3RVCA

Effector domain of ns1 from influenza a/pr/8/34 containing a w187a mutation
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
118
structure length
118
Chain Sequence
ASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Conservation of a crystallographic interface suggests a role for beta-sheet augmentation in influenza virus NS1 multifunctionality.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Influenza a virus
molecule keywords Non-structural protein 1
total genus 32
structure length 118
sequence length 118
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.330 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3rvcA00
3P31A 3P38A 4OPAA 2GX9A 3RVCA 3EE9A 3OA9A 3KWIA 3EE8A 3P39A 3KWGA 4OPHA 3L4QA 3O9RA 3D6RA 3O9SA 2KKZA 3O9TA 3M5RA 3O9QA 3O9UA 2RHKA 3F5TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9SB 1J5OA 3AVCA 2Z1JA 3CCLN 4CJ3A 3O1WA 2DY4A 5KI6A 3QEIA 1HQEA 1EKEA 1HNVA 4DQSA 2A1SA 4OJRA 4R79A 3NF7A 5FDLA 1NKEA 2UUBK 4FLYA 1I94K 1RDUA 4M41A 1U2VA 1X9MA 4OLAA 2A3ZA 4CEOA 3SBTA 1NGHA 3CC4N 3VF4A 1DLOA 2IS3A 1G15A 4CGJA 1RILA 3VGKA 3N4QA 2P5OA 3I33A 4CGGA 3CCUN 5GIPA 1QSYA 1K8KA 1JKHA 3G25A 2P9KA 1U2VB 3C94A 3P83D 3TSPA 1KVCA 3NF8A 4QS7A 5KTQA 4CK3A 1VQ6N 2O8CA 4ILJA 1ZBSA 3H45C 2KZZA 2VWBA 2G8VA 4HCCA 3CCEN 1K8AO 3SYZA 4BDYA 5KPTA 4U7BA 1K8KB 2B5JA 3NMUA 2O8CB 4YOXA 3AVHA 1E3MA 3R6MA 2KZMA 1XMOK 1C0MA 4H03B 2I7PA 1JXEA 2QWQA 3QFPA 3QEVA 4IO8A 4FZZA 4V19S 1JCGA 5C15A 1C6VA 1LAWA 5AQTA 5BRDA 4CZMA 2UXDK 3HVRA 3DM2A 3VQQA 4C1NI 3CPEA 3VERA 2VYPA 2HMPA 3KVGA 3LDPA 5CYMA 2UXBK 3PX6A 4BC2A 2OPQA 4BRDA 1L3UA 5GAEP 4QOZB 2WOMA 5KPRA 1A5VA 1T8EA 1T6CA 2D0BA 4YDUC 1K9MO 1NGIA 1OH7A 2HBJA 2YNIA 5J1EA 1LCUA 4CFCA 3CHWA 4OGEA 5AQIA 4W5TA 2OZSA 5AFUA 4LH5A 3F2KA 3I0SA 1HLUA 1NU0A 2I7NA 4BE0A 3MN5A 2F9WA 1VQ9N 1LWFA 2PZSA 4KO0A 3MX2A 2P9IA 3MAQA 4DTMA 3VQAA 3O9TA 4I2PA 1OH8A 1RT1A 2KW4A 4BY9C 3G71N 1TL3A 4PKHA 5AQMA 1OVQA 3ZT4A 3DJCA 4L3QA 4FLZA 1M1KO 2P9IB 4DSEA 5BN9A 4CIFA 1ILYA 1YUWA 3D2FB 3VQ6A 2ATQA 4RG8A 4DQQA 2E2PA 5JVHL 1BDGA 3LP2A 4DV2K 4CGIA 1I39A 2KHOA 2F4VK 4CJ7A 2Z1IA 4CJVA 2B6AA 1FXXA 1Q86O 5SWMA 4FVMA 3DLGA 4BR9A 4KRFA 2O8DA 4LF5K 4OPKA 1NJYA 3KD1E 5H1SQ 1LOTB 5F0XA 4CJLA 2YJFA 3ENHA 5JICA 4MQ3A 1DTQA 5LL6Z 5J2NA 4BGBA 2PY5A 2CGJA 4CF1A 1CZ9A 4LSLA 2O8DB 1IO2A 2XY5A 2HHHK 4FJKA 3MN7A 4UY8O 3RMAA 4CD3A 3K57A 4KTZA 3DAWA 4LSNA 3RSEA 3FZHA 3V9UA 1ZYQA 1VQPN 1KAYA 2G8HA 3TTCA 3BDPA 3VETA 1WUAA 2J4RA 3DLRA 1XQSC 2YHXA 5BRHA 5BRFA 3RSEB 4BRLA 1X9JA 3UE5A 1ASWA 3PY8A 4DQ8A 4O4GA 3AA5X 5HBMA 5AFUH 1L5UA 3SK3A 1KC8O 3CPWM 4KB0A 3ZEUA 5TKYA 1SL2A 2P9NA 3OHRA 1S1UA 4CBUA 1VSMA 4CK2A 5KGWA 4FWPA 1HPZA 3LAKA 4IG0A 1JLCA 5AQNA 3OBYA 4JKAA 2ASMA 3OYNA 1QVGM 2OTJN 4CW7B 2AJQA 3ZEUB 1VQLN 3TTDA 1KFDA 3E9PA 4C8MA 3HM9A 2IVOA 4O44A 4JKDA 5M1NA 5JVGL 1P8ZA 1XC3A 1HKBA 1X3NA 4E7HA 5T7BA 3OVNA 3I55N 3TWHA 3MWTA 3V4IA 4JLHA 3VA3A 3A8YA 4LF9K 1WSEA 2KQ2A 3HTVA 4CERA 1GLBG 5AQPA 5FPNA 1V4TA 2E5LK 2GELA 4MLEA 1IKVA 2QWLA 4RW8A 3QO9A 3VQDA 4GNIA 4OKJA 1OVYA 1NNEA 5C10A 4KH4A 3VA0A 3MK6A 1WAFA 3HM8A 4B1UB 3QESA 1EO1A 3ENBA 4FZYA 3A2FA 2XRIA 3OBWA 4XIUA 4B1ZA 3M8RA 4N56A 4AM7A 1EX4A 4HHTA 2Q3SA 3UKRA 4Q5VA 4RTFD 4KHNA 2QWMA 4GV6A 3O9QA 3EKUA 2QI2A 1GLDG 3C0BA 4L8RB 2WTUA 1WN7A 3VGMA 3DOKA 4B9QA 5F1XA 1S9GA 3THYA 3QLHA 1QTMA 3VQEA 2F96A 3AV9A 3JS6A 1VQNN 4CEFA 1DKGD 1BO5O 2DFHA 3C6HA 4H0OA 1VQMN 4E1MA 4JD2A 4OPHA 1U6ZA 4OPJA 3KLGA 5DM6L 1RGIA 1RNHA 1Y64A 4CBXA 3THYB 3AAQA 2O8FA 2AP1A 2HNZA 3ZCMA 2E2OA 3GE1A 3G6EN 4BVOA 4JD2B 3W3DA 1JCEA 3GBTA 4I2QA 2GV9A 3RWUA 4O8KA 5I9EB 1RDCA 3C6AA 5DK5A 5ADXA 2ZM6K 3QINA 1U4BA 2O8FB 1VHXA 1KVBA 4M7XA 1VAZA 4DV6K 4NXNK 1HRHA 3QMLA 3EEQA 1YTUA 3V9XA 1B9DA 3ZSXA 1B92A 4DTJA 1CZBA 3SAFA 1YVNA 2VG7A 3WNHA 1WLJA 4DSIA 3FE1A 4DR2K 1KLNA 2BE2A 3QBWA 3GG4A 4X65K 1NJIO 1S5JA 4CE9A 4F3OA 4FWOA 2BUPA 5CR4A 1E4FT 2F9TA 3SCXA 1IH7A 5JLFA 1S6PA 3SQ4A 3GDQA 5GADP 4CJFA 1ESVA 3B6PA 4JI1K 1XNRK 3K9KA 5FPEA 4Z0UA 3VQ5A 3MWPA 4H0VB 1JCFA 3F9KA 1VSKA 4WE1A 4E1JA 2A42A 2YCHA 4KHQA 3U8XA 3SV3A 4LFBK 4DUYK 3DMJA 2P9PA 5AZIB 3WQTA 4HTUA 4RWTA 3ZETB 1CLQA 2UUCK 1JJ2M 3AVJA 3G10A 4JKHA 4WQ5A 4CZEA 4OO1J 2Q31A 3L0QA 4BRFA 2P9PB 3EE9A 3ZT2A 4B8CA 1S6QA 4H5VA 5K14A 1HPMA 1UA1A 3WXLA 1Q18A 3ID8A 5JMVA 4KPYA 4DFJA 2QTDA 3TAMA 4KAZA 3R9PA 3E9LA 3S3NA 2Q2RA 3VGLA 2AA4A 2FBVA 3O6WA 3VPZA 4JI6K 5ADXH 2O4IA 1QSLA 2D0CA 4AHSA 2PYLA 3SAGA 2YKMA 2VWKA 3H3NO 5J2QA 2BTFA 5AQOA 4RCHA 1D9DA 2FF6A 1XWLA 4HUFA 3THVA 2A41A 4B9UA 1N33K 3LAMA 3M8QA 3NGIA 5GIOA 3BY5A 4H5TA 1RT4A 3CETA 4CJKA 3Q7BA 5JLHA 1LW2A 3CJCA 1YJWN 4CGDA 1J9AA 3J8AA 4K41A 3SPZA 3BUZB 4H0TB 4WF9L 4LY7A 1ATRA 4IJAA 1DTTA 1BHLA 2QW9A 4FM0A 3WEEA 1ATNA 1TK8A 3O4QA 4O5BA 4F4KA 3NE6A 1UA0A 4DU1A 5GAGP 4DR1K 4DU3A 4MO5A 4YOWA 1NGAA 4F9OA 3AAPA 4PKIA 3WEEB 4FLXA 3SJHA 3BF3A 3AO4A 3KWGA 4DCHA 3TAQA 3THWA 3QNNA 3J81O 1BL3A 3EO3A 4EAHD 1NM1A 1S22A 2ASOA 1GLEG 4DQIA 3O3HA 3I0RA 4BQLA 4O5FA 3IUCA 2NLXA 3QIPA 1YVUA 2WFBA 1NK6A 1RTHA 3THWB 2Y1IA 3J7AP 4DTSA 4IOCL 1BQNA 4IDHA 1HYVA 3MX5A 1KAXA 4K25A 5C2DA 3K0SA 4BR7A 4J8FA 1HNIA 5AZJA 3C6UA 1GOAA 1O13A 4CHQA 4H5NA 2ITGA 4NCGA 2ZJPL 2OANA 1EWQA 5EU7A 4K43A 1HNZK 3ZSZA 1NGJA 3O4WA 4NLBA 4CF2A 3A5NC 4AHRA 2VCPA 4BG9A 4B1YB 5AZJB 1J6ZA 4CJPA 2Q0RA 1NJXA 3H1VX 2YKNA 4B9MA 4A57A 1WSJA 4W5OA 2YI1A 3WUHA 4QCLA 3IDHA 3DLBA 3HJFA 3VEWA 5AQKA 2Q36A 4X64K 3R1XA 3HK2A 5AQLA 4CIGA 4FJJA 1VSFA 4ZHRA 1HYSA 4A62A 2P5GA 2NRWA 1RTDA 4C8OA 3MCAB 4BRHA 4HVJA 2HHUA 3K59A 4JN4A 1U04A 3VEVA 4B1VA 3ZX3A 4CIEA 3PIOL 4DUZK 3CMEN 2HVIA 2BDPA 4GKKK 4XEIA 4CJQA 4DV7K 1ITGA 2WBNA 3LDLA 4DV0K 3CI5A 4FK2A 3ZLJA 2GTDA 4DG1A 3OTOK 1SAZA 2DFEA 2NUBA 1EWRA 3QETA 3T1YK 4FJHA 2OCEA 4LFCK 3T7ZA 4YOYA 5DM7L 2GX9A 5CHIA 5BREA 1RT2A 2XY6A 4Z94A 3ULDA 3UIQA 3VF2A 1KQSM 4FZXC 3KJVA 2Y1JA 1S1VA 3ITHA 5BPNA 3LDNA 1VQ7N 5B8HA 2Q97A 4Z4HA 3O3FA 3R3LA 2QXLA 3I56N 1Q8IA 2P9KB 1RDWX 4IG3A 2HHVA 4FJ5A 4ISEA 4WFBL 1RDBA 4FWNA 4JEPA 2QKKA 2P9LA 3GL1A 3VMFB 3O9SA 5I42A 4IKFA 2KFNA 4KHSA 3NVKA 4UQGA 4CJRA 3P38A 1NGDA 1SKSA 2F8TA 1W9HA 2PBDA 3HBTA 4CF9A 2P9LB 4FW2A 4AF1A 4OKKA 5KRTA 1C0FA 3CJ7A 4ICLA 2VQFK 4BE2A 1N5YA 3NHGA 3KK2A 2O8EA 4FWMA 3T3FA 1RFQA 4BRNA 5E84A 1JLFA 5I3UA 1GLJO 3VN5A 1IBMK 3HPGA 1NGEA 4RW6A 3CFPA 1BOTO 3P31A 2JGUA 2CH5A 2O8EB 4CGFA 4FVUA 1TUYA 3SBGA 1IV0A 3PO5A 3IRXA 1HMVA 4E19A 3KWIA 2HF4A 4AHTA 3AA3A 3OW2M 2RF2A 4W5NA 3T1HK 1JLGA 1F21A 1K6YA 3T1AA 2RHKA 2ZD1A 1MA9B 4CJ4A 5M1KA 1HKGA 2GWKA 1KFSA 3LPTA 2QWRA 1WOQA 4WFAL 2XO7A 1I3AA 4M3UA 4FWQA 5D3GA 1KAZA 4AH9A 4G1QA 4JI3K 4GMJB 2OYQA 3ZYYX 3KHYA 1FJGK 4MFBA 4DFKA 1N32K 2QWOA 1LWEA 3OYDA 1BA1A 3WXKA 5HROA 2YNHA 3TU5A 1SKRA 1QQNA 3OS2A 3NFAA 1Q9XA 3LP1A 1U49A 5AJ3K 2RKIA 4A2AA 1RBTA 2IDOA 3AVAA 3O5BA 1L3VA 1TK0A 1GLCG 3JAMO 3LDSA 1XNQK 4H0YB 1VSHA 4B3OA 4PA1A 2FBYA 3WXMB 4GVMA 4O0IA 3OS1A 4Q0BA 3LDQA 5EX5A 2E88A 3ZSOA 4FW1A 1YT3A 2QM1A 4Y0WA 3AGRA 1HR0K 4NB4A 2ZJRL 1MWKA 4KI4A 4JI0K 4IEIA 4CCHA 4KV8A 2HF3A 1KCFA 2NNWA 3L2QA 4FYDA 4CHNA 4FM2A 1RBSA 1MDUB 2QWPA 3ZT3A 3OYJA 1BIUA 3AVIA 3CJ9A 2E8AA 4BRIA 4DTNA 2BGGA 1HJRA 1IBKK 5EVZA 4W5QA 3MEDA 4HUEA 4NO7A 3G0ZA 2HSTA 1JL2A 1FKOA 3TAPA 4GW6A 1NMNA 4FJIA 3VEYA 1BISA 1S72N 5BPMA 3LM9A 5FPMA 1RT3A 3OYMA 1JLQA 3CCJN 2ETJA 4GY2B 5KRSA 3WNGA 2HNYA 3S3OA 3FGUA 3SQ1A 4FOIA 3KKRA 4FLUA 5J2MA 1KVAA 1QHTA 4E3SA 4CJWA 2FXUA 3V1OA 3MN9A 2Z1HA 4DTPA 4LF7K 3BZCA 1BGXT 4BRCA 1XHXA 3ASMA 2P9NB 1DEJA 3R8EA 1VSLA 4BG8A 4B3MK 2ITMA 3M1FA 5M1FA 3OYHA 5LMUK 1YJ9N 2ZJQL 1W97L 4KHPK 4CF8A 3LZJA 3MXIA 2D0PA 4YHHK 1VSIA 3A5LC 3BGRA 3PSIA 4YORA 4ZTJA 3QEXA 3SV4A 3HZ6A 1C1BA 4JHDA 3EY1A 4JNEA 5AQWA 2FC0A 3VEZA 3K5MA 4DTXA 4K8ZA 3NH2A 3EZ5A 1WSFA 3O3GA 4B08A 3SLCA 4CJSA 2W41A 3SUNA 1GLFO 2Z1GA 2OPPA 3U3GA 4JHDB 3OYCA 1N8RO 3VOVA 4E89A 4M45A 4FCYA 1JLEA 3MECA 4FSVA 2HNDA 4FLWA 4CEDA 3DYAA 4KB1A 3KK1A 2E6LA 4H5RA 4DR7K 4RW7A 5EY4A 4F3TA 3AVGA 3DXMA 3OYIA 4QS8A 2JWKA 3A0IX 4C8KA 3SUQA 4I6MA 3UKRB 3NF9A 2OA8A 3C65A 4I7FA 4F2RA 1TV6A 3AO3A 3AVNA 3L4QA 3HP6A 4N41A 3DXMB 4H8KA 4M3YA 5E26A 3L3VA 5EXWA 3T19A 3OY9A 4DWIA 3KTQA 5CY4A 4HWIA 1ZBUA 2W6LA 4JI2K 4A61A 3D2EA 2F7TA 2IVNA 3H1QA 3DRRA 4CK1A 3HI0A 1NK8A 5KQ8A 4M3RA 1NJZA 4B9SA 3V9ZA 4G9ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3P31 A;  3P38 A;  4OPA A;  2GX9 A;  3RVC A;  3EE9 A;  3OA9 A;  3KWI A;  3EE8 A;  3P39 A;  3KWG A;  4OPH A;  3L4Q A;  3O9R A;  3D6R A;  3O9S A;  2KKZ A;  3O9T A;  3M5R A;  3O9Q A;  3O9U A;  2RHK A;  3F5T A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2P9S B;  1J5O A;  3AVC A;  2Z1J A;  3CCL N;  4CJ3 A;  3O1W A;  2DY4 A;  5KI6 A;  3QEI A;  1HQE A;  1EKE A;  1HNV A;  4DQS A;  2A1S A;  4OJR A;  4R79 A;  3NF7 A;  5FDL A;  1NKE A;  2UUB K;  4FLY A;  1I94 K;  1RDU A;  4M41 A;  1U2V A;  1X9M A;  4OLA A;  2A3Z A;  4CEO A;  3SBT A;  1NGH A;  3CC4 N;  3VF4 A;  1DLO A;  2IS3 A;  1G15 A;  4CGJ A;  1RIL A;  3VGK A;  3N4Q A;  2P5O A;  3I33 A;  4CGG A;  3CCU N;  5GIP A;  1QSY A;  1K8K A;  1JKH A;  3G25 A;  2P9K A;  1U2V B;  3C94 A;  3P83 D;  3TSP A;  1KVC A;  3NF8 A;  4QS7 A;  5KTQ A;  4CK3 A;  1VQ6 N;  2O8C A;  4ILJ A;  1ZBS A;  3H45 C;  2KZZ A;  2VWB A;  2G8V A;  4HCC A;  3CCE N;  1K8A O;  3SYZ A;  4BDY A;  5KPT A;  4U7B A;  1K8K B;  2B5J A;  3NMU A;  2O8C B;  4YOX A;  3AVH A;  1E3M A;  3R6M A;  2KZM A;  1XMO K;  1C0M A;  4H03 B;  2I7P A;  1JXE A;  2QWQ A;  3QFP A;  3QEV A;  4IO8 A;  4FZZ A;  4V19 S;  1JCG A;  5C15 A;  1C6V A;  1LAW A;  5AQT A;  5BRD A;  4CZM A;  2UXD K;  3HVR A;  3DM2 A;  3VQQ A;  4C1N I;  3CPE A;  3VER A;  2VYP A;  2HMP A;  3KVG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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