4BC4A

Crystal structure of human d-xylulokinase in complex with d-xylulose
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
525
structure length
525
Chain Sequence
RRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
molecule keywords XYLULOSE KINASE
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 181
structure length 525
sequence length 525
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc4A01
4FWLA 3C0BA 1TUYA 2ASPA 3ULEA 3CJ1A 4BRAA 2FLOA 1R59O 2FF3B 2CGJA 3AAPA 4EAHD 3CERA 5BPMA 1HKGA 5ADXA 4JAXA 4JNEA 4CD3A 1JCEA 1NGBA 4BR9A 4IXCA 3FFKB 4B1VA 4AM6A 4BR5A 1ZXOA 4M63C 3R6MA 1KAXA 2E20A 1NGAA 1C0FA 2IVOA 1ZBSA 4I6MB 4JHDA 4JD2A 5KQ8A 2YCHA 3M1FA 3MN6A 2HF3A 1HLUA 5AQOA 2VCPA 3AARA 5LJVA 4I6MA 4DB3A 2WUSA 5AQJA 3FLCO 1QQMA 2P9KB 2BTFA 5B8HA 4K43A 1TYQB 4FOIA 1J6ZA 2KHOA 4MLEA 3S41A 5AQXA 3VGKA 3ENHA 3UKRB 3LDPA 4BRHA 3UKUA 2W40A 3ID8A 3QBXA 5CE3A 5F1XA 5KPTA 4IZ9A 2YJEA 2P9KA 3ZX2A 3CJ9A 3SK3A 2E2PA 3R8EA 3GBTA 1TYQA 2A5XA 4FSVA 2Q31A 4CZKA 2FXUA 3FZMA 3A5NC 3GDQA 1OKJA 3VGLA 3D2EA 4BVPA 5I9EB 3TPQA 1T6CA 3IMXA 3DAWA 3BUZB 3W0LA 4BVOA 1Y64A 2IIRA 1NGDA 4QS8A 1U6ZA 2V7YA 2YHXA 3I33A 4AM7A 3O08A 5JMVA 1GLJO 5TKYA 4FO0A 5AQRA 2I7PA 3TU5A 3VF6A 3WXJA 5AFUH 3QDKA 2H3GX 2GEMA 5AQUA 5BR9A 3DXKA 2P9PB 4XH5A 2ITMA 2Q2RA 3C7NA 4CZJA 4CBXA 2PAVA 3CHWA 1KAZA 1X9JA 3RSEA 5AQFA 4BC2A 4CZEA 5AQWA 4BGAA 4H0OA 5E84A 1NWKA 3HI0A 4H5RA 3VF4A 1YUWA 2D0OA 3WXIA 3CETA 2P9LB 5AQYA 3ZEUB 4BRDA 4FPAA 5JLFA 2P9UA 2A6AA 5BPNA 1K8KB 3A5LC 3VEOA 3FZHA 3O5BA 4BRPA 4BRCA 3MCPA 3ZEUA 1RFQA 4KBOA 4FWKA 5BPLA 1WUAA 5EX5A 2FSJA 4YDUC 2D4WA 1GLCG 3KHYA 2AA4A 1GLBG 4H0XB 4PKIA 2GWJA 2P9SA 5FPNA 3VESA 1GLLO 3CIPA 3ULEB 5EXWA 4O8KA 3M6GA 1NGGA 1BUPA 1XUPO 3LM9A 5EY4A 2GTDA 4CZFA 2VYPA 1NGEA 2BUPA 3KVGA 4FWSA 3HTVA 4BRNA 3FZFA 3CJCA 3DWLA 3ZETA 4RTFD 4Y0WA 1U2VA 4EIAA 1DKGD 2ZGZA 4F9OA 5AQIA 5AZJA 4H0VB 4JHDB 4JD2B 4DQ8A 1NGIA 3A5OC 4K41A 3I8BA 3ATVA 2UYTA 4ISEA 5AR0A 4BR2A 4PKHA 2ASOA 2NLXA 2E8AA 2YI1A 4QS9A 3VEVA 3ENOA 4FWRA 2Q0UA 3QB0A 4H0TB 3JXUA 4BRKA 1NGCA 4FWMA 1QHAA 3O1WA 2FF6A 1Z6RA 3ZX3A 4JN4A 4LC9B 2QWQA 3WUHA 3UKUB 4A61A 4H5WA 4QS7A 1QZ5A 2GUPA 3IFRA 3DXMB 1WOQA 3QBWA 3MN9A 4ISFA 4NO7A 4BRMA 5AQMA 1DEJA 4FOEA 4H5TA 4BRFA 3EO3A 4H0PA 5EOYA 3D2FA 1GLAG 5AQNA 3VF2A 1MWKA 1TUUA 3DXMA 1S22A 1X3MA 5AQSA 4BG8A 3D2EB 3FZLA 3D7EO 3KZBA 4YDUA 2I7NA 3G25A 3U8XA 1E4GT 3FE1A 2ZWHA 4M7YA 5KPRA 3WXKA 1BG3A 3VEWA 1NGJA 4BQLA 3MN5A 4H0YB 4MO4A 4GY2B 2Q0RA 2ZF5O 3OHRA 3FZKA 3VEYA 4B1WB 5BRDA 2F9TA 4BRGA 1ATSA 3IDHA 4FWQA 1D4XA 3DXKB 4BR0A 3C7NB 1NMDA 5BREA 3EL2A 1MA9B 4A2AA 4BG9A 3CQXA 4IO8A 4FWNA 1RGIA 3MDQA 3RSEB 3U9ZA 1HUXA 3ZX0A 4A62A 4CZHA 3HBTA 1CZAN 1Q18A 5AQKA 3WEEA 4BC3A 5F2RA 4DCHA 3DJCA 4EHUA 4HTLA 1HPMA 3VOVA 3A5MC 2HMPA 3MMVA 2A3ZA 3CJBA 2A40A 2Q36A 2E2QA 2P9UB 4H5VA 4RCHA 2IVNA 5AFUA 1BO5O 3VEZA 2YJFA 3LDNA 4CD1A 2A42A 5AZIA 4BROA 4CZLA 2E2NA 2V7ZA 4FPBA 3H46O 1C0GA 4B1XB 2YHWA 4B9QA 2CH5A 1KAYA 4CZGA 1H1VA 3AY9A 1JCFA 1LCUA 3VEXA 4B1YB 3WQUA 2P9SB 2QWRA 4PL8A 3WT0A 4CZMA 5ELZA 1HX1A 2P9NA 2A41A 3LDOA 4IJNA 3W3DA 2QM1A 2QWPA 3EN9A 4HWIA 4CBUA 3BP8A 3UE5A 2D0PA 2IVPA 5BRHA 1ZC6A 4GNIA 4C23A 3ZETB 1HKBA 2DPNA 1BA0A 3CQYA 4BGBA 3BF3A 3BF1A 1U2VB 2NRHA 3ATUA 1JCGA 2Q97A 1KXPA 5AZJB 4BRLA 1ATNA 1GLFO 1XC3A 3GL1A 4WQ4C 2P9IA 3SLCA 4J8FA 1ATRA 5AQPA 3A8YA 3O80A 1SAZA 3JS6A 2F9WA 3VPZA 2QWOA 2QWNA 2YHYA 3P4IA 1P8ZA 2GELA 4L3QA 4NB4A 5F0XA 3H3NO 1DGKN 5FPEA 3GE1A 4FWOA 5BN9A 4BR4A 3D2FB 5AQQA 3M3ZA 4Z94A 2QWLA 4K25A 2E88A 1HKCA 2Q1NA 4DHYA 4B1UB 3O8MA 3EKUA 3HZ6A 5KQDA 2EWSA 3AAQA 2CH6A 1GLEG 4CI6A 5JLHA 4MLHA 3FGUA 3SMSA 1NBWA 4MO5A 2ZGYA 5AQHA 2V51B 2HOEA 4EHTA 1Z05A 3VETA 5FPMA 3BEXA 1MDUB 1BU6O 3MN7A 3LDQA 4K42A 1V4SA 3CJAA 3LDLA 4H03B 5E26A 2E2OA 4BC5A 1NGHA 1NLVA 1EQYA 3O4WA 5AQGA 3CJ7A 1ESVA 5BRFA 3B8AX 5JICA 1BA1A 3L6QA 1SQKA 3QMLA 3UKRA 1YAGA 1SZ2A 1IG8A 1YXQA 3GG4A 3WEEB 4RWTA 5LY3A 2AP1A 4WQ4A 1T44A 4IWVA 4WQ5C 2VWBA 4PL7A 2V52B 3O6WA 3VENA 3LL3A 1GLDG 4XEIA 5EVZA 3SMPA 3WXLA 4CBWA 4FWPA 3H1VX 3MK6A 2J4RA 3L0QA 2ASMA 2OANA 2QXLA 3HSCA 3H3OB 4B1ZA 5AZIB 3F9MA 4BR7A 1RDWX 2CGKA 4IJAA 3H6EA 1QZ6A 1XQSC 3O1BA 1BWFO 2QW9A 1V4TA 4O5FA 3U4LA 3EZWA 4BRIA 4M7XA 3J8AA 4ISGA 5AQLA 5AQVA 1LOTB 4H5NA 4BC4A 5AQZA 5BN8A 1QQNA 3FR0A 5KPZA 3EKSA 3QFPA 2P9NB 3VERA 2D1KA 1NM1A 3VGMA 3WQTA 2P9PA 2E1YA 4E1JA 1YVNA 4A2BA 2HF4A 3SJHA 1NGFA 5LJWA 3QICA 2FSKA 3R9PA 1MWMA 3IUCA 2QWMA 3GOIA 3H1QA 1QQOA 3QFUA 2CGLA 1G99A 3H45C 5AQTA 2E1ZA 3LM2A 1T6DA 1S3XA 1X3NA 4WYBA 4BRQA 3A0IX 3CI5A 2P9LA 3UB5A 1BDGA 5FPDA 2P9IB 2PBDA 4CZIA 2W41A 1IJJA 4BQZA 2NZTA 3U9DA 1K8KA 4EFHA 2GWKA 2FSNA 4PKGA 5ADXH 3HM8A 4XH4A 4BREA 1E4FT 1HJOA 4FL9A 4WQ5A 4CJ7A 4XH1A 3L4IA 1BOTO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKEA 1TUYA 4E1NA 4BRAA 3O3HA 3OYAA 3AO5A 2HHWA 3AAPA 2O8DA 1HKGA 4JNEA 4HHTA 5HLFA 1N8RO 4AM6A 3KWIA 4CEOA 3KLHA 1VQ4N 4WFBL 4M63C 2E20A 3N4QA 3LP3A 4I6MB 4JHDA 1T05A 2RHKA 2YCHA 4CEBA 2G8FA 3OJSA 3P1GA 3TWHA 4JV5K 5AQOA 1SKRA 4I6MA 2P9KB 2KHOA 3C95A 3ENBA 3HVTA 5CE3A 2W40A 3ID8A 3QBXA 3SV4A 2P9KA 1L3TA 3QESA 3CJ9A 2G8VA 3CD6N 2XHBA 1NK0A 1K8AO 4NCBA 1JLEA 4V19S 1KFSA 4M3UA 3FZMA 3IMXA 1Q9XA 3DAWA 3BUZB 4DF4A 4FJGA 5C24A 4W5QA 4DQPA 2YNHA 3DLLL 4X66K 3I0RA 4CGJA 1U6ZA 4FJNA 3I33A 1S1VA 3O08A 4ID1A 1GLJO 4DV2K 4JI8K 4DU3A 5CR4A 3OYLA 2GEMA 5AQUA 3G4SN 3DXKA 4KI6A 4PHTX 1K73O 2Q2RA 3ULDA 5FLXO 4EP5A 1LW2A 4FJHA 3HRGA 4CBXA 2FBVA 2PAVA 1KAZA 1X9JA 5AQFA 3U3GA 3I8DA 3SYZA 5AQWA 1KVBA 4H0OA 1VK0A 1NK6A 1NWKA 4FLTA 4DTPA 3AVFA 3CQ8A 4OGEA 3VTIA 5KGWA 4CHYA 4FPAA 3SQ1A 2P9UA 2A6AA 2KLAA 4G1QA 4MDBA 3B6OA 4KBOA 4FWKA 4FW1A 4OLAA 5EX5A 1UAXA 3O3FA 4KO0A 4O4GA 2AA4A 2Z1JA 4CJ3A 4PKIA 3SV3A 5M1FA 4AHTA 1YJNN 3CMEN 4J2EA 1N36K 3AVNA 4DV7K 2FBTA 1U45A 1XUPO 5EY4A 2NRXA 3KVGA 4BRNA 4GW6A 1NU0A 1REVA 4CEEA 1C1CA 4CIGA 3IS9A 1OH6A 4CCHA 2YNFA 1T7PA 2ZGZA 1BCMA 3SBTA 1C0TA 5AQIA 3RMCA 3SPZA 4F3OA 1BCOA 1TVRA 3ATVA 2VWJA 3SAGA 1NMNA 2Y1IA 5AR0A 4LY7A 4PKHA 4M3XA 1VSKA 2I5JA 2HHTA 2O8BB 2E8AA 3SAHA 1SKSA 2YI1A 4QS9A 3VEVA 2Q0UA 1NGCA 1QHAA 1VQ9N 3ZX3A 2G8HA 4AHCA 4A61A 4IG3A 4H5WA 2O8BA 4QS7A 4ICLA 3DXMB 1WOQA 3B6PA 3QBWA 5E41A 3RMBA 4OPAA 4H5TA 4H0PA 1VQPN 3ITHA 1MWKA 3DXMA 3DI6A 1S22A 1XWLA 4A57A 2I7NA 1W97L 4DSKA 1VSDA 5KPRA 1BG3A 3VEWA 1D9DA 1M90O 4FZXC 3MN5A 4CJ5A 3RRGA 4GY2B 4C1NI 3HP9A 3CCRN 4J2AA 4DTNA 4MFBA 1QSLA 1RILA 3THVA 2Z1GA 3DRSA 3HL8A 5BRDA 2F9TA 3TI0A 1WBBA 1BI4A 1D4XA 2OPPA 4GV6A 3L8BA 1RBSA 3C7NB 5BREA 5KRSA 2HHQA 5IWAK 1HUXA 1N33K 3LAMA 3RTVA 3ZT3A 4HTLA 3VOVA 1BQNA 2PYJA 1C1AA 4EZ6A 2A3ZA 2E2QA 4H5VA 4RCHA 4YOWA 3QEIA 3VEZA 1IKXA 1TK8A 2E2NA 3QEVA 1C0GA 2O8FB 5GADP 4FW2A 4CZGA 4KHNA 4RW6A 2VGMA 4WE1A 3VEXA 4K8XA 4PL8A 3G71N 3WT0A 5ELZA 3QNOA 3LDOA 3HOSA 2QM1A 3MCAB 5H1SQ 3S3NA 4C8MA 3SQ4A 4E0DA 2RE2A 5J2QA 1HR0K 4FJMA 1T3VA 3L2VA 4DG1A 4B3MK 3LDSA 1KXPA 2P5GA 3EE9A 3PV8A 3J7ZO 2QXFA 1RNHA 2WONA 4DV3K 4I9LA 1SS6A 4CJWA 4J8FA 3K5MA 4N41A 1ATRA 3LZJA 1NK4A 3BY5A 1SAZA 2F9WA 3VPZA 1QSSA 2JWLA 3WNGA 3NF7A 1OH7A 4CJUA 4KB1A 5GAHP 1T8EA 4BDZA 3C6TA 4C8OA 1XI1A 1HYVA 4KHWA 2VG6A 3THYB 3PSFA 3GE1A 3OBYA 3OYGA 1N6QA 3M3ZA 1XNQK 3ZSRA 3TABA 2P51A 1HKCA 2PYLA 3O8MA 1JLBA 3O9QA 1GLEG 5DMRA 4MO5A 4FJIA 4W5OA 2V51B 4JI7K 3K0SA 2UUBK 1JXEA 2W42A 1YJ9N 2EX3A 4K42A 1VSLA 4ZHRA 1G15A 1GOBA 5E26A 3VQPA 3CM5A 1WLJA 4KI4A 5CZ2A 2W6LA 2WBNA 3L6QA 3ALYA 3J81O 3GG4A 4B9LA 1IG8A 4RWTA 1Y97A 1YIJN 4WQ4A 3U3YA 3VENA 5A2QO 1JJ2M 2PY5A 1GLDG 5EVZA 3VQDA 1HNXK 3ZSZA 2NUBA 3VA3A 4B8CA 4CBWA 4FWPA 1X1PA 3H1VX 1YHQN 3DM2A 3D0PA 1NK8A 2OANA 2QXLA 4KH6A 4B1ZA 3SZ2A 1HYZA 4W5RA 1ITGA 3H6EA 3EYZA 3I56N 2F8SA 4KHSA 2BE2A 1K6YA 5AQLA 2KFNA 4BC4A 3AGKA 1J5OA 2HVHA 3EKSA 1YTUA 2P9NB 1SL1A 3THWA 2P9PA 2E1YA 4KTQA 2HF4A 4AQYK 4KREA 2WOMA 5FRMA 3JSMA 1HJRA 1N5YA 4CE9A 2NRVA 2CGLA 3NH0A 4JKGA 2E1ZA 1KC8O 3QLHA 1BGXT 5HOOA 1D8YA 4U67L 3M5RA 4ELUA 5FRNA 2P9LA 2P9IB 4JK7A 1VQKN 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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