1YIJ N;  3I55 N;  5GAD P;  1Q82 O;  1NJI O;  1YJW N;  3G71 N;  5HL7 L;  1VQN N;  4UY8 O;  1YI2 N;  3CXC M;  3CCQ N;  4WFA L;  3PIP L;  3I56 N;  1YJN N;  3G6E N;  1VQM N;  1M90 O;  2OTJ N;  1KC8 O;  2ZJP L;  1KD1 O;  3CCR N;  1ILY A;  1Q86 O;  5JVH L;  4IO9 L;  3CMA N;  3CD6 N;  2OTL N;  3PIO L;  1YHQ N;  3OW2 M;  3CCM N;  1VQ6 N;  5JVG L;  1YIT N;  5DM6 L;  2QEX N;  4WFN L;  3J7Z O;  3CC4 N;  2QA4 N;  4IOC L;  1K73 O;  1OVY A;  1VQO N;  1QVG M;  3CCL N;  3CPW M;  3G4S N;  3CC2 N;  1M1K O;  1W2B M;  5H1S Q;  1KQS M;  3CC7 N;  1VQ9 N;  1S72 N;  4WF9 L;  3CCV N;  1YJ9 N;  1VQ5 N;  2ZJQ L;  1Q81 O;  1VQ7 N;  1VQ8 N;  5MLC Q;  1N8R O;  3DLL L;  4WCE L;  1JJ2 M;  3CF5 L;  3CCU N;  1QVF M;  3CCS N;  1Q7Y O;  1K9M O;  3CME N;  1K8A O;  2ZJR L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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