4BQLA

Crystal structure of archaeal actin
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
DKSPDPMGVISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Crenactin, an Archaeal Actin Homologue Active at 90Degc.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN/ACTIN FAMILY PROTEIN
molecule tags Contractile protein
source organism Pyrobaculum calidifontis
total genus 126
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bqlA02
4XH4A 3D7EO 2P9SB 3WXIA 4B9QA 1BWFO 3AAQA 2ASOA 1TYQA 2D0OA 2UYTA 3GL1A 4JHDB 3GG4A 3C7NB 4K41A 2AA4A 3DAWA 2E1YA 3ENOA 3QFPA 1Y64A 4ISGA 1MDUB 2ZGYA 3CQXA 3CQYA 2FXUA 1GLAG 1DEJA 3R6MA 1D4XA 2W40A 2A5XA 3FGUA 5AR0A 4NB4A 5KPRA 5AZJA 2VYPA 2IIRA 4BC3A 1NGCA 1NBWA 3VEWA 1ATSA 5LJVA 2E88A 5FPMA 5ADXA 1H1VA 3JXUA 1JCEA 2GTDA 2HOEA 4FPAA 4BVPA 3QBWA 1YAGA 1E4FT 1QQMA 2QWPA 2P9NB 3H3OB 4BG9A 3UKRA 3HBTA 1KAXA 3FZKA 1QZ5A 4DQ8A 1ZBSA 3H3NO 2ITMA 4FWNA 2D1KA 1T6DA 1MWMA 4NO7A 4B1ZA 4B1YB 4F9OA 2Q0UA 5JLHA 4HTLA 4IXCA 3VF4A 3WQTA 1Z05A 4HWIA 5AQKA 4H0VB 3DXKA 3QBXA 4BGAA 1JCGA 2OANA 4MLHA 3MN6A 3DWLA 1KAYA 3JS6A 1K8KB 2A42A 3CI5A 2ZGZA 2Q2RA 1ATNA 3QDKA 3S41A 1BDGA 2P9KB 4Z94A 4FOEA 3VENA 3U4LA 1BO5O 3M3ZA 4JHDA 3LDQA 4JN4A 4WYBA 3C7NA 1Q18A 2V52B 4BRCA 4H5NA 4A2AA 4H0YB 3O08A 3J8AA 4CBUA 5AQQA 3VPZA 1S22A 4QS7A 4LC9B 1S3XA 3MN9A 1DGKN 4CD3A 3ENHA 4JAXA 4CJ7A 4H0OA 1X9JA 2E20A 2IVNA 5AQOA 1NGDA 2W41A 3UKUB 1C0FA 5AQYA 2Q31A 3ULEB 3M6GA 3DXMB 4DB3A 1ZC6A 3OHRA 4H0XB 2Q1NA 3W0LA 1YXQA 2FSKA 3VF6A 2ZF5O 2D4WA 4EHTA 1ESVA 1GLEG 3UB5A 3H1VX 2KHOA 1V4SA 3AY9A 3L4IA 3VGLA 1RDWX 3D2EA 3H46O 1HUXA 3ID8A 2IVOA 3DJCA 5FPDA 1U6ZA 5AQWA 2P9UA 3VEOA 3RSEB 4JD2A 3L0QA 4B1UB 4BR2A 4CZKA 1RFQA 3H1QA 4K25A 1BA1A 3CJ9A 1LOTB 1NGJA 4IZ9A 4MLEA 4B1WB 3A0IX 5JMVA 3ZEUB 4XH1A 3ZETB 2HMPA 4DHYA 4I6MB 5AQJA 2NZTA 4CBWA 3FFKB 4CD1A 2HF3A 3WXLA 2ASMA 3KZBA 3WEEB 4WQ4C 3BEXA 3HTVA 4MO5A 4EIAA 3FZHA 1HKCA 4FWRA 3VGKA 3I8BA 3WXJA 2P9PA 2YI1A 4IJNA 3O5BA 1J6ZA 3ZX3A 4H03B 5BPMA 4FWKA 4BC4A 1QQNA 2GWKA 3O4WA 1LCUA 5KPTA 3BUZB 4FWQA 3CIPA 2IVPA 4H5RA 2CH6A 3O8MA 4BG8A 4BR9A 1E4GT 1R59O 3LDPA 1WOQA 4QS9A 1HJOA 3IFRA 3MCPA 3VERA 4A61A 5KQDA 1YVNA 4M7YA 2V51B 3FE1A 3QB0A 4FO0A 2E2QA 4BRLA 5BRFA 1SAZA 3D2FB 5BRDA 3DXMA 5BN8A 2E1ZA 2Q97A 4BRKA 3VGMA 1X3MA 1X3NA 3CJ7A 3MDQA 4BQLA 4BRDA 5AQGA 3WQUA 3B8AX 1NGEA 1CZAN 1YUWA 3H45C 5I9EB 5FPNA 2F9WA 3F9MA 3AARA 3CERA 2FF6A 5JLFA 1ZXOA 4BC5A 5AQSA 4B1VA 1RGIA 4QS8A 1HKBA 1DKGD 4PKHA 1NGGA 4GY2B 2QWQA 4XH5A 5EX5A 4CZGA 4PKIA 4A62A 1XC3A 2YHYA 3ZX2A 3ZETA 4EHUA 2P9SA 4CI6A 1NMDA 4I6MA 4CZJA 3HI0A 3H6EA 4FL9A 4FWOA 5AQZA 5BPNA 3WEEA 4CZMA 3VETA 4CZFA 1XQSC 4BC2A 4PL7A 1T44A 2QWMA 4WQ5A 2A3ZA 3SMPA 2CGJA 3EKUA 4J8FA 2QM1A 3FZMA 1GLJO 3CJ1A 2VCPA 4FWLA 1SQKA 2AP1A 2E2NA 2NLXA 1TYQB 1BG3A 3BP8A 4BROA 4O8KA 4YDUA 3QMLA 1MWKA 4FOIA 2NRHA 3P4IA 1SZ2A 2GELA 2A6AA 3HM8A 1NGHA 3FZFA 5AQIA 5FPEA 3D2FA 3QICA 2P9NA 2Q0RA 3ATUA 4Y0WA 2FF3B 3HSCA 3SJHA 2BTFA 4KBOA 3U9ZA 1MA9B 4K43A 4BRPA 3UE5A 5BPLA 1NGAA 3C0BA 4BR7A 3VESA 4CZLA 5F0XA 3A5LC 4H5TA 4E1JA 1P8ZA 2QXLA 4RWTA 4H5WA 1GLLO 1GLCG 2GEMA 2P9IB 2YHWA 3VEXA 2BUPA 3MN5A 4DCHA 3UKRB 4BVOA 1K8KA 4BRAA 5AQMA 3IUCA 5BRHA 2HF4A 5LY3A 3IMXA 2F9TA 5EY4A 4FWSA 4BQZA 2P9KA 5KQ8A 3I33A 5AQHA 4C23A 3L6QA 2YJEA 3EL2A 2E8AA 3DXKB 4MO4A 5AQXA 3FZLA 5B8HA 4BRFA 1BA0A 3A5NC 1NGIA 3BF3A 4BR4A 1G99A 4CZEA 3O1BA 3CJCA 2QWRA 5AFUH 3VOVA 2FSJA 1GLFO 1NM1A 1NWKA 2EWSA 4CZIA 1GLDG 2QW9A 1GLBG 3ATVA 3CJBA 4AM7A 4JNEA 4B1XB 4BRNA 5AZIB 3UKUA 4A2BA 4RCHA 5F2RA 3ULEA 5CE3A 1C0GA 1U2VB 4ISEA 3EZWA 4BRGA 2YJFA 3MN7A 2FSNA 5LJWA 4M7XA 3W3DA 2CH5A 4K42A 3LM9A 4M63C 5ADXH 3BF1A 5AQLA 5BREA 4XEIA 3O1WA 2H3GX 3QFUA 1Z6RA 1BOTO 1T6CA 3IDHA 1KXPA 5EXWA 5EVZA 3TPQA 1QZ6A 5E26A 2P9IA 2V7YA 5EOYA 3RSEA 3VF2A 2ASPA 2FLOA 4GNIA 3SLCA 5BR9A 3VEZA 4BGBA 3O6WA 3FR0A 2GWJA 3HZ6A 3ZEUA 2PBDA 4H5VA 2QWOA 2P9LB 3WUHA 3CETA 2E2OA 3A5OC 5AQUA 1OKJA 5TKYA 4L3QA 2D0PA 3R8EA 3GOIA 1IJJA 2A41A 3D2EB 3ZX0A 2P9UB 4O5FA 1HX1A 4ISFA 4BREA 2VWBA 4JD2B 2V7ZA 4CBXA 1JCFA 1XUPO 4EFHA 3G25A 4PL8A 2DPNA 2CGKA 2ZWHA 2J4RA 1HKGA 3MK6A 4FPBA 4BRMA 3FLCO 4FWMA 4FWPA 2I7NA 5AQPA 4AM6A 4CZHA 4BRIA 2YCHA 4PKGA 3WT0A 3KHYA 4EAHD 4FSVA 5AZIA 4IJAA 3LDNA 3LDOA 5BN9A 1U2VA 1HPMA 3M1FA 2P9PB 3SK3A 3GE1A 1QQOA 3EO3A 3GBTA 3A5MC 3LDLA 5AZJB 3U9DA 2A40A 5AQFA 1BU6O 3GDQA 1V4TA 1TUUA 4WQ5C 2E2PA 5E84A 3R9PA 4BRQA 2WUSA 1QHAA 3A8YA 2QWNA 4RTFD 3LM2A 4H0PA 2QWLA 1WUAA 3LL3A 5AQRA 2Q36A 1ATRA 4H0TB 5F1XA 1KAZA 4IO8A 5AQVA 5KPZA 4BR5A 4YDUC 4WQ4A 2I7PA 3SMSA 3VEVA 4IWVA 2GUPA 1EQYA 1HLUA 2P9LA 5JICA 5AQNA 1BUPA 3WXKA 3TU5A 4BRHA 1TUYA 1NGBA 3O80A 3CHWA 3MMVA 1NGFA 2PAVA 5ELZA 5AQTA 3U8XA 3VEYA 4BR0A 3EN9A 2YHXA 1NLVA 3AAPA 2CGLA 1IG8A 3CJAA 3KVGA 3EKSA 5AFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D7EO 2QTDA 1U04A 1Y97A 4B9QA 4KPYA 3THWB 4ILJA 1O13A 2ASOA 5I3UA 2YX6A 3GL1A 1RCHA 4GV6A 1RTJA 3LP3A 3SJJA 3PIOL 1EXQA 4R79A 2A5XA 3A2FA 1BGXT 3LP2A 1C1AA 2E88A 1RILA 3SNNA 5C10A 5C2FA 3QBWA 3HPHA 1YAGA 1QQMA 2BDPA 3SCXA 2D0BA 3H3OB 2YNGA 5CY4A 1OH7A 1N5YA 4CW7B 4YY3K 3T1AA 3OJSA 1QZ5A 5C42A 2YNFA 1HNWK 3WQTA 1Z05A 1J54A 2XRIA 3F5TA 3SUOA 4CIFA 3MN6A 1K8KB 3CI5A 3CPEA 3KLGA 1BDGA 1BHLA 3OYCA 4Z4EA 5KGWA 4AHRA 2HBKA 1CLQA 3MEGA 4DG1A 4DSJA 4RW6A 4FOEA 2G8FA 3OYJA 3U4LA 1Q18A 2O8CA 1XHXA 3CCLN 4CHOA 4BRCA 3Q7BA 3SI6A 4H5NA 1BI4A 3AVIA 3J8AA 4FLZA 3VPZA 3O9UA 3NFAA 1FKPA 5J1EA 4JAXA 2OTLN 4J2BA 3EY1A 3RRHA 5AQOA 1NGDA 1C0FA 3THXB 3CYMA 1SL2A 3V9UA 4KTQA 1W97L 2Q1NA 3ZYYX 1VQ4N 3DMJA 4DFJA 2O8DA 4OPKA 3SQ0A 1U48A 2UXCK 3VF6A 1Z25A 1GLEG 5LMUK 3KKSA 2KHOA 3TAGA 4IOCL 4RW8A 3TAPA 1YTAA 5MLCQ 1ZBLA 2IVOA 5FPDA 2WBNA 2KZZA 3O4QA 1FK9A 1X9SA 2Y1JA 2AJQA 3RSEB 3H1QA 1TK8A 3QIOA 1L3VA 4B1WB 1LOTB 1NGJA 3DRPA 4IZ9A 4MLEA 1UWBA 3NH0A 4DTJA 3ZETB 1XMOK 5HBMA 4I6MB 5AQJA 4CBWA 4JKGA 1GOBA 2HF3A 3KWIA 3WEEB 1S1XA 2A1SA 2VQEK 4CESA 3QERA 1HKCA 3VGKA 1CZBA 3ZSQA 3WXJA 2P9PA 2YI1A 4C8OA 4IFYA 4IJNA 3LPUA 4H03B 2O4IA 2QKBA 3OW2M 1QQNA 4CGIA 1REVA 1RT7A 5KPTA 4DR2K 1FJGK 2IVPA 4BR9A 3VERA 3K5OA 3MCAB 5KQDA 4M7YA 4J2AA 5BRDA 3DXMA 2E1ZA 4CGHA 5HRNA 2HBMA 5T7BA 4FLYA 1NGEA 3MX5A 1YUWA 5I9EB 3OY9A 1BCMA 1ZXOA 1RGIA 1VHXA 4B9MA 1LAVA 3BZCA 3OYHA 2QA4N 1X1PA 2QWQA 4W5OA 5HP1A 4EP5A 4J2DA 2YHYA 4F3TA 4FM2A 3THWA 3AVJA 3OYBA 5AQZA 5BPNA 1YJ9N 1NK6A 3UIQA 4BC2A 4CF0A 2ZJPL 2Z1HA 4CJ5A 2QWMA 1OH6A 2A3ZA 1N32K 2KTQA 3ZSXA 4NYNA 3QEWA 4CFAA 3FZMA 1RDBA 1WSHA 3CJ1A 2VCPA 3OYAA 1JLFA 2E2NA 4YNQA 3VQ4A 3IRXA 3HO1A 2EHGA 3J7YP 4KKOA 3QMLA 4FOIA 2F7TA 3VTHA 2PFUA 3P4IA 4JKAA 3NF6A 1ZBUA 2GELA 2A6AA 1WLJA 1VQON 4B3RK 3LZIA 3AA5X 1MA9B 3KK3A 4K43A 2WC9A 1RBUA 3UE5A 1NGAA 3C0BA 4BR7A 5A2QO 3MWTA 4OGCA 3A5LC 4H5TA 4Z0UA 3I55N 3KLHA 1GLCG 4MDBA 2VGMA 2FBXA 3WNHA 2WTUA 4CHQA 4FJLA 1K8KA 3LAKA 3P83D 1XNRK 1HNVA 3AO1A 2VQFK 1IKVA 4M3XA 3ALYA 1VSMA 4CERA 4FWSA 4BQZA 3QLHA 1OVQA 3I33A 2W42A 4C23A 3L6QA 3V9ZA 2F8TA 3EL2A 4MO4A 3DXKB 4BRFA 4H4MA 1BA0A 3A5NC 3ZSRA 3DLLL 4BR4A 3O1BA 1D9DA 3CC7N 3OYGA 4JI4K 4DV6K 4E1MA 1WB9A 1QSSA 3C6TA 2FSJA 2EWSA 1GLDG 4KB0A 1KVCA 5KRSA 2KQ2A 1RDAA 1YTUA 1EETA 4AM7A 4B1XB 3ZSYA 4CHPA 4OJRA 5KTQA 1S1TA 1C0GA 1M1KO 1U2VB 3AO4A 3CM6A 1YJNN 4B8CA 4KHUA 3MN7A 3W3DA 1E3MA 1NJXA 1T8EA 4K42A 3NAEA 4AQYK 5J2NA 3RVCA 5BREA 4XEIA 3J7AP 5M1FA 5EXWA 5EVZA 3HYFA 1QZ6A 3L2QA 5E26A 3RSEA 2ASPA 4GNIA 3HXMA 4JRPA 3K5NA 1DT9A 1NNEA 3T1HK 3CCVN 4IOAL 3AVCA 3TAMA 1DTTA 1VQ7N 3CETA 3TTCA 5AQUA 2ITGA 3N4PA 5TKYA 2D0PA 1IJJA 2A41A 2P9UB 1HX1A 4CJEA 5LL6Z 4CBXA 1JCFA 3OVNA 1K9MO 5HROA 1VSLA 1HNIA 4GV9A 4CECA 2DPNA 3OBWA 2YHBA 3KJVA 1HKGA 2GX9A 1TV6A 1WSFA 2NRTA 3MK6A 3RMBA 4N47A 4ID5A 3TTDA 4NLBA 4DQIA 4BRIA 2NRVA 4PKGA 2HHVA 3K59A 2YKMA 3LDNA 5BN9A 3SK3A 3B6OA 3ZT4A 3GE1A 3MXIA 4KHSA 3AO2A 1VQMN 1VQLN 5AQFA 3RMAA 5EU7A 1JXBA 3THYA 1MU2A 3KK2A 4BRQA 1W2BM 3LL3A 4DU3A 4FLUA 2Q36A 3OS0A 2RHKA 1RDCA 2OPRA 4FM0A 1IBMK 4CFCA 5HRSA 1NK9A 1YHQN 4WQ4A 3D0PA 1EQYA 2VG7A 4CK2A 4OKEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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