4B8C | Genus

Total Genus 85

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	85
sequence length	280
structure length	267
Chain Sequence	PIFLPPPNYLFVRDVWKSNLYSEFAVIRQLVSQYNHVSISTEFVGTLARPIGTFRSKVDYHYQTMRANVDFLNPIQLGLSLSDANGNKPDNGPSTWQFNFEFDPKKEIMSTESLELLRKSGINFEKHENLGIDVFEFSQLLMDSGLMMDDSVTWITYHAAYDLGFLINILMNDSMPNNKEDFEWWVHQYMPNFYDLNLVYKIIQEFKNQYSLTTLADELGLPRFSIFTTTGGQSLLMLLSFCQLSKLSMHKFPNGTDFAKYQGVIYG

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__00245157977397__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__00245157977397__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4B8C/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__00245157977397__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"00245157977397","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4B8C/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__00245157977397__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5d038c2644e66e6a205dd621/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5d038c2644e66e6a205dd621/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5d038c2644e66e6a205dd621/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5d038c2644e66e6a205dd621/pdb.gz): 933 ms

reading 267 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

267 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 24 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:266});backbone only;select *;

platformSpeed = 8

cartoonsFancy = true

sheetSmoothing = 1.0

traceAlpha = true

loadScript /static/js/j2s/core/corescriptcmd.z.js

specularPower = 9

ambientPercent = 20

antialiasDisplay = true

Script completed

Jmol script terminated

loadScript /static/js/j2s/J/g3d/HermiteRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/renderbio/BioMeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/render/MeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/shape/Mesh.js

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase/cell cycle
source organism	Saccharomyces cerevisiae
publication title	Architecture of the Nuclease Module of the Yeast Ccr4-not Complex: The not1-Caf1-Ccr4 Interaction. pubmed doi rcsb
molecule keywords	POLY(A) RIBONUCLEASE POP2
total genus	85
structure length	267
sequence length	280
chains with identical sequence	C, E, F
ec nomenclature	ec 3.1.13.4: Poly(A)-specific ribonuclease.
pdb deposition date	2012-08-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04857	CAF1	CAF1 family ribonuclease

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H	4b8cA00

2X74A 3WNGA 1ZBHA 2IDOA 3AVMA 2Z1HA 3ULDA 3HP9A 4LSLA 2P51A 4E7JA 2DFFA 4ICLA 4M41A 1IKXA 3VQ8A 1RT1A 5CY4A 4CEOA 1DTTA 3ZSVA 4CIGA 4CJKA 5E41A 4FM0A 2XY5A 1KSPA 3S3OA 3IS9A 3MECA 3QINA 3QESA 4OVLA 4BWMA 4CHPA 2D0BA 3T1AA 4AHVA 3HYFA 3NGYA 3OYHA 2YV0X 2IGIA 1F21A 3PX4A 1NOZA 3VQDA 3HP6A 2HHSA 1RTJA 2DFEA 3C95A 5HROA 2HHWA 3AVHA 3QIOA 1U48A 4NYFA 3VQPA 5C42A 1C0UA 4F3OA 1JXEA 3KIOA 4CJPA 1TVRA 1QE1A 3WNHA 5EU7A 2ZQBA 3AVAA 2PYJA 4CF2A 3CFPA 1SUQA 3LWLA 1JKHA 4OGCA 3RMBA 3B6OA 3VQQA 1LAWA 1QTMA 1IKWA 3SUPA 1KRPA 4Z4FA 1RDDA 3KKRA 4B9VA 4E1NA 4TSXA 4E3SA 1UA1A 1NK4A 4M3WA 3QEIA 4M3YA 4W5NA 1CXUA 3DRRA 4KHUA 4DMNA 2G8FA 1BCOA 1GOAA 1R0AA 3OVNA 3KLIA 3MAQA 3LAMA 1FXXA 1IH7A 1C1AA 3M8PA 3DLGA 4KHQA 1LWEA 1Q8IA 1X9SA 5KI6A 2OPRA 1X9WA 4O55A 3ZT3A 3QEPA 4CJUA 1BISA 3ZT4A 3DOKA 2VG6A 3I0SA 4LH4A 3AVJA 4H8KA 1D9FA 4FJKA 3MXIA 5HBMA 3EZ5A 1NJWA 3ZSZA 1CZBA 1Y97A 2NUBA 2QK9A 1ITGA 1BI4B 1JLFA 4FJGA 2DY4A 2YHBA 1WSIA 1RCHA 4FW2A 4G1QA 3D0PA 4AHSA 5HRSA 5KGWA 2O4GA 3O3GA 3EYZA 2FBVA 3TAEA 4DTXA 3SUOA 4CF0A 3SPZA 3BDPA 5SWMA 4JRQA 4PUOA 1YTUA 1FKPA 5JS2A 4RG8A 4CESA 4NCAA 2HNYA 3KD5E 3V9XA 1N5YA 3VQAA 1ASWA 3TARA 4DQPA 4CFCA 4M3ZA 3DI6A 4CEDA 3TAMA 4CHYA 3AVGA 4IFYA 3TAFA 3KTQA 3QLHA 4KTZA 4FJHA 4CK3A 1WNSA 3CM6A 1Z26A 3WNEA 3M8QA 5HLFA 3ALYA 4Q0BA 1TKXA 1HYSA 2KFNA 3P1GA 1VSKA 1XHZA 1NJXA 1TKDA 3C6UA 4N5SA 3I0RA 1KFDA 1U49A 1BIUA 2E4LA 4B9SA 1CLQA 4K8XA 3SV4A 2OYQA 3JYTA 3IG1A 3S3NA 3DM2A 3NF7A 3QEXA 4DSFA 3AA3A 4CJVA 3THVA 4H4MA 3MXMA 2OPPA 1FK9A 1O1WA 3AVCA 3L3VA 4E7KA 1L3VA 3WNFA 2WONA 2P5OA 1HPZA 3OY9A 2GUIA 1LW0A 3DLRA 3PO4A 2HHVA 4B9LA 3AA2A 3RWUA 4NYNA 2Y1IA 4F2SA 1WSJA 5I42A 2OZSA 1XWLA 1WN7A 4GW6A 4CIEA 3VQ9A 3MEDA 4IG0A 1HNIA 1WLJA 4BE1A 4C8OA 1TK0A 2IS3A 1QSLA 2HHQA 4Z4GA 2PYLA 3K58A 3K5LA 5FRNA 3RMCA 4CGJA 4DU1A 1VSIA 4J2BA 1SV5A 4QAGA 2QKBA 3NGIA 1LW2A 1IKYA 4J2EA 3SQ2A 2YNFA 1RTHA 1BQMA 4CFDA 1RT2A 1YVUA 4PA1A 1EXQA 2E6LA 4DLGA 3PX0A 3SPYA 2FBXA 3ZSWA 4KI4A 3CG7A 3MEGA 1S5JA 4DFMA 4F4KA 4I2PA 1RDAA 4KHWA 1VSDA 1L3UA 4DLEA 3KLFA 2P1JA 1QSSA 2G8KA 3V1QA 1RILA 4Y1CA 2P5GA 3L2UA 4B08A 1XC9A 4L8RB 1ZBUA 1RTIA 3LP3A 2XY6A 3NH2A 2B5JA 3K59A 3AO5A 4FJIA 1WSGA 1KVBA 2LSNA 2FBYA 2PZSA 3LALA 2KFZA 3U3YA 4FLZA 1B9DA 3EY1A 2YKMA 1IKVA 2KQ2A 4FLUA 4QOZB 3DYAA 3AA4A 2QKKA 3O3FA 3AVLA 3UIQA 2YNGA 4JLHA 4FCYA 4I9LA 5J2NA 3RMAA 4C8LA 4CFBA 2HVHA 3VQ6A 1RT6A 4DS5A 4DTUA 3G10A 4DF4A 2BGGA 1CZ9A 3V9WA 4CK2A 4IDKA 3QEWA 1SL0A 3OYAA 5FROA 4DSKA 1VSJA 4FJMA 3DLKA 4DFKA 4YFUA 2Y1JA 4HCCA 4BDYA 3PUFA 4Z4HA 4KRFA 3NFAA 4AHRA 4RW7A 4K8ZA 2XY8A 4HUFA 3DRSA 1W0HA 1S1TA 2YKNA 4OKEA 4Z4EA 2HW3A 1W9HA 4FJLA 1RT3A 3C94A 3ZSRA 3TWHA 3RR8A 1VRTA 1WAJA 1RBUA 4CJSA 4FK2A 3CFOA 4DSJA 1TAUA 3O4NA 4CEAA 2G8IA 1QS4A 4CJLA 4KV8A 2JLEA 4NCGA 3VQBA 3OYEA 3M8RA 1EKEA 1XHXA 2I5JA 3RMDA 1NJYA 1IG9A 5FDLA 4N56A 4FW1A 4OJRA 3AV9A 3OYIA 4ELVA 4PQUA 3QNOA 1T05A 3ZSOA 2F8SA 1BL3A 4Z4IA 3KK2A 1HYVA 1C6VA 3H08A 3TAQA 5HP1A 2GBZA 1EP4A 5HRPA 4CF9A 1Q9XA 4IBNA 1HQUA 1JLGA 3IRXA 4KO0A 3OJSA 4MFBA 1NK5A 4OKJA 5I3UA 1NKEA 2X78A 1SKSA 5D3GA 1QQCA 3CQ8A 1B9FA 3ASMA 3SZ2A 4H4OA 2ZE2A 2DFHA 3O4QA 3VA3A 1TV6A 1TL3A 4HHTA 5C25A 2HHUA 5J2PA 4B9NA 4CGGA 1D5AA 4FLVA 2B4JA 4F8RA 3OYLA 3ZSYA 3RRHA 4I9QA 1RNHA 2YNIA 1RT4A 4OPKA 4DTPA 4FJ8A 3B6PA 3VQEA 2KZZA 3U6FA 1ZBLA 3ZSQA 4CF8A 4O5BA 1X1PA 3MEEA 4W5RA 3SQ4A 1DTQA 3NGZA 2BDPA 1JLBA 4R5PA 3SYZA 4KB0A 1GOCA 3T19A 4FK4A 1JLEA 3DLEA 5DK5A 4DQSA 2Z1IA 2VG5A 4M3RA 3NE6A 4HUEA 2HB5A 2VWKA 2A1SA 1CXQA 4I7FA 5CYQA 3L8BA 3HVTA 4FLXA 1T03A 4BDPA 2KW4A 4E19A 3V4IA 3OYMA 1N6QA 1UAXA 3M8SA 3P5JA 4BWJA 1S1VA 4CJEA 1JL1A 1TKTA 2X6SA 3VQ7A 1RBRA 1VSHA 3L2VA 4E7HA 1L3TA 4CJQA 1J53A 4KTWA 4CJTA 1NKBA 2G8WA 3ZCMA 2XHBA 2OA8A 3AO1A 5KRTA 1SKRA 4GMJB 4FYDA 2YHAA 4N41A 4E7IA 2A1RA 4CERA 1SKWA 1KLMA 3RRGA 4M3UA 4JRPA 1YTAA 4LY7A 3AVIA 3D45A 4FJ7A 3L2QA 4W5OA 4JS5A 4FLTA 2D5RA 4N76A 3OYFA 2G8VA 1VSLA 1J54A 4AHTA 3HJFA 3VN5A 4CF1A 4DF8A 4KAZA 3K5NA 4DSLA 4KREA 1XI1A 4J2DA 2HNZA 4CGFA 3F9KA 2G8UA 2D0CA 4GVMA 3SUQA 3SQ1A 1NK9A 4CHNA 1RDCA 4HUGA 4DSIA 5HRNA 4B8AB 1KTQA 4DTOA 3A2FA 1RTDA 3V81A 4B9MA 3HPHA 1HYZA 3LDSA 3KK1A 4UQGA 3E01A 4DTNA 1BIZA 2EX3A 4I2QA 5J1EA 3ITHA 2BANA 3G0ZA 2O4IA 1UWBA 2Z1JA 5HRRA 3SV3A 4DFJA 1ZBFA 3QIPA 3LP1A 4ZHRA 4ZTJA 3PX6A 3PY8A 2FC0A 4DU3A 4OLBA 4FXDA 2RN2A 4IKFA 2KZMA 4N47A 1Z25A 2EHGA 1QHTA 1S9EA 2OPQA 3AVBA 3K5MA 4KPYA 4AHCA 4FJ5A 1ASVA 4W5QA 2XY7A 4O44A 3JSMA 2OPSA 3CYMA 4O4GA 1RT5A 2W42A 4DFPA 3V6DA 1S1UA 4BDZA 4KKOA 4CHZA 2X6NA 4C8NA 1NK6A 3AO3A 3NF9A 1NK7A 4MQ3A 4CCHA 2AJQA 3C6TA 3HVRA 3HO1A 4B8CA 3TAGA 4AILC 3ZT0A 3SJJA 1TKZA 2HHXA 3NDKA 1HJRA 5CYMA 2JGUA 1S6PA 4FZZA 1BGXT 4KB1A 4CEBA 1S6QA 4Z4CA 3LANA 3HSTB 1HRHA 4E1MA 4CECA 3VA0A 1JLCA 1UOCA 4YNQA 3SUNA 1LV5A 1I39A 4QCLA 1ZBIA 2RPIA 3V9UA 3F73A 1A5VA 3HPGA 3DLHA 4FZYA 5CZ2A 4CEEA 4CGHA 3T3FA 4HCBA 3AA5X 4KHSA 1VSMA 2XRIA 1BCMA 1RBSA 4CGDA 3VQ4A 1BQNA 2HNDA 4DQQA 4CJFA 1WSFA 3DMJA 4CHQA 3HK2A 4B3OA 1D9DA 3LP2A 2Z1GA 1JXBA 3SCXA 1KLNA 1IO2A 3QETA 1U45A 1NOYA 3HPOA 3HXMA 2HMIA 4HVJA 4DS4A 3V1RA 1BHLA 2ETJA 4CJRA 5KTQA 3KJVA 3CFRA 4JS4A 4XIUA 4LH5A 4DTRA 3MXJA 3KLHA 1DLOA 1GOBA 4RW8A 1FKOA 4AH9A 4FM2A 2ZD1A 3QEVA 3SNNA 1T7PA 1NJZA 2F96A 4AHUA 4CFAA 1JLQA 3V9ZA 4HTUA 4CE9A 1C1BA 1X9MA 4DTJA 3ISNC 4BE2A 3AVFA 4RW6A 3K2PA 4CGIA 4CIFA 1NKCA 4LSNA 1JL2A 4KI6A 4DQRA 4ID5A 1T8EA 3OYCA 1C0MA 5JS1A 5CZ1A 3L2WA 1KFSA 2RF2A 5KRSA 1RBTA 3NF6A 1J9AA 4EZ6A 4CJ3A 4WE1A 1U04A 4OLAA 5T7BA 2D0AA 4CJWA 4OPJA 1BI4A 4O0JA 3S9HA 3LAKA 1K6YA 1LAVA 4Q5VA 3OS1A 4KTQA 3SI6A 3KKSA 2IC3A 4CHOA 3OYJA 3KLGA 1NK0A 3QERA 2E6MA 1EX4A 4FLWA 3LPTA 3TAPA 4KHYA 2WOMA 3RTVA 4F3TA 4FJ9A 1HNVA 1G15A 2ITGA 1ZYQA 3HT3A 3AO2A 1Q9YA 3DRPA 4RW9A 3VQCA 1VSFA 4IG3A 3KLEA 1I3AA 3KK3A 3LZJA 4CEQA 4EP5A 1MU2A 1S1WA 4C8KA 3DOLA 3LPUA 4J2AA 3VQ5A 5SZTA 2FBTA 3CM5A 4EZ9A 3L2RA 3LZIA 2HHTA 1RDBA 1WSHA 4M42A 4DTMA 4FZXC 4KHNA 4BE0A 2HVIA 2BE2A 1HQEA 4CJ5A 3TANA 1UA0A 5DMRA 4PY5A 4ELTA 1NK8A 3TABA 2R7YA 1D8YA 5FRMA 1C1CA 3AVKA 5C24A 1J5OA 3NH0A 2B6AA 4M3XA 4LD0A 4DU4A 4E0DA 1YT3A 5J2QA 4FVMA 3LP0A 4IFVA 3L3UA 5KGXA 4ZTFA 3TI0A 1L3SA 2G8HA 4FLYA 4DTSA 3PV8A 4ID1A 3OYGA 3KD1E 3U3GA 2QXFA 4KFBA 3OYBA 1L5UA 1KVAA 3AO4A 4C8MA 1WAFA 4OKKA 4W5TA 2KTQA 1QSYA 1C0TA 3ZSXA 3QNNA 2YNHA 2IOCA 3V9SA 1A5WA 1U4BA 1JLAA 1RBVA 1RT7A 1TAQA 2GV9A 1VSEA 3K5OA 4Z0UA 3OYDA 1SL2A 3IAYA 3TR8A 3PO5A 4Y1DA 3NBPA 3ZT2A 2XO7A 1SL1A 4FK0A 4M3TA 1VRUA 3RR7A 3NAEA 2OZMA 4CJ4A 4M45A 3NHGA 4DWIA 3OYNA 3I8DA 4DQIA 3AVNA 1ASUA 2RKIA 4B9TA 3HM9A 3ZT1A 1KCFA 4NCBA 2DTUA 5K14A 3FFIA 3O3HA 3BGRA 1A5XA 1KVCA 2IAJA 2VWJA 3S3MA 3OS2A 2F8TA 3P83D 4RW4A 2ATQA 4E89A 4FJNA 1LWFA 1WSEA 3NH1A 4B9UA 1HMVA 1S9GA 4ELUA 3V1OA 4CEZA 3OYKA 4BACA 4FJXA 3LWMA 1TGOA 1LWCA 4DG1A 4DSEA 1REVA 3QO9A 3SQ0A 4EP4A 3NCIA 4PWDA 3K57A 4F2RA 3NF8A 1S1XA 4OGEA 3OS0A 4CK1A 5J2MA 1U47A 3OJUA 2PY5A 1TK8A 1EETA 4FJJA 1TK5A 3HL8A 1TL1A 4CEFA 4FM1A 4E7LA 3DLBA 1B92A 2Q3SA 1VK0A 2VG7A 4O0IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3WNGA 4LSLA 2V7ZA 1QZ5A 1LOTB 4CEOA 4EFHA 3QFPA 3P39A 1IBLK 4DB3A 1ESVA 3QESA 3EEQA 3TTCA 4CHPA 3NGYA 3OYHA 3ZYYX 5FPDA 3U8XA 2CH6A 1NOZA 3VQDA 2OCEA 1RTJA 2DFEA 2HHWA 1OH5A 3QIOA 1VQ9N 3VQPA 5EU7A 3OHRA 1JKHA 3B8AX 4BRNA 3R8EA 1QTMA 4Z4FA 3KKRA 4M3WA 4E3SA 3QEIA 3LL3A 1CXUA 4KHUA 4MO5A 3OVNA 3VPZA 4JKCA 3LAMA 3THYB 1C1AA 2UXDK 2W40A 3M8PA 3DWLA 1Q8IA 4NO7A 3AY9A 1YAGA 4CJUA 3CCMN 3RSEA 2VG6A 3MXIA 2O8CB 1NJWA 1CZBA 1Y97A 1U6ZA 1ITGA 1JLFA 4FJGA 4EAHD 4G1QA 3ZX0A 3D0PA 2DY4A 5HRSA 1ATNA 3Q7CA 2O4GA 4CZKA 3CCJN 5SWMA 3VOVA 4PUOA 2YCHA 1FKPA 5JS2A 4CESA 2HNYA 3KZBA 3V9XA 3J80O 4DQPA 4CFCA 4AF1A 1HNZK 4CEDA 4H5VA 3QLHA 3CM6A 4FWNA 3ALYA 1TKXA 1NJXA 3C6UA 4N5SA 2E20A 3I0RA 4BR4A 1BIUA 2UYTA 1CLQA 4K8XA 2OYQA 3JYTA 3S3NA 3TPQA 4H4MA 1OVQA 2OPPA 1FK9A 4IJAA 1GLDG 1L3VA 2WONA 1NG9A 1HLUA 3DLRA 3C0BA 5EY4A 1JCEA 1P8ZA 3AA2A 4CZMA 3THWB 2BTFA 2UUBK 1NJIO 1WN7A 5AR0A 4DR7K 3MEDA 3CCEN 1WLJA 2W6KA 4FWPA 4C8OA 1QSLA 3DXMB 3M1FA 4DR3K 4CGJA 4J2BA 5M1QA 2QKBA 1LW2A 2Q1NA 1RTHA 4ISEA 2FBXA 4KI4A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1SL2 A;  3IAY A;  3TR8 A;  3PO5 A;  4Y1D A;  3NBP A;  3ZT2 A;  2XO7 A;  1SL1 A;  4FK0 A;  4M3T A;  1VRU A;  3RR7 A;  3NAE A;  2OZM A;  4CJ4 A;  4M45 A;  3NHG A;  4DWI A;  3OYN A;  3I8D A;  4DQI A;  3AVN A;  1ASU A;  2RKI A;  4B9T A;  3HM9 A;  3ZT1 A;  1KCF A;  4NCB A;  2DTU A;  5K14 A;  3FFI A;  3O3H A;  3BGR A;  1A5X A;  1KVC A;  2IAJ A;  2VWJ A;  3S3M A;  3OS2 A;  2F8T A;  3P83 D;  4RW4 A;  2ATQ A;  4E89 A;  4FJN A;  1LWF A;  1WSE A;  3NH1 A;  4B9U A;  1HMV A;  1S9G A;  4ELU A;  3V1O A;  4CEZ A;  3OYK A;  4BAC A;  4FJX A;  3LWM A;  1TGO A;  1LWC A;  4DG1 A;  4DSE A;  1REV A;  3QO9 A;  3SQ0 A;  4EP4 A;  3NCI A;  4PWD A;  3K57 A;  4F2R A;  3NF8 A;  1S1X A;  4OGE A;  3OS0 A;  4CK1 A;  5J2M A;  1U47 A;  3OJU A;  2PY5 A;  1TK8 A;  1EET A;  4FJJ A;  1TK5 A;  3HL8 A;  1TL1 A;  4CEF A;  4FM1 A;  4E7L A;  3DLB A;  1B92 A;  2Q3S A;  1VK0 A;  2VG7 A;  4O0I A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WNG A;  4LSL A;  2V7Z A;  1QZ5 A;  1LOT B;  4CEO A;  4EFH A;  3QFP A;  3P39 A;  1IBL K;  4DB3 A;  1ESV A;  3QES A;  3EEQ A;  3TTC A;  4CHP A;  3NGY A;  3OYH A;  3ZYY X;  5FPD A;  3U8X A;  2CH6 A;  1NOZ A;  3VQD A;  2OCE A;  1RTJ A;  2DFE A;  2HHW A;  1OH5 A;  3QIO A;  1VQ9 N;  3VQP A;  5EU7 A;  3OHR A;  1JKH A;  3B8A X;  4BRN A;  3R8E A;  1QTM A;  4Z4F A;  3KKR A;  4M3W A;  4E3S A;  3QEI A;  3LL3 A;  1CXU A;  4KHU A;  4MO5 A;  3OVN A;  3VPZ A;  4JKC A;  3LAM A;  3THY B;  1C1A A;  2UXD K;  2W40 A;  3M8P A;  3DWL A;  1Q8I A;  4NO7 A;  3AY9 A;  1YAG A;  4CJU A;  3CCM N;  3RSE A;  2VG6 A;  3MXI A;  2O8C B;  1NJW A;  1CZB A;  1Y97 A;  1U6Z A;  1ITG A;  1JLF A;  4FJG A;  4EAH D;  4G1Q A;  3ZX0 A;  3D0P A;  2DY4 A;  5HRS A;  1ATN A;  3Q7C A;  2O4G A;  4CZK A;  3CCJ N;  5SWM A;  3VOV A;  4PUO A;  2YCH A;  1FKP A;  5JS2 A;  4CES A;  2HNY A;  3KZB A;  3V9X A;  3J80 O;  4DQP A;  4CFC A;  4AF1 A;  1HNZ K;  4CED A;  4H5V A;  3QLH A;  3CM6 A;  4FWN A;  3ALY A;  1TKX A;  1NJX A;  3C6U A;  4N5S A;  2E20 A; 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4B8CA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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