4BC4A

Crystal structure of human d-xylulokinase in complex with d-xylulose
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
525
structure length
525
Chain Sequence
RRCCLGWDFSTQQVKVVAVDAELNVFYEESVHFDRDLPEFGTQGGVHVHKDGLTVTSPVLMWVQALDIILEKMKASGFDFSQVLALSGAGQQHGSIYWKAGAQQALTSLSPDLRLHQQLQDCFSISDCPVWMDSSTTAQCRQLEAAVGGAQALSCLTGSRAYERFTGNQIAKIYQQNPEAYSHTERISLVSSFAASLFLGSYSPIDYSDGSGMNLLQIQDKVWSQACLGACAPHLEEKLSPPVPSCSVVGAISSYYVQRYGFPPGCKVVAFTGDNPASLAGMRLEEGDIAVSLGTSDTLFLWLQEPMPALEGHIFCNPVDSQHYMALLCFKNGSLMREKIRNESVSRSWSDFSKALQSTEMGNGGNLGFYFDVMEITPEIIGRHRFNTENHKVAAFPGDVEVRALIEGQFMAKRIHAEGLGYRVMSKTKILATGGASHNREILQVLADVFDAPVYVIDTANSACVGSAYRAFHGLAGGTDVPFSEVVKLAPNPRLAATPSPGASQVYEALLPQYAKLEQRILSQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure and Function of Human Xylulokinase, an Enzyme with Important Roles in Carbohydrate Metabolism
pubmed doi rcsb
molecule keywords XYLULOSE KINASE
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 181
structure length 525
sequence length 525
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2012-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bc4A01
2EWSA 3VEYA 3U9ZA 5FPMA 4CZLA 4A62A 2QWOA 4QS8A 4BRQA 2E1ZA 5BRDA 3FZMA 5AQPA 1NGIA 1MWMA 2AA4A 1NGAA 2CH6A 3MCPA 3ZEUA 1U2VB 5AQZA 1V4TA 3WQUA 2GELA 5F2RA 1NGDA 4B9QA 1HX1A 1LCUA 3EL2A 2Q2RA 2DPNA 1Z05A 3OHRA 1KAZA 3D7EO 4L3QA 1R59O 1S22A 3ZETB 1K8KB 2YHXA 5JLHA 3UB5A 4DQ8A 1HJOA 2H3GX 1ATRA 2V51B 3MN9A 5EOYA 3F9MA 1T6DA 4F9OA 1ESVA 1LOTB 1KAXA 2GWJA 4B1UB 5AR0A 1BDGA 3GE1A 4CJ7A 1YVNA 3VF6A 1P8ZA 4C23A 1WOQA 3I8BA 4RWTA 3QICA 2OANA 3O6WA 4PKIA 4BREA 3GL1A 3WXLA 4CBXA 3D2FA 2ASMA 3MN6A 3VENA 3VOVA 5BREA 2A3ZA 2CGLA 4M7XA 3VF4A 3BP8A 3FZLA 2E2OA 5LJVA 5JICA 2CGKA 2VCPA 3ZX3A 3FFKB 4ISGA 5EY4A 1QQOA 1GLJO 4O5FA 1NGJA 5KQ8A 2QWMA 3LM9A 2VYPA 3CIPA 4BRAA 1NGCA 3O5BA 4H03B 3R8EA 1DEJA 2WUSA 3W0LA 3WXJA 4H5TA 3GOIA 3SMSA 3VESA 1GLFO 3CJBA 5AQWA 4LC9B 4BVPA 2PAVA 3M1FA 3C7NA 2IVNA 3RSEB 3VEVA 3UKRA 4JHDA 4PKHA 2W40A 1BA1A 4BRIA 3DXKA 1SAZA 4BR2A 3G25A 4O8KA 4EIAA 2QWQA 2E2QA 4FPAA 2P9UA 3CQXA 1JCEA 2I7PA 2E2NA 5AQNA 4NO7A 3ZEUB 1JCFA 3H1QA 4H0OA 4WQ4A 4PL8A 3FZKA 3O8MA 4FL9A 2E20A 2QXLA 2D4WA 2IIRA 2P9KA 3IDHA 2YI1A 4FOIA 4MLEA 1NBWA 3FE1A 1NM1A 3ID8A 2UYTA 1IG8A 1BWFO 3GG4A 3C0BA 3EO3A 4JD2A 5AQLA 5LJWA 3MK6A 4CI6A 2BTFA 5F0XA 4PKGA 2Q0UA 1S3XA 3MMVA 4IZ9A 1WUAA 3CI5A 3ATUA 1NWKA 3L4IA 4IXCA 4MLHA 4FWLA 4BRKA 4K41A 3SJHA 4EAHD 4BR7A 2Q31A 1SZ2A 3ULEA 3CJ9A 3EKUA 1TYQA 2CGJA 4FOEA 4BC2A 2GTDA 4GNIA 1GLDG 5AQSA 4BRLA 5KQDA 3A5NC 4E1JA 1J6ZA 4K43A 2QWLA 3UE5A 4BRHA 4FWOA 2YCHA 4WQ4C 3D2EA 1NLVA 2A6AA 2Q36A 3I33A 5KPTA 4BG8A 4QS9A 5E26A 1BOTO 5AQVA 4BRGA 3LDLA 3FR0A 3LM2A 4JAXA 3BF3A 4I6MA 4BGBA 3VEWA 1E4FT 4H5RA 1G99A 4MO4A 4RCHA 3BUZB 4A61A 2D0OA 2HF3A 3FZHA 2QWRA 2GWKA 3C7NB 4M7YA 5BN9A 1T6CA 4CBUA 2ZF5O 3UKRB 3ZX0A 4JHDB 3QB0A 5EX5A 5I9EB 3HBTA 3DXKB 1U6ZA 1ATSA 3H3NO 3S41A 5AQRA 1X9JA 2P9UB 2PBDA 1V4SA 3VPZA 3HM8A 2YHWA 3A0IX 3QMLA 4YDUA 2P9KB 3CQYA 3DXMB 1GLEG 3O1WA 4BRNA 1NGEA 3H45C 3FGUA 4H5NA 3CHWA 4FWQA 2A40A 5TKYA 1T44A 1HPMA 3SMPA 2ZGZA 4BRCA 4B1VA 4XEIA 4CBWA 5B8HA 3AAQA 3TPQA 4MO5A 4XH4A 1X3NA 1C0GA 3BEXA 2F9WA 4H5VA 4JD2B 2E2PA 2IVPA 3ENHA 5AFUA 2YHYA 4FWSA 2A42A 4IO8A 3DWLA 2Q0RA 3LDQA 4CZEA 4EFHA 3CJAA 1NGGA 4CZFA 4CD1A 4XH1A 5EVZA 5BPNA 3QBXA 5AQMA 5AFUH 3ULEB 1TYQB 5FPEA 5JLFA 5ADXA 1SQKA 3UKUA 1XUPO 3O1BA 1MDUB 5KPZA 2IVOA 3U4LA 2HF4A 2NLXA 3VF2A 3D2EB 4DHYA 4ISFA 3A5MC 3L0QA 5ADXH 3HTVA 4YDUC 2A5XA 1QHAA 4J8FA 5AZIA 3HZ6A 1C0FA 2I7NA 3LDOA 4Z94A 3VETA 5EXWA 4FWRA 5AQIA 5AZJA 2P9SB 3H3OB 3DXMA 4IJAA 1E4GT 4I6MB 4H0PA 3O4WA 4QS7A 4BROA 4BRDA 4WQ5A 3VGMA 1QQMA 4H5WA 5BPLA 3WXIA 5ELZA 4WYBA 3SLCA 3FLCO 3H1VX 4EHTA 3ENOA 3WT0A 4FWPA 4CZMA 4XH5A 3U9DA 4HTLA 5JMVA 1QZ6A 3LDNA 2P9LA 4JNEA 1YAGA 1YUWA 1Y64A 2KHOA 1RDWX 3J8AA 3A5OC 3KHYA 3VERA 4BC5A 3R9PA 4K25A 4IJNA 1BG3A 3WXKA 1EQYA 3A8YA 3EN9A 2FSKA 2QM1A 1TUUA 4GY2B 1OKJA 2FLOA 3KZBA 5F1XA 1CZAN 3R6MA 2P9PB 2V7YA 1DGKN 1ZXOA 3BF1A 4BRMA 1BUPA 1GLCG 1YXQA 3VGKA 2FSNA 4M63C 3CJ7A 4WQ5C 1ATNA 3M6GA 2P9SA 5AQYA 3MN5A 3U8XA 3H46O 1GLLO 4CD3A 3WQTA 3CJ1A 1KXPA 4H0VB 2QW9A 2QWPA 5AQTA 4ISEA 3QBWA 2ITMA 2A41A 2HMPA 2E1YA 1H1VA 3UKUB 1D4XA 5BRFA 3CETA 1ZC6A 4JN4A 1DKGD 3AARA 1NMDA 1ZBSA 5AQJA 4H0TB 4NB4A 1BA0A 4CZKA 1KAYA 2FXUA 2P9IA 4BQZA 3W3DA 1QZ5A 1XC3A 2AP1A 2Q1NA 3WEEB 5AZIB 2ASPA 1GLAG 3VEXA 1RGIA 5AQKA 3IFRA 2GUPA 5AQUA 5AZJB 2Q97A 3DJCA 3VGLA 4PL7A 4BRFA 3QFPA 1NGFA 2F9TA 2P9PA 2NZTA 4B1YB 1NGBA 2ZWHA 4B1XB 4IWVA 1NGHA 4RTFD 4EHUA 2YJEA 3ATVA 3HI0A 4BR5A 3EZWA 3AAPA 3EKSA 4DCHA 3ZX2A 1QQNA 3IMXA 2GEMA 4BQLA 2P9LB 1GLBG 4BC4A 3IUCA 2NRHA 2YJFA 3CJCA 3QDKA 4AM7A 4CZIA 2D0PA 3LL3A 4BR4A 4FWKA 1HKCA 1U2VA 2P9NB 4KBOA 4FSVA 3KVGA 5BRHA 5BPMA 2CH5A 4BC3A 4H0YB 2FF6A 3GDQA 4BRPA 5BR9A 3M3ZA 2D1KA 1HUXA 4HWIA 1X3MA 4BR0A 3O08A 1MA9B 2ASOA 3QFUA 3LDPA 3O80A 5KPRA 3WEEA 4BG9A 3ZETA 1K8KA 1JCGA 5AQXA 4DB3A 2V7ZA 1Z6RA 3MN7A 3FZFA 4FWMA 4BVOA 5AQGA 1XQSC 2E8AA 3H6EA 4AM6A 3A5LC 4FWNA 5FPDA 1HKGA 4FO0A 4A2BA 3CERA 2J4RA 5LY3A 4Y0WA 5BN8A 3TU5A 3WUHA 4B1ZA 3VEOA 2VWBA 3GBTA 5FPNA 2W41A 4A2AA 1BU6O 3SK3A 2HOEA 2E88A 1IJJA 3JXUA 1Q18A 3VEZA 2ZGYA 3JS6A 2FF3B 4FPBA 1HLUA 3MDQA 3L6QA 2P9IB 4K42A 2V52B 2BUPA 1BO5O 4BGAA 3HSCA 2P9NA 3B8AX 4H0XB 5AQFA 5E84A 5CE3A 3AY9A 2QWNA 4CZHA 1TUYA 3DAWA 5AQHA 3P4IA 5AQQA 2FSJA 1MWKA 5AQOA 4CZGA 4CZJA 4B1WB 1HKBA 3RSEA 3D2FB 1RFQA 4BR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NF6A 3VEYA 5FPMA 4CF0A 3ALYA 4A62A 4DQQA 1KRPA 4PWDA 4HCBA 4IOCL 3FZMA 1MWMA 4OKEA 3KJVA 3ZEUA 1SL1A 2XHBA 1HYZA 1KQSM 1V4TA 3WQUA 5F2RA 3OYNA 3RVCA 3VTIA 4B9QA 5M1FA 2IC3A 1D9FA 1KLMA 2Y1IA 2HMIA 3PX6A 1I3AA 4YY3K 3OBYA 2HHQA 4WCEL 4KH5A 4FCYA 1HJOA 4KI6A 4WFBL 1LOTB 4LF6K 3AO4A 1KAXA 2GWJA 4B1UB 3J7AP 3OJUA 1YVNA 3VF6A 4CEQA 3G6EN 3VQ8A 3I8BA 4CEDA 1JKHA 2OANA 3F9KA 5HRPA 2KFNA 2BE2A 1NK8A 1IBMK 3VENA 4LY7A 1QS4A 3KLIA 4M7XA 4FZYA 3HXMA 3SUPA 3K5OA 1N32K 5LJVA 2VCPA 3ZX3A 2GBZA 3MXMA 4ISGA 4CIEA 2QWMA 3CIPA 1KFDA 4BRAA 3QIOA 1HNVA 2BH1A 2DFFA 3LPUA 5LMNK 4H5TA 3SMSA 3VESA 3NBPA 1BQNA 4ID1A 4N41A 3CD6N 4LC9B 4BVPA 4LH5A 1TAUA 3I0SA 4XIUA 3V9UA 1SL0A 3RSEB 1C0TA 3HK2A 2JGUA 3PUFA 4BE2A 2DY4A 4PKHA 1BA1A 1LW0A 3JYTA 3CFRA 3G25A 4O8KA 1OH6A 2E2QA 4DWIA 3CQXA 1JCFA 4H0OA 2QTDA 4FL9A 1BCMA 3I0RA 2FBYA 3L4QA 3L3VA 3SYZA 1XI1A 1SL2A 2D0AA 5JVGL 4FOIA 3EE9A 3K9KA 4U7BA 1J5EK 1B9DA 2DFHA 3NFAA 5KGWA 3C0BA 2E4LA 1LWFA 4JD2A 2VQEK 2G8UA 3SI6A 3MK6A 4CI6A 1U47A 3ZSWA 3L2VA 1NK5A 3MMVA 4IZ9A 3NCIA 3CI5A 1IBLK 4IXCA 4CEAA 1W2BM 3CC4N 3RR8A 1UA0A 1RTIA 3AO5A 3ZT3A 4BR7A 3K5LA 2ZJRL 2Q31A 4DTUA 4GNIA 3OYKA 2NUBA 3UE5A 1ITGA 4WQ4C 5DMRA 2OTLN 4RG8A 2A6AA 3M8PA 2RHKA 1RTDA 5FDLA 3E9OA 4CHPA 4BGBA 1A5WA 1E4FT 3MX5A 4H5RA 2O8FB 2A1RA 4RCHA 4HHTA 4A61A 2YNFA 1D5AA 3NH1A 3C7NB 1XNQK 4CBUA 4L8RB 3SUQA 3O9SA 4E19A 2ZF5O 2PY5A 4JHDB 5SWMA 1NNEA 3V9XA 3HRGA 5EX5A 4DV0K 4KPYA 2DTUA 4CIGA 2IOCA 1C0UA 3TAGA 4M3WA 3VPZA 4B9UA 3G0ZA 1VQ9N 3ZSXA 5J1EA 4YDUA 4BWMA 2P9KB 3DXMB 1ZBIA 2HSTA 1L3UA 4IG3A 1D9DA 2A40A 4PY5A 4CBWA 1T44A 1HPMA 1VQLN 4JKEA 3TPQA 3K58A 4CHZA 3BEXA 4H5VA 3TAPA 4DKWA 3VQQA 4FWSA 1NJYA 4LF7K 3V1RA 4ICLA 3RTVA 3DWLA 1XWLA 3LDQA 4EFHA 2HHUA 3L3UA 4RW4A 4CJQA 4CD1A 5AFUH 3ULEB 1JXEA 3NGZA 1SQKA 2G8HA 1XUPO 1TK8A 5KPZA 2IVOA 4LFCK 1HYVA 3D2EB 4DU1A 2NRWA 3L0QA 1XHZA 4B08A 4FJIA 1QHAA 3T1HK 5AZIA 3LDOA 4JKFA 3LANA 4H4OA 4E1NA 4JI7K 5AQIA 2P9SB 3TSQA 3DXMA 3QETA 4DSIA 4QS7A 4BROA 4BRDA 4JK7A 1RDCA 1QQMA 5ELZA 1NJIO 4EHTA 3HPOA 1TV6A 1KC8O 3ZYYX 3AVCA 4XH5A 3U9DA 5JMVA 5SZTA 4U67L 1JLAA 4FM1A 3PLAA 3LDNA 3CM5A 4B3RK 1RDWX 4BC5A 3KLEA 3MWTA 1OVYA 3R9PA 3B6OA 3DLLL 4DFPA 3EN9A 4O5BA 2R7YA 4KO0A 3ITHA 4GVEA 3CFOA 1OKJA 2FLOA 1CZAN 2P9PB 2V7YA 1DGKN 4C8KA 4OVLA 1Q86O 4JI5K 3NE6A 1GLCG 3KTQA 1R0AA 4PQUA 1ATNA 4WFNL 2P9SA 1VSLA 1HRHA 1D8YA 5AQYA 1ILYA 4W5TA 2NNWA 4GVMA 4PHTX 1HR0K 2Z1IA 1GLLO 3CJ1A 3S3OA 3PIPL 2OPRA 4H0VB 3V9ZA 1YJNN 3RRGA 1FJGK 1VQ7N 2QWPA 2ITMA 1TK5A 1N33K 1REVA 3QINA 4DR7K 3RMBA 4F2RA 1D4XA 4KHUA 3R3LA 3CETA 4CGGA 3C6UA 3P38A 1HNIA 1RT7A 4CZKA 4MFBA 4JI4K 1QZ5A 1XC3A 2Q1NA 3LP1A 4DLEA 3PV8A 2ASPA 1HQUA 3KKSA 1DT9A 3ZSYA 4DQIA 1B92A 3C95A 2P9PA 3WNEA 4B1YB 4W5RA 1NGBA 4B1XB 3VQDA 2UXDK 1WN7A 2YJEA 2UUCK 4I9QA 4DQPA 3EKSA 4CJFA 1S6QA 4CESA 4DFJA 4OKKA 4BE1A 1E3MA 1GLBG 3BZCA 4CGJA 3QDKA 4AM7A 4IO9L 2DFEA 4J2EA 4KI4A 1KTQA 1HKCA 1KVCA 5HRRA 3P5JA 4AF1A 3KVGA 5BPMA 4BC3A 1EKEA 3GDQA 4BRPA 5BR9A 3DLGA 1RBSA 1T3VA 3O80A 4IBNA 2X74A 1Z6RA 1RNHA 4FWMA 1A5XA 4BVOA 1U04A 4O8UA 4O4GA 4Z0UA 2E8AA 3OS0A 3H6EA 4B9MA 4FWNA 4JI6K 5FPDA 4C1NK 4FO0A 2O8BB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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