4BC2A

Crystal structure of human d-xylulokinase in complex with d-xylulose and adenosine diphosphate
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
528
structure length
528
Chain Sequence
APRRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
molecule keywords XYLULOSE KINASE
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 180
structure length 528
sequence length 528
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc2A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc2A01
2FSJA 3L0QA 1E4FT 3H6EA 1DEJA 5LY3A 1BO5O 1KAXA 3LDNA 4CZMA 3HZ6A 4PKGA 4XH1A 2P9LA 4FSVA 5EVZA 4BQZA 3D2FB 3JS6A 2KHOA 3HI0A 3VEZA 5ADXA 3MK6A 3D7EO 3VOVA 4K41A 4BC4A 3AAPA 3VGLA 1QQOA 3IUCA 2VYPA 3DXMB 2W40A 3VF4A 3EKSA 3VESA 3H1QA 1HPMA 2J4RA 3CQXA 3VEOA 4B1VA 5FPMA 1TYQB 3GDQA 3AARA 4EHUA 3W3DA 2IVPA 1HUXA 4CJ7A 5F1XA 2CH5A 4A61A 3L4IA 4C23A 4PL7A 5AQYA 4EFHA 3A5LC 2NZTA 2ZF5O 1MDUB 5AQFA 4HWIA 1RGIA 4XEIA 3UE5A 3ZEUA 3M3ZA 4BG8A 5KPTA 1BA0A 2PAVA 3UKRA 1GLLO 4B1UB 3CJ1A 3FE1A 3EL2A 3QFPA 3GL1A 4FWPA 3B8AX 3VENA 1KXPA 4BRHA 3HTVA 5AQUA 2CH6A 3H3NO 1ATSA 3LDLA 3VETA 1V4TA 3QBXA 4M7YA 4I6MB 3I8BA 3J8AA 3M6GA 2P9NB 3BEXA 3LDQA 1WOQA 3G25A 3O1WA 3CIPA 4WYBA 2E2OA 3BP8A 4FWMA 1IJJA 4BRKA 5AR0A 4B1ZA 1HLUA 2DPNA 3KZBA 3QICA 4JN4A 3O08A 4MLEA 2QXLA 2ITMA 3LL3A 1NBWA 4KBOA 5B8HA 4GNIA 2FF3B 1NM1A 4BVOA 3LDOA 3UB5A 1NGGA 2A3ZA 3LDPA 4IWVA 5BN9A 3ZETA 4FWOA 1JCGA 4EIAA 2GWJA 4JNEA 4BR2A 1GLCG 3ZETB 3P4IA 3ZX2A 2QWOA 1LCUA 2P9PB 3D2EA 1NGJA 4CZFA 5KPZA 3CHWA 3H1VX 2HOEA 1K8KB 4BGBA 3A5OC 2ASMA 2W41A 4E1JA 3MDQA 3A8YA 2E1YA 1V4SA 2VWBA 3FLCO 4BRFA 4FOEA 3MCPA 2Q97A 2ZGZA 4BG9A 4H0OA 1S22A 4BRAA 4CBXA 2PBDA 5AFUH 1X3MA 4ISFA 4EAHD 2QWNA 2Q2RA 4FWRA 4WQ5C 5BRHA 4XH4A 2E2PA 4B1XB 3VERA 3MN9A 3R6MA 5JMVA 3M1FA 3ENOA 2Q1NA 3QDKA 3H46O 1G99A 1GLBG 2Q0UA 3VGKA 2F9WA 2D0PA 3WUHA 5KQDA 3VEVA 1XC3A 2P9IA 1JCFA 4YDUA 1NGBA 1SZ2A 2HMPA 3GG4A 4BRMA 1GLJO 4FWQA 5JLFA 2ASPA 3MN7A 1C0FA 2ASOA 3O80A 1JCEA 1GLFO 1BWFO 5AZJA 3IFRA 3ENHA 3H45C 5AQOA 2YHXA 3DAWA 4FL9A 4BR0A 5AZJB 3ATVA 5BRFA 3SMSA 4BR7A 2P9LB 4BRQA 4CZEA 4B9QA 3GOIA 4Y0WA 4BRPA 2AA4A 3A5NC 3VEYA 2Q36A 3BF1A 4CZGA 2A42A 4O8KA 5AQWA 5F0XA 1NGDA 2CGJA 1HKBA 3ZX0A 4NB4A 3EO3A 4RCHA 5E26A 5JLHA 3FZLA 3A5MC 1H1VA 4BREA 4H5TA 3VF6A 3ULEA 2NLXA 4DB3A 1U6ZA 3VEWA 1GLDG 4FO0A 3KVGA 1NWKA 4F9OA 1NGFA 2A5XA 2QM1A 3S41A 4L3QA 1NGEA 1BG3A 3EKUA 3DXKA 4YDUC 4BQLA 1DGKN 2EWSA 4H5WA 3RSEA 3QBWA 1YXQA 4EHTA 3CI5A 3DXKB 5BREA 1BDGA 1WUAA 2A41A 3ZEUB 1XUPO 5BPNA 2E88A 3MN6A 1J6ZA 3JXUA 1XQSC 4H03B 1SQKA 3CJBA 5AQZA 4CZKA 3UKRB 2YI1A 2H3GX 1QQMA 3H3OB 4MO4A 3WEEA 3A0IX 1T44A 5AQGA 2IVNA 1U2VA 2V51B 5AQSA 3IMXA 5AQLA 1DKGD 2D1KA 2ZGYA 1QHAA 4BGAA 2Q0RA 5AQRA 2FXUA 4BRLA 1TUYA 3MMVA 4PKHA 1ZXOA 4BVPA 4K43A 4CBUA 4JHDA 5EY4A 3MN5A 2E2NA 4BR9A 3IDHA 4CD3A 1YAGA 2YHWA 4H5RA 5FPEA 5FPNA 2BUPA 5F2RA 2UYTA 4O5FA 3CJ9A 4FWNA 1RDWX 4A2AA 5I9EB 4BRGA 3HSCA 3ATUA 3FR0A 3FZHA 3CQYA 2I7NA 3AAQA 4DCHA 2P9UA 4IXCA 3SMPA 2QW9A 3WQTA 4M7XA 3I33A 4QS9A 4CI6A 1EQYA 2CGKA 4K42A 2D4WA 3TPQA 4FWLA 4BC2A 3TU5A 4H0XB 5AZIA 1CZAN 5AQXA 3FZMA 3D2EB 3UKUA 3U9DA 5AZIB 4CBWA 1ATNA 1BUPA 3O8MA 3UKUB 2P9SA 4DQ8A 3AY9A 4ISEA 4J8FA 4H0YB 4HTLA 3CETA 4A2BA 5BPMA 1YUWA 4DHYA 1ZC6A 2IIRA 5LJVA 4WQ4A 1YVNA 1MA9B 1NGHA 3C0BA 4PL8A 4B1WB 3F9MA 4JD2A 3O6WA 3WQUA 1Y64A 2IVOA 3O1BA 4JD2B 3QMLA 2QWPA 2P9IB 5EXWA 5BRDA 1S3XA 3O4WA 2YJFA 3FGUA 4XH5A 2P9KA 2BTFA 2FF6A 2GELA 3O5BA 4GY2B 5EOYA 5CE3A 1QZ6A 1KAZA 5KQ8A 4Z94A 5LJWA 4RTFD 1Z05A 1R59O 4H5NA 1HX1A 4IO8A 2AP1A 1MWKA 3GBTA 5ADXH 4FWSA 1TUUA 2YJEA 4BC3A 3D2FA 1ZBSA 3U9ZA 4A62A 2A6AA 2HF4A 4NO7A 1IG8A 1BA1A 3FZFA 4WQ4C 3ULEB 4H5VA 3DXMA 3BUZB 3CJAA 3U4LA 5KPRA 1LOTB 4H0TB 3VGMA 3WXLA 3SK3A 3WT0A 2GUPA 1TYQA 1X9JA 1X3NA 4BR5A 3FFKB 4BROA 2D0OA 1RFQA 4FWKA 1ESVA 5AQPA 3SLCA 3LM2A 1QZ5A 2A40A 4IJAA 3EZWA 2E20A 3L6QA 4PKIA 3RSEB 2E1ZA 4H0VB 1NGAA 2NRHA 2ZWHA 4FPAA 4RWTA 4MLHA 3CJ7A 5AQMA 4QS7A 1HKCA 1GLAG 3OHRA 2I7PA 2YHYA 1P8ZA 5ELZA 3HM8A 5FPDA 3SJHA 3WEEB 5AQQA 1U2VB 3WXIA 3ZX3A 4H0PA 1NGIA 5AQTA 2FSKA 1HKGA 1OKJA 4JHDB 2FLOA 4CD1A 2GEMA 3KHYA 5AQIA 4B1YB 1E4GT 2OANA 5TKYA 1ATRA 4FPBA 5JICA 1NLVA 2QWLA 5E84A 3HBTA 4I6MA 2YCHA 1MWMA 3R8EA 2Q31A 4BRDA 2P9NA 4CZJA 3CJCA 3QFUA 2QWMA 3VPZA 2CGLA 3CERA 4CZHA 4WQ5A 1C0GA 1Z6RA 2P9UB 2QWRA 3ID8A 5AQJA 3DWLA 1T6DA 3WXJA 4AM7A 4ISGA 3QB0A 4JAXA 4BC5A 2VCPA 1NGCA 2E2QA 4BRCA 5AQKA 2GTDA 3VF2A 1D4XA 1KAYA 2QWQA 3R9PA 5BR9A 2V7ZA 5AQHA 1BU6O 1GLEG 3C7NA 2V7YA 2P9SB 1SAZA 2V52B 2HF3A 3C7NB 4IJNA 2P9PA 3EN9A 5AQNA 4CZLA 4IZ9A 4FOIA 1K8KA 2FSNA 3LM9A 4MO5A 1QQNA 2F9TA 2WUSA 5AFUA 1NMDA 3WXKA 1HJOA 3DJCA 4K25A 5BN8A 5BPLA 5EX5A 1T6CA 3GE1A 4CZIA 3W0LA 3FZKA 2P9KB 3BF3A 1Q18A 4M63C 2E8AA 5AQVA 3U8XA 4BR4A 4QS8A 4BRIA 1BOTO 4BRNA 2GWKA 4AM6A 4LC9B 3VEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FLYA 3L0QA 1S1WA 3LPUA 3H6EA 1BO5O 1KAXA 4PKGA 4FJ9A 5EVZA 3KWGA 4CE9A 3OYDA 1ILYA 2KHOA 5C42A 3PSFA 3D7EO 3VOVA 4J2AA 1Q82O 3IUCA 4FLXA 4NLBA 2VYPA 4AHRA 4JI3K 3VF4A 2J4RA 2QK9A 4M41A 3PLAA 4IKFA 3KTQA 2IVPA 2CH5A 4JKCA 3ZT0A 4DU3A 2X6SA 1RT4A 1WBBA 3KWIA 4EFHA 2G8IA 1MDUB 5AQFA 4HWIA 4M3UA 4XEIA 2A1RA 4ZTFA 4FK4A 3NMUA 1VSJA 3O9RA 5KPTA 2OPSA 1B9FA 3VQ6A 4CJRA 4BACA 5BR8K 1ITGA 2PAVA 1HNXK 4F3TA 2QXFA 1JLFA 3E66A 3GL1A 2YV0X 2HNZA 3VENA 2W42A 1Y97A 3T7ZA 4BRHA 4E7HA 4DR7K 1O1WA 5AQUA 1XMOK 1NK7A 4DFMA 4IDHA 3H3NO 3VETA 3LDLA 3QBXA 4AHSA 4E1NA 3F73A 4I6MB 3RMCA 3M6GA 2P9NB 3BEXA 3LDQA 4OO1J 2NUBA 1WOQA 3O4QA 3KIOA 1HLUA 4JN4A 3O08A 4FZYA 3AVAA 1S72N 2ITMA 3LL3A 1NBWA 1J5EK 1SUQA 1NGGA 4JK9A 2A3ZA 3QETA 4IWVA 1TKDA 5JVGL 4FWOA 3M8QA 2GWJA 3SYZA 4JNEA 4QCLA 1GLCG 1JLGA 2QWOA 4DS4A 1TKTA 1EP4A 3OYKA 3VQPA 4Z4FA 1NGJA 4CJSA 2DFHA 3H1VX 2HOEA 5I3UA 3KLIA 4F3OA 4BGBA 4DV1K 3A5OC 3A8YA 1LWCA 4CEQA 1Q9XA 4FOEA 2OZMA 2ZGZA 1ASUA 4BRAA 4B9SA 1X3MA 3NHGA 3V4IA 5KRTA 4EAHD 1XMQK 3S9HA 5JMVA 3R6MA 1S9GA 1TL3A 3M1FA 3MN9A 3QDKA 3OY9A 2G8FA 4PY5A 1S5JA 3QINA 4FZZA 1P90A 1TKXA 4LFAK 2D0PA 4DQQA 4EZ6A 2P9IA 2OZSA 1KLMA 2ZE2A 1J5OA 1VRTA 4JK7A 5JLFA 1XHZA 1R0AA 2BDPA 3O80A 5AZJA 4QAGA 1IH7A 3ENHA 3H45C 5AQOA 3DAWA 4JKGB 4LF8K 4BRQA 4B9QA 1JL1A 4BRPA 1J53A 3BF1A 4CZGA 1NOYA 2A42A 3ZSZA 2RF2A 2ZD1A 3LP1A 4DTMA 2F8SA 1RT5A 4DLEA 5E26A 1RTHA 1BISA 1GOAA 3VQ7A 3O9TA 1Z26A 2GX9A 3BY5A 1LW2A 3K9KA 3ULEA 2NLXA 4DB3A 3MWPA 2IOCA 2YNFA 5M1NA 4NCAA 4FO0A 3CCSN 1NGFA 5KI6A 3OYCA 2BE2A 3A2FA 4YY3K 3V81A 1UA1A 1D9DA 2EWSA 4H5WA 3QBWA 5BREA 4I7FA 1WUAA 3C6AA 2VQEK 3JXUA 4RG8A 4H03B 3CJBA 5AQZA 2H3GX 1DTTA 4MO4A 2GBZA 3A0IX 1SKSA 3T3FA 5AQSA 3ZSYA 4CGJA 2Z1GA 1QHAA 4BGAA 3SQ0A 4PKHA 1ZXOA 3V1QA 4CBUA 3SQ2A 3I56N 1T8EA 3K9JA 3RTVA 2E2NA 4MFBA 4BR9A 1YAGA 4H5RA 4E3SA 4LF9K 1VK0A 4B3RK 3CJ9A 1JLQA 5I9EB 3P5JA 3HSCA 3G0ZA 1TV6A 4N5SA 3CCEN 1VQPN 1VQLN 2ZJPL 2P9UA 2QW9A 4WE1A 3I33A 3WNEA 1EXQA 4QS9A 4CI6A 3V9ZA 1FKOA 3TPQA 2WOMA 5C2FA 4BC2A 3TU5A 1KFSA 4IEEA 1VQ9N 2HVHA 4DV4K 1CZAN 5C10A 3MX5A 4JKHA 5AQXA 4IG3A 4CHPA 3UKUB 2P9SA 4ISEA 4H0YB 2YX6A 5HRPA 1ZC6A 1S6PA 4DTNA 1MA9B 1FW6A 4FJHA 4DKWA 3NF7A 4PWDA 1OH6A 4BDZA 3SQ1A 2IVOA 4JD2B 5C12A 3QMLA 2QWPA 2JGUA 4E7JA 3QEWA 4C8LA 4XH5A 4FM0A 5T7BA 1FXXA 4KHNA 5KQ8A 4KB1A 1HJRA 1TAUA 3OYAA 4AHCA 3V1OA 4OKJA 3OYIA 1VQ8N 4JV5K 1CLQA 4CGIA 4CHNA 1C1CA 2XY6A 1O13A 1CZBA 2HW3A 4KREA 5DMRA 1VSMA 5CYQA 4CHYA 4YHHK 1HYSA 3AVMA 4H5VA 3QNOA 4OPHA 2F96A 3BUZB 3U4LA 4MDBA 4HHTA 2GUPA 1NOZA 4DFKA 2QKBA 1QSSA 1X3NA 4BROA 2D0OA 3TTFA 5AQPA 4M3ZA 3CXCM 2B4JA 4IJAA 3L6QA 3OA9A 4C1NI 1C1BA 2KFNA 1HYVA 2YNGA 1GLAG 2IDOA 1BIZA 4AH9A 3ID6A 4FW1A 3CQ8A 1YJWN 4A5BA 1K9MO 1FJGK 3RR7A 3HK2A 3WEEB 3IRXA 3F2KA 5CZ2A 3T1AA 1BL3A 4JHDB 1OKJA 3TI0A 2D0BA 1C1AA 2ZJRL 2GEMA 3KHYA 1WSIA 2HNDA 4Z4GA 3TANA 2VWJA 2O8DB 1N34K 1NLVA 3Q7BA 3MWTA 1VQ6N 4I6MA 4B08A 3R8EA 2B5JA 3AVGA 3LWMA 4DTSA 2P9NA 4GV6A 1JLBA 3QFUA 3OYJA 4CZHA 3VA0A 1RBTA 1T6DA 3QB0A 4JAXA 3D0PA 4BC5A 2VCPA 3M8PA 3DM2A 2JWKA 4BRCA 2QKKA 5IWAK 3VF2A 2PY5A 1U04A 3R9PA 4DTXA 2PZSA 4XIUA 4K8ZA 1RDDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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