4BC2A

Crystal structure of human d-xylulokinase in complex with d-xylulose and adenosine diphosphate
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
528
structure length
528
Chain Sequence
APRRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
molecule keywords XYLULOSE KINASE
total genus 180
structure length 528
sequence length 528
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc2A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc2A01
5LJWA 4KBOA 2KHOA 4RWTA 3WUHA 5AQIA 5I9EB 1NGHA 1K8KB 4XH5A 3J8AA 5AZJB 2J4RA 3VGLA 3WEEB 4EIAA 4FO0A 3UE5A 4K25A 4HWIA 5ADXA 2Q2RA 3H6EA 4XH4A 3BP8A 2YHWA 1NGFA 4CI6A 5CE3A 1K8KA 5AQRA 3ZETB 2OANA 4BRFA 2VYPA 4A61A 1KXPA 2A42A 4H5VA 3FZHA 2GEMA 2A5XA 3WT0A 4ISFA 3WEEA 1ZXOA 3BF1A 2PAVA 3H46O 4WYBA 5BPLA 1J6ZA 4CD3A 1TUYA 2P9SB 2A40A 1R59O 4EFHA 1QQNA 3WQTA 5AQSA 3U9DA 4IJNA 5BPNA 3I33A 3EO3A 3M3ZA 3ZETA 5EXWA 1V4SA 1YUWA 3L6QA 1C0FA 2P9PB 3A5MC 3DWLA 1Z05A 4BC4A 2AP1A 3O08A 4L3QA 4FWOA 4Z94A 3HTVA 4PKIA 3CQYA 3VEWA 3ATUA 2WUSA 2Q31A 3M1FA 2I7NA 2YCHA 4EHTA 1T6CA 3CERA 3U4LA 4M63C 2FXUA 1U6ZA 1RFQA 3AAPA 4JHDA 3M6GA 3JS6A 2P9PA 5LY3A 3FFKB 2E2OA 1WOQA 4FPAA 4O5FA 3AY9A 3MN9A 3B8AX 1KAZA 3ZX3A 3CETA 3FZFA 1GLDG 2YHYA 1XQSC 4RCHA 4CZLA 1X3NA 3U9ZA 1BU6O 3GDQA 3L4IA 3R6MA 3ZEUB 3MN6A 4CD1A 2PBDA 1MA9B 2D0PA 2E1YA 4FWLA 5FPMA 4XH1A 2ZGZA 3GOIA 1GLJO 5AQNA 1HUXA 4H0OA 2GUPA 3DAWA 5AQGA 3QDKA 1ZC6A 5KPRA 3VERA 1NGBA 5AQPA 3D2EA 5AQUA 3FGUA 3U8XA 4WQ4A 1NGGA 2E2QA 2FSNA 5KPZA 5AQHA 4JNEA 3R8EA 3FE1A 4A2BA 3VPZA 3MCPA 3R9PA 1HPMA 4H0YB 4BR9A 3VEXA 5AQMA 3UB5A 3ENOA 3D7EO 4H0VB 5AFUA 2P9UB 2VCPA 3A5NC 3TPQA 4MLHA 1D4XA 1TYQB 5EX5A 4CZJA 1BOTO 2A41A 3O5BA 5F2RA 1XUPO 3IUCA 1Y64A 4K42A 2ZWHA 4QS9A 1HKGA 4A62A 4BRKA 1NGCA 4JD2B 3FZLA 5FPEA 4CJ7A 3IDHA 2UYTA 1TYQA 3BUZB 4J8FA 2QWLA 3VOVA 3A5OC 2FLOA 1C0GA 1JCGA 2E2NA 3QBXA 4JD2A 3WXKA 4FWPA 1WUAA 4BR5A 1MWKA 5E26A 2AA4A 3O1BA 4MO5A 3EKSA 1IG8A 3MN5A 4DB3A 2GELA 1LCUA 5AQFA 2QW9A 4B1WB 3HI0A 2P9LB 5F0XA 4AM6A 3SJHA 3LDLA 3MK6A 1NGEA 3TU5A 4H0TB 5AQYA 3CQXA 2F9WA 2W40A 3FLCO 1TUUA 4B9QA 2HMPA 4AM7A 3W0LA 1S22A 2QWRA 4IXCA 2FF6A 2P9LA 4Y0WA 1CZAN 1NGDA 3FZKA 3EN9A 1MWMA 4JHDB 2VWBA 4BRCA 1QZ6A 5AQJA 2P9IB 3O4WA 3CIPA 3FR0A 4NB4A 2CH5A 4BR2A 3ULEB 1NLVA 1E4FT 3ENHA 4CZGA 1KAXA 3CJ1A 3P4IA 3LM9A 4BRGA 1S3XA 5ELZA 4BQLA 3ZX0A 3WXIA 1QQOA 1QHAA 4M7YA 1HKCA 4FSVA 3VESA 4H5RA 3DXMB 1GLBG 2BTFA 2P9IA 3CHWA 3G25A 3DJCA 3SLCA 2D1KA 4C23A 3O8MA 3ULEA 4EAHD 2E20A 4B1YB 1NMDA 5EOYA 1V4TA 4YDUA 4BC2A 1SAZA 3D2EB 3VGKA 3CJCA 3ID8A 5BRFA 4BC3A 5E84A 2QWOA 3LDQA 2HF3A 3QICA 3SMSA 2IVNA 3FZMA 4H0PA 3DXMA 1X9JA 3GBTA 3LL3A 4H5NA 3VEZA 1QZ5A 3A5LC 2GTDA 3QMLA 3OHRA 3MN7A 5BN9A 4QS7A 4CZKA 2CGJA 2YI1A 1BWFO 1GLFO 4WQ5A 2A6AA 2YHXA 3VENA 4BR7A 2E2PA 2ITMA 4NO7A 4A2AA 3O80A 1E4GT 3ZX2A 4BVOA 3VETA 3AARA 1ESVA 4BRNA 1NGJA 4HTLA 4B1ZA 4B1VA 2FSJA 3LDNA 4BG8A 3LM2A 3WXLA 5EY4A 4CZHA 3LDPA 5EVZA 2Q0UA 4BRAA 3VF6A 3WQUA 4DQ8A 3GE1A 4FWMA 3HSCA 2HF4A 1GLCG 4BGBA 3KZBA 3KHYA 5AZIA 5BPMA 1ZBSA 2D0OA 3H3NO 4O8KA 1YXQA 4CZMA 2Q1NA 3UKRB 1GLLO 1X3MA 2V51B 4PKHA 3VF4A 4RTFD 1YVNA 5JLHA 1ATNA 1Z6RA 3CI5A 3GG4A 5BREA 2CH6A 1BG3A 3DXKB 2Q0RA 3AAQA 2I7PA 4BRQA 1JCEA 4F9OA 4H5TA 2YJFA 3H45C 4H0XB 1Q18A 2EWSA 1NWKA 3UKRA 3D2FA 1HJOA 2GWKA 5AQVA 5AQKA 5LJVA 1JCFA 2A3ZA 4BREA 3DXKA 4FOIA 4B1XB 3F9MA 1SQKA 2P9NB 4BR4A 1NGAA 5BN8A 2ZGYA 1ATRA 2E8AA 5TKYA 3C0BA 1U2VB 5JLFA 5AQLA 4CBUA 1NBWA 2DPNA 4ISGA 2ASPA 2QM1A 3QB0A 2ZF5O 4YDUC 2P9NA 1BUPA 1BO5O 4BRPA 5FPNA 3BEXA 3C7NB 4BRHA 1U2VA 4IZ9A 1BA1A 2NRHA 3CJ9A 4IWVA 4IJAA 5AQOA 4FPBA 3IFRA 4GNIA 3QFPA 3MDQA 2QWMA 4WQ5C 4BRIA 1GLAG 3L0QA 5ADXH 1BDGA 4FWRA 2E1ZA 2IVOA 3HM8A 5AQQA 3H1QA 1HLUA 4WQ4C 3C7NA 1DKGD 4MLEA 3O1WA 5AZJA 2P9KB 3EKUA 4DCHA 1NM1A 3S41A 2V7YA 3VEYA 4MO4A 4B1UB 2IIRA 4FWSA 3VGMA 3LDOA 4K41A 4IO8A 4EHUA 2FF3B 1NGIA 3JXUA 4CZEA 2CGKA 1DGKN 2NZTA 2FSKA 4DHYA 5JMVA 3W3DA 4FWQA 4ISEA 3QFUA 4K43A 3CJAA 2P9KA 3H3OB 3RSEB 4M7XA 2NLXA 3VF2A 1P8ZA 1YAGA 5KQDA 2P9SA 1ATSA 3KVGA 1RDWX 3ATVA 2E88A 2QWQA 3H1VX 4FL9A 1T44A 2P9UA 2QWPA 4CBWA 3HBTA 2ASOA 5KQ8A 2Q36A 2ASMA 3RSEA 4E1JA 1G99A 3QBWA 2F9TA 4H5WA 5KPTA 2YJEA 4I6MB 1T6DA 4PKGA 5AZIB 1DEJA 5AR0A 3CJ7A 5AQXA 4BRDA 4H03B 3IMXA 4BGAA 5AQWA 1XC3A 3VEOA 3MMVA 1SZ2A 4BRMA 5B8HA 1OKJA 3EZWA 3EL2A 4XEIA 3A8YA 2D4WA 3UKUB 4I6MA 4JN4A 3BF3A 1GLEG 1MDUB 3SK3A 3ZEUA 3O6WA 4BVPA 3HZ6A 5BR9A 3D2FB 4FWNA 5BRDA 1EQYA 2GWJA 4BC5A 4BROA 1BA0A 1QQMA 5AQTA 4JAXA 4PL7A 2HOEA 3VEVA 2W41A 4CBXA 3UKUA 3WXJA 1KAYA 3I8BA 1IJJA 2V7ZA 3CJBA 4CZIA 3GL1A 5FPDA 2CGLA 5AFUH 3SMPA 4BRLA 1LOTB 2QXLA 1RGIA 4PL8A 2Q97A 5F1XA 2QWNA 5JICA 4QS8A 4CZFA 2H3GX 5BRHA 4BR0A 5AQZA 4BQZA 1HX1A 4GY2B 4LC9B 1H1VA 4BG9A 1HKBA 2IVPA 2BUPA 3A0IX 4FOEA 4FWKA 2V52B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KLHA 5J2QA 4CF1A 3VQ5A 1QVFM 5J2MA 3JYTA 1G15A 3CCVN 1LWFA 1HNXK 4KREA 2LSNA 4JI6K 2J4RA 1L3SA 3VGLA 3CFRA 3WEEB 3AV9A 3Q7CA 2Q2RA 2P5OA 4CJRA 1U48A 4YOXA 2OANA 4FJLA 3QIOA 1FKOA 4KFBA 2GEMA 3CCQN 2A5XA 3WEEA 3RVCA 3TAQA 3CCEN 3HT3A 3H46O 1TUYA 1JXEA 4JI1K 4UY8O 1UAXA 2RHKA 5BPNA 3G71N 2JLEA 3I33A 3M3ZA 5IT9O 5HRPA 3SPYA 1C0FA 4FM2A 3AO4A 4X66K 1NKCA 3O08A 3TSPA 2NRXA 5IWAK 4Z94A 4NXNK 3TANA 3WNHA 2IGIA 4AHCA 1NK5A 3PSFA 2P1JA 4DUYK 4EHTA 1T6CA 2O8CB 1S6PA 2FXUA 1U6ZA 3AAPA 3C94A 2IC3A 1C1AA 3JS6A 1WBDA 1IBLK 2F8TA 5DM6L 2XHBA 3M8RA 3HPOA 4R79A 3AY9A 3MN9A 4IFYA 3FZFA 2O4GA 3RTVA 1X3NA 4KPYA 3U9ZA 1BU6O 3L4IA 3LAMA 3R6MA 3MN6A 2PBDA 1MA9B 5C42A 2O8CA 3OW2M 5EU7A 1HUXA 4B8CA 4H0OA 1VQKN 4LF4K 2VG7A 1RDBA 3DAWA 3LPTA 2W6KA 1BQNA 3BGRA 3VA0A 5AQGA 1JLAA 5AQPA 1VQNN 1XHZA 3PIPL 1ZBHA 3OYBA 1KQSM 3FGUA 4KKOA 1XMQK 4B3MK 4JKAA 1NGGA 2E2QA 4LSNA 4NLCA 3V9WA 4X64K 1VQ4N 1NOZA 3FE1A 4A2BA 3VPZA 3MCPA 3R9PA 4F2RA 3VQQA 4BDPA 4E19A 2NUBA 4DFJA 3UB5A 3ENOA 2I5JA 1RTIA 2P9UB 3TPQA 5EX5A 1UA1A 3NFAA 4BACA 1XUPO 4LF8K 1T3VA 3AVNA 1FKPA 4NLBA 5FPEA 1NOYA 3J7YP 3R3LA 5I3UA 1L3TA 4E0DA 4J8FA 4DU3A 4CJKA 4DV4K 1NK7A 3CQ8A 2HHTA 4N41A 3A5OC 4H4MA 2E4LA 1YJ9N 3QBXA 3ZSOA 3NH1A 4WFBL 3KK3A 3WXKA 4X65K 1WUAA 5E26A 2AA4A 2Z1HA 4N56A 1SL0A 4IEEA 4IFVA 3O1BA 1N36K 3EKSA 4GW6A 2HNZA 3MN5A 4DB3A 2WTUA 2GELA 5AQFA 3QEXA 1XI1A 3IKMA 3E9LA 4WFNL 3O9TA 4AM6A 1BISA 5M1KA 2QXFA 3LDLA 1BGXT 1NGEA 3MK6A 1K8AO 3CQXA 2F9WA 1N6QA 1TUUA 3CC4N 4B9QA 3W0LA 3SBTA 1WNSA 1S22A 2FF6A 2UXBK 1J54A 3NDKA 4CFAA 4C8NA 4B9VA 3NGIA 4BY9C 1MWMA 4JKBA 4BDZA 4ELTA 5AQJA 3CIPA 2UUAK 4BR2A 3I56N 3SZ2A 4JK7A 3P4IA 3LM9A 4BQLA 4I9LA 3MECA 3WXIA 3EE8A 4CJ5A 4FSVA 1DLOA 4H5RA 2HHUA 3HXMA 4C23A 2D1KA 4DLGA 3KJVA 3L2RA 2E20A 4B1YB 5EOYA 2JWLA 4YDUA 4BC2A 4FXDA 1NJWA 4IFEA 4CESA 1HNWK 5BRFA 4JI4K 5E84A 4B3TK 4NCGA 3TARA 2IVNA 2RN2A 1X9JA 4TSXA 3VEZA 1QZ5A 4A5BA 3K2PA 4NYFA 1L5UA 5BN9A 1TVRA 4CZKA 2NRZA 4WQ5A 4NO7A 4A2AA 3O80A 3LP2A 2KZZA 2Z1JA 3OS2A 1ESVA 4B1ZA 4DQPA 4CIGA 3PX0A 5EY4A 1JLFA 2X78A 4CZHA 4ILGB 3AVAA 3ISNC 2R7YA 4EZ9A 4DS4A 4ILHA 2KKZA 3RMAA 3HSCA 4Q0BA 4BGBA 5AZIA 5BPMA 3H3NO 5BR8K 3VF4A 5JLHA 3J81O 1L3VA 3GG4A 2UUBK 4FJKA 1BG3A 4B9TA 4G1QA 2NRTA 2HBLA 4F9OA 1IKWA 3TAPA 1YJNN 3H45C 4CF2A 4JK9A 3K0SA 1TKDA 4DTPA 3OYJA 5AQKA 3K5MA 4J2AA 1JCFA 5HOOA 1I94K 4DSLA 3F9MA 1W7AA 2P9NB 1HYSA 1ATRA 2E8AA 2HHWA 3R1XA 1RDAA 1HJRA 4KO0A 1S6QA 3L2WA 3SBGA 1S72N 2QM1A 5FROA 4DR6K 3I0SA 1VQLN 3ENBA 2ZF5O 4YDUC 1WSEA 2P9NA 1BUPA 2BDPA 1K6YA 4FJJA 3C7NB 2G8IA 4BRHA 1ILYA 4IZ9A 4F3OA 1GOBA 2QWMA 4WQ5C 1HRHA 2G8VA 3VA3A 5C12A 3LZJA 5DMRA 2IVOA 5JVHL 5KGXA 3C7NA 5AZJA 1VQ6N 2P9KB 4EP5A 4DCHA 3P39A 1NM1A 1LW2A 1SL1A 2V7YA 3VEYA 1RDUA 1RTDA 4HUFA 4FWSA 3LDOA 3KK1A 3JXUA 4CZEA 3EYZA 2CGKA 2RKIA 1DGKN 2FSKA 4ELVA 4WFAL 5JMVA 5GAHP 3PO4A 3W3DA 3OYKA 1LW0A 4ISEA 1X9MA 2P9KA 3HRGA 4M3RA 3H3OB 1IBKK 3VF2A 1S5JA 5HRSA 2PYJA 2P9SA 2Z1IA 3KVGA 1VSEA 1RDWX 2IAJA 1VSFA 2XY6A 3H1VX 4JS4A 5A2QO 2QWPA 3E9OA 1KSPA 2GUIA 5KQ8A 4M3XA 1T7PA 3DMJA 4H5WA 4I6MB 1T6DA 3V9UA 3HL8A 1TK8A 5JVGL 1GOCA 3CJ7A 4OPHA 1NK8A 4E7IA 4DTOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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